Protein

Protein Id:  ABW87820.1 Length:   1472 aa
Description:   spike protein Beluga whale coronavirus SW1. Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   30-Apr-08
Source:   Beluga whale coronavirus SW1
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Beluga whale coronavirus
Host:   Delphinapterus leucas (beluga whale) Authors:   Mihindukulasuriya;K.A.; Wu;G.; St Leger;J.; Nordhausen;R.W. and Wang;D.
Title:   Identification of a novel coronavirus from a beluga whale by using a panviral microarray Journal:   J Virol 82 (10); 5084-5088 (2008)
Taxonomy:   Beluga whale coronavirus SW1 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Cegacovirus.
db_xref:   """taxon:694015, CDD:279880, CDD:279881"""
Sequence:   MVRLSFVIVFLCTMLMNPLLISAIDEGLWPAGMWYSHLLQENNTYTVAAFQEHAILPSYVNNNWTVITNFTAENATQLEWDDPYYNSTLFSYVNITMVGDNCIGNFTNRTLGELGDIDYFPFNCTNVTNEFRTNYGYFIQNVMVARCLSSLCAVIIPKGRVFFEKNEMWWWSWQDRYQPGNYTFRHERFMSLSQNITVIGLAGNFSLFGLGQTININSASYDWGTVIRGRLDDRICELQMTGADLCNLTRVDTSSDAFYTAGLVRPASAALIADGAYKPIFTGVFHDNETHQVLYENATIKPSVRSFQVKNNDFDALYVGRKEKFSIDAVTIIFRLKETSTYLDLPFCNETRVDKSDKAIIGYLIGGDFYSVDVSSIVIERYNPPQPNATSIPTTISTVSTTTSGWEDLRSLNMSCVRFDYKLKKVMSVPLPMVKAFIIDFKQRQLAIDGFPVGALIADFEFRFSIVAMPQTFISTLNYTTALVTFDKGNVRSVIDCNSEKPFDRLRCDLQTDVVSDGFYPVNIKTNEAKENTTFIDVPATLANLTLEVFVSSPEQSPACVIKSYKCVDTRYFYISDYSYSCAENGIPNDAAGAAYCRGVLDQINNYGVRGMDFKGKCPFAGSKVNSGLTFDKICFGVYEQGCQSDKACRFGFYFDNVQFSQYGNKLYYKPQDLGFIDYQFGTLFKNSLVQSNIIQEGCHDYDIYGYKGTGVVKPFSDYSYLQTGGLIMLDSGGFPSLFRYNFALYEVTQCTREVAQLAVASNNAIGYYLPKQVTIDGVNASTSCNTTGAFKYCYYDDVIHVGRDVSNVTINVCNPSLMMENSHCINIQGNFMVNEPAITFNSTQYQPLLGVSGDVQLPRTLMLHTTTEFIQTHSPKIVIDCTKYVCGSSERCRRILVKYGGFCESIMRLLNGVNMADDVSVTDFLDNFNSFDNISVSLQNLNASFGQFEGYGFQKFLPKSFDFDGSDPRDARSTIEDILFDKVTTVGLGTVDADYDKCTKGLSVADLVCAQYYNGIMVLPGVADAEKMAMYTGALVGGMVLGGITSAAAIPFATQIQARVNYLALTQNAIQENQKIIVQQFNKAIDSMTSAFQSVNEGFSAVSSAITEVQNAVNAQSQALTKLLGQLNYNFGATTSSIKELYERLAKLEADVQVDRLINGRLTALSAFVAARQVEAAKVASQRVLAAEKINECVKSTSNRYGFCGNGAHIISFPQNAPNGMLFVHFSLVPNETITVKGIIGLCLNNSIGIVPAKDRGMFIQCSNGTYCPEFENSFNESKNGNVTFPFAITSREQYNPRQITTGDIQMLTSCNSGYTHIEWSQLPLVAPPYDDFDKEFDKLYEKWNYTLEELEKLNVTFPYLNVSEQIDIINSAMENIKSQIQNLNSSYIDLEWLNKYERYSKWPWWVWLIIVLCFAAFCLLVFWIFICTGCCGGCCNCCGIPALFGYCKRKAHYERLRMDEEGNLEEIKAD

Nucleotide

Nucleotide_Id:  EU111742.1 Length:   4419bp
Description:   Coronavirus SW1; complete genome Source:   Beluga whale coronavirus SW1
Nucleotide_type:   RNA Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   30-Apr-08
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Beluga whale coronavirus
CDS:   EU111742.1:20450..24868 Host:   Delphinapterus leucas (beluga whale)
Authors:   Mihindukulasuriya;K.A.; Wu;G.; St Leger;J.; Nordhausen;R.W. and Wang;D. Journal:   J Virol 82 (10); 5084-5088 (2008)
Title:   Identification of a novel coronavirus from a beluga whale by using a panviral microarray db_xref:   taxon:694015
Taxonomy:   Beluga whale coronavirus SW1 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Cegacovirus.
Features:   --
Sequence:   ATGGTAAGATTATCATTCGTGATAGTGTTTCTGTGCACTATGTTGATGAATCCTTTATTAATTAGTGCTATAGATGAAGGTTTATGGCCTGCAGGTATGTGGTATTCTCATTTATTGCAAGAGAATAATACTTATACAGTGGCAGCTTTTCAAGAGCATGCTATTTTACCGAGTTATGTTAATAATAATTGGACTGTTATTACTAATTTTACGGCGGAAAATGCCACCCAATTGGAGTGGGATGATCCGTATTATAATAGTACTTTATTTTCCTATGTAAATATAACCATGGTAGGGGATAATTGCATAGGTAATTTCACTAATAGAACGTTGGGCGAGTTAGGGGATATTGATTATTTCCCTTTTAACTGTACCAACGTTACTAATGAGTTTCGTACTAATTATGGTTATTTTATTCAGAATGTAATGGTGGCACGTTGTTTATCATCATTATGTGCTGTTATAATACCTAAAGGTCGTGTCTTTTTTGAGAAGAATGAAATGTGGTGGTGGTCCTGGCAGGATAGATACCAACCAGGCAACTATACATTTAGACACGAGCGTTTTATGAGCTTATCCCAAAATATTACTGTAATTGGATTGGCTGGTAACTTCTCATTGTTTGGTTTGGGCCAAACTATTAATATTAATAGTGCATCCTATGACTGGGGTACAGTTATACGTGGGCGTTTAGATGATCGTATATGTGAATTGCAGATGACGGGTGCCGATCTCTGTAATTTGACTAGAGTGGATACTAGCTCAGATGCATTTTATACAGCTGGTTTAGTTCGACCAGCTTCAGCAGCATTAATTGCAGATGGTGCTTATAAGCCCATTTTTACTGGTGTATTTCATGATAACGAAACACACCAGGTGTTATATGAAAATGCTACTATAAAACCTAGTGTTCGTAGCTTTCAGGTTAAGAATAATGATTTTGATGCGTTATACGTCGGTAGGAAAGAAAAATTTTCAATCGACGCTGTGACTATTATATTTAGGTTAAAAGAAACCTCCACTTATCTAGATCTCCCCTTTTGTAATGAGACAAGAGTGGATAAATCAGATAAGGCTATTATTGGTTATTTAATTGGTGGAGACTTTTATAGTGTTGATGTATCATCTATTGTGATAGAACGCTATAATCCTCCTCAGCCAAATGCTACAAGTATACCCACCACCATTTCTACTGTAAGTACTACAACCAGTGGTTGGGAAGACTTGCGTAGTTTGAATATGTCGTGTGTGAGGTTTGATTATAAATTAAAGAAAGTAATGTCCGTACCTTTGCCAATGGTAAAGGCATTTATAATAGATTTTAAGCAGAGACAGCTGGCTATCGATGGCTTTCCAGTTGGGGCTCTGATAGCAGATTTTGAATTTAGGTTTAGCATTGTAGCAATGCCTCAAACCTTTATTTCAACTTTAAATTACACAACAGCACTTGTTACTTTTGATAAAGGAAATGTGCGTAGTGTTATCGATTGTAATAGTGAAAAACCCTTTGATAGGTTAAGGTGTGATTTACAAACAGATGTTGTGTCTGATGGGTTTTACCCTGTTAATATTAAGACAAATGAAGCCAAGGAGAATACAACTTTTATAGATGTACCGGCTACACTTGCTAATTTAACGCTGGAAGTTTTTGTTAGTAGTCCGGAACAAAGTCCAGCATGTGTTATTAAGAGCTATAAATGTGTTGATACTCGTTATTTTTATATTAGTGATTATAGTTATAGTTGTGCTGAAAATGGTATTCCCAATGATGCTGCAGGAGCAGCGTATTGTAGGGGCGTATTGGACCAAATTAATAATTATGGTGTTAGAGGTATGGATTTTAAAGGTAAGTGCCCCTTTGCTGGTAGTAAAGTAAATAGTGGCCTTACATTTGATAAAATTTGTTTTGGTGTTTATGAGCAAGGCTGCCAGTCTGATAAGGCTTGCCGCTTTGGGTTTTATTTTGATAATGTTCAATTTTCTCAGTATGGAAATAAACTATATTATAAACCCCAAGATTTGGGTTTTATTGATTACCAATTTGGCACACTTTTTAAGAATTCATTAGTTCAATCTAATATAATTCAGGAAGGTTGCCATGATTATGATATATATGGCTATAAAGGAACTGGTGTTGTTAAGCCCTTTTCTGATTATAGCTACTTGCAGACTGGTGGACTTATTATGCTAGATAGTGGTGGCTTTCCATCTTTATTTAGGTATAATTTTGCGTTGTATGAAGTGACTCAATGCACTAGGGAGGTAGCACAATTAGCTGTTGCTTCTAATAATGCCATTGGTTATTATTTACCTAAACAGGTTACTATAGATGGTGTAAATGCGTCTACTAGTTGTAATACTACAGGTGCATTTAAGTATTGTTATTATGATGATGTTATACATGTGGGTAGAGATGTGAGTAATGTCACCATTAATGTGTGTAATCCGTCGCTTATGATGGAAAATTCACATTGTATTAATATACAAGGCAATTTCATGGTTAATGAACCTGCCATTACTTTTAACTCAACTCAATATCAGCCTTTATTAGGTGTATCAGGAGATGTTCAGTTGCCTAGAACATTAATGTTGCATACGACTACTGAGTTTATACAGACGCATAGTCCTAAAATTGTTATAGATTGCACTAAATACGTATGCGGTAGTTCTGAGAGATGCAGACGTATACTTGTTAAGTATGGTGGTTTTTGTGAGAGCATCATGCGGTTGTTAAATGGTGTTAACATGGCAGATGATGTCAGTGTTACAGATTTTCTTGATAATTTTAATAGTTTTGATAATATTTCTGTGAGTTTGCAGAACCTTAATGCAAGTTTTGGTCAATTTGAAGGCTATGGCTTTCAGAAATTCTTGCCAAAATCCTTTGACTTTGATGGTAGTGATCCTAGGGATGCTAGGTCCACCATTGAAGATATTTTATTTGATAAAGTAACAACTGTAGGTCTTGGCACGGTTGATGCAGACTATGACAAGTGTACTAAGGGATTGTCAGTGGCAGACTTAGTGTGTGCACAATATTATAATGGTATTATGGTATTACCTGGTGTTGCGGATGCTGAAAAGATGGCAATGTACACTGGGGCTTTAGTAGGTGGTATGGTTCTAGGAGGCATTACCTCTGCAGCGGCCATACCTTTTGCAACTCAAATACAAGCTCGTGTCAATTATCTTGCGCTTACCCAGAATGCTATTCAGGAGAATCAAAAGATAATAGTCCAGCAGTTTAATAAGGCTATTGATTCTATGACTTCTGCATTTCAGAGCGTTAATGAGGGCTTTAGTGCAGTGTCTAGCGCAATAACTGAGGTACAAAATGCAGTGAATGCTCAATCACAGGCATTGACTAAGTTGTTGGGACAGTTAAATTATAATTTTGGTGCTACAACAAGCTCTATTAAAGAACTTTATGAGAGACTTGCTAAGTTGGAAGCAGATGTCCAAGTAGACAGATTGATTAATGGTAGACTTACCGCATTGTCAGCTTTTGTGGCAGCCCGACAGGTAGAAGCCGCCAAGGTGGCGTCACAACGTGTATTAGCAGCTGAAAAGATTAATGAATGTGTTAAGAGTACATCCAATAGATATGGCTTTTGTGGTAATGGAGCTCATATTATCAGCTTCCCACAGAATGCACCTAATGGCATGTTGTTTGTACACTTCTCCTTAGTACCTAATGAGACAATTACCGTTAAAGGTATTATTGGCTTATGCTTGAATAACTCTATTGGCATTGTACCTGCAAAGGATAGAGGAATGTTTATACAATGCAGTAATGGTACTTACTGCCCTGAATTTGAAAATAGTTTTAATGAGAGTAAAAATGGCAACGTAACTTTTCCCTTTGCCATAACTAGTAGAGAACAGTATAACCCACGACAGATTACGACGGGAGATATACAGATGCTTACTTCATGTAACTCAGGTTACACGCACATAGAATGGAGTCAACTACCTTTAGTGGCGCCACCCTATGATGATTTTGATAAAGAGTTTGATAAATTGTATGAGAAATGGAACTATACGCTCGAGGAGTTGGAGAAGTTAAATGTAACTTTCCCTTACCTTAACGTTAGTGAACAAATAGATATTATTAATAGTGCCATGGAAAATATTAAGAGCCAGATTCAAAATTTGAACAGCTCTTATATTGACCTTGAATGGCTTAATAAGTATGAGAGGTATTCTAAGTGGCCTTGGTGGGTGTGGCTAATAATCGTGCTGTGTTTTGCTGCATTTTGCCTATTAGTCTTTTGGATATTTATTTGTACTGGGTGTTGTGGTGGATGCTGCAATTGTTGTGGCATACCAGCACTCTTTGGCTATTGTAAGCGAAAGGCCCATTATGAGAGATTGCGAATGGATGAAGAAGGCAACCTAGAGGAAATAAAAGCAGACTAG