Protein

Protein Id:  BAA33439.1 Length:   1453 aa
Description:   Spike protein Canine coronavirus. Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   18-Jun-99
Source:   Canine coronavirus
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Canine coronavirus
Host:   -- Authors:   Kokubu;T.; Taharaguchi;S.; Katayama;S.; Hatano;M.; Takahasi;T.; Iwamoto;K.; Masubuchi;K.; Yamanaka;M.; Sasaki;O. and Inaba;Y.
Title:   Nucleotide sequence of the spike protein of a canine coronavirus; strain 5821 Journal:   J. Vet. Med. Sci. 51; 251-255 (1998)
Taxonomy:   Canine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus.
db_xref:   """taxon:11153, CDD:279880, CDD:279881"""
Sequence:   MIVLVTCILLLCSYHTASSTSNNDCRQVNVTQLDGNENLIRDFLFQNFKEEGTVVVGGYYPTEVWYNCSRTATTTAYEYFSNIHAFYFDMEAMENSTGNARGKPLLFHVHGEPVSVIIYISYRDDVQHRPLLKHGLVCITESRNIDYNSFTSSQWNSICTGNDRKIPFSVIPTDNGTKIYGLEWNDEFVTAYISGRSYNWNINNNWFNNVTLLYSRSSTATWQHSAAYVYQGVSNFTYYKLNNTNGLKTYELCEDYEYCTGYATNIFAPTVGGYIPDGFSFNNWFLLTNSSTFVSGRFVTNQPLLVNCLWPVPSFGVAAQEFCFEGAQFSQCNGVFLNNTVDVIRFNLNFTADVQSGMGATVFSLNTTGGCILEISCYNDIVSESSFYSYGEIPFGVTDGPRYCYVLYNGTALKYFGTLPPSVKEIAISKWGQFYINGYNFFSTFPIDCISFNLTTGDSGAFWTIAYTSYTEALVQVENTAIKKVTYCNSHINNIKCSQLTANLQNGFYPVASSEVGLVNKSVVLLPSFYSHTSVNITIDLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNNTDVYCIRSNQFSVYVHSTCKSSLWDNNFNQDCTDVLYATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKLCLSLNPTGANCKFDVAARTRTNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGRTGVGIIRQTNSTILSGLHYTSLSGDLLGFKNVSDGVVYSVTPCDVSAQAAVIDGAIVGAMTSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNTTNERTRGTAIDSNDVDCEPIITYSNIGVCKNGALVFINVTHSDGDVQPISTGNVTIPTNFTISVQVEYIQVYTTPVSIDCSRYVCNGNPRCNKLLTQYVSACQTIEQALAMSASLENMEVDSMLFVSENALKLASVEAFNSTEHLDPIYKEWPNIGGSWLGGLKDILPSHNSKRKYRSAIEDLLFDKVVTSGLGTVDEDYKRCTGGYDIADLVCAQYYNGIMVLPGVANDDKMTMYTASLAGGIALGALGGGAVAIPFAVAVQARLNYVALQTDVLNKNQQILANAFNQAIGNITQAFGKVNDAIHQTSQGLATVAKALAKVQDVVNTQGQALSHLTVQLQNSFQAISSSISDIYNRLDELSADAQVDRLITGRLTALNAFVSQTLTRQAEVRASRQLAKDKVNECVRSQSQRFGFCGNGTHLFSLANAAPNGMVFFHTVLLPTAYETVTAWSGICASDGDRTFGLVVKDVQLTLFRNLDDKFYLTPRTMYQPRAATSSDFVQIEGCDVLFVNATVIDLPSIIPDYIDINQTVQDILENYRPNWTVPELTIDIFNATYLNLTGEIDDLEFRSEKLHNTTVELAILIDNINNTLVNLEWLNRIETYVKWPWYVWLLIGLVVVFCIPLLLFCCCSTGCCGCIGCLGSCCHSICSRRQFENYEPIEKVHVH

Nucleotide

Nucleotide_Id:  AB017789.1 Length:   4362bp
Description:   Canine coronavirus gene for Spike protein; complete cds; strain:5821 Source:   Canine coronavirus
Nucleotide_type:   RNA Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   18-Jun-99
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Canine coronavirus
CDS:   AB017789.1:1..4362 Host:   --
Authors:   Kokubu;T.; Taharaguchi;S.; Katayama;S.; Hatano;M.; Takahasi;T.; Iwamoto;K.; Masubuchi;K.; Yamanaka;M.; Sasaki;O. and Inaba;Y. Journal:   J. Vet. Med. Sci. 51; 251-255 (1998)
Title:   Nucleotide sequence of the spike protein of a canine coronavirus; strain 5821 db_xref:   taxon:11153
Taxonomy:   Canine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus.
