Protein

Protein Id:  ABG11965.1 Length:   1360 aa
Description:   spike Bat coronavirus A701/2005. Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   19-Jul-06
Source:   Bat coronavirus A701/2005
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Bat coronavirus
Host:   -- Authors:   Tang;X.C.; Zhang;J.X.; Zhang;S.Y.; Wang;P.; Fan;X.H.; Li;L.F.; Li;G.; Dong;B.Q.; Liu;W.; Cheung;C.L.; Xu;K.M.; Song;W.J.; Vijaykrishna;D.; Poon;L.L.; Peiris;J.S.; Smith;G.J.; Chen;H. and Guan;Y.
Title:   Prevalence and genetic diversity of coronaviruses in bats from China Journal:   J Virol 80 (15); 7481-7490 (2006)
Taxonomy:   Bat coronavirus A701/2005 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; unclassified Alphacoronavirus.
db_xref:   """taxon:389256, CDD:279880, CDD:279881"""
Sequence:   MKYLLLLIFIGHIQKAALNPSCNGPSDFTRFFSRFNLPSNAQLVVGGYLPNSNESWVCNTAKHTQNNTHGFFVNIGSGNGGFVIGVSQKVFDPTKWQLYIFKPANQHAIAMRICKWPNADLDIELSPGASGATECLFRDGNIGFNVPQNQNVILGLTWSDDSFTLFTDRITKFKLDNADWSLVRAVCTNSASCPMQFSRSIIYYMFNTTDSLQYSLCTAPDCQGFATNVFAVEDGGYIPSSFSFNNWFLLTNTSTLVNGRVLSNQPLLVSCLIAVPKFLTGSSTFYFNDTLSDGCNGAQTNHTPEAFRFNINDTQALVAANSVVLTTIEGFDISLICSNTSDPLSASSFSIPFGAVDTVHYCFLNVSYGVNYTIEFLSVLPPSVKEVVVTKYGSVYINGYGYIHTGQLASVQINIPPNGESYGVWTVAATMFTDVMVEVNGTNIVRVLYCDNPETRLMCSQLSFDLQDGFYAITPYNDYFVDQPYAFVQLPAFNNHAFLKLELNVTFGQFVNSAVESYSILFNGEESSCVSTSQFTLSISTNFVPKNAYHDLIFQSKCPFTPYSVNNYLPFGKFCVSNHTLAEACQVEVYVKRSSDTHYITTLYFQHSSGDVVTGVPEALGGVTDVSFFEEGVCSQYTIYGHKGQGKIVKSDVEYLAGLYYTAPSGQILAFKNITTGDIYSVLPCSFSQQAVFIEGRIVGVMSSINSTYAYNYTKELPGFFYHSNDDSNCTEPALVYSNIGVCKNGAIGLVGIRNTQPKIQPMSEGVISIPTNLTMQIRTEYIQLFSKPVSIDCAMYVCNGNERCNRLLGQYASACRTIESSLQLSARLESVEVNDMLTISEKALELGTIQKFGGGDYNFTNVLGTSTGQKSVIEDILFDKVVTNGLGTVDEDYKKCTNGLSISDLVCAQYYNGIMVLPGVADAEKVHMYSASLMGGMALGGITAAAALPFSYAVQARLNYVALQTDVLQRNQQLLAQSFNNAIGNITMAFESVNDAIEQTSQGLSTVAQALTKVQDVVNGQGLALSHLTNQLQNNFQAISSSISDIYARLDQLTADAQVDRLITGRLSALNAFVSQTMTRYVEVQASRRLAQQKVNECVKSQSTRYGFCGDDGEHIFSMVQGAPQGLMFLHTVLVPSGYVNVTAVSGLCVDDTRAFVLREPGLVMFKQDSSTNSYFLTPRKMFEPRAISVTDLVQVETCLVAYFNLSSDQLPDVVPDYIDVNKTLEDILASLPNRTEPNFPLDVFNATYLNLTGEXADLEMRSEYLKNTTEELRLLINSINSTLVDLEWLNRVETFIKWPWWVWLIIVIVLIFVVSLLLFCCIATGCCGCCGCFGACFSGCCKGPRLQPYEPIEKVHIQ

Nucleotide

Nucleotide_Id:  DQ648793.1 Length:   4083bp
Description:   Bat coronavirus (BtCoV/A701/2005) spike (S) gene; complete cds Source:   Bat coronavirus A701/2005
Nucleotide_type:   RNA Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   19-Jul-06
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Bat coronavirus
CDS:   DQ648793.1:1..4083 Host:   --
Authors:   Tang;X.C.; Zhang;J.X.; Zhang;S.Y.; Wang;P.; Fan;X.H.; Li;L.F.; Li;G.; Dong;B.Q.; Liu;W.; Cheung;C.L.; Xu;K.M.; Song;W.J.; Vijaykrishna;D.; Poon;L.L.; Peiris;J.S.; Smith;G.J.; Chen;H. and Guan;Y. Journal:   J Virol 80 (15); 7481-7490 (2006)
Title:   Prevalence and genetic diversity of coronaviruses in bats from China db_xref:   taxon:389256
Taxonomy:   Bat coronavirus A701/2005 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; unclassified Alphacoronavirus.
Features:   SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4083); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4083); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4083); strand=1); type='CDS')
Sequence:   ATGAAGTATTTGCTTCTTTTAATTTTTATAGGTCATATTCAGAAGGCTGCACTTAATCCTAGTTGTAATGGACCTAGTGATTTTACTAGGTTCTTTTCTAGATTTAACTTACCATCCAATGCCCAGTTAGTCGTTGGTGGCTATTTGCCTAATAGCAATGAGAGCTGGGTCTGTAATACTGCTAAACACACGCAGAATAATACTCATGGCTTCTTTGTTAATATTGGTTCTGGAAATGGTGGTTTTGTTATTGGAGTGTCACAGAAGGTTTTTGATCCTACTAAGTGGCAACTCTACATTTTTAAACCTGCTAACCAACATGCAATTGCCATGCGTATTTGTAAGTGGCCTAATGCTGATCTCGACATAGAACTTTCACCTGGTGCCTCAGGTGCAACTGAGTGCTTGTTTAGAGATGGTAATATAGGTTTTAATGTACCTCAAAACCAGAATGTTATATTAGGTCTTACTTGGTCTGATGACAGCTTTACTCTATTTACAGATCGCATTACCAAGTTTAAACTTGACAATGCTGATTGGTCTCTTGTAAGAGCTGTCTGCACCAATTCTGCCTCTTGTCCTATGCAGTTTTCACGTAGTATTATTTATTATATGTTTAATACTACTGATTCATTACAATACTCACTTTGTACTGCACCTGATTGTCAAGGCTTTGCCACCAATGTTTTTGCTGTTGAAGATGGTGGTTATATACCTTCGAGCTTTAGTTTTAATAATTGGTTTTTGCTTACAAACACCTCCACTCTTGTCAATGGCCGTGTTCTTTCCAACCAGCCATTGCTTGTTAGTTGTCTTATAGCTGTACCTAAGTTTTTAACTGGTTCTAGCACTTTTTATTTTAATGACACTCTTAGTGATGGTTGTAACGGTGCGCAAACTAACCACACGCCTGAAGCTTTTAGGTTTAATATTAACGACACTCAAGCTTTAGTTGCTGCTAATAGTGTTGTTCTAACCACCATTGAGGGTTTTGACATATCTTTGATATGTTCTAATACTAGTGACCCTCTCTCAGCTTCAAGTTTTTCCATTCCTTTTGGCGCTGTTGACACTGTTCATTACTGCTTTCTTAATGTTAGTTATGGTGTCAACTACACTATAGAGTTTTTGTCAGTGTTACCGCCCAGTGTTAAAGAGGTCGTGGTGACTAAATATGGCTCAGTTTATATTAATGGCTATGGTTATATTCATACAGGTCAACTTGCATCAGTTCAAATTAATATTCCACCAAATGGTGAGTCATATGGTGTTTGGACTGTTGCTGCCACTATGTTTACTGATGTCATGGTTGAAGTTAATGGTACTAATATAGTTCGTGTGCTTTACTGTGACAACCCAGAGACAAGGCTTATGTGCTCTCAACTTAGTTTTGATTTACAGGATGGCTTTTATGCTATCACACCTTATAATGATTACTTTGTTGATCAGCCATACGCATTTGTGCAGTTACCAGCATTTAACAACCATGCCTTTTTGAAGCTCGAGCTTAACGTGACTTTTGGTCAGTTTGTTAATAGTGCTGTTGAATCTTACTCAATACTCTTCAATGGTGAAGAGTCTTCTTGTGTTTCAACTTCCCAATTCACACTCTCCATTAGTACTAATTTTGTGCCTAAGAATGCATACCACGACCTTATTTTCCAGAGCAAGTGCCCATTTACACCTTATAGTGTTAATAATTACTTGCCTTTTGGCAAGTTCTGTGTTTCTAATCACACTCTAGCTGAAGCTTGTCAGGTGGAGGTGTATGTTAAACGCAGTTCAGACACTCATTACATTACCACATTGTATTTTCAGCACTCTAGTGGTGATGTTGTGACAGGTGTTCCGGAAGCACTTGGTGGTGTAACAGACGTTTCCTTTTTTGAAGAGGGTGTTTGTTCTCAATACACCATATATGGCCACAAGGGACAAGGTAAGATTGTCAAATCTGATGTAGAATATTTGGCAGGTCTTTACTATACAGCTCCCTCTGGTCAAATTCTTGCTTTTAAAAATATCACTACAGGTGATATTTATTCAGTCCTACCTTGCTCTTTTTCACAGCAAGCTGTTTTTATTGAAGGCCGCATTGTTGGAGTTATGAGTAGTATTAATTCTACCTATGCGTATAATTATACTAAGGAGTTGCCTGGTTTTTTCTATCATTCTAATGATGATTCTAATTGTACTGAACCAGCACTCGTTTATTCTAACATTGGCGTTTGTAAAAATGGCGCTATTGGTCTTGTTGGCATAAGAAATACACAGCCTAAGATTCAGCCTATGTCTGAAGGTGTTATAAGTATTCCTACCAACTTGACTATGCAGATCAGGACTGAGTATATACAATTGTTTAGTAAGCCTGTTAGCATTGACTGTGCAATGTATGTTTGTAACGGTAATGAGCGTTGTAACAGGCTTCTTGGTCAATATGCTTCTGCTTGTAGAACTATAGAGTCTTCTTTGCAGTTAAGCGCCAGACTTGAATCTGTAGAGGTAAATGACATGTTAACTATTTCAGAAAAGGCGCTGGAGCTTGGCACCATACAGAAGTTTGGTGGTGGAGATTATAACTTCACTAATGTACTTGGTACTTCTACAGGCCAGAAAAGTGTCATTGAGGATATACTTTTTGATAAAGTTGTCACCAATGGTTTAGGTACCGTTGATGAAGACTATAAAAAGTGTACAAATGGCCTTTCTATTTCAGACCTCGTTTGTGCGCAGTACTACAATGGCATCATGGTGCTTCCTGGCGTTGCTGACGCTGAAAAAGTTCACATGTATAGTGCATCTTTGATGGGTGGTATGGCTTTGGGTGGTATTACAGCTGCTGCTGCTTTACCATTTAGTTATGCTGTTCAGGCTAGACTCAATTACGTTGCTTTACAGACTGATGTTTTGCAGCGCAACCAGCAATTGTTGGCACAATCATTCAATAATGCTATTGGTAACATTACCATGGCTTTTGAAAGTGTCAACGATGCAATTGAGCAGACTTCTCAAGGACTTAGTACTGTTGCACAGGCTCTTACTAAGGTTCAAGATGTCGTTAACGGCCAGGGTCTAGCTTTATCTCATCTTACAAACCAACTGCAGAACAATTTTCAGGCTATATCTAGTTCTATCAGTGACATCTATGCAAGGCTTGATCAGCTGACAGCTGACGCCCAGGTTGATAGACTTATCACTGGACGTTTGTCTGCACTTAATGCATTTGTGTCTCAGACTATGACTAGGTATGTTGAAGTTCAAGCCAGTAGGCGTCTTGCACAGCAGAAAGTCAACGAATGTGTAAAATCACAATCTACCCGCTATGGTTTTTGTGGTGATGATGGTGAACACATTTTTTCTATGGTGCAAGGTGCTCCTCAGGGACTTATGTTTCTTCACACCGTCCTTGTTCCTTCTGGTTATGTTAATGTTACTGCTGTTTCTGGTTTGTGTGTTGATGATACTAGGGCATTTGTTTTGCGTGAGCCAGGTTTGGTCATGTTTAARCAAGATTCCAGTACTAACTCATACTTTCTTACACCCAGAAAGATGTTTGAACCTCGTGCTATTAGTGTTACTGACCTTGTACAAGTTGAAACCTGTTTGGTGGCTTATTTCAACTTGTCTTCTGATCAGTTACCTGATGTAGTCCCTGACTACATTGATGTGAATAAAACTTTAGAGGATATTTTGGCTAGTCTTCCTAATAGGACAGAACCTAATTTTCCTCTAGATGTTTTTAATGCCACCTATCTTAATTTAACTGGTGAGRTTGCTGACCTTGAGATGCGCTCTGAGTATTTGAAAAATACTACTGAGGAGTTGCGTCTTTTGATTAACAGTATCAACAGCACACTAGTCGACCTAGAATGGCTTAACCGTGTTGAAACATTTATTAAATGGCCGTGGTGGGTCTGGTTGATTATTGTTATTGTCTTAATTTTTGTAGTTTCACTACTTTTGTTCTGCTGTATTGCTACAGGTTGCTGTGGTTGCTGTGGATGTTTTGGAGCGTGTTTTTCAGGTTGTTGTAAGGGTCCTAGACTTCAACCTTACGAACCTATTGAAAAAGTTCACATCCAATAA