| Protein Id: ABO88141.1 |
Length: 1453 aa |
| Description: spike protein Raccoon dog coronavirus GZ43/2003. |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 10-Apr-07 |
| Source: Raccoon dog coronavirus GZ43/2003 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Raccoon dog coronavirus |
| Host: -- |
Authors: Vijaykrishna;D.; Smith;G.J.; Zhang;J.X.; Peiris;J.S.; Chen;H. and Guan;Y. |
| Title: Evolutionary insights into the ecology of coronaviruses |
Journal: J Virol 81 (8); 4012-4020 (2007) |
| Taxonomy: Raccoon dog coronavirus GZ43/2003 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
| db_xref: """taxon:434614, CDD:279880, CDD:279881""" |
| Sequence: MIVLTLFILLVSYTNVYCTTNSDCVQVNVTQLPGNENIIKDFLFSNFKEEGTVVVGGYYPTEVWYNCSRTATTSAYAYFSNIHAFYFDMEAMINSTGNAGGKPLLFHVHGEPVSVIIYISAYKDDVQHRPLLKHGLLCITENRTIDYNMFTSAQWNYICMGNDRKIPFSVIPTDNGTKIYGLEWNDESVTAYISGHYYNLNINTNWFNNVTLMYSRSSTATWQKSAAYVYQGVSNFTYYKLNNTNGLKTYELCEDYEYCTGYATNIFAPTVGGYIPDGFSFNNWFLLTNSSTFVSGRFVTNQPLLVNCLWPVPSFGVAAQEFCFEGAQFSQCNGVSLNNTVDVIRFNLNFTADVQSGMGATVFSLNTTGGVILEISCYNDTVSESSFYSYGEIPFGVTDGPRYCYVLYNGTALKYLGTLPPSVKEIAISKWGHFYINGYNFFSTFPIDCISFNLTTGASGAFWTIAYTSYTEALVQVENTAIKKVTYCNSHINNIKCSQLTANLQNGFYPVASSEVGLVNKSVVLLPSFYSHTSVNITIDLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNNTDVYCIRSNQFSVYTHSTCKSSLWDNNFNQDCTDFLYATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCLSLNPTGANCKFDVAARTRTNEQVFRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGKTGVGIIRQTNSTILSGLYYTSLAGDLLGFKNVSDGVVYSVTPCDVSAQAAVIDGAIVGAMTSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNERTRGTAIDSNDVDCEPIITYSNIGVCKNGALVFINVTHSDGDVQPISTGNVTIPTNFTISVQVEYIQVYTTPVSIDCSRYVCNGNPRCNKLLTQYVSACQTIEQALAMSARLENMEVDSMLFVSENALKLASVEAFNSTEHLDPIYKEWPNIGGSWLGGLKDILPSHNSKRKYRSAIEDLLFDKVVTSGLGTVDEDYKRCTGGHDIADLVCAQYYNGIMVLPGVANDDKMTMYTASLAGGITLGALGGGAVAIPFAVAVQARLNYVALQTDVLNKNQQILANAFNQAIGNITQAFGKVNDAIHQTSQGLATVAKALAKVQDVVNTQGQALSHLTVQLQNNFQAISSSISDIYNRLDELSADAQVDRLITGRLTALNAFVSQTLTRQAEVRASRQLAKDKVNECVRSQSQRFGFCGNGTHLFSLANAAPNGMIFFHTVLLPTAYETVTAWSGICASDGDRTFGLVVKDVQLTLFRNLDGKFYLTPRTMYQPRAATSSDFVQIEGCDVLFVNATVIDLPSIIPDYIDINQTVQDILENYRPNWTVPESTLDIFNATYLNLTGEIDDLEFRSEKLHNTTVELAILIDNINNTLVNLEWLNRIETYVKWPWHVWLLIGLVVVFCIPLLLFCCCSTGCCGCIGCLGSCCHSICSRRQFENYEPIEKVHVH |
Nucleotide
| Nucleotide_Id: EF192155.1 |
Length: 4362bp |
| Description: Raccoon dog coronavirus GZ43/2003 spike protein (S) gene; complete cds |
Source: Raccoon dog coronavirus GZ43/2003 |
| Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 10-Apr-07 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Raccoon dog coronavirus |
| CDS: EF192155.1:1..4362 |
Host: -- |
| Authors: Vijaykrishna;D.; Smith;G.J.; Zhang;J.X.; Peiris;J.S.; Chen;H. and Guan;Y. |
Journal: J Virol 81 (8); 4012-4020 (2007) |
| Title: Evolutionary insights into the ecology of coronaviruses |
db_xref: taxon:434614 |
| Taxonomy: Raccoon dog coronavirus GZ43/2003 Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
| Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4362); strand=1); type='CDS') |
| Sequence: ATGATTGTTCTAACATTGTTTATTCTTTTGGTCTCATACACCAATGTTTATTGTACAACAAACTCTGATTGTGTACAAGTCAATGTTACACAATTACCAGGCAATGAAAACATTATTAAAGACTTTCTGTTTAGCAATTTTAAAGAAGAAGGAACTGTAGTTGTTGGTGGTTATTACCCTACAGAGGTGTGGTACAACTGTTCTAGAACTGCAACCACCTCTGCCTACGCGTATTTCAGTAATATACATGCTTTCTATTTTGATATGGAAGCCATGATAAATAGTACTGGTAATGCAGGGGGTAAACCTTTATTATTCCATGTGCATGGTGAGCCGGTTAGTGTCATCATATATATATCAGCTTATAAGGATGATGTGCAACATAGGCCACTTTTAAAACATGGATTATTGTGCATAACTGAAAATCGCACTATTGACTATAACATGTTCACCAGCGCTCAGTGGAATTACATATGTATGGGTAATGACAGAAAAATTCCTTTCTCTGTCATACCCACGGATAATGGAACAAAAATCTATGGTCTTGAGTGGAATGATGAATCTGTTACAGCTTACATTAGTGGTCATTATTACAACCTGAACATCAATACTAATTGGTTTAACAATGTCACACTTATGTATTCGCGCTCAAGCACTGCAACATGGCAAAAGAGTGCTGCATATGTTTATCAAGGTGTTTCTAACTTCACTTATTACAAGTTAAATAACACCAATGGTTTAAAAACCTATGAATTATGTGAAGATTATGAATATTGCACTGGCTACGCCACTAACATCTTTGCCCCAACTGTGGGAGGTTACATACCTGATGGATTCAGTTTTAACAATTGGTTTTTACTTACAAATAGCTCCACCTTTGTTAGTGGCAGATTTGTAACAAATCAACCATTACTAGTTAATTGCTTGTGGCCAGTGCCTAGTTTTGGTGTTGCAGCGCAAGAATTTTGTTTTGAAGGTGCCCAGTTTAGCCAATGTAATGGTGTGTCTTTAAATAACACAGTGGATGTTATTAGATTCAACCTTAATTTTACTGCAGATGTACAATCTGGTATGGGTGCTACAGTGTTTTCACTGAATACAACAGGTGGTGTCATTCTTGAGATTTCTTGTTATAATGATACAGTGAGTGAGTCAAGTTTTTACAGTTATGGTGAAATTCCATTCGGCGTAACTGATGGACCGCGTTACTGTTATGTGCTCTATAATGGCACGGCTCTTAAGTACTTAGGAACATTACCACCTAGTGTCAAGGAAATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCATTTTTATATTAATGGTTACAATTTCTTTAGCACTTTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAACTTAACCACTGGTGCTAGTGGAGCTTTCTGGACAATTGCCTACACATCATACACTGAAGCGTTAGTACAAGTTGAAAACACAGCTATTAAGAAGGTGACGTATTGTAACAGTCACATTAACAACATCAAATGTTCTCAACTCACTGCTAACTTGCAAAATGGATTTTATCCTGTTGCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCAAGTTTTTATTCACATACCAGCGTTAATATAACTATTGACCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCTTCAACATTAAGTAACATCACACTACCAATGCAGGATAATAACACTGATGTGTACTGTATTCGTTCTAACCAATTTTCAGTTTACACCCATTCCACTTGCAAAAGTTCTTTGTGGGACAACAATTTTAATCAAGATTGCACAGATTTTTTATATGCCACAGCTGTTATAAAAACTGGTACTTGTCCTTTCTCATTTGATAAGTTGAACAATTACTTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTGTCGTTGAATCCTACTGGTGCCAACTGTAAGTTTGATGTTGCTGCCCGTACAAGAACCAATGAGCAGGTTTTTAGAAGTTTATATGTAATATATGAAGAAGGAGATAACATAGTGGGTGTACCGTCTGATAATAGTGGTCTTCACGATCTGTCAGTGTTACACTTAGACTCCTGTACAGATTACAATATATATGGTAAAACTGGTGTTGGTATTATTAGACAAACTAACAGCACAATACTTAGTGGCTTATATTACACCTCACTAGCGGGTGATTTGTTAGGTTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTTGTCTATTCTGTGACACCATGTGATGTAAGTGCACAAGCGGCTGTTATTGATGGTGCCATAGTTGGAGCTATGACTTCCATTAATAGTGAACTGTTAGGTCTAACACATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTACTACTCCATATATAATTATACAAATGAGAGAACTCGTGGCACTGCAATTGACAGTAACGATGTTGATTGTGAACCTATCATAACCTATTCTAACATAGGTGTTTGTAAAAATGGTGCTTTGGTCTTTATTAACGTCACACACTCTGATGGTGACGTTCAACCAATTAGCACTGGTAATGTCACGATACCAACAAACTTTACCATATCTGTGCAAGTCGAATACATCCAGGTTTACACTACACCAGTGTCAATAGATTGTTCTAGATATGTTTGTAATGGTAACCCTAGATGTAATAAATTGTTAACACAATATGTTTCTGCATGTCAAACTATTGAGCAAGCGCTTGCAATGAGTGCCAGACTCGAAAACATGGAAGTTGATTCCATGTTGTTTGTTTCAGAAAATGCCCTTAAATTGGCATCTGTTGAGGCGTTCAATAGTACGGAACATTTAGATCCTATTTACAAAGAATGGCCTAACATAGGTGGCTCTTGGCTAGGAGGTCTAAAAGACATACTTCCGTCCCATAATAGCAAACGTAAATACCGTTCTGCTATAGAAGACTTGCTTTTTGACAAAGTTGTAACTTCTGGTCTGGGTACAGTTGATGAAGATTATAAACGTTGTACAGGTGGTCACGACATAGCTGACTTAGTTTGTGCACAATATTATAATGGCATCATGGTTCTACCTGGTGTGGCTAATGATGACAAGATGACTATGTACACAGCCTCTCTTGCAGGTGGTATAACATTAGGTGCACTAGGTGGTGGTGCCGTGGCTATACCTTTTGCAGTAGCAGTTCAGGCTAGACTTAATTATGTTGCTCTACAAACTGATGTATTGAATAAAAACCAGCAGATCCTGGCTAATGCTTTTAACCAAGCTATTGGTAACATTACACAGGCATTTGGTAAGGTTAATGATGCTATACATCAGACATCACAAGGTCTTGCCACTGTTGCTAAAGCATTGGCAAAAGTGCAAGATGTCGTTAACACACAAGGTCAAGCTTTAAGCCACCTAACTGTGCAATTGCAAAATAATTTCCAAGCCATTAGTAGTTCTATCAGTGACATTTATAATAGGCTTGACGAACTGAGTGCTGATGCACAAGTTGATAGGCTGATTACAGGTAGACTTACAGCACTTAATGCATTTGTGTCTCAAACTCTAACCAGACAAGCTGAGGTTAGGGCTAGTAGACAACTTGCCAAAGACAAGGTTAATGAATGTGTTAGGTCTCAGTCTCAGAGATTTGGATTCTGTGGTAATGGTACACATTTGTTTTCACTTGCAAATGCAGCACCAAATGGCATGATTTTCTTTCACACAGTGCTATTACCAACAGCTTATGAAACCGTAACAGCTTGGTCAGGTATTTGTGCTTCAGATGGCGATCGCACTTTTGGACTCGTCGTTAAAGATGTTCAGTTGACGTTGTTTCGTAATCTAGATGGCAAGTTCTATTTGACTCCCAGAACTATGTATCAGCCTAGAGCTGCAACTAGTTCAGATTTTGTTCAAATTGAGGGGTGTGATGTGTTGTTTGTCAATGCTACTGTAATTGACTTGCCTAGTATTATACCTGACTATATCGACATTAACCAGACTGTTCAAGACATATTAGAAAACTACAGACCAAACTGGACTGTACCTGAATCGACACTTGACATTTTTAACGCAACCTATTTAAATCTGACTGGTGAAATTGATGACTTAGAATTTAGGTCAGAAAAGCTACATAATACTACTGTAGAACTTGCCATTCTCATTGACAATATTAACAATACATTAGTCAATCTTGAATGGCTCAATAGAATTGAGACTTATGTGAAATGGCCCTGGCATGTGTGGCTACTAATAGGCTTAGTAGTAGTATTTTGCATACCGCTATTGCTATTTTGCTGTTGTAGTACAGGTTGCTGTGGATGCATAGGTTGTTTAGGAAGTTGTTGTCACTCTATTTGTAGTAGAAGACAATTTGAAAATTACGAACCAATTGAAAAAGTGCATGTCCACTAA |