| Protein Id: AAV65515.1 |
Length: 1453 aa |
| Description: spike protein Canine coronavirus 1-71. |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 6-May-08 |
| Source: Canine coronavirus 1-71 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Canine coronavirus |
| Host: -- |
Authors: Ma;G.; Wang;Y. and Lu;C. |
| Title: Molecular characterization of the 9.36 kb C-terminal region of canine coronavirus 1-71 strain |
Journal: Virus Genes 36 (3); 491-497 (2008) |
| Taxonomy: Canine coronavirus 1-71 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
| db_xref: """taxon:301047, CDD:279880, CDD:279881""" |
| Sequence: MIVLTLCLLLFSYNSVICTSNNDCVQVNVTQLPGNENIIKDFLLHTFKEEGSVVVGGYYPTEVWYNCSRSATTTAYKDFSNIHAFYFDMEAMENSTGNARGKPLLVHVHGDPVSIIIYISAYRDDVQGRPLLKHGLLCITKNKIIDYNTFTSAQWSAICLGDDRKIPFSVIPTDNGTKIFGLEWNDDYVTAYISDRSHHLNINNNWFNNVTILYSRSSTATWQKSAAYVYQGVSNFTYYKLNNTNGLKSYELCEDYEYCTGYATNVFAPTVGGYIPDGFSFNNWFMLTNSSTFVSGRFVTNQPLLVNCLWPVPSFGVAAQEFCFEGAQFSQCNGVSLNNTVDVIRFNLNFTTDVQSGMGATVFSLNTTGGVILEISCYNDTVSESSFYSYGEISFGVTDGPRYCYALYNGTALKYLGTLPPSVKEIAISKWGHFYINGYNFFSTFPIDCISFNLTTGDSGAFWTIAYTSYTDALVQVENTAIKKVTYCNSHINNIKCSQLTANLQNGFYPVASSEVGLVNESVVLLPSFYSHTSVNITIDLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNNTDVYCIRSNHFSVYVHSTCKSSLWDDVFNSDCTDVLYATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCLSLNPVGANCKFDVAARTRTNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGRTGVGIIRQTNSTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVSDGVIYSVTPCDVSAQAAVIDGAIVGAMTSINSELLDLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNERTRGTAIDSNDVDCEPIITYSNIGVCKNGALVFINVTHSDGDVQPISTGNVTIPTNFTISVQVEYIQVYTTPVSIDCSRYVCNGNPRCNKLLTQYVSACQTIEQALAMGARLENMEIDSMLFVSENALKLASVEAFNSTETLDPIYKEWPNIGGSWLGGLKDILPSHNSKRKYRSAIEDLLFDKVVTSGLGTVDEDYKRCTGGYDIADLVCAQYYNGIMVLPGVANDDKMAMYTASLAGGITLGALGGGAVSIPFAIAVQARLNYVALQTDVLNKNQQILANAFNQAIGNITQAFGKVNDAIHQTSQGLATVAKALAKVQDVVNTQGQALSHLTVQLQNNFQAISSSISDIYSRLDELSADAQVDRLITGRLTALNAFVSQTLTRQAEVRASRQLAKDKVNECVRSQSQRFGFCGNGTHLFSLANAAPNGMIFFHTVLLPTAYETVTAWSGICASDGDRTFGLVVKDVQLTLFRNLDDKFYLTPRTMYQPRVATSSDFVQIEGCDVLFVNATVIDLPSIIPDYIDINQTVQDILENFRPNWTVPELPLDIFNATYLNLTGEINDLEFRSEKLHNTTVELAILIDNINNTLVNLEWLNRIETYVKWPWYVWLLIGLVVIFCIPILLFCCCSTGCCGCIGCLGSCCHSICSRRQFESYEPIEKVHVH |
Nucleotide
| Nucleotide_Id: AY796289.1 |
Length: 4362bp |
| Description: Canine coronavirus 1-71 spike protein (S) mRNA; complete cds |
Source: Canine coronavirus 1-71 |
| Nucleotide_type: mRNA |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 6-May-08 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Canine coronavirus |
| CDS: AY796289.1:1..4362 |
Host: -- |
| Authors: Ma;G.; Wang;Y. and Lu;C. |
Journal: Virus Genes 36 (3); 491-497 (2008) |
| Title: Molecular characterization of the 9.36 kb C-terminal region of canine coronavirus 1-71 strain |
db_xref: taxon:301047 |
| Taxonomy: Canine coronavirus 1-71 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
| Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='CDS') |
| Sequence: ATGATTGTGCTTACATTGTGCCTCCTCTTGTTTTCGTACAATAGTGTGATTTGTACATCAAACAATGACTGTGTACAAGTTAATGTGACACAATTGCCTGGCAATGAAAACATTATTAAAGATTTTCTACTTCACACCTTCAAAGAAGAAGGAAGTGTAGTTGTTGGTGGTTATTACCCTACAGAGGTGTGGTATAACTGCTCCAGAAGCGCAACAACCACCGCTTACAAGGATTTTAGTAATATACATGCATTCTATTTTGATATGGAAGCCATGGAGAATAGTACTGGCAATGCACGAGGTAAACCTTTACTAGTACATGTTCATGGTGATCCTGTTAGTATCATCATATATATATCGGCTTATAGAGATGATGTGCAAGGAAGGCCTCTTTTAAAACATGGTTTGTTGTGTATAACTAAAAATAAAATCATTGACTATAACACGTTTACCAGCGCACAGTGGAGTGCCATATGTTTGGGTGATGACAGAAAAATACCATTCTCTGTCATACCCACAGATAATGGTACAAAAATATTTGGTCTTGAGTGGAATGATGACTATGTTACAGCCTATATTAGTGATCGTTCTCACCATTTGAACATCAATAATAATTGGTTTAACAATGTGACAATCCTATACTCTCGATCAAGCACTGCTACGTGGCAGAAGAGTGCTGCATATGTTTATCAAGGTGTTTCAAATTTTACTTATTACAAGTTAAATAACACCAATGGCTTGAAAAGCTATGAATTGTGTGAAGATTATGAATACTGCACTGGCTATGCTACCAACGTATTTGCCCCGACAGTGGGCGGTTATATACCTGATGGCTTCAGTTTTAACAATTGGTTTATGCTTACAAACAGTTCCACGTTTGTTAGTGGCAGATTTGTAACAAATCAACCATTATTGGTTAATTGTTTGTGGCCAGTGCCCAGTTTTGGTGTCGCAGCACAAGAATTTTGTTTTGAAGGTGCGCAGTTTAGCCAATGTAATGGTGTGTCTTTAAACAATACAGTGGATGTCATTAGATTCAACCTTAATTTTACCACAGATGTACAATCTGGCATGGGTGCTACAGTATTTTCACTGAATACAACAGGTGGTGTCATTCTTGAGATTTCTTGTTATAATGATACAGTGAGTGAGTCAAGTTTCTACAGTTATGGTGAAATTTCATTCGGCGTAACTGATGGACCGCGTTACTGTTACGCACTCTATAATGGCACGGCTCTTAAGTATTTAGGAACATTACCACCTAGTGTCAAGGAAATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCATTTTTATATTAATGGTTACAATTTCTTTAGCACTTTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAATTTAACCACTGGTGATAGTGGAGCATTTTGGACAATTGCTTACACATCGTACACTGACGCATTAGTACAAGTTGAAAACACAGCTATTAAAAAGGTGACGTATTGTAACAGTCACATTAATAACATTAAATGTTCTCAACTTACTGCTAATTTGCAAAATGGATTTTATCCTGTTGCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATGAGAGTGTTGTGTTACTACCTAGTTTCTATTCACATACCAGTGTTAATATAACTATTGATCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCCTCAACATTAAGTAACATCACACTACCAATGCAGGATAATAACACCGATGTGTACTGCATTCGTTCTAACCATTTTTCAGTTTACGTTCATTCCACTTGTAAAAGTTCTTTATGGGACGATGTGTTTAATTCCGACTGCACAGATGTTTTATATGCTACAGCTGTTATAAAAACTGGTACTTGTCCTTTCTCGTTTGATAAATTGAACAATTACTTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTGTCATTGAATCCTGTTGGTGCCAACTGCAAGTTTGATGTTGCCGCTCGTACAAGAACCAATGAGCAGGTTGTTAGAAGTTTATATGTAATATATGAAGAAGGAGACAACATAGTGGGTGTGCCGTCTGACAATAGTGGTCTTCACGACTTGTCAGTGCTACACTTAGACTCCTGTACAGATTATAATATATATGGTAGAACTGGTGTTGGTATTATTAGACAAACTAACAGTACGCTACTTAGTGGCTTATATTACACATCACTATCAGGTGACTTGTTAGGGTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTCATCTATTCTGTCACGCCATGTGATGTAAGCGCACAAGCTGCTGTTATTGATGGCGCCATAGTTGGAGCTATGACTTCCATTAATAGTGAACTGTTAGATCTAACACATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTATTATTCTATATATAATTATACCAATGAAAGGACTCGTGGCACAGCAATTGATAGTAACGATGTTGATTGTGAACCTATCATAACCTATTCTAATATAGGTGTTTGTAAAAATGGAGCTTTGGTTTTTATTAACGTCACACATTCTGATGGAGACGTTCAACCAATTAGCACCGGTAATGTCACGATACCTACAAATTTTACCATATCTGTGCAAGTTGAATACATTCAGGTTTACACTACACCGGTGTCAATAGATTGTTCAAGGTACGTTTGCAATGGTAACCCTAGATGCAATAAATTGTTAACGCAATACGTTTCTGCATGTCAAACTATTGAGCAAGCACTTGCAATGGGTGCCAGACTTGAAAACATGGAGATTGATTCCATGTTGTTTGTTTCGGAAAATGCCCTTAAATTGGCATCTGTTGAAGCATTCAATAGTACGGAAACTTTAGATCCTATTTACAAAGAATGGCCTAACATTGGTGGTTCTTGGCTAGGAGGTTTAAAAGACATATTGCCATCTCACAACAGCAAACGTAAGTACCGGTCGGCTATAGAAGATTTGCTTTTTGATAAGGTTGTAACATCTGGCTTAGGTACAGTTGATGAAGATTATAAACGTTGTACAGGTGGTTATGACATAGCTGACTTAGTGTGTGCACAATATTACAATGGCATCATGGTGCTACCTGGTGTAGCTAATGATGACAAGATGGCTATGTACACTGCATCTCTTGCAGGTGGTATAACATTAGGTGCACTTGGTGGTGGCGCAGTGTCTATACCTTTTGCAATAGCAGTTCAAGCCAGACTTAATTATGTTGCTCTACAAACTGATGTATTGAACAAGAACCAGCAGATCCTGGCTAATGCTTTCAATCAAGCTATTGGTAACATTACACAGGCATTTGGTAAGGTTAATGATGCTATACATCAAACGTCACAAGGTCTTGCTACTGTTGCTAAAGCATTGGCAAAAGTGCAAGATGTTGTTAACACACAAGGGCAAGCTTTAAGCCACCTAACAGTACAATTGCAAAATAATTTCCAAGCCATTAGTAGTTCCATTAGTGACATTTATAGCAGGCTTGATGAATTGAGTGCTGATGCACAAGTTGACAGGCTGATTACAGGAAGACTTACAGCACTTAATGCATTTGTGTCTCAGACTTTAACCAGACAAGCAGAGGTTAGGGCTAGCAGACAGCTTGCTAAAGACAAGGTAAATGAATGCGTTAGGTCTCAATCTCAGAGATTTGGATTCTGTGGTAATGGTACACATTTATTTTCACTTGCAAATGCAGCACCAAATGGCATGATCTTCTTTCACACAGTGCTATTACCAACAGCTTATGAAACCGTGACAGCCTGGTCAGGTATTTGTGCATCAGATGGCGATCGTACTTTTGGACTTGTTGTTAAGGATGTCCAGTTGACGCTGTTTCGCAATCTAGATGACAAATTCTATTTGACTCCCAGAACTATGTATCAGCCTAGAGTTGCAACTAGTTCTGATTTTGTTCAAATTGAAGGATGTGATGTGTTGTTTGTTAATGCAACTGTAATTGACTTGCCTAGTATTATACCTGACTATATTGATATTAATCAAACTGTTCAGGACATATTAGAAAATTTCAGACCAAATTGGACTGTACCTGAGTTGCCACTTGACATTTTCAATGCAACCTACTTAAACCTGACTGGTGAAATTAATGACTTAGAATTTAGGTCAGAAAAGTTACATAACACCACAGTAGAACTTGCTATTCTCATTGATAATATTAATAACACATTAGTCAATCTTGAATGGCTCAACAGAATTGAAACTTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTGTGGCTACTAATTGGATTAGTAGTAATATTCTGCATACCCATATTGCTATTTTGTTGTTGTAGTACTGGTTGTTGTGGATGTATTGGGTGTTTAGGAAGCTGTTGTCATTCCATATGTAGTAGAAGGCAATTTGAAAGTTATGAACCAATTGAAAAAGTGCATGTTCACTGA |