Protein

Protein Id:  ABD18932.1 Length:   1363 aa
Description:   spike glycoprotein precursor Bovine coronavirus. Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   6-Sep-06
Source:   Bovine coronavirus
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Bovine coronavirus
Host:   -- Authors:   Park;S.J.; Jeong;C.; Yoon;S.S.; Choy;H.E.; Saif;L.J.; Park;S.H.; Kim;Y.J.; Jeong;J.H.; Park;S.I.; Kim;H.H.; Lee;B.J.; Cho;H.S.; Kim;S.K.; Kang;M.I. and Cho;K.O.
Title:   Detection and Characterization of Bovine Coronaviruses in Fecal Specimens of Adult Cattle with Diarrhea during the Warmer Seasons Journal:   J Clin Microbiol 44 (9); 3178-3188 (2006)
Taxonomy:   Bovine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus.
db_xref:   """taxon:11128, CDD:293060, CDD:286493, CDD:279881"""
Sequence:   MFLILLISLPMAFAVIGDLKCTTVSINDVDTGVPSISTDTVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLLLNGYYPTSGSTYRNMALKGTLLLSTLWFKPPFLSDFTNGIFAKVKNTKVIKDGVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPHTTNFDSKLQGLLEISVCQYTMCEYPNTICNPNLGNRRVELWHWDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGTVLSHYYVMPLTCNSALTLEYWVTPLTSKQYLLAFNQDGVIFNAVDCKSDFMSEIKCKTLSIAPSTGVYELNGYTVQPIADVYRRIPNLPDCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNRRFGFTEQSVFKPQPAGVFTDHDVVYAQHCFKAPTNFCPCKLDGSLCVGSGPGIDAGYKNTGIGTCPAGTNYLTCHNAAQCDCLCTPDPITSKATGPYKCPQTKYLVGIGEHCSGLAIKSDYCGGNPCSCQPQAFLGWSVDSCLQGDRCNIFANFILHDVNSGTTCSTDLQKSNTDIILGVCVNYDLYGITGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYLTNRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNILSRQLQPINYFDSYLGCVVNADNSTSSVVQTCDLTVGSGYCVDYSTKRRSRRSITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMEEFIQTSSPKVTIDCSAFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGATLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVLGCLGSDCNKVSSRSAIEDLLFSKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYNGIKVLPPLLSENQISGYTLAATSASLFPPWSAAAGVPFYLNVQYRINGIGVTMDVLSQNQKLIANAFKKAVGAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALSNVLQQLCNRFGAMSSSLQEILSRLDALEAQAQIDRLINGRLTALNAYASQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTAKVSPGLCIAGDRGIAPKSGYFVNVNNTWMFTGSGYYYPEPITGNNVVVMSTCAVNYTKAPDVMLNISTPNLPDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQDEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLIGFAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGHQELVIKTSHDD

Nucleotide

Nucleotide_Id:  DQ389656.1 Length:   4092bp
Description:   Bovine coronavirus isolate KWD15 spike glycoprotein precursor (S) gene; complete cds Source:   Bovine coronavirus
Nucleotide_type:   RNA Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   6-Sep-06
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Bovine coronavirus
CDS:   DQ389656.1:1..4092 Host:   --
Authors:   Park;S.J.; Jeong;C.; Yoon;S.S.; Choy;H.E.; Saif;L.J.; Park;S.H.; Kim;Y.J.; Jeong;J.H.; Park;S.I.; Kim;H.H.; Lee;B.J.; Cho;H.S.; Kim;S.K.; Kang;M.I. and Cho;K.O. Journal:   J Clin Microbiol 44 (9); 3178-3188 (2006)
Title:   Detection and Characterization of Bovine Coronaviruses in Fecal Specimens of Adult Cattle with Diarrhea during the Warmer Seasons db_xref:   taxon:11128
Taxonomy:   Bovine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus.
Features:   SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4092); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4092); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4092); strand=1); type='CDS')
Sequence:   ATGTTTTTGATACTTTTAATTTCCTTACCAATGGCTTTTGCTGTTATAGGAGATTTAAAGTGTACTACAGTTTCCATTAATGATGTTGACACTGGTGTTCCTTCTATTAGCACTGATACTGTCGATGTTACTAATGGTTTAGGTACTTATTATGTTTTAGATCGTGTGTATTTAAATACTACGTTGTTGCTTAATGGTTACTACCCTACTTCAGGTTCTACATATCGTAATATGGCACTGAAGGGAACTTTACTATTGAGCACACTATGGTTTAAACCACCTTTTCTTTCTGATTTTACTAATGGTATTTTTGCTAAGGTCAAAAATACCAAGGTTATTAAAGATGGTGTAATGTATAGTGAGTTTCCTGCTATAACTATAGGTAGTACTTTTGTAAATACATCCTATAGTGTGGTAGTACAACCACATACTACTAATTTTGATAGTAAATTACAAGGTCTCTTAGAGATTTCTGTTTGCCAGTATACTATGTGCGAGTACCCAAATACGATTTGTAATCCTAATCTGGGTAATCGACGCGTAGAACTATGGCATTGGGATACAGGTGTTGTTTCCTGTTTATATAAGCGTAATTTCACATATGATGTGAATGCTGATTATTTGTATTTCCATTTTTATCAAGAAGGTGGTACTTTTTATGCATATTTTACAGACACTGGTGTTGTTACTAAGTTTCTGTTTAATGTTTATTTAGGCACGGTGCTCTCACATTATTATGTCATGCCTTTGACTTGTAATAGTGCTCTGACTTTAGAATATTGGGTTACACCTCTCACTTCTAAACAATATCTACTAGCTTTCAATCAAGATGGTGTTATTTTTAATGCTGTTGATTGTAAGAGTGATTTTATGAGTGAGATTAAGTGTAAAACACTATCTATAGCACCATCTACTGGTGTTTATGAATTAAACGGTTACACTGTTCAGCCAATTGCAGATGTTTACCGACGTATACCTAATCTTCCCGATTGTAATATTGAGGCTTGGCTTAATGATAAGTCGGTGCCCTCTCCATTAAATTGGGAACGTAAGACCTTTTCAAATTGTAATTTTAATATGAGCAGCCTGATGTCTTTTATTCAGGCAGACTCATTTACTTGTAATAATATTGATGCTGCTAAGATATATGGTATGTGTTTTTCCAGCATAACTATAGATAAGTTTGCAATACCCAATGGTAGGAAGGTTGACCTACAATTGGGTAATTTGGGTTATTTGCAGTCTTTTAACTATAGAATTGATACTACTGCGACAAGTTGTCAGTTGTATTATAATTTACCTGCTGCTAATGTTTCTGTTAGCAGGTTTAATCCTTCTACTTGGAATAGGAGATTTGGTTTTACAGAACAATCTGTTTTTAAGCCTCAACCTGCAGGTGTTTTTACTGATCATGATGTTGTTTATGCACAACATTGTTTTAAAGCTCCCACTAATTTCTGTCCGTGTAAATTGGATGGGTCTTTGTGTGTAGGTAGTGGTCCTGGTATAGATGCTGGTTATAAAAATACTGGTATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGCCATAATGCTGCCCAATGTGATTGTTTGTGCACCCCAGACCCCATTACATCTAAAGCTACAGGGCCTTACAAGTGCCCCCAAACTAAATACTTAGTTGGTATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCTTGCTATTAAAAGTGATTATTGTGGAGGCAATCCTTGTAGTTGCCAACCACAAGCATTTTTGGGTTGGTCTGTTGACTCTTGTTTACAAGGGGATAGGTGTAATATTTTTGCTAATTTTATTTTGCATGATGTTAATAGTGGTACTACTTGTTCTACTGATTTACAAAAATCAAACACAGACATAATTCTTGGTGTTTGTGTTAATTATGATCTTTATGGTATTACTGGCCAAGGTATTTTTGTTGAGGTTAATGCGACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTTTTATATGATTCTAATGGTAATCTCTATGGTTTTAGAGACTACTTAACAAATAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGCTATAGCGGTCGTGTATCAGCGGCCTTTCATGCTAACTCTTCCGAACCAGCATTGCTATTTCGGAATATTAAATGCAACTACGTTTTTAATAATATTCTTTCACGACAGCTGCAACCTATTAACTATTTTGATAGCTATCTTGGTTGTGTTGTCAATGCTGATAATAGTACTTCTAGTGTTGTTCAAACATGCGATCTCACAGTAGGTAGTGGTTACTGTGTGGATTACTCTACAAAAAGACGAAGTCGTAGATCGATTACCACTGGTTATCGGTTTACTAATTTTGAGCCATTTACTGTTAATTCAGTAAATGATAGTTTAGAACCTGTAGGTGGTTTGTATGAAATTCAAATACCTTCAGAGTTTACTATAGGTAATATGGAGGAGTTTATTCAAACAAGCTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTTCTGCTTTTGTCTGTGGTGATTATGCAGCATGTAAATCACAGTTGGTTGAATATGGTAGCTTCTGTGACAATATCAACGCTATACTCACAGAAGTAAATGAACTACTTGACACTACACAGCTGCAAGTAGCTAATAGTTTAATGAATGGTGCCACTCTTAGCACTAAGCTTAAAGATGGCGTTAATTTCAATGTAGATGACATCAATTTTTCCCCTGTATTAGGTTGTTTAGGAAGCGACTGTAATAAAGTTTCCAGTAGATCTGCTATAGAGGATTTGCTTTTTTCTAAAGTAAAGTTATCTGATGTCGGTTTTGTTGAGGCTTATAATAATTGTACTGGAGGTGCCGAAATTAGGGACCTCATTTGTGTGCAAAGTTATAACGGTATCAAGGTGTTGCCTCCACTGCTCTCAGAAAATCAGATCAGTGGATACACTTTGGCTGCCACCTCTGCTAGTCTGTTTCCTCCTTGGTCAGCAGCAGCAGGTGTACCATTTTATTTAAATGTTCAGTATCGTATTAATGGGATTGGCGTTACCATGGATGTGCTAAGTCAAAATCAAAAGCTTATTGCTAACGCATTTAAGAAGGCTGTTGGTGCTATTCAGGAAGGTTTTGACGCTACCAATTCTGCTTTAGTTAAAATTCAAGCTGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCTCTTAGTAACGTATTGCAACAACTCTGTAATAGGTTTGGTGCCATGAGTTCTTCTTTACAAGAAATTCTATCTAGACTGGATGCTCTTGAAGCGCAAGCTCAGATAGACAGACTTATTAATGGGCGTCTTACCGCTCTTAATGCTTATGCTTCTCAACAGCTTAGTGACTCTACACTAGTAAAATTTAGTGCAGCACAAGCTATGGAGAAGGTTAATGAATGTGTTAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTTTGTGGTAATGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCATATGGTTTGTATTTCATCCACTTTAGCTATGTCCCTACTAAGTATGTTACAGCGAAGGTTAGTCCCGGTCTGTGCATTGCTGGTGATAGAGGTATAGCCCCCAAGAGTGGTTATTTTGTTAATGTAAATAATACTTGGATGTTCACTGGTAGTGGTTATTACTACCCTGAACCTATAACTGGAAATAATGTTGTTGTTATGAGTACCTGTGCTGTTAATTATACTAAAGCGCCGGATGTAATGCTGAACATTTCAACACCCAACCTCCCTGATTTTAAGGAAGAGTTGGATCAATGGTTTAAAAACCAAACATCAGTGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATAAATGTTACATTCTTGGACCTACAAGATGAAATGAATAGGTTACAGGAGGCAATAAAAGTTTTAAATCAGAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACATATGAGTATTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATTGGCTTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGTTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGTTTTAAGAAATGTGGCGGTTGTTGTGATGATTATACCGGACACCAGGAGTTAGTAATTAAAACATCACATGACGACTAA