Protein

Protein Id:  ABE68840.3 Length:   1169 aa
Description:   spike glycoprotein Infectious bronchitis virus. Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   2-Jul-20
Source:   Infectious bronchitis virus
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Infectious bronchitis virus
Host:   -- Authors:   Toro;H.; van Santen;V.L.; Li;L.; Lockaby;S.B.; van Santen;E. and Hoerr;F.J.
Title:   Epidemiological and experimental evidence for immunodeficiency affecting avian infectious bronchitis Journal:   Avian Pathol 35 (6); 455-464 (2006)
Taxonomy:   Infectious bronchitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus.
db_xref:   """taxon:11120, CDD:279880, CDD:279881"""
Sequence:   MLVKSLFLVTILFALCSANLYDNESFVYYYQSAFRPGHGWHLHGGAYAVVNVSSENNNAGTAPSCTAGAIGYSKNFSAASVAMTAPLSGMSWSANSFCTAHCNFTSYIVFVTHCYKSGPNSCPLTGLIPSGYIRIAAMKHGSAMPGNLFYNLTVSVTKYPKFRSLQCVNNYTSVYLNGDLVFTSNYTEDVVAAGVHFKSGGPITYKVMREVKALAYFVNGTAHDVILCDDTPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNTSIVKDKFIVYRESSVNTTLTLTNFTFSNESGAPPNTGGVDSFILYQTQTAQSGYYNFNFSFLSSFVYTESYYMYGSYHPRCSFTPETLNNGLWFNSLSVSLTYGPIQGGCKQSVFNGKATCCYAYSYGGPHGCKGVYRGELTQYFECGLLVYVTKSDGSRIQTATQPPVLTQNFYNNINLGKCVDYNIYGRIGQGLITNVTDLAVSYNYLSDAGLAILDTSGAIDIFVVQGEYGPNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQLLENQFYIKITNGTRRSRRSVTENVTNCPYVSYGKFCIKPDGSISVIVPKELDQFVAPLLNVTEYVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKIQINCLQYVCGNSLACRKLFQQYGPVCDNILSVVNSVGQKEDMELLNFYSSTKPARFNTPVFSNLSTGEFNISLLLTPPSSPRRRSFIEDLLFTSVESVGLPTDDAYKMCTAGPLGFLKDLACAREYNGLLVLPPIITAEMQTLYTSSLVASMAFGGITAAGAIPFATQLQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQIQDVVNKQSAILTETMAALNKNFGAISSVIQDIYQQLDSIQADAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQSEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSIRYSFCGNGRHVLTIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFINVTAIVGFCVSPANASQYAIVPANGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVSVNKTVITTFVDNDDFDFADELSKWWNDTKHELPDFDKFNYTVPILDIDSEIDRIQGVIQGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIAFATIIFILILGWLFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV

Nucleotide

Nucleotide_Id:  DQ458218.3 Length:   3510bp
Description:   Infectious bronchitis virus isolate AL/7149/00 spike glycoprotein (S) gene; complete cds Source:   Infectious bronchitis virus
Nucleotide_type:   RNA Molecule type:   linear
Data category:   VRL Date:   2-Jul-20
Class virus:   Coronaviridae Virus name:   Infectious bronchitis virus
CDS:   DQ458218.3:1..3510 Host:   --
Authors:   Toro;H.; van Santen;V.L.; Li;L.; Lockaby;S.B.; van Santen;E. and Hoerr;F.J. Journal:   Avian Pathol 35 (6); 455-464 (2006)
Title:   Epidemiological and experimental evidence for immunodeficiency affecting avian infectious bronchitis db_xref:   taxon:11120
Taxonomy:   Infectious bronchitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus.
Features:   SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3510); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3510); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3510); strand=1); type='CDS')
Sequence:   ATGTTGGTGAAGTCACTGTTTCTAGTGACCATTTTGTTTGCACTATGTAGTGCTAATTTATATGACAACGAATCTTTTGTGTATTACTACCAGAGTGCTTTTAGGCCAGGACATGGTTGGCATTTACATGGAGGTGCTTATGCAGTAGTTAATGTGTCTAGTGAAAATAATAATGCAGGTACTGCCCCAAGTTGCACTGCTGGTGCTATTGGCTACAGTAAGAATTTCAGTGCGGCCTCAGTAGCCATGACTGCACCACTAAGTGGTATGTCATGGTCTGCCAACTCTTTTTGTACAGCCCACTGTAATTTTACTTCTTATATAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAGAGCGGACCTAATAGTTGTCCTTTGACAGGTCTTATTCCAAGCGGTTATATTCGTATTGCTGCTATGAAACATGGAAGTGCTATGCCTGGTAACTTATTTTATAATTTAACAGTTTCTGTGACTAAATATCCTAAGTTTAGATCGCTACAATGTGTTAATAATTATACTTCTGTATATTTAAATGGTGACCTTGTTTTCACATCTAACTATACTGAAGATGTTGTAGCTGCAGGTGTCCATTTTAAAAGTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAGGTTAAAGCCTTGGCTTATTTTGTCAATGGTACTGCACATGATGTCATTCTATGTGATGACACACCTAGAGGTTTGTTAGCATGCCAATATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTCTATCCTTTTACTAATACTAGTATTGTTAAGGATAAGTTTATTGTTTATCGTGAAAGTAGTGTCAATACTACTTTAACATTAACTAATTTCACGTTTAGTAATGAAAGTGGTGCCCCTCCTAATACAGGTGGTGTTGACAGTTTTATTTTATACCAGACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAACTTTTCATTTCTGAGTAGTTTTGTTTATACGGAAAGTTATTATATGTATGGATCTTACCATCCACGTTGTAGTTTTACACCTGAAACCCTTAATAATGGTTTGTGGTTTAATTCCCTTTCTGTTTCATTAACATACGGTCCCATTCAAGGTGGTTGTAAGCAATCTGTATTTAATGGTAAAGCAACTTGTTGTTATGCTTATTCATACGGAGGACCTCATGGTTGTAAAGGTGTCTATAGAGGTGAGCTAACACAGTATTTTGAATGTGGTTTGTTAGTTTATGTTACTAAGAGCGATGGCTCCCGTATACAAACTGCAACACAACCACCTGTATTAACCCAAAATTTTTATAATAACATCAATTTAGGTAAGTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAATTGGCCAAGGTCTTATTACTAATGTAACCGACTTAGCTGTTAGTTATAATTATTTATCAGACGCAGGTTTGGCTATTTTAGATACATCTGGTGCCATAGACATCTTCGTTGTACAAGGTGAATATGGTCCTAACTATTATAAGGTTAATCCATGTGAAGATGTCAACCAACAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTCACTTCACGTAATGAAACAGGTTCTCAGCTTCTTGAGAACCAGTTTTATATTAAAATCACTAATGGAACTCGTCGTTCTAGACGTTCTGTTACTGAAAATGTTACAAATTGCCCTTATGTTAGTTATGGCAAGTTTTGTATAAAACCTGATGGTTCAATTTCTGTAATAGTACCAAAAGAACTGGATCAGTTTGTGGCACCTTTACTTAATGTTACTGAATATGTGCTCATACCTAACAGTTTTAATTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACGCGTATGGATAAGATCCAAATTAATTGCCTGCAGTATGTTTGTGGCAATTCTTTGGCCTGTAGAAAGCTGTTTCAACAATATGGGCCTGTTTGTGACAACATATTGTCTGTAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTAAATTTCTATTCTTCTACTAAACCAGCTCGTTTTAATACACCAGTTTTTAGTAATCTTAGTACTGGTGAGTTTAATATTTCTCTTTTGTTAACACCCCCTAGTAGTCCTAGGAGGCGTTCTTTTATTGAAGATCTTTTATTTACAAGTGTTGAATCTGTAGGATTACCAACAGATGACGCATACAAAATGTGCACTGCAGGACCTTTAGGCTTTCTTAAAGACCTTGCATGTGCTCGTGAATATAATGGTTTGCTTGTGTTGCCTCCTATTATAACAGCAGAAATGCAAACTTTGTATACTAGTTCTTTAGTAGCTTCTATGGCTTTTGGTGGTATTACTGCAGCTGGTGCCATACCTTTTGCCACACAACTGCAGGCTAGAATTAATCACTTGGGTATTACCCAGTCACTTTTGTTGAAGAATCAAGAAAAAATTGCTGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGGAGTACATCTCTAGCATTACAACAAATTCAAGATGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACTGAGACTATGGCAGCACTTAATAAAAATTTTGGTGCTATTTCTTCTGTGATTCAAGACATTTACCAGCAACTTGATTCCATACAAGCAGATGCTCAAGTGGATCGGCTCATAACTGGTAGATTGTCATCACTTTCTGTCTTAGCATCTGCTAAGCAGTCGGAGTACATTAGAGTGTCACAACAGCGTGAGTTAGCTACTCAGAAAATTAATGAGTGTGTTAAATCACAGTCTATTAGGTATTCCTTTTGTGGTAATGGACGACATGTTTTAACCATACCACAAAATGCCCCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTATACACCAGAGAGCTTTATTAATGTTACTGCAATAGTGGGTTTTTGTGTAAGTCCTGCTAATGCTAGTCAGTATGCAATAGTGCCCGCTAATGGTAGGGGTATTTTTATACAAGTTAATGGTAGTTACTACATCACTGCACGAGATATGTATATGCCAAGAGATATTACTGCAGGAGATATAGTTACGCTTACTTCTTGTCAAGCAAATTATGTAAGTGTAAATAAGACCGTCATTACTACATTTGTAGACAATGATGATTTTGATTTTGCTGATGAATTGTCAAAATGGTGGAATGATACTAAGCATGAGCTACCAGACTTTGACAAATTCAATTACACAGTACCTATACTTGACATTGATAGTGAAATTGATCGTATTCAAGGCGTTATACAGGGTCTTAACGACTCTCTAATAGACCTTGAAACACTATCAATACTCAAAACTTATATTAAGTGGCCTTGGTATGTGTGGTTAGCCATAGCTTTTGCCACTATTATCTTCATCTTAATACTAGGATGGTTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGCATTATTCCTTTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTATTACACGACTTTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA