Protein Id: ABW87820.1 |
Length: 1472 aa |
Description: spike protein Beluga whale coronavirus SW1. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 30-Apr-08 |
Source: Beluga whale coronavirus SW1 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Beluga whale coronavirus |
Host: Delphinapterus leucas (beluga whale) |
Authors: Mihindukulasuriya;K.A.; Wu;G.; St Leger;J.; Nordhausen;R.W. and Wang;D. |
Title: Identification of a novel coronavirus from a beluga whale by using a panviral microarray |
Journal: J Virol 82 (10); 5084-5088 (2008) |
Taxonomy: Beluga whale coronavirus SW1 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Cegacovirus. |
db_xref: """taxon:694015, CDD:279880, CDD:279881""" |
Sequence: MVRLSFVIVFLCTMLMNPLLISAIDEGLWPAGMWYSHLLQENNTYTVAAFQEHAILPSYVNNNWTVITNFTAENATQLEWDDPYYNSTLFSYVNITMVGDNCIGNFTNRTLGELGDIDYFPFNCTNVTNEFRTNYGYFIQNVMVARCLSSLCAVIIPKGRVFFEKNEMWWWSWQDRYQPGNYTFRHERFMSLSQNITVIGLAGNFSLFGLGQTININSASYDWGTVIRGRLDDRICELQMTGADLCNLTRVDTSSDAFYTAGLVRPASAALIADGAYKPIFTGVFHDNETHQVLYENATIKPSVRSFQVKNNDFDALYVGRKEKFSIDAVTIIFRLKETSTYLDLPFCNETRVDKSDKAIIGYLIGGDFYSVDVSSIVIERYNPPQPNATSIPTTISTVSTTTSGWEDLRSLNMSCVRFDYKLKKVMSVPLPMVKAFIIDFKQRQLAIDGFPVGALIADFEFRFSIVAMPQTFISTLNYTTALVTFDKGNVRSVIDCNSEKPFDRLRCDLQTDVVSDGFYPVNIKTNEAKENTTFIDVPATLANLTLEVFVSSPEQSPACVIKSYKCVDTRYFYISDYSYSCAENGIPNDAAGAAYCRGVLDQINNYGVRGMDFKGKCPFAGSKVNSGLTFDKICFGVYEQGCQSDKACRFGFYFDNVQFSQYGNKLYYKPQDLGFIDYQFGTLFKNSLVQSNIIQEGCHDYDIYGYKGTGVVKPFSDYSYLQTGGLIMLDSGGFPSLFRYNFALYEVTQCTREVAQLAVASNNAIGYYLPKQVTIDGVNASTSCNTTGAFKYCYYDDVIHVGRDVSNVTINVCNPSLMMENSHCINIQGNFMVNEPAITFNSTQYQPLLGVSGDVQLPRTLMLHTTTEFIQTHSPKIVIDCTKYVCGSSERCRRILVKYGGFCESIMRLLNGVNMADDVSVTDFLDNFNSFDNISVSLQNLNASFGQFEGYGFQKFLPKSFDFDGSDPRDARSTIEDILFDKVTTVGLGTVDADYDKCTKGLSVADLVCAQYYNGIMVLPGVADAEKMAMYTGALVGGMVLGGITSAAAIPFATQIQARVNYLALTQNAIQENQKIIVQQFNKAIDSMTSAFQSVNEGFSAVSSAITEVQNAVNAQSQALTKLLGQLNYNFGATTSSIKELYERLAKLEADVQVDRLINGRLTALSAFVAARQVEAAKVASQRVLAAEKINECVKSTSNRYGFCGNGAHIISFPQNAPNGMLFVHFSLVPNETITVKGIIGLCLNNSIGIVPAKDRGMFIQCSNGTYCPEFENSFNESKNGNVTFPFAITSREQYNPRQITTGDIQMLTSCNSGYTHIEWSQLPLVAPPYDDFDKEFDKLYEKWNYTLEELEKLNVTFPYLNVSEQIDIINSAMENIKSQIQNLNSSYIDLEWLNKYERYSKWPWWVWLIIVLCFAAFCLLVFWIFICTGCCGGCCNCCGIPALFGYCKRKAHYERLRMDEEGNLEEIKAD |
Nucleotide
Nucleotide_Id: EU111742.1 |
Length: 4419bp |
Description: Coronavirus SW1; complete genome |
Source: Beluga whale coronavirus SW1 |
Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 30-Apr-08 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Beluga whale coronavirus |