Features:   SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4363); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='CDS')
Sequence:   ATGATTGTGCTCGTAACTTGCATTTTATTGTTATGTTCATACCACACTGCTTCGAGTACGTCAAATAATGATTGTAGACAAGTTAACGTAACACAATTAGATGGCAATGAAAACCTCATTAGAGACTTTTTGTTTCAAAACTTTAAAGAAGAAGGAACTGTAGTTGTTGGTGGTTACTACCCTACAGAGGTTTGGTATAACTGTTCTAGAACAGCAACAACTACTGCCTATGAGTATTTCAGTAATATACACGCATTCTATTTTGATATGGAAGCCATGGAGAATAGTACTGGTAATGCACGTGGTAAACCTTTATTATTTCATGTTCATGGTGAGCCTGTTAGTGTCATCATATACATATCTTATAGAGATGATGTGCAACATAGGCCACTTTTAAAACACGGATTAGTGTGCATAACTGAAAGTCGCAACATTGACTATAACAGTTTCACCAGTAGCCAGTGGAATTCCATATGTACGGGTAATGACAGAAAAATTCCTTTCTCTGTCATACCCACGGACAATGGAACAAAAATTTATGGTCTTGAGTGGAATGATGAATTTGTTACAGCGTACATTAGTGGTCGTTCTTATAATTGGAACATCAATAATAATTGGTTTAACAATGTCACGCTTCTGTATAGTCGCTCAAGCACTGCCACATGGCAACACAGTGCTGCATACGTTTACCAAGGTGTTTCTAACTTCACTTATTACAAGTTAAATAACACCAATGGTCTAAAAACCTATGAATTATGTGAAGATTATGAATATTGCACTGGCTACGCCACTAACATCTTTGCCCCAACTGTGGGAGGTTACATACCTGATGGATTTAGTTTTAACAATTGGTTTTTGCTTACAAACAGCTCCACTTTTGTTAGTGGCAGATTTGTAACAAATCAACCATTATTAGTTAATTGCTTGTGGCCAGTTCCTAGTTTTGGTGTTGCAGCACAAGAATTTTGTTTTGAAGGTGCACAGTTTAGCCAATGTAATGGTGTGTTTTTAAATAACACAGTAGATGTCATTAGATTCAACCTTAATTTTACTGCAGATGTACAATCTGGCATGGGTGCTACAGTATTTTCACTGAATACAACAGGTGGTTGCATTCTTGAGATTTCTTGTTATAATGATATAGTGAGCGAGTCAAGTTTCTACAGTTATGGTGAAATTCCCTTCGGCGTAACTGATGGACCGCGTTATTGTTATGTCCTCTATAATGGCACAGCTCTTAAGTATTTCGGCACATTACCCCCTAGTGTCAAGGAAATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCAATTTTATATTAATGGTTACAATTTCTTTAGCACTTTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAACTTAACCACTGGTGATAGTGGAGCATTTTGGACAATTGCTTACACATCGTACACTGAAGCATTAGTACAAGTTGAAAACACAGCCATTAAAAAGGTGACGTATTGTAACAGTCACATTAATAACATCAAATGTTCTCAACTTACTGCTAATTTGCAAAATGGCTTTTATCCTGTTGCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCTAGTTTCTATTCACATACCAGTGTTAATATAACTATTGATCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCCTCAACACTAAGTAACATCACACTACCAATGCAGGATAATAACACCGATGTGTACTGTATTCGTTCTAACCAATTCTCAGTTTATGTTCACTCCACTTGCAAAAGTTCTTTATGGGACAACAATTTTAATCAAGATTGCACAGATGTTTTATATGCCACAGCTGTTATAAAAACTGGTACTTGCCCCTTCTCATTTGATAAATTGAATAATTACTTAACTTTTAACAAGCTTTGTTTGTCGTTGAATCCTACTGGTGCCAACTGTAAGTTTGATGTTGCTGCCCGTACAAGAACCAATGAGCAGGTTGTTAGAAGTTTATATGTAATATATGAAGAAGGAGACAACATAGTGGGTGTACCGTCTGATAATAGTGGTCTTCACGATTTGTCAGTGTTACACTTAGACTCCTGTACAGATTACAATATATATGGTAGAACTGGTGTTGGTATTATTAGACAAACTAACAGCACAATACTTAGTGGCTTACATTATACATCACTATCAGGTGATTTATTAGGTTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTTGTCTATTCTGTGACACCATGTGATGTAAGCGCACAAGCGGCTGTTATTGATGGGGCCATAGTTGGAGCTATGACTTCCATTAATAGTGAACTGTTAGGTCTAACACATTGGACAACAACACCAAATTTTTATTACTACTCTATATATAATACAACAAATGAGAGAACTCGTGGCACTGCAATCGACAGTAACGATGTAGATTGTGAACCTATCATAACCTATTCTAACATAGGTGTTTGTAAAAATGGTGCGTTGGTTTTTATTAACGTCACACATTCTGATGGAGATGTTCAACCAATTAGCACTGGCAATGTCACGATACCCACAAACTTTACCATATCTGTGCAAGTTGAATACATCCAGGTTTACACTACACCGGTGTCAATAGATTGTTCTAGATACGTTTGTAATGGTAACCCTAGATGTAATAAATTGTTAACACAATATGTTTCTGCATGTCAAACTATTGAGCAAGCGCTTGCAATGAGTGCCAGCCTTGAAAACATGGAAGTTGATTCCATGTTGTTTGTTTCAGAAAATGCCCTTAAATTGGCATCTGTTGAGGCGTTCAATAGTACAGAACATTTAGATCCTATTTACAAAGAATGGCCTAACATAGGTGGTTCTTGGCTAGGAGGTCTAAAAGACATACTTCCGTCCCATAATAGCAAACGTAAGTATCGTTCTGCTATAGAAGACTTGCTTTTTGATAAAGTTGTAACTTCTGGTCTAGGTACAGTTGATGAAGATTATAAACGTTGTACAGGTGGTTATGACATAGCTGACTTAGTTTGTGCACAATATTACAATGGCATCATGGTTCTACCTGGTGTTGCTAATGATGACAAGATGACTATGTACACAGCCTCTCTTGCAGGTGGTATAGCATTAGGTGCACTAGGTGGTGGCGCCGTGGCTATACCTTTTGCAGTAGCAGTTCAGGCTAGACTTAATTATGTTGCTCTACAAACTGATGTATTGAACAAAAACCAGCAGATCCTGGCTAATGCTTTCAACCAAGCTATTGGTAACATTACACAGGCATTTGGTAAGGTTAATGATGCTATACATCAAACATCACAAGGTCTTGCCACTGTTGCTAAAGCATTGGCAAAAGTGCAAGATGTTGTTAACACACAAGGGCAAGCTTTAAGCCACCTAACAGTACAACTGCAAAATAGCTTCCAAGCCATTAGTAGTTCTATTAGTGACATTTATAATAGGCTTGATGAACTGAGTGCTGATGCACAAGTTGATAGGCTGATTACAGGTAGACTTACAGCACTTAATGCATTTGTATCTCAGACTCTAACCAGACAAGCGGAGGTTAGGGCTAGTAGACAACTTGCCAAAGACAAGGTTAATGAATGTGTTAGGTCTCAGTCTCAGAGATTTGGATTTTGTGGTAATGGTACACATTTGTTTTCACTTGCAAATGCAGCACCAAATGGCATGGTTTTCTTTCACACAGTGCTATTACCAACAGCTTATGAAACTGTAACAGCTTGGTCAGGTATTTGTGCTTCAGATGGCGATCGCACTTTTGGACTTGTCGTTAAAGATGTTCAGTTGACGTTGTTTCGTAATCTAGATGACAAGTTCTATTTGACTCCCAGAACTATGTATCAGCCTAGAGCTGCAACTAGTTCTGATTTTGTTCAGATTGAGGGGTGCGACGTGTTGTTTGTCAATGCAACTGTAATTGACTTGCCTAGTATTATACCTGACTATATCGACATTAATCAGACTGTTCAAGACATATTAGAAAACTACAGACCAAACTGGACTGTACCTGAATTGACAATTGACATTTTTAACGCAACCTATTTAAATCTGACTGGTGAAATTGATGACTTAGAATTTAGGTCAGAAAAGCTACATAACACCACAGTAGAGCTTGCCATTCTCATTGACAATATTAACAATACATTAGTCAATCTTGAATGGCTCAATAGAATTGAAACTTATGTGAAATGGCCTTGGTATGTGTGGCTACTAATAGGCTTAGTAGTAGTGTTTTGCATACCGCTATTGCTATTTTGCTGTTGTAGTACAGGTTGCTGTGGATGCATAGGTTGTTTGGGAAGTTGTTGTCATTCTATTTGTAGTAGAAGACAATTTGAAAATTACGAACCAATTGAAAAAGTGCATGTCCACTAA