Protein

Protein Id:  AAA42908.1 Length:   1363 aa
Description:   spike glycoprotein Bovine coronavirus. Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   5-Apr-01
Source:   Bovine coronavirus
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Bovine coronavirus
Host:   -- Authors:   Zhang;X.M.; Kousoulas;K.G. and Storz;J.
Title:   Comparison of the nucleotide and deduced amino acid sequences of the S genes specified by virulent and avirulent strains of bovine coronaviruses Journal:   Virology 183 (1); 397-404 (1991)
Taxonomy:   Bovine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus.
db_xref:   """taxon:11128, CDD:293060, CDD:286493, CDD:279881"""
Sequence:   MFLILLISLPMAFAVIGDLKCTTVSINDVDTGAPSISTDTVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLLLNGYYPTSGSTYRNMALKGTLLLSRLWFKPPFLSDFINGIFAKVKNTKVIKKGVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPHTTNLDNKLQGLLEISVCQYTMCEYPHTICHPNLGNQRVELWHWDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGTVLSHYYVLPLTCYSAMTLEYWVTPLTSKQYLLAFNQDGVIFNAVDCKSDFMSEIKCKTLSIAPSTGVYELNGYTVQPIADVYRRIPNLPDCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIEAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTAASCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNRRFGFTEQSVFKPQPVGVFTHHDVVYAQHCFKAPTNFCPCKLDGSLCVGNGPGIDAGYKNSGIGTCPAGTNYLTCHNAAQCDCLCTPDPITSKSTGPYKCPQTKYLVGIGEHCSGLAIKSDYCGGNPCTCQPQAFLGWSVDSCLQGDRCNIFANFILHDVNSGTTCSTDLQKSNTDIILGVCVNYDLYGITGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYLTNRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNTLSRQLQPINYFDSYLGCVVNADNSTSSVVQTCDLTVGSGYCVDYSTKRRSRRAITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMEEFIQTSSPKVTIDCSAFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVLGCLGSDCNKVSSRSAIEDLLFSKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYNGIKVLPPLLSVNQISGYTLAATSASLFPPWSAAAGVPFYLNVQYRINGIGVTMDVLSQNQKLIANAFNNALDAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISSSLQEILSRLDALEAQAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTAKVSPGLCIAGDRGIAPKSGYFVNVNNTWMFTGSGYYYPEPITGNNVVVMSTCAVNYTKAPDVMLNISTPNLHDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQDEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLIGFAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKICGGCCDDYTGHQELVIKTSHDD

Nucleotide

Nucleotide_Id:  M64668.1 Length:   4092bp
Description:   Bovine coronavirus spike glycoprotein (S) gene; complete cds Source:   Bovine coronavirus
Nucleotide_type:   ss-RNA Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   5-Apr-01
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Bovine coronavirus
CDS:   M64668.1:19..4110 Host:   --
Authors:   Zhang;X.M.; Kousoulas;K.G. and Storz;J. Journal:   Virology 183 (1); 397-404 (1991)
Title:   Comparison of the nucleotide and deduced amino acid sequences of the S genes specified by virulent and avirulent strains of bovine coronaviruses db_xref:   taxon:11128
Taxonomy:   Bovine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus.
Features:   SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4110); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(18); ExactPosition(4110); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(18); ExactPosition(4110); strand=1); type='CDS')
Sequence:   ATGTTTTTGATACTTTTAATTTCCTTACCAATGGCTTTTGCTGTTATAGGAGATTTAAAGTGTACTACGGTTTCCATTAATGATGTTGACACCGGTGCTCCTTCTATTAGCACTGATACTGTCGATGTTACTAATGGTTTAGGTACTTATTATGTTTTAGATCGTGTGTATTTAAATACTACGTTGTTGCTTAATGGTTACTACCCTACTTCAGGTTCTACATATCGTAATATGGCACTGAAGGGAACTTTACTATTGAGCAGACTATGGTTTAAACCACCTTTTCTTTCTGATTTTATTAATGGTATTTTTGCTAAGGTCAAAAATACCAAGGTTATTAAAAAGGGTGTAATGTATAGTGAGTTTCCTGCTATAACTATAGGTAGTACTTTTGTAAATACATCCTATAGTGTGGTAGTACAACCACATACTACCAATTTGGATAATAAATTACAAGGTCTCTTAGAGATCTCTGTTTGCCAGTATACTATGTGCGAGTACCCACATACGATTTGTCATCCTAATCTGGGTAATCAACGCGTAGAACTATGGCATTGGGATACAGGTGTTGTTTCCTGTTTATATAAGCGTAATTTCACATATGATGTGAATGCTGATTACTTGTATTTCCATTTTTATCAAGAAGGTGGTACTTTTTATGCATATTTTACAGACACTGGTGTTGTTACTAAGTTTCTGTTTAATGTTTATTTAGGCACGGTGCTTTCACATTATTATGTCCTGCCTTTGACTTGTTATAGTGCTATGACTTTAGAATATTGGGTTACACCTCTCACTTCTAAACAATATTTACTAGCTTTCAATCAAGATGGTGTTATTTTTAATGCTGTTGATTGTAAGAGTGATTTTATGAGTGAGATTAAGTGTAAAACACTATCTATAGCACCATCTACTGGTGTTTATGAATTAAACGGTTACACTGTTCAGCCAATTGCAGATGTTTACCGACGTATACCTAATCTTCCCGATTGTAATATAGAGGCTTGGCTTAATGATAAGTCTGTGCCCTCTCCATTAAATTGGGAACGTAAGACCTTTTCAAATTGTAATTTTAATATGAGCAGCCTGATGTCTTTTATTCAGGCAGACTCATTTACTTGTAATAATATTGAAGCTGCTAAGATATATGGTATGTGTTTTTCCAGCATAACTATAGATAAGTTTGCTATACCCAATGGTAGGAAGGTTGACCTACAATTGGGCAATTTGGGCTATTTGCAGTCTTTTAACTATAGAATTGATACTACTGCTGCAAGTTGTCAGTTGTATTATAATTTACCTGCTGCTAATGTTTCTGTTAGCAGGTTTAATCCTTCTACTTGGAATAGGAGATTTGGTTTTACAGAACAATCTGTTTTTAAGCCTCAACCTGTAGGTGTTTTTACTCATCATGATGTTGTTTATGCACAACATTGTTTTAAAGCTCCCACAAATTTCTGTCCGTGTAAATTGGATGGGTCTTTGTGTGTAGGTAATGGTCCTGGTATAGATGCTGGTTATAAAAATAGTGGTATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGCCATAATGCTGCCCAATGTGATTGTTTGTGCACTCCCGACCCCATTACATCTAAATCTACAGGGCCTTACAAGTGCCCCCAAACTAAATACTTAGTTGGCATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCTTGCTATTAAAAGTGATTATTGTGGAGGTAATCCTTGTACTTGCCAACCACAAGCATTTTTGGGTTGGTCTGTTGACTCTTGTTTACAAGGGGATAGGTGTAATATTTTTGCTAATTTTATTTTGCATGATGTTAATAGTGGTACTACTTGTTCTACTGATTTACAAAAATCAAACACAGACATAATTCTTGGTGTTTGTGTTAATTATGATCTTTATGGTATTACAGGCCAAGGTATTTTTGTTGAGGTTAATGCGACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTTTTATATGATTCTAATGGTAATCTCTATGGTTTTAGAGACTACTTAACAAACAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGCTATAGCGGTCGTGTTTCAGCGGCCTTTCATGCTAACTCTTCCGAACCAGCATTGCTATTTCGGAATATTAAATGCAATTACGTTTTTAATAATACTCTTTCACGACAGCTGCAACCTATTAACTATTTTGATAGTTATCTTGGTTGTGTTGTCAATGCTGATAATAGTACTTCTAGTGTTGTTCAAACATGTGATCTCACAGTAGGTAGTGGTTACTGTGTGGATTACTCTACAAAAAGACGAAGTCGTAGAGCGATTACCACTGGTTATCGGTTTACTAATTTTGAGCCATTTACTGTTAATTCAGTAAATGATAGTTTAGAACCTGTAGGTGGTTTGTATGAAATTCAAATACCTTCAGAGTTTACTATAGGTAATATGGAGGAGTTTATTCAAACAAGCTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTTCTGCTTTTGTCTGTGGTGATTATGCAGCATGTAAATCACAGTTGGTTGAATATGGTAGCTTCTGTGACAATATTAATGCTATACTCACAGAAGTAAATGAACTACTTGACACTACACAGTTGCAAGTAGCTAATAGTTTAATGAATGGTGTCACTCTTAGCACTAAGCTTAAAGATGGCGTTAATTTCAATGTAGACGACATCAATTTTTCCCCTGTATTAGGTTGTTTAGGAAGCGATTGTAATAAAGTTTCCAGCAGATCTGCTATAGAGGATTTACTTTTTTCTAAAGTAAAGTTATCTGATGTCGGTTTCGTTGAGGCTTATAATAATTGTACTGGAGGTGCCGAAATTAGGGACCTCATTTGTGTGCAAAGTTATAATGGTATCAAAGTGTTGCCTCCACTGCTCTCAGTAAATCAGATCAGTGGATACACTTTGGCTGCCACCTCTGCTAGTCTGTTTCCTCCTTGGTCAGCAGCAGCAGGTGTACCATTTTATTTAAATGTTCAGTATCGTATTAATGGGATTGGTGTTACCATGGATGTGTTAAGTCAAAATCAAAAGCTTATTGCTAATGCATTTAACAATGCTCTTGATGCTATTCAGGAAGGGTTTGATGCTACCAATTCTGCTTTAGTTAAAATTCAAGCTGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCTCTTAATAACTTATTGCAACAACTCTCTAATAGATTTGGTGCTATAAGTTCTTCTTTACAAGAAATTCTATCTAGACTGGATGCTCTTGAAGCGCAAGCTCAGATAGACAGACTTATTAATGGGCGTCTTACCGCTCTTAATGCTTATGTTTCTCAACAGCTTAGTGATTCTACACTAGTAAAATTTAGTGCAGCACAAGCTATGGAGAAGGTTAATGAATGTGTCAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTTTGTGGTAATGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCATATGGTTTGTATTTTATCCACTTTAGCTATGTCCCTACTAAGTATGTCACTGCGAAGGTTAGTCCCGGTCTGTGCATTGCTGGTGATAGAGGTATAGCCCCTAAGAGTGGTTATTTTGTTAATGTAAATAATACTTGGATGTTCACTGGTAGTGGTTATTACTACCCTGAACCCATAACTGGAAATAATGTTGTTGTTATGAGTACCTGTGCTGTTAACTATACTAAAGCGCCGGATGTAATGCTGAACATTTCAACACCCAACCTCCATGATTTTAAGGAAGAGTTGGATCAATGGTTTAAAAACCAAACATCAGTGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATAAATGTTACATTCTTGGACCTACAAGATGAAATGAATAGGTTACAGGAGGCAATAAAAGTTTTAAATCAGAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACATATGAGTATTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATTGGCTTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGTTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGTTTTAAGATATGTGGTGGTTGTTGTGATGATTATACTGGACACCAGGAGTTAGTAATTAAAACATCACATGACGACTAA