| Protein Id: ABO88142.1 |
Length: 1457 aa |
| Description: spike protein Chinese ferret badger coronavirus DM95/2003. |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 10-Apr-07 |
| Source: Chinese ferret badger coronavirus DM95/2003 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Chinese ferret badger coronavirus |
| Host: -- |
Authors: Vijaykrishna;D.; Smith;G.J.; Zhang;J.X.; Peiris;J.S.; Chen;H. and Guan;Y. |
| Title: Evolutionary insights into the ecology of coronaviruses |
Journal: J Virol 81 (8); 4012-4020 (2007) |
| Taxonomy: Chinese ferret badger coronavirus DM95/2003 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
| db_xref: """taxon:434615, CDD:279880, CDD:279881""" |
| Sequence: MKFLVFLVIVPLIYGDEFPCSKFINRTIGNHWNLIETFLLNYSSRLPPNSDVVLGDYFPTVTPWFNCIRNNNNRLYVTMENLKALYWDYATENTTADYRQRLHVVVEGNPYSITVTTTRDFNSAEGAIICICKGTPPKTTTVNSASQLNCNWGSECRLQHTGTQHTKFPICPSNIESNCGNMLYGLQWFRDEVVAYLHGAIYRINFENQWSGTVTLGDMRATTSANAGALVDLWWFNPVYDITYYRVNSKNSTTVISNCTDQCASYVDNIFTTQPGGFIPSDFSFNNWFLLTNSSTVVSGKFVTRQPLLVNCLWPVPSFKGAASTFCFEGAGFDQCNGAVLNKTVDVIRFNLNFTADVQSGMGATVFSLNTTGGVILEISCYNNTVSESSFYSYGEIPFGVTDGPRYCYVLYNGTVLKYLGTLPPSVKEIAISKWGHFYINGYNFFSTFPIDCISFNLTTGATGAFWTIAYTSYTEALVQVENTAIKKVTYCNSHINNIKCSQLTANLQNGFYPVASSEVGLVNKSVVLLPSFYSHTSVNITIDLGMQRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNKTDVYCIRSNQFSVYVHSTCKSALWDNVFNSDCTDVLYATAIIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCLSLNPTGANCKFDVAARTRTNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDSSGLYDLSVLHLDSCTDYNIYGRTGVGIIRRTNSTILSGLYYTSLAGDLLGFKNISDGVVYSVTPCDVSAQAAVIDGAIVGAMTSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNERTRGTAIDSNDVDCEPIITYSNIGVCKNGALVFINVTHSDGDVQPISTGNVTIPTNFTISVQVEYIQVYTTPVSIDCSRYVCNGNPRCNKLLTQYVSACQTIEQALAMSARLENMEVDSMLFVSENALKLASVEAFNSTEHLDPIYKEWPNIGGFWLGGLKYILPSYNSKRKYRSAIEDLLFDKVVTSGLGTVDEDYKRCTGGHDIADLACAQYYNGIMVLPGVANDDKMTMYTASLAGGITLGALGGGAVAIPFAVAVQARLNYVALQTDVLSKNQQILANAFNQAIGNITQAFGKVNDAIHQTSQGLATVAKALAKVQNVVNTQGQALSHLTVQLQNNFQAISSSISDIYNRLDELSADAQVDRLITGRLTALNAFVSQTLTRQAEVRASRQLAKDKVNECVRSQSQRFGFCGNGTHLFSLANAAPNGMIFFHSVLLPTAYETVTAWSGICASDGDRTFGLVVKDVQLTLFRNLDDKFYLTPRTMYQPRAATSSDFVQIEGCDVLFVNATVIDLPSIIPDYIDINQTVQDILENYKPNWTVPELTLDIFNATYLNLTGEIDDLEFRSEKLHNTTVELAILIDNINNTLVNLEWLNRIETYVKWPWYVWLLIGLVVVFCIPLLLFCCCSTGCCGCIGCLGSCCHSICSRRQFENYEPIEKVHVH |
Nucleotide
| Nucleotide_Id: EF192156.1 |
Length: 4374bp |
| Description: Chinese ferret badger coronavirus DM95/2003 spike protein (S) gene; complete cds |
Source: Chinese ferret badger coronavirus DM95/2003 |
| Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 10-Apr-07 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Chinese ferret badger coronavirus |
| CDS: EF192156.1:1..4374 |
Host: -- |
| Authors: Vijaykrishna;D.; Smith;G.J.; Zhang;J.X.; Peiris;J.S.; Chen;H. and Guan;Y. |
Journal: J Virol 81 (8); 4012-4020 (2007) |
| Title: Evolutionary insights into the ecology of coronaviruses |
db_xref: taxon:434615 |
| Taxonomy: Chinese ferret badger coronavirus DM95/2003 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
| Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4374); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4374); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4374); strand=1); type='CDS') |
| Sequence: ATGAAATTTTTGGTGTTTTTAGTTATAGTACCATTGATCTATGGAGATGAATTCCCTTGTTCTAAATTCATTAATAGAACCATAGGCAATCATTGGAATTTGATTGAAACATTTCTTTTAAATTATAGCAGTAGATTACCACCTAACTCTGATGTGGTGTTAGGTGATTACTTTCCTACTGTGACACCTTGGTTTAATTGCATTCGCAATAATAATAATAGGCTTTATGTTACAATGGAAAATCTTAAAGCATTGTACTGGGATTATGCGACAGAAAATACAACAGCAGATTACAGACAAAGGTTACATGTAGTCGTTGAAGGCAACCCATATTCCATTACAGTTACCACAACTCGTGACTTTAATTCTGCTGAAGGTGCTATTATATGTATTTGCAAAGGTACACCACCTAAGACTACTACCGTCAATTCGGCATCTCAACTGAATTGTAATTGGGGTAGCGAATGCAGGTTACAGCACACGGGAACCCAACATACAAAATTCCCTATTTGTCCTTCTAATATTGAATCCAATTGTGGTAATATGTTGTATGGTTTACAATGGTTTAGAGATGAAGTTGTTGCTTATTTACATGGTGCTATTTATCGTATTAATTTTGAAAACCAATGGTCCGGCACTGTCACACTTGGTGACATGCGTGCAACAACTAGTGCAAACGCTGGAGCGTTAGTAGACCTGTGGTGGTTTAACCCTGTTTATGATATCACTTATTATAGAGTGAATAGTAAAAACAGCACTACTGTAATCTCCAATTGCACTGATCAATGTGCTAGTTATGTGGATAATATTTTTACCACACAGCCTGGAGGTTTTATACCATCAGATTTTAGTTTTAACAATTGGTTTCTTTTAACTAATAGTTCTACGGTTGTTAGTGGTAAATTTGTTACCAGACAGCCGCTATTAGTTAATTGCTTATGGCCAGTTCCTAGTTTTAAAGGAGCAGCATCCACATTTTGCTTTGAAGGAGCTGGTTTCGATCAGTGTAATGGTGCTGTTCTAAATAAAACTGTAGATGTTATTAGATTCAACCTTAATTTCACCGCAGATGTACAATCTGGCATGGGTGCTACAGTATTTTCACTGAATACAACAGGTGGTGTCATTCTTGAGATTTCTTGTTATAATAATACAGTGAGTGAGTCAAGTTTCTACAGTTATGGTGAAATTCCATTCGGCGTAACTGATGGACCGCGTTACTGTTATGTGCTCTATAATGGCACGGTTCTTAAGTACTTAGGAACATTACCACCTAGTGTCAAGGAAATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCATTTTTATATTAATGGTTACAATTTCTTTAGCACTTTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAACTTAACCACTGGTGCTACTGGAGCTTTCTGGACAATTGCCTACACATCATACACTGAAGCGTTAGTACAAGTTGAAAACACAGCTATTAAGAAGGTGACGTATTGTAACAGTCACATTAATAACATCAAATGTTCTCAACTCACTGCTAACTTGCAAAATGGATTTTATCCTGTTGCTTCAAGTGAAGTCGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCAAGTTTTTATTCACATACTAGTGTTAATATAACTATTGATCTTGGTATGCAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCCTCTACATTAAGTAACATCACACTACCAATGCAGGATAATAAAACCGATGTGTACTGCATTCGTTCTAACCAGTTTTCAGTTTATGTTCATTCAACTTGTAAAAGTGCTTTATGGGATAATGTGTTTAATTCTGACTGCACAGATGTTTTATATGCCACAGCTATTATAAAAACTGGTACTTGTCCTTTCTCATTTGATAAGTTGAACAATTATTTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTGTCGTTGAATCCTACTGGTGCCAACTGTAAGTTTGATGTTGCTGCCCGTACAAGAACCAATGAGCAGGTTGTTAGAAGTTTATATGTAATATATGAAGAAGGAGATAACATAGTTGGTGTACCGTCTGATAGTAGTGGTCTTTACGATCTGTCAGTGTTACACTTAGACTCCTGTACAGATTACAATATATATGGTAGAACTGGTGTTGGTATTATTAGACGAACTAACAGCACAATACTTAGTGGCTTATATTACACCTCACTAGCGGGTGATTTGTTAGGTTTTAAAAATATTAGTGATGGTGTTGTCTATTCTGTGACACCATGTGATGTAAGTGCACAAGCGGCTGTTATTGATGGTGCCATAGTCGGAGCTATGACTTCCATTAATAGTGAACTGTTAGGTCTAACACATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTACTACTCCATATATAATTACACAAATGAGAGAACTCGTGGCACTGCAATTGACAGTAACGATGTTGATTGTGAACCTATCATAACCTATTCTAACATAGGTGTTTGTAAAAATGGTGCTTTGGTCTTTATTAACGTCACACACTCTGATGGTGATGTTCAACCAATTAGCACTGGTAATGTCACGATACCAACAAACTTTACCATATCTGTGCAAGTCGAATACATCCAGGTTTACACTACACCAGTGTCAATAGATTGTTCTAGATATGTTTGTAATGGTAACCCTAGATGTAATAAATTGTTAACACAATATGTTTCTGCATGTCAAACTATTGAGCAAGCGCTTGCAATGAGTGCCAGACTCGAAAACATGGAAGTTGATTCCATGTTGTTTGTTTCAGAAAATGCCCTTAAATTGGCATCTGTTGAGGCGTTCAATAGTACAGAACATTTAGATCCTATTTACAAAGAATGGCCTAACATAGGTGGTTTTTGGTTAGGAGGTCTAAAATATATACTTCCGTCTTATAATAGCAAACGTAAATACCGTTCTGCTATAGAAGACTTGCTTTTTGACAAAGTTGTAACTTCTGGTCTGGGTACAGTTGATGAAGATTATAAACGTTGTACAGGTGGTCACGACATAGCTGACTTAGCGTGTGCACAATATTATAATGGCATCATGGTTCTACCTGGTGTGGCTAATGATGACAAGATGACTATGTACACAGCCTCTCTTGCAGGTGGTATAACATTAGGTGCACTAGGTGGTGGTGCCGTGGCTATACCTTTTGCAGTAGCAGTTCAGGCTAGACTTAATTATGTTGCTCTACAAACTGATGTATTGAGCAAAAACCAGCAGATCCTGGCTAATGCTTTCAATCAAGCTATTGGTAACATTACACAGGCATTTGGTAAGGTTAATGATGCTATACATCAGACATCACAAGGTCTTGCCACTGTTGCTAAAGCATTGGCAAAAGTGCAAAATGTCGTTAACACACAAGGTCAAGCTTTAAGCCACCTAACTGTACAATTGCAAAATAATTTCCAAGCCATTAGTAGTTCTATTAGTGATATTTATAACAGGCTTGATGAATTGAGTGCTGATGCACAAGTTGATAGGCTGATTACAGGTAGACTTACAGCACTTAATGCATTCGTGTCTCAGACTCTAACCAGACAAGCTGAGGTTAGGGCCAGTAGACAACTTGCAAAAGACAAGGTTAATGAATGTGTTAGGTCTCAATCTCAGAGATTTGGATTCTGTGGTAATGGTACACATTTGTTTTCACTTGCTAATGCAGCACCAAATGGCATGATTTTCTTTCACTCAGTGCTATTACCAACAGCTTATGAAACCGTAACAGCTTGGTCAGGTATTTGTGCTTCAGATGGCGATCGCACTTTTGGACTCGTCGTTAAAGATGTTCAGTTGACGTTGTTTCGTAATCTAGATGACAAGTTCTATTTGACTCCCAGAACTATGTATCAGCCTAGAGCTGCAACTAGTTCAGATTTTGTTCAAATTGAGGGTTGTGATGTGTTGTTTGTCAATGCTACTGTAATTGACTTGCCTAGTATTATACCTGACTATATCGACATTAATCAGACTGTTCAAGACATATTAGAAAACTACAAACCAAACTGGACTGTACCTGAATTGACACTTGATATTTTTAACGCAACCTATTTAAATCTGACTGGTGAAATTGATGACTTAGAATTTAGGTCAGAAAAGCTACATAATACTACTGTAGAACTTGCCATTCTCATTGACAATATTAACAATACATTAGTCAATCTTGAATGGCTCAATAGAATTGAGACTTATGTGAAATGGCCCTGGTATGTGTGGCTACTAATAGGCTTAGTAGTAGTATTTTGCATACCGCTATTGCTATTTTGCTGTTGTAGTACAGGTTGCTGTGGATGCATAGGTTGTTTAGGAAGTTGTTGTCACTCTATTTGTAGTAGAAGACAATTTGAAAATTACGAACCAATTGAAAAAGTGCATGTCCACTAA |