Protein Id: AAR11077.1 |
Length: 1453 aa |
Description: spike protein Canine coronavirus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 5-Nov-03 |
Source: Canine coronavirus |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Canine coronavirus |
Host: giant panda |
Authors: Qiao;J.; Meng;Q. and Xia;X. |
Title: Cloning and sequence analysis of canine coronavirus giant panda strain S protein gene |
Journal: Unpublished |
Taxonomy: Canine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
db_xref: """taxon:11153, CDD:279880, CDD:279881""" |
Sequence: MIVLTLCLLLFSYNSVICTSNNDCVQVNVTQLPGNENIIKDFLFHTFKEEGSVVVGGYYPTEVWYNCSRSATTTAYKDFSNIHAFYFDMEAMENSTGNARGKPLLVHVHGDPVSIIIYISAYRDDVQGRPLLKHGLLCITKNEIIDYNTFTSAQWSAICLGDDRKIPFSVIPPDNGTKIFGLEWNDDYVTAYISDRSHHLNINNNWFNNVTILYSRSSTATWQKSAAYVYQGVSNFTYYKLNNTNGLKSYELCEDYEYCTGYATNVFAPTVGGYIPDGFSFNNWFMLTNSSTFVSGRFVTNQPLLVNCLWPVPSFGVAAQQFCFEGAQFSQCNGVSLNNTVDVIRFNLNFTTDVQSGMGATVFSLNATGGVILEISCYNDTVSESSFYSYGEISFGVTDGPRYCFALYNGTALKYLGTLPPSVKEIAISKWGHFYINGYNFFSTFPIDCISFNLTTGDSGAFWTIAYTSYTDALVQVENTAIKKVTYCNSHINNIKCSQLTANLQNGFYPVASSEVGLVNKSVVLLPSFYSHTSVNITIDLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNNTDVYCIRSNRFSVYFHSTCKSSLWDDVFNSDCTDVLYATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCLSLNPVGANCKFDVAARTRTNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGITGVGIIRQTNSTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVSDGVIYSVTPCDVSAHAAVIDGAIVGAMTSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNERTRGTAIDSNDVDCEPIITYSNIGVCKNGALVFINVTHSDGDVQPISTGNVTIPTNFTISVQVEYIQVYTTPVSIDCSRYVCNGNPRCNKLLTQYVSACQTIEQALAMGARLENMEIDSMLFVSENALKLASVEAFNSTETLDPIYKEWPNIGGSWLGGLKDILPSHNSKRKYRSAIEDLLFDKVVTSGLGTVDEDYKRCTGGYDIADLVCAQYYNGIMVLPGVANDDKMAMYTASLAGGITLGSLGGGAVSIPFAIAVQARLNYVALQTDVLNKNQQILANAFNQAIGNITQAFGKVNDAIHQTSQGLATVAKVLAKVQDVVNTQGQALSHLTVQLQNNFQAISSSISDIYNRLDELSADAQVDRLITGRLTALNAFVSQTLTRQAEVRASRQLAKDKVNECVRSQSQRFGFCGNGTHLFSLANAAPNGMIFFHTVLLPTAYETVTAWSGICASDGDRTFGLVVKDVQLTLFRNLDDKFYLTPRTMYQPRVATSSDFVQIEGCDVLFVNATVIDLPSIIPDYIDINQTVQDILENFRPNWTVPELPLDIFNATYLNLTGEINDLEFRSEKLHNTTVELAILIDNINNTLVNLEWLNRIETYVKWPWYVWLLIGLVVIFCIPILLFCCCSTGCCGCIGCLGSCCHSICSRRQFESYEPTEKVHVH |
Nucleotide
Nucleotide_Id: AY436637.1 |
Length: 4362bp |
Description: Canine coronavirus spike protein (S) mRNA; complete cds |
Source: Canine coronavirus |
Nucleotide_type: mRNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 5-Nov-03 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Canine coronavirus |
CDS: AY436637.1:1..4362 |
Host: giant panda |
Authors: Qiao;J.; Meng;Q. and Xia;X. |
Journal: Unpublished |
Title: Cloning and sequence analysis of canine coronavirus giant panda strain S protein gene |
db_xref: taxon:11153 |
Taxonomy: Canine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='CDS') |
Sequence: ATGATTGTGCTTACATTGTGCCTCCTCTTGTTTTCGTACAATAGTGTGATTTGTACATCAAACAATGACTGTGTACAAGTTAATGTGACACAATTGCCTGGCAATGAAAACATTATTAAAGATTTTCTATTTCACACCTTCAAAGAAGAAGGAAGTGTAGTTGTTGGTGGTTATTACCCTACAGAGGTGTGGTATAACTGCTCCAGAAGCGCAACAACCACCGCTTACAAGGATTTTAGTAATATACATGCATTCTATTTTGATATGGAAGCCATGGAGAATAGTACTGGCAATGCACGAGGTAAACCTTTACTAGTACATGTTCATGGTGATCCTGTTAGTATCATCATATATATATCGGCTTATAGAGATGATGTGCAAGGAAGGCCTCTTTTAAAACATGGTTTGTTGTGTATAACTAAAAATGAAATCATTGACTATAACACGTTTACCAGCGCACAGTGGAGTGCCATATGTTTGGGTGATGACAGAAAAATACCATTCTCTGTCATACCCCCAGATAATGGTACAAAAATATTTGGTCTTGAGTGGAATGATGACTATGTTACAGCCTATATTAGTGATCGTTCTCACCATTTGAACATCAATAATAATTGGTTTAACAATGTGACAATCCTATACTCTCGATCAAGCACTGCTACGTGGCAGAAGAGTGCTGCATATGTTTATCAAGGTGTTTCAAATTTTACTTATTACAAGTTAAATAACACCAATGGCTTGAAAAGCTATGAATTGTGTGAAGATTATGAATACTGCACTGGCTATGCTACCAACGTATTTGCCCCGACAGTGGGCGGTTATATACCTGATGGCTTCAGTTTTAACAATTGGTTTATGCTTACAAACAGTTCCACGTTTGTTAGTGGCAGATTTGTAACAAATCAACCATTATTGGTTAATTGTTTGTGGCCAGTGCCCAGTTTTGGTGTCGCAGCACAACAATTTTGTTTTGAAGGTGCGCAGTTTAGCCAATGTAATGGTGTGTCTTTAAACAATACAGTGGATGTCATTAGATTCAACCTTAATTTTACCACAGATGTACAATCTGGCATGGGTGCTACAGTATTTTCACTGAATGCAACAGGTGGTGTCATTCTTGAGATTTCTTGTTATAATGATACAGTGAGTGAGTCAAGTTTCTACAGTTATGGTGAAATTTCATTCGGCGTAACTGATGGACCGCGTTACTGTTTCGCACTCTATAATGGCACGGCTCTTAAGTATTTAGGAACATTACCACCTAGTGTCAAGGAAATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCATTTTTATATTAATGGTTACAATTTCTTTAGCACTTTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAATTTAACCACTGGTGATAGTGGAGCATTTTGGACAATTGCTTACACATCGTACACTGACGCATTAGTACAAGTTGAAAACACAGCTATTAAAAAGGTGACGTATTGTAACAGTCACATTAATAACATTAAATGTTCTCAACTTACTGCTAATTTGCAAAATGGATTTTATCCTGTTGCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCTAGTTTCTATTCACATACCAGTGTTAATATAACTATTGATCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCCTCAACATTAAGTAACATCACACTACCAATGCAGGATAATAACACCGATGTGTACTGCATTCGTTCTAACCGATTTTCAGTTTACTTTCATTCCACTTGTAAAAGTTCTTTATGGGACGATGTGTTTAATTCCGACTGCACAGATGTTTTATATGCTACAGCTGTTATAAAAACTGGTACTTGTCCTTTCTCGTTTGATAAATTGAACAATTACTTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTGTCATTGAATCCTGTTGGTGCCAACTGCAAGTTTGATGTTGCCGCTCGTACAAGAACCAATGAGCAGGTTGTTAGAAGTTTATATGTAATATATGAAGAAGGAGACAACATAGTGGGTGTGCCGTCTGACAATAGTGGTCTTCACGACTTGTCAGTGCTACACTTAGACTCCTGTACAGATTATAATATATATGGTATAACTGGTGTTGGTATTATTAGACAAACTAACAGTACGCTACTTAGTGGCTTATATTACACATCACTATCAGGTGACTTGTTAGGGTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTCATCTATTCTGTCACGCCATGTGATGTAAGCGCACATGCTGCTGTTATTGATGGCGCCATAGTTGGAGCTATGACTTCCATTAATAGTGAACTGTTAGGTCTAACACATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTATTATTCTATATATAATTATACCAATGAAAGGACTCGTGGCACAGCAATTGATAGTAACGATGTTGATTGTGAACCTATCATAACCTATTCTAATATAGGTGTTTGTAAAAATGGAGCTTTGGTTTTTATTAACGTCACACATTCTGATGGAGACGTTCAACCAATTAGCACCGGTAATGTCACGATACCTACAAATTTTACCATATCTGTGCAAGTTGAATACATTCAGGTTTACACTACACCGGTTTCAATAGATTGTTCAAGGTACGTTTGCAATGGTAACCCTAGATGCAATAAATTGTTAACGCAATACGTTTCTGCATGTCAAACTATTGAGCAAGCACTTGCAATGGGTGCCAGACTTGAAAACATGGAGATTGATTCCATGTTGTTTGTTTCGGAAAATGCCCTTAAATTGGCATCTGTTGAAGCATTCAATAGTACGGAAACTTTAGATCCTATTTACAAAGAATGGCCTAACATTGGTGGTTCTTGGCTAGGAGGTTTAAAAGACATATTGCCATCTCACAACAGCAAACGTAAGTACCGGTCGGCTATAGAAGATTTGCTTTTTGATAAGGTTGTAACATCTGGCTTAGGTACAGTTGATGAAGATTATAAACGTTGTACAGGTGGTTATGACATAGCTGACTTAGTGTGTGCACAATATTACAATGGCATCATGGTGCTACCTGGTGTAGCTAATGATGACAAGATGGCTATGTACACTGCATCTCTTGCAGGTGGTATAACATTAGGTTCACTTGGTGGTGGCGCAGTGTCTATACCTTTTGCAATAGCAGTTCAAGCCAGACTTAATTATGTTGCTCTACAAACTGATGTATTGAACAAGAACCAGCAGATCCTGGCTAATGCTTTCAATCAAGCTATTGGTAACATTACACAGGCATTTGGTAAGGTTAATGATGCTATACATCAAACGTCACAAGGTCTTGCTACTGTTGCTAAAGTATTGGCAAAAGTGCAAGATGTTGTTAACACACAAGGGCAAGCTTTAAGCCACCTAACAGTACAATTGCAAAATAATTTCCAAGCCATTAGTAGTTCCATTAGTGACATTTATAACAGGCTTGATGAATTGAGTGCTGATGCACAAGTTGACAGGCTGATTACAGGAAGACTTACAGCACTTAATGCATTTGTGTCTCAGACTTTAACCAGACAAGCAGAGGTTAGGGCTAGCAGACAGCTTGCTAAAGACAAGGTAAATGAATGCGTTAGGTCTCAATCTCAGAGATTTGGATTCTGTGGTAATGGTACACATTTGTTTTCACTTGCAAATGCAGCACCAAATGGCATGATCTTCTTTCACACAGTGCTATTACCAACAGCTTATGAAACCGTGACAGCCTGGTCAGGTATTTGTGCATCAGATGGCGATCGTACTTTTGGACTTGTTGTTAAGGATGTCCAGTTGACGCTGTTTCGCAATCTAGATGACAAATTCTATTTGACTCCCAGAACTATGTATCAGCCTAGAGTTGCAACTAGTTCTGATTTTGTTCAAATTGAAGGATGTGATGTGTTGTTTGTTAATGCAACTGTAATTGACTTGCCTAGTATTATACCTGACTATATTGATATTAATCAAACTGTTCAGGACATATTAGAAAATTTCAGACCAAATTGGACTGTACCTGAGTTGCCACTTGACATTTTCAATGCAACCTACTTAAACCTGACTGGTGAAATTAATGACTTAGAATTTAGGTCAGAAAAGTTACATAACACCACAGTAGAACTTGCTATTCTCATTGATAATATTAATAACACATTAGTCAATCTTGAATGGCTCAATAGAATTGAAACTTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTGTGGCTACTAATTGGATTAGTAGTAATATTCTGCATACCCATATTGCTATTTTGTTGTTGTAGTACTGGTTGTTGTGGATGTATTGGGTGTTTAGGAAGTTGTTGTCATTCCATATGTAGTAGAAGGCAATTTGAAAGTTATGAACCAACCGAAAAAGTGCATGTTCACTGA |