Protein Id: AAZ85066.1 |
Length: 1167 aa |
Description: spike protein Pigeon coronavirus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 30-Aug-05 |
Source: Pigeon coronavirus |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Pigeon coronavirus |
Host: -- |
Authors: Qian;H.D.; Hua;X.G.; Zhu;J.G.; Wu;Z.L.; Ding;D.Z. and Ye;X.G. |
Title: Charaterization of Spike Gene of Pigeon Coronavirus PSH050513 Isolated in China |
Journal: Unpublished |
Taxonomy: Pigeon coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
db_xref: """taxon:300189, CDD:279880, CDD:279881""" |
Sequence: MLGKSLLIVTVLFALCSATLYTHDYVYYYQSAYRPPNGWHLQGGAYAVVNSTNKTNNAGAASECSVGVLFNYTNGNDVGYNNSASSVAMTAPLPGMSWSKTQFCTAHCNFSDFTVFVTHCFANSCPLTGRIEVNHIRISAMRNGSLFYNLTVSVSKYPKFKSLQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNKTTDVIGAGVYFKAGGPITYKIMKEFKVLAYFVNGTVQDVILCDDTPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKKKFIVYRESSVNTTLILTNYTFYNVTNAPPNQGGVQSILTYQTQTAQSGYYNFNLSFLSSFVYKQSDYMYGSYHPACNFRLETINNGLWFNSLSVSLAYGPLQGGCKQSVFSSRATCCYAYSYNGPRACKGVYAGELRQNFECGLLVYVTKSDGSRIQTATEPPVITQHNYNNITLNTCVDYNIYGRVGRGFITNVTDLSSSYNYLADGGLAILDTSGAIDIFVVQGEHGFNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNATGSQPLENQFYIKLTKETRRFRRSTSENVTSCPYVSYGRFCIQPDGSIKQIVPQELQNFVAPLLNVTENVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYVCGNSLDCRKLFQQYGPVCDNILSIVNSVGQKEDMELLSFYSSTKPAGYNAPVFSNISTGDFNISLLLTPSSSPRGRSFIEDLLFTSVETVGLPTDAEYKKCTAGPLGTLKDLVCAREYNGLLVLPPIITADMQTMYTASLVASMAFGGITAAGAVPFATQIQARINHLGITQSLLLKNQERIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQVQDVVNKQSAILTETMNSLNKNFGAISSVIQDIYAQLDAIQADAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQSEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSNRYGFCGSGRHVLSIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFVNVTAIVGFCVQPANASQYAIVPVNGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVNVNKTVITTFVEDDDFDFDDELSKWWNDTKHELPDFDDFNYTVPILNISGEIDRIQGVIQGLNDSIIDLEELSIIKTYIKWPWYVWLAIGFAIIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV |
Nucleotide
Nucleotide_Id: DQ160004.1 |
Length: 3504bp |
Description: Pigeon coronavirus strain PSH050513 spike protein gene; complete cds |
Source: Pigeon coronavirus |
Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 30-Aug-05 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Pigeon coronavirus |
CDS: DQ160004.1:67..3570 |
Host: -- |
Authors: Qian;H.D.; Hua;X.G.; Zhu;J.G.; Wu;Z.L.; Ding;D.Z. and Ye;X.G. |
Journal: Unpublished |
Title: Charaterization of Spike Gene of Pigeon Coronavirus PSH050513 Isolated in China |
db_xref: taxon:300189 |
Taxonomy: Pigeon coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3701); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(66); ExactPosition(3570); strand=1); type='CDS') |
Sequence: ATGTTGGGGAAGTCACTGTTAATAGTGACTGTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCCACTCTTTATACTCACGATTATGTTTACTACTACCAAAGTGCCTATAGACCACCAAATGGATGGCATTTGCAAGGGGGTGCTTATGCAGTAGTGAATTCTACTAATAAAACTAACAATGCAGGCGCCGCTAGCGAGTGTTCTGTAGGTGTTCTTTTTAATTATACTAACGGAAATGACGTTGGTTATAATAATAGTGCTTCTTCCGTAGCCATGACAGCACCGCTTCCTGGTATGTCTTGGTCTAAAACACAATTTTGTACTGCCCATTGTAACTTTTCGGATTTTACAGTGTTTGTTACACATTGTTTTGCAAATTCTTGTCCTTTAACAGGTAGGATAGAGGTAAACCATATCCGTATTTCTGCTATGAGAAATGGTTCTCTATTTTATAATTTAACAGTTAGTGTATCCAAATACCCTAAATTTAAATCGCTTCAATGTGTTAACAATTTCACTTCTGTTTATTTAAATGGTGACCTTGTTTTTACTTCTAACAAAACCACTGATGTTATAGGTGCTGGTGTGTATTTTAAAGCAGGTGGGCCTATAACCTACAAAATTATGAAAGAATTTAAGGTTTTGGCTTATTTTGTCAATGGTACTGTGCAAGATGTAATTCTGTGTGATGACACACCGAGAGGCTTGCTTGCATGTCAATATAATACTGGTAATTTTTCAGATGGGTTTTACCCTTTTACTAATTCTAGTTTAGTTAAGAAAAAGTTTATTGTTTATCGTGAGAGTAGTGTTAATACTACTCTTATTTTAACTAATTATACTTTTTATAATGTGACTAATGCCCCGCCTAATCAAGGTGGTGTTCAGTCTATTTTAACTTATCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTATCATTTCTGAGTAGTTTTGTGTATAAACAATCTGATTACATGTATGGGTCTTATCACCCTGCATGTAATTTTAGATTAGAAACTATTAATAATGGCTTGTGGTTTAATTCACTGTCAGTTTCTCTTGCTTATGGACCACTTCAAGGTGGGTGTAAGCAGTCGGTTTTTAGTAGTAGAGCCACTTGTTGTTATGCTTATTCATATAATGGTCCTCGCGCTTGTAAGGGTGTTTATGCAGGCGAGTTACGACAAAATTTTGAATGTGGACTGTTGGTTTATGTTACTAAGAGCGATGGCTCTCGTATACAAACAGCCACCGAGCCACCAGTCATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAGTTGGTCGAGGTTTCATTACTAATGTAACTGACTTATCATCTAGTTATAATTATTTAGCAGATGGAGGGTTGGCTATTTTAGATACATCAGGTGCCATAGACATCTTTGTTGTACAAGGTGAACATGGTTTTAATTATTACAAGGTTAATCCCTGTGAAGATGTAAACCAGCAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACCTCACGTAATGCAACAGGTTCTCAGCCCCTTGAGAATCAATTCTACATTAAACTCACTAAAGAGACACGTCGTTTTAGACGTTCTACTAGTGAAAATGTAACAAGTTGCCCTTATGTTAGTTATGGCAGGTTTTGTATACAACCTGATGGTTCTATTAAGCAAATAGTACCGCAAGAATTACAAAACTTTGTGGCACCTTTGTTAAATGTTACTGAAAATGTGCTCATACCTAACAGTTTTAATTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACACGTATGGATAAAGTTCAAATTAATTGCCTGCAATATGTTTGTGGTAATTCTTTGGATTGTAGGAAGTTATTTCAACAATATGGTCCTGTCTGTGACAACATATTGTCTATAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTAAGTTTCTATTCTTCTACTAAACCAGCTGGTTATAATGCACCTGTTTTTAGTAATATTAGTACTGGTGATTTTAATATTTCTCTTTTATTAACACCATCTAGTAGTCCTAGAGGTCGTTCTTTTATAGAAGATTTGTTATTTACAAGTGTTGAAACAGTTGGTTTGCCAACTGATGCTGAATATAAAAAATGCACAGCAGGACCTTTGGGTACTCTTAAAGACCTTGTTTGCGCTAGAGAATATAATGGTTTGTTAGTACTGCCCCCTATTATTACGGCAGATATGCAAACAATGTATACTGCATCTTTAGTAGCATCTATGGCCTTTGGTGGTATTACAGCCGCCGGTGCTGTACCTTTTGCTACTCAGATTCAGGCAAGAATTAACCATCTTGGTATTACACAGTCTTTGTTGTTAAAAAATCAAGAGAGAATTGCAGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGAAGCACTTCGCTAGCATTACAACAGGTTCAAGACGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACTGAAACTATGAATTCTCTTAATAAGAATTTTGGTGCCATTTCATCAGTAATTCAAGACATTTATGCGCAACTTGATGCAATTCAAGCAGATGCACAAGTTGACCGTCTTATTACTGGCAGACTCTCTTCTCTCTCAGTGCTAGCCTCTGCTAAGCAGTCTGAGTACATTAGAGTTTCTCAACAACGTGAATTAGCCACTCAAAAAATTAATGAGTGTGTTAAATCACAATCTAATAGGTATGGATTTTGTGGTAGTGGAAGACATGTTCTTTCGATACCACAAAATGCACCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTACACCCCAGAGAGTTTTGTTAATGTTACTGCAATAGTGGGTTTTTGTGTACAGCCTGCTAATGCTAGTCAGTATGCAATAGTGCCTGTTAATGGTAGAGGTATTTTTATACAAGTTAATGGTAGTTACTATATCACTGCACGTGATATGTATATGCCTAGAGACATTACTGCAGGAGATATAGTTACTCTTACCTCTTGTCAAGCAAATTATGTTAATGTAAATAAAACCGTCATTACTACATTTGTAGAAGATGACGATTTTGATTTTGATGATGAGTTGTCGAAATGGTGGAATGACACTAAGCATGAGCTACCAGATTTTGACGACTTCAATTACACAGTACCTATACTGAATATTAGCGGTGAAATTGATCGTATTCAAGGTGTTATACAGGGTCTTAATGACTCCATTATAGACCTTGAAGAACTGTCAATAATCAAAACTTATATTAAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTTGCGATAGGCTTTGCCATTATTATTTTTATCCTTATCTTAGGATGGGTGTTTTTCATGACAGGTTGTTGTGGCTGTTGTTGTGGATGCTTTGGTATCATTCCTCTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTATTACACTACTTTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA |