| Protein Id: AAX84792.1 |
Length: 1361 aa |
| Description: spike glycoprotein Human coronavirus OC43. |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 26-May-05 |
| Source: Human coronavirus OC43 (HCoV-OC43) |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Human coronavirus |
| Host: -- |
Authors: Vijgen;L.; Keyaerts;E.; Lemey;P.; Moes;E.; Li;S.; Vandamme;A.M. and Van Ranst;M. |
| Title: Circulation of genetically distinct contemporary human coronavirus OC43 strains |
Journal: Virology 337 (1); 85-92 (2005) |
| Taxonomy: Human coronavirus OC43 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
| db_xref: """taxon:31631, CDD:293060, CDD:286493, CDD:279881""" |
| Sequence: MFLILLISLPTAFAVIGDLNCPLDTRLKGSFNNRDTGPPSISTDTVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLFLNGYYPTSGSTYRNMALKGTDKLSTLWFKPPFLSDFINGIFAKVKNTKVFKDGVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPRTINSTQDGVNKLQGLLEVSVCQYNMCEYPHTICHPKLGNHFKELWHLDTGVVSCLYKRNFTYDVNATYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGFVTKFLFNVYLGMALSHYYVMPLTCISRLDIGFTLEYWVTPLTSRQYLLAFNQDGIIFNAVDCMSDFMSEIKCKTQSIAPPTGVYELNGYTVQPIADVYRRKPDLPNCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNRRKVDLQLGNLGYLQSSNYRIDTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNKRFGFIEDSVFVPQPTGVFTNHSVVYAQHCFKAPKNFCPCKLNGSCPGKNNGIGTCPAGTNYLTCDNLCTLDPITFKAPGTYKCPQTKSLVGIGEHCSGLAVKSDYCGNNSCTCQPQAFLGWSADSCLQGDKCNIFANFILHDVNNGLTCSTDLQKANTEIELGVCVNYDLYGISGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYITNRTFMIRSCYSGRVSAAYHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNSLTRQLQPINYSFDSYLGCVVNAYNSTAISVQTCDLTVGSGYCVDYSKNRRSRRAITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMEEFIQTSSPKVTIDCAAFVCGDYAACKLQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVLGCLGSECSKASSRSAIEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYKGIKVLPPLLSENQISGYTLAATSASLFPPWTAAAGVPFYLNVQYRINGLGVTMDVLSQNQKLIANAFNNALHAIQQGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISASLQEILSRLDALEAEAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFNYVPTKYVTAKVSPGLCIAGNRGIAPKSGYFVNVNNTWMYTGSGYYYPEPITENNVVVMSTCAVNYTKAPYVMLNTSIPNLPDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQVEMNRLQEAIKVLNHSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLICLAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGYQELVIKTSHDD |
Nucleotide
| Nucleotide_Id: AY903455.1 |
Length: 4086bp |
| Description: Human coronavirus OC43 strain 34364 Belgium 2004 spike glycoprotein (S) gene; complete cds |
Source: Human coronavirus OC43 (HCoV-OC43) |
| Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 26-May-05 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Human coronavirus |
| CDS: AY903455.1:1..4086 |
Host: -- |
| Authors: Vijgen;L.; Keyaerts;E.; Lemey;P.; Moes;E.; Li;S.; Vandamme;A.M. and Van Ranst;M. |
Journal: Virology 337 (1); 85-92 (2005) |
| Title: Circulation of genetically distinct contemporary human coronavirus OC43 strains |
db_xref: taxon:31631 |
| Taxonomy: Human coronavirus OC43 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
| Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4086); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4086); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4086); strand=1); type='CDS') |
| Sequence: ATGTTTTTGATACTTTTAATTTCCTTACCAACGGCTTTTGCTGTTATAGGAGATTTAAATTGTCCTTTAGATACTAGGCTTAAAGGTAGCTTTAATAATAGAGACACCGGTCCTCCTTCTATAAGTACTGATACTGTTGATGTTACTAATGGTTTGGGTACTTATTATGTTTTAGATCGTGTGTATTTAAATACTACGTTGTTTCTTAATGGTTATTACCCCACTTCAGGTTCCACATATCGTAATATGGCACTGAAGGGAACTGACAAATTGAGCACATTATGGTTTAAACCACCATTTCTTTCTGATTTTATTAATGGTATTTTTGCTAAGGTCAAAAATACCAAGGTTTTTAAAGATGGTGTAATGTATAGTGAGTTCCCTGCTATAACTATAGGTAGTACTTTTGTAAATACATCCTATAGTGTGGTAGTACAACCACGTACAATTAATTCAACACAGGATGGTGTTAATAAATTACAAGGTCTTTTAGAGGTCTCTGTTTGCCAGTATAATATGTGTGAGTACCCACATACGATTTGTCATCCTAAATTGGGTAACCACTTCAAAGAACTATGGCATTTGGATACAGGTGTTGTTTCCTGTTTATATAAGCGTAATTTCACATATGATGTGAATGCTACTTATTTGTATTTTCATTTTTATCAAGAAGGTGGTACTTTTTATGCATATTTTACAGACACTGGTTTTGTTACTAAGTTTTTGTTTAATGTTTATTTAGGCATGGCACTTTCACACTATTATGTCATGCCTCTGACTTGTATTAGTAGGCTTGATATTGGTTTTACTTTAGAATATTGGGTTACACCCCTCACTTCTAGACAATATTTACTCGCTTTCAATCAAGATGGTATTATTTTTAATGCTGTTGATTGTATGAGTGATTTTATGAGTGAGATTAAGTGTAAAACACAATCTATAGCACCACCTACTGGTGTTTATGAATTAAACGGTTACACTGTTCAGCCAATCGCAGATGTTTACCGACGCAAACCTGATCTTCCCAATTGCAATATAGAAGCTTGGCTTAATGATAAGTCGGTGCCCTCTCCATTAAATTGGGAACGTAAGACATTTTCAAATTGTAATTTTAATATGAGCAGCCTGATGTCTTTTATTCAGGCAGACTCATTTACTTGTAATAATATTGATGCTGCTAAGATATATGGTATGTGTTTTTCCAGCATAACTATAGATAAGTTTGCTATACCCAATCGCAGGAAGGTTGACCTACAATTGGGCAATTTGGGCTATTTGCAGTCATCCAACTATAGAATTGATACTACTGCAACAAGTTGTCAGTTGTATTATAATTTACCTGCTGCTAATGTCTCTGTTAGCAGGTTTAATCCTTCTACTTGGAATAAGAGATTTGGTTTTATAGAAGATTCTGTTTTTGTGCCTCAACCTACAGGTGTTTTTACTAATCACAGTGTAGTTTATGCACAACACTGTTTCAAAGCCCCTAAAAATTTCTGTCCGTGTAAATTGAATGGTTCCTGTCCTGGTAAAAATAATGGTATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGTGATAATTTATGTACGCTTGATCCTATTACATTTAAAGCTCCAGGTACTTATAAGTGCCCCCAAACTAAATCTTTAGTTGGTATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCTTGCTGTTAAAAGTGATTATTGTGGAAACAATTCTTGTACTTGCCAACCACAAGCATTTTTGGGTTGGTCTGCAGACTCTTGTTTACAAGGAGACAAGTGTAATATTTTTGCTAATTTCATTTTACATGATGTTAATAATGGTCTTACTTGTTCTACTGATTTACAAAAAGCTAACACAGAAATAGAACTTGGTGTTTGTGTTAATTATGACCTCTATGGTATTTCAGGCCAAGGCATTTTTGTTGAGGTTAATGCGACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTTTTATATGATTCTAATGGTAACCTCTACGGTTTTAGAGACTACATAACAAACAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGCTATAGCGGTCGTGTTTCTGCGGCCTATCATGCCAACTCTTCCGAACCAGCATTGCTATTTCGGAATATTAAATGCAACTACGTTTTTAATAATAGTCTTACACGACAGCTGCAACCCATTAACTATTCGTTTGATAGTTATCTTGGTTGTGTTGTCAATGCTTATAATAGTACTGCTATTTCTGTTCAAACATGTGATCTCACAGTAGGTAGTGGTTACTGTGTGGATTACTCTAAAAACAGACGAAGTCGTAGAGCGATCACCACTGGTTATCGGTTTACTAATTTTGAGCCATTTACTGTTAATTCAGTAAATGATAGTTTGGAACCTGTAGGTGGTTTGTATGAAATTCAAATACCTTCAGAGTTTACTATAGGTAATATGGAGGAGTTTATTCAAACAAGCTCTCCCAAAGTTACTATTGATTGTGCTGCATTTGTCTGTGGTGATTATGCAGCATGTAAATTACAGTTGGTTGAATATGGTAGTTTCTGTGATAACATTAATGCCATACTCACAGAAGTAAATGAACTACTTGATACTACACAGTTGCAAGTAGCTAATAGTTTAATGAATGGTGTTACTCTTAGCACTAAGCTTAAAGATGGTGTTAATTTCAATGTAGACGACATCAATTTTTCCCCTGTATTAGGTTGTCTAGGCAGCGAATGTAGTAAAGCTTCCAGTAGATCTGCTATAGAGGATTTACTTTTTGATAAAGTAAAGTTATCTGATGTCGGTTTCGTTGAGGCTTATAATAATTGTACAGGAGGTGCCGAAATTAGGGACCTCATTTGTGTGCAAAGTTATAAAGGCATCAAAGTGTTGCCCCCACTGCTCTCAGAAAATCAGATCAGTGGATATACTTTGGCTGCCACCTCTGCTAGTCTATTTCCTCCTTGGACAGCAGCAGCAGGTGTACCATTTTATTTAAATGTTCAGTATCGCATTAATGGGCTTGGTGTCACCATGGATGTGCTAAGTCAAAATCAAAAGCTTATTGCTAATGCATTTAACAATGCCCTTCATGCTATTCAGCAAGGGTTCGATGCAACTAATTCTGCTTTAGTTAAAATTCAAGCTGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCTCTTAATAACTTATTGCAACAACTCTCTAATAGATTTGGTGCTATAAGTGCTTCTTTACAAGAAATTCTATCTAGACTTGATGCTCTTGAAGCGGAAGCTCAGATAGATAGACTTATTAATGGTCGTCTCACCGCTCTTAATGCTTATGTTTCTCAACAGCTTAGTGATTCTACACTGGTAAAATTTAGTGCAGCACAAGCTATGGAGAAGGTTAATGAATGTGTCAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTCTGTGGTAATGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCATATGGTTTGTATTTTATCCACTTTAATTATGTCCCTACTAAGTATGTCACAGCGAAGGTTAGTCCTGGTCTGTGCATTGCTGGTAATAGAGGTATAGCTCCTAAGAGTGGTTATTTTGTTAATGTAAATAATACTTGGATGTACACTGGTAGTGGTTACTACTACCCTGAACCTATAACTGAAAATAATGTTGTTGTTATGAGTACCTGCGCTGTTAATTATACTAAAGCGCCGTATGTAATGCTGAACACTTCAATACCCAACCTTCCTGATTTTAAGGAAGAGTTGGACCAATGGTTCAAAAATCAAACATCAGTGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATAAATGTTACATTCTTGGACCTACAAGTTGAAATGAATAGGTTACAGGAGGCAATAAAAGTCTTAAATCATAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACATATGAATATTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATCTGCCTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGTTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGTTTTAAGAAATGTGGTGGTTGTTGTGATGATTATACTGGATACCAGGAGTTAGTAATCAAAACTTCACATGACGACTAA |