Information In Noncoding For ENCR40010143

Accession Number:  ENCR40010143	Category:   promoter; regulatory region
Cross-Ref:   Regulatory_region_ID: RR_00050	Description:   TSS position: -; CCNA leading gene: CCNA_00050 ; CCNA lagging gene: CCNA_00050 ; annotation of leading gene: apolipoprotein N-acyltransferase
Organism:   Caulobacter crescentus	RefSeq:   NC_011916
Condition:   Rich medium	locus_tag:   -
Date:   2018/11/11	Reference:   Christen B, et al (2011). The essential genome of a bacterium. Mol Syst Biol, 7:670.

Nucleotide sequence:   AUGACACCCCGCGCAGACAUCGUCGCCGUCGAGCUCUCGACCCCGUUCGAAGCGGUGGCCGCCCAGUUCGCCGAAGCCGAGCACUCUCGGAUGCCGAUCUAUCGCGAGACCCUCGACGACCCCGUCGGCGUCAUCCACGUCAAGGACGUGUUCCGCCUUCUCGCCGACGAGGCCAAGCGCCCUGCGCCGAGCGACCUGAUCCUGAACAAGCUGCGCCGCGACGCCUUGUACGUGCCGGCCUCCAUGAAGGCCGCCGACCUUCUGCUCCGCAUGCGCACCAGCCGCAUCCACAUGGCGCUGGUCAUCGACGAGUUCGGCGGCACAGACGGUCUGGUGUCGAUGGAAGACCUGAUCGAAGCGGUCGUCGGCGAGAUCGACGACGAGCAUGACGACGCCACCGCCGUUGCGGUCGUAGCGCGUCCGGGCGGGAUCUUCGACGCCGACGCCCGGGCGCCGCUAGAGGAGCUGGAGGCUGCGCUGAGCCACGACCUGGCGCCGCCGGACAUGGACGAGGAUAUCGACACCGUCGCGGGCCUGGUCGUCGCCCUGGCCGGCCGAGUGCCCCAGCGGGGCGAGGUGAUCGCCCAUCCCGACGGUUUCGAGUUCGAAGUCGUCGAGGCCGACCCCCGUCGGGUUCGACGCGUUCGGGUUCGCGGCGGUCCUUCCCAACCGGCGGAGCCCGCGCUGGAUGGCGCCCAGCCGGACAUAGAGCGCUC

Molecular structure In Noncoding For ENCR40010143

Results for minimum free energy prediction

The optimal secondary structure in dot-bracket notation with a minimum free energy of -328.8 kcal/mol is given below.

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Results for thermodynamic ensemble prediction

The free energy of the thermodynamic ensemble is -338.18 kcal/mol.

The frequency of the MFE structure in the ensemble is 0.00 %.

The ensemble diversity is 211.56

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The centroid secondary structure in dot-bracket notation with a minimum free energy of -263.20 kcal/mol is given below.

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