Protein Id: ABY66326.1 |
Length: 1168 aa |
Description: spike glycoprotein Infectious bronchitis virus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 2-Jul-20 |
Source: Infectious bronchitis virus |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Infectious bronchitis virus |
Host: -- |
Authors: van Santen;V.L. and Toro;H. |
Title: Rapid selection in chickens of subpopulations within ArkDPI-derived infectious bronchitis virus vaccines |
Journal: Avian Pathol 37 (3); 293-306 (2008) |
Taxonomy: Infectious bronchitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
db_xref: """taxon:11120, CDD:279880, CDD:279881""" |
Sequence: MLVKSLFLVTILFALCSANLYDNESFVYYYQSAFRPGHGWHLHGGAYAVVNVSSENNNAGTAPSCTAGAIGYSKNLSAASVAMTAPLSGMSWSANSFCTAHCNFTSYIVFVTHCYKSGSNSCPLTGLIPGGYIRIAAMKHGSAMPGHLFYNLTVSVTKYPKFRSLQCVNNYTSVYLNGDLVFTSNYTEDVVAAGVHFKSGGPITYKVMREVKALAYFVNGTAHDVILCDDTPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNTSIVKDKFIVYRESSVNTTLTLTNFTFSNESGAPPNTGGVDSFILYQTQTAQSGYYNFNFSFLSSFVYRESNYMYGSYHPRCSFRPETLNGLWFNSLSVSLTYGPIQGGCKQSVFNGKATCCYAYSYGGPRGCKGVYRGELTQHFECGLLVYVTKSDGSRIQTATQPPVLTQNFYNNINLGKCVDYNIYGRIGQGLITNVTDLAVSYNYLSDAGLAILDTSGAIDIFVVQGEYGPNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQLLENQFYIKITNGTRRSRRSVTENVTNCPYVSYGKFCIKPDGSISVIVPKELDQFVAPLLNVTEYVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKIQINCLQYVCGNSLACRKLFQQYGPVCDNILSVVNSVGQKEDMELLNFYSSTKPARFNTPVFSNLSTGEFNISLLLTPPSSPRRRSFIEDLLFTSVESVGLPTDDAYKKCTAGPLGFFKDLACAREYNGLLVLPPIITAEMQTLYTSSLVASMAFGGITAAGAIPFATQLQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQIQDVVNKQSAILTETMAALNKNFGAISSVIQDIYQQLDSIQADAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQSEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSIRYSFCGNGRHVLTIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFINVTAIVGFCVSPANASQYAIVPANGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVSVNKTVITTFVDNDDFDLDDELSKWWNDTKHELPDFDKFNYTVPILDIGSEIDRIQGVIQGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIAFATIIFILILGWLFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV |
Nucleotide
Nucleotide_Id: EU359643.1 |
Length: 3507bp |
Description: Infectious bronchitis virus isolate ArkDPI vaccine A-1 spike glycoprotein gene; complete cds |
Source: Infectious bronchitis virus |
Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 2-Jul-20 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Infectious bronchitis virus |
CDS: EU359643.1:1..3507 |
Host: -- |
Authors: van Santen;V.L. and Toro;H. |
Journal: Avian Pathol 37 (3); 293-306 (2008) |
Title: Rapid selection in chickens of subpopulations within ArkDPI-derived infectious bronchitis virus vaccines |
db_xref: taxon:11120 |
Taxonomy: Infectious bronchitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3507); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3507); strand=1); type='CDS') |
Sequence: ATGTTGGTGAAGTCACTGTTTCTAGTGACCATTTTGTTTGCACTATGTAGTGCTAATTTATATGACAACGAATCTTTTGTGTATTACTACCAGAGTGCTTTTAGGCCAGGACATGGTTGGCATTTACATGGAGGTGCTTATGCAGTAGTTAATGTGTCTAGTGAAAATAATAATGCAGGTACTGCCCCAAGTTGCACTGCTGGTGCTATTGGCTACAGTAAGAATCTCAGTGCGGCCTCAGTAGCCATGACTGCACCACTAAGTGGTATGTCATGGTCTGCCAACTCTTTTTGTACAGCCCACTGTAATTTTACTTCTTATATAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAGAGCGGATCTAATAGTTGTCCTTTGACAGGTCTTATTCCAGGCGGTTATATTCGTATTGCTGCTATGAAACATGGAAGTGCTATGCCTGGTCACTTATTTTATAATTTAACAGTTTCTGTGACTAAATATCCTAAGTTTAGATCGCTACAATGTGTTAATAATTATACTTCTGTATATTTAAATGGTGACCTTGTTTTCACATCTAACTATACTGAAGATGTTGTAGCTGCAGGTGTCCATTTTAAAAGTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAGGTTAAAGCCTTGGCTTATTTTGTCAATGGTACTGCACATGATGTCATTCTATGTGATGACACACCTAGAGGTTTGTTAGCATGCCAATATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTCTATCCTTTTACTAATACTAGTATTGTTAAGGATAAGTTTATTGTTTATCGTGAAAGTAGTGTCAATACTACTTTAACATTAACTAATTTCACGTTTAGTAATGAAAGTGGTGCCCCTCCTAATACAGGTGGTGTTGACAGTTTTATTTTATACCAGACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAACTTTTCATTTCTGAGTAGTTTTGTTTATAGGGAAAGTAATTATATGTATGGATCTTACCATCCACGTTGTAGTTTTAGACCTGAAACCCTTAATGGTTTGTGGTTTAATTCCCTTTCTGTTTCATTAACATACGGTCCCATTCAAGGTGGTTGTAAGCAATCTGTATTTAATGGTAAAGCAACTTGTTGTTATGCTTATTCATACGGAGGACCTCGTGGTTGTAAAGGTGTCTATAGAGGTGAGCTAACACAGCATTTTGAATGTGGTTTGTTAGTTTATGTTACTAAGAGCGATGGCTCCCGTATACAAACTGCAACACAACCACCTGTATTAACCCAAAATTTTTATAATAACATCAATTTAGGTAAGTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAATTGGCCAAGGTCTTATTACTAATGTAACCGACTTAGCTGTTAGTTATAATTATTTATCAGACGCAGGTTTGGCTATTTTAGATACATCTGGTGCCATAGACATCTTCGTTGTACAAGGTGAATATGGTCCTAACTATTATAAGGTTAATCCATGTGAAGATGTCAACCAACAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTCACTTCACGTAATGAAACAGGTTCTCAGCTTCTTGAGAACCAGTTTTATATTAAAATCACTAATGGAACTCGTCGTTCTAGACGTTCTGTTACTGAAAATGTTACAAATTGCCCTTATGTTAGTTATGGCAAGTTTTGTATAAAACCTGATGGTTCAATTTCTGTAATAGTACCAAAAGAACTGGATCAGTTTGTGGCACCTTTACTTAATGTTACTGAATATGTGCTCATACCTAACAGTTTTAATTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACGCGTATGGATAAGATCCAAATTAATTGCCTGCAGTATGTTTGTGGCAATTCTTTGGCCTGTAGAAAGCTGTTTCAACAATATGGGCCTGTTTGTGACAACATATTGTCTGTAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTAAATTTCTATTCTTCTACTAAACCAGCTCGTTTTAATACACCAGTTTTTAGTAATCTTAGCACTGGTGAGTTTAATATTTCTCTTTTGTTAACACCCCCTAGTAGTCCTAGGAGGCGTTCTTTTATTGAAGATCTTTTATTTACAAGTGTTGAATCTGTAGGATTACCAACAGATGACGCATACAAAAAGTGCACTGCAGGACCTTTAGGCTTTTTTAAAGACCTTGCATGTGCTCGTGAATATAATGGTTTGCTTGTGTTGCCTCCTATTATAACAGCAGAAATGCAAACTTTGTATACTAGTTCTTTAGTAGCTTCTATGGCTTTTGGTGGTATTACTGCAGCTGGTGCCATACCTTTTGCCACACAACTGCAGGCTAGAATTAATCACTTGGGTATTACCCAGTCACTTTTGTTGAAGAATCAAGAAAAAATTGCTGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGGAGTACATCTCTAGCATTACAACAAATTCAAGATGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACTGAGACTATGGCAGCACTTAATAAAAATTTTGGTGCTATTTCTTCTGTGATTCAAGACATTTACCAGCAACTTGATTCCATACAAGCAGATGCTCAAGTGGATCGGCTCATAACTGGTAGATTGTCATCACTTTCTGTCTTAGCATCTGCTAAGCAGTCGGAGTACATTAGAGTGTCACAACAGCGTGAGTTAGCTACTCAGAAAATTAATGAGTGTGTTAAATCACAGTCTATTAGGTATTCCTTTTGTGGTAATGGACGACATGTTTTAACCATACCACAAAATGCCCCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTATACACCAGAGAGCTTTATTAATGTTACTGCAATAGTGGGTTTTTGTGTAAGTCCTGCTAATGCTAGTCAGTATGCAATAGTGCCCGCTAATGGTAGGGGTATTTTTATACAAGTTAATGGTAGTTACTACATCACTGCACGAGATATGTATATGCCAAGAGATATTACTGCAGGAGATATAGTTACGCTTACTTCTTGTCAAGCAAATTATGTAAGTGTAAATAAGACCGTCATTACTACATTTGTAGACAATGATGATTTTGATTTAGATGATGAATTGTCAAAATGGTGGAATGATACTAAGCATGAGCTACCAGACTTTGACAAATTCAATTACACAGTACCTATACTTGACATTGGTAGTGAAATTGATCGTATTCAAGGCGTTATACAGGGTCTTAACGACTCTCTAATAGACCTTGAAACACTATCAATACTCAAAACTTATATTAAGTGGCCTTGGTATGTGTGGTTAGCCATAGCTTTTGCCACTATTATCTTCATCTTAATACTAGGATGGTTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGCATTATTCCTTTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTATTACACGACTTTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA |