| Protein Id: AAT00645.1 |
Length: 1449 aa |
| Description: spike glycoprotein Transmissible gastroenteritis virus. |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 1-May-04 |
| Source: Transmissible gastroenteritis virus |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Transmissible gastroenteritis virus |
| Host: -- |
Authors: He;K. and Yang;Q. |
| Title: Direct Submission |
Journal: Submitted (01-APR-2004) Jiangsu Academy of Agricultural Sciences; |
| Taxonomy: Transmissible gastroenteritis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
| db_xref: """taxon:11149, CDD:279880, CDD:279881""" |
| Sequence: MKKLFAVLVVMPLIYGDNFPCSKLTNRTIGNHWNLIETFLLNYSSRLSPNSDVVLGDYFPTVQPWFNCIRNNSNDLYVTLENLKALYWDYATENITSNHKQRLNVVVNGYPYSITVTTTRNFNSAEGAIICICKGSPPTTTTESSLTCNWGSECRLNHKFPICPSNSEANCGNMLYGLQWFADAVVAYLHGASYRISFENQWSGTVTLGDMRATTLETAGTLVDLWWFNPVYDVSYYRVNNKNGTTVVSNCTDQCASYVANVFTTQPGGFIPSDFSFNNWFLLTNSSTLVSGKLVTKQPLLVNCLWPVPSFEEAASTFCFEGAGFDQCNGAVLNNTVDVIRFNLNFTTNVQSGKGATVFSLNTTGGVTLEISCYNDTVSDSSFSSYGEMPFGVTDGPRYCYVLYNGTALKYLGTLPPIVKEIAISKWGHFYINGYNFFSTFPIDCISFNLTTGDSDVFWTIAYTSYTEALVQVENTAITKVTYCNSYVNNIKCSQLTANLNNGFYPVSSSEVGLVNKSVVLLPSFYTHTIVNITIGLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNNTDVYCIRSDQFSVYVHSTCKSSLWDNVFKRNCTDVLDATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCLSLSPVGANCKFDVAARTRTNDQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGRTGVGIIRQTNRTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVSDGVIYSVTPCDVSAQAAVIDGTIVGAITSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNDRTRGTAIDSNDVDCEPVITYSNIGVCKNGALVFINVTHSDGDVQPISTGNVTIPTNFTISVQVEYIQVYTTPVSIDCSRYVCNGNPRCNKLLTQYVSACQTIEQALAMGARLENMEVDSMLFVSENALKLASVEAFNSSETLDPIYKEWPNIGGSWLEGLKYILPSDNSKRKYRSAIEDLLFAKVVTSGLGTVDEDYKRCTGGYDIADLVCAQYYNGIMVLPGVANADKMTMYTASLAGGITLGALGGGAVAIPFAVAVQARLNYVALQTDVLNKNQQILASAFNQAIGNITQSFGKVNDAIHQTSRGLATVAKALAKVQDVVNTQGQALSHLTVQLQNNFQAISSSISDIYNRLDELSADAQVDRLITGRLTALNAFVSQTLTRQAEVRASRQLAKDKVNECVRSQSQRFGFCGNGTHLFSLANAAPNGMIFFHTVLLPTAYETVTAWAGICALDGDRTFGLVVKDVQLTLFRNLDDKFYLTPRTMYQPRVATSSDFVQIEGCDVLFVNATVSDLPSIIPDYIDINQTVQDILENFRPNWTVPELTFDIFNATYLNLTGEIDDLEFRSEKLHNTTVELAILIDNINNTLVNLEWLNRIETYVKWPWYVWLLIGLVVIFCIPLLLFCCCSTGCCGCIGCLGSCCHSICSRRQFENYEPIEKVHVH |
Nucleotide
| Nucleotide_Id: AY587882.1 |
Length: 4350bp |
| Description: Transmissible gastroenteritis virus strain HN2002 spike glycoprotein (S) mRNA; complete cds |
Source: Transmissible gastroenteritis virus |
| Nucleotide_type: mRNA |
Molecule type: linear |
| Data category: VRL |
Date: 1-May-04 |
| Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Transmissible gastroenteritis virus |
| CDS: AY587882.1:1..4350 |
Host: -- |
| Authors: He;K. and Yang;Q. |
Journal: Submitted (01-APR-2004) Jiangsu Academy of Agricultural Sciences; |
| Title: Direct Submission |
db_xref: taxon:11149 |
| Taxonomy: Transmissible gastroenteritis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Alphacoronavirus; Tegacovirus. |
| Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4350); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4350); strand=1); type='gene'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4350); strand=1); type='CDS') |
| Sequence: ATGAAAAAATTATTTGCGGTTTTGGTTGTAATGCCATTGATTTATGGAGACAATTTTCCTTGTTCTAAATTGACTAATAGAACTATAGGTAACCATTGGAATCTCATTGAAACCTTCCTTCTAAATTATAGTAGTAGGTTATCACCTAATTCAGATGTGGTGTTAGGTGATTATTTTCCTACTGTACAACCTTGGTTTAATTGCATTCGCAATAATAGTAATGACCTTTATGTTACATTGGAAAATCTTAAAGCATTGTATTGGGATTATGCTACAGAAAATATCACTTCGAATCACAAACAACGGTTAAACGTAGTCGTTAATGGATACCCATACTCCATCACAGTTACAACAACCCGCAATTTTAATTCTGCTGAAGGTGCTATTATATGCATTTGCAAGGGCTCACCACCTACTACCACCACAGAATCTAGTTTGACTTGCAATTGGGGTAGTGAGTGCAGGTTAAACCATAAGTTCCCTATATGTCCTTCTAATTCAGAGGCAAATTGTGGTAATATGCTGTATGGCCTACAATGGTTTGCAGATGCGGTTGTTGCTTATTTACATGGTGCTAGTTACCGTATTAGTTTTGAAAATCAATGGTCTGGCACTGTTACACTTGGTGATATGCGTGCGACTACATTAGAAACCGCTGGCACGCTTGTAGACCTTTGGTGGTTTAATCCTGTTTATGATGTCAGTTATTATAGAGTTAATAATAAAAATGGTACTACCGTAGTTTCCAATTGCACTGATCAATGTGCTAGTTATGTGGCTAATGTTTTTACTACACAGCCAGGAGGCTTTATACCATCAGATTTTAGTTTTAATAATTGGTTCCTTCTAACTAATAGCTCCACGTTGGTTAGTGGTAAATTAGTTACCAAACAGCCGTTATTAGTTAATTGCTTATGGCCAGTCCCTAGCTTTGAAGAAGCAGCTTCTACATTTTGTTTTGAAGGTGCTGGCTTTGATCAATGTAATGGTGCTGTTTTAAATAACACTGTAGACGTCATCAGGTTTAACCTTAATTTTACTACAAATGTACAATCAGGTAAGGGTGCCACAGTGTTTTCATTGAACACAACGGGTGGTGTCACTCTTGAAATCTCATGTTATAATGATACAGTGAGTGACTCGAGCTTTTCCAGTTACGGTGAAATGCCGTTCGGCGTAACTGATGGACCACGGTACTGTTACGTACTCTATAATGGCACAGCTCTTAAGTATCTAGGAACATTACCACCTATTGTCAAGGAGATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCATTTTTATATTAATGGTTACAATTTCTTTAGCACATTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAATTTGACCACTGGTGATAGTGACGTTTTCTGGACAATAGCTTACACATCGTACACTGAAGCATTAGTACAAGTTGAAAACACAGCTATTACAAAGGTGACGTATTGTAATAGTTACGTTAATAACATTAAATGCTCTCAACTTACTGCTAATTTGAATAATGGATTTTATCCTGTTTCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCTAGCTTTTACACACATACCATTGTTAACATAACTATTGGTCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCCTCAACATTAAGTAACATTACACTACCAATGCAGGATAACAACACCGATGTGTACTGTATTCGTTCTGACCAATTTTCAGTTTATGTTCATTCTACTTGCAAAAGTTCTTTATGGGACAATGTTTTTAAGCGAAACTGCACGGACGTTTTAGATGCCACAGCTGTTATAAAAACTGGTACTTGTCCTTTCTCATTTGATAAATTGAACAATTACTTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTGTCGTTGAGTCCTGTTGGTGCTAATTGTAAGTTTGATGTAGCTGCCCGTACAAGAACCAATGATCAGGTTGTTAGAAGTTTGTATGTAATATATGAAGAAGGAGACAACATAGTGGGTGTACCGTCTGATAATAGTGGTTTACACGATTTGTCAGTGCTACACCTAGATTCCTGCACAGATTACAATATATATGGTAGAACTGGTGTTGGTATTATTAGACAAACTAACAGGACGCTACTTAGTGGCTTATATTACACATCACTATCAGGTGATTTGTTAGGTTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTCATCTACTCTGTAACGCCATGTGATGTAAGCGCACAAGCAGCTGTTATTGATGGTACCATAGTTGGGGCTATCACTTCCATTAACAGTGAACTGTTAGGTCTAACACATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTACTACTCTATATATAATTACACAAATGATAGGACTCGTGGCACTGCAATTGACAGTAATGATGTTGATTGTGAACCTGTCATAACCTATTCTAACATAGGTGTTTGTAAAAATGGTGCTTTGGTTTTTATTAACGTCACACATTCTGATGGAGACGTGCAACCAATTAGCACTGGTAACGTCACGATACCTACAAACTTTACTATATCCGTGCAAGTCGAATATATTCAGGTTTACACTACACCAGTGTCAATAGACTGTTCAAGATATGTTTGTAATGGCAACCCTAGGTGTAACAAATTGTTAACACAATACGTTTCCGCATGTCAAACTATTGAGCAAGCACTTGCAATGGGTGCCAGACTTGAAAACATGGAAGTTGATTCCATGTTATTTGTTTCTGAAAATGCCCTTAAATTGGCTTCTGTCGAAGCATTCAATAGTTCAGAAACTTTAGATCCTATTTACAAAGAATGGCCTAATATAGGTGGCTCTTGGCTAGAAGGTCTAAAATACATACTTCCGTCCGATAATAGCAAACGTAAGTATCGTTCAGCTATAGAGGACTTGCTTTTTGCTAAGGTTGTAACATCTGGTTTAGGTACAGTTGATGAAGATTATAAACGTTGTACAGGTGGTTATGACATAGCTGACTTAGTATGTGCTCAATACTACAATGGCATCATGGTGCTACCTGGTGTGGCTAATGCTGACAAAATGACTATGTACACAGCATCCCTCGCAGGTGGTATAACATTAGGTGCACTTGGTGGAGGCGCCGTGGCTATACCTTTTGCAGTAGCAGTTCAGGCTAGACTTAATTATGTTGCTCTACAAACTGATGTATTGAACAAAAACCAGCAGATCCTGGCTAGTGCTTTCAATCAAGCTATTGGTAACATTACACAGTCATTTGGTAAGGTTAATGATGCTATACATCAAACATCACGAGGTCTTGCAACTGTTGCTAAAGCATTGGCAAAAGTGCAAGATGTTGTCAACACACAAGGGCAAGCTTTAAGCCACCTAACAGTACAATTGCAAAATAATTTCCAAGCCATTAGTAGTTCTATTAGTGACATTTATAATAGGCTTGATGAATTGAGTGCTGATGCACAAGTTGACAGGCTGATCACAGGAAGACTTACAGCACTTAATGCATTTGTGTCTCAGACTCTAACCAGACAAGCCGAGGTTAGGGCTAGTAGACAACTTGCCAAAGACAAGGTTAATGAATGCGTTAGGTCTCAGTCTCAGAGATTCGGATTCTGTGGTAATGGTACACATTTGTTTTCACTCGCAAATGCAGCACCAAATGGCATGATCTTCTTTCACACAGTGCTATTACCAACGGCTTATGAAACTGTGACTGCTTGGGCAGGTATTTGTGCTTTAGATGGTGATCGCACTTTTGGACTTGTCGTTAAAGATGTCCAGTTGACTTTGTTTCGTAATCTAGATGACAAGTTCTATTTGACCCCCAGAACTATGTATCAGCCTAGAGTGGCAACTAGTTCTGATTTTGTTCAAATTGAAGGGTGCGATGTGCTGTTTGTTAATGCAACTGTAAGTGATTTGCCTAGTATTATACCTGATTATATTGATATTAATCAGACTGTTCAAGACATATTAGAAAATTTTAGACCAAATTGGACTGTACCTGAGTTGACATTTGACATTTTTAACGCAACCTATTTAAACCTGACTGGTGAAATTGATGACTTAGAATTTAGGTCAGAAAAGCTACATAACACTACTGTAGAACTTGCCATTCTTATTGACAACATTAACAATACATTAGTCAATCTTGAATGGCTCAATAGAATTGAAACCTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTGTGGCTACTAATAGGCTTAGTAGTAATATTTTGCATACCATTACTGCTATTTTGCTGTTGTAGTACAGGTTGCTGTGGATGCATAGGTTGTTTAGGAAGTTGTTGTCACTCTATATGCAGTAGAAGACAATTTGAAAATTACGAACCTATTGAAAAAGTGCACGTCCATTAA |