Protein Id: AAY21244.1 |
Length: 1162 aa |
Description: spike protein Infectious bronchitis virus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 2-May-05 |
Source: Infectious bronchitis virus |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Infectious bronchitis virus |
Host: -- |
Authors: Fang;S.; Shen;S.; Tay;F.P. and Liu;D. |
Title: Selection of and recombination between minor variants leads to the adaptation of an avian to primate cells |
Journal: Unpublished |
Taxonomy: Infectious bronchitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
db_xref: """taxon:11120, CDD:279880, CDD:279881""" |
Sequence: MLVTPLLLVTLLCALCSAVLYDSSSYVYYYQSAFRPPNGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSPGCIVGTIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAHCNFSDTTVFVTHCYKYDGCPITGMLQKNFIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYPTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNETTDVTSAGVYFKAGGPITYKVMREVKALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFINSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHNFTFHNETGANPNPSGVQNIQTYQTQTAQSGYYNFNFSFLSSFVYKESNFMYGSYHPSCNFRLETINNGLWFNSLSVSIAYGPLQGGCKQSVFSGRATCCYAYSYGGPSLCKGVYSGELDLNFECGLLVYVTKSGGSRIQTATEPPVITQHNYNNITLNTCVDYNIYGRTGQGFITNVTDSAVSYNYLADAGLAILDTSGSIDIFVVQGEYGLNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQLLENQFYIKITNGTRRFRRSITENVANCPYVSYGKFCIKPDGSIATIVPKQLEQFVAPLFNVTENVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYVCGSSLDCRKLFQQYGPVCDNILSVVNSVGQKEDMELLNFYSSTKPAGFNTPVLSNVSTGEFNISLLLTTPSSRRRRSVIEDLLFTSVESVGLPTDDAYKNCTAGPLGFLKDLACAREYNGLLVLPPIITAEMQALYTSSLVASMAFGGITAAGAIPFATQLQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQIQDVVSKQSAILTETMASLNKNFGAISSVIQEIYQQLDAIQANAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQAEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSIRYSFCGNGRHVLTIPQNAPNGIVFIHFSYTPDSFVNVTAIVGFCVKPANASQYAIVPSNGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRAITAGDVVTLTSCQANYVIVNKTVITTFVDNDDFDFNDELSKWWNDTKHELPDFDKFNYTVPILDIDSEIDRIQGVIQGLNDSLIDLEKLSILKTYIKWPWYVWLAIAFATIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIMPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV |
Nucleotide
Nucleotide_Id: DQ001336.1 |
Length: 3489bp |
Description: Avian infectious bronchitis virus strain Beaudette spike protein mRNA; complete cds |
Source: Infectious bronchitis virus |
Nucleotide_type: mRNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 2-May-05 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Infectious bronchitis virus |
CDS: DQ001336.1:1..3489 |
Host: -- |
Authors: Fang;S.; Shen;S.; Tay;F.P. and Liu;D. |
Journal: Unpublished |
Title: Selection of and recombination between minor variants leads to the adaptation of an avian to primate cells |
db_xref: taxon:11120 |
Taxonomy: Infectious bronchitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3489); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3489); strand=1); type='CDS') |
Sequence: ATGTTGGTAACACCTCTTTTACTAGTGACTCTTTTGTGTGCACTATGTAGTGCTGTTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTTTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTAATGGTTGGCATTTACACGGGGGTGCTTATGCGGTAGTTAATATTTCTAGCGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCACCTGGGTGTATTGTTGGTACTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCACACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAATATGATGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAAAAGAATTTTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTCTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGAGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAAAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGATCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTATTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACAATTTCACTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCTAATCCTAGTGGTGTTCAGAATATTCAAACTTACCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTTTCCTTTCTGAGTAGTTTTGTTTATAAGGAGTCTAATTTTATGTATGGATCTTATCACCCAAGTTGTAATTTTAGACTAGAAACTATTAATAATGGCTTGTGGTTTAATTCACTTTCAGTTTCAATTGCTTACGGTCCTCTTCAAGGTGGTTGCAAGCAATCTGTCTTTAGTGGTAGAGCAACTTGTTGTTATGCTTATTCATATGGAGGTCCTTCGCTGTGTAAAGGTGTTTATTCAGGTGAGTTAGATCTTAATTTTGAATGTGGACTGTTAGTTTATGTTACTAAGAGCGGTGGCTCTCGTATACAAACAGCCACTGAACCGCCAGTTATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAACTGGCCAAGGTTTTATTACTAATGTAACCGACTCAGCTGTTAGTTATAATTATCTAGCAGACGCAGGTTTGGCTATTTTAGATACATCTGGTTCCATAGACATCTTTGTTGTACAAGGTGAATATGGTCTTAATTATTATAAGGTTAACCCTTGCGAAGATGTCAACCAGCAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACTTCACGTAATGAGACTGGTTCTCAGCTTCTTGAGAACCAGTTTTACATCAAAATCACTAATGGAACACGTCGTTTTAGACGTTCTATTACTGAAAATGTTGCAAATTGCCCTTATGTTAGTTATGGTAAGTTTTGTATAAAACCTGATGGCTCAATTGCCACAATAGTACCAAAACAATTGGAACAGTTTGTGGCACCTTTATTTAATGTTACTGAAAATGTGCTCATACCTAACAGTTTCAACTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACGCGTATGGATAAGGTCCAAATTAATTGCCTGCAGTATGTTTGTGGCAGTTCTCTGGATTGTAGAAAGTTGTTTCAACAATATGGGCCTGTTTGCGACAACATATTGTCTGTAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTGAATTTCTATTCTTCTACTAAACCGGCTGGTTTTAATACACCAGTTCTTAGTAATGTTAGCACTGGTGAGTTTAATATTTCTCTTCTGTTAACAACTCCTAGTAGTCGTAGAAGGCGTTCTGTTATTGAAGACCTTCTATTTACAAGCGTTGAATCTGTTGGACTACCAACAGATGACGCATATAAAAATTGCACTGCAGGACCTTTAGGCTTTCTTAAGGACCTTGCGTGTGCTCGTGAATATAATGGTTTGCTTGTGTTGCCTCCTATTATAACAGCAGAAATGCAAGCTTTGTATACTAGTTCTCTAGTAGCTTCTATGGCTTTTGGTGGTATTACTGCAGCTGGTGCTATACCTTTTGCCACACAACTGCAGGCTAGAATTAATCACTTGGGTATTACCCAGTCACTTTTGTTGAAGAATCAAGAAAAAATTGCTGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGAAGTACATCTCTAGCATTACAACAAATTCAAGATGTTGTTAGTAAACAGAGTGCTATTCTTACTGAGACTATGGCATCACTTAATAAAAATTTTGGTGCTATTTCTTCTGTGATTCAAGAAATCTACCAGCAATTAGACGCCATACAAGCAAATGCTCAAGTGGATCGTCTTATAACTGGTAGATTGTCATCACTTTCTGTTTTAGCATCTGCTAAGCAGGCGGAGTATATTAGAGTGTCACAACAGCGTGAGTTAGCTACTCAGAAAATTAATGAGTGTGTTAAGTCACAGTCTATTAGGTACTCCTTTTGTGGTAATGGACGACATGTTCTAACCATACCGCAAAATGCACCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTTCTTATACTCCAGATAGTTTTGTTAATGTTACTGCAATAGTGGGTTTTTGTGTAAAGCCAGCTAATGCTAGTCAGTATGCAATAGTGCCCTCTAATGGTAGGGGTATTTTTATACAAGTTAATGGTAGTTACTACATCACTGCACGAGATATGTATATGCCAAGAGCTATTACTGCAGGAGATGTAGTTACGCTTACTTCTTGTCAAGCAAATTATGTAATTGTAAATAAGACCGTCATTACTACATTCGTAGACAATGATGATTTTGATTTTAATGACGAATTGTCAAAATGGTGGAATGATACTAAGCATGAGCTACCAGACTTTGACAAATTCAATTACACAGTACCTATACTTGACATTGATAGTGAAATTGATCGTATTCAAGGCGTTATACAGGGTCTTAATGACTCTCTAATAGACCTTGAAAAACTTTCAATACTCAAAACTTATATTAAGTGGCCTTGGTATGTGTGGTTAGCCATAGCTTTTGCCACTATTATCTTCATCTTAATACTAGGATGGGTTTTCTTCATGACTGGATGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGCATTATGCCTCTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTATTACACGACTTTTGATAACGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTGA |