| Accession Number: ENCR40010005 |
Category: non-coding element |
| Cross-Ref: Nondisruptable_sequence_ID: CCNA_99931 |
Description: sRNA (CCNA_R0018) |
| Organism: Caulobacter crescentus |
RefSeq: NC_011916 |
| Condition: Rich medium |
locus_tag: - |
| Date: 2018/11/11 |
Reference: Christen B, et al (2011). The essential genome of a bacterium. Mol Syst Biol, 7:532. |
| Nucleotide sequence: UCCCAAUCGGUCAUGGUCGUUUCCGCUUGUUGGUAUAUCGUCGGUCUAACUUGCCCCUGACGGAAGGUGCUUCGUUUGUUUUAUGGCAGAGCCGAAACUUGUUCGGUCAGGCGGCGAAAAAUCGUCGUCUGCUCCAGCGCGUUAACGCGCGGGCGGACGCGAUCGACGCGCAAGCAUGCGCCGAAGACGGCGAUAAGGAAAAGGGGAGGGAGGAAGGGACGCGUUCAGGGGGGGAGACGCUCGCGUCCCUUCCUCUCUAGCGCGACGCCCGGUUAGGGGGAGAGGG |
Results for minimum free energy prediction |
| The optimal secondary structure in dot-bracket notation with a minimum free energy of -130 kcal/mol is given below. |
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(-130.00)
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Results for thermodynamic ensemble prediction |
| The free energy of the thermodynamic ensemble is -135.64 kcal/mol. |
| The frequency of the MFE structure in the ensemble is 0.01 %. |
| The ensemble diversity is 25.68 |
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[-135.64] |
| The centroid secondary structure in dot-bracket notation with a minimum free energy of -129.20 kcal/mol is given below. |
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{-129.20 d=16.86}
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