Protein Id: BAA33439.1 |
Length: 1453 aa |
Description: Spike protein Canine coronavirus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 18-Jun-99 |
Source: Canine coronavirus |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Canine coronavirus |
Host: -- |
Authors: Kokubu;T.; Taharaguchi;S.; Katayama;S.; Hatano;M.; Takahasi;T.; Iwamoto;K.; Masubuchi;K.; Yamanaka;M.; Sasaki;O. and Inaba;Y. |
Title: Nucleotide sequence of the spike protein of a canine coronavirus; strain 5821 |
Journal: J. Vet. Med. Sci. 51; 251-255 (1998) |
Taxonomy: Canine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
db_xref: """taxon:11153, CDD:279880, CDD:279881""" |
Sequence: MIVLVTCILLLCSYHTASSTSNNDCRQVNVTQLDGNENLIRDFLFQNFKEEGTVVVGGYYPTEVWYNCSRTATTTAYEYFSNIHAFYFDMEAMENSTGNARGKPLLFHVHGEPVSVIIYISYRDDVQHRPLLKHGLVCITESRNIDYNSFTSSQWNSICTGNDRKIPFSVIPTDNGTKIYGLEWNDEFVTAYISGRSYNWNINNNWFNNVTLLYSRSSTATWQHSAAYVYQGVSNFTYYKLNNTNGLKTYELCEDYEYCTGYATNIFAPTVGGYIPDGFSFNNWFLLTNSSTFVSGRFVTNQPLLVNCLWPVPSFGVAAQEFCFEGAQFSQCNGVFLNNTVDVIRFNLNFTADVQSGMGATVFSLNTTGGCILEISCYNDIVSESSFYSYGEIPFGVTDGPRYCYVLYNGTALKYFGTLPPSVKEIAISKWGQFYINGYNFFSTFPIDCISFNLTTGDSGAFWTIAYTSYTEALVQVENTAIKKVTYCNSHINNIKCSQLTANLQNGFYPVASSEVGLVNKSVVLLPSFYSHTSVNITIDLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNNTDVYCIRSNQFSVYVHSTCKSSLWDNNFNQDCTDVLYATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKLCLSLNPTGANCKFDVAARTRTNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGRTGVGIIRQTNSTILSGLHYTSLSGDLLGFKNVSDGVVYSVTPCDVSAQAAVIDGAIVGAMTSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNTTNERTRGTAIDSNDVDCEPIITYSNIGVCKNGALVFINVTHSDGDVQPISTGNVTIPTNFTISVQVEYIQVYTTPVSIDCSRYVCNGNPRCNKLLTQYVSACQTIEQALAMSASLENMEVDSMLFVSENALKLASVEAFNSTEHLDPIYKEWPNIGGSWLGGLKDILPSHNSKRKYRSAIEDLLFDKVVTSGLGTVDEDYKRCTGGYDIADLVCAQYYNGIMVLPGVANDDKMTMYTASLAGGIALGALGGGAVAIPFAVAVQARLNYVALQTDVLNKNQQILANAFNQAIGNITQAFGKVNDAIHQTSQGLATVAKALAKVQDVVNTQGQALSHLTVQLQNSFQAISSSISDIYNRLDELSADAQVDRLITGRLTALNAFVSQTLTRQAEVRASRQLAKDKVNECVRSQSQRFGFCGNGTHLFSLANAAPNGMVFFHTVLLPTAYETVTAWSGICASDGDRTFGLVVKDVQLTLFRNLDDKFYLTPRTMYQPRAATSSDFVQIEGCDVLFVNATVIDLPSIIPDYIDINQTVQDILENYRPNWTVPELTIDIFNATYLNLTGEIDDLEFRSEKLHNTTVELAILIDNINNTLVNLEWLNRIETYVKWPWYVWLLIGLVVVFCIPLLLFCCCSTGCCGCIGCLGSCCHSICSRRQFENYEPIEKVHVH |
Nucleotide
Nucleotide_Id: AB017789.1 |
Length: 4362bp |
Description: Canine coronavirus gene for Spike protein; complete cds; strain:5821 |
Source: Canine coronavirus |
Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 18-Jun-99 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Canine coronavirus |
CDS: AB017789.1:1..4362 |
Host: -- |
Authors: Kokubu;T.; Taharaguchi;S.; Katayama;S.; Hatano;M.; Takahasi;T.; Iwamoto;K.; Masubuchi;K.; Yamanaka;M.; Sasaki;O. and Inaba;Y. |
Journal: J. Vet. Med. Sci. 51; 251-255 (1998) |
Title: Nucleotide sequence of the spike protein of a canine coronavirus; strain 5821 |
db_xref: taxon:11153 |
Taxonomy: Canine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4363); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='CDS') |
Sequence: ATGATTGTGCTCGTAACTTGCATTTTATTGTTATGTTCATACCACACTGCTTCGAGTACGTCAAATAATGATTGTAGACAAGTTAACGTAACACAATTAGATGGCAATGAAAACCTCATTAGAGACTTTTTGTTTCAAAACTTTAAAGAAGAAGGAACTGTAGTTGTTGGTGGTTACTACCCTACAGAGGTTTGGTATAACTGTTCTAGAACAGCAACAACTACTGCCTATGAGTATTTCAGTAATATACACGCATTCTATTTTGATATGGAAGCCATGGAGAATAGTACTGGTAATGCACGTGGTAAACCTTTATTATTTCATGTTCATGGTGAGCCTGTTAGTGTCATCATATACATATCTTATAGAGATGATGTGCAACATAGGCCACTTTTAAAACACGGATTAGTGTGCATAACTGAAAGTCGCAACATTGACTATAACAGTTTCACCAGTAGCCAGTGGAATTCCATATGTACGGGTAATGACAGAAAAATTCCTTTCTCTGTCATACCCACGGACAATGGAACAAAAATTTATGGTCTTGAGTGGAATGATGAATTTGTTACAGCGTACATTAGTGGTCGTTCTTATAATTGGAACATCAATAATAATTGGTTTAACAATGTCACGCTTCTGTATAGTCGCTCAAGCACTGCCACATGGCAACACAGTGCTGCATACGTTTACCAAGGTGTTTCTAACTTCACTTATTACAAGTTAAATAACACCAATGGTCTAAAAACCTATGAATTATGTGAAGATTATGAATATTGCACTGGCTACGCCACTAACATCTTTGCCCCAACTGTGGGAGGTTACATACCTGATGGATTTAGTTTTAACAATTGGTTTTTGCTTACAAACAGCTCCACTTTTGTTAGTGGCAGATTTGTAACAAATCAACCATTATTAGTTAATTGCTTGTGGCCAGTTCCTAGTTTTGGTGTTGCAGCACAAGAATTTTGTTTTGAAGGTGCACAGTTTAGCCAATGTAATGGTGTGTTTTTAAATAACACAGTAGATGTCATTAGATTCAACCTTAATTTTACTGCAGATGTACAATCTGGCATGGGTGCTACAGTATTTTCACTGAATACAACAGGTGGTTGCATTCTTGAGATTTCTTGTTATAATGATATAGTGAGCGAGTCAAGTTTCTACAGTTATGGTGAAATTCCCTTCGGCGTAACTGATGGACCGCGTTATTGTTATGTCCTCTATAATGGCACAGCTCTTAAGTATTTCGGCACATTACCCCCTAGTGTCAAGGAAATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCAATTTTATATTAATGGTTACAATTTCTTTAGCACTTTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAACTTAACCACTGGTGATAGTGGAGCATTTTGGACAATTGCTTACACATCGTACACTGAAGCATTAGTACAAGTTGAAAACACAGCCATTAAAAAGGTGACGTATTGTAACAGTCACATTAATAACATCAAATGTTCTCAACTTACTGCTAATTTGCAAAATGGCTTTTATCCTGTTGCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCTAGTTTCTATTCACATACCAGTGTTAATATAACTATTGATCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCCTCAACACTAAGTAACATCACACTACCAATGCAGGATAATAACACCGATGTGTACTGTATTCGTTCTAACCAATTCTCAGTTTATGTTCACTCCACTTGCAAAAGTTCTTTATGGGACAACAATTTTAATCAAGATTGCACAGATGTTTTATATGCCACAGCTGTTATAAAAACTGGTACTTGCCCCTTCTCATTTGATAAATTGAATAATTACTTAACTTTTAACAAGCTTTGTTTGTCGTTGAATCCTACTGGTGCCAACTGTAAGTTTGATGTTGCTGCCCGTACAAGAACCAATGAGCAGGTTGTTAGAAGTTTATATGTAATATATGAAGAAGGAGACAACATAGTGGGTGTACCGTCTGATAATAGTGGTCTTCACGATTTGTCAGTGTTACACTTAGACTCCTGTACAGATTACAATATATATGGTAGAACTGGTGTTGGTATTATTAGACAAACTAACAGCACAATACTTAGTGGCTTACATTATACATCACTATCAGGTGATTTATTAGGTTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTTGTCTATTCTGTGACACCATGTGATGTAAGCGCACAAGCGGCTGTTATTGATGGGGCCATAGTTGGAGCTATGACTTCCATTAATAGTGAACTGTTAGGTCTAACACATTGGACAACAACACCAAATTTTTATTACTACTCTATATATAATACAACAAATGAGAGAACTCGTGGCACTGCAATCGACAGTAACGATGTAGATTGTGAACCTATCATAACCTATTCTAACATAGGTGTTTGTAAAAATGGTGCGTTGGTTTTTATTAACGTCACACATTCTGATGGAGATGTTCAACCAATTAGCACTGGCAATGTCACGATACCCACAAACTTTACCATATCTGTGCAAGTTGAATACATCCAGGTTTACACTACACCGGTGTCAATAGATTGTTCTAGATACGTTTGTAATGGTAACCCTAGATGTAATAAATTGTTAACACAATATGTTTCTGCATGTCAAACTATTGAGCAAGCGCTTGCAATGAGTGCCAGCCTTGAAAACATGGAAGTTGATTCCATGTTGTTTGTTTCAGAAAATGCCCTTAAATTGGCATCTGTTGAGGCGTTCAATAGTACAGAACATTTAGATCCTATTTACAAAGAATGGCCTAACATAGGTGGTTCTTGGCTAGGAGGTCTAAAAGACATACTTCCGTCCCATAATAGCAAACGTAAGTATCGTTCTGCTATAGAAGACTTGCTTTTTGATAAAGTTGTAACTTCTGGTCTAGGTACAGTTGATGAAGATTATAAACGTTGTACAGGTGGTTATGACATAGCTGACTTAGTTTGTGCACAATATTACAATGGCATCATGGTTCTACCTGGTGTTGCTAATGATGACAAGATGACTATGTACACAGCCTCTCTTGCAGGTGGTATAGCATTAGGTGCACTAGGTGGTGGCGCCGTGGCTATACCTTTTGCAGTAGCAGTTCAGGCTAGACTTAATTATGTTGCTCTACAAACTGATGTATTGAACAAAAACCAGCAGATCCTGGCTAATGCTTTCAACCAAGCTATTGGTAACATTACACAGGCATTTGGTAAGGTTAATGATGCTATACATCAAACATCACAAGGTCTTGCCACTGTTGCTAAAGCATTGGCAAAAGTGCAAGATGTTGTTAACACACAAGGGCAAGCTTTAAGCCACCTAACAGTACAACTGCAAAATAGCTTCCAAGCCATTAGTAGTTCTATTAGTGACATTTATAATAGGCTTGATGAACTGAGTGCTGATGCACAAGTTGATAGGCTGATTACAGGTAGACTTACAGCACTTAATGCATTTGTATCTCAGACTCTAACCAGACAAGCGGAGGTTAGGGCTAGTAGACAACTTGCCAAAGACAAGGTTAATGAATGTGTTAGGTCTCAGTCTCAGAGATTTGGATTTTGTGGTAATGGTACACATTTGTTTTCACTTGCAAATGCAGCACCAAATGGCATGGTTTTCTTTCACACAGTGCTATTACCAACAGCTTATGAAACTGTAACAGCTTGGTCAGGTATTTGTGCTTCAGATGGCGATCGCACTTTTGGACTTGTCGTTAAAGATGTTCAGTTGACGTTGTTTCGTAATCTAGATGACAAGTTCTATTTGACTCCCAGAACTATGTATCAGCCTAGAGCTGCAACTAGTTCTGATTTTGTTCAGATTGAGGGGTGCGACGTGTTGTTTGTCAATGCAACTGTAATTGACTTGCCTAGTATTATACCTGACTATATCGACATTAATCAGACTGTTCAAGACATATTAGAAAACTACAGACCAAACTGGACTGTACCTGAATTGACAATTGACATTTTTAACGCAACCTATTTAAATCTGACTGGTGAAATTGATGACTTAGAATTTAGGTCAGAAAAGCTACATAACACCACAGTAGAGCTTGCCATTCTCATTGACAATATTAACAATACATTAGTCAATCTTGAATGGCTCAATAGAATTGAAACTTATGTGAAATGGCCTTGGTATGTGTGGCTACTAATAGGCTTAGTAGTAGTGTTTTGCATACCGCTATTGCTATTTTGCTGTTGTAGTACAGGTTGCTGTGGATGCATAGGTTGTTTGGGAAGTTGTTGTCATTCTATTTGTAGTAGAAGACAATTTGAAAATTACGAACCAATTGAAAAAGTGCATGTCCACTAA |