Protein Id: AAQ20921.1 |
Length: 1205 aa |
Description: spike glycoprotein precursor Turkey coronavirus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 13-Aug-03 |
Source: Turkey coronavirus |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Turkey coronavirus |
Host: -- |
Authors: Jackwood;M.W. and Hilt;D.A. |
Title: Turkey Coronavirus Spike Glycoprotein Sequence |
Journal: Unpublished |
Taxonomy: Turkey coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
db_xref: """taxon:11152, CDD:279880, CDD:279881, CDD:223910""" |
Sequence: MLVQLCCLTILLSLVCNVSSITTICNNATVGSGVCISCTNIPEYADGKNGGEALDFYSPDVMRPSDGAYIQSGYYEPLFTGCFNQTNQTDTTCKNGLYAGSPGNFTIQGGFLQNYDAIGIMFWWGIGTNADKKSNDPIFNLTWGNFFLNFTGFPKVKSVIFIATGDIFVNGVLMGVYNLNFTQTLTIWLAQCVGTMKVVILRNSNALVHFSAGNVVAFEPCTGDTTINKLRCAYQQFNFSTGFYDIDTFVPVTPNITHLPYPDLKDNTSQEVHEFYVALKGDPVNYNQSCVDSKYSFFKLKCNNTYSWDFDKLYTLGSEIYVPGYNVYTNTATFICRHYTQIIQLVLPKGLSLENIYNNIGFNRFCVTKLLETRDISSITQYTCVYVVSVEGFDSYHSGLKYSYVGVNFDFGTAMYSVKSAPKQFIYTEQCHNYNIYNIRGVGQILNVTGKDNTTLVDGGLAITSGSGLLAFRNNGSLYSVQPCQTVSTQAVIVNGSFVGLFVPASCRLAQQFNLGNHTEYVDGGCLISNKTTIRMRRSTSAVYTGECIGLFVAMGKSCIYSNGTVLNRTLPQSSVQTSVQPLLGVVANVSIPKELTLAVTTEYLQTRYQKVTIDCAKYVCGDSARCRTLLQQYGSFCQSINAILSGVNENEDNGLLQYAEAINTGYTLNFTGYNVSNLGGFDLSLVLPKNLTLLQNQGRSTIEDLLFDKVVTLGVSEVDQNYDKCIASRGGSFTNLADLTCAQFYNGVMVLPGVVDPGLMAVYTGSLIGGMALGGITAAASIPFATQIQARVNYLALTQSVLLDNQNLIANSFNKALKGIQSALDTMSNGFAEVAKGFESVTVALNKVQDVVNTHSDILNKLMAQLSVNFGAVSSSLNEIYLKLDQINADAQVDRLITGRLTALSTYVASLQLAAYKADQSRRLALQEVEECVKSQSMRYGFCGNGSHVLTIPQSAPNGIFFIHYTYQPTVYVTIEAVPGLCVTTPSGKYGECPRLEVASYLDRMVLSLSLPHSYXEPKLLSYSEVVNLTSCEANYYNVSESETPFQPALPNFDDEFNDIFTELNTSKDAIKNISSNFNYTIPILDLQDEICRLNHSINTLYNYSDVIDKINQGLNDTFINLEQLNKITRYIKWPWYVWLAIGFACLIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVYEQYRPKKSV |
Nucleotide
Nucleotide_Id: AY342356.1 |
Length: 3618bp |
Description: Turkey coronavirus strain Gh spike glycoprotein precursor; gene; complete cds |
Source: Turkey coronavirus |
Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 13-Aug-03 |
Class virus: Coronaviridae |
Virus name: Turkey coronavirus |
CDS: AY342356.1:1..3618 |
Host: -- |
Authors: Jackwood;M.W. and Hilt;D.A. |
Journal: Unpublished |
Title: Turkey Coronavirus Spike Glycoprotein Sequence |
db_xref: taxon:11152 |
Taxonomy: Turkey coronavirus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Gammacoronavirus; Igacovirus. |
Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3702); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(3618); strand=1); type='CDS'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(1614); strand=1); type='mat_peptide'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(1614); ExactPosition(3615); strand=1); type='mat_peptide') |
Sequence: ATGTTGGTCCAGTTGTGCTGCCTGACGATACTCTTGTCACTTGTATGTAATGTGAGTTCTATTACCACAATTTGTAATAATGCCACTGTAGGTAGTGGTGTGTGTATATCTTGCACAAACATACCAGAGTATGCTGATGGTAAAAATGGGGGTGAAGCCCTAGATTTTTATAGTCCAGATGTCATGCGACCGTCAGACGGTGCGTATATACAATCCGGTTATTACGAACCACTTTTTACAGGTTGCTTTAACCAAACTAATCAAACTGATACCACCTGTAAAAATGGGCTTTATGCAGGGTCGCCAGGTAATTTTACTATACAAGGTGGTTTTCTTCAAAATTATGATGCTATTGGCATAATGTTTTGGTGGGGCATTGGTACTAATGCAGATAAAAAATCCAATGATCCCATTTTTAATTTAACATGGGGCAACTTTTTCCTTAATTTTACAGGTTTCCCTAAAGTTAAAAGTGTTATATTCATTGCCACTGGAGATATTTTTGTAAATGGTGTTTTAATGGGTGTTTATAATCTAAATTTTACGCAAACCTTAACAATTTGGTTAGCACAGTGTGTTGGCACAATGAAAGTTGTTATTTTACGTAATAGTAATGCTCTAGTTCACTTTTCAGCTGGCAACGTAGTTGCTTTTGAACCCTGCACAGGAGACACTACTATTAATAAGTTACGTTGCGCTTATCAGCAATTTAATTTTTCTACAGGATTTTATGACATAGATACTTTTGTACCTGTGACACCTAATATTACACATTTACCTTACCCAGATTTAAAAGATAATACTAGTCAAGAGGTACATGAATTTTATGTAGCTCTTAAAGGAGATCCTGTTAATTACAATCAAAGTTGTGTAGACTCTAAGTACTCATTCTTTAAATTAAAGTGTAATAATACTTATTCTTGGGATTTTGATAAGCTTTATACATTAGGGTCTGAAATATATGTGCCGGGGTATAATGTTTACACTAATACGGCAACATTCATATGCCGGCACTATACCCAAATTATCCAACTTGTTCTTCCCAAAGGTCTTAGTTTGGAGAATATTTATAATAATATAGGTTTCAATAGATTTTGTGTAACTAAATTGTTAGAGACTCGTGATATATCATCTATAACCCAATACACTTGTGTTTATGTCGTTAGTGTAGAAGGTTTTGATAGTTATCATAGTGGTCTTAAATACAGTTATGTTGGTGTAAACTTTGATTTTGGTACAGCTATGTATAGTGTGAAAAGTGCACCCAAGCAGTTCATCTATACAGAGCAGTGTCATAATTATAATATTTACAACATAAGAGGTGTTGGTCAAATATTAAATGTCACTGGTAAAGATAATACTACACTTGTAGACGGTGGTCTAGCAATAACCAGTGGCAGTGGTTTATTGGCCTTTCGTAATAATGGAAGTCTTTATAGTGTACAACCTTGCCAGACAGTTTCAACTCAAGCTGTAATTGTTAATGGGAGTTTTGTAGGCTTGTTTGTTCCTGCATCTTGTCGGTTAGCCCAGCAATTTAATCTAGGTAACCACACAGAATATGTAGATGGTGGTTGTCTTATTAGTAATAAGACTACTATTAGAATGCGTAGGTCTACTAGCGCTGTTTATACTGGTGAATGCATAGGTTTATTTGTAGCTATGGGTAAATCTTGTATTTATAGTAATGGCACAGTTCTTAATAGAACATTACCACAATCATCTGTTCAAACTAGTGTGCAACCATTACTAGGTGTTGTAGCAAATGTGTCTATTCCAAAAGAATTGACACTTGCTGTAACCACAGAATACTTACAAACTCGTTATCAGAAAGTTACTATTGATTGTGCTAAATATGTTTGCGGTGATTCTGCAAGGTGCCGCACATTGCTGCAGCAGTATGGTTCTTTTTGCCAGAGTATTAATGCTATATTAAGTGGTGTTAATGAGAATGAAGATAATGGTTTACTGCAATATGCGGAAGCTATTAATACAGGTTACACACTTAATTTTACTGGTTATAATGTATCTAATTTGGGTGGGTTTGATTTGTCGCTTGTTCTACCCAAAAATCTTACTCTGTTACAAAATCAAGGTAGGTCTACTATTGAAGACTTACTTTTTGACAAAGTTGTTACTCTAGGTGTTAGTGAAGTTGATCAGAATTATGATAAATGTATAGCATCTAGAGGTGGTTCTTTTACTAATTTAGCAGATTTAACTTGTGCTCAGTTTTACAATGGTGTGATGGTGCTTCCTGGTGTTGTTGACCCTGGCCTAATGGCGGTGTACACCGGTTCTTTAATAGGTGGTATGGCGCTTGGAGGCATTACAGCAGCGGCATCCATACCATTTGCTACTCAAATACAAGCACGTGTCAATTATTTAGCGTTGACACAATCGGTGCTTTTAGATAACCAAAATTTGATAGCAAATTCTTTTAATAAAGCCCTTAAAGGTATACAGTCAGCATTAGACACTATGTCCAATGGATTTGCTGAAGTAGCTAAAGGTTTTGAGAGTGTAACTGTAGCACTTAACAAAGTCCAGGATGTAGTTAATACACATTCCGACATATTAAATAAACTTATGGCTCAGCTTAGTGTTAATTTTGGGGCTGTTTCATCTTCTCTTAATGAGATATACCTAAAATTAGACCAGATTAATGCAGATGCTCAGGTTGATAGGTTAATTACTGGTAGGTTGACTGCATTATCAACTTATGTAGCATCTCTTCAATTAGCAGCTTATAAGGCTGATCAGTCAAGACGCTTGGCTCTACAGGAAGTAGAGGAGTGTGTTAAGTCGCAATCTATGCGATATGGTTTCTGTGGTAATGGTAGCCATGTTCTAACAATACCACAGAGCGCTCCTAATGGAATATTTTTCATCCACTACACGTACCAACCCACTGTTTATGTTACGATTGAAGCAGTGCCTGGTCTATGTGTAACAACACCTTCTGGAAAGTATGGTGAATGCCCAAGACTGGAAGTGGCATCATATTTAGACAGAATGGTACTTTCTTTGTCACTTCCACACAGTTATANTGAGCCTAAGCTTTTATCATATTCAGAAGTGGTTAATTTAACATCTTGTGAAGCTAATTATTACAATGTTAGTGAAAGTGAAACACCCTTTCAACCAGCATTGCCTAATTTCGATGATGAGTTTAATGACATTTTTACTGAGTTAAATACCTCAAAAGATGCCATTAAAAATATCAGTTCCAATTTTAACTACACAATTCCCATCCTAGATCTTCAGGATGAGATTTGTAGATTGAATCACTCCATTAACACACTATATAATTATAGTGATGTTATTGATAAAATTAACCAGGGTCTTAATGACACCTTTATTAATCTTGAACAACTTAATAAAATCACACGTTACATTAAGTGGCCTTGGTATGTTTGGTTAGCAATTGGTTTTGCTTGTTTAATATTCATCTTAATATTAGGATGGGTGTTTTTCATGACCGGTTGCTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGCATTATTCCGCTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCCTCTTACTACACGACTTTTGATAATGATGTGGTGTATGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA |