Protein Id: AAX38496.1 |
Length: 1363 aa |
Description: spike glycoprotein precursor Bovine coronavirus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 19-Mar-05 |
Source: Bovine coronavirus |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Bovine coronavirus |
Host: -- |
Authors: Jeong;J.H.; Kim;G.Y.; Yoon;S.S.; Park;S.J.; Kim;Y.J.; Sung;C.M.; Shin;S.S.; Lee;B.J.; Kang;M.I.; Park;N.Y.; Koh;H.B. and Cho;K.O. |
Title: Molecular analysis of S gene of spike glycoprotein of winter dysentery bovine coronavirus circulated in Korea during 2002-2003 |
Journal: Virus Res 108 (1-2); 207-212 (2005) |
Taxonomy: Bovine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
db_xref: """taxon:11128, CDD:293060, CDD:286493, CDD:279881, CDD:223910""" |
Sequence: MFLILLISLPMAFAVIGDLKCTTVSINDVDTGVPSISTDTVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLLLNGYYPTSGSTYRNMALKGTLLLSTLWFKPPFLSDFTNGIFAKVKNTKVVKNGVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPHTTNFDSKLQGLLEISVCQYTMCEYPNTICNPNLGNRRVELWHWDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGTVLSHYYVMPLTCNSALTLEYWVTPLTSKQYLLAFNQDGVIFNAVDCKSDFMSEIKCKTLSIAPSTGVYELNGYTVQPIADVYRRIPNLPDCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNRRFGFTEQSVFKPQPAGVFTDHDVVYAQHCFKAPTNFCPCKLDGSLCVGNGSGIDAGYKNTGIGTCPAGTNYLTCHNAAQCDCLCTPDPITSKATGPYKCPQTKYLVGIGEHCSGLAIKSDYCGGNPCSCQPQAFLGWSVDSCLQGDRCNIFANFILHDVNSGTTCSIDLQKSNTDIILGVCVNYDLYGITGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYLTNRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNILSRQLQPINYFDSYLGCVVNADNSTSSVVQTCDLTVGSGYCVDYSTKRRSRRSITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMEEFIQTSSPKVTIDCSAFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVLGCLGSDCNKVSSRSAIEDLLFSKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYNGIKVLPPLLSENQISGYTLAATSASLFPPWSAAAGVPFYLNVQYRINGIGVTMDVLSQNQKLIANAFNNALGAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISSSLQEILSRLDALEAQAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTAKVSPGLCIAGDRGIAPKSGYFVNVNNTWMFTGSGYYYPEPITGNNVVVMSTCAVNYTKAPDVMLNISTPNLPDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQDEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLIGFAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGHQELVIKTSHDD |
Nucleotide
Nucleotide_Id: AY935644.1 |
Length: 4092bp |
Description: Bovine coronavirus isolate KWD8 spike glycoprotein precursor (S) gene; complete cds |
Source: Bovine coronavirus |
Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 19-Mar-05 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Bovine coronavirus |
CDS: AY935644.1:1..4092 |
Host: -- |
Authors: Jeong;J.H.; Kim;G.Y.; Yoon;S.S.; Park;S.J.; Kim;Y.J.; Sung;C.M.; Shin;S.S.; Lee;B.J.; Kang;M.I.; Park;N.Y.; Koh;H.B. and Cho;K.O. |
Journal: Virus Res 108 (1-2); 207-212 (2005) |
Title: Molecular analysis of S gene of spike glycoprotein of winter dysentery bovine coronavirus circulated in Korea during 2002-2003 |
db_xref: taxon:11128 |
Taxonomy: Bovine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4092); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4092); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4092); strand=1); type='CDS') |
Sequence: ATGTTTTTGATACTTTTAATTTCCTTACCAATGGCTTTTGCTGTTATAGGAGATTTAAAGTGTACTACAGTTTCCATTAATGATGTTGACACTGGTGTTCCTTCTATTAGCACTGATACTGTCGATGTTACTAATGGTTTAGGTACTTATTATGTTTTAGATCGTGTGTATTTAAATACTACGTTGTTGCTTAATGGTTACTACCCTACTTCAGGTTCTACATATCGTAATATGGCACTGAAGGGAACTTTACTATTGAGCACACTATGGTTTAAACCACCTTTTCTTTCTGATTTTACTAATGGTATTTTTGCTAAGGTCAAAAATACCAAGGTTGTTAAAAATGGTGTAATGTATAGTGAGTTTCCTGCTATAACTATAGGTAGTACTTTTGTAAATACATCCTATAGTGTGGTAGTACAACCACATACTACTAATTTTGATAGTAAATTACAAGGTCTCTTAGAGATTTCTGTTTGCCAGTATACTATGTGCGAGTACCCAAATACGATTTGTAATCCTAATCTGGGTAATCGACGCGTAGAACTATGGCATTGGGATACAGGTGTTGTTTCCTGTTTATATAAGCGTAATTTCACATATGATGTGAATGCTGATTATTTGTATTTCCATTTTTATCAAGAAGGTGGTACTTTTTATGCATATTTTACAGACACTGGTGTTGTTACTAAGTTTCTGTTTAATGTTTATTTAGGCACGGTGCTCTCACATTATTATGTCATGCCTTTGACTTGTAATAGTGCTCTGACTTTAGAATATTGGGTTACACCTCTCACTTCTAAACAATATCTACTAGCTTTCAATCAAGATGGTGTTATTTTTAATGCTGTTGATTGTAAGAGTGATTTTATGAGTGAGATTAAGTGTAAAACACTATCTATAGCACCATCTACTGGTGTTTATGAATTAAACGGTTACACTGTTCAGCCAATTGCAGATGTTTACCGACGTATACCTAATCTTCCTGATTGCAATATTGAGGCTTGGCTTAATGATAAGTCGGTGCCCTCTCCATTAAATTGGGAACGTAAGACCTTTTCAAATTGTAATTTTAATATGAGCAGCCTGATGTCTTTTATTCAGGCAGACTCATTTACTTGTAATAATATTGATGCTGCTAAGATATATGGTATGTGTTTTTCCAGCATAACTATAGATAAGTTTGCAATACCCAATGGTAGGAAGGTTGACCTACAATTGGGTAATTTGGGTTATTTGCAGTCTTTTAACTATAGAATTGATACTACTGCTACAAGTTGTCAGTTGTATTATAATTTACCTGCTGCTAATGTTTCTGTTAGCAGGTTTAATCCTTCTACTTGGAATAGGAGATTTGGTTTTACAGAACAATCTGTTTTTAAGCCTCAACCTGCAGGTGTTTTTACTGATCATGATGTTGTTTATGCACAACATTGTTTTAAAGCTCCCACAAATTTCTGTCCGTGTAAATTGGATGGGTCTTTGTGTGTAGGTAATGGTTCTGGTATAGATGCTGGTTATAAAAATACTGGTATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGCCATAATGCTGCCCAATGTGATTGTTTGTGCACTCCCGACCCCATTACATCTAAAGCTACAGGGCCTTACAAGTGCCCCCAAACTAAATATTTAGTTGGTATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCTTGCTATTAAAAGTGATTATTGTGGAGGTAATCCTTGTAGTTGCCAACCACAAGCATTTTTGGGTTGGTCTGTTGACTCTTGTTTACAAGGGGATAGGTGTAATATTTTTGCTAATTTTATTTTGCATGATGTTAATAGTGGTACTACTTGTTCTATTGATTTACAAAAATCAAACACAGACATAATTCTTGGTGTTTGTGTTAATTATGATCTTTATGGTATTACTGGCCAAGGGATTTTTGTTGAGGTTAATGCGACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTTTTATATGATTCTAATGGTAATCTCTATGGTTTTAGAGACTACTTAACAAATAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGCTATAGCGGTCGTGTTTCAGCGGCCTTTCATGCTAACTCTTCCGAACCAGCATTGCTATTTCGGAATATCAAATGCAATTACGTTTTTAATAATATTCTTTCACGACAGCTGCAACCTATTAACTATTTTGATAGCTATCTTGGTTGTGTTGTCAATGCTGATAATAGTACTTCTAGTGTTGTTCAAACATGTGATCTCACAGTAGGTAGTGGTTACTGTGTGGATTACTCTACAAAAAGACGAAGTCGTAGATCGATTACCACTGGTTATCGGTTTACTAATTTTGAGCCATTTACTGTTAATTCAGTAAATGATAGTTTAGAACCTGTAGGTGGTTTGTATGAAATTCAAATACCTTCAGAGTTTACTATAGGTAATATGGAGGAGTTTATTCAAACAAGCTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTTCTGCTTTTGTCTGTGGTGATTATGCAGCATGTAAATCACAGTTGGTTGAATATGGTAGCTTCTGTGACAATATTAATGCTATACTCACAGAAGTAAATGAACTACTTGACACTACACAGTTGCAAGTAGCTAATAGTTTAATGAATGGTGTCACTCTTAGCACTAAGCTTAAAGATGGCGTTAATTTCAATGTAGACGACATCAATTTTTCCCCTGTATTAGGTTGTTTAGGAAGCGATTGCAATAAAGTTTCCAGTAGATCTGCTATAGAGGACTTACTTTTTTCTAAAGTAAAGTTATCTGATGTCGGTTTCGTTGAGGCTTATAATAATTGTACTGGAGGTGCCGAAATTAGGGACCTCATTTGTGTGCAAAGTTATAATGGTATCAAGGTGTTGCCTCCACTGCTCTCAGAAAATCAGATCAGTGGATACACTTTGGCTGCCACCTCTGCTAGCCTGTTTCCTCCATGGTCAGCAGCAGCAGGTGTACCATTCTATTTAAATGTTCAGTATCGTATTAATGGTATTGGTGTTACCATGGATGTGCTAAGTCAAAATCAAAAGCTTATTGCTAATGCATTTAACAATGCTCTTGGTGCTATTCAGGAAGGGTTTGATGCTACCAATTCTGCTTTAGTTAAAATTCAAGCTGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCTCTTAATAACTTATTGCAACAACTCTCTAATAGATTTGGTGCTATAAGTTCTTCTTTACAAGAAATTCTATCTAGACTGGATGCTCTTGAAGCGCAAGCTCAGATAGACAGACTTATTAATGGGCGTCTTACCGCTCTTAATGCTTATGTTTCTCAACAGCTTAGTGACTCTACACTAGTAAAGTTTAGTGCAGCACAAGCTATGGAGAAGGTTAATGAATGTGTCAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTTTGTGGTAATGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCATATGGTTTGTATTTTATCCACTTTAGCTATGTCCCTACTAAGTATGTCACAGCGAAGGTTAGTCCCGGTCTGTGCATTGCTGGTGATAGAGGTATAGCCCCTAAGAGTGGTTATTTTGTTAATGTAAATAATACTTGGATGTTCACTGGTAGTGGTTATTACTACCCTGAACCTATAACTGGAAATAATGTTGTTGTTATGAGTACCTGTGCTGTTAATTATACTAAAGCGCCGGATGTAATGCTGAACATTTCAACACCCAACCTCCCTGACTTTAAGGAAGAGTTGGATCAATGGTTTAAAAACCAAACATCAGTGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATAAATGTTACATTCTTGGACCTACAAGATGAAATGAATAGGTTACAGGAGGCAATAAAAGTTTTAAATCAGAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACTTATGAGTATTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATTGGCTTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGTTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGTTTTAAGAAATGTGGTGGTTGTTGTGATGATTATACTGGACACCAGGAGTTAGTAATTAAAACATCACATGACGACTAA |