| Protein Id: ABI93999.2 |
Length: 1363 aa |
| Description: spike protein Bovine coronavirus isolate Alpaca. |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 19-Jun-07 |
| Source: Bovine coronavirus isolate Alpaca |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Bovine coronavirus |
| Host: alpaca |
Authors: Jin;L.; Cebra;C.K.; Baker;R.J.; Mattson;D.E.; Cohen;S.A.; Alvarado;D.E. and Rohrmann;G.F. |
| Title: Analysis of the genome sequence of an alpaca coronavirus |
Journal: Virology 365 (1); 198-203 (2007) |
| Taxonomy: Bovine coronavirus isolate Alpaca Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
| db_xref: """taxon:404135, CDD:293060, CDD:286493, CDD:279881""" |
| Sequence: MFLILLISLPTAFAVIGDLKCTTVSINDVDTGVPSISTDTVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLLLNGYYPTSGSTYRNMALKGTLLLSTLWFKPPFLSDFTNGIFAKVKNTKVIKDGVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPHTTILGNKLQGFLEISVCQYTMCEYPNTICNSNLGNRRVELWHWDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGTVLSHYYVMPLTCNSALTLEYWVTPLTSKQYLLAFNQDGVIFNAVDCKSDFMSEIKCKTLSIAPSTGVYELNGYTVQPIADVYRRIPNLPDCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNRRFGFTEQSVFKPQPAGVFTDHDVVYAQHCFKAPTNFCPCKLDGSLCVGNGPGIDAGYKTSGIGTCPAGTNYLTCHNAAQCNCLCTPDPITSKATGPYKCPQTKYLVGIGEHCSGPAIKSDYCGGNPCTCQPQAFLGWSVDSCLQGDRCNIFANFILHDVNSGTTCSTDLQKSNTDIILGVCVNYDLYGITGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYLTNRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPASLFRNIKCNYVFNNTLSRQLQPINYFDSYLGCVVNADNSTSSVVQTCDLTVGSGYCVDYSTKRRSRRSITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMEEFIQTSSPKVTIDCSAFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVLGCLGSDCNKVSSRSAIEDLLFSKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYNGIKVLPPLLSDNQISGYTLAATSASLFPPWSAAAGVPFYLNVQYRINGIGVTMDVLSQNQKLIANAFNNALGAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISSSLQEILSRLDALDAQAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTAKVSPGLCIAGGRGIAPKSGYFVNVNNTWMFTGSGYYYPEPITGNNVVVMSTCAVNYTKAPDVMLNISTPNLPDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQDEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLIGFAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGHQELVIKTSHED |
Nucleotide
| Nucleotide_Id: DQ915164.2 |
Length: 4092bp |
| Description: Bovine coronavirus isolate Alpaca; complete genome |
Source: Bovine coronavirus isolate Alpaca |
| Nucleotide_type: ds-RNA |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 19-Jun-07 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Bovine coronavirus |
| CDS: DQ915164.2:23641..27732 |
Host: alpaca |
| Authors: Jin;L.; Cebra;C.K.; Baker;R.J.; Mattson;D.E.; Cohen;S.A.; Alvarado;D.E. and Rohrmann;G.F. |
Journal: Virology 365 (1); 198-203 (2007) |
| Title: Analysis of the genome sequence of an alpaca coronavirus |
db_xref: taxon:404135 |
| Taxonomy: Bovine coronavirus isolate Alpaca Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
| Sequence: ATGTTTTTGATACTTTTAATTTCCTTACCAACTGCTTTTGCTGTTATAGGAGATTTAAAGTGTACTACAGTTTCCATTAATGATGTTGACACTGGTGTTCCTTCTATTAGCACTGATACTGTCGATGTTACTAATGGTTTAGGTACTTATTATGTTTTAGATCGTGTGTATTTAAATACTACGTTGTTGCTTAATGGTTATTACCCTACTTCAGGTTCTACATATCGTAATATGGCACTGAAGGGAACTTTACTATTGAGCACACTGTGGTTTAAACCACCTTTTCTTTCTGATTTTACTAATGGTATTTTTGCTAAGGTCAAAAATACCAAGGTTATTAAAGATGGTGTAATGTATAGTGAGTTTCCTGCTATAACTATAGGTAGTACTTTTGTAAATACATCCTATAGTGTGGTAGTACAACCACATACTACCATTTTGGGTAATAAATTACAAGGTTTCTTAGAGATCTCTGTTTGCCAGTATACTATGTGCGAGTACCCAAATACGATTTGTAATTCTAATCTGGGTAATCGACGCGTAGAACTATGGCATTGGGATACAGGTGTTGTTTCCTGTTTATATAAGCGTAATTTCACATATGATGTGAATGCTGATTATTTGTATTTCCATTTTTATCAAGAAGGTGGTACTTTTTATGCATATTTTACAGACACTGGTGTTGTTACTAAGTTTCTGTTTAATGTTTATTTAGGCACAGTGCTCTCACATTATTATGTCATGCCTTTGACTTGTAATAGTGCTCTGACTTTAGAATATTGGGTTACACCCCTCACTTCTAAACAATATCTACTAGCTTTCAATCAAGATGGTGTTATTTTTAATGCTGTTGATTGTAAGAGTGATTTTATGAGTGAGATTAAGTGTAAAACACTATCTATAGCACCATCTACTGGTGTTTATGAACTAAACGGTTACACTGTTCAGCCAATTGCAGATGTTTACCGACGTATACCTAATCTTCCCGATTGCAATATTGAGGCTTGGCTTAATGATAAGTCGGTGCCCTCTCCATTAAATTGGGAACGTAAGACCTTTTCAAATTGTAATTTTAATATGAGCAGCCTGATGTCTTTTATTCAGGCAGACTCATTTACTTGTAATAATATTGATGCTGCTAAGATATATGGTATGTGTTTTTCCAGCATAACTATAGATAAGTTTGCAATACCCAATGGTAGGAAGGTTGACCTACAATTGGGTAATTTGGGCTATTTGCAGTCTTTTAATTATAGAATTGATACTACTGCTACAAGTTGTCAGTTGTATTATAATTTACCTGCTGCTAATGTTTCTGTTAGCAGGTTTAATCCTTCTACTTGGAATAGGAGATTTGGTTTTACAGAACAATCTGTTTTTAAGCCTCAACCTGCAGGTGTTTTTACTGATCATGATGTTGTTTATGCACAACATTGTTTTAAAGCTCCCACAAATTTCTGTCCGTGTAAATTGGATGGGTCTTTGTGTGTAGGTAATGGTCCTGGTATAGATGCTGGTTATAAAACTAGTGGCATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGCCATAATGCTGCCCAATGTAATTGTTTGTGCACTCCAGACCCCATTACATCTAAAGCTACAGGGCCTTACAAGTGCCCCCAAACTAAATATTTAGTTGGCATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCCTGCTATTAAAAGTGATTATTGTGGAGGTAATCCTTGTACTTGCCAACCACAAGCATTTTTGGGGTGGTCTGTTGACTCTTGTTTACAAGGGGATAGGTGTAATATTTTTGCTAATTTCATTTTGCATGATGTTAATAGTGGTACTACTTGTTCTACTGATTTACAAAAATCAAACACAGACATAATTCTTGGTGTTTGTGTTAATTATGATCTTTATGGTATTACTGGCCAAGGTATCTTTGTTGAGGTTAATGCGACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTTTTATATGATTCTAATGGTAATCTCTATGGTTTTAGAGACTACTTAACAAATAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGCTATAGTGGTCGTGTTTCAGCGGCCTTTCATGCTAACTCTTCCGAACCAGCATCGCTATTTCGGAATATTAAATGCAATTACGTTTTTAATAATACTCTTTCACGACAGCTGCAACCTATTAACTATTTTGATAGCTATCTTGGTTGTGTTGTCAATGCTGATAATAGTACTTCTAGTGTTGTTCAAACATGTGATCTCACAGTAGGTAGTGGTTACTGTGTGGATTACTCTACAAAAAGACGAAGTCGTAGATCGATTACCACTGGTTATCGGTTTACTAATTTTGAGCCATTTACTGTTAATTCAGTAAATGATAGCTTAGAACCTGTAGGTGGTTTGTACGAAATTCAAATACCTTCAGAGTTTACTATAGGTAATATGGAGGAGTTTATTCAAACAAGCTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTTCTGCTTTTGTCTGTGGTGATTATGCAGCATGTAAATCACAGTTGGTTGAATATGGTAGCTTCTGTGACAATATTAATGCTATACTCACAGAAGTAAATGAACTACTTGACACTACACAGTTGCAAGTAGCTAATAGTTTAATGAATGGTGTCACTCTTAGCACTAAGCTTAAAGATGGCGTTAATTTCAATGTAGACGACATCAATTTTTCCCCTGTATTAGGTTGTTTAGGAAGCGATTGCAATAAAGTTTCCAGTAGATCTGCTATAGAGGACTTACTTTTTTCTAAAGTAAAGTTATCTGATGTCGGTTTCGTTGAGGCCTATAATAATTGTACTGGAGGTGCCGAAATTAGGGACCTCATTTGTGTGCAAAGTTATAATGGTATCAAGGTGTTGCCTCCACTGCTCTCAGATAATCAGATCAGTGGATACACTTTGGCTGCCACCTCTGCTAGCCTGTTTCCTCCATGGTCAGCAGCAGCAGGTGTACCATTCTATTTAAATGTTCAGTATCGTATTAATGGTATTGGTGTTACCATGGATGTGCTAAGTCAAAATCAAAAGCTTATTGCTAATGCATTTAACAATGCTCTTGGTGCTATTCAGGAAGGGTTTGATGCTACCAATTCTGCTTTAGTTAAAATTCAAGCTGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCTCTTAATAACTTATTGCAACAACTCTCTAATAGATTTGGTGCTATAAGTTCTTCTTTACAAGAAATTCTATCTAGACTGGATGCTCTTGACGCGCAAGCTCAGATAGATAGACTTATTAATGGGCGTCTTACCGCTCTTAATGCTTATGTTTCTCAACAGCTTAGTGACTCTACACTAGTAAAGTTTAGTGCAGCACAAGCTATGGAGAAGGTTAATGAATGTGTCAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTTTGTGGTAATGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCATATGGTTTGTATTTTATCCACTTTAGCTATGTCCCTACTAAGTATGTCACAGCGAAGGTTAGTCCCGGTCTGTGCATTGCTGGTGGTAGAGGTATAGCCCCTAAGAGTGGTTATTTTGTTAATGTAAATAACACTTGGATGTTCACTGGTAGTGGTTATTACTACCCTGAACCTATAACTGGAAATAATGTTGTTGTTATGAGTACCTGTGCTGTTAATTATACTAAAGCGCCGGATGTAATGCTGAACATTTCAACACCCAACCTCCCTGATTTTAAGGAAGAGTTGGATCAATGGTTTAAAAACCAAACATCAGTGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATAAATGTTACATTCTTGGACCTACAAGATGAAATGAATAGGTTACAGGAGGCAATAAAAGTTTTAAATCAGAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACATATGAGTATTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATTGGCTTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGTTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGTTTTAAGAAATGTGGTGGTTGTTGTGATGATTATACTGGACACCAGGAGTTAGTAATTAAAACATCACATGAAGACTAA |