| Accession Number |
Protein Id |
Protein Description |
Protein Sequence |
Nucleotide Id |
Nucleotide Description |
Nucleotide Sequence |
isolate |
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| DVSP51815658 |
QYN76615.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ726587.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/TX-DSHS-7140/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/TX-DSHS-7140/2021 |
nasopharyngeal swab |
USA: Texas |
2021/7/16 |
| DVSP51815659 |
QYN76594.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ726585.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/TX-DSHS-7138/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， and envelope protein (E) genes， complete cds; membrane glycoprotein (M) and ORF7a protein (ORF7a) genes， partial cds; ORF7b (ORF7b) gene， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/TX-DSHS-7138/2021 |
nasopharyngeal swab |
USA: Texas |
2021/7/6 |
| DVSP51815660 |
QYN76583.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ726584.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/TX-DSHS-7137/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/TX-DSHS-7137/2021 |
nasopharyngeal swab |
USA: Texas |
2021/7/9 |
| DVSP51815661 |
QYN76404.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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nasopharyngeal swab |
USA |
2021/7/27 |
| DVSP51815662 |
QYN76260.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
MFVFLVLLPLVSSQCVNLRTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLDVYYHKNNKSWMESGVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYRYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSKPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSRRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQNVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/OH-GD-SID-21072633178/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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nasopharyngeal swab |
USA |
2021/7/26 |
| DVSP51815663 |
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MZ726535.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/KY-GD-SID-21072632600/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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nasopharyngeal swab |
USA |
2021/7/26 |
| DVSP51815664 |
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SARS-CoV-2/human/USA/OH-GD-SID-21072532031/2021 |
nasopharyngeal swab |
USA |
2021/7/25 |
| DVSP51815665 |
QYN76119.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ726530.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/OH-GD-SID-21072531894/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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nasopharyngeal swab |
USA |
2021/7/25 |
| DVSP51815666 |
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MZ726482.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CO-GD-SID-21070910731/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/CO-GD-SID-21070910731/2021 |
nasopharyngeal swab |
USA |
2021/7/9 |
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QYM90346.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ724565.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-2-4678864/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-2-4678864/2021 |
Anterior nasal swab |
USA: CA |
2021/7/6 |
| DVSP51815668 |
QYM90286.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
MFVFLVLLPLVSSQCVNLRTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLDVYYHKNNKSWMESGVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYRYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSKPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSRRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQNVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
MZ724559.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CO-CDC-2-4678878/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， and ORF6 protein (ORF6) genes， complete cds; ORF7a gene， complete sequence; ORF7b (ORF7b) gene， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/CO-CDC-2-4678878/2021 |
nasopharyngeal swab |
USA: CO |
2021/7/6 |
| DVSP51815669 |
QYM90222.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
MFVFLVLLPLVSSQCVNLRTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLDVYYHKNNKSWMESGVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYRYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSKPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSRRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQNVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
MZ724553.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/AL-CDC-2-4679554/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/AL-CDC-2-4679554/2021 |
Nasal midturbinate swab |
USA: AL |
2021/7/20 |
| DVSP51815670 |
QYM90191.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ724550.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/NJ-CDC-2-4679369/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， and ORF6 protein (ORF6) genes， complete cds; ORF7a gene， complete sequence; ORF7b (ORF7b) gene， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/NJ-CDC-2-4679369/2021 |
Anterior nasal swab |
USA: NJ |
2021/7/15 |
| DVSP51815671 |
QYM90158.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
MFVFLVLLPLVSSQCVNLRTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLDVYYHKNNKSWMESGVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYRYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSKPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSRRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQNVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
MZ724547.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/PR-CDC-2-4678863/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， and envelope protein (E) genes， complete cds; membrane glycoprotein (M) gene， partial cds; ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/PR-CDC-2-4678863/2021 |
nasopharyngeal swab |
USA: PR |
2021/7/10 |
| DVSP51815672 |
QYM90124.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
MFVFLVLLPLVSSQCVNLRTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLDVYYHKNNKSWMESGVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYRYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSKPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSRRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQNVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
MZ724544.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/SD-CDC-2-4679557/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
ATGTTTGTTTTTCTTGTTTTATTGCCACTAGTCTCTAGTCAGTGTGTTAATCTTAGAACCAGAACTCAATTACCCCCTGCATACACTAATTCTTTCACACGTGGTGTTTATTACCCTGACAAAGTTTTCAGATCCTCAGTTTTACATTCAACTCAGGACTTGTTCTTACCTTTCTTTTCCAATGTTACTTGGTTCCATGCTATACATGTCTCTGGGACCAATGGTACTAAGAGGTTTGATAACCCTGTCCTACCATTTAATGATGGTGTTTATTTTGCTTCCACTGAGAAGTCTAACATAATAAGAGGCTGGATTTTTGGTACTACTTTAGATTCGAAGACCCAGTCCCTACTTATTGTTAATAACGCTACTAATGTTGTTATTAAAGTCTGTGAATTTCAATTTTGTAATGATCCATTTTTGGATGTTTATTACCACAAAAACAACAAAAGTTGGATGGAAAGTGGAGTTTATTCTAGTGCGAATAATTGCACTTTTGAATATGTCTCTCAGCCTTTTCTTATGGACCTTGAAGGAAAACAGGGTAATTTCAAAAATCTTAGGGAATTTGTGTTTAAGAATATTGATGGTTATTTTAAAATATATTCTAAGCACACGCCTATTAATTTAGTGCGTGATCTCCCTCAGGGTTTTTCGGCTTTAGAACCATTGGTAGATTTGCCAATAGGTATTAACATCACTAGGTTTCAAACTTTACTTGCTTTACATAGAAGTTATTTGACTCCTGGTGATTCTTCTTCAGGTTGGACAGCTGGTGCTGCAGCTTATTATGTGGGTTATCTTCAACCTAGGACTTTTCTATTAAAATATAATGAAAATGGAACCATTACAGATGCTGTAGACTGTGCACTTGACCCTCTCTCAGAAACAAAGTGTACGTTGAAATCCTTCACTGTAGAAAAAGGAATCTATCAAACTTCTAACTTTAGAGTCCAACCAACAGAATCTATTGTTAGATTTCCTAATATTACAAACTTGTGCCCTTTTGGTGAAGTTTTTAACGCCACCAGATTTGCATCTGTTTATGCTTGGAACAGGAAGAGAATCAGCAACTGTGTTGCTGATTATTCTGTCCTATATAATTCCGCATCATTTTCCACTTTTAAGTGTTATGGAGTGTCTCCTACTAAATTAAATGATCTCTGCTTTACTAATGTCTATGCAGATTCATTTGTAATTAGAGGTGATGAAGTCAGACAAATCGCTCCAGGGCAAACTGGAAAGATTGCTGATTATAATTATAAATTACCAGATGATTTTACAGGCTGCGTTATAGCTTGGAATTCTAACAATCTTGATTCTAAGGTTGGTGGTAATTATAATTACCGGTATAGATTGTTTAGGAAGTCTAATCTCAAACCTTTTGAGAGAGATATTTCAACTGAAATCTATCAGGCCGGTAGCAAACCTTGTAATGGTGTTGAAGGTTTTAATTGTTACTTTCCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACTAATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTAGTAGTACTTTCTTTTGAACTTCTACATGCACCAGCAACTGTTTGTGGACCTAAAAAGTCTACTAATTTGGTTAAAAACAAATGTGTCAATTTCAACTTCAATGGTTTAACAGGCACAGGTGTTCTTACTGAGTCTAACAAAAAGTTTCTGCCTTTCCAACAATTTGGCAGAGACATTGCTGACACTACTGATGCTGTCCGTGATCCACAGACACTTGAGATTCTTGACATTACACCATGTTCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCAGGAACAAATACTTCTAACCAGGTTGCTGTTCTTTATCAGGGTGTTAACTGCACAGAAGTCCCTGTTGCTATTCATGCAGATCAACTTACTCCTACTTGGCGTGTTTATTCTACAGGTTCTAATGTTTTTCAAACACGTGCAGGCTGTTTAATAGGGGCTGAACATGTCAACAACTCATATGAGTGTGACATACCCATTGGTGCAGGTATATGCGCTAGTTATCAGACTCAGACTAATTCTCGTCGGCGGGCACGTAGTGTAGCTAGTCAATCCATCATTGCCTACACTATGTCACTTGGTGCAGAAAATTCAGTTGCTTACTCTAATAACTCTATTGCCATACCCACAAATTTTACTATTAGTGTTACCACAGAAATTCTACCAGTGTCTATGACCAAGACATCAGTAGATTGTACAATGTACATTTGTGGTGATTCAACTGAATGCAGCAATCTTTTGTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACACAATTAAACCGTGCTTTAACTGGAATAGCTGTTGAACAAGACAAAAACACCCAAGAAGTTTTTGCACAAGTCAAACAAATTTACAAAACACCACCAATTAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCAGATCCATCAAAACCAAGCAAGAGGTCATTTATTGAAGATCTACTTTTCAACAAAGTGACACTTGCAGATGCTGGCTTCATCAAACAATATGGTGATTGCCTTGGTGATATTGCTGCTAGAGACCTCATTTGTGCACAAAAGTTTAACGGCCTTACTGTTTTGCCACCTTTGCTCACAGATGAAATGATTGCTCAATACACTTCTGCACTGTTAGCGGGTACAATCACTTCTGGTTGGACCTTTGGTGCAGGTGCTGCATTACAAATACCATTTGCTATGCAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGAGTTACACAGAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAATTGATTGCCAACCAATTTAATAGTGCTATTGGCAAAATTCAAGACTCACTTTCTTCCACAGCAAGTGCACTTGGAAAACTTCAAAATGTGGTCAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAGCTCCAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTTTTAAATGATATCCTTTCACGTCTTGACAAAGTTGAGGCTGAAGTGCAAATTGATAGGTTGATCACAGGCAGACTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAACAATTAATTAGAGCTGCAGAAATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCAGAGTGTGTACTTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATGTCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTATGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATGATGGAAAAGCACACTTTCCTCGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACACACTGGTTTGTAACACAAAGGAATTTTTATGAACCACAAATCATTACTACAGACAACACATTTGTGTCTGGTAACTGTGATGTTGTAATAGGAATTGTCAACAACACAGTTTATGATCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCATTCAAGGAGGAGTTAGATAAATATTTTAAGAATCATACATCACCAGATGTTGATTTAGGTGACATCTCTGGCATTAATGCTTCAGTTGTAAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTTGCCAAGAATTTAAATGAATCTCTCATCGATCTCCAAGAACTTGGAAAGTATGAGCAGTATATAAAATGGCCATGGTACATTTGGCTAGGTTTTATAGCTGGCTTGATTGCCATAGTAATGGTGACAATTATGCTTTGCTGTATGACCAGTTGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGTGGATCCTGCTGCAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCAGTGCTCAAAGGAGTCAAATTACATTACACATAA |
SARS-CoV-2/human/USA/SD-CDC-2-4679557/2021 |
nasopharyngeal swab |
USA: SD |
2021/7/22 |
| DVSP51815673 |
QYM90093.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ724541.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/NV-CDC-2-4679553/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， and surface glycoprotein (S) genes， complete cds; ORF3a gene， complete sequence; envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/NV-CDC-2-4679553/2021 |
Nasal midturbinate swab |
USA: NV |
2021/7/22 |
| DVSP51815674 |
QYM89947.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
MFVFLVLLPLVSSQCVNLRTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLDVYYHKNNKSWMESGVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYRYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSKPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSRRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQNVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
MZ724535.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/IND/hospital_3_254/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/IND/hospital_3_254/2021 |
nasopharyngeal swab |
India |
2021/4/26 |
| DVSP51815675 |
QYM89914.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
MFVFLVLLPLVSSQCVNLRTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLDVYYHKNNKSWMESGVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYRYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSKPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSRRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQNVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
MZ724532.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/IND/hospital_3_249/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/IND/hospital_3_249/2021 |
nasopharyngeal swab |
India |
2021/4/24 |
| DVSP51815676 |
QYM88683.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ724421.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/IND/Hospital_1_41/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/IND/Hospital_1_41/2021 |
nasopharyngeal swab |
India |
2021/4/6 |
| DVSP51815677 |
QYM87061.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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SARS-CoV-2/human/USA/UT-UPHL-210721995500/2021 |
-- |
USA |
2021/4/23 |
| DVSP51815678 |
QYM87050.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/UT-UPHL-210721994349/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab)， ORF1a polyprotein (ORF1ab)， surface glycoprotein (S)， ORF3a protein (ORF3a)， envelope protein (E)， membrane glycoprotein (M)， ORF6 protein (ORF6)， ORF7a protein (ORF7a)， and ORF7b (ORF7b) genes， complete cds; ORF8 gene， complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes， complete cds. |
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-- |
USA |
2021/4/23 |
| DVSP51815679 |
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surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/UT-UPHL-210721987772/2021， complete genome. |
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2021/7/8 |