Accession Number |
Protein Id |
Protein Description |
Protein Sequence |
Nucleotide Id |
Nucleotide Description |
Nucleotide Sequence |
isolate |
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DVSP51815358 |
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surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/WA-CDC-UW21071446526/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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nasal |
USA: Washington |
2021/7/14 |
DVSP51815359 |
QYN99833.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ729406.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/WA-CDC-UW21071427715/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) gene, complete cds; ORF1a polyprotein (ORF1ab) gene, partial cds; and surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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nasal |
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2021/7/14 |
DVSP51815360 |
QYN99533.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ729379.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/WA-CDC-UW21071537600/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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nasal |
USA: Washington |
2021/7/15 |
DVSP51815361 |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/WA-CDC-UW21071549890/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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Nasal - Anterior Nares |
USA: Illinois |
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QYN97092.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ729084.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/TN-CDC-ASC210155785/2021, complete genome. |
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SARS-CoV-2/human/USA/TN-CDC-ASC210155785/2021 |
Nasal - Anterior Nares |
USA: Tennessee |
2021/7/1 |
DVSP51815365 |
QYN96991.1 |
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MZ729075.1 |
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SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-ASC210154953/2021 |
Nasal - Anterior Nares |
USA: California |
2021/6/28 |
DVSP51815366 |
QYN96969.1 |
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MZ729073.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/GA-CDC-ASC210154614/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/GA-CDC-ASC210154614/2021 |
Nasal - Anterior Nares |
USA: Georgia |
2021/6/28 |
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surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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SARS-CoV-2/human/USA/FL-CDC-ASC210110134/2021 |
Nasal - Anterior Nares |
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2021/6/18 |
DVSP51815371 |
QYN96636.1 |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/NC-CDC-ASC210155061/2021, complete genome. |
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SARS-CoV-2/human/USA/NC-CDC-ASC210155061/2021 |
Nasal - Anterior Nares |
USA: North Carolina |
2021/6/29 |
DVSP51815372 |
QYN96503.1 |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-ASC210155579/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-ASC210155579/2021 |
Nasal - Anterior Nares |
USA: California |
2021/7/1 |
DVSP51815373 |
QYN96447.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ729027.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/NJ-CDC-ASC210111654/2021, complete genome. |
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2021/7/6 |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/FL-CDC-ASC210155987/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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2021/7/9 |
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Nasal - Anterior Nares |
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2021/7/6 |
DVSP51815377 |
QYN96241.1 |
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MZ729009.1 |
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NP Swab |
USA: Tennessee |
2021/7/8 |
DVSP51815378 |
QYN96084.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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2021/7/9 |
DVSP51815379 |
QYN95745.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ728965.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/TX-CDC-ASC210111402/2021, complete genome. |
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SARS-CoV-2/human/USA/TX-CDC-ASC210111402/2021 |
NP Swab |
USA: Texas |
2021/7/2 |
DVSP51815380 |
QYN95558.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ728948.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/MN-CDC-IBX859586675203/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), and ORF6 protein (ORF6) genes, complete cds; ORF7a gene, complete sequence; and ORF7b (ORF7b), truncated ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/MN-CDC |
nasal swab |
USA: Minnesota |
2021/7/11 |
DVSP51815381 |
QYN95198.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ728906.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-048933/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds; surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), and ORF7a protein (ORF7a) genes, complete cds; ORF7b gene, complete sequence; and truncated ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-FG-048933/2021 |
nasal swab |
USA: California |
2021/7/23 |
DVSP51815382 |
QYN95027.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAISGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTYGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIDDTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSHRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPINFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILARLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTHNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
MZ728890.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/FL-CDC-ASC210113834/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), truncated ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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USA: Florida |
2021/7/12 |
DVSP51815383 |
QYN95015.1 |
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/FL-CDC-ASC210113832/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), truncated ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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Nasal - Anterior Nares |
USA: Florida |
2021/7/12 |
DVSP51815384 |
QYN94748.1 |
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MZ728844.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-ASC210113286/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), and ORF7b (ORF7b) genes, complete cds; ORF8 gene, complete sequence; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
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SARS-CoV-2/human/USA/CA-CDC-ASC210113286/2021 |
Nasal - Anterior Nares |
USA: California |
2021/7/12 |
DVSP51815386 |
QYN94402.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ728834.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/UT-CDC-ASC210113505/2021, complete genome. |
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SARS-CoV-2/human/USA/UT-CDC-ASC210113505/2021 |
Nasal - Anterior Nares |
USA: Utah |
2021/7/11 |
DVSP51815387 |
QYN94180.1 |
surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]. |
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MZ728814.1 |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/NJ-CDC-IBX977762195460/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), and ORF7a protein (ORF7a) genes, complete cds; ORF7b gene, complete sequence; and truncated ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds. |
ATGTTTGTTTTTCTTGTTTTATTGCCACTAGTCTCTAGTCAGTGTGTTAATCTTACAACCAGAACTCAATTACCCCCTGCATACACTAATTCTTTCACACGTGGTGTTTATTACCCTGACAAAGTTTTCAGATCCTCAGTTTTACATTCAACTCAGGACTTGTTCTTACCTTTCTTTTCCAATGTTACTTGGTTCCATGCTATCTCTGGGACCAATGGTACTAAGAGGTTTGATAACCCTGTCCTACCATTTAATGATGGTGTTTATTTTGCTTCCACTGAGAAGTCTAACATAATAAGAGGCTGGATTTTTGGTACTACTTTAGATTCGAAGACCCAGTCCCTACTTATTGTTAATAACGCTACTAATGTTGTTATTAAAGTCTGTGAATTTCAATTTTGTAATGATCCATTTTTGGGTGTTTACCACAAAAACAACAAAAGTTGGATGGAAAGTGAGTTCAGAGTTTATTCTAGTGCGAATAATTGCACTTTTGAATATGTCTCTCAGCCTTTTCTTATGGACCTTGAAGGAAAACAGGGTAATTTCAAAAATCTTAGGGAATTTGTGTTTAAGAATATTGATGGTTATTTTAAAATATATTCTAAGCACACGCCTATTAATTTAGTGCGTGATCTCCCTCAGGGTTTTTCGGCTTTAGAACCATTGGTAGATTTGCCAATAGGTATTAACATCACTAGGTTTCAAACTTTACTTGCTTTACATAGAAGTTATTTGACTCCTGGTGATTCTTCTTCAGGTTGGACAGCTGGTGCTGCAGCTTATTATGTGGGTTATCTTCAACCTAGGACTTTTCTATTAAAATATAATGAAAATGGAACCATTACAGATGCTGTAGACTGTGCACTTGACCCTCTCTCAGAAACAAAGTGTACGTTGAAATCCTTCACTGTAGAAAAAGGAATCTATCAAACTTCTAACTTTAGAGTCCAACCAACAGAATCTATTGTTAGATTTCCTAATATTACAAACTTGTGCCCTTTTGGTGAAGTTTTTAACGCCACCAGATTTGCATCTGTTTATGCTTGGAACAGGAAGAGAATCAGCAACTGTGTTGCTGATTATTCTGTCCTATATAATTCCGCATCATTTTCCACTTTTAAGTGTTATGGAGTGTCTCCTACTAAATTAAATGATCTCTGCTTTACTAATGTCTATGCAGATTCATTTGTAATTAGAGGTGATGAAGTCAGACAAATCGCTCCAGGGCAAACTGGAAAGATTGCTGATTATAATTATAAATTACCAGATGATTTTACAGGCTGCGTTATAGCTTGGAATTCTAACAATCTTGATTCTAAGGTTGGTGGTAATTATAATTACCTGTATAGATTGTTTAGGAAGTCTAATCTCAAACCTTTTGAGAGAGATATTTCAACTGAAATCTATCAGGCCGGTAGCACACCTTGTAATGGTGTTGAAGGTTTTAATTGTTACTTTCCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACTTATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTAGTAGTACTTTCTTTTGAACTTCTACATGCACCAGCAACTGTTTGTGGACCTAAAAAGTCTACTAATTTGGTTAAAAACAAATGTGTCAATTTCAACTTCAATGGTTTAACAGGCACAGGTGTTCTTACTGAGTCTAACAAAAAGTTTCTGCCTTTCCAACAATTTGGCAGAGACATTGATGACACTACTGATGCTGTCCGTGATCCACAGACACTTGAGATTCTTGACATTACACCATGTTCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCAGGAACAAATACTTCTAACCAGGTTGCTGTTCTTTATCAGGGTGTTAACTGCACAGAAGTCCCTGTTGCTATTCATGCAGATCAACTTACTCCTACTTGGCGTGTTTATTCTACAGGTTCTAATGTTTTTCAAACACGTGCAGGCTGTTTAATAGGGGCTGAACATGTCAACAACTCATATGAGTGTGACATACCCATTGGTGCAGGTATATGCGCTAGTTATCAGACTCAGACTAATTCTCATCGGCGGGCACGTAGTGTAGCTAGTCAATCCATCATTGCCTACACTATGTCACTTGGTGCAGAAAATTCAGTTGCTTACTCTAATAACTCTATTGCCATACCCATAAATTTTACTATTAGTGTTACCACAGAAATTCTACCAGTGTCTATGACCAAGACATCAGTAGATTGTACAATGTACATTTGTGGTGATTCAACTGAATGCAGCAATCTTTTGTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACACAATTAAACCGTGCTTTAACTGGAATAGCTGTTGAACAAGACAAAAACACCCAAGAAGTTTTTGCACAAGTCAAACAAATTTACAAAACACCACCAATTAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCAGATCCATCAAAACCAAGCAAGAGGTCATTTATTGAAGATCTACTTTTCAACAAAGTGACACTTGCAGATGCTGGCTTCATCAAACAATATGGTGATTGCCTTGGTGATATTGCTGCTAGAGACCTCATTTGTGCACAAAAGTTTAACGGCCTTACTGTTTTGCCACCTTTGCTCACAGATGAAATGATTGCTCAATACACTTCTGCACTGTTAGCGGGTACAATCACTTCTGGTTGGACCTTTGGTGCAGGTGCTGCATTACAAATACCATTTGCTATGCAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGAGTTACACAGAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAATTGATTGCCAACCAATTTAATAGTGCTATTGGCAAAATTCAAGACTCACTTTCTTCCACAGCAAGTGCACTTGGAAAACTTCAAGATGTGGTCAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAGCTCCAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTTTTAAATGATATCCTTGCACGTCTTGACAAAGTTGAGGCTGAAGTGCAAATTGATAGGTTGATCACAGGCAGACTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAACAATTAATTAGAGCTGCAGAAATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCAGAGTGTGTACTTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATGTCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTATGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATGATGGAAAAGCACACTTTCCTCGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACACACTGGTTTGTAACACAAAGGAATTTTTATGAACCACAAATCATTACTACACACAACACATTTGTGTCTGGTAACTGTGATGTTGTAATAGGAATTGTCAACAACACAGTTTATGATCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCATTCAAGGAGGAGTTAGATAAATATTTTAAGAATCATACATCACCAGATGTTGATTTAGGTGACATCTCTGGCATTAATGCTTCAGTTGTAAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTTGCCAATAATTTAAATGAATCTCTCATCGATCTCCAAGAACTTGGAAAGTATGAGCAGTATATAAAATGGCCATGGTACATTTGGCTAGGTTTTATAGCTGGCTTGATTGCCATAGTAATGGTGACAATTATGCTTTGCTGTATGACCAGTTGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGTGGATCCTGCTGCAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCAGTGCTCAAAGGAGTCAAATTACATTACACATAA |
SARS-CoV-2/human/USA/NJ-CDC |
nasal swab |
USA: New Jersey |
2021/3/25 |