Protein Id: AAS58177.1 |
Length: 1356 aa |
Description: Spike protein Human coronavirus NL63. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 22-Jun-04 |
Source: Human coronavirus NL63 (HCoV-NL63) |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Human coronavirus |
Host: -- |
Authors: van der Hoek;L.; Pyrc;K.; Jebbink;M.F.; Vermeulen-Oost;W.; Berkhout;R.J.; Wolthers;K.C.; Wertheim-van Dillen;P.M.; Kaandorp;J.; Spaargaren;J. and Berkhout;B. |
Title: Identification of a new human coronavirus |
Journal: Nat Med 10 (4); 368-373 (2004) |
Taxonomy: Human coronavirus NL63 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Setracovirus. |
db_xref: """taxon:277944, CDD:279880, CDD:279881, CDD:223910""" |
Sequence: MKLFLILLVLPLASCFFTCNSNANLSMLQLGVPDNSSTIVTGLLPTHWFCANQSTSVYSANGFFYIDVGNHRSAFALHTGYYDANQYYIYVTNEIGLNASVTLKICKFSRNTTFDFLSNASSSFDCIVNLLFTEQLGAPLGITISGETVRLHLYNVTRTFYVPAAYKLTKLSVKCYFNYSCVFSVVNATVTVNVTTHNGRVVNYTVCDDCNGYTDNIFSVQQDGRIPNGFPFNNWFLLTNGSTLVDGVSRLYQPLRLTCLWPVPGLKSSTGFVYFNATGSDVNCNGYQHNSVVDVMRYNLNFSANSLDNLKSGVIVFKTLQYDVLFYCSNSSSGVLDTTIPFGPSSQPYYCFINSTINTTHVSTFVGILPPTVREIVVARTGQFYINGFKYFDLGFIEAVNFNVTTASATDFWTVAFATFVDVLVNVSATNIQNLLYCDSPFEKLQCEHLQFGLQDGFYSANFLDDNVLPETYVALPIYYQHTDINFTATASFGGSCYVCKPHQVNISLNGNTSVCVRTSHFSIRYIYNRVKSGSPGDSSWHIYLKSGTCPFSFSKLNNFQKFKTICFSTVEVPGSCNFPLEATWHYTSYTIVGALYVTWSEGNSITGVPYPVSGIREFSNLVLNNCTKYNIYDYVGTGIIRSSNQSLAGGITYVSNSGNLLGFKNVSTGNIFIVTPCNQPDQVAVYQQSIIGAMTAVNESRYGLQNLLQLPNFYYVSNGGNNCTTAVMTYSNFGICADGSLIPVRPRNSSDNGISAIITANLSIPSNWTTSVQVEYLQITSTPIVVDCATYVCNGNPRCKNLLKQYTSACKTIEDALRLSAHLETNDVSSMLTFDSNAFSLANVTSFGDYNLSSVLPQRNIRSSRIAGRSALEDLLFSKVVTSGLGTVDVDYKSCTKGLSIADLACAQYYNGIMVLPGVADAERMAMYTGSLIGGMVLGGLTSAAAIPFSLALQARLNYVALQTDVLQENQKILAASFNKAINNIVASFSSVNDAITQTAEAIHTVTIALNKIQDVVNQQGSALNHLTSQLRHNFQAISNSIQAIYDRLDSIQADQQVDRLITGRLAALNAFVSQVLNKYTEVRGSRRLAQQKINECVKSQSNRYGFCGNGTHIFSIVNSAPDGLLFLHTVLLPTDYKNVKAWSGICVDGIYGYVLRQPNLVLYSDNGVFRVTSRVMFQPRLPVLSDFVQIYNCNVTFVNISRVELHTVIPDYVDVNKTLQEFAQNLPKYVKPNFDLTPFNLTYLNLSSELKQLEAKTASLFQTTVELQGLIDQINSTYVDLKLLNRFENYIKWPWWVWLIISVVFVVLLSLLVFCCLSTGCCGCCNCLTSSMRGCCDCGSTKLPYYEFEKVHVQ |
Nucleotide
Nucleotide_Id: AY567487.2 |
Length: 4071bp |
Description: Human Coronavirus NL63; complete genome |
Source: Human coronavirus NL63 (HCoV-NL63) |
Nucleotide_type: ss-RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 22-Jun-04 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Human coronavirus |
CDS: AY567487.2:20472..24542 |
Host: -- |
Authors: van der Hoek;L.; Pyrc;K.; Jebbink;M.F.; Vermeulen-Oost;W.; Berkhout;R.J.; Wolthers;K.C.; Wertheim-van Dillen;P.M.; Kaandorp;J.; Spaargaren;J. and Berkhout;B. |
Journal: Nat Med 10 (4); 368-373 (2004) |
Title: Identification of a new human coronavirus |
db_xref: taxon:277944 |
Taxonomy: Human coronavirus NL63 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Setracovirus. |
Sequence: ATGAAACTTTTCTTGATTTTGCTTGTTTTGCCCCTGGCCTCTTGCTTTTTCACATGTAATAGTAATGCTAATCTCTCTATGTTACAATTAGGTGTTCCTGACAATTCTTCAACTATTGTTACGGGTTTATTGCCAACTCATTGGTTTTGTGCTAATCAGAGTACATCTGTTTACTCAGCCAATGGTTTCTTTTATATTGATGTTGGTAATCACCGTAGTGCTTTTGCGCTCCATACTGGTTATTATGATGCTAATCAGTATTATATTTATGTTACTAATGAAATAGGCTTAAATGCTTCTGTTACTCTTAAGATTTGTAAGTTTAGTAGAAACACTACTTTTGATTTTTTAAGTAATGCTTCTAGTTCTTTTGACTGTATAGTTAATTTGTTATTTACAGAACAGTTAGGTGCGCCTTTGGGCATAACTATATCTGGTGAAACTGTGCGTCTGCATTTATATAATGTAACTCGTACTTTTTATGTGCCAGCAGCTTATAAACTTACTAAACTTAGTGTTAAATGTTACTTTAACTATTCCTGTGTTTTTAGTGTTGTCAACGCCACCGTTACTGTGAATGTCACCACACATAATGGCCGTGTAGTTAACTACACTGTTTGTGATGATTGTAATGGTTATACTGATAACATATTTTCTGTTCAACAGGATGGCCGCATTCCTAATGGTTTCCCTTTTAATAATTGGTTTTTGTTAACTAATGGTTCCACACTAGTGGACGGGGTCTCTAGACTTTATCAACCACTCCGTTTAACTTGTTTATGGCCTGTACCTGGTCTTAAATCTTCAACTGGTTTTGTTTATTTTAATGCCACTGGTTCTGATGTTAATTGTAACGGCTATCAACATAATTCTGTTGTTGATGTTATGCGTTACAATCTTAACTTCAGTGCTAATTCTTTGGACAATCTCAAGAGTGGTGTTATAGTTTTTAAAACTTTACAGTACGATGTTTTGTTTTATTGTAGTAATTCTTCCTCAGGTGTTCTTGACACCACAATACCTTTTGGCCCGTCCTCTCAACCTTATTACTGTTTTATAAACAGCACTATCAACACTACTCATGTTAGCACTTTTGTGGGTATTTTACCACCCACTGTGCGTGAAATTGTTGTTGCTAGAACTGGCCAGTTTTATATTAATGGTTTTAAGTATTTCGATTTGGGTTTCATAGAAGCTGTCAATTTTAATGTCACGACTGCTAGCGCCACAGATTTTTGGACGGTTGCATTTGCTACTTTTGTTGATGTTTTGGTTAATGTTAGTGCAACTAACATTCAAAACTTACTTTATTGCGATTCTCCATTTGAAAAGTTGCAGTGTGAGCACTTGCAGTTTGGATTGCAGGATGGTTTTTATTCTGCAAATTTTCTTGATGATAATGTTTTGCCTGAGACTTATGTTGCACTCCCCATTTATTATCAACACACGGACATAAATTTTACTGCAACTGCATCTTTTGGTGGTTCTTGTTATGTTTGTAAACCACACCAGGTTAATATATCTCTTAATGGTAACACTTCAGTGTGTGTTAGAACATCTCATTTTTCAATTAGGTATATTTATAACCGCGTTAAGAGTGGTTCACCAGGTGACTCTTCATGGCACATTTATTTAAAGAGTGGCACTTGTCCATTTTCTTTTTCTAAGTTAAATAATTTTCAAAAGTTCAAGACTATTTGTTTCTCAACCGTCGAAGTGCCTGGTAGTTGTAATTTTCCGCTTGAAGCCACCTGGCATTACACTTCTTATACTATTGTTGGTGCTTTGTATGTTACTTGGTCTGAAGGTAATTCTATTACTGGTGTACCTTATCCTGTCTCTGGTATTCGTGAGTTTAGTAATTTAGTTTTAAATAATTGTACCAAATATAATATTTATGATTATGTTGGTACTGGAATTATACGTTCTTCAAACCAGTCACTTGCTGGTGGTATTACATATGTTTCTAACTCTGGTAATTTACTTGGTTTTAAAAATGTTTCCACTGGTAACATTTTTATTGTGACACCATGTAACCAACCAGACCAAGTAGCTGTTTATCAACAAAGCATTATTGGTGCCATGACCGCTGTTAATGAGTCTAGATATGGCTTGCAAAACTTACTACAGTTACCTAACTTTTATTATGTTAGTAATGGTGGTAACAATTGCACTACGGCCGTTATGACTTATTCTAATTTTGGTATTTGTGCTGATGGTTCTTTGATTCCTGTTCGTCCGCGTAATTCTAGTGATAATGGTATTTCAGCCATAATCACTGCTAATTTATCCATTCCTTCTAACTGGACTACTTCAGTTCAAGTTGAGTACCTCCAAATTACTAGTACTCCAATAGTTGTTGATTGTGCTACTTATGTGTGTAATGGTAACCCTCGCTGTAAGAATCTACTTAAGCAGTATACTTCTGCTTGTAAAACTATTGAAGATGCCTTACGACTTAGTGCTCATTTGGAAACTAATGATGTTAGTAGTATGCTAACTTTCGATAGCAATGCTTTTAGTTTGGCTAATGTTACTAGTTTTGGAGATTATAACCTTTCTAGTGTTTTACCTCAGAGAAACATTCGTTCAAGCCGTATAGCAGGACGTAGTGCTTTGGAAGATTTGTTGTTTAGCAAAGTTGTTACATCTGGTTTGGGTACTGTTGATGTTGACTATAAGTCTTGTACTAAAGGTCTTTCTATTGCTGACCTTGCTTGTGCTCAGTACTACAATGGCATAATGGTTTTGCCAGGTGTTGCTGATGCTGAACGTATGGCCATGTACACAGGTTCTCTTATAGGTGGCATGGTGCTCGGAGGTCTTACATCAGCAGCCGCCATACCTTTTTCTTTGGCACTGCAAGCACGACTTAACTATGTTGCTTTACAAACTGATGTGCTTCAAGAAAATCAGAAAATTTTGGCTGCATCATTTAATAAGGCTATTAATAATATTGTTGCTTCTTTTAGTAGCGTTAATGATGCTATTACACAAACTGCAGAGGCTATACATACTGTTACTATTGCACTTAATAAGATTCAGGATGTTGTTAATCAACAGGGTAGTGCTCTTAACCATCTCACTTCACAATTGAGACATAATTTTCAGGCCATTTCTAATTCAATTCAGGCTATTTATGACCGGCTTGATTCAATTCAAGCCGATCAACAAGTTGACAGATTAATTACTGGACGGCTTGCAGCTTTGAATGCATTTGTTTCCCAAGTTTTGAATAAATATACTGAAGTTCGTGGTTCAAGACGCTTAGCACAGCAGAAGATTAATGAATGTGTCAAGTCACAATCTAATAGATATGGTTTTTGTGGCAATGGCACTCACATCTTTTCAATCGTCAACTCAGCTCCAGATGGTTTGCTTTTTCTTCATACTGTTTTGCTGCCAACTGATTACAAGAATGTAAAGGCGTGGTCTGGTATCTGTGTTGATGGCATTTATGGCTATGTTCTGCGTCAACCTAACTTGGTTCTTTATTCTGATAATGGTGTCTTTCGTGTAACTTCCAGGGTCATGTTTCAACCTCGCTTACCTGTTTTGTCTGATTTTGTGCAAATATATAATTGTAATGTTACTTTTGTTAACATATCTCGTGTTGAGTTACATACTGTCATACCTGACTACGTTGATGTTAATAAAACATTACAAGAGTTTGCACAAAACTTACCAAAGTATGTTAAGCCTAATTTTGACTTGACTCCTTTTAATTTAACATATCTTAATTTGAGTTCTGAGTTGAAGCAACTCGAAGCTAAAACTGCTAGTCTTTTTCAAACTACTGTTGAATTACAAGGTCTTATTGATCAGATTAACAGTACATATGTTGATTTGAAGTTGCTTAATAGGTTTGAAAATTATATCAAATGGCCTTGGTGGGTTTGGCTCATTATTTCTGTTGTTTTTGTTGTATTGTTGAGTCTTCTTGTGTTTTGTTGTCTTTCTACAGGTTGTTGTGGTTGTTGCAATTGTTTAACTTCATCAATGCGAGGCTGTTGTGATTGTGGTTCAACTAAACTTCCTTATTACGAATTTGAAAAGGTCCACGTTCAATAA |