Protein Id: ABE68839.3 |
Length: 1169 aa |
Description: spike glycoprotein Infectious bronchitis virus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 2-Jul-20 |
Source: Infectious bronchitis virus |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Infectious bronchitis virus |
Host: -- |
Authors: Toro;H.; van Santen;V.L.; Li;L.; Lockaby;S.B.; van Santen;E. and Hoerr;F.J. |
Title: Epidemiological and experimental evidence for immunodeficiency affecting avian infectious bronchitis |
Journal: Avian Pathol 35 (6); 455-464 (2006) |
Taxonomy: Infectious bronchitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
db_xref: """taxon:11120, CDD:279880, CDD:279881""" |
Sequence: MLVKSLFLVTILFALCSANLYDNESFVYYYQSAFRPGHGWHLHGGAYAVVNVSSENNNAGTASSCTAGAIGYSKNFSAASVAMTAPLSGMSWSTNSFCTAHCNFTSYIVFVTHCYKSGSNSCPLTGLIPSGYIRIAAMKHGSAMPGHLFYNLTVSVTKYSKFRSLQCVNNHTSVYLNGDLVFTSNYTEDVVAAGVHFKSGGPITYKVMREVKALAYFVNGTAHDVILCDDTPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNTSIVKDKFIVYRESSVNTTLTLTNFTFSNESGAPPNTGGVDSFILYQTQTAQSGYYNFNFSFLSSFVYRESDYMYGSYHPRCSFRPETLNNGLWFNSLSVSLTYGPIQGGCKQSVFNGKATCCYAYSYRGPRVCKGVYRGELTQYFECGLLVYVTKSDGSRIQTATQPPVLTQNFYNNITLGKCVDYNVYGRTGQGFITNVTDLATSHNYLEDGGLAILDTSGAIDIFVVQGAYGPNYYKVNLCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQPLENQFYIKITNGTHRFRRSVNENVTNCPYVSYGKFCIKPDGSVSPIVPKELEQFVAPLLNVTGNVLIPNSFNLTVTDEYIQTHMDKIQINCLQYVCGNSLACKKLFQQXGPVCDNILSVVNSVGQKEDMEFLSFYSSTKPSGFNTPVFSNLSTGEFNISLLLTTPSSPRGRSFIEDLLFTSVESVGLPTDEAYKKCTAGPLGFLKDLACAREYNGLLVLPPIITAEMQTLYTSSLVASMAFGGITSAGAIPFATQLQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQIQDVVNKQSAILTETMLALNKNFGAISSVIQDIYQQLDDIQADAQVDRIITGRLSSLSVLASAKQSEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSIRYSFCGNGRHVLTIPQSAPNGIVFIHFTYTPESFINVTAVVGFCVSPANASQYAIVPANGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVSVNKTVITTFVDNDDFDFDGELSKWWNETKHELPDFDQFNYTIPVLNITYDIDKIEEVIKGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIFFAIIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV |
Nucleotide
Nucleotide_Id: DQ458217.3 |
Length: 3510bp |
Description: Infectious bronchitis virus isolate AL/4614/98 spike glycoprotein (S) gene; complete cds |
Source: Infectious bronchitis virus |
Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 2-Jul-20 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Infectious bronchitis virus |
CDS: DQ458217.3:1..3510 |
Host: -- |
Authors: Toro;H.; van Santen;V.L.; Li;L.; Lockaby;S.B.; van Santen;E. and Hoerr;F.J. |
Journal: Avian Pathol 35 (6); 455-464 (2006) |
Title: Epidemiological and experimental evidence for immunodeficiency affecting avian infectious bronchitis |
db_xref: taxon:11120 |
Taxonomy: Infectious bronchitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3510); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3510); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3510); strand=1); type='CDS') |
Sequence: ATGTTGGTGAAGTCACTGTTTCTAGTGACCATTTTGTTTGCACTATGTAGTGCTAATTTATATGACAACGAATCTTTTGTGTATTACTACCAGAGTGCTTTTAGGCCAGGACATGGTTGGCATTTACATGGAGGTGCTTATGCAGTGGTTAATGTGTCTAGTGAAAATAATAATGCAGGTACTGCCTCAAGTTGCACTGCTGGTGCTATTGGCTACAGTAAGAATTTCAGTGCGGCCTCAGTAGCCATGACTGCACCACTAAGTGGTATGTCATGGTCTACCAATTCATTTTGTACAGCCCACTGTAATTTTACTTCTTATATAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAGAGCGGATCTAATAGTTGTCCTTTGACAGGTCTTATTCCGAGCGGTTATATTCGTATTGCTGCTATGAAACATGGAAGTGCTATGCCTGGTCACTTATTTTATAATTTAACAGTTTCTGTGACTAAATATTCTAAGTTTAGATCGCTACAATGTGTTAATAATCATACTTCTGTATATTTAAATGGTGACCTTGTTTTCACATCTAACTATACTGAAGATGTTGTAGCTGCAGGTGTCCATTTTAAAAGTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAGGTTAAAGCCTTGGCTTATTTTGTCAATGGTACTGCACATGATGTCATTCTATGTGATGACACACCTAGAGGTTTGTTAGCATGCCAATATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTCTATCCTTTTACTAATACTAGTATTGTTAAGGATAAGTTTATTGTTTATCGTGAAAGTAGTGTCAATACTACTTTAACATTAACTAATTTCACGTTTAGTAATGAAAGTGGTGCCCCTCCTAATACAGGTGGTGTTGACAGTTTTATTTTATACCAGACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTTTCATTTCTGAGTAGTTTTGTTTATAGAGAAAGTGATTATATGTATGGATCTTATCATCCACGTTGTAGTTTTAGACCTGAAACCCTTAATAATGGTTTGTGGTTTAATTCCCTTTCTGTTTCATTAACATACGGTCCCATTCAAGGTGGTTGTAAGCAATCTGTATTTAATGGTAAAGCAACTTGTTGTTATGCTTATTCATATAGAGGACCTCGTGTTTGTAAAGGTGTCTATAGAGGTGAGCTAACACAGTATTTTGAATGTGGTTTGTTAGTTTATGTTACTAAGAGCGATGGCTCCCGTATACAAACTGCAACACAACCACCTGTATTAACTCAAAATTTTTATAATAACATTACTTTGGGTAAGTGTGTTGATTATAATGTTTATGGTAGAACTGGACAAGGTTTTATTACTAATGTAACTGATTTAGCTACTTCTCATAATTATTTAGAGGATGGAGGATTGGCTATTTTAGATACATCTGGTGCCATAGACATCTTCGTTGTACAAGGTGCATATGGCCCTAACTACTATAAGGTTAATTTATGTGAAGATGTTAACCAACAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACTTCGCGTAATGAAACTGGTTCTCAGCCTCTTGAAAACCAGTTTTACATTAAAATCACTAATGGAACACATCGTTTTAGACGTTCTGTTAATGAAAATGTTACNAATTGCCCTTATGTTAGTTATGGCAAGTTTTGTATAAAACCTGATGGTTCAGTTTCTCCTATAGTACCAAAAGAACTTGAACAGTTTGTGGCACCTTTACTTAATGTTACTGGAAATGTGCTCATACCTAACAGTTTTAATTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACGCATATGGATAAGATCCAAATTAATTGTCTGCAGTATGTTTGTGGCAACTCTTTGGCGTGTAAAAAGTTGTTTCAACAANATGGGCCTGTTTGTGACAACATATTGTCTGTAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAATTTTTAAGCTTCTACTCTTCTACTAAACCATCTGGTTTTAATACACCAGTTTTTAGTAATCTTAGCACTGGTGAGTTTAATATCTCTCTTTTGTTAACAACCCCTAGTAGTCCTAGAGGGCGTTCTTTTATTGAAGATCTTTTATTTACAAGTGTCGAATCTGTTGGATTACCAACAGATGAAGCTTACAAAAAGTGCACTGCAGGACCTTTAGGCTTTCTTAAAGACCTTGCATGTGCTCGTGAATATAATGGTTTGCTTGTGTTGCCTCCTATTATAACAGCAGAAATGCAAACTTTGTATACTAGTTCTCTAGTAGCTTCTATGGCTTTTGGTGGTATTACTTCAGCTGGTGCTATACCTTTTGCCACACAGCTGCAGGCTAGAATTAATCACTTGGGTATTACCCAGTCACTTTTGTTGAAGAATCAAGAAAAAATTGCTGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGGAGTACATCTCTAGCATTACAACAAATTCAAGATGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACTGAGACTATGTTAGCACTTAATAAAAATTTTGGTGCTATTTCTTCTGTGATTCAAGACATTTACCAGCAACTTGATGATATACAAGCAGATGCTCAAGTGGATCGAATCATAACTGGTAGATTGTCATCACTTTCTGTCTTAGCATCTGCTAAGCAGTCGGAGTACATTAGAGTGTCACAACAGCGTGAGTTAGCTACTCAGAAAATTAATGAGTGTGTTAAATCACAGTCTATTAGGTATTCCTTTTGTGGTAATGGACGACATGTTTTAACCATACCACAAAGTGCCCCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTATACACCAGAGAGCTTTATTAATGTTACTGCAGTAGTAGGTTTTTGTGTAAGTCCTGCTAATGCTAGTCAGTACGCAATAGTGCCCGCTAATGGTAGGGGTATTTTTATACAAGTTAATGGTAGTTACTACATCACTGCACGTGATATGTATATGCCAAGAGATATTACTGCAGGAGATATAGTTACGCTTACTTCTTGTCAAGCAAATTATGTAAGTGTAAACAAGACCGTCATTACTACATTTGTAGACAATGATGATTTTGATTTTGATGGCGAGTTATCAAAATGGTGGAATGAAACTAAGCACGAGTTGCCAGACTTTGACCAGTTTAATTACACCATTCCTGTTTTAAATATAACTTATGATATTGACAAGATTGAGGAAGTTATTAAGGGACTTAATGATTCCTTGATTGACCTCGAAACATTGTCAATTCTCAAAACTTATATTAAGTGGCCTTGGTATGTTTGGTTAGCCATATTCTTCGCCATTATTATATTCATCCTAATATTAGGGTGGGTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGCATTATTCCTCTAATGAGCAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTATTACACGACTTTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA |