Protein Id: AAZ09202.1 |
Length: 1166 aa |
Description: spike glycoprotein Infectious bronchitis virus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 26-May-06 |
Source: Infectious bronchitis virus |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Infectious bronchitis virus |
Host: chicken |
Authors: Liu;S.W.; Zhang;Q.X.; Chen;J.D.; Han;Z.X.; Liu;X.; Feng;L.; Shao;Y.H.; Rong;J.G.; Kong;X.G. and Tong;G.Z. |
Title: Genetic diversity of avian infectious bronchitis coronavirus strains isolated in China between 1995 and 2004 |
Journal: Arch Virol 151 (6); 1133-1148 (2006) |
Taxonomy: Infectious bronchitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
db_xref: """taxon:11120, CDD:279880, CDD:279881""" |
Sequence: MLGKSLFIVTLLFALCSAALFDNNETVYYYQSAFRPADGWHLHGGAYAVVNVSLETNNAGTASQCIAGAISWSKNFSASAVAMTAPELGMTWSTGQFCTAHCNFSDFTVLVTHCFKHGNGLCPLTGLIPSGFIRVSAMRKGSNSLFYNLTVSVTKYPRFKSLQCVNNYTSVYLNGDLVFTSNETKPVSAAGVSFKAGGPITYKTMSEVKVLAYFVNGTAQTVIPCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPYTNSSLVKERFIVYRESSVNTTLVLTNFTFSNVSNAPPNTGGVHSIVLHQTQTTQSGYYNFNFSFLSSFRYVESDFMYGSYHPKCSFRLETINNGLWFNSLSVSLGYGPLQGGCKQSVFNNMATCCYAYSYSGPTLCKGVYSGQLQKTFECGLLVFVTKSDGSRIQTRNEPLVLTQHNYNNITLNKCVEYNIYGRVGQGLITNITDSAANHGYLADGGLAVLDTSGAIDVFVAQGVYGLTYYKVNPCEDVNQQFVVSGGQLVGILTSRNETGSQPIENRFYVKFPNSRRRTGRSTIANVTNCPYVSYGKFCIKPDGSVSEIVPQEIEHFVAPLLNVTEHVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKIQINCRQYVCGNSIECRKLFQQYGPVCDNILSVVNTVGQREDMELLSFYSSTKPKDYNIPIFSNVSTGDFNISLLLTPPNSPTGRSFIEDILFTSVESVGLPTDAEYKKCTAGPLGTLKDLICAREYNGLLVLPPIITADMQTMYTASLVGAMAFGGITSAAAIPFATQIQARINHLGITQSLLMKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQVQDVVNKQSAILTETMNSLNKNFGAISSVIQDIYAQLDAIQADAQVDRLITGRLPSLSVLASAKQSEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSNRYGFCGSGRHVLSIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFVNVTAIVGFCVNPPNASQYALAPANGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVSVNRTVITTFVDNDDFDFDDELSKWWNDTKHELPDFDEFNYTIPVLNISNEIDRIQEVIQGLNDSLIDLEALSILKTYIKWPWYVWLAIAFLTIIFILVLCWIFFMTGCCGCCCGCFGVMPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV |
Nucleotide
Nucleotide_Id: DQ068701.1 |
Length: 3501bp |
Description: Infectious bronchitis virus isolate Chicken/China/LDL97I/97 spike glycoprotein (S) gene; complete cds |
Source: Infectious bronchitis virus |
Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 26-May-06 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Infectious bronchitis virus |
CDS: DQ068701.1:1..3501 |
Host: chicken |
Authors: Liu;S.W.; Zhang;Q.X.; Chen;J.D.; Han;Z.X.; Liu;X.; Feng;L.; Shao;Y.H.; Rong;J.G.; Kong;X.G. and Tong;G.Z. |
Journal: Arch Virol 151 (6); 1133-1148 (2006) |
Title: Genetic diversity of avian infectious bronchitis coronavirus strains isolated in China between 1995 and 2004 |
db_xref: taxon:11120 |
Taxonomy: Infectious bronchitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3501); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3501); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3501); strand=1); type='CDS') |
Sequence: ATGTTGGGGAAGTCACTGTTTATAGTGACTCTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCCGCTTTGTTTGATAATAATGAAACCGTTTACTACTACCAAAGTGCCTTTAGACCGGCTGATGGATGGCATTTGCATGGTGGTGCTTATGCAGTAGTAAACGTTTCTTTAGAAACTAATAATGCAGGCACAGCTTCACAATGCATTGCAGGGGCTATTTCTTGGAGTAAAAATTTCTCTGCTTCTGCTGTAGCCATGACTGCACCTGAGTTAGGGATGACGTGGTCAACTGGGCAATTCTGCACGGCTCACTGTAACTTCTCGGATTTTACAGTGCTCGTTACGCATTGTTTTAAACACGGTAACGGTCTATGCCCGCTAACAGGGCTTATTCCAAGTGGATTTATTCGTGTTTCTGCTATGAGGAAGGGAAGTAATTCCTTGTTTTATAATTTAACAGTTTCTGTGACTAAATATCCTAGATTTAAGTCGCTTCAATGTGTTAATAATTATACATCTGTGTACTTAAATGGTGATCTTGTGTTCACTTCTAATGAAACTAAACCTGTTAGTGCAGCAGGTGTTTCTTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTACAAGACTATGAGTGAAGTTAAAGTCCTAGCTTATTTTGTCAATGGAACCGCACAAACTGTTATTCCTTGTGATGGTTCACCTAGAGGCTTGTTAGCTTGTCAGTATAATACAGGCAATTTTTCAGATGGTTTCTACCCTTACACTAATAGTAGTTTAGTTAAGGAAAGGTTTATTGTTTATAGAGAAAGTAGTGTTAACACTACCTTAGTGTTAACTAATTTTACTTTCTCAAATGTTAGTAACGCCCCTCCTAATACAGGTGGTGTTCATAGTATTGTTCTACATCAAACACAAACAACTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTCTCCTTTCTGAGTAGTTTCCGTTATGTAGAATCAGATTTTATGTATGGGTCATACCACCCAAAATGTTCATTTAGACTAGAAACTATTAATAATGGTTTGTGGTTTAATTCACTTTCGGTTTCTCTTGGTTACGGTCCACTACAGGGTGGTTGTAAGCAATCTGTGTTTAATAATATGGCAACTTGTTGTTATGCTTATTCATATAGTGGTCCCACACTATGTAAAGGTGTTTATAGTGGTCAGTTACAAAAAACTTTTGAGTGTGGGTTGCTGGTTTTTGTGACTAAGAGCGATGGCTCTCGTATACAAACTAGAAATGAACCACTTGTGTTAACTCAGCACAATTACAATAATATTACTTTAAATAAGTGTGTTGAGTATAATATATATGGCAGAGTTGGCCAAGGTCTTATTACTAACATAACAGATTCAGCTGCTAATCATGGCTATTTGGCAGATGGCGGGTTGGCTGTTTTAGATACTTCAGGTGCCATAGACGTTTTTGTTGCACAAGGTGTTTATGGCCTAACTTACTATAAGGTTAATCCCTGTGAAGATGTTAACCAACAATTTGTAGTCTCTGGTGGACAGTTAGTTGGCATACTTACATCTCGTAATGAAACTGGTTCTCAACCTATTGAGAACCGGTTTTATGTTAAATTTCCTAATAGTAGACGTCGCACGGGACGTTCTACTATAGCTAATGTCACAAATTGCCCTTATGTAAGTTATGGTAAGTTTTGTATAAAACCGGATGGTTCAGTTTCAGAAATAGTACCACAAGAAATTGAACATTTTGTGGCACCTTTGCTTAATGTTACAGAACATGTGCTCATACCTAATAGTTTTAATTTGACTGTTACAGATGAGTACATACAAACACGTATGGATAAAATTCAAATTAATTGTCGTCAATATGTTTGTGGTAACTCTATTGAGTGCAGAAAGTTGTTCCAGCAATATGGTCCTGTCTGTGACAACATATTGTCTGTAGTAAATACTGTTGGTCAAAGGGAGGATATGGAACTTTTGAGTTTTTATTCTTCTACTAAACCAAAAGATTATAATATACCAATTTTTAGTAATGTTAGTACGGGTGATTTTAATATATCTCTCTTGCTAACACCACCCAATAGTCCTACTGGGCGTTCTTTTATTGAAGATATTTTATTTACAAGCGTCGAATCTGTTGGGTTACCGACTGATGCTGAATATAAAAAATGCACAGCGGGACCTTTGGGTACCCTTAAAGATCTTATCTGTGCTAGGGAATATAATGGTTTATTAGTGTTGCCTCCAATCATTACGGCGGATATGCAAACAATGTATACCGCGTCTTTAGTAGGTGCTATGGCTTTTGGTGGTATTACATCAGCTGCAGCTATACCTTTTGCTACTCAGATTCAGGCAAGAATTAATCATCTTGGTATTACACAGTCTTTGTTAATGAAAAACCAAGAAAAGATTGCTGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGAAGCACTTCGCTAGCATTACAACAGGTTCAAGATGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACGGAAACTATGAATTCTCTTAATAAGAATTTTGGTGCTATTTCATCAGTCATTCAAGACATTTACGCGCAACTTGATGCAATTCAAGCAGATGCACAAGTTGACCGCCTTATTACTGGTAGACTCCCTTCTCTCTCAGTGCTAGCCTCTGCTAAGCAGTCTGAGTACATTAGAGTTTCCCAACAGCGTGAATTAGCCACTCAAAAAATTAATGAGTGTGTTAAATCACAATCTAATAGGTATGGATTTTGTGGTAGTGGAAGACATGTTCTTTCGATACCACAGAATGCGCCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTATACTCCAGAGAGTTTTGTTAATGTTACTGCAATAGTGGGTTTTTGTGTAAACCCACCTAATGCTAGTCAGTATGCATTGGCGCCCGCTAATGGTAGGGGCATTTTTATACAAGTTAATGGTAGTTACTACATCACTGCACGTGATATGTATATGCCAAGGGACATAACAGCAGGAGACATAGTTACATTGACTTCTTGTCAAGCGAATTATGTAAGTGTAAATAGGACCGTCATTACTACGTTTGTAGATAATGATGATTTTGATTTTGATGATGAATTGTCAAAATGGTGGAATGATACTAAACATGAGCTACCAGACTTTGACGAGTTTAATTACACCATTCCAGTGTTGAATATTAGTAATGAGATTGACAGAATTCAAGAAGTAATACAGGGGCTTAATGACTCTCTTATTGATCTTGAAGCACTTTCAATACTCAAGACTTATATTAAATGGCCTTGGTATGTGTGGCTTGCCATTGCATTCCTTACCATTATCTTCATTCTGGTACTCTGTTGGATATTTTTCATGACCGGTTGTTGCGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGTGTCATGCCTTTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTACTACACCACTTTTGATAACGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA |