Protein Id: YP_009824990.1 |
Length: 1269 aa |
Description: spike protein Bat coronavirus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 3-Sep-20 |
Source: Bat coronavirus |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Bat coronavirus |
Host: Eidolon helvum |
Authors: Yinda;C.K.; Ghogomu;S.M.; Conceicao-Neto;N.; Beller;L.; Deboutte;W.; Vanhulle;E.; Maes;P.; Van Ranst;M. and Matthijnssens;J. |
Title: Cameroonian fruit bats harbor divergent viruses; including rotavirus H; bastroviruses; and picobirnaviruses using an alternative genetic code |
Journal: Virus Evol 4 (1); vey008 (2018) |
Taxonomy: Bat coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Coronavirinae; unclassified Coronavirinae. |
db_xref: """taxon:1508220, GeneID:55060229""" |
Sequence: MVVLLFVMFSLVVADRPNCYLPQYSYTISPATITNTSYFNVNPISIVVPEFSVARTNLVVRQRLQVAAYDFTKIPITPPHRSIFNNTYFRVGDGILVNTHMYHRTNIATNLGSSFYGCQEPFGAAFGNTFVNEPITLVMFYAGNVGSWSSLVTQQQANITIVSCDNATLCANPFFLRWGPGVIRSFTISNAFQCHGNYTFYDTKLVNFTVSTARYNLAFTFADGDIFMYYAALGDSLNLPTAYPLQPYLRIPAGFKPDVVQFFQAITRPNGESAEVACASSTVSWYVSRLYYKELLVGYDSYSSIVNVSFCSSDAESELQCLLGTFAPANGVYSLSNFRSSPTDNVRITNSASSCSVPYSVLSRPPLPFVWKRYAISNCKFDFQALLSHLPTFQLRCFGISPTKLATMCFGTVTLDIMLVNVTHYNNLLNDVPDDFSLYNYQLPRNFYGCLHSYYLPNDTAFSYTVASRIRYPSWVHSITPGGRQPVGPFLDSLQSSSKPCTGSCLGLAVISLSIASANKLVCPVGNDTDIVPDTCVNYNIYGYQGTGVISRSNYTLPSSKVFSLSSSGELTVFAVGSSFYQLSPCAFAPISAAFYKGYTTSLLFNNLPCSNRHRAVVEPVSAYWRRSVADNNTFDTTAGCIFNAYNLTSIVVNQCDLPIGDSYCLQPSLIKGFEATLSLVTYNPLADSLTPITPVYQVSVPTNFTLVASTEYIQTYASKISIDCAKYLCGDSSQCRTVLLQYGTFCNDVNVALTRVFTLLDNSLVDTFSSLKSTAPVQLAYTGDFNFTSLVGCIGTDCDSKSHRSALSDLLFSKVSVADPGFMQSYQQCLDAQWGGNIRDLLCTQTFNGISVLPPIVSPSMQALYTTALVGGIAASGFTFGVSSAAVIPFATQLQFRLNGLGVTTNVLMENQQLIANAFNKALVSIQEGFTATNQALNKIQTVVNNNALQLQVLVQQLGNTFGAISASVNEIFSRLDLLEANAEVDRLISGRMVVLNTYVTQLLIQASELRSQAELAKQKMSECVKSQSLRNDFCGNGTHVLSIPQLAPNGMLFIHYSYQPTKYAQVYTTAGLCFNGTGFVPRDGLFVRENNESQVWYFTKASFYNPVNLSYENTHLLDTCGVNYTTVNNSVLNPIEPPNYNFQEEFDKYFKNQSSQFNITFDSSQFNVSIVNLNEQMAALDSVVKSLNESFIDLKKLGVYTQQPNTPWYAWLGMIAGLVGLALAVFMLCCMTNCCSGFRGICSCKQCQYDDYADVYPAVRVSGKRTV |
Nucleotide
Nucleotide_Id: NC_048212.1 |
Length: 3810bp |
Description: Bat coronavirus; complete genome |
Source: Bat coronavirus |
Nucleotide_type: ss-RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 22-Nov-20 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Bat coronavirus |
CDS: NC_048212.1:20814..24623 |
Host: Eidolon helvum |
Authors: Yinda;C.K.; Ghogomu;S.M.; Conceicao-Neto;N.; Beller;L.; Deboutte;W.; Vanhulle;E.; Maes;P.; Van Ranst;M. and Matthijnssens;J. |
Journal: Virus Evol 4 (1); vey008 (2018) |
Title: Cameroonian fruit bats harbor divergent viruses; including rotavirus H; bastroviruses; and picobirnaviruses using an alternative genetic code |
db_xref: taxon:1508220; GeneID:55060228; GeneID:55060228; GeneID:55060235; GeneID:55060235; GeneID:55060229; GeneID:55060229; GeneID:55060230; GeneID:55060230; GeneID:59893239; GeneID:59893239; GeneID:55060231; GeneID:55060231; GeneID:55060232; GeneID:55060232; GeneID:55060233; GeneID:55060233; GeneID:55060234; GeneID:55060234 |
Taxonomy: Bat coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Coronavirinae; unclassified Coronavirinae. |
Sequence: ATGGTCGTCTTATTGTTCGTGATGTTTAGTTTAGTGGTAGCTGACAGGCCTAATTGTTATTTGCCTCAGTATTCTTACACTATTTCACCAGCAACCATCACTAACACCTCCTATTTTAATGTCAATCCCATTTCCATTGTTGTCCCCGAGTTTTCAGTTGCGCGCACCAACCTTGTTGTGCGCCAGCGTTTACAAGTTGCTGCTTATGATTTTACTAAGATACCCATTACACCGCCACACCGTAGTATTTTTAATAACACTTATTTTCGTGTAGGCGATGGTATTTTAGTGAATACTCACATGTATCACAGAACTAACATAGCTACCAACTTAGGTAGCTCCTTCTATGGTTGTCAAGAGCCTTTTGGTGCAGCCTTTGGCAACACTTTTGTTAATGAACCCATAACTTTAGTTATGTTTTATGCAGGCAATGTTGGTAGTTGGTCTAGTCTTGTTACTCAGCAGCAAGCTAACATCACCATAGTGTCTTGTGATAACGCCACTTTGTGTGCTAACCCCTTCTTTCTAAGATGGGGTCCAGGTGTCATACGCAGTTTTACTATAAGTAATGCATTTCAGTGTCATGGTAATTATACATTTTATGACACTAAACTTGTTAATTTTACTGTTTCCACTGCTCGCTATAATTTAGCTTTTACTTTTGCAGATGGTGACATTTTTATGTACTATGCTGCACTGGGTGATTCTTTGAATTTACCTACTGCTTACCCGCTGCAGCCATATTTACGTATACCTGCTGGTTTTAAACCAGATGTTGTACAGTTTTTCCAGGCCATAACACGCCCCAATGGTGAAAGTGCTGAAGTTGCTTGTGCTTCTAGCACCGTTTCTTGGTATGTGTCGCGGTTGTATTATAAAGAGCTACTGGTTGGTTATGATTCTTACAGTAGTATCGTTAATGTTAGTTTTTGTTCTTCAGATGCTGAAAGTGAGTTGCAGTGCTTGTTGGGTACATTTGCGCCAGCTAATGGTGTTTATTCACTCAGTAATTTTCGTAGTAGTCCCACTGACAATGTACGTATCACTAACAGTGCTTCTTCTTGTAGTGTACCTTATTCTGTTTTGAGTCGGCCACCTTTACCTTTTGTATGGAAGCGTTATGCCATTTCCAATTGTAAGTTTGATTTTCAGGCATTGCTTAGCCATTTGCCTACATTTCAACTTCGCTGTTTTGGCATATCGCCTACTAAGCTTGCCACTATGTGTTTTGGCACTGTCACTTTAGACATTATGTTGGTTAATGTTACTCATTACAATAACCTCCTTAATGATGTTCCTGATGATTTTAGCCTTTATAATTATCAATTACCGCGTAATTTCTACGGTTGTTTGCATAGTTATTATTTACCTAATGACACTGCATTTAGTTATACTGTAGCTTCGCGCATACGTTACCCTTCTTGGGTGCATTCTATCACACCTGGTGGTAGACAACCCGTTGGCCCTTTCTTAGATTCCTTACAAAGTTCCAGCAAGCCTTGTACCGGATCATGTTTAGGTTTAGCCGTTATTTCTTTAAGTATAGCCTCGGCAAACAAATTAGTTTGTCCAGTAGGCAATGACACAGATATTGTGCCTGACACTTGTGTCAACTACAATATTTATGGTTATCAAGGCACTGGTGTTATTAGTAGGTCAAATTACACTTTGCCCTCTTCTAAGGTTTTCTCGCTTAGTTCTTCTGGTGAGTTGACTGTCTTTGCAGTTGGTTCTTCTTTTTACCAGCTATCTCCGTGTGCATTTGCTCCTATATCTGCAGCTTTTTATAAGGGTTACACTACTTCTTTGTTGTTTAATAACCTTCCTTGTTCCAACCGGCATCGTGCAGTCGTGGAACCTGTTAGTGCTTATTGGCGTCGTAGTGTTGCAGACAATAACACGTTTGACACAACTGCTGGGTGCATTTTTAATGCGTATAATTTAACTAGCATTGTAGTTAATCAGTGTGATTTACCTATTGGTGATAGTTATTGTTTACAACCATCCCTTATTAAGGGTTTTGAAGCCACATTATCATTGGTTACGTACAACCCATTGGCTGATTCTTTAACACCTATCACACCGGTTTATCAAGTTTCAGTGCCTACCAATTTTACTTTGGTAGCTTCTACTGAATATATTCAAACTTATGCATCAAAAATTTCTATTGATTGTGCTAAGTATTTATGTGGTGATTCTTCACAGTGCAGAACGGTGTTGTTGCAGTACGGCACATTTTGTAATGATGTTAATGTTGCTTTAACGAGGGTTTTTACGTTGCTTGACAATTCACTCGTTGATACGTTTTCATCCTTGAAGTCCACAGCACCAGTTCAGTTAGCTTATACGGGTGATTTTAATTTCACATCGTTAGTGGGCTGTATTGGTACTGATTGTGATTCTAAGTCACATAGGTCCGCTTTGTCAGATCTATTGTTTAGTAAGGTTAGTGTTGCTGACCCAGGTTTCATGCAATCTTACCAACAATGTTTGGATGCACAGTGGGGTGGTAATATACGTGATTTGCTTTGTACTCAGACGTTCAATGGCATCTCAGTATTGCCACCCATTGTATCTCCTTCCATGCAGGCTCTCTATACGACCGCCTTAGTCGGTGGCATTGCAGCCTCTGGTTTTACTTTTGGTGTGTCATCTGCTGCTGTAATTCCTTTTGCCACACAGTTGCAGTTCAGACTTAATGGGTTAGGTGTGACCACTAATGTTTTAATGGAGAATCAACAATTGATAGCTAATGCTTTTAATAAGGCTCTTGTTTCGATACAGGAAGGGTTTACAGCCACTAATCAGGCTCTAAACAAAATCCAAACTGTTGTCAATAACAATGCCTTGCAATTGCAAGTGTTAGTGCAGCAGTTGGGTAATACATTTGGTGCTATATCAGCATCTGTTAATGAAATTTTTAGCCGTCTCGACTTGTTGGAGGCTAATGCCGAAGTTGATAGGCTGATTTCTGGTCGTATGGTTGTACTTAACACATATGTGACTCAGTTGCTTATTCAAGCTTCTGAACTTCGGTCTCAGGCGGAATTGGCTAAGCAAAAGATGTCCGAATGTGTTAAGTCTCAATCTTTGCGTAATGACTTCTGTGGTAACGGGACTCATGTTCTTAGCATACCTCAGTTAGCTCCTAATGGCATGCTGTTCATACATTATAGTTATCAACCTACTAAGTATGCACAGGTGTATACCACGGCGGGCCTATGCTTCAATGGTACAGGCTTTGTTCCTAGGGATGGTTTGTTTGTCAGGGAAAACAATGAATCCCAAGTTTGGTATTTTACTAAGGCAAGTTTTTACAATCCTGTGAACTTGTCTTATGAGAACACTCATTTATTAGACACTTGTGGTGTTAATTACACTACAGTCAATAATAGTGTGTTGAACCCAATTGAACCTCCTAATTATAATTTTCAGGAAGAGTTCGATAAGTATTTCAAGAACCAGTCTTCTCAGTTTAATATCACTTTTGATTCTTCTCAGTTTAATGTTTCTATTGTTAATTTGAATGAACAGATGGCTGCTTTAGATTCAGTCGTTAAGAGTCTCAATGAATCTTTCATTGACCTCAAGAAGCTAGGTGTGTACACGCAGCAACCAAACACACCCTGGTATGCGTGGTTAGGTATGATTGCAGGTTTAGTTGGACTCGCCTTAGCTGTTTTTATGCTTTGTTGCATGACCAACTGCTGCAGTGGATTCAGGGGCATATGCTCTTGTAAGCAATGCCAGTATGATGATTATGCTGACGTTTACCCAGCTGTTCGAGTTAGTGGTAAACGAACAGTATGA |