CDS: EU111742.1:20450..24868 |
Host: Delphinapterus leucas (beluga whale) |
Authors: Mihindukulasuriya;K.A.; Wu;G.; St Leger;J.; Nordhausen;R.W. and Wang;D. |
Journal: J Virol 82 (10); 5084-5088 (2008) |
Title: Identification of a novel coronavirus from a beluga whale by using a panviral microarray |
db_xref: taxon:694015 |
Taxonomy: Beluga whale coronavirus SW1 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Cegacovirus. |
Sequence: ATGGTAAGATTATCATTCGTGATAGTGTTTCTGTGCACTATGTTGATGAATCCTTTATTAATTAGTGCTATAGATGAAGGTTTATGGCCTGCAGGTATGTGGTATTCTCATTTATTGCAAGAGAATAATACTTATACAGTGGCAGCTTTTCAAGAGCATGCTATTTTACCGAGTTATGTTAATAATAATTGGACTGTTATTACTAATTTTACGGCGGAAAATGCCACCCAATTGGAGTGGGATGATCCGTATTATAATAGTACTTTATTTTCCTATGTAAATATAACCATGGTAGGGGATAATTGCATAGGTAATTTCACTAATAGAACGTTGGGCGAGTTAGGGGATATTGATTATTTCCCTTTTAACTGTACCAACGTTACTAATGAGTTTCGTACTAATTATGGTTATTTTATTCAGAATGTAATGGTGGCACGTTGTTTATCATCATTATGTGCTGTTATAATACCTAAAGGTCGTGTCTTTTTTGAGAAGAATGAAATGTGGTGGTGGTCCTGGCAGGATAGATACCAACCAGGCAACTATACATTTAGACACGAGCGTTTTATGAGCTTATCCCAAAATATTACTGTAATTGGATTGGCTGGTAACTTCTCATTGTTTGGTTTGGGCCAAACTATTAATATTAATAGTGCATCCTATGACTGGGGTACAGTTATACGTGGGCGTTTAGATGATCGTATATGTGAATTGCAGATGACGGGTGCCGATCTCTGTAATTTGACTAGAGTGGATACTAGCTCAGATGCATTTTATACAGCTGGTTTAGTTCGACCAGCTTCAGCAGCATTAATTGCAGATGGTGCTTATAAGCCCATTTTTACTGGTGTATTTCATGATAACGAAACACACCAGGTGTTATATGAAAATGCTACTATAAAACCTAGTGTTCGTAGCTTTCAGGTTAAGAATAATGATTTTGATGCGTTATACGTCGGTAGGAAAGAAAAATTTTCAATCGACGCTGTGACTATTATATTTAGGTTAAAAGAAACCTCCACTTATCTAGATCTCCCCTTTTGTAATGAGACAAGAGTGGATAAATCAGATAAGGCTATTATTGGTTATTTAATTGGTGGAGACTTTTATAGTGTTGATGTATCATCTATTGTGATAGAACGCTATAATCCTCCTCAGCCAAATGCTACAAGTATACCCACCACCATTTCTACTGTAAGTACTACAACCAGTGGTTGGGAAGACTTGCGTAGTTTGAATATGTCGTGTGTGAGGTTTGATTATAAATTAAAGAAAGTAATGTCCGTACCTTTGCCAATGGTAAAGGCATTTATAATAGATTTTAAGCAGAGACAGCTGGCTATCGATGGCTTTCCAGTTGGGGCTCTGATAGCAGATTTTGAATTTAGGTTTAGCATTGTAGCAATGCCTCAAACCTTTATTTCAACTTTAAATTACACAACAGCACTTGTTACTTTTGATAAAGGAAATGTGCGTAGTGTTATCGATTGTAATAGTGAAAAACCCTTTGATAGGTTAAGGTGTGATTTACAAACAGATGTTGTGTCTGATGGGTTTTACCCTGTTAATATTAAGACAAATGAAGCCAAGGAGAATACAACTTTTATAGATGTACCGGCTACACTTGCTAATTTAACGCTGGAAGTTTTTGTTAGTAGTCCGGAACAAAGTCCAGCATGTGTTATTAAGAGCTATAAATGTGTTGATACTCGTTATTTTTATATTAGTGATTATAGTTATAGTTGTGCTGAAAATGGTATTCCCAATGATGCTGCAGGAGCAGCGTATTGTAGGGGCGTATTGGACCAAATTAATAATTATGGTGTTAGAGGTATGGATTTTAAAGGTAAGTGCCCCTTTGCTGGTAGTAAAGTAAATAGTGGCCTTACATTTGATAAAATTTGTTTTGGTGTTTATGAGCAAGGCTGCCAGTCTGATAAGGCTTGCCGCTTTGGGTTTTATTTTGATAATGTTCAATTTTCTCAGTATGGAAATAAACTATATTATAAACCCCAAGATTTGGGTTTTATTGATTACCAATTTGGCACACTTTTTAAGAATTCATTAGTTCAATCTAATATAATTCAGGAAGGTTGCCATGATTATGATATATATGGCTATAAAGGAACTGGTGTTGTTAAGCCCTTTTCTGATTATAGCTACTTGCAGACTGGTGGACTTATTATGCTAGATAGTGGTGGCTTTCCATCTTTATTTAGGTATAATTTTGCGTTGTATGAAGTGACTCAATGCACTAGGGAGGTAGCACAATTAGCTGTTGCTTCTAATAATGCCATTGGTTATTATTTACCTAAACAGGTTACTATAGATGGTGTAAATGCGTCTACTAGTTGTAATACTACAGGTGCATTTAAGTATTGTTATTATGATGATGTTATACATGTGGGTAGAGATGTGAGTAATGTCACCATTAATGTGTGTAATCCGTCGCTTATGATGGAAAATTCACATTGTATTAATATACAAGGCAATTTCATGGTTAATGAACCTGCCATTACTTTTAACTCAACTCAATATCAGCCTTTATTAGGTGTATCAGGAGATGTTCAGTTGCCTAGAACATTAATGTTGCATACGACTACTGAGTTTATACAGACGCATAGTCCTAAAATTGTTATAGATTGCACTAAATACGTATGCGGTAGTTCTGAGAGATGCAGACGTATACTTGTTAAGTATGGTGGTTTTTGTGAGAGCATCATGCGGTTGTTAAATGGTGTTAACATGGCAGATGATGTCAGTGTTACAGATTTTCTTGATAATTTTAATAGTTTTGATAATATTTCTGTGAGTTTGCAGAACCTTAATGCAAGTTTTGGTCAATTTGAAGGCTATGGCTTTCAGAAATTCTTGCCAAAATCCTTTGACTTTGATGGTAGTGATCCTAGGGATGCTAGGTCCACCATTGAAGATATTTTATTTGATAAAGTAACAACTGTAGGTCTTGGCACGGTTGATGCAGACTATGACAAGTGTACTAAGGGATTGTCAGTGGCAGACTTAGTGTGTGCACAATATTATAATGGTATTATGGTATTACCTGGTGTTGCGGATGCTGAAAAGATGGCAATGTACACTGGGGCTTTAGTAGGTGGTATGGTTCTAGGAGGCATTACCTCTGCAGCGGCCATACCTTTTGCAACTCAAATACAAGCTCGTGTCAATTATCTTGCGCTTACCCAGAATGCTATTCAGGAGAATCAAAAGATAATAGTCCAGCAGTTTAATAAGGCTATTGATTCTATGACTTCTGCATTTCAGAGCGTTAATGAGGGCTTTAGTGCAGTGTCTAGCGCAATAACTGAGGTACAAAATGCAGTGAATGCTCAATCACAGGCATTGACTAAGTTGTTGGGACAGTTAAATTATAATTTTGGTGCTACAACAAGCTCTATTAAAGAACTTTATGAGAGACTTGCTAAGTTGGAAGCAGATGTCCAAGTAGACAGATTGATTAATGGTAGACTTACCGCATTGTCAGCTTTTGTGGCAGCCCGACAGGTAGAAGCCGCCAAGGTGGCGTCACAACGTGTATTAGCAGCTGAAAAGATTAATGAATGTGTTAAGAGTACATCCAATAGATATGGCTTTTGTGGTAATGGAGCTCATATTATCAGCTTCCCACAGAATGCACCTAATGGCATGTTGTTTGTACACTTCTCCTTAGTACCTAATGAGACAATTACCGTTAAAGGTATTATTGGCTTATGCTTGAATAACTCTATTGGCATTGTACCTGCAAAGGATAGAGGAATGTTTATACAATGCAGTAATGGTACTTACTGCCCTGAATTTGAAAATAGTTTTAATGAGAGTAAAAATGGCAACGTAACTTTTCCCTTTGCCATAACTAGTAGAGAACAGTATAACCCACGACAGATTACGACGGGAGATATACAGATGCTTACTTCATGTAACTCAGGTTACACGCACATAGAATGGAGTCAACTACCTTTAGTGGCGCCACCCTATGATGATTTTGATAAAGAGTTTGATAAATTGTATGAGAAATGGAACTATACGCTCGAGGAGTTGGAGAAGTTAAATGTAACTTTCCCTTACCTTAACGTTAGTGAACAAATAGATATTATTAATAGTGCCATGGAAAATATTAAGAGCCAGATTCAAAATTTGAACAGCTCTTATATTGACCTTGAATGGCTTAATAAGTATGAGAGGTATTCTAAGTGGCCTTGGTGGGTGTGGCTAATAATCGTGCTGTGTTTTGCTGCATTTTGCCTATTAGTCTTTTGGATATTTATTTGTACTGGGTGTTGTGGTGGATGCTGCAATTGTTGTGGCATACCAGCACTCTTTGGCTATTGTAAGCGAAAGGCCCATTATGAGAGATTGCGAATGGATGAAGAAGGCAACCTAGAGGAAATAAAAGCAGACTAG |