Protein Id: AKA65829.1 |
Length: 1454 aa |
Description: spike protein Canine coronavirus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 28-May-15 |
Source: Canine coronavirus |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Canine coronavirus |
Host: Canis lupus familiaris (domestic dog) |
Authors: Decaro;N.; Mari;V.; Dowgier;G.; Elia;G.; Lanave;G.; Colaianni;M.L. and Buonavoglia;C. |
Title: Full-genome sequence of pantropic canine coronavirus |
Journal: Genome Announc 3 (3) (2015) |
Taxonomy: Canine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
db_xref: """taxon:11153, CDD:279880, CDD:279881, CDD:223910""" |
Sequence: MIVILTCVLLLCSYHTVASTTNNDCRQVNVTQLDGNENLIRDFLFQNFKEEGTVVVGGYYPTEVWYNCSRTAPTTAYEYFNNIHAFYFDMEAMENSTGNARGKPLLFHVHGEPVSAIIYISAYRNDVQHRPLLKHGLVCITKTRNIDYNSFTSRQWNSICTGNDRKIPFSVIPTDNGTKIYGLEWNDEFVTAYISGHSYNWNINNNWFNNVTLLYSRSSTATWQHSAAYVYQGVSNFTYYKLNNTNGLKTYEFCDDYEYCTGYATNVFAPTVGGYIPDGFSFNNWFLLTNGSTFVSGRFVTNQPLLVNCLWPVPSFGVAAQEFCFEGAQFSQCNGVSLNNTVDVIRFNLNFTADVQSGMGATVFSLNTTGGVILEISCYNDTVSESSFYSYGEIPFGITDGPRYCYALYNGTALKYLGTLPPSVKEIAISKWGHFYINGYNFFSTFPIDCISFNLTTGTSGAFWTIAYTSYTEALVQVENTAIKKVTYCNSHINNIKCSQLTANLQNGFYPVASSEVGLVNKSVVLLPSFYSHTSVNITIDLGMKRSGYGQPIASALSNITLPMQDNNTDVYCIRSNQFSVYVHSTCKSSLWDNVFNSDCTDFLHATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCFSLNPVGANCKFDVAARTRTNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGRTGVGIIRQTNSTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVTDGVVYSVTPCDVSAQAAVIDGAIVGAMTSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNARTRGTAIDSNDVDCEPIITYSNIGVCKNGALVFINVTHSDGDVQPISTGNVTIPTNFTISVQVEYIQVYTTPVSIDCSRYVCNGNPRCNKLLTQYVSACQTIEQALAMGARLENMEVDSMLFVSENALKLASVEAFNSTETLDPIYKEWPNIGGSWLGGLKDILPSHNSKRKYRSAIEDLLFDKVVTSGLGTVDEDYKRCTGGYDIADLVCAQYYNGIMVLPGVANDDKMAMYTASLAGGITLGALGGGAVSIPFAVAVQARLNYVALQTDVLNKNQQILANAFNQAIGNITQAFGKVNDAIHQTSKGLATVAKALAKVQDVVNTQGQALSHLTVQLQNNFQAISSSISDIYNRLDELSADAQVDRLITGRLTALNAFVSQTLTRQAEVRASRQLAKDKVNECVRSQSQRFGFCGNGTHLFSLANAAPNGMIFFHTVLLPTAYETVTAWSGICASDGDRTFGLVVKDVQLTLFRNLDDKFYLTPRTMYQPRVATSSDFVQIEGCDVLFVNATVIELPSIIPDYIDINQTVQDILENYRPNWTVPELTLDIFNATYLNLTGEINDLEFRSEKLHNTTVELAVLIDNINNTLVNLEWLNRIETYVKWPWYVWLLIGLVVIFCIPLLLFCCCSTGCCGCIGCLGSCCHSICSRRQFENYEPIEKVHVH |
Nucleotide
Nucleotide_Id: KP981644.1 |
Length: 4365bp |
Description: Canine coronavirus strain CB/05; complete genome |
Source: Canine coronavirus |
Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 28-May-15 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Canine coronavirus |
CDS: KP981644.1:20355..24719 |
Host: Canis lupus familiaris (domestic dog) |
Authors: Decaro;N.; Mari;V.; Dowgier;G.; Elia;G.; Lanave;G.; Colaianni;M.L. and Buonavoglia;C. |
Journal: Genome Announc 3 (3) (2015) |
Title: Full-genome sequence of pantropic canine coronavirus |
db_xref: taxon:11153 |
Taxonomy: Canine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
Sequence: ATGATTGTGATCTTAACTTGCGTCTTATTGTTGTGCTCGTACCATACTGTTGCGAGTACGACAAATAATGATTGTAGACAAGTTAACGTAACACAATTAGATGGCAACGAAAATCTCATTAGAGACTTTTTGTTTCAAAACTTTAAAGAAGAAGGAACTGTAGTCGTTGGTGGCTATTATCCTACAGAGGTGTGGTACAACTGTTCTAGAACAGCACCTACCACTGCCTATGAGTATTTTAATAACATACATGCATTTTATTTTGATATGGAAGCCATGGAAAATAGCACTGGTAATGCACGTGGTAAACCGTTATTGTTTCATGTTCATGGTGAGCCTGTTAGTGCTATCATATATATATCGGCTTATAGAAATGATGTACAACACAGGCCACTTTTAAAACATGGGTTAGTGTGCATAACTAAAACTCGCAATATTGACTATAACAGCTTCACTAGCAGACAGTGGAATTCCATATGTACAGGTAATGACAGAAAAATTCCTTTCTCTGTCATACCCACGGACAATGGAACAAAAATCTATGGACTTGAGTGGAATGACGAATTTGTTACAGCCTATATTAGTGGTCATTCTTATAATTGGAACATCAATAATAATTGGTTTAACAATGTTACACTACTTTATTCCCGCTCAAGTACTGCTACATGGCAACACAGTGCTGCATATGTTTACCAAGGTGTTTCTAACTTCACTTATTACAAGTTAAATAACACCAATGGTTTAAAAACTTATGAATTTTGTGATGATTATGAATATTGCACTGGCTACGCTACTAATGTCTTTGCTCCCACTGTAGGAGGTTACATACCTGATGGATTTAGTTTTAACAATTGGTTTTTGCTTACAAATGGCTCCACTTTTGTTAGTGGCAGATTTGTAACAAATCAACCATTATTAGTTAATTGTTTATGGCCAGTGCCCAGTTTTGGTGTGGCAGCACAAGAATTTTGTTTTGAAGGTGCGCAGTTTAGTCAGTGCAATGGTGTGTCTTTAAATAACACAGTGGATGTTATTAGATTCAATCTTAATTTTACCGCAGATGTACAATCTGGCATGGGTGCTACAGTGTTCTCATTGAATACAACAGGTGGTGTCATTCTTGAAATTTCATGTTATAATGACACAGTGAGTGAGTCTAGTTTTTACAGTTATGGTGAAATTCCATTTGGCATAACTGATGGACCACGGTACTGTTATGCACTTTACAATGGCACAGCTCTTAAGTATTTAGGAACATTACCACCTAGTGTAAAGGAAATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCATTTTTATATTAATGGTTACAATTTCTTTAGCACATTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAATTTAACCACTGGTACTAGTGGAGCTTTTTGGACTATTGCTTACACATCGTACACTGAAGCATTAGTACAAGTTGAAAACACAGCTATTAAAAAGGTGACGTATTGTAACAGTCACATTAATAACATTAAATGTTCTCAACTTACTGCTAATTTGCAAAATGGTTTTTATCCTGTTGCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCTAGTTTCTATTCACATACCAGTGTTAATATAACTATTGATCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCTATAGCCTCAGCATTAAGTAACATCACACTACCGATGCAGGATAATAACACCGATGTGTATTGCATTCGTTCTAATCAATTTTCAGTTTACGTGCATTCCACTTGTAAAAGTTCTTTATGGGACAATGTGTTTAATTCTGACTGCACAGATTTTTTACATGCTACAGCTGTTATAAAAACTGGTACTTGTCCTTTCTCATTTGATAAATTGAACAATTACCTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTTTCATTGAATCCTGTTGGTGCCAATTGCAAATTTGATGTTGCTGCCCGTACAAGAACCAATGAGCAGGTTGTTAGAAGTTTATATGTGATATATGAAGAAGGAGACAATATAGTGGGTGTACCGTCTGATAATAGTGGTCTGCACGATTTGTCAGTGTTACACTTAGACTCCTGTACAGATTACAATATATATGGTAGAACTGGTGTTGGTATTATTAGACAAACTAACAGCACACTACTTAGTGGCTTATATTACACATCACTATCAGGTGATTTGTTAGGTTTTAAAAATGTCACTGACGGTGTTGTCTATTCTGTAACACCATGTGATGTAAGTGCACAAGCTGCTGTTATTGATGGTGCCATAGTTGGAGCTATGACTTCCATTAATAGTGAACTGTTAGGTCTAACTCATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTATTACTCCATATATAATTATACAAATGCGAGAACTCGTGGCACTGCAATCGACAGTAACGATGTTGATTGTGAACCTATCATAACCTATTCTAATATAGGTGTTTGTAAAAATGGAGCTTTGGTTTTTATTAACGTCACACATTCTGATGGTGACGTTCAACCAATTAGCACCGGTAATGTCACGATACCTACAAATTTTACTATATCTGTGCAAGTCGAATATATTCAGGTTTACACTACACCAGTGTCAATAGATTGTTCAAGATACGTCTGCAATGGTAATCCTAGATGCAATAAATTGTTAACACAATATGTCTCTGCATGTCAAACTATTGAGCAAGCACTTGCAATGGGTGCCAGACTTGAAAACATGGAAGTTGATTCCATGTTGTTTGTTTCTGAAAATGCCCTTAAATTGGCATCTGTTGAAGCATTCAATAGTACGGAAACTCTAGATCCTATTTACAAAGAATGGCCTAACATTGGTGGTTCTTGGCTAGGAGGTTTAAAAGACATATTGCCATCTCACAATAGCAAACGTAAGTACCGGTCTGCTATAGAAGATTTGCTTTTTGATAAGGTTGTGACATCTGGCTTAGGTACAGTCGATGAAGATTACAAACGTTGTACGGGTGGCTATGACATAGCTGACTTAGTGTGTGCACAATATTACAATGGCATCATGGTGTTACCTGGTGTGGCTAATGATGACAAGATGGCTATGTACACTGCATCTCTTGCAGGTGGTATAACATTAGGTGCACTTGGTGGTGGTGCAGTGTCTATACCTTTTGCAGTAGCAGTTCAGGCTAGACTTAATTATGTAGCTTTACAAACTGACGTATTGAACAAAAACCAGCAGATTCTGGCTAATGCTTTCAATCAAGCGATTGGTAACATTACACAGGCATTTGGTAAGGTTAATGATGCTATACATCAAACGTCAAAAGGTCTTGCTACTGTTGCTAAAGCATTGGCAAAAGTGCAAGATGTTGTTAACACACAAGGGCAAGCTTTAAGCCACCTAACAGTACAATTGCAAAATAATTTTCAAGCCATTAGTAGTTCCATTAGTGACATTTATAACAGGCTTGATGAGTTGAGTGCGGATGCACAAGTTGACAGGCTGATTACAGGACGACTTACAGCACTTAATGCATTTGTGTCTCAGACTTTAACCAGACAAGCAGAGGTTAGGGCTAGTAGACAACTTGCTAAAGACAAAGTTAATGAATGCGTTAGGTCTCAATCCCAAAGATTTGGATTCTGTGGTAATGGTACACATTTGTTTTCACTTGCAAATGCAGCACCAAATGGCATGATTTTCTTTCACACAGTGCTATTACCAACAGCTTATGAAACTGTGACGGCCTGGTCAGGTATTTGTGCATCAGATGGCGATCGCACTTTTGGACTTGTTGTTAAAGATGTCCAGCTGACGCTATTTCGCAATTTAGATGACAAATTCTATTTGACACCTAGAACTATGTATCAGCCTAGAGTTGCAACTAGTTCTGATTTTGTTCAAATTGAAGGGTGTGATGTCTTGTTTGTCAATGCAACTGTAATTGAGTTGCCTAGTATTATACCTGATTATATCGATATTAATCAGACTGTTCAAGACATATTAGAAAATTACAGACCAAATTGGACAGTACCTGAATTAACACTTGACATTTTCAACGCAACCTACTTAAACCTGACTGGTGAAATTAATGACTTAGAATTCAGGTCAGAAAAGCTACATAACACCACGGTAGAACTTGCTGTTCTCATTGACAATATTAACAATACATTAGTCAATCTTGAATGGCTCAATAGAATTGAAACTTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTACTAATAGGCTTAGTAGTAATATTTTGCATACCATTACTGCTATTTTGCTGTTGTAGTACAGGTTGCTGTGGGTGCATAGGTTGCTTAGGAAGTTGTTGTCACTCTATTTGTAGTAGAAGACAATTTGAAAATTATGAACCAATTGAGAAAGTGCATGTCCATTAA |