| Protein Id: ABO88151.1 |
Length: 1372 aa |
| Description: spike protein Bat coronavirus Shandong/977/2006. |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 10-Apr-07 |
| Source: Bat coronavirus Shandong/977/2006 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Bat coronavirus |
| Host: Rhinolophus ferrumequinum |
Authors: Vijaykrishna;D.; Smith;G.J.; Zhang;J.X.; Peiris;J.S.; Chen;H. and Guan;Y. |
| Title: Evolutionary insights into the ecology of coronaviruses |
Journal: J Virol 81 (8); 4012-4020 (2007) |
| Taxonomy: Bat coronavirus Shandong/977/2006 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; unclassified Alphacoronavirus. |
| db_xref: """taxon:389165, CDD:279880, CDD:279881""" |
| Sequence: MLSFAVYLAVLLSSLKFVVTAGHATGKECGGDPGLLPNLNLGLPANSTVLVSGYLPEPVSVSNNWICPVKPLDQFGVDYFTNLKGIWWSYYSGNTGVEFGIADSNYEQNPNQWALYMYQNNNVTFNGSQGVLYFRICKYSGKYTPVGDPDKDNVHKVCLIDKKVNFKFVEQANQVIGVTWSGNYVTFYGIDKSFRIYLPNKWNIVAVKCLVKETCAFFAAHKMVTLNITTNGQGLIKNYSVCKECNGFPAHVFPVLDGGKIPGDFSFDNWFLLTNSSTIVNGKIVDIQPLKLLCLWPVPALSSDDDKIYFNITGANCNGFKDENAYADVLRFSLNFTNSQVFNGIHSVTVNVVGGNLKFSCSNTSTYTASDEVLPFGPLSSVYYCFVSGQLGNETFSRFVGILPPVVKEIVISRYGSFYMNGVKLFEVPYVESVIFNVTSSVGSDFWTVAYAQNTEVLLEVNSTDIKDILYCDTPSNKLKCQQLSFSLEDGFYPAAVVAGVDVPRTYVALPYHATHSFVNLTVHLGQGVDSAAYAQINGVNDSYCVNTTQFTTNFQQLDVNNNVKAVMQNGDCPFNFDSLNNFLSFDSICFNLQPVGSSCTISIMRSWMGFNTPWRSIYVSFKRGNRITGVKTASTGIFDPSVMELDNCTDCTIYGVSGRGIIRKANSSYISGLYYTSIAGQIIGFKNATTGEVFSVTPCQLTMQAAVVNDDIVGVISSTNASSIPFSHTITTKTFYYHTNVQQNCSEPVLTNANIGVCSDGSITEVTIRKTEPEPVAPITTGNVSIPSNFTVSVQVEYLQMYNKPVSVDCSTYVCNGNPRCLKLLTQYATACRTIEESLQLSARLESVEVANMISVSEEAIQLANVSYFDTYNISALLPRGQSRGSVIEDLLFNKVITSGLGTVDEDYKACTGEGFGAALADVFCAQYYNGIMVLPGVVDEAKMGLYTASLTGAMVMGGITAAAAIPFSLAVQSRLNYVALQTDVLQENQKILASAFNSAMSNITYAFTEVKNAIKDTSVAINTVAQALGKIQNVVNDQGQALSQLTRQLASNFQAISSSIQDIYNRLNGLEADAQVDRLITGRLAALNAFVTQTLTKYTEVRASRQLAQQKINECVKSQSSRYGFCGNGTHLFSISNAAPQGIIFFHTVLLPTEYETVEAWSGVCVNSQYGLVLRNVHDALYKRNDSYYITSRDMYEPRVPQESDFVRITGCSVVYLNITHTQIGEIIPEYIDVNKTLEEFLSSYPNYTVPDLNLDLYNQTVLNLTEDISKLYEKAESLHNKTIILQQLIDNLNNTYVDLEWLNRVETYIKWPWYVWLVIFLALAAFTFLMLYCCIATGCCGCLSCIFSSCADCRGRRLQRYEVEKIHIQ |
Nucleotide
| Nucleotide_Id: EF434381.1 |
Length: 4119bp |
| Description: Bat coronavirus Shandong/977/2006 spike protein (S) gene; complete cds |
Source: Bat coronavirus Shandong/977/2006 |
| Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 10-Apr-07 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Bat coronavirus |
| CDS: EF434381.1:1..4119 |
Host: Rhinolophus ferrumequinum |
| Authors: Vijaykrishna;D.; Smith;G.J.; Zhang;J.X.; Peiris;J.S.; Chen;H. and Guan;Y. |
Journal: J Virol 81 (8); 4012-4020 (2007) |
| Title: Evolutionary insights into the ecology of coronaviruses |
db_xref: taxon:389165 |
| Taxonomy: Bat coronavirus Shandong/977/2006 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; unclassified Alphacoronavirus. |
| Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4119); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4119); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4119); strand=1); type='CDS') |
| Sequence: ATGTTAAGTTTTGCCGTTTATTTGGCTGTTTTATTGTCCAGTTTAAAGTTTGTTGTTACAGCAGGTCATGCTACAGGTAAAGAATGTGGTGGAGACCCTGGTTTATTGCCTAACTTGAATCTTGGTTTACCAGCTAATAGTACAGTTTTGGTTAGTGGTTACTTGCCAGAACCAGTTAGTGTTAGTAATAATTGGATATGTCCTGTAAAACCATTAGACCAATTTGGTGTTGATTACTTTACTAACCTTAAAGGTATTTGGTGGTCGTATTATAGTGGTAACACTGGTGTCGAATTTGGTATTGCAGATTCCAATTATGAACAAAACCCTAATCAGTGGGCTTTGTACATGTACCAGAATAATAATGTCACTTTCAATGGTTCGCAAGGTGTTTTGTACTTTCGTATCTGTAAATACAGTGGTAAGTACACACCTGTAGGTGATCCTGATAAAGACAATGTTCACAAAGTTTGTCTTATTGATAAAAAGGTCAATTTCAAATTTGTTGAACAAGCTAATCAAGTCATAGGTGTTACGTGGTCTGGTAATTACGTGACTTTCTATGGCATTGACAAGTCTTTTAGAATTTACTTACCTAATAAATGGAACATTGTTGCTGTTAAGTGTCTTGTTAAAGAAACTTGTGCATTCTTTGCAGCTCACAAAATGGTCACTCTGAACATTACTACAAATGGTCAAGGTTTGATTAAAAATTATAGTGTTTGCAAAGAATGCAATGGCTTTCCAGCACATGTTTTTCCAGTTCTAGATGGTGGCAAAATTCCTGGTGATTTTAGTTTCGACAATTGGTTTCTTCTCACTAATAGTTCTACTATAGTGAATGGAAAAATAGTCGACATACAACCTCTTAAATTGCTTTGTCTATGGCCTGTTCCAGCACTGAGTTCAGATGATGATAAAATTTATTTTAACATCACTGGTGCAAATTGTAATGGCTTTAAAGATGAGAATGCTTATGCAGATGTGCTTCGTTTTTCACTGAATTTCACAAATAGCCAAGTTTTTAATGGTATCCATAGTGTTACTGTTAATGTAGTTGGCGGTAATTTAAAATTTAGTTGTTCTAATACGAGCACTTATACTGCTTCAGATGAAGTTTTACCATTTGGACCTCTAAGTAGTGTTTATTACTGTTTTGTTTCTGGACAGCTCGGCAATGAAACTTTCAGCAGATTTGTTGGCATATTGCCCCCTGTTGTTAAAGAAATTGTCATTAGCCGCTATGGTTCCTTTTACATGAACGGTGTTAAGCTTTTTGAGGTTCCTTATGTGGAAAGTGTCATTTTTAATGTCACTAGTAGTGTTGGTTCTGACTTCTGGACAGTAGCTTATGCCCAAAACACAGAAGTTCTGCTAGAAGTAAATTCGACTGACATTAAAGACATATTGTATTGCGACACACCTTCGAACAAATTAAAGTGTCAACAACTCAGTTTTAGCTTGGAAGATGGTTTTTACCCTGCCGCTGTTGTAGCTGGTGTTGACGTACCGCGCACATATGTTGCTTTGCCTTACCATGCTACCCATTCATTTGTTAATTTGACAGTGCATTTGGGTCAAGGTGTTGACAGTGCTGCTTATGCGCAGATTAATGGTGTTAACGATTCATATTGTGTCAATACTACACAGTTTACTACCAACTTTCAACAGTTGGATGTTAATAACAATGTGAAAGCAGTGATGCAAAATGGTGATTGCCCTTTTAATTTTGATAGTTTAAACAACTTCCTCAGCTTCGATAGTATTTGTTTCAATCTACAACCTGTTGGTTCTAGCTGTACAATTTCTATTATGAGAAGCTGGATGGGTTTTAATACACCCTGGAGAAGTATTTATGTCAGTTTTAAAAGAGGCAATCGTATTACAGGTGTTAAAACTGCTAGTACTGGCATTTTTGATCCCAGTGTCATGGAATTAGATAATTGTACAGATTGCACTATTTATGGTGTTTCTGGTAGAGGCATCATTCGTAAGGCAAATTCGTCTTACATTAGTGGGTTGTACTACACATCTATTGCAGGTCAGATCATTGGTTTCAAAAATGCAACTACTGGTGAAGTGTTTTCAGTTACACCATGTCAGCTTACTATGCAAGCTGCTGTTGTTAATGACGACATTGTTGGTGTAATTTCCTCTACTAACGCTTCTAGTATACCTTTTTCACACACCATTACTACGAAAACATTTTATTACCACACCAATGTGCAACAAAATTGTTCTGAACCAGTACTTACTAATGCTAATATTGGTGTGTGTTCAGATGGTTCAATTACTGAAGTCACTATAAGAAAAACTGAACCAGAGCCTGTTGCACCAATCACTACTGGAAATGTTAGTATACCTTCCAACTTTACAGTTTCTGTACAAGTTGAGTACTTACAAATGTACAACAAACCAGTTAGTGTTGATTGTTCCACTTATGTTTGCAATGGTAATCCTCGTTGTTTAAAATTATTAACTCAATATGCCACAGCCTGCAGAACAATTGAAGAATCTTTGCAGCTTAGTGCTCGTTTAGAGTCAGTTGAAGTTGCTAACATGATCTCTGTTTCTGAAGAAGCTATTCAGTTGGCAAACGTTAGTTATTTTGACACATATAACATTAGTGCACTTTTACCAAGAGGTCAGAGTCGCGGTAGTGTTATAGAAGACCTATTGTTTAACAAAGTTATTACAAGTGGTCTTGGAACTGTGGATGAGGATTACAAAGCTTGCACAGGTGAAGGATTTGGTGCTGCACTGGCAGATGTCTTTTGTGCTCAGTATTACAATGGTATTATGGTGTTACCAGGTGTTGTAGATGAAGCAAAAATGGGATTATACACTGCATCACTTACTGGTGCTATGGTAATGGGTGGTATTACAGCTGCTGCAGCTATTCCATTTTCATTGGCCGTACAATCCAGACTTAATTACGTTGCTTTGCAAACTGATGTTTTGCAAGAAAACCAAAAGATACTTGCTTCAGCTTTCAACAGTGCCATGAGTAACATCACTTATGCTTTCACAGAAGTTAAAAATGCCATTAAGGATACGTCCGTGGCTATTAACACAGTTGCTCAAGCGCTTGGAAAGATTCAGAATGTTGTGAATGATCAAGGTCAAGCCTTGTCACAGCTTACTAGACAATTAGCCTCAAACTTTCAAGCTATCTCGTCTTCTATCCAGGATATCTATAATAGATTGAACGGTTTAGAGGCAGATGCACAAGTTGATAGGCTTATTACTGGTAGGCTTGCTGCACTTAATGCTTTTGTGACTCAGACTTTGACTAAGTACACAGAAGTTCGTGCTTCACGACAGCTGGCTCAACAAAAGATTAATGAGTGTGTAAAATCGCAGTCATCTCGTTATGGATTTTGCGGTAATGGCACTCATTTGTTCTCAATTTCTAATGCTGCACCACAAGGAATCATCTTTTTTCACACAGTTTTGCTTCCTACAGAATATGAAACTGTTGAAGCTTGGTCTGGTGTCTGCGTCAATAGTCAATACGGTCTAGTTTTAAGAAATGTTCATGATGCGCTGTATAAGCGTAATGACAGTTATTACATTACTAGTCGTGACATGTATGAACCTAGAGTTCCACAAGAGTCCGATTTTGTTAGAATAACTGGCTGCAGTGTTGTGTATCTCAATATAACTCACACTCAAATTGGTGAGATTATACCTGAGTACATTGATGTTAATAAAACTCTTGAGGAGTTTCTTAGCAGCTATCCTAATTACACTGTCCCAGATTTGAACTTAGATCTTTATAACCAGACTGTTTTGAATTTGACTGAAGACATCAGTAAGCTGTATGAAAAAGCTGAAAGTCTCCACAATAAGACCATTATACTACAACAGTTGATTGATAATCTCAACAACACATATGTTGATTTAGAATGGTTGAATCGTGTGGAAACTTACATTAAGTGGCCTTGGTATGTGTGGTTAGTCATCTTTTTGGCACTTGCAGCTTTTACGTTTTTAATGCTGTACTGTTGTATCGCAACAGGTTGCTGCGGTTGTTTGAGTTGTATTTTCAGCTCTTGTGCTGATTGTAGAGGCAGAAGATTACAACGTTACGAAGTGGAAAAGATTCACATTCAATAA |