Accession Number |
Protein Id |
Protein Description |
Protein Length |
Protein Sequence |
Nucleotide Id |
Nucleotide Description |
Nucleotide Length |
Nucleotide Sequence |
Source |
Class_virus |
Virus_name |
Host |
DVSP08800267 |
AAP82936.1 |
spike protein S1, partial Infectious bronchitis virus. |
538 aa |
MLVTPLLLVTLLCALCSAVLYDSSSYVYYYQSAFRPPNGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSSGCTVGTIHGDRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAHCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQHFIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYPTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNETTDVTSAGVYFKTGGPITYKVMREVKALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFINSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHYFSFHNETGANPNPSGVQNIQTYQTQTAQSGYYNFNFSFLSSFVYKESNFMYGSYHPSCNFRLETINNGLWFNSLSVSIAYGPLQGGCKQSVFSGRATCCYAYSYEGPLLCKGVYSGELDHNFECGLLVYVTKSGGSRIQTATEPPVITQHNYNNITLNTCVDYNIYGRTGQGFITNVTDSAVSYNYLADAGLAILDTSGSIDIFVVQGEYGLNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQLLENQFYIKITNGTRRFRRS |
AY319302.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate GX1-98 spike protein S1 gene; complete cds |
1615bp |
ATGTTGGTAACACCTCTTTTACTAGTGACTCTTTTGTGTGCACTATGTAGTGCTGTTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTATCAAAGTGCCTTCAGACCACCTAATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCTTATGCGGTAGTTAATATTTCTAGCGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGGGTGTACTGTTGGTACTATTCATGGTGATCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCACACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGCATTTTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTCTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGAGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAACTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAAAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGATCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTATTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATAGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACTATTTCAGTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCTAATCCTAGTGGTGTTCAGAATATTCAAACTTACCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTTTCCTTTCTGAGTAGTTTTGTTTATAAGGAGTCTAATTTTATGTATGGATCTTATCACCCAAGTTGTAATTTTAGACTAGAAACTATTAATAATGGCTTGTGGTTTAATTCACTTTCAGTTTCAATTGCTTACGGTCCTCTTCAAGGTGGTTGCAAGCAATCTGTCTTTAGTGGTAGAGCAACTTGTTGTTATGCTTATTCATATGAAGGTCCTTTGCTTTGTAAAGGTGTTTATTCGGGTGAGTTAGACCATAATTTTGAATGTGGACTGTTAGTTTATGTTACTAAGAGCGGTGGCTCTCGTATACAAACAGCCACTGAACCGCCAGTTATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAACTGGCCAAGGTTTTATTACTAATGTAACCGACTCAGCTGTTAGTTATAATTATCTAGCAGACGCAGGTTTGGCTATTTTAGATACATCTGGTTCCATAGACATCTTTGTTGTACAAGGTGAATATGGTCTTAATTATTATAAGGTTAATCCTTGCGAAGATGTCAACCAGCAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACTTCACGTAATGAGACTGGTTCTCAGCTTCTTGAGAACCAGTTTTACATCAAAATCACTAATGGAACACGTCGTTTTAGACGTTCTA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP13700012 |
AAP82968.1 |
spike glycoprotein SARS coronavirus Shanhgai LY. |
1255 aa |
MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFGNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIISNSTNVVIRACNFELCDNPFFAVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGSLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDIWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKKISNCVADYSVLYNSTFFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTGNIDATSTGNYDYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPALNCYWPLNDYGFYTTTGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTAIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSLLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCTQLNRALSGIAAEQDRNTREVFAQVKQMYKTPTLKYFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLPFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAGIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
AH012999.2 |
SARS coronavirus Shanhgai LY polyprotein gene; partial cds; alternatively spliced; orf1ab polyprotein; orf1a polyprotein; and orf1ab polyprotein genes; partial cds; spike glycoprotein gene; complete cds; Orf3a and Orf7a genes; partial cds; and Orf7b; Orf8A; Orf8b; and nucleocapsid protein genes; complete cds |
3768bp |
ATGTTTATTTTCTTATTATTTCTTACTCTCACTAGTGGTAGTGACCTTGACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCTATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAGGATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATTAATCATACGTTTGGCAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTTGCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAACAAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAGCAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAACTTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTTTCTAAACCCATGGGTACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCTGATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTTGTGTTTAAAAATAAAGATGGGTCTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTAGTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGTATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTCACCTGCTCAAGACATTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTAAAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGATTGCTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAAGGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCTAATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTCTATGCATGGGAGAGAAAAAAAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAACTCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTTTGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATAGCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATGGGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTGGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATGATTATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAATGTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCTCTTAATTGTTATTGGCCATTAAATGATTATGGTTTTTACACCACTACTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTTGTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCCACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGTGTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCTGATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGCTCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTTCTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACACCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTTATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATTTGTGCTAGTTACCATACAGTTTCTTTATTACGTAGTACTAGCCAAAAATCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAACACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCTATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCTAATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATTGCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAAACCCCAACTTTGAAATATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTAAAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCCCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGATGCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATTTGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATTGCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCTGGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGAGTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCGATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGACGTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAGGTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAACAACTAATCAGGGCTGCTGGAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCTGAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGTGGAAAGGGCTACCACCTTATGTCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCCCAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCTCGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTTTCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATTGGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAAGAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCAGGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCTAAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATTAAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTTACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGTAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGTGGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTACATTACACATAA |
SARS coronavirus Shanhgai LY |
Coronaviridae |
SARS coronavirus |
-- |
DVSP08800268 |
AAP92675.1 |
spike protein Infectious bronchitis virus. |
1169 aa |
MLVKSTFLVTLLSALCSAVLYDNGNYVYYYQSAFRPPGGWHLQGGAYAVVNSTNKSNNAGTASECSVGVLFNYTNGNSDVGYNQSASSIAMTAPLPGMAWSKSQFCTAHCNFSDFTVFITHCFANSCPLTGRIDQNHIRISAMRNGFLFYNLTVSVTKYPNFKSLQCVNNHTSVYLNGDLVFTSNQTTDVIGAGVYFKAGGPIIYKIMKEFKVLAYFVNGTVQDVVLCDDSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKEKFIVYRESSVNTTLTLTNFTFTNQSNAPPNSGSVQTFVLYQTQTAQSGYYNFNLSFLNSFVYKASDFMYGSYHPACHFRPETINSGLWFNSLSVSLTYGPLQGGCKQSVFSGRTTCCYAYSYDGPRACKGVYSGELRKDFECGLLVYVTKSDGSRIQTRSEPLVLTQHNYNNITLDKCVEYNIYGREGHLRITNVTDSAGNFNYLADGGLAILDASGAIDIFVVHGTYGLNYYKVNPCDDVNKQFVVSGSNIVGILTSKNETGSEQVENQFYVKLTNSSRRTRRSSSRNVTSCPYVSYGRFCIEPDGSLKIIVPEELEHFVAPLLNVTEHVLIPTGFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYICGNSLECRKLFQQYGPVCDNILSVVNSVSQKEDMELLNFYSSTKPSGYNSPVFNNLTTGEFNISLVLTQPSSPSGRSFVEDLLFTSVETVGLPTDAEYKKCTAGPLGALKDLVCAREYNGLLMLPPIITADMQTMYTASLVASMAFGGITAAGAIPFATQIQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIVHMQEGFRSTSLALQQIQDVVNKQSAIPAEALVALNKNFGAISSVMQDIYQQLDAIQADAQVDRLITGRLSSLSVLAAAKQSEYLKVSQQRELATQKINECVKSQSTRYSFCGNGRHVLTIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFVNVTAIVGFCVNPTNASQYAIVPANGRGIFISVNGTYYITARDMYMPRNITSGDIVTLTSCQANYVSVNKTVVTTFVDNDDFDFDDELSKWWNDTKHELPDFDYFNYTVPILNISSEIDRIQGVIQGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIGFAVIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV |
AY319651.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate BJ; complete genome |
3510bp |
ATGTTGGTGAAGTCAACTTTTTTAGTGACTCTTTTGTCTGCACTATGTAGTGCAGTTTTGTATGATAATGGTAATTATGTTTATTACTACCAAAGTGCATTTAGACCCCCAGGTGGATGGCATTTGCAAGGGGGTGCTTATGCAGTAGTTAATTCTACTAATAAGTCTAATAATGCAGGCACTGCCTCCGAGTGTTCTGTGGGTGTTCTTTTTAATTATACTAACGGGAATAGTGACGTTGGTTATAATCAAAGTGCTTCCTCCATAGCCATGACAGCACCGCTTCCTGGTATGGCTTGGTCTAAATCACAATTTTGTACTGCTCACTGTAACTTCTCGGATTTTACAGTGTTTATTACACATTGTTTTGCAAATTCTTGTCCTTTAACAGGTAGGATAGATCAGAACCATATTCGTATTTCTGCTATGAGAAATGGTTTTTTATTTTATAATTTAACAGTTAGTGTAACTAAATACCCTAACTTTAAATCGCTTCAATGTGTTAACAATCACACTTCCGTTTATCTAAATGGTGATCTTGTTTTTACATCTAATCAAACCACTGATGTCATAGGTGCTGGTGTGTATTTTAAAGCAGGTGGGCCTATAATCTATAAAATTATGAAAGAATTTAAGGTTTTGGCTTATTTTGTAAATGGCACTGTACAAGATGTTGTTTTGTGTGATGACTCACCTAGAGGATTGTTGGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGTTTTTATCCTTTTACTAATTCTAGTTTAGTTAAGGAAAAGTTCATTGTTTATCGTGAAAGTAGTGTTAATACTACTTTGACGCTAACTAATTTCACTTTTACTAACCAAAGTAATGCACCGCCCAATAGTGGTAGTGTTCAAACTTTTGTTTTATATCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTATCATTTCTGAATTCTTTCGTGTATAAAGCAAGTGATTTTATGTATGGGTCGTATCACCCCGCCTGTCATTTTAGACCAGAAACCATTAACAGTGGTTTGTGGTTTAACTCGTTGTCAGTTTCTCTTACCTATGGACCCCTACAGGGAGGGTGTAAGCAATCTGTTTTTAGTGGTAGGACAACGTGTTGCTATGCCTACTCTTATGATGGCCCAAGAGCCTGTAAAGGTGTCTATTCAGGTGAGTTAAGGAAAGATTTTGAATGTGGATTGTTGGTTTATGTTACTAAGAGTGATGGCTCTCGTATACAAACTAGGTCAGAACCCTTAGTATTAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAGATAAGTGCGTTGAGTATAATATATATGGCAGAGAAGGCCATCTTAGAATTACTAATGTGACTGATTCTGCTGGTAATTTTAATTATCTAGCAGATGGTGGATTAGCTATTTTAGATGCATCTGGTGCCATAGACATTTTTGTTGTACATGGCACCTATGGTCTTAATTATTACAAGGTTAACCCTTGTGATGATGTTAACAAACAGTTTGTAGTGTCGGGTAGCAATATAGTTGGTATTCTTACTTCTAAAAATGAAACAGGTTCTGAACAGGTTGAGAATCAGTTTTATGTTAAATTAACTAATAGCTCACGACGTACTAGACGTTCCAGTAGTCGAAATGTTACAAGCTGTCCATATGTTAGTTATGGCAGATTTTGCATTGAACCAGATGGTTCATTAAAGATAATAGTGCCTGAAGAATTGGAGCACTTTGTGGCACCTTTACTAAATGTCACTGAACATGTACTCATACCTACAGGTTTTAATTTGACTGTTACAGATGAGTACATACAAACACGTATGGATAAGGTCCAAATCAACTGCCTGCAATATATTTGTGGCAATTCTTTGGAGTGTAGAAAATTATTTCAACAATATGGTCCAGTTTGTGATAACATATTGTCTGTTGTAAATAGTGTTAGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTAAATTTCTATTCTTCCACCAAACCAAGTGGTTATAATTCACCGGTTTTCAATAACTTGACTACTGGTGAATTTAACATTTCTCTCGTACTAACGCAACCTAGTAGTCCTAGTGGACGCTCGTTTGTTGAAGACCTTTTATTTACAAGTGTAGAAACAGTTGGTTTACCGACCGACGCTGAGTATAAGAAGTGCACAGCAGGACCTTTAGGTGCTCTTAAGGATCTTGTTTGCGCTAGAGAATATAATGGCTTACTAATGCTGCCCCCAATTATTACAGCGGATATGCAGACAATGTATACAGCTTCTTTAGTAGCATCTATGGCTTTTGGTGGTATTACAGCGGCTGGTGCTATACCTTTTGCTACTCAGATACAAGCTAGGATTAATCATTTAGGTATTACTCAGTCTCTTTTGTTGAAAAATCAAGAAAAAATTGCAGCCTCCTTTAATAAGGCAATTGTCCATATGCAGGAAGGCTTTAGAAGTACTTCTCTAGCTTTACAACAAATTCAAGATGTTGTTAACAAGCAGAGTGCTATTCCTGCCGAAGCTTTGGTAGCACTTAATAAAAATTTTGGTGCCATTTCTTCAGTAATGCAAGATATTTACCAGCAACTTGATGCTATTCAAGCTGACGCTCAGGTTGATCGTCTGATTACTGGTAGACTTTCATCACTCTCAGTGTTGGCAGCAGCTAAGCAGTCTGAGTATCTTAAAGTCTCACAACAACGCGAATTAGCCACTCAGAAAATTAATGAGTGTGTTAAATCGCAATCTACTAGGTATTCTTTTTGTGGTAATGGAAGACATGTCTTAACCATACCACAAAATGCACCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTACACTCCCGAGAGTTTTGTTAATGTAACAGCAATAGTAGGTTTTTGCGTAAACCCGACTAATGCTAGTCAGTATGCAATAGTGCCCGCTAATGGAAGAGGTATTTTTATAAGTGTTAATGGTACATACTATATCACAGCTCGTGATATGTATATGCCAAGAAACATTACTTCAGGAGACATAGTAACTTTAACATCTTGTCAAGCAAACTATGTCAGTGTTAATAAAACAGTCGTTACTACTTTTGTGGATAATGATGATTTCGATTTTGATGATGAATTATCAAAGTGGTGGAATGATACTAAGCATGAACTACCAGACTTTGATTATTTCAATTACACAGTACCTATTTTGAATATTAGTAGTGAAATTGATAGAATTCAAGGTGTCATACAAGGTCTTAATGATTCTTTGATCGACCTTGAAACACTATCAATTCTCAAAACTTATATTAAATGGCCTTGGTATGTCTGGCTTGCCATAGGTTTTGCAGTTATTATATTCATCCTAATATTGGGATGGGTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGTATCATTCCTCTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTATTACACGACTTTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP13700016 |
AAP97882.1 |
S protein SARS coronavirus Taiwan TC3. |
1255 aa |
MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFGNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFAVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDIWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKKISNCVADYSVLYNSTFFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPALNCYWPLNDYGFYTTTGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTAIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSLLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCTQLNRALSGIAAEQDRNTREVFAQVKQMYKTPTLKYFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
AY348314.1 |
SARS coronavirus Taiwan TC3; complete genome |
3768bp |
ATGTTTATTTTCTTATTATTTCTTACTCTCACTAGTGGTAGTGACCTTGACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCTATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAGGATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATTAATCATACGTTTGGCAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTTGCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAACAAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAACTTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTTTCTAAACCCATGGGTACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCTGATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTTGTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTAGTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGTATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTCACCTGCTCAAGACATTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTAAAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGATTGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAAGGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCTAATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTCTATGCATGGGAGAGAAAAAAAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAACTCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTTTGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATAGCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATGGGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAATTATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAATGTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCTCTTAATTGTTATTGGCCATTAAATGATTATGGTTTTTACACCACTACTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTTGTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCCACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGTGTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCTGATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGCTCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTTCTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACACCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTTATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATTTGTGCTAGTTACCATACAGTTTCTTTATTACGTAGTACTAGCCAAAAATCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAACACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCTATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCTAATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATTGCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAAACCCCAACTTTGAAATATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTAAAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGATGCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATTTGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATTGCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCTGGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGAGTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCGATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGACGTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAGGTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAACAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCTGAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGTGGAAAGGGCTACCACCTTATGTCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCCCAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCTCGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTTTCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATTGGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAAGAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCAGGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCTAAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATTAAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTTACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGTGGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTACATTACACATAA |
SARS coronavirus Taiwan TC3 |
Coronaviridae |
SARS coronavirus |
-- |
DVSP13700017 |
AAQ01597.1 |
S protein SARS coronavirus Taiwan TC1. |
1255 aa |
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-- |
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DVSP15800015 |
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Transmissible gastroenteritis virus spike glycoprotein (S) gene; complete cds |
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Transmissible gastroenteritis virus spike glycoprotein (S); small membrane protein (sM); integral membrane protein (M); and nucleocapsid protein (N) genes; complete cds |
4350bp |
ATGAAAAAATTATTTGTGGTTTTGGTTGTAATGCCATTGATTTATGGAGACAATTTTCCTTGTTCTAAATTGACTAATAGAACTATAGGTAACCATTGGAATCTCATTGAAACCTTCCTTCTAAATTATAGTAGTAGGTTATCACCTAATTCAGATGTGGTGTTAGGTGATTATTTTCCTACTGTACAACCTTGGTTTAATTGCATTCGCAATAATAGTAATGACCTTTATGTTACATTGGAAAATCTTAAAGCATTGTATTGGGATTATGCTACAGAAAATATCACTTGGAATCACAAACAACGGTTAAACGTAGTCGTTAATGGATACCCATACTCCATCACAGTTACAACAACCCGCAATTTTAATTCTGCTGAAGGTGCTATTATATGCATTTGCAAGGGCTCACCACCTACTACCACCACAGAATCTAGTTTGACTTGCAATTGGGGTAGTGAGTGCAGGTTAAACCATAAGTTCCCTATATGTCCTTCTAATTCAGAGGCAAATTGTGGTAATATGCTGTATGGCCTACAATGGTTTGCAGATGCGGTTGTTGCTTATTTACATGGTGCTAGTTACCGTATTAGTTTTGAAAATCAATGGTCTGGCACTGTTACACTTGGTGATATGCGTGCGACTACATTAGAAACCGCTGGCACGCTTGTAGACCTTTGGTGGTTTAATCCTGTTTATGATGTCAGTTATTATAGAGTTAATAATAAAAATGGTACTACCGTAGTTTCCAATTGCACTGATCAATGTGCTAGTTATGTGGCTAATGTTTTTACTACACAGCCAGGAGGCTTTATACCATCAGATTTTAGTTTTAATAATTGGTTCCTTCTAACTAATAGCTCCACGTTGGTTAGTGGTAAATTAGTTACCAAACAGCCGTTATTAGTTAATTGCTTATGGCCAGTCCCTAGCTTTGAAGAAGCAGCTTCTACATTTTGTTTTGAAGGTGCTGGCTTTGATCAATGTAATGGTGCTGTTTTAAATAACACTGTAGACGTCATCAGGTTTAACCTTAATTTTACTACAAATGTACAATCAGGTAAGGGTGCCACAGTGTTTTCATTGAACACAACGGGTGGTGTCACTCTTGAAATCTCATGTTATAATGATACAGTGAGTGACTCGAGCTTTTCCAGTTACGGTGAAATGCCGTTCGGCGTAACTGATGGACCACGGTACTGTTACGTACTCTATAATGGCACAGCTCTTAAGTATCTAGGAACATTACCACCTATTGTCAAGGAGATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCATTTTTATATTAATGGTTACAATTTCTTTAGCACATTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAATTTGACCACTGGTGATAGTGACGTTTTCTGGACAATAGCTTACACATCGTACACTGAAGCATTAGTGCAAGTTGAAAACACAGCTATTACAAAGGTGACGTATTGTAATAGTTACGTTAATAACATTAAATGCTCTCAACTTACTGCTAATTTGAATAATGGATTTTATCCTGTTTCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCTAGCTTTTACACACATACCATTGTTAACATAACTATTGGTCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCCTCAACATTAAGTAACATTACACTACCAATGCAGGATAACAACACCGATGTGTACTGTATTCGTTCTGACCAATTTTCAGTTTGTGTTCATTCTACTTGCAAAAGTTCTTTATGGGACAATGTTTTTAAGCGAAACTGCACGGACGTTTTAGATGCCACAGCTGTTATAAAAACTGGTACTTGTCCTTTCTCATTTGATAAATTGAACAATTACTTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTGTCGTTGAGTCCTGTTGGTGCTAATTGTAAGTTTGATGTAGCTGCCCGTACAAGAACCAATGATCAGGTTGTTAGAAGTTTGTATGTAATATATGAAGAAGGAGACAACATAGTGGGTGTACCGTCTGATAATAGTGGTTTACACGATTTGTCAGTGCTACACCTAGATTCCTGCACAGATTACAATATATATGGTAGAACTGGTGTTGGTATTATTAGACAAACTAACAGGACGCTACTTAGTGGCTTATATTACACATCACTATCAGGTGATTTGTTAGGTTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTCATCTACTCTGTAACGCCATGTGATGTAAGCGCACAAGCAGCTGTTATTGATGGTACCATAGTTGGGGCTATCACTTCCATTAACAGTGAACTGTTAGGTCTAACACATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTACTACTCTATATATAATTACACAAATGATAGGACTCGTGGCACTGCAATTGACAGTAATGATGTTGATTGTGAACCTGTCATAACCTATTCTAACATAGGTGTTTGTAAAAATGGTGCTTTGGTTTTTATTAACGTCACACATTCTGATGGAGACGTGCAACCAATTAGCACTGGTAACGTCACGATACCTACAAACTTTACTATATCCGTGCAAGTCGAATATATTCAGGTTTACACTACACCAGTGTCAATGGACTGTTCAAGATATGTTTGTAATGGCAACCCTAGGTGTAACAAATTGTTAACACAATACGTTTCTGCATGTCAAACTATTGAGCAAGCACTTGCAATGGGTGCCAGACTTGAAAACATGGAAGTTGATTCCATGTTATTTGTTTCTGAAAATGCCCTTAAATTGGCTTCTGTCGAAGCATTCAATAGTTCAGAAACTTTAGATCCTATTTACAAAGAATGGCCTAATATAGGTGGCTCTTGGCTAGAAGGTCTAAAATACATACTTCCGTCCGATAATAGCAAACGTAAGTATCGTTCAGCTATAGAGGACTTGCTTTTTGCTAAGGTTGTAACATCTGGTTTAGGTACAGTTGATGAAGATTATAAACGTTGTACAGGTGGTTATGGCATAGCTGACTTAGTATGTGCTCAATACTACAATGGCATCATGGTGCTACCTGGTGTGGCTAATGCTGACAAAATGACTATGTACACAGCATCCCTCACAGGTGGTATAACATTAGGTGCACTTGGTGGAGGCGCCGTGGCTATACCTTTTGCAGTAGCAGTTCAGGCTAGACTTAATTATGTTGCTCTACAAACTGATGTATTGAACAAAAACCAGCAGATCCTGGCTAGTGCTTTCAATCAAGCTATTGGTAACATTACACAGTCATTTGGTAAGGTTAATGATGCTATACATCAGACATCACGAGGTCTTGCAACTGTTGCTAAAGCATTGGCAAAAGTGCAAGATGTTGTCAACACACAAGGGCAAGCTTTAAGCCACCTAACAGTACAATTGCAAAATAATTTCCAAGCCATTAGTAGTTCTATTAGTGACATTTATAATAGGCTTGACGAATTGAGTGCTGATGCACAAGTTGACAGGCTGATCACAGGAAGACTTACAGCACTTAATGCATTTGTGTCTCAGACTCTAACCAGACAAGCCGAGGTTAGGGCTAGTAGACAACTTGCCAAAGACAAGGTTAATGAATGCGTTAGGTCTCAGTCTCAGAGATTCGGATTCTGTGGTAATGGTACACATTTGTTTTCACTCGCAAATGCAGCACCAAATGGCATGATCTTCTTTCACACAGTGCTATTACCAACGGCTTATGAAACTGTGACTGCTTGGGCAGGTATTTGTGCTTTAGATGGTGATCGCACTTTTGGACTTGTCGTTAAAGATGTCCAGTTGACTTTGTTTCGTAATCTAGATGACAAGTTCTATTTGACCCCCAGAACTATGTATCAGCCTAGAGTGGCAACTAGTTCTGATTTTGTTCAAATTGAAGGGTGCGATGTGCTGTTTGTTAATGCAACTGCAAGTGATTTGCCTAGTATTATACCTGATTATATTGATATTAATCAGACTGTTCAAGACATATTAGAAAATTTTAGACCAAATTGGACTGTACCTGAGTTGACATTTGACATTTTTAACGCAACCTATTTAAACCTGACAGGTGAAATTGATGACTTAGAATTTAGGTCAGAAAAGCTACATAACACTACTGTAGAACTTGCCATTCTTATTGACAACATTAACAATACATTAGTCAATCTTGAATGGCTCAATAGAATTGAAACCTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTGTGGCTACTAATAGGCTTAGTAGTAATATTTTGCGTACCATTACTGCTATTTTGCTGTTGTGGTACAGGTTGCTGTGGATGCATAGGTTGTTTAGGAAGTTGTTGTCACTCTATATGCAGTAGAAGACAATTTGAAAATTACGAACCTATTGAAAAAGTGCACGTCCATTAA |
Transmissible gastroenteritis virus |
Coronaviridae |
Transmissible gastroenteritis virus |
swine |
DVSP05100002 |
AAQ17220.1 |
spike Canine coronavirus. |
1453 aa |
MIVLTLCLFLVLYNSVICTSNNECVQVNVTQLPGNENIIRDFLFQNFKEEGTVVVGGYYPTEVWYNCSRTARTQAFKTFSNIHAFYFDMEAMENSTGDARGKPLLVHVHGNPVSIIVYISAYRHDVQGRPKLKHGLLCITKNSTTDYDRFTANQWRDICLGEDRKIPFSVVPTDNGTKLFGLEWNDDYVTAYISDDSHYLNINNNWFNNVTLLYSRSSTATWQHSAAYVYQGVSNFTYYKLNNTNGLKSYELCEDYEYCTGYATNVFAPTPGGYIPEGFSFNNWFMLTNSSTFVSGRFVTNQPLLVNCLWPVPSFGVAAQEFCFEGAQFSQCNGVSLNNTVDVIRFNLNFTTDVQSGMGATVFSLNTTGGVILDISCYNDTVSESSFYSYGEIPFGVIDGPRYCYVLYNGTALKYLGTLPPSVKEIAISKWGHFYINGYNFFSTFPIDCISFNLTTGASGAFWTIAYTSYTEALVQVENTAIKKVTYCNSHVNSIKCSQLTANLQNGFYPVASSEVGLVNKSVVLLPSFYSHTSVNITIDLGMRRSGYGQPVASSLSNISLPMQDNNTDVYCIRSNQFSFYVHSNCKSASWDNIFNSACTDVLEATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCLSLNPTGANCKFDVVARTRTNEQGVGSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGRNGVGIIRKTNSTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVSDGVVYSVTPCEVSAQAAVIDGAIVGAMTSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNERVRGTVTDSNDVDCEPIITYSNIGVCKNGALVFINVTHSDGDVQPISTGNVTIPTNFTISVQVEYIQVYTTPVSIDCSRYVCNGNSRCNKLLTQYVSACHTIEQALAMGARLENMEIDSMLFVSENALKLASVEAFNSTDNLDPIYREWPNIGGSWLGGLKDILPSHNSKRKYRSAIEDLLFDKVVTSGLGTVDEDYKRCTGGYDIADLVCAQYYNGIMVLPGVANDDKMAMYTASLAGGITLGALGGGAVSIPFAVAVQARLNYVALQTDVLNKNQQILANAFNQAIGNITQAFGNVNDAIHQTSKGLATVAKALAKVQDVVNTQGQALSHLTVQLQNNFQAISSSISDIYNRLDELSADAQVDRLITGRLTALNAFVSQTLTRQAEVRASRQLAKDKVNECVRSQSQRFGFCGNGTHLFSLANAAPNGMIFFHTVLLPTAYETVTAWSGICASDGNRTFGLVVKDVQLTLFRNLDYKFYLTPRTMYQPRVATSSDFVQIEGCDVLFVNATVIELPSIIPDYIDINQTVQDILENFRPNWTVPELPLDIFNATYLNLTGEINDLEFRSEKLHNTTLELATLIDNINNTLVNLEWLNRIETYVKWPWYVWLLIGLVVIFCIPLLLFCCCSTGCCGCFGCIGSCCHSMCSRRQFESYEPIEKVHVH |
AY342160.1 |
Canine coronavirus strain BGF10 spike (S); non-structural protein 3a (nsp 3a); non-structural protein 3b (nsp 3b); envelope protein (E); membrane protein (M); nucleoprotein (N); non-structural protein 7a (nsp 7a); and non-structural protein 7b (nsp 7b) genes; complete cds |
4362bp |
ATGATTGTGCTCACATTGTGCCTTTTCTTGGTCCTGTACAATAGTGTGATTTGCACATCAAACAATGAATGTGTACAAGTCAATGTGACACAATTGCCTGGCAATGAAAATATTATTAGAGATTTTCTATTTCAGAACTTTAAAGAAGAAGGAACTGTTGTTGTTGGTGGTTACTACCCCACTGAAGTGTGGTATAACTGTTCCAGAACTGCAAGAACGCAAGCATTCAAAACTTTTAGTAATATACATGCATTTTATTTTGATATGGAAGCTATGGAGAATAGTACTGGCGATGCAAGAGGTAAACCTTTACTAGTACATGTTCATGGTAATCCTGTTAGTATCATTGTTTACATATCAGCTTATAGACATGATGTGCAAGGTAGGCCAAAATTAAAACATGGTTTATTGTGTATAACTAAAAACAGTACCACTGACTATGATCGCTTTACCGCTAACCAGTGGCGTGACATATGTTTAGGTGAAGACAGAAAAATACCATTCTCTGTAGTACCCACAGATAATGGTACGAAATTATTTGGTCTTGAGTGGAATGATGACTATGTTACAGCCTATATTAGTGATGATTCTCATTATTTGAATATCAATAATAATTGGTTTAACAATGTTACACTCCTATACTCTCGATCAAGTACTGCCACATGGCAACATAGTGCCGCATATGTCTATCAAGGTGTTTCAAATTTTACTTATTATAAGTTAAACAACACCAATGGCTTAAAAAGCTATGAATTGTGTGAAGACTATGAATATTGCACTGGCTATGCTACCAATGTGTTCGCTCCGACACCAGGTGGTTATATACCTGAGGGATTTAGTTTTAACAATTGGTTTATGCTTACAAACAGTTCCACTTTTGTTAGTGGTAGATTTGTAACAAATCAACCACTGTTAGTTAATTGTTTGTGGCCAGTGCCCAGTTTTGGTGTTGCAGCGCAAGAATTTTGTTTTGAAGGTGCACAGTTTAGCCAATGTAACGGTGTTTCTTTAAATAACACAGTAGATGTTATTAGATTTAACCTTAATTTTACTACAGATGTACAATCTGGCATGGGTGCTACAGTATTTTCACTGAATACAACAGGTGGTGTCATTCTTGATATTTCTTGTTATAATGACACAGTGAGTGAGTCGAGTTTCTACAGTTATGGTGAAATTCCCTTCGGCGTGATTGATGGACCACGTTACTGTTATGTACTTTATAATGGCACGGCTCTTAAGTATTTAGGAACATTACCACCTAGTGTCAAGGAAATTGCTATTAGTAAATGGGGCCATTTTTATATTAATGGTTACAATTTCTTTAGCACTTTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAATTTAACCACTGGTGCTAGCGGTGCATTTTGGACAATTGCTTACACATCTTACACTGAAGCATTAGTACAAGTTGAAAACACAGCTATTAAAAAGGTGACGTATTGTAACAGTCATGTTAATAGCATCAAATGTTCTCAACTTACTGCTAATTTGCAAAATGGATTTTATCCTGTTGCTTCAAGTGAGGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTATTACCTAGTTTTTATTCGCATACCAGTGTTAATATAACTATTGATCTTGGTATGAGGCGTAGTGGCTATGGTCAACCCGTAGCATCATCATTAAGTAATATCTCACTACCAATGCAAGATAATAACACTGATGTGTACTGCATTCGTTCTAATCAATTTTCATTTTATGTTCATTCCAATTGCAAAAGTGCGTCATGGGACAATATTTTTAATTCAGCATGTACTGATGTTTTAGAAGCCACAGCGGTTATAAAAACTGGTACTTGTCCTTTCTCATTTGATAAATTGAATAATTACTTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTGTCGTTGAATCCTACTGGTGCCAACTGTAAGTTTGATGTTGTCGCCCGTACGAGAACCAATGAGCAGGGTGTTGGAAGTTTATATGTAATATATGAAGAAGGAGACAACATAGTTGGTGTACCGTCTGATAATAGTGGTCTTCACGATTTGTCAGTGCTACACTTAGACTCCTGTACAGATTATAATATATATGGTAGAAATGGTGTTGGTATCATTAGAAAGACTAACAGCACACTACTTAGCGGCTTATATTACACATCACTATCTGGTGATTTGTTAGGTTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTTGTTTATTCTGTAACGCCATGTGAAGTAAGTGCACAGGCTGCTGTTATTGATGGTGCCATAGTTGGAGCTATGACTTCCATTAATAGTGAACTGTTAGGTCTAACTCATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTATTACTCTATATATAATTATACAAATGAGAGGGTTCGTGGCACAGTAACTGATAGCAACGATGTTGATTGCGAACCTATCATAACCTATTCTAATATAGGTGTTTGTAAAAATGGAGCTTTGGTTTTTATTAACGTCACACATTCTGATGGAGATGTTCAACCAATTAGCACTGGCAATGTCACGATACCTACAAATTTTACTATATCTGTGCAAGTCGAATACATTCAGGTTTACACCACACCAGTGTCAATAGACTGTTCAAGATACGTTTGCAATGGTAACTCTAGGTGCAATAAATTGTTAACACAATATGTTTCAGCATGTCACACTATTGAGCAAGCACTTGCAATGGGTGCCAGACTTGAAAACATGGAAATCGATTCCATGTTATTTGTTTCGGAAAATGCCCTTAAATTGGCCTCTGTTGAAGCGTTCAATAGTACTGACAATTTAGATCCTATTTACAGAGAATGGCCTAATATTGGTGGTTCCTGGTTAGGAGGTTTAAAAGATATATTGCCATCTCATAATAGCAAACGTAAGTACCGCTCGGCTATAGAAGACTTGCTTTTTGATAAGGTTGTAACATCTGGCTTAGGTACAGTTGATGAAGATTACAAACGTTGTACAGGTGGCTATGACATAGCTGATTTAGTGTGTGCACAATATTACAATGGCATCATGGTGCTACCTGGTGTGGCTAATGATGACAAGATGGCTATGTACACTGCATCTCTCGCAGGTGGTATAACCTTAGGTGCACTTGGTGGTGGTGCAGTGTCTATACCTTTTGCAGTAGCAGTCCAAGCTAGACTCAACTATGTTGCTCTACAAACTGATGTGTTGAACAAAAACCAGCAGATCCTGGCTAATGCTTTCAATCAAGCTATTGGTAATATTACACAGGCATTTGGCAATGTTAACGATGCAATACATCAAACATCAAAGGGTCTTGCTACTGTTGCTAAAGCATTGGCAAAAGTGCAAGATGTCGTCAACACACAAGGCCAAGCTTTAAGCCACCTAACAGTACAATTGCAAAACAATTTCCAAGCCATTAGCAGTTCTATTAGTGATATTTATAACAGGCTTGATGAATTGAGTGCTGATGCACAAGTTGACAGGCTGATCACAGGAAGACTTACAGCACTTAATGCCTTCGTGTCTCAGACTCTAACTAGACAGGCAGAGGTTAGGGCTAGTAGACAACTTGCTAAGGACAAGGTTAATGAATGCGTTAGGTCTCAATCCCAGAGATTTGGCTTCTGTGGTAATGGTACACATTTGTTTTCACTTGCAAATGCGGCACCAAATGGCATGATTTTCTTTCATACAGTGCTATTACCAACAGCTTATGAAACTGTAACGGCTTGGTCAGGTATTTGTGCGTCAGATGGCAATCGCACTTTTGGACTTGTTGTTAAGGATGTCCAGCTGACGCTATTCCGCAACTTAGATTATAAATTCTATTTGACTCCCAGAACTATGTATCAACCTAGAGTTGCAACTAGTTCTGACTTTGTCCAAATAGAAGGTTGTGATGTGTTGTTTGTTAATGCAACTGTAATTGAATTGCCTAGTATTATACCTGACTATATTGATATCAATCAAACTGTTCAGGACATACTAGAAAATTTCAGACCAAATTGGACTGTACCTGAGTTGCCACTTGATATTTTCAATGCAACATATTTAAACCTGACTGGTGAAATTAATGACTTGGAATTTAGGTCAGAAAAGTTGCATAACACTACATTAGAACTTGCTACTCTCATTGATAATATTAATAACACATTAGTCAATCTTGAATGGCTCAACAGAATCGAAACTTATGTTAAATGGCCTTGGTATGTGTGGCTACTTATTGGACTAGTAGTAATATTCTGCATACCACTCTTGCTATTTTGTTGCTGCAGTACTGGTTGTTGTGGGTGTTTTGGATGTATTGGGAGTTGTTGCCACTCCATGTGTAGTAGAAGACAATTTGAAAGTTATGAACCTATTGAAAAAGTGCATGTTCACTAA |
Canine coronavirus |
Coronaviridae |
Canine coronavirus |
-- |
DVSP15900001 |
AAQ20921.1 |
spike glycoprotein precursor Turkey coronavirus. |
1205 aa |
MLVQLCCLTILLSLVCNVSSITTICNNATVGSGVCISCTNIPEYADGKNGGEALDFYSPDVMRPSDGAYIQSGYYEPLFTGCFNQTNQTDTTCKNGLYAGSPGNFTIQGGFLQNYDAIGIMFWWGIGTNADKKSNDPIFNLTWGNFFLNFTGFPKVKSVIFIATGDIFVNGVLMGVYNLNFTQTLTIWLAQCVGTMKVVILRNSNALVHFSAGNVVAFEPCTGDTTