| Protein Id: YP_173238.1 |
Length: 1356 aa |
| Description: spike glycoprotein Human coronavirus HKU1. |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 25-Aug-20 |
| Source: Human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1) |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Human coronavirus |
| Host: Homo sapiens |
Authors: Woo;P.C.; Lau;S.K.; Chu;C.M.; Chan;K.H.; Tsoi;H.W.; Huang;Y.; Wong;B.H.; Poon;R.W.; Cai;J.J.; Luk;W.K.; Poon;L.L.; Wong;S.S.; Guan;Y.; Peiris;J.S. and Yuen;K.Y. |
| Title: Characterization and complete genome sequence of a novel coronavirus; coronavirus HKU1; from patients with pneumonia |
Journal: J Virol 79 (2); 884-895 (2005) |
| Taxonomy: Human coronavirus HKU1 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
| db_xref: """taxon:290028, CDD:293060, CDD:286493, CDD:279880, CDD:279881, GeneID:3200426""" |
| Sequence: MLLIIFILPTTLAVIGDFNCTNFAINDLNTTVPRISEYVVDVSYGLGTYYILDRVYLNTTILFTGYFPKSGANFRDLSLKGTTYLSTLWYQKPFLSDFNNGIFSRVKNTKLYVNKTLYSEFSTIVIGSVFINNSYTIVVQPHNGVLEITACQYTMCEYPHTICKSKGSSRNESWHFDKSEPLCLFKKNFTYNVSTDWLYFHFYQERGTFYAYYADSGMPTTFLFSLYLGTLLSHYYVLPLTCNAISSNTDNETLQYWVTPLSKRQYLLKFDNRGVITNAVDCSSSFFSEIQCKTKSLLPNTGVYDLSGFTVKPVATVHRRIPDLPDCDIDKWLNNFNVPSPLNWERKIFSNCNFNLSTLLRLVHTDSFSCNNFDESKIYGSCFKSIVLDKFAIPNSRRSDLQLGSSGFLQSSNYKIDTTSSSCQLYYSLPAINVTINNYNPSSWNRRYGFNNFNLSSHSVVYSRYCFSVNNTFCPCAKPSFASSCKSHKPPSASCPIGTNYRSCESTTVLDHTDWCRCSCLPDPITAYDPRSCSQKKSLVGVGEHCAGFGVDEEKCGVLDGSYNVSCLCSTDAFLGWSYDTCVSNNRCNIFSNFILNGINSGTTCSNDLLQPNTEVFTDVCVDYDLYGITGQGIFKEVSAVYYNSWQNLLYDSNGNIIGFKDFVTNKTYNIFPCYAGRVSAAFHQNASSLALLYRNLKCSYVLNNISLTTQPYFDSYLGCVFNADNLTDYSVSSCALRMGSGFCVDYNSPSSSSSRRKRRSISASYRFVTFEPFNVSFVNDSIESVGGLYEIKIPTNFTIVGQEEFIQTNSPKVTIDCSLFVCSNYAACHDLLSEYGTFCDNINSILDEVNGLLDTTQLHVADTLMQGVTLSSNLNTNLHFDVDNINFKSLVGCLGPHCGSSSRSFFEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGSEIRDLLCVQSFNGIKVLPPILSESQISGYTTAATVAAMFPPWSAAAGIPFSLNVQYRINGLGVTMDVLNKNQKLIATAFNNALLSIQNGFSATNSALAKIQSVVNSNAQALNSLLQQLFNKFGAISSSLQEILSRLDALEAQVQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDISLVKFGAALAMEKVNECVKSQSPRINFCGNGNHILSLVQNAPYGLLFMHFSYKPISFKTVLVSPGLCISGDVGIAPKQGYFIKHNDHWMFTGSSYYYPEPISDKNVVFMNTCSVNFTKAPLVYLNHSVPKLSDFESELSHWFKNQTSIAPNLTLNLHTINATFLDLYYEMNLIQESIKSLNNSYINLKDIGTYEMYVKWPWYVWLLISFSFIIFLVLLFFICCCTGCGSACFSKCHNCCDEYGGHHDFVIKTSHDD |
Nucleotide
| Nucleotide_Id: NC_006577.2 |
Length: 4071bp |
| Description: Human coronavirus HKU1; complete genome |
Source: Human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1) |
| Nucleotide_type: ss-RNA |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 20-Nov-20 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Human coronavirus |
| CDS: NC_006577.2:22942..27012 |
Host: Homo sapiens |
| Authors: Woo;P.C.; Lau;S.K.; Chu;C.M.; Chan;K.H.; Tsoi;H.W.; Huang;Y.; Wong;B.H.; Poon;R.W.; Cai;J.J.; Luk;W.K.; Poon;L.L.; Wong;S.S.; Guan;Y.; Peiris;J.S. and Yuen;K.Y. |
Journal: J Virol 79 (2); 884-895 (2005) |
| Title: Characterization and complete genome sequence of a novel coronavirus; coronavirus HKU1; from patients with pneumonia |
db_xref: taxon:290028; GeneID:3200429; GeneID:3200429; GeneID:3200429; GeneID:3200425; GeneID:3200425; GeneID:3200426; GeneID:3200426; GeneID:3200427; GeneID:3200427; GeneID:3200430; GeneID:3200430; GeneID:3200428; GeneID:3200428; GeneID:3200423; GeneID:3200423; GeneID:3200424; GeneID:3200424 |
| Taxonomy: Human coronavirus HKU1 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
| Sequence: ATGTTATTAATTATTTTTATTTTGCCTACAACATTAGCTGTTATAGGTGATTTTAATTGTACTAATTTTGCTATTAATGATTTAAACACCACAGTTCCTCGCATAAGTGAGTATGTTGTGGATGTTTCTTATGGTTTGGGTACATATTATATACTTGATCGTGTTTATTTAAATACTACTATATTATTTACTGGTTATTTCCCTAAATCTGGTGCCAATTTTAGGGATCTATCTTTAAAAGGTACTACATATTTGAGTACTCTTTGGTATCAGAAACCCTTTTTATCTGATTTTAATAATGGTATTTTTTCTAGAGTTAAGAATACTAAGTTGTATGTTAATAAAACTTTGTATAGTGAGTTTAGTACTATAGTTATAGGTAGTGTTTTTATTAACAACTCTTATACTATTGTTGTTCAACCTCATAATGGTGTTTTGGAGATTACAGCTTGTCAATACACTATGTGTGAGTATCCTCATACTATTTGTAAATCTAAAGGTAGTTCTCGTAATGAATCTTGGCATTTTGATAAATCTGAACCTTTGTGTCTGTTCAAGAAAAATTTTACTTATAATGTTTCTACAGATTGGTTGTATTTTCATTTTTATCAAGAACGTGGCACTTTTTATGCTTATTATGCTGATTCTGGCATGCCTACTACTTTTTTATTTAGTTTGTATCTTGGTACTCTTTTATCTCATTATTATGTTTTGCCTTTGACTTGTAATGCTATATCTTCTAATACTGATAATGAGACTTTACAATATTGGGTCACACCTTTGTCTAAACGCCAATATCTTCTTAAATTTGACAACCGTGGTGTTATTACTAATGCTGTTGATTGTTCTAGTAGTTTCTTTAGCGAGATTCAATGTAAAACTAAATCTTTATTACCTAATACTGGTGTTTATGACTTATCTGGTTTTACTGTTAAGCCTGTTGCAACTGTACATCGTCGTATTCCTGATTTACCTGATTGTGACATTGATAAATGGCTTAACAATTTTAATGTACCCTCACCTCTTAATTGGGAACGTAAAATTTTTTCTAATTGCAACTTTAATTTGAGTACTTTGCTTCGTTTAGTTCATACTGATTCTTTTTCTTGTAATAATTTTGATGAATCTAAGATATATGGTAGTTGTTTTAAGAGTATTGTTTTAGATAAATTTGCCATACCCAACTCCAGACGATCTGATTTGCAGTTGGGCAGTTCTGGTTTTCTGCAATCTTCTAATTATAAAATTGACACTACTTCTAGTTCTTGTCAATTGTATTATAGTTTGCCTGCAATTAATGTTACTATTAATAATTATAATCCTTCTTCTTGGAATAGAAGGTATGGTTTTAATAATTTTAATTTGAGCTCTCATAGTGTTGTTTACTCACGTTATTGTTTTTCTGTTAATAATACTTTTTGTCCTTGTGCTAAACCTTCTTTTGCTTCAAGTTGCAAGAGTCATAAACCACCTTCTGCTTCCTGTCCTATTGGTACTAATTATCGTTCTTGTGAGAGTACTACTGTACTCGACCACACTGACTGGTGTAGGTGTTCTTGTTTACCTGATCCTATAACTGCTTATGACCCTAGGTCTTGTTCTCAAAAAAAGTCTCTGGTTGGTGTTGGTGAACATTGTGCAGGGTTCGGTGTTGATGAAGAAAAGTGTGGTGTATTGGATGGATCATATAATGTTTCTTGTCTTTGTAGTACTGATGCCTTTCTAGGTTGGTCTTATGACACTTGCGTCAGTAACAACCGTTGTAATATTTTTTCTAATTTTATTTTAAATGGTATCAATAGTGGTACCACTTGTTCTAATGATTTATTGCAGCCTAATACTGAAGTTTTTACTGATGTTTGTGTTGATTACGACCTTTATGGTATTACAGGACAAGGTATTTTTAAAGAAGTTTCTGCTGTTTATTATAATAGTTGGCAAAATCTTTTGTATGATTCTAATGGCAACATTATTGGTTTTAAAGATTTTGTTACTAATAAAACATATAATATTTTCCCTTGTTATGCAGGAAGAGTTTCTGCTGCTTTTCATCAAAATGCTTCCTCTTTGGCTTTACTTTATCGTAATTTAAAATGTAGCTATGTTTTGAATAATATTTCTTTAACTACTCAGCCATATTTTGATAGTTATCTTGGTTGCGTTTTTAATGCTGATAATTTAACTGATTATTCTGTTTCTTCTTGTGCTCTTCGCATGGGTAGTGGTTTTTGTGTTGATTATAACTCACCTTCTTCTTCCTCTTCGCGTCGTAAACGTAGAAGTATTTCTGCTTCTTATCGTTTTGTTACTTTTGAACCCTTTAATGTCAGTTTTGTTAATGACAGTATTGAGTCTGTGGGTGGTCTTTATGAGATCAAAATTCCCACTAACTTTACTATAGTTGGTCAAGAGGAATTTATTCAAACTAATTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTTCTTTATTTGTCTGTTCTAATTATGCAGCTTGCCATGACTTATTGTCAGAGTATGGCACTTTTTGTGATAATATTAATAGTATTTTAGATGAAGTTAATGGTTTACTTGATACTACTCAATTGCATGTAGCTGATACTCTTATGCAAGGTGTCACACTTAGCTCCAATCTTAATACTAATTTGCATTTTGATGTTGATAATATTAATTTTAAATCCCTAGTTGGATGTTTAGGTCCACACTGCGGTTCTTCTTCTCGTTCTTTTTTTGAAGATTTATTGTTTGACAAAGTTAAACTTTCAGATGTTGGTTTTGTTGAAGCTTATAACAATTGTACTGGTGGTAGTGAAATTAGAGATCTTCTTTGTGTACAATCCTTTAATGGTATTAAAGTTTTGCCTCCTATTTTGTCTGAATCTCAAATTTCTGGTTACACCACAGCCGCTACTGTTGCTGCTATGTTTCCACCATGGTCAGCAGCAGCTGGCATACCATTTTCTCTTAATGTACAATATAGAATTAATGGTTTGGGTGTTACTATGGATGTTCTTAATAAAAATCAAAAGTTGATAGCTACTGCTTTTAATAATGCTCTTCTTTCTATTCAGAATGGTTTTAGTGCTACCAACTCTGCACTTGCTAAAATACAAAGTGTTGTTAATTCTAATGCTCAAGCACTTAATAGTTTGTTACAGCAATTATTTAATAAATTTGGTGCAATTAGTTCTTCTTTACAAGAAATTTTATCTCGTCTCGATGCTTTAGAGGCTCAGGTTCAGATTGATAGGCTTATTAATGGTCGTTTAACTGCTTTAAATGCTTATGTCTCTCAACAGCTTAGTGATATTTCTCTTGTAAAATTTGGTGCTGCTTTAGCTATGGAGAAGGTTAATGAGTGTGTTAAAAGTCAATCTCCTCGTATTAATTTTTGTGGTAATGGTAATCATATTTTGTCATTAGTTCAAAATGCTCCTTATGGTTTGTTGTTTATGCATTTTAGTTATAAACCTATTTCTTTTAAAACTGTTTTAGTAAGTCCTGGTTTGTGTATATCAGGTGATGTAGGTATTGCACCTAAACAAGGGTATTTTATTAAACATAATGATCATTGGATGTTCACTGGTAGTTCTTACTATTATCCTGAACCAATTTCAGATAAAAATGTTGTTTTTATGAATACTTGTTCTGTTAATTTTACTAAAGCGCCTCTTGTTTATTTGAATCATTCTGTACCAAAATTGTCTGATTTTGAATCTGAGTTATCTCATTGGTTTAAAAATCAAACATCCATTGCGCCTAATTTGACTTTAAATCTTCATACTATTAATGCTACTTTTTTAGATTTGTATTATGAGATGAATCTTATTCAAGAGTCTATTAAGTCTTTGAATAATAGTTATATCAATCTTAAAGATATAGGTACATATGAAATGTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTACTAATTTCTTTTTCATTTATAATATTCCTTGTATTGCTCTTTTTTATATGTTGTTGTACTGGTTGTGGTTCTGCATGTTTTAGTAAATGTCATAATTGTTGTGATGAGTATGGTGGTCATCATGATTTTGTTATCAAAACATCTCATGATGATTAG |