| Protein Id: CAA54335.1 |
Length: 1453 aa |
| Description: spike protein, partial Canine coronavirus. |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 26-Jul-16 |
| Source: Canine coronavirus |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Canine coronavirus |
| Host: -- |
Authors: Wesseling;J.G.; Vennema;H.; Godeke;G.J.; Spaan;W.J.M.; Horzinek;M.C. and Rottier;P.J.M. |
| Title: Nucleotide sequence and expression of the spike (S) gene of canine coronavirus and comparison with the S proteins of feline and swine coronaviruses |
Journal: J. Gen. Virol. 75; 1789-1794 (1994) |
| Taxonomy: Canine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
| db_xref: """taxon:11153, CDD:279880, CDD:279881, GOA:Q65984, InterPro:IPR002551, InterPro:IPR002552, UniProtKB/Swiss-Prot:Q65984""" |
| Sequence: MIVLILCLLLFSYNSVICTSNNDCVQGNVTQLPGNENIIKDFLFHTFKEEPSVVVGGYYPTEVWYNCSRSATTTAYKDFSNIHAFYFDMEAMENSTGNARGKPLLVHVHGDPVSIIIYISAYRDDVQPRPLLKHGLLCITKNKIIDYNTFTSAQWSAICLGDDRKIPFSVIPTDNGTKIFGLEWNDDYVTAYISDRSHHLNINNNWFNNVTILYSRSSSATWQKSAAYVYQGVSNFTYYKLNNTNGLKSYELCEDYEYCTGYATNVFAPTVGGYIPHGFSFNNWFMRTNSSTFVSGRFVTNQPLLVNCLWPVPSFGVAAQQFCFEGAQFSQCNGVSLNNTVDVIRFNLNFTALVQSGMGATVFSLNTTGGVILEISCYNDTVSESSFYSYGEISFGVTDGPRYCFALYNGTALKYLGTLPPSVKEIAISKWGHFYINGYNFFSTFPIDCISFNLTTGDSGAFWTIAYTSYTDALVQVENTAIKKVTYCNSHINNIKCSQLTANLQNGFYPVASSEVGLVNKSVVLLPSFYSHTSVNITIDLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNNTDVYCIRSNRFSVYFHSTCKSSLWDDVFNSDCTDVLYATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCLSLNPVGANCKFDVAARTRTNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGITGVGIIRQTNSTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVSDGVIYSVTPCDVSAHAAVIDGAIVGAMTSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNERTRGTAIDSNDVDCEPIITYSNIGVCKNGALVFINVTHSDGDVQPISTGNVTIPTNFTISVQVEYIQVYTTPVSIDCSRYVCNGNPRCNKLLTQYVSACQTIEQALAMGARLENMEIDSMLFVSENALKLASVEAFNSTETLDPIYKEWPNIGGSWLGGLKDILPSHNSKRKYRSAIEDLLFDKVVTSGLGTVDEDYKRCTGGYDIADLVCAQYYNGIMVLPGVANDDKMAMYTASLAGGITLGSLGGGAVSIPFAIAVQARLNYVALQTDVLNKNQQILANAFNQAIGNITQAFGKVNDAIHQTSQGLATVAKVLAKVQDVVNTQGQALSHLTLQLQNNFQAISSSISDIYNRLDELSADAQVDRLITGRLTALNAFVSQTLTRQAEVRASRQLAKDKVNECVRSQSQRFGFCGNGTHLFSLANAAPNGMIFFHTVLLPTAYETVTAWSGICASDGDRTFGLVVKDVQLTLFRNLDDKFYLTPRTMYQPIVATSSDFVQIEGCDVLFVNATVIDLPSIIPDYIDINQTVQDILENFRPNWTVPELPLDIFNATYLNLTGEINDLEFRSEKLHNTTVELAILIDNINNTLVNLEWLNRIETYVKWPWYVWLLIGLVVIFCIPILLFCCCSTGCCGCIGCLGSCCHSICSRRQFESYEPIEKVHVH |
Nucleotide
| Nucleotide_Id: X77047.1 |
Length: 4359bp |
| Description: Canine coronavirus mRNA for spike protein |
Source: Canine coronavirus |
| Nucleotide_type: mRNA |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 26-Jul-16 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Canine coronavirus |
