Protein

Protein Id:  ABD18911.1 Length:   1363 aa
Description:   spike glycoprotein precursor Bovine coronavirus. Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   12-Sep-07
Source:   Bovine coronavirus
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Bovine coronavirus
Host:   -- Authors:   Park;S.J.; Lim;G.K.; Park;S.I.; Kim;H.H.; Koh;H.B. and Cho;K.O.
Title:   Detection and molecular characterization of calf diarrhoea bovine coronaviruses circulating in South Korea during 2004-2005 Journal:   Zoonoses Public Health 54 (6-7); 223-230 (2007)
Taxonomy:   Bovine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus.
db_xref:   """taxon:11128, CDD:293060, CDD:286493, CDD:279881, CDD:223910"""
Sequence:   MFLILLISLPMAFAVIGDLKCTTVSINDVDTGVPSISTDTVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLLLNGYYPTSGSTYRNMALKGTLLLSRLWFKPPFLSDFTNGIFAKVKNTKVIKDGVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPHTTNFDSKLQGLLEISVCQYTMCEYPNTICNPNLGNQRVELWHWDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGTVLSHYYVMPLTCNSALTLEYWVTPLTSKQYLLAFNQDGVIFNAVDCKSDFMSEIKCKTLSIAPSTGVYELNGYTVQPIADVYRRIPNLPDCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPYTWNRRFGFTEQSVFKPQPAGVFTDHDVVYAQHCFKAPTNFCPCKLDGSLCVGSGSGIDAGYKNTGIGTCPAGTNYLTCHNAAQCDCLCTPDPITSKATGPYKCPQTKYLVGIGEHCSGLAIKSDYCGGNPCSCQPQAFLGWSVDSCLQGDRCNIFANFILHDVNSGTTCSTDLQKSNTDIILGVCVNYDLYGITGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYLTNRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNTLSRQLQPINYFDSYLGCVVNADNSTSSVVQTCDLTVGSGYCVDYSTKRRSRRSITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMEEFIQTSSPKVTIDCSAFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDKINFSPVLGFLGSDCNKVSSRSAIEDLLFSKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYNGIKVLPPLLSENQISGYTLAATSASLFPPWSAAAGVPFYLNVQYRINGIGVTMDVLSQNQKLIANAFNNALGAIQDGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISSSLQEILSRLDALEAQAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTAKVSPGLCIAGDRGIAPKSGYFVNVNNTWMFTGSGYYYPEPITGNNVVVMSTCAVNYTKAPDVMLNISTPNLPDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQDEINRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLVGFAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGHQELVIKTSHDD

Nucleotide

Nucleotide_Id:  DQ389635.1 Length:   4092bp
Description:   Bovine coronavirus isolate KCD4 spike glycoprotein precursor (S) gene; complete cds Source:   Bovine coronavirus
Nucleotide_type:   RNA Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   12-Sep-07
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Bovine coronavirus
CDS:   DQ389635.1:1..4092 Host:   --
Authors:   Park;S.J.; Lim;G.K.; Park;S.I.; Kim;H.H.; Koh;H.B. and Cho;K.O. Journal:   Zoonoses Public Health 54 (6-7); 223-230 (2007)
Title:   Detection and molecular characterization of calf diarrhoea bovine coronaviruses circulating in South Korea during 2004-2005 db_xref:   taxon:11128
Taxonomy:   Bovine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus.
Features:   SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4092); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4092); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4092); strand=1); type='CDS')
Sequence:   ATGTTTTTGATACTTTTAATTTCCTTACCAATGGCTTTTGCTGTTATAGGAGATTTAAAGTGTACTACAGTTTCCATTAATGATGTTGACACTGGTGTTCCTTCTATTAGCACTGATACTGTCGATGTTACTAATGGTTTAGGTACTTATTATGTTTTAGATCGTGTGTATTTAAATACTACGTTGTTGCTTAATGGTTACTACCCTACTTCAGGTTCTACATATCGTAATATGGCACTGAAGGGAACTTTACTATTGAGCAGACTATGGTTTAAACCACCTTTTCTTTCTGATTTTACTAATGGTATTTTTGCTAAGGTCAAAAATACCAAGGTTATTAAAGATGGTGTAATGTATAGTGAGTTTCCTGCTATAACTATAGGTAGTACTTTTGTAAATACATCCTATAGTGTGGTAGTACAACCACATACTACTAATTTTGATAGTAAATTACAAGGTCTCTTAGAGATTTCTGTTTGCCAGTATACTATGTGCGAGTACCCAAATACGATTTGTAATCCTAATCTGGGTAATCAACGCGTAGAACTATGGCATTGGGATACAGGTGTTGTTTCCTGTTTATATAAGCGTAATTTCACATATGATGTGAATGCTGATTATTTGTATTTCCATTTTTATCAAGAAGGTGGTACTTTTTATGCATATTTTACAGACACTGGTGTTGTTACTAAGTTTCTGTTTAATGTTTATTTAGGCACGGTGCTCTCACATTATTATGTCATGCCTTTGACTTGTAATAGTGCTCTGACTTTAGAATATTGGGTTACACCTCTCACTTCTAAACAATATCTACTAGCTTTCAATCAAGATGGTGTTATTTTTAATGCTGTTGATTGTAAGAGTGATTTTATGAGTGAGATTAAGTGTAAAACACTATCTATAGCACCATCTACTGGTGTTTATGAATTAAACGGTTACACTGTTCAGCCAATTGCAGATGTTTACCGACGTATACCTAATCTTCCCGATTGTAATATTGAGGCTTGGCTTAATGATAAGTCGGTGCCCTCTCCATTAAATTGGGAACGTAAGACCTTTTCAAATTGTAATTTTAATATGAGTAGCCTGATGTCTTTTATTCAGGCAGACTCATTTACTTGTAATAATATTGATGCTGCTAAGATATATGGTATGTGTTTTTCCAGCATAACTATAGATAAGTTTGCAATACCCAATGGTAGGAAGGTTGACCTACAATTGGGTAATTTGGGTTATTTGCAGTCTTTTAACTATAGAATTGATACTACTGCTACAAGTTGTCAGTTGTATTATAATTTACCTGCTGCTAATGTTTCTGTTAGCAGGTTTAATCCTTATACTTGGAATAGGAGATTTGGTTTTACAGAACAATCTGTTTTTAAGCCTCAACCTGCAGGTGTTTTTACTGATCATGATGTTGTTTATGCACAACATTGTTTTAAAGCTCCCACAAATTTCTGTCCTTGTAAATTGGATGGGTCTTTGTGTGTAGGTAGTGGTTCTGGTATAGATGCTGGTTATAAAAATACTGGTATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGCCATAATGCTGCCCAATGTGATTGTTTGTGCACCCCAGACCCCATTACATCTAAAGCTACAGGGCCTTACAAGTGCCCCCAAACTAAATACTTAGTTGGTATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCTCGCTATTAAAAGTGATTATTGTGGAGGTAATCCTTGTAGTTGCCAACCACAAGCATTTTTGGGTTGGTCTGTTGACTCTTGTTTACAAGGGGATAGGTGTAATATTTTTGCTAATTTTATTTTGCATGATGTTAATAGTGGTACTACTTGTTCTACTGATTTACAAAAATCAAACACAGACATAATTCTTGGTGTTTGTGTTAATTATGATCTTTATGGTATTACTGGCCAAGGTATTTTTGTTGAGGTTAATGCGACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTTTTATATGATTCTAATGGTAATCTCTATGGTTTTAGAGACTACTTAACAAATAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGCTATAGCGGTCGTGTATCAGCGGCCTTTCATGCTAACTCTTCCGAACCAGCATTGCTATTTCGGAATATTAAATGCAACTACGTTTTTAATAATACTCTTTCACGACAGCTGCAACCTATTAACTATTTTGATAGCTATCTTGGTTGTGTTGTCAATGCTGATAATAGTACTTCTAGTGTTGTTCAAACATGCGATCTCACAGTAGGTAGTGGTTACTGTGTGGATTACTCTACAAAAAGACGAAGTCGTAGATCGATTACCACTGGTTATCGGTTTACTAATTTTGAGCCATTTACTGTTAATTCAGTAAATGATAGTTTAGAACCTGTAGGTGGTTTGTATGAAATTCAAATACCTTCAGAGTTTACTATAGGTAATATGGAGGAGTTTATTCAAACAAGCTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTTCTGCTTTTGTCTGTGGTGATTATGCAGCATGTAAATCACAGTTGGTTGAATATGGTAGCTTCTGTGACAATATTAATGCTATACTCACAGAAGTAAATGAACTACTTGACACTACACAGTTGCAAGTAGCTAATAGTTTAATGAATGGTGTCACTCTTAGCACTAAGCTTAAAGATGGCGTTAATTTCAATGTAGATAAAATCAATTTTTCCCCTGTATTAGGTTTTTTAGGAAGCGACTGTAATAAAGTTTCCAGTAGATCTGCTATAGAGGATTTACTTTTTTCTAAAGTAAAGTTATCTGATGTCGGTTTTGTTGAGGCTTATAACAATTGTACTGGAGGTGCCGAAATTAGGGACCTCATTTGTGTGCAAAGTTATAACGGTATCAAGGTGTTGCCTCCACTGCTCTCAGAAAATCAGATCAGTGGATACACTTTGGCTGCCACCTCTGCTAGTCTGTTTCCTCCTTGGTCAGCAGCAGCAGGTGTACCATTTTATTTAAATGTTCAGTATCGCATTAATGGGATTGGTGTTACCATGGATGTGCTAAGTCAAAATCAAAAGCTTATTGCTAATGCATTTAACAATGCTCTTGGTGCTATTCAGGACGGTTTTGATGCTACCAATTCTGCTTTAGTTAAAATTCAAGCTGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCTCTTAATAACTTATTGCAACAACTCTCTAATAGGTTTGGTGCTATAAGTTCTTCTTTACAAGAAATTCTATCTAGACTGGATGCTCTTGAAGCGCAAGCTCAGATAGACAGACTTATTAATGGGCGTCTTACCGCTCTTAATGCCTATGTTTCTCAACAGCTTAGTGACTCTACACTAGTAAAATTTAGTGCAGCACAAGCTATGGAGAAGGTTAATGAATGTGTCAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTTTGTGGTAATGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCATATGGTTTGTATTTCATCCACTTTAGCTATGTCCCTACTAAGTATGTCACAGCGAAGGTTAGTCCCGGTCTGTGCATTGCTGGTGATAGAGGTATAGCCCCCAAGAGTGGTTATTTTGTTAATGTAAATAATACTTGGATGTTCACTGGTAGTGGTTATTACTACCCTGAACCTATAACTGGAAATAATGTTGTTGTTATGAGTACCTGTGCTGTTAATTATACTAAAGCGCCGGATGTAATGCTGAACATTTCAACACCCAACCTCCCTGATTTTAAGGAAGAGTTGGATCAATGGTTTAAAAACCAAACATCAGTGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATAAATGTTACATTCTTGGACCTACAAGATGAAATTAATAGGTTACAGGAGGCAATAAAAGTTTTAAATCAGAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACATATGAGTATTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAGTTGGCTTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGTTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGTTTTAAGAAATGTGGCGGTTGTTGTGATGATTATACTGGACACCAGGAGTTAGTAATTAAAACATCACATGACGACTAA