Protein Id: ACL93320.1 |
Length: 1363 aa |
Description: spike protein Canine respiratory coronavirus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 5-Aug-09 |
Source: Canine respiratory coronavirus |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Canine respiratory coronavirus |
Host: dog |
Authors: An;D.-J.; Jeong;W.-S.; Yoon;S.H.; Kim;H.-J. and Park;B.-K. |
Title: Genetic diversity of group 2 coronavirus isolates from dogs in Korea |
Journal: Unpublished |
Taxonomy: Canine respiratory coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
db_xref: """taxon:215681, CDD:293060, CDD:286493, CDD:279881""" |
Sequence: MFLILLISLPMAFAVIGDLKCTTVSINNVDTGAPSISTDVVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLLLNGYYPTSGSTYRNMALKGTLLLSTLWFKPPFLSDFIDGVFAKVKNTKVIKHGVVYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPHTTNLDNKLQGLLEISVCQYTMCDYPHTMCHPNLGNKRIELWHWDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTSYAYFTDTGVVTKFLFHVYLGTVLSHYYVMPLTCNSVMTLEYWVTPLTFKQYLLAFNQDGVIFNAVDCKSDFMSEIKCKTLSIAPSTGVYELNGYTVQPIADVYRRIPNLPDCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQMGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYNLPAGNVPISRFNPSIWNRRFGFTEQSVFKPQPAGVFTDHDVVYAQHCFKAPTNFCPCKLNGSFCVGSGSGIDAGYKNSGIGTCPAGTNYLTCYNANQCDCLCTPDPILSKSTGPYKCPQTKHLVGIGEHCSGLAIKSDYCGGNPCTCQPKAFLGWSVDSCLQGDRCNIFANFILHGVNGGTTCSTDLQKSNTDIILGVCVNYDLYGITGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYLTNRTFMIRSCYSGRVSAAFHSNSSEPALLFRNIKCNYVFNNTLSRQLQPINYFDSYLGCVVNADNSTSSSVQTCDLTVGSGYCVDYSTKRRSRRSITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLQPVGGLYEIQIPSEFTIGNMEEFIQTSSPKVTIDCSVFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGFNFNVDDINFSPVLGCLGSECNKVSSRSAIEDLLFSKVKLSDVGFVDAYNNCTGGAEIRDLICVQSYNGIKVLPPLLSGSQISGYTVAATFASLFPPWSAAAGVPFYLNVQYRINGIGVTMDVLSQNQKLISNAFNNALDAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISASLQEILSRPDALEAQAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTAKVSPGLCIAGDRGIAPKSGYFVNVNNTWMFTGSGYYYPEPITGNNVVVMSTCAVNYTKAPDVMLNISTPNLPDFKEELDQWFKNQTLMAPDLSLDYINVTFLDLQDEMNRLQEAIKVLNHSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLIGLAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGHQELVIKTLHDD |
Nucleotide
Nucleotide_Id: EU983107.1 |
Length: 4092bp |
Description: Canine respiratory coronavirus isolate CRCVK39 spike protein (S) gene; complete cds |
Source: Canine respiratory coronavirus |
Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 5-Aug-09 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Canine respiratory coronavirus |
CDS: EU983107.1:1..4092 |
Host: dog |
Authors: An;D.-J.; Jeong;W.-S.; Yoon;S.H.; Kim;H.-J. and Park;B.-K. |
Journal: Unpublished |
Title: Genetic diversity of group 2 coronavirus isolates from dogs in Korea |
db_xref: taxon:215681 |
Taxonomy: Canine respiratory coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4092); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4092); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4092); strand=1); type='CDS') |
Sequence: ATGTTTTTGATACTTTTAATTTCCTTACCAATGGCTTTTGCTGTTATAGGAGATTTAAAGTGTACTACGGTTTCCATCAATAATGTTGACACCGGTGCTCCTTCTATTAGCACTGATGTTGTCGATGTTACTAATGGTTTAGGTACTTATTATGTTTTAGATCGTGTGTATTTAAATACTACATTGTTGCTTAATGGTTATTATCCTACTTCAGGTTCTACATATCGTAATATGGCACTGAAGGGAACTTTACTATTGAGCACACTATGGTTTAAACCACCATTTCTTTCTGATTTTATTGATGGTGTTTTTGCTAAGGTAAAAAATACCAAGGTTATTAAACATGGTGTAGTGTATAGTGAGTTTCCTGCTATAACTATAGGTAGTACTTTTGTAAATACATCCTACAGTGTGGTAGTACAACCGCATACTACTAATTTAGATAATAAATTACAAGGTCTCTTAGAGATCTCTGTTTGCCAGTATACTATGTGCGATTACCCACATACGATGTGTCATCCTAATCTGGGTAATAAACGCATAGAACTATGGCATTGGGATACAGGTGTTGTTTCCTGTTTATATAAGCGTAATTTCACATATGATGTGAATGCTGATTATTTGTATTTCCATTTTTATCAAGAAGGTGGTACTTCTTATGCATATTTTACAGACACTGGTGTTGTTACTAAGTTTCTGTTTCATGTTTATTTAGGCACGGTGCTTTCACATTATTATGTCATGCCTTTGACTTGTAATAGTGTTATGACTTTAGAATACTGGGTTACACCTCTCACTTTTAAACAATATTTACTCGCTTTCAATCAAGATGGTGTTATTTTTAATGCTGTTGATTGTAAGAGTGATTTTATGAGTGAGATTAAGTGTAAAACACTATCTATAGCACCATCTACTGGTGTTTATGAATTAAACGGTTACACTGTTCAGCCAATTGCAGATGTTTACCGACGTATACCTAATCTTCCCGATTGTAATATAGAGGCTTGGCTTAATGATAAGTCGGTGCCTTCTCCATTAAATTGGGAACGTAAGACCTTTTCAAATTGTAATTTTAATATGAGCAGCCTGATGTCTTTTATTCAGGCTGACTCGTTTACTTGTAATAATATTGATGCTGCTAAGATATACGGTATGTGTTTTTCCAGCATAACTATAGATAAGTTTGCTATACCCAATGGTAGGAAGGTTGACCTACAAATGGGCAATTTGGGCTATTTGCAGTCTTTTAACTATAGAATTGATACTACTGCTACAAGTTGTCAGTTGTATTATAATTTACCTGCTGGTAATGTTCCTATTAGCAGGTTTAATCCTTCTATTTGGAATAGGAGATTTGGTTTTACAGAACAATCTGTTTTTAAGCCTCAACCTGCAGGTGTTTTTACTGATCATGATGTTGTTTATGCACAACATTGTTTTAAAGCTCCCACAAATTTCTGTCCATGTAAATTGAATGGGTCTTTTTGTGTAGGTAGTGGTTCTGGTATAGATGCTGGTTATAAAAATAGTGGTATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGTTATAATGCTAACCAATGTGATTGTTTGTGCACTCCAGACCCCATTTTATCTAAATCTACAGGGCCTTATAAGTGCCCCCAAACTAAACACTTAGTTGGCATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCTTGCTATTAAAAGTGATTATTGTGGAGGCAATCCTTGTACTTGCCAACCAAAAGCATTTTTGGGTTGGTCTGTGGACTCTTGTTTACAAGGGGATAGGTGTAATATTTTTGCTAATTTTATTTTGCATGGTGTTAATGGTGGTACTACTTGTTCTACTGATTTACAAAAATCAAACACAGACATAATTCTTGGTGTTTGTGTTAATTATGATCTTTATGGTATTACAGGCCAAGGTATTTTTGTTGAGGTTAATGCGACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTTTTATATGATTCTAATGGTAATCTCTATGGTTTTAGGGACTACTTAACAAACAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGCTATAGCGGTCGTGTTTCAGCGGCCTTTCACTCTAACTCTTCCGAACCAGCATTGCTATTTCGGAATATTAAATGCAATTACGTTTTTAATAATACTCTTTCACGACAGCTGCAACCTATTAACTATTTTGATAGTTATCTTGGTTGTGTTGTCAATGCTGATAATAGTACTTCTAGTTCTGTTCAAACATGTGATCTCACAGTAGGTAGTGGTTACTGTGTGGATTACTCTACAAAAAGACGAAGTCGTAGATCGATTACCACTGGTTATCGGTTTACTAATTTTGAGCCATTTACTGTTAATTCAGTAAATGATAGTTTACAACCTGTAGGTGGTTTGTATGAAATTCAAATACCTTCAGAGTTTACTATAGGTAATATGGAGGAGTTTATTCAAACAAGTTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTTCTGTTTTTGTCTGTGGTGATTATGCAGCATGTAAATCACAGTTGGTTGAATATGGTAGTTTCTGTGACAATATTAATGCTATACTCACAGAAGTAAATGAACTACTTGACACTACACAGTTGCAAGTAGCTAATAGTTTAATGAATGGTGTCACTCTTAGCACTAAGCTTAAAGATGGCTTTAATTTCAATGTAGATGACATCAATTTTTCCCCTGTATTAGGTTGTTTAGGAAGCGAATGTAATAAAGTTTCCAGTAGATCTGCTATAGAGGATTTACTTTTTTCTAAAGTAAAGTTATCTGATGTTGGTTTCGTTGATGCTTATAATAATTGTACTGGAGGTGCCGAAATTAGGGACCTCATTTGTGTGCAAAGTTATAATGGTATCAAAGTGTTGCCTCCACTGCTCTCAGGAAGTCAGATCAGTGGATACACTGTGGCTGCCACCTTTGCTAGTCTGTTTCCTCCTTGGTCAGCAGCAGCAGGCGTACCATTTTATTTAAATGTTCAGTATCGTATTAATGGTATTGGTGTTACCATGGATGTGCTAAGTCAAAATCAAAAGCTTATTTCTAATGCATTTAACAATGCCCTTGATGCTATTCAGGAAGGGTTTGATGCTACTAATTCTGCTTTAGTTAAAATTCAAGCTGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCTCTTAATAACTTATTGCAACAACTCTCTAATAGATTTGGTGCTATAAGTGCTTCTTTACAAGAAATTCTATCTAGACCTGATGCTCTTGAAGCGCAAGCTCAGATAGATAGACTTATCAACGGGCGTCTTACCGCTCTTAATGCTTATGTTTCTCAACAGCTTAGTGATTCTACACTAGTAAAATTTAGTGCAGCCCAAGCTATGGAGAAGGTTAATGAATGTGTCAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTTTGTGGTAATGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCATATGGTTTGTATTTTATCCACTTTAGCTATGTCCCTACTAAGTATGTTACTGCGAAGGTTAGTCCCGGTCTGTGCATTGCAGGTGATAGAGGTATAGCTCCTAAGAGTGGTTATTTTGTTAATGTAAATAACACTTGGATGTTCACTGGTAGTGGTTATTACTACCCTGAACCTATAACTGGAAATAATGTTGTTGTTATGAGTACCTGTGCTGTTAACTATACTAAAGCACCGGATGTAATGCTGAACATTTCAACACCCAACCTCCCTGATTTTAAGGAAGAGTTGGATCAATGGTTTAAAAACCAAACATTAATGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATAAATGTTACATTCTTGGACCTACAAGATGAAATGAATAGGTTACAGGAGGCAATAAAAGTTTTAAATCATAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACATATGAATATTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATTGGCCTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGTTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGTTTTAAGAAATGCGGTGGTTGTTGTGATGATTATACTGGACATCAGGAGTTAGTAATTAAAACCTTACATGACGACTAA |