Protein Id: ABG11965.1 |
Length: 1360 aa |
Description: spike Bat coronavirus A701/2005. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 19-Jul-06 |
Source: Bat coronavirus A701/2005 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Bat coronavirus |
Host: -- |
Authors: Tang;X.C.; Zhang;J.X.; Zhang;S.Y.; Wang;P.; Fan;X.H.; Li;L.F.; Li;G.; Dong;B.Q.; Liu;W.; Cheung;C.L.; Xu;K.M.; Song;W.J.; Vijaykrishna;D.; Poon;L.L.; Peiris;J.S.; Smith;G.J.; Chen;H. and Guan;Y. |
Title: Prevalence and genetic diversity of coronaviruses in bats from China |
Journal: J Virol 80 (15); 7481-7490 (2006) |
Taxonomy: Bat coronavirus A701/2005 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; unclassified Alphacoronavirus. |
db_xref: """taxon:389256, CDD:279880, CDD:279881""" |
Sequence: MKYLLLLIFIGHIQKAALNPSCNGPSDFTRFFSRFNLPSNAQLVVGGYLPNSNESWVCNTAKHTQNNTHGFFVNIGSGNGGFVIGVSQKVFDPTKWQLYIFKPANQHAIAMRICKWPNADLDIELSPGASGATECLFRDGNIGFNVPQNQNVILGLTWSDDSFTLFTDRITKFKLDNADWSLVRAVCTNSASCPMQFSRSIIYYMFNTTDSLQYSLCTAPDCQGFATNVFAVEDGGYIPSSFSFNNWFLLTNTSTLVNGRVLSNQPLLVSCLIAVPKFLTGSSTFYFNDTLSDGCNGAQTNHTPEAFRFNINDTQALVAANSVVLTTIEGFDISLICSNTSDPLSASSFSIPFGAVDTVHYCFLNVSYGVNYTIEFLSVLPPSVKEVVVTKYGSVYINGYGYIHTGQLASVQINIPPNGESYGVWTVAATMFTDVMVEVNGTNIVRVLYCDNPETRLMCSQLSFDLQDGFYAITPYNDYFVDQPYAFVQLPAFNNHAFLKLELNVTFGQFVNSAVESYSILFNGEESSCVSTSQFTLSISTNFVPKNAYHDLIFQSKCPFTPYSVNNYLPFGKFCVSNHTLAEACQVEVYVKRSSDTHYITTLYFQHSSGDVVTGVPEALGGVTDVSFFEEGVCSQYTIYGHKGQGKIVKSDVEYLAGLYYTAPSGQILAFKNITTGDIYSVLPCSFSQQAVFIEGRIVGVMSSINSTYAYNYTKELPGFFYHSNDDSNCTEPALVYSNIGVCKNGAIGLVGIRNTQPKIQPMSEGVISIPTNLTMQIRTEYIQLFSKPVSIDCAMYVCNGNERCNRLLGQYASACRTIESSLQLSARLESVEVNDMLTISEKALELGTIQKFGGGDYNFTNVLGTSTGQKSVIEDILFDKVVTNGLGTVDEDYKKCTNGLSISDLVCAQYYNGIMVLPGVADAEKVHMYSASLMGGMALGGITAAAALPFSYAVQARLNYVALQTDVLQRNQQLLAQSFNNAIGNITMAFESVNDAIEQTSQGLSTVAQALTKVQDVVNGQGLALSHLTNQLQNNFQAISSSISDIYARLDQLTADAQVDRLITGRLSALNAFVSQTMTRYVEVQASRRLAQQKVNECVKSQSTRYGFCGDDGEHIFSMVQGAPQGLMFLHTVLVPSGYVNVTAVSGLCVDDTRAFVLREPGLVMFKQDSSTNSYFLTPRKMFEPRAISVTDLVQVETCLVAYFNLSSDQLPDVVPDYIDVNKTLEDILASLPNRTEPNFPLDVFNATYLNLTGEXADLEMRSEYLKNTTEELRLLINSINSTLVDLEWLNRVETFIKWPWWVWLIIVIVLIFVVSLLLFCCIATGCCGCCGCFGACFSGCCKGPRLQPYEPIEKVHIQ |
Nucleotide
Nucleotide_Id: DQ648793.1 |
Length: 4083bp |
Description: Bat coronavirus (BtCoV/A701/2005) spike (S) gene; complete cds |
Source: Bat coronavirus A701/2005 |
Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 19-Jul-06 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Bat coronavirus |
CDS: DQ648793.1:1..4083 |
Host: -- |
Authors: Tang;X.C.; Zhang;J.X.; Zhang;S.Y.; Wang;P.; Fan;X.H.; Li;L.F.; Li;G.; Dong;B.Q.; Liu;W.; Cheung;C.L.; Xu;K.M.; Song;W.J.; Vijaykrishna;D.; Poon;L.L.; Peiris;J.S.; Smith;G.J.; Chen;H. and Guan;Y. |
Journal: J Virol 80 (15); 7481-7490 (2006) |
Title: Prevalence and genetic diversity of coronaviruses in bats from China |
db_xref: taxon:389256 |
Taxonomy: Bat coronavirus A701/2005 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; unclassified Alphacoronavirus. |
Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4083); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4083); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4083); strand=1); type='CDS') |
Sequence: ATGAAGTATTTGCTTCTTTTAATTTTTATAGGTCATATTCAGAAGGCTGCACTTAATCCTAGTTGTAATGGACCTAGTGATTTTACTAGGTTCTTTTCTAGATTTAACTTACCATCCAATGCCCAGTTAGTCGTTGGTGGCTATTTGCCTAATAGCAATGAGAGCTGGGTCTGTAATACTGCTAAACACACGCAGAATAATACTCATGGCTTCTTTGTTAATATTGGTTCTGGAAATGGTGGTTTTGTTATTGGAGTGTCACAGAAGGTTTTTGATCCTACTAAGTGGCAACTCTACATTTTTAAACCTGCTAACCAACATGCAATTGCCATGCGTATTTGTAAGTGGCCTAATGCTGATCTCGACATAGAACTTTCACCTGGTGCCTCAGGTGCAACTGAGTGCTTGTTTAGAGATGGTAATATAGGTTTTAATGTACCTCAAAACCAGAATGTTATATTAGGTCTTACTTGGTCTGATGACAGCTTTACTCTATTTACAGATCGCATTACCAAGTTTAAACTTGACAATGCTGATTGGTCTCTTGTAAGAGCTGTCTGCACCAATTCTGCCTCTTGTCCTATGCAGTTTTCACGTAGTATTATTTATTATATGTTTAATACTACTGATTCATTACAATACTCACTTTGTACTGCACCTGATTGTCAAGGCTTTGCCACCAATGTTTTTGCTGTTGAAGATGGTGGTTATATACCTTCGAGCTTTAGTTTTAATAATTGGTTTTTGCTTACAAACACCTCCACTCTTGTCAATGGCCGTGTTCTTTCCAACCAGCCATTGCTTGTTAGTTGTCTTATAGCTGTACCTAAGTTTTTAACTGGTTCTAGCACTTTTTATTTTAATGACACTCTTAGTGATGGTTGTAACGGTGCGCAAACTAACCACACGCCTGAAGCTTTTAGGTTTAATATTAACGACACTCAAGCTTTAGTTGCTGCTAATAGTGTTGTTCTAACCACCATTGAGGGTTTTGACATATCTTTGATATGTTCTAATACTAGTGACCCTCTCTCAGCTTCAAGTTTTTCCATTCCTTTTGGCGCTGTTGACACTGTTCATTACTGCTTTCTTAATGTTAGTTATGGTGTCAACTACACTATAGAGTTTTTGTCAGTGTTACCGCCCAGTGTTAAAGAGGTCGTGGTGACTAAATATGGCTCAGTTTATATTAATGGCTATGGTTATATTCATACAGGTCAACTTGCATCAGTTCAAATTAATATTCCACCAAATGGTGAGTCATATGGTGTTTGGACTGTTGCTGCCACTATGTTTACTGATGTCATGGTTGAAGTTAATGGTACTAATATAGTTCGTGTGCTTTACTGTGACAACCCAGAGACAAGGCTTATGTGCTCTCAACTTAGTTTTGATTTACAGGATGGCTTTTATGCTATCACACCTTATAATGATTACTTTGTTGATCAGCCATACGCATTTGTGCAGTTACCAGCATTTAACAACCATGCCTTTTTGAAGCTCGAGCTTAACGTGACTTTTGGTCAGTTTGTTAATAGTGCTGTTGAATCTTACTCAATACTCTTCAATGGTGAAGAGTCTTCTTGTGTTTCAACTTCCCAATTCACACTCTCCATTAGTACTAATTTTGTGCCTAAGAATGCATACCACGACCTTATTTTCCAGAGCAAGTGCCCATTTACACCTTATAGTGTTAATAATTACTTGCCTTTTGGCAAGTTCTGTGTTTCTAATCACACTCTAGCTGAAGCTTGTCAGGTGGAGGTGTATGTTAAACGCAGTTCAGACACTCATTACATTACCACATTGTATTTTCAGCACTCTAGTGGTGATGTTGTGACAGGTGTTCCGGAAGCACTTGGTGGTGTAACAGACGTTTCCTTTTTTGAAGAGGGTGTTTGTTCTCAATACACCATATATGGCCACAAGGGACAAGGTAAGATTGTCAAATCTGATGTAGAATATTTGGCAGGTCTTTACTATACAGCTCCCTCTGGTCAAATTCTTGCTTTTAAAAATATCACTACAGGTGATATTTATTCAGTCCTACCTTGCTCTTTTTCACAGCAAGCTGTTTTTATTGAAGGCCGCATTGTTGGAGTTATGAGTAGTATTAATTCTACCTATGCGTATAATTATACTAAGGAGTTGCCTGGTTTTTTCTATCATTCTAATGATGATTCTAATTGTACTGAACCAGCACTCGTTTATTCTAACATTGGCGTTTGTAAAAATGGCGCTATTGGTCTTGTTGGCATAAGAAATACACAGCCTAAGATTCAGCCTATGTCTGAAGGTGTTATAAGTATTCCTACCAACTTGACTATGCAGATCAGGACTGAGTATATACAATTGTTTAGTAAGCCTGTTAGCATTGACTGTGCAATGTATGTTTGTAACGGTAATGAGCGTTGTAACAGGCTTCTTGGTCAATATGCTTCTGCTTGTAGAACTATAGAGTCTTCTTTGCAGTTAAGCGCCAGACTTGAATCTGTAGAGGTAAATGACATGTTAACTATTTCAGAAAAGGCGCTGGAGCTTGGCACCATACAGAAGTTTGGTGGTGGAGATTATAACTTCACTAATGTACTTGGTACTTCTACAGGCCAGAAAAGTGTCATTGAGGATATACTTTTTGATAAAGTTGTCACCAATGGTTTAGGTACCGTTGATGAAGACTATAAAAAGTGTACAAATGGCCTTTCTATTTCAGACCTCGTTTGTGCGCAGTACTACAATGGCATCATGGTGCTTCCTGGCGTTGCTGACGCTGAAAAAGTTCACATGTATAGTGCATCTTTGATGGGTGGTATGGCTTTGGGTGGTATTACAGCTGCTGCTGCTTTACCATTTAGTTATGCTGTTCAGGCTAGACTCAATTACGTTGCTTTACAGACTGATGTTTTGCAGCGCAACCAGCAATTGTTGGCACAATCATTCAATAATGCTATTGGTAACATTACCATGGCTTTTGAAAGTGTCAACGATGCAATTGAGCAGACTTCTCAAGGACTTAGTACTGTTGCACAGGCTCTTACTAAGGTTCAAGATGTCGTTAACGGCCAGGGTCTAGCTTTATCTCATCTTACAAACCAACTGCAGAACAATTTTCAGGCTATATCTAGTTCTATCAGTGACATCTATGCAAGGCTTGATCAGCTGACAGCTGACGCCCAGGTTGATAGACTTATCACTGGACGTTTGTCTGCACTTAATGCATTTGTGTCTCAGACTATGACTAGGTATGTTGAAGTTCAAGCCAGTAGGCGTCTTGCACAGCAGAAAGTCAACGAATGTGTAAAATCACAATCTACCCGCTATGGTTTTTGTGGTGATGATGGTGAACACATTTTTTCTATGGTGCAAGGTGCTCCTCAGGGACTTATGTTTCTTCACACCGTCCTTGTTCCTTCTGGTTATGTTAATGTTACTGCTGTTTCTGGTTTGTGTGTTGATGATACTAGGGCATTTGTTTTGCGTGAGCCAGGTTTGGTCATGTTTAARCAAGATTCCAGTACTAACTCATACTTTCTTACACCCAGAAAGATGTTTGAACCTCGTGCTATTAGTGTTACTGACCTTGTACAAGTTGAAACCTGTTTGGTGGCTTATTTCAACTTGTCTTCTGATCAGTTACCTGATGTAGTCCCTGACTACATTGATGTGAATAAAACTTTAGAGGATATTTTGGCTAGTCTTCCTAATAGGACAGAACCTAATTTTCCTCTAGATGTTTTTAATGCCACCTATCTTAATTTAACTGGTGAGRTTGCTGACCTTGAGATGCGCTCTGAGTATTTGAAAAATACTACTGAGGAGTTGCGTCTTTTGATTAACAGTATCAACAGCACACTAGTCGACCTAGAATGGCTTAACCGTGTTGAAACATTTATTAAATGGCCGTGGTGGGTCTGGTTGATTATTGTTATTGTCTTAATTTTTGTAGTTTCACTACTTTTGTTCTGCTGTATTGCTACAGGTTGCTGTGGTTGCTGTGGATGTTTTGGAGCGTGTTTTTCAGGTTGTTGTAAGGGTCCTAGACTTCAACCTTACGAACCTATTGAAAAAGTTCACATCCAATAA |