Protein

Protein Id:  AAR11077.1 Length:   1453 aa
Description:   spike protein Canine coronavirus. Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   5-Nov-03
Source:   Canine coronavirus
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Canine coronavirus
Host:   giant panda Authors:   Qiao;J.; Meng;Q. and Xia;X.
Title:   Cloning and sequence analysis of canine coronavirus giant panda strain S protein gene Journal:   Unpublished
Taxonomy:   Canine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus.
db_xref:   """taxon:11153, CDD:279880, CDD:279881"""
Sequence:   MIVLTLCLLLFSYNSVICTSNNDCVQVNVTQLPGNENIIKDFLFHTFKEEGSVVVGGYYPTEVWYNCSRSATTTAYKDFSNIHAFYFDMEAMENSTGNARGKPLLVHVHGDPVSIIIYISAYRDDVQGRPLLKHGLLCITKNEIIDYNTFTSAQWSAICLGDDRKIPFSVIPPDNGTKIFGLEWNDDYVTAYISDRSHHLNINNNWFNNVTILYSRSSTATWQKSAAYVYQGVSNFTYYKLNNTNGLKSYELCEDYEYCTGYATNVFAPTVGGYIPDGFSFNNWFMLTNSSTFVSGRFVTNQPLLVNCLWPVPSFGVAAQQFCFEGAQFSQCNGVSLNNTVDVIRFNLNFTTDVQSGMGATVFSLNATGGVILEISCYNDTVSESSFYSYGEISFGVTDGPRYCFALYNGTALKYLGTLPPSVKEIAISKWGHFYINGYNFFSTFPIDCISFNLTTGDSGAFWTIAYTSYTDALVQVENTAIKKVTYCNSHINNIKCSQLTANLQNGFYPVASSEVGLVNKSVVLLPSFYSHTSVNITIDLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNNTDVYCIRSNRFSVYFHSTCKSSLWDDVFNSDCTDVLYATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCLSLNPVGANCKFDVAARTRTNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGITGVGIIRQTNSTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVSDGVIYSVTPCDVSAHAAVIDGAIVGAMTSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNERTRGTAIDSNDVDCEPIITYSNIGVCKNGALVFINVTHSDGDVQPISTGNVTIPTNFTISVQVEYIQVYTTPVSIDCSRYVCNGNPRCNKLLTQYVSACQTIEQALAMGARLENMEIDSMLFVSENALKLASVEAFNSTETLDPIYKEWPNIGGSWLGGLKDILPSHNSKRKYRSAIEDLLFDKVVTSGLGTVDEDYKRCTGGYDIADLVCAQYYNGIMVLPGVANDDKMAMYTASLAGGITLGSLGGGAVSIPFAIAVQARLNYVALQTDVLNKNQQILANAFNQAIGNITQAFGKVNDAIHQTSQGLATVAKVLAKVQDVVNTQGQALSHLTVQLQNNFQAISSSISDIYNRLDELSADAQVDRLITGRLTALNAFVSQTLTRQAEVRASRQLAKDKVNECVRSQSQRFGFCGNGTHLFSLANAAPNGMIFFHTVLLPTAYETVTAWSGICASDGDRTFGLVVKDVQLTLFRNLDDKFYLTPRTMYQPRVATSSDFVQIEGCDVLFVNATVIDLPSIIPDYIDINQTVQDILENFRPNWTVPELPLDIFNATYLNLTGEINDLEFRSEKLHNTTVELAILIDNINNTLVNLEWLNRIETYVKWPWYVWLLIGLVVIFCIPILLFCCCSTGCCGCIGCLGSCCHSICSRRQFESYEPTEKVHVH

Nucleotide

Nucleotide_Id:  AY436637.1 Length:   4362bp
Description:   Canine coronavirus spike protein (S) mRNA; complete cds Source:   Canine coronavirus
Nucleotide_type:   mRNA Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   5-Nov-03
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Canine coronavirus
CDS:   AY436637.1:1..4362 Host:   giant panda
Authors:   Qiao;J.; Meng;Q. and Xia;X. Journal:   Unpublished
Title:   Cloning and sequence analysis of canine coronavirus giant panda strain S protein gene db_xref:   taxon:11153
Taxonomy:   Canine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus.
Features:   SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='CDS')
Sequence:   ATGATTGTGCTTACATTGTGCCTCCTCTTGTTTTCGTACAATAGTGTGATTTGTACATCAAACAATGACTGTGTACAAGTTAATGTGACACAATTGCCTGGCAATGAAAACATTATTAAAGATTTTCTATTTCACACCTTCAAAGAAGAAGGAAGTGTAGTTGTTGGTGGTTATTACCCTACAGAGGTGTGGTATAACTGCTCCAGAAGCGCAACAACCACCGCTTACAAGGATTTTAGTAATATACATGCATTCTATTTTGATATGGAAGCCATGGAGAATAGTACTGGCAATGCACGAGGTAAACCTTTACTAGTACATGTTCATGGTGATCCTGTTAGTATCATCATATATATATCGGCTTATAGAGATGATGTGCAAGGAAGGCCTCTTTTAAAACATGGTTTGTTGTGTATAACTAAAAATGAAATCATTGACTATAACACGTTTACCAGCGCACAGTGGAGTGCCATATGTTTGGGTGATGACAGAAAAATACCATTCTCTGTCATACCCCCAGATAATGGTACAAAAATATTTGGTCTTGAGTGGAATGATGACTATGTTACAGCCTATATTAGTGATCGTTCTCACCATTTGAACATCAATAATAATTGGTTTAACAATGTGACAATCCTATACTCTCGATCAAGCACTGCTACGTGGCAGAAGAGTGCTGCATATGTTTATCAAGGTGTTTCAAATTTTACTTATTACAAGTTAAATAACACCAATGGCTTGAAAAGCTATGAATTGTGTGAAGATTATGAATACTGCACTGGCTATGCTACCAACGTATTTGCCCCGACAGTGGGCGGTTATATACCTGATGGCTTCAGTTTTAACAATTGGTTTATGCTTACAAACAGTTCCACGTTTGTTAGTGGCAGATTTGTAACAAATCAACCATTATTGGTTAATTGTTTGTGGCCAGTGCCCAGTTTTGGTGTCGCAGCACAACAATTTTGTTTTGAAGGTGCGCAGTTTAGCCAATGTAATGGTGTGTCTTTAAACAATACAGTGGATGTCATTAGATTCAACCTTAATTTTACCACAGATGTACAATCTGGCATGGGTGCTACAGTATTTTCACTGAATGCAACAGGTGGTGTCATTCTTGAGATTTCTTGTTATAATGATACAGTGAGTGAGTCAAGTTTCTACAGTTATGGTGAAATTTCATTCGGCGTAACTGATGGACCGCGTTACTGTTTCGCACTCTATAATGGCACGGCTCTTAAGTATTTAGGAACATTACCACCTAGTGTCAAGGAAATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCATTTTTATATTAATGGTTACAATTTCTTTAGCACTTTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAATTTAACCACTGGTGATAGTGGAGCATTTTGGACAATTGCTTACACATCGTACACTGACGCATTAGTACAAGTTGAAAACACAGCTATTAAAAAGGTGACGTATTGTAACAGTCACATTAATAACATTAAATGTTCTCAACTTACTGCTAATTTGCAAAATGGATTTTATCCTGTTGCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCTAGTTTCTATTCACATACCAGTGTTAATATAACTATTGATCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCCTCAACATTAAGTAACATCACACTACCAATGCAGGATAATAACACCGATGTGTACTGCATTCGTTCTAACCGATTTTCAGTTTACTTTCATTCCACTTGTAAAAGTTCTTTATGGGACGATGTGTTTAATTCCGACTGCACAGATGTTTTATATGCTACAGCTGTTATAAAAACTGGTACTTGTCCTTTCTCGTTTGATAAATTGAACAATTACTTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTGTCATTGAATCCTGTTGGTGCCAACTGCAAGTTTGATGTTGCCGCTCGTACAAGAACCAATGAGCAGGTTGTTAGAAGTTTATATGTAATATATGAAGAAGGAGACAACATAGTGGGTGTGCCGTCTGACAATAGTGGTCTTCACGACTTGTCAGTGCTACACTTAGACTCCTGTACAGATTATAATATATATGGTATAACTGGTGTTGGTATTATTAGACAAACTAACAGTACGCTACTTAGTGGCTTATATTACACATCACTATCAGGTGACTTGTTAGGGTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTCATCTATTCTGTCACGCCATGTGATGTAAGCGCACATGCTGCTGTTATTGATGGCGCCATAGTTGGAGCTATGACTTCCATTAATAGTGAACTGTTAGGTCTAACACATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTATTATTCTATATATAATTATACCAATGAAAGGACTCGTGGCACAGCAATTGATAGTAACGATGTTGATTGTGAACCTATCATAACCTATTCTAATATAGGTGTTTGTAAAAATGGAGCTTTGGTTTTTATTAACGTCACACATTCTGATGGAGACGTTCAACCAATTAGCACCGGTAATGTCACGATACCTACAAATTTTACCATATCTGTGCAAGTTGAATACATTCAGGTTTACACTACACCGGTTTCAATAGATTGTTCAAGGTACGTTTGCAATGGTAACCCTAGATGCAATAAATTGTTAACGCAATACGTTTCTGCATGTCAAACTATTGAGCAAGCACTTGCAATGGGTGCCAGACTTGAAAACATGGAGATTGATTCCATGTTGTTTGTTTCGGAAAATGCCCTTAAATTGGCATCTGTTGAAGCATTCAATAGTACGGAAACTTTAGATCCTATTTACAAAGAATGGCCTAACATTGGTGGTTCTTGGCTAGGAGGTTTAAAAGACATATTGCCATCTCACAACAGCAAACGTAAGTACCGGTCGGCTATAGAAGATTTGCTTTTTGATAAGGTTGTAACATCTGGCTTAGGTACAGTTGATGAAGATTATAAACGTTGTACAGGTGGTTATGACATAGCTGACTTAGTGTGTGCACAATATTACAATGGCATCATGGTGCTACCTGGTGTAGCTAATGATGACAAGATGGCTATGTACACTGCATCTCTTGCAGGTGGTATAACATTAGGTTCACTTGGTGGTGGCGCAGTGTCTATACCTTTTGCAATAGCAGTTCAAGCCAGACTTAATTATGTTGCTCTACAAACTGATGTATTGAACAAGAACCAGCAGATCCTGGCTAATGCTTTCAATCAAGCTATTGGTAACATTACACAGGCATTTGGTAAGGTTAATGATGCTATACATCAAACGTCACAAGGTCTTGCTACTGTTGCTAAAGTATTGGCAAAAGTGCAAGATGTTGTTAACACACAAGGGCAAGCTTTAAGCCACCTAACAGTACAATTGCAAAATAATTTCCAAGCCATTAGTAGTTCCATTAGTGACATTTATAACAGGCTTGATGAATTGAGTGCTGATGCACAAGTTGACAGGCTGATTACAGGAAGACTTACAGCACTTAATGCATTTGTGTCTCAGACTTTAACCAGACAAGCAGAGGTTAGGGCTAGCAGACAGCTTGCTAAAGACAAGGTAAATGAATGCGTTAGGTCTCAATCTCAGAGATTTGGATTCTGTGGTAATGGTACACATTTGTTTTCACTTGCAAATGCAGCACCAAATGGCATGATCTTCTTTCACACAGTGCTATTACCAACAGCTTATGAAACCGTGACAGCCTGGTCAGGTATTTGTGCATCAGATGGCGATCGTACTTTTGGACTTGTTGTTAAGGATGTCCAGTTGACGCTGTTTCGCAATCTAGATGACAAATTCTATTTGACTCCCAGAACTATGTATCAGCCTAGAGTTGCAACTAGTTCTGATTTTGTTCAAATTGAAGGATGTGATGTGTTGTTTGTTAATGCAACTGTAATTGACTTGCCTAGTATTATACCTGACTATATTGATATTAATCAAACTGTTCAGGACATATTAGAAAATTTCAGACCAAATTGGACTGTACCTGAGTTGCCACTTGACATTTTCAATGCAACCTACTTAAACCTGACTGGTGAAATTAATGACTTAGAATTTAGGTCAGAAAAGTTACATAACACCACAGTAGAACTTGCTATTCTCATTGATAATATTAATAACACATTAGTCAATCTTGAATGGCTCAATAGAATTGAAACTTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTGTGGCTACTAATTGGATTAGTAGTAATATTCTGCATACCCATATTGCTATTTTGTTGTTGTAGTACTGGTTGTTGTGGATGTATTGGGTGTTTAGGAAGTTGTTGTCATTCCATATGTAGTAGAAGGCAATTTGAAAGTTATGAACCAACCGAAAAAGTGCATGTTCACTGA