| Protein Id: ABD96188.1 |
Length: 1356 aa |
| Description: spike glycoprotein Human coronavirus HKU1. |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 11-Jun-06 |
| Source: Human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1) |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Human coronavirus |
| Host: -- |
Authors: Lau;S.K.; Woo;P.C.; Yip;C.C.; Tse;H.; Tsoi;H.W.; Cheng;V.C.; Lee;P.; Tang;B.S.; Cheung;C.H.; Lee;R.A.; So;L.Y.; Lau;Y.L.; Chan;K.H. and Yuen;K.Y. |
| Title: Coronavirus HKU1 and Other Coronavirus Infections in Hong Kong |
Journal: J Clin Microbiol 44 (6); 2063-2071 (2006) |
| Taxonomy: Human coronavirus HKU1 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
| db_xref: """taxon:290028, CDD:293060, CDD:286493, CDD:279880, CDD:279881""" |
| Sequence: MLLIIFILPTTLAVIGDFNCTNFAINDLNTTVPRISEYVVDVSYGLGTYYILDRVYLNTTILFTGYFPKSGANFRDLSLKGTTYLSTLWYQKPFLSDFNNGIFSRVKNTKLYVNKTLYSEFSTIVIGSVFINNSYTIVVQPHNGVLEITACQYTMCEYPHTICKSKGSSRNESWHFDKSEPLCLFKKNFTYNVSTDWLYFHFYQERGTFYAYYADSGMPTTFLFSLYFGTLLSHYYVLPLTCNAISSNTDNETLQYWVTPLSKRQYLLKFDNRGVITNAVDCSSSFFSEIQCKTKSLLPNTGVYDLSGFTVKPVATVHRRIPDLPDCDIDKWLNNFNVPSPLNWERKIFSNCNFNLSTLLRLVHTDSFSCNNFDESKIYGSCFKSIVLDKFAIPNSRRSDLQLGSSGFLQSSNYKIDTTSSSCQLYYSLPAINVTINNYNPSFWNRRYGFNNFNLSSHSVVYSRYCFSVNNTFCPCAKPSFASSCKSHKPPSASCPIGTNYRSCESTTVLDHTDWCRCSCLPDPITAYDPRSCSQKKSLVGVGEHCAGFGVDEEKCGVLDGSYNVSCLCSTDAFLGWSYDTCVSNNLCNIFSNFILNGINSGTTCSNDLLQPNTEVFTDVCVDYDLYGITGQGIFKEVSAVYYNSWQNLLYDSNGNIIGFKDFVTNKTYNIFPCYAGRVSAAFHQNASSLALLYRNLKCSYVLNNISLTTQPYFDSYLGCVFNADNLTDYSVSSCALRMGSGFCVDYNSPSSSSSRRKRRSISASYRFVTFEPFNVSFVNDSIESVGGLYEIKIPTNFTIVGQEEFIQTNSPKVTIDCSLFVCSNYAACHDLLSEYGTFCDNINSILDEVNGLLDTTQLHVADTLMQGVTLSSNLNTNLHFDVDNINFKSLVGCLGPHCGSSSRSFFEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGSEIRDLLCVQSFNGIKVLPPILSESQISGYTTAATVAAMFPPWSAAAGIPFSLNVQYRINGLGVTMDVLNKNQKLIATAFNNALLSIQNGFSATNSALAKIQSVVNSNAQALNSLLQQLFNKFGAISSSLQEILSRLDALEAQVQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDISLVKFGAALAMEKVNECVKSQSPRINFCGNGNHILSLVQNAPYGLLFMHFSYKPISFKTVLVSPGLCISGDVGIAPKQGYFIKHNDHWMFTGSSYYYPEPISDKNVVFMNTCSVNFTKAPLVYLNHSVPKLSDFESELSHWFKNQTSIAPNLTLNLHTINATFLDLYYEMNLIQESIKSLNNSYINLKDIGTYEMYVKWPWYVWLLISFSFIIFLVLLFFICCCTGCGSACFSKCHNCCDEYGGHHDFVIKTSHDD |
Nucleotide
| Nucleotide_Id: DQ437609.1 |
Length: 4071bp |
| Description: Human coronavirus HKU1 strain N14 spike glycoprotein (S) gene; complete cds |
Source: Human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1) |
| Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 11-Jun-06 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Human coronavirus |
| CDS: DQ437609.1:1..4071 |
Host: -- |
| Authors: Lau;S.K.; Woo;P.C.; Yip;C.C.; Tse;H.; Tsoi;H.W.; Cheng;V.C.; Lee;P.; Tang;B.S.; Cheung;C.H.; Lee;R.A.; So;L.Y.; Lau;Y.L.; Chan;K.H. and Yuen;K.Y. |
Journal: J Clin Microbiol 44 (6); 2063-2071 (2006) |
| Title: Coronavirus HKU1 and Other Coronavirus Infections in Hong Kong |
db_xref: taxon:290028 |
| Taxonomy: Human coronavirus HKU1 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
| Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4071); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4071); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4071); strand=1); type='CDS') |
| Sequence: ATGTTATTAATTATTTTTATTTTGCCTACAACATTAGCTGTTATAGGTGATTTTAATTGTACTAATTTTGCTATTAATGATTTAAACACCACAGTTCCTCGCATAAGTGAGTATGTTGTGGATGTTTCTTATGGTTTGGGTACATATTATATACTTGATCGTGTTTATTTAAATACTACTATATTATTTACTGGTTATTTCCCTAAATCTGGTGCCAATTTTAGGGATCTATCTTTAAAAGGTACTACATATTTGAGTACTCTTTGGTATCAGAAACCCTTTTTATCTGATTTTAATAATGGTATTTTTTCTAGAGTTAAGAATACTAAGTTGTATGTTAATAAAACTTTGTATAGTGAGTTTAGTACTATAGTTATAGGTAGTGTTTTTATTAACAACTCTTATACTATTGTTGTTCAACCTCATAATGGTGTTTTGGAGATTACAGCTTGTCAATACACTATGTGTGAGTATCCTCATACTATTTGTAAATCTAAAGGTAGTTCTCGTAATGAATCTTGGCATTTTGATAAATCTGAACCTTTGTGTCTGTTCAAGAAAAATTTTACTTATAATGTTTCTACAGATTGGTTGTATTTTCATTTTTATCAAGAACGTGGCACTTTTTATGCTTATTATGCTGATTCTGGCATGCCTACTACTTTTTTATTTAGTTTGTATTTTGGTACTCTTTTATCTCATTATTATGTTTTGCCTTTGACTTGTAATGCTATATCTTCTAATACTGATAATGAGACTTTACAATATTGGGTCACACCTTTGTCTAAACGCCAATATCTTCTTAAATTTGACAACCGTGGTGTTATTACTAATGCTGTTGATTGTTCTAGTAGTTTCTTTAGCGAGATTCAATGTAAAACTAAATCTTTATTACCTAATACTGGTGTTTATGACTTATCTGGTTTTACTGTTAAGCCTGTTGCAACTGTACATCGTCGTATTCCTGATTTACCTGATTGTGACATTGATAAATGGCTTAACAATTTTAATGTACCCTCACCTCTTAATTGGGAACGTAAAATTTTTTCTAATTGCAACTTTAATTTGAGTACTTTGCTTCGTTTAGTTCATACTGATTCTTTTTCTTGTAATAATTTTGATGAATCTAAGATATATGGTAGTTGTTTTAAGAGTATTGTTTTAGATAAATTTGCCATACCCAACTCCAGACGATCTGATTTGCAGTTGGGCAGTTCTGGTTTTCTGCAATCTTCTAATTATAAAATTGACACTACTTCTAGTTCTTGTCAATTGTATTATAGTTTGCCTGCAATTAATGTTACTATTAATAATTATAATCCTTCTTTTTGGAATAGAAGGTATGGTTTTAATAATTTTAATTTGAGCTCTCATAGTGTTGTTTACTCACGTTATTGTTTTTCTGTTAATAATACTTTTTGTCCTTGTGCTAAACCTTCTTTTGCTTCAAGTTGCAAGAGTCATAAACCACCTTCTGCTTCCTGTCCTATTGGTACTAATTATCGTTCTTGTGAGAGTACTACTGTACTCGACCACACTGACTGGTGTAGGTGTTCTTGTTTACCTGATCCTATAACTGCTTATGACCCTAGGTCTTGTTCTCAAAAAAAGTCTCTGGTTGGTGTTGGTGAACATTGTGCAGGGTTCGGTGTTGATGAAGAAAAGTGTGGTGTATTGGATGGATCATATAATGTTTCTTGTCTTTGTAGTACTGATGCCTTTCTAGGTTGGTCTTATGACACTTGCGTCAGTAACAACCTTTGTAATATTTTTTCTAATTTTATTTTAAATGGTATCAATAGTGGTACCACTTGTTCTAATGATTTATTGCAGCCTAATACTGAAGTTTTTACTGATGTTTGTGTTGATTACGACCTTTATGGTATTACAGGACAAGGTATTTTTAAAGAAGTTTCTGCTGTTTATTATAATAGTTGGCAAAATCTTTTGTATGATTCTAATGGCAACATTATTGGTTTTAAAGATTTTGTTACTAATAAAACATATAATATTTTCCCTTGTTATGCAGGAAGAGTTTCTGCTGCTTTTCATCAAAATGCTTCCTCTTTGGCTTTACTTTATCGTAATTTAAAATGTAGCTATGTTTTGAATAATATTTCTTTAACTACTCAGCCATATTTTGATAGTTATCTTGGTTGCGTTTTTAATGCTGATAATTTAACTGATTATTCTGTTTCTTCTTGTGCTCTTCGCATGGGTAGTGGTTTTTGTGTTGATTATAACTCACCTTCTTCTTCCTCTTCGCGTCGTAAACGTAGAAGTATTTCTGCTTCTTATCGTTTTGTTACTTTTGAACCCTTTAATGTCAGTTTTGTTAATGACAGTATTGAGTCTGTGGGTGGTCTTTATGAGATCAAAATTCCCACTAACTTTACTATAGTTGGTCAAGAGGAATTTATTCAAACTAATTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTTCTTTATTTGTCTGTTCTAATTATGCAGCTTGCCATGACTTATTGTCAGAGTATGGCACTTTTTGTGATAATATTAATAGTATTTTAGATGAAGTTAATGGTTTACTTGATACTACTCAATTGCATGTAGCTGATACTCTTATGCAAGGTGTCACACTTAGCTCCAATCTTAATACTAATTTGCATTTTGATGTTGATAATATTAATTTTAAATCCCTAGTTGGATGTTTAGGTCCACACTGCGGTTCTTCTTCTCGTTCTTTTTTTGAAGATTTATTGTTTGACAAAGTTAAACTTTCAGATGTTGGTTTTGTTGAAGCTTATAACAATTGTACTGGTGGTAGTGAAATTAGAGATCTTCTTTGTGTACAATCCTTTAATGGTATTAAAGTTTTGCCTCCTATTTTGTCTGAATCTCAAATTTCTGGTTACACCACAGCCGCTACTGTTGCTGCTATGTTTCCACCATGGTCAGCAGCAGCTGGCATACCATTTTCTCTTAATGTACAATATAGAATTAATGGTTTGGGTGTTACTATGGATGTTCTTAATAAAAATCAAAAGTTGATAGCTACTGCTTTTAATAATGCTCTTCTTTCTATTCAGAATGGTTTTAGTGCTACCAACTCTGCACTTGCTAAAATACAAAGTGTTGTTAATTCTAATGCTCAAGCACTTAATAGTTTGTTACAGCAATTATTTAATAAATTTGGTGCAATTAGTTCTTCTTTACAAGAAATTTTATCTCGTCTCGATGCTTTAGAGGCTCAGGTTCAGATTGATAGGCTTATTAATGGTCGTTTAACTGCTTTAAATGCTTATGTCTCTCAACAGCTTAGTGATATTTCTCTTGTAAAATTTGGTGCTGCTTTAGCTATGGAGAAGGTTAATGAGTGTGTTAAAAGTCAATCTCCTCGTATTAATTTTTGTGGTAATGGTAATCATATTTTGTCATTAGTTCAAAATGCTCCTTATGGTTTGTTGTTTATGCATTTTAGTTATAAACCTATTTCTTTTAAAACTGTTTTAGTAAGTCCTGGTTTGTGTATATCAGGTGATGTAGGTATTGCACCTAAACAAGGGTATTTTATTAAACATAATGATCATTGGATGTTCACTGGTAGTTCTTACTATTATCCTGAACCAATTTCAGATAAAAATGTTGTTTTTATGAATACTTGTTCTGTTAATTTTACTAAAGCGCCTCTTGTTTATTTGAATCATTCTGTACCAAAATTGTCTGATTTTGAATCTGAGTTATCTCATTGGTTTAAAAATCAAACATCCATTGCGCCTAATTTGACTTTAAATCTTCATACTATTAATGCTACTTTTTTAGATTTGTATTATGAGATGAATCTTATTCAAGAGTCTATTAAGTCTTTGAATAATAGTTATATCAATCTTAAAGATATAGGTACATATGAAATGTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTACTAATTTCTTTTTCATTTATAATATTCCTTGTATTGCTCTTTTTTATATGTTGTTGTACTGGTTGTGGTTCTGCATGTTTTAGTAAATGTCATAATTGTTGTGATGAGTATGGTGGTCATCATGATTTTGTTATCAAAACATCTCATGATGATTAG |