Accession Number |
Protein Id |
Protein Description |
Protein Sequence |
Nucleotide Id |
Nucleotide Description |
Nucleotide Sequence |
isolate |
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DVSP51815298 |
QYO14334.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ730645.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/NY-CDC-FG-048413/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/NY-CDC-FG-048413/2021 |
RNA |
USA: New York |
2021/7/21 |
DVSP51815299 |
QYO14245.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ730637.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/NY-CDC-FG-048385/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/NY-CDC-FG-048385/2021 |
RNA |
USA: New York |
2021/7/21 |
DVSP51815300 |
QYO14234.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
MFVFLVLLPLVSSQCVNLRTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLDVYYHKNNKSWMESGVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYRYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSKPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSRRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQNVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/NY-CDC-FG-048368/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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USA: New York |
2021/7/21 |
DVSP51815301 |
QYO14157.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ730629.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/NY-CDC-FG-048253/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/NY-CDC-FG-048253/2021 |
RNA |
USA: New York |
2021/7/21 |
DVSP51815302 |
QYO13900.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFGNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYHKNNKSWMESESRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYRYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLNVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQHVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
MZ730606.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/LA-CDC-FG-048504/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; and surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
ATGTTTGTTTTTCTTGTTTTATTGCCACTAGTCTCTAGTCAGTGTGTTAATCTTACAACCAGAACTCAATTACCCCCTGCATACACTAATTCTTTCACACGTGGTGTTTATTACCCTGACAAAGTTTTCAGATCCTCAGTTTTACATTCAACTCAGGACTTGTTCTTACCTTTCTTTTCCAATGTTACTTGGTTCCATGCTATACATGTCTCTGGGACCAATGGTACTAAGAGGTTTGGTAACCCTGTCCTACCATTTAATGATGGTGTTTATTTTGCTTCCACTGAGAAGTCTAACATAATAAGAGGCTGGATTTTTGGTACTACTTTAGATTCGAAGACCCAGTCCCTACTTATTGTTAATAACGCTACTAATGTTGTTATTAAAGTCTGTGAATTTCAATTTTGTAATGATCCATTTTTGGGTGTTTACCACAAAAACAACAAAAGTTGGATGGAAAGTGAGTCCAGAGTTTATTCTAGTGCGAATAATTGCACTTTTGAATATGTCTCTCAGCCTTTTCTTATGGACCTTGAAGGAAAACAGGGTAATTTCAAAAATCTTAGGGAATTTGTGTTTAAGAATATTGATGGTTATTTTAAAATATATTCTAAGCACACGCCTATTAATTTAGTGCGTGATCTCCCTCAGGGTTTTTCGGCTTTAGAACCATTGGTAGATTTGCCAATAGGTATTAACATCACTAGGTTTCAAACTTTACTTGCTTTACATAGAAGTTATTTGACTCCTGGTGATTCTTCTTCAGGTTGGACAGCTGGTGCTGCAGCTTATTATGTGGGTTATCTTCAACCTAGGACTTTTCTATTAAAATATAATGAAAATGGAACCATTACAGATGCTGTAGACTGTGCACTTGACCCTCTCTCAGAAACAAAGTGTACGTTGAAATCCTTCACTGTAGAAAAAGGAATCTATCAAACTTCTAACTTTAGAGTCCAACCAACAGAATCTATTGTTAGATTTCCTAATATTACAAACTTGTGCCCTTTTGGTGAAGTTTTTAACGCCACCAGATTTGCATCTGTTTATGCTTGGAACAGGAAGAGAATCAGCAACTGTGTTGCTGATTATTCTGTCTTATATAATTCCGCATCATTTTCCACTTTTAAGTGTTATGGAGTGTCTCCTACTAAATTAAATGATCTCTGCTTTACTAATGTCTATGCAGATTCATTTGTAATTAGAGGTGATGAAGTCAGACAAATCGCTCCAGGGCAAACTGGAAAGATTGCTGATTATAATTATAAATTACCAGATGATTTTACAGGCTGCGTTATAGCTTGGAATTCTAACAATCTTGATTCTAAGGTTGGTGGTAATTATAATTACCGGTATAGATTGTTTAGGAAGTCTAATCTCAAACCTTTTGAGAGAGATATTTCAACTGAAATCTATCAGGCCGGTAGCACACCTTGTAATGGTGTTGAAGGTTTTAATTGTTACTTTCCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACTAATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTAGTAGTACTTTCTTTTGAACTTCTACATGCACCAGCAACTGTTTGTGGACCTAAAAAGTCTACTAATTTGGTTAAAAACAAATGTGTCAATTTCAACTTCAATGGTTTAACAGGCACAGGTGTTCTTACTGAGTCTAACAAAAAGTTTCTGCCTTTCCAACAATTTGGCAGAGACATTGCTGACACTACTGATGCTGTCCGTGATCCACAGACACTTGAGATTCTTGACATTACACCATGTTCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCAGGAACAAATACTTCTAACCAGGTTGCTGTTCTTTATCAGGGTGTTAACTGCACAGAAGTCCCTGTTGCTATTCATGCAGATCAACTTACTCCTACTTGGCGTGTTTATTCTACAGGTTCTAATGTTTTTCAAACACGTGCAGGCTGTTTAATAGGGGCTGAACATGTCAACAACTCATATGAGTGTGACATACCCATTGGTGCAGGTATATGCGCTAGTTATCAGACTCAGACTAATTCTCCTCGGCGGGCACGTAGTGTAGCTAGTCAATCCATCATTGCCTACACTATGTCACTTGGTGCAGAAAATTCAGTTGCTTACTCTAATAACTCTATTGCCATACCCACAAATTTTACTATTAGTGTTACCACAGAAATTCTACCAGTGTCTATGACCAAGACATCAGTAGATTGTACAATGTACATTTGTGGTGATTCAACTGAATGCAGCAATCTTTTGTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACACAATTAAACCGTGCTTTAACTGGAATAGCTGTTGAACAAGACAAAAACACCCAAGAAGTTTTTGCACAAGTCAAACAAATTTATAAAACACCACCAATTAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCAGATCCATCAAAACCAAGCAAGAGGTCATTTATTGAAGATCTACTTTTCAACAAAGTGACACTTGCAGATGCTGGCTTCATCAAACAATATGGTGATTGCCTTGGTGATATTGCTGCTAGAGACCTCATTTGTGCACAAAAGTTTAACGGCCTTAATGTTTTGCCACCTTTGCTCACAGATGAAATGATTGCTCAATACACTTCTGCACTGTTAGCGGGTACAATCACTTCTGGTTGGACCTTTGGTGCAGGTGCTGCATTACAAATACCATTTGCTATGCAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGAGTTACACAGAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAATTGATTGCCAACCAATTTAATAGTGCTATTGGCAAAATTCAAGACTCACTTTCTTCCACAGCAAGTGCACTTGGAAAACTTCAACATGTGGTCAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAGCTCCAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTTTTAAATGATATCCTTTCACGTCTTGACAAAGTTGAGGCTGAAGTGCAAATTGATAGGTTGATCACAGGCAGACTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAACAATTAATTAGAGCTGCAGAAATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCAGAGTGTGTACTTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATGTCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTATGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATGATGGAAAAGCACACTTTCCTCGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACACACTGGTTTGTAACACAAAGGAATTTTTATGAACCACAAATCATTACTACAGACAACACATTTGTGTCTGGTAACTGTGATGTTGTAATAGGAATTGTCAACAACACAGTTTATGATCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCATTCAAGGAGGAGTTAGATAAATATTTTAAGAATCATACATCACCAGATGTTGATTTAGGTGACATCTCTGGCATTAATGCTTCAGTTGTAAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTTGCCAAGAATTTAAATGAATCTCTCATCGATCTCCAAGAACTTGGAAAGTATGAGCAGTATATAAAATGGCCATGGTACATTTGGCTAGGTTTTATAGCTGGCTTGATTGCCATAGTAATGGTGACAATTATGCTTTGCTGTATGACCAGTTGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGTGGATCCTGCTGCAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCAGTGCTCAAAGGAGTCAAATTACATTACACATAA |
SARS-CoV-2/human/USA/LA-CDC-FG-048504/2021 |
RNA |
USA: Louisiana |
2021/7/20 |
DVSP51815303 |
QYO13668.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAISGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTYGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIDDTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSHRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPINFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILARLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTHNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
MZ730585.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/AL-CDC-FG-048439/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; and surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), truncated ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/AL-CDC-FG-048439/2021 |
RNA |
USA: Alabama |
2021/7/19 |
DVSP51815304 |
QYO13102.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ730534.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/NJ-CDC-FG-048552/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; and surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), truncated ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/NJ-CDC-FG-048552/2021 |
RNA |
USA: New Jersey |
2021/7/17 |
DVSP51815305 |
QYO12727.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ730500.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/NY-CDC-FG-048398/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; and surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/NY-CDC-FG-048398/2021 |
RNA |
USA: New York |
2021/7/19 |
DVSP51815306 |
QYO12569.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ730486.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-048112/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-048112/2021 |
nasal swab |
USA: California |
2021/7/22 |
DVSP51815307 |
QYO12415.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ730472.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-048097/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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nasal swab |
USA: California |
2021/7/24 |
DVSP51815308 |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-048168/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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2021/7/24 |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-048090/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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USA: California |
2021/7/24 |
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MZ730249.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049447/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049447/2021 |
nasal swab |
USA: California |
2021/7/24 |
DVSP51815311 |
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MZ730212.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049416/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; and surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049416/2021 |
nasal swab |
USA: California |
2021/7/24 |
DVSP51815312 |
QYO09007.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAISGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTYGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIDDTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSHRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPINFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILARLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTHNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
MZ730163.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049239/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; and surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), truncated ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049239/2021 |
nasal swab |
USA: California |
2021/7/23 |
DVSP51815313 |
QYO08753.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ730140.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049379/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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nasal swab |
USA: California |
2021/7/23 |
DVSP51815314 |
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MZ730056.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049342/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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2021/7/23 |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049360/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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USA: California |
2021/7/23 |
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MZ730044.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049200/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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USA: California |
2021/7/23 |
DVSP51815317 |
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MZ730034.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049340/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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2021/7/23 |
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MZ730005.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049305/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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USA: California |
2021/7/23 |
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QYO07240.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049108/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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nasal swab |
USA: California |
2021/7/23 |
DVSP51815320 |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049068/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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USA: California |
2021/7/23 |
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MZ729979.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049221/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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USA: California |
2021/7/23 |
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MZ729954.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049086/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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nasal swab |
USA: California |
2021/7/23 |
DVSP51815323 |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049149/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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USA: California |
2021/7/23 |
DVSP51815324 |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049015/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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USA: California |
2021/7/23 |
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2021/7/23 |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049130/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-049144/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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USA: California |
2021/7/23 |