| CDS: X77047.1:121..>4479 |
Host: -- |
| Authors: Wesseling;J.G.; Vennema;H.; Godeke;G.J.; Spaan;W.J.M.; Horzinek;M.C. and Rottier;P.J.M. |
Journal: J. Gen. Virol. 75; 1789-1794 (1994) |
| Title: Nucleotide sequence and expression of the spike (S) gene of canine coronavirus and comparison with the S proteins of feline and swine coronaviruses |
db_xref: taxon:11153; GOA:Q65984; InterPro:IPR002551; InterPro:IPR002552; UniProtKB/Swiss-Prot:Q65984 |
| Taxonomy: Canine coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
| Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4480); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(88); ExactPosition(94); strand=1); type='repeat_region'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(120); AfterPosition(4479); strand=1); type='CDS') |
| Sequence: ATGATTGTGCTAATATTGTGCCTCCTCTTGTTTTCGTACAATAGTGTGATTTGTACATCAAACAATGACTGTGTACAAGGTAATGTGACACAATTGCCTGGCAATGAAAACATTATTAAAGATTTTCTATTTCACACCTTCAAAGAAGAACCAAGTGTAGTTGTTGGTGGTTATTACCCTACAGAGGTGTGGTATAACTGCTCCAGAAGCGCAACAACCACCGCTTACAAGGATTTTAGTAATATACATGCATTCTATTTTGATATGGAAGCCATGGAGAATAGTACTGGCAATGCACGAGGTAAACCTTTACTAGTACATGTTCATGGTGATCCTGTTAGTATCATCATATATATATCGGCTTATAGAGATGATGTGCAACCAAGGCCTCTTTTAAAACATGGTTTGTTGTGTATAACTAAAAATAAAATCATTGACTATAACACGTTTACCAGCGCACAGTGGAGTGCCATATGTTTGGGTGATGACAGAAAAATACCATTCTCTGTCATACCCACAGATAATGGTACAAAAATATTTGGTCTTGAGTGGAATGATGACTATGTTACAGCCTATATTAGTGATCGTTCTCACCATTTGAACATCAATAATAATTGGTTTAACAATGTGACAATCCTATACTCTCGATCAAGCTCTGCTACGTGGCAGAAGAGTGCTGCATATGTTTATCAAGGTGTTTCAAATTTTACTTATTACAAGTTAAATAACACCAATGGCTTGAAAAGCTATGAATTGTGTGAAGATTATGAATACTGCACTGGCTATGCTACCAACGTATTTGCCCCGACAGTGGGCGGTTATATACCTCATGGCTTCAGTTTTAACAATTGGTTTATGCGGACAAACAGTTCCACGTTTGTTAGTGGCAGATTTGTAACAAATCAACCATTATTGGTTAATTGTTTGTGGCCAGTGCCCAGTTTTGGTGTCGCAGCACAACAATTTTGTTTTGAAGGTGCGCAGTTTAGCCAATGTAATGGTGTGTCTTTAAACAATACAGTGGATGTCATTAGATTCAACCTTAATTTTACCGCATTAGTACAATCTGGCATGGGTGCTACAGTATTTTCACTGAATACAACAGGTGGTGTCATTCTTGAGATTTCTTGTTATAATGATACAGTGAGTGAGTCAAGTTTCTACAGTTATGGTGAAATTTCATTCGGCGTAACTGATGGACCGCGTTACTGTTTCGCACTCTATAATGGCACGGCTCTTAAGTATTTAGGAACATTACCACCTAGTGTCAAGGAAATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCATTTTTATATTAATGGTTACAATTTCTTTAGCACTTTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAATTTAACCACTGGTGATAGTGGAGCATTTTGGACAATTGCTTACACATCGTACACTGACGCATTAGTACAAGTTGAAAACACAGCTATTAAAAAGGTGACGTATTGTAACAGTCACATTAATAACATTAAATGTTCTCAACTTACTGCTAATTTGCAAAATGGATTTTATCCTGTTGCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCTAGTTTCTATTCACATACCAGTGTTAATATAACTATTGATCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCCTCAACATTAAGTAACATCACACTACCAATGCAGGATAATAACACCGATGTGTACTGCATTCGTTCTAACCGATTTTCAGTTTACTTTCATTCCACTTGTAAAAGTTCTTTATGGGACGATGTGTTTAATTCCGACTGCACAGATGTTTTATATGCTACAGCTGTTATAAAAACTGGCACTTGTCCTTTCTCGTTTGATAAATTGAACAATTACTTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTGTCATTGAATCCTGTTGGTGCCAACTGCAAGTTTGATGTTGCCGCTCGTACAAGAACCAATGAGCAGGTTGTTAGAAGTTTATATGTAATATATGAAGAAGGAGACAACATAGTGGGTGTGCCGTCTGACAATAGTGGTCTTCACGACTTGTCAGTGCTACACTTAGACTCCTGTACAGATTATAATATATATGGTATAACTGGTGTTGGTATTATTAGACAAACTAACAGTACGCTACTTAGTGGCTTATATTACACATCACTATCAGGTGACTTGTTAGGGTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTCATCTATTCTGTCACGCCATGTGATGTAAGCGCACATGCTGCTGTTATTGATGGCGCCATAGTTGGAGCTATGACTTCCATTAATAGTGAACTGTTAGGTCTAACACATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTATTATTCTATATATAATTATACCAATGAAAGGACTCGTGGCACAGCAATTGATAGTAACGATGTTGATTGTGAACCTATCATAACCTATTCTAATATAGGTGTTTGTAAAAATGGAGCTTTGGTTTTTATTAACGTCACACATTCTGATGGAGACGTTCAACCAATTAGCACCGGTAATGTCACGATACCTACAAATTTTACCATATCTGTGCAAGTTGAATACATTCAGGTTTACACTACACCGGTGTCAATAGATTGTTCAAGGTACGTTTGCAATGGTAACCCTAGATGCAATAAATTGTTAACGCAATACGTTTCTGCATGTCAAACTATTGAGCAAGCACTTGCAATGGGTGCCAGACTTGAAAACATGGAGATTGATTCCATGTTGTTTGTTTCGGAAAATGCCCTTAAATTGGCATCTGTTGAAGCATTCAATAGTACGGAAACTTTAGATCCTATTTACAAAGAATGGCCTAACATTGGTGGTTCTTGGCTAGGAGGTTTAAAAGACATATTGCCATCTCACAACAGCAAACGTAAGTACCGGTCGGCTATAGAAGATTTGCTTTTTGATAAGGTTGTAACATCTGGCTTAGGTACAGTTGATGAAGATTATAAACGTTGTACAGGTGGTTATGACATAGCTGACTTAGTGTGTGCACAATATTACAATGGCATCATGGTGCTACCTGGTGTAGCTAATGATGACAAGATGGCTATGTACACTGCATCTCTTGCAGGTGGTATAACATTAGGTTCACTTGGTGGTGGCGCAGTGTCTATACCTTTTGCAATAGCAGTTCAAGCCAGACTTAATTATGTTGCTCTACAAACTGATGTATTGAACAAGAACCAGCAGATCCTGGCTAATGCTTTCAATCAAGCTATTGGTAACATTACACAGGCATTTGGTAAGGTTAATGATGCTATACATCAAACGTCACAAGGTCTTGCTACTGTTGCTAAAGTATTGGCAAAAGTGCAAGATGTTGTTAACACACAAGGGCAAGCTTTAAGCCACCTAACATTACAATTGCAAAATAATTTCCAAGCCATTAGTAGTTCCATTAGTGACATTTATAACAGGCTTGATGAATTGAGTGCTGATGCACAAGTTGACAGGCTGATTACAGGAAGACTTACAGCACTTAATGCATTTGTGTCTCAGACTTTAACCAGACAAGCAGAGGTTAGGGCTAGCAGACAGCTTGCTAAAGACAAGGTAAATGAATGCGTCAGGTCTCAATCTCAGAGATTTGGATTCTGTGGTAATGGTACACATTTATTTTCACTTGCAAATGCAGCACCAAATGGCATGATCTTCTTTCACACAGTGCTATTACCAACAGCTTATGAAACCGTGACAGCCTGGTCAGGTATTTGTGCATCAGATGGCGATCGTACTTTTGGACTTGTTGTTAAGGATGTCCAGTTGACGCTGTTTCGCAATCTAGATGACAAATTCTATTTGACTCCCAGAACTATGTATCAGCCTATAGTTGCAACTAGTTCTGATTTTGTTCAAATTGAAGGATGTGATGTGTTGTTTGTTAATGCAACTGTAATTGACTTGCCTAGTATTATACCTGACTATATTGATATTAATCAAACTGTTCAGGACATATTAGAAAATTTCAGACCAAATTGGACTGTACCTGAGTTGCCACTTGACATTTTCAATGCAACCTACTTAAACCTGACTGGTGAAATTAATGACTTAGAATTTAGGTCAGAAAAGTTACATAACACCACAGTAGAACTTGCTATTCTCATTGATAATATTAATAACACATTAGTCAATCTTGAATGGCTCAATAGAATTGAAACTTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTGTGGCTACTAATTGGATTAGTAGTAATATTCTGCATACCCATATTGCTATTTTGTTGTTGTAGTACTGGTTGTTGTGGATGTATTGGGTGTTTAGGAAGCTGTTGTCATTCCATATGTAGTAGAAGGCAATTTGAAAGTTATGAACCAATTGAAAAAGTTCATGTTCAC |