Protein Id: AAF05704.1 |
Length: 1361 aa |
Description: spike protein Murine hepatitis virus. |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 3-Nov-99 |
Source: Murine hepatitis virus |
Class virus: hepatitis virus |
Virus name: Murine hepatitis virus |
Host: -- |
Authors: Yamada;Y.K. and Yabe;M. |
Title: Sequence analysis of major structural proteins of newly isolated mouse hepatitis virus |
Journal: Unpublished |
Taxonomy: Murine hepatitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
db_xref: """taxon:11138, CDD:293060, CDD:286493, CDD:279881""" |
Sequence: MLFVFILLLPSCLGYIGDFRCINLVNTDTSNASAPIVSTEVVDVSKGIGTYYVLDRVYLNAILLLTGYYPVDGSNYRNLALTGTNTISLNWYKPPFLSEFNDGIFAKVKNLKASLPKDSISYFPTIVIGSNFVNTSYTVVLEPYNGIIMASICHYTICQLPYTDCKPKTGGNKLIGFWHIDLKPPVCILKRNFTFNVNTDWLYFHFYQQGGTFYAYYADVGSATTFLFSSYIGDVLTQYFVLPYVCNTPTAGVFSPQYWVTPLVKRQYLFNFNQKGVITSAVDCASSYTSEIKCKTQSMNPSTGVYDLTGYTVQPVGVVYRRVRNLPDCKIEDWLTAKTVPSPLNWERKTFQNCNFNLSSLLRFVQAESLSCSNIDASKVYGMCFGSVSIDKFAIPNRRRVDLQLGNSGFLQSFNYKIDTRATSCQLYYSLAQNNVTVINHNPSSWNRRYGFNDVATFGNGKHDVAYAEACYTVGASYCPCANPSIVSPCTQDKPKAANCPVGTRNRECNPLALGSNLFKCDCTCNPSPLTTYDLRCLQARSMLGVGDHCEGLGVLEDKCGGSNTCNCSADAFVGWAKDSCLSNGYCHIFSNFVLNGINSGTTCSTDLQLPNTEVIIGVCVKYDLYGITGQGVFKEVKADYYNSWQNLLYDVNGNLNGFRDIVTNKTYLIRSCYSGRVSAAYHQDAPEPALLYRNLKCDYVFNNNISREETPLNYFDSYLGCVVNADNSTEQSVDACDLRMGSGLCVNFSLAHRARRSVSTGYKLTTFEPFTVSIVNDSAESVGGLYEMQIPTNFTIASHQEFIQTRSPKVTIDCAAFVCGDYTACRQQLIEYGSFCDNINAILGEVNNLIDTMQLQVASALIQGVTLSSRLADGISGQIDDINFSPLLGCLGSQCSEGTMAAQGRSTIEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGQEVRDLLCVQSFNGIKVLPPVLSENQISGYTAGATASSMFPPWSAAAGVPFSLSVQYRINGLGVTMNVLSENQKMIASAFNNAIGAIQEGFDATNSALAKIQSVVNANAEALNNLLNQLSNRFGAISASLQEILSRLDALEAQAQIDRLINGRLTALNAYVSKQLSDMTLIKVSAAQAVEKVNECVKSQSPRINFCGNGNHILSLVQNAPYGLYFIHFSYVPTSFTTANVSTGLCISGDRGLAPKAGYFVQDNGEWKFTGSNYYYPEPINDKNSVVMSSCAVNYTKAPEVFLNTSLPNLPDFKEELDKWFKNQTSVAPDLSLDFEKLNVTFLDLSGEMNRIQEAIKKLNESYINLKEVGTYEMYVKWPWYVWLLIGLAGVAVCVLLFFICCCTGCGSCCFKRCGNCCDEYGGHQDSIVIHNILSHED |
Nucleotide
Nucleotide_Id: AF190406.1 |
Length: 4086bp |
Description: Murine hepatitis virus strain TY spike protein gene; complete cds |
Source: Murine hepatitis virus |
Nucleotide_type: RNA |
Molecule type: linear |
Data category: VRL |
Date: 3-Nov-99 |
Class virus: hepatitis virus |
Virus name: Murine hepatitis virus |
CDS: AF190406.1:1..4086 |
Host: -- |
Authors: Yamada;Y.K. and Yabe;M. |
Journal: Unpublished |
Title: Sequence analysis of major structural proteins of newly isolated mouse hepatitis virus |
db_xref: taxon:11138 |
Taxonomy: Murine hepatitis virus Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota; Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae; Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus; Embecovirus. |
Features: SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4086); strand=1); type='source'); SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(0); ExactPosition(4086); strand=1); type='CDS') |
Sequence: ATGCTGTTCGTTTTTATCTTACTGTTACCCTCTTGCTTAGGGTATATTGGTGATTTTAGATGTATCAACCTTGTAAACACTGACACCTCTAATGCTAGCGCTCCAATCGTTAGTACTGAAGTGGTTGATGTTTCCAAAGGAATTGGTACGTATTATGTTTTAGATCGTGTCTATTTAAATGCCATATTATTGCTTACTGGTTATTATCCTGTGGATGGTTCCAATTATAGGAACCTGGCTTTAACGGGAACTAACACCATAAGTCTTAATTGGTATAAACCACCCTTTTTATCAGAGTTTAATGATGGCATTTTTGCTAAGGTAAAGAACCTTAAAGCATCTTTGCCCAAAGACTCTATATCATACTTCCCTACTATAGTCATAGGCAGTAATTTTGTTAATACTTCTTATACTGTAGTATTGGAACCCTATAATGGTATAATTATGGCATCCATTTGCCATTATACCATTTGTCAATTACCGTATACGGATTGCAAACCCAAAACGGGCGGTAACAAGCTAATTGGTTTTTGGCACATAGATTTAAAACCCCCGGTGTGCATTTTAAAGCGTAATTTCACGTTTAATGTTAATACCGATTGGCTTTATTTTCATTTTTACCAGCAGGGTGGTACTTTTTATGCGTATTATGCAGATGTTGGTTCTGCTACTACGTTTTTGTTTAGTTCGTATATTGGCGATGTGTTAACACAGTATTTTGTGTTGCCTTATGTGTGTAACACCCCTACGGCGGGTGTCTTTTCACCGCAGTATTGGGTTACACCTCTTGTTAAGCGCCAATATTTATTTAATTTTAATCAGAAGGGTGTCATTACTAGTGCTGTTGATTGTGCTAGTAGTTATACCAGTGAAATAAAGTGTAAGACTCAAAGTATGAACCCCAGTACGGGAGTTTATGACCTTACTGGTTACACTGTGCAACCTGTTGGTGTAGTCTATCGGAGAGTTAGAAATTTGCCCGATTGTAAAATAGAGGATTGGTTAACTGCTAAGACAGTACCCTCTCCTCTCAATTGGGAACGCAAAACATTTCAAAATTGTAACTTCAACCTGAGCAGTCTATTAAGATTTGTTCAGGCTGAGTCACTCTCATGTAGTAATATAGATGCTTCCAAGGTTTATGGTATGTGTTTTGGCAGTGTATCTATAGATAAATTTGCAATACCCAATCGGCGCCGCGTTGACCTTCAGCTAGGTAACTCGGGGTTTTTGCAATCATTTAATTATAAAATTGATACAAGAGCGACTTCGTGTCAGCTCTATTATAGTCTTGCACAAAATAATGTCACTGTTATTAACCATAACCCCTCCTCCTGGAATAGGCGTTATGGATTTAATGATGTGGCTACATTTGGTAATGGCAAGCATGACGTTGCCTATGCTGAGGCGTGCTATACTGTTGGGGCATCTTATTGCCCTTGTGCTAATCCCAGCATAGTATCGCCGTGCACACAAGATAAACCTAAGGCTGCCAATTGCCCAGTAGGTACACGCAATCGTGAGTGCAACCCTCTGGCACTTGGCAGTAATCTATTTAAGTGTGACTGCACCTGCAACCCTAGTCCCCTAACTACCTATGACCTTAGGTGCCTCCAAGCAAGGAGCATGCTAGGCGTAGGTGATCATTGTGAGGGTCTAGGTGTCTTAGAAGATAAGTGTGGTGGCAGCAATACGTGCAATTGTTCTGCTGATGCCTTCGTTGGCTGGGCTAAGGATAGCTGCCTTTCTAATGGCTACTGCCACATTTTCAGTAATTTTGTGTTAAATGGCATTAATAGTGGTACAACTTGTTCCACGGATTTGCAATTGCCTAATACTGAAGTGATCATTGGCGTTTGTGTCAAGTATGATCTCTATGGTATTACAGGCCAAGGTGTTTTTAAGGAGGTTAAGGCTGATTATTATAATAGTTGGCAGAACCTATTATATGATGTTAATGGTAACTTAAATGGCTTTCGTGATATTGTTACCAATAAGACTTATTTAATACGAAGTTGCTATAGTGGGCGTGTTTCGGCTGCATACCATCAAGATGCACCTGAACCAGCTCTACTATATCGCAATTTAAAATGTGATTATGTCTTTAATAACAACATATCCCGTGAGGAGACACCACTTAACTATTTTGATAGTTACTTGGGCTGTGTTGTTAATGCTGATAACTCAACTGAGCAGTCTGTTGACGCGTGTGATTTGCGTATGGGTAGTGGGCTCTGTGTCAACTTCTCACTCGCCCATCGCGCGCGCAGGTCTGTCAGTACGGGTTACAAATTAACTACTTTTGAACCATTTACAGTCAGCATTGTCAATGATAGTGCTGAGTCTGTTGGTGGACTATATGAGATGCAAATACCAACCAACTTTACTATAGCTAGCCATCAGGAGTTCATTCAAACGAGGTCTCCAAAGGTTACTATAGACTGCGCTGCGTTTGTCTGTGGTGATTACACAGCATGTCGGCAGCAGTTGATTGAGTATGGATCTTTTTGTGATAATATTAATGCCATTCTTGGCGAGGTGAATAACCTCATAGATACTATGCAACTCCAAGTTGCTAGTGCTCTGATTCAAGGTGTCACGCTAAGTTCACGCTTGGCAGATGGCATTTCAGGTCAGATTGATGATATTAACTTTAGTCCTCTTCTAGGCTGTCTTGGCTCACAGTGCAGCGAAGGCACCATGGCAGCGCAAGGGCGCTCAACTATAGAGGATTTGTTATTCGATAAAGTCAAACTCTCTGATGTTGGATTTGTCGAAGCATATAACAATTGCACTGGAGGTCAAGAAGTTAGGGACCTACTATGTGTGCAATCGTTCAATGGCATCAAAGTGCTACCGCCTGTATTGTCTGAGAATCAAATTTCCGGCTATACAGCGGGTGCTACTGCATCTTCTATGTTCCCCCCGTGGTCCGCAGCTGCAGGGGTGCCATTTTCTTTAAGTGTTCAATATAGAATTAATGGTCTGGGTGTCACTATGAATGTTCTTAGTGAAAACCAGAAAATGATAGCTAGTGCATTCAACAACGCGATAGGTGCTATACAGGAGGGGTTCGATGCAACCAATTCCGCATTAGCAAAAATTCAGTCCGTTGTCAATGCAAATGCAGAAGCACTTAATAATTTATTAAACCAGCTTTCTAATAGGTTTGGTGCAATTAGTGCTTCTTTACAAGAGATTCTATCTCGCCTTGATGCTCTTGAAGCACAGGCTCAGATAGATCGTCTTATTAATGGCAGATTAACTGCACTTAATGCTTACGTCTCTAAGCAGCTGAGTGACATGACCCTTATTAAGGTGAGTGCTGCTCAGGCTGTGGAGAAAGTTAATGAGTGTGTTAAAAGCCAATCACCTAGGATAAATTTTTGTGGCAATGGCAATCACATATTGTCATTAGTCCAAAATGCGCCTTATGGTTTATATTTTATTCATTTCAGCTATGTGCCTACATCCTTTACAACAGCTAATGTGAGTACTGGACTCTGCATTTCTGGTGATAGAGGATTAGCACCTAAAGCTGGATATTTTGTTCAAGATAATGGAGAGTGGAAGTTCACAGGTAGCAATTATTACTACCCTGAACCCATAAATGATAAAAACAGTGTCGTCATGAGTAGTTGCGCGGTAAACTATACAAAAGCGCCTGAAGTTTTCTTGAACACTTCACTACCTAACCTACCCGATTTTAAGGAGGAGTTAGATAAATGGTTTAAGAATCAGACGTCTGTTGCGCCTGATTTATCTCTCGATTTCGAGAAGTTAAATGTTACATTCCTTGACCTGTCCGGTGAGATGAACAGGATTCAGGAAGCAATTAAGAAGTTAAATGAGAGCTACATCAACCTCAAGGAAGTTGGCACATATGAAATGTATGTGAAATGGCCTTGGTATGTGTGGTTGCTAATTGGATTAGCTGGTGTAGCTGTCTGTGTTTTGTTATTTTTCATATGTTGCTGCACAGGTTGCGGCTCATGTTGTTTTAAAAGGTGTGGAAATTGTTGTGACGAGTATGGAGGACACCAGGACAGTATTGTGATACATAATATTTTATCCCACGAGGATTGA |