| Protein Id: ACM45229.1 |
Length: 1168 aa |
| Description: spike protein Infectious bronchitis virus. |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 9-Feb-10 |
| Source: Infectious bronchitis virus |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Infectious bronchitis virus |
| Host: chicken |
Authors: Ammayappan;A. and Vakharia;V.N. |
| Title: Complete nucleotide analysis of the structural genome of the infectious bronchitis virus strain md27 reveals its mosaic nature |
Journal: Viruses 1 (3); 1166-1177 (2009) |
| Taxonomy: Infectious bronchitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
| db_xref: """taxon:11120, CDD:279880, CDD:279881""" |
| Sequence: MLVKSLFLVTILFALCSANLYDNSYVYYYQSAFRPGPGWHLHGGAYKVVNVSQESNTAGNARSCRAGVIGYSKNFSASSVAMTAPPSGMSWSTTQFCTAHCNFTGFTVFVTHCFKSGSDECPLTGLIQSGYIRIAAMRSGCANSACIFYNSTLSVNKYPTFKSLQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNDTIDVSGAGVYFKAGGPITYKVMAETKALAYFVNGTAQDVILCDGSPIGLLACQYNTGNFSDGLYPFTNYSIVKDKFIVYRENSVNTTLTLNNFTFSNQTGASPNRGGVDTFVLYQTQTAQSGYYNFNFSFLSSFVYKESDFMYGSYHRDCSFRPETLNNGLWFNSLTVSLTYGPLQGGCKQSVFSGKATCCYAYSYRGPSLCKGVYPGELLHNFECGLLVYVTKSDGSRIQTATKPPVITQHNYNNITLDTCVDYNIYGRTGQGFITNVTDLAVSYNYLADAGLAILDTSGAIDIFVVQGEYGPNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNVTGSQLLENQFYIKITNGVHRSRRSITENVTNCPYVSYGKFCIKPDGSVSVIVPKELDQFVAPLLNVTEYVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKIQINCLQYVCGNSLACRKLFQQYGPVCDNILSVVNSVGQKEDMELLSFYSSTKPSGFNTPVFSNLSTGEFNISLLLTTPSSPSGRSFIEDLLFTSVESVGLPTDDAYKKCTAGPLGFLKDLACAREYNGLLVLPPIITAEMQTLYTSSLVASMAFGGITAAGAIPFATQLQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNSAIGHMQEGFRSTSLALQQIQDVVNKQSAILTETMAALNKNFGAISSVIQDIYQQLDSIQADAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQSEYIRVAQQRELATQKINECVKSQSIRYSFCGNGRHVLTIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFINVTAIVGFCVSPANASQYAIVPANGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYESVNKTVITTFVDNDDFDFDDELSKWWNDTKHELPDFEKFNYTVPILDIDSEIDRIQGVIQGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIAFAFIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV |
Nucleotide
| Nucleotide_Id: FJ008695.1 |
Length: 3507bp |
| Description: Infectious bronchitis virus strain Md27 spike protein; 3a protein; 3b protein; small envelope protein; membrane protein; 5a protein; 5b protein; and nucleocapsid protein genes; complete cds |
Source: Infectious bronchitis virus |
| Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 9-Feb-10 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Infectious bronchitis virus |
| CDS: FJ008695.1:510..4016 |
Host: chicken |
| Authors: Ammayappan;A. and Vakharia;V.N. |
Journal: Viruses 1 (3); 1166-1177 (2009) |
| Title: Complete nucleotide analysis of the structural genome of the infectious bronchitis virus strain md27 reveals its mosaic nature |
db_xref: taxon:11120 |
| Taxonomy: Infectious bronchitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
| Sequence: ATGTTGGTGAAGTCACTGTTTCTAGTGACCATTTTGTTTGCACTATGTAGTGCTAATTTATATGACAATTCTTATGTGTATTACTACCAGAGTGCTTTTAGGCCAGGACCTGGTTGGCATTTACATGGAGGGGCTTATAAAGTAGTTAATGTTTCTCAGGAATCTAATACTGCAGGTAATGCAAGGTCTTGTCGTGCTGGTGTTATCGGCTACAGTAAGAACTTTAGTGCTTCTTCTGTGGCGATGACTGCACCACCTAGTGGTATGTCGTGGTCAACTACACAATTTTGTACGGCTCACTGCAATTTTACCGGTTTTACAGTGTTTGTTACACATTGTTTTAAGTCCGGTTCTGATGAGTGCCCTTTGACAGGTCTTATTCAATCAGGTTATATCCGCATTGCTGCTATGAGAAGCGGATGTGCTAACTCTGCTTGTATATTTTATAATTCAACATTGTCTGTTAATAAGTATCCTACATTTAAGTCGCTACAATGTGTTAATAATTTTACATCTGTGTACTTAAATGGTGACCTTGTTTTCACATCTAATGACACTATAGATGTTAGTGGTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCCATAACTTACAAAGTTATGGCGGAAACCAAAGCTTTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTCTTTGTGATGGTTCACCTATAGGTTTGTTAGCATGTCAGTATAATACTGGTAATTTTTCAGATGGTCTCTATCCTTTTACTAATTATAGTATTGTTAAGGATAAGTTTATTGTTTATCGTGAAAATAGTGTCAATACTACTTTGACGTTAAATAATTTCACGTTTTCTAACCAAACTGGTGCCAGTCCTAATAGAGGTGGTGTTGATACTTTTGTTTTATATCAGACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTTTCCTTTCTGAGTAGTTTTGTTTATAAGGAGTCTGATTTTATGTATGGATCTTACCACCGAGATTGTAGTTTTAGACCTGAAACTCTTAATAATGGTTTGTGGTTTAATTCCCTTACTGTCTCACTAACATACGGTCCTCTTCAAGGTGGTTGCAAGCAATCTGTCTTTAGTGGTAAAGCAACTTGTTGTTATGCTTACTCATATAGAGGTCCTTCGTTGTGTAAAGGTGTTTATCCAGGTGAGTTACTACATAATTTTGAATGTGGACTGTTAGTTTATGTTACTAAGAGCGATGGTTCGCGTATACAAACAGCCACTAAACCTCCAGTTATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAGATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAACTGGTCAAGGTTTTATTACTAATGTAACCGACTTAGCTGTTAGTTATAATTATTTAGCAGACGCAGGTTTGGCTATTTTAGATACATCTGGTGCCATAGACATCTTTGTTGTACAAGGTGAATACGGCCCTAATTATTATAAGGTTAACCCATGTGAAGATGTTAACCAACAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTCACTTCACGTAATGTAACTGGTTCTCAGCTTCTTGAAAACCAGTTTTACATTAAAATCACTAATGGAGTACATCGTTCTAGACGTTCTATTACTGAAAATGTTACAAATTGCCCTTATGTTAGTTATGGCAAGTTTTGTATAAAACCTGATGGTTCAGTTTCTGTAATAGTACCAAAGGAACTGGATCAGTTTGTGGCACCTTTACTTAATGTCACTGAATATGTGCTCATACCTAACAGTTTTAATTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACGCGTATGGATAAGATCCAAATTAATTGTCTGCAGTATGTTTGTGGCAACTCTTTGGCTTGTAGAAAGCTGTTTCAACAGTATGGGCCTGTTTGTGACAACATATTGTCTGTAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTAAGCTTCTATTCTTCTACTAAACCATCTGGTTTTAATACACCAGTTTTTAGTAATCTCAGCACTGGTGAGTTTAATATTTCTCTTTTGTTAACAACCCCTAGTAGTCCTAGTGGGCGTTCTTTTATTGAAGATCTTTTATTTACAAGTGTTGAATCTGTAGGACTACCAACAGATGACGCATATAAAAAATGCACTGCAGGACCTTTAGGCTTTCTTAAAGACCTTGCATGTGCTCGTGAATATAATGGTTTGCTTGTGTTGCCTCCTATTATAACAGCAGAAATGCAAACTTTGTATACTAGTTCTCTAGTAGCTTCTATGGCTTTTGGTGGTATTACTGCAGCTGGTGCTATACCTTTTGCTACACAACTGCAGGCTAGAATTAATCACTTGGGTATTACCCAGTCACTTTTGTTGAAGAATCAAGAAAAAATTGCTGCTTCCTTTAATAGTGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGGAGTACATCTCTAGCATTACAACAAATTCAAGATGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACTGAGACTATGGCAGCACTTAATAAAAATTTTGGTGCTATTTCTTCTGTGATTCAAGACATTTACCAGCAACTTGATTCCATACAAGCAGATGCTCAAGTGGATCGACTCATAACTGGTAGATTGTCATCACTTTCTGTCTTAGCATCTGCTAAGCAGTCGGAGTACATTAGAGTGGCACAACAGCGTGAGTTAGCTACTCAGAAAATTAATGAGTGTGTTAAATCACAGTCTATTAGGTATTCCTTTTGTGGTAATGGACGACATGTTTTAACCATACCACAAAATGCCCCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTATACACCAGAGAGCTTTATTAATGTTACTGCAATAGTAGGTTTTTGTGTAAGTCCTGCTAATGCTAGTCAGTATGCAATAGTGCCCGCTAATGGTAGGGGTATTTTTATACAAGTTAATGGTAGTTACTACATCACTGCACGAGATATGTATATGCCAAGAGATATTACTGCAGGAGATATAGTTACGCTTACTTCTTGTCAAGCAAATTATGAAAGTGTAAACAAAACCGTCATTACTACATTTGTAGACAATGATGATTTTGATTTTGATGATGAATTGTCAAAATGGTGGAATGATACTAAGCATGAGCTACCAGACTTTGAGAAATTTAATTACACAGTACCTATACTTGATATTGATAGTGAAATTGATCGTATTCAAGGCGTTATACAAGGTCTTAATGACTCTCTAATAGACCTTGAAACACTATCAATACTCAAAACTTATATTAAGTGGCCTTGGTATGTGTGGTTAGCCATAGCTTTTGCCTTTATTATATTCATCTTAATATTAGGATGGGTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGCATTATTCCTCTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTACTACACGACTTTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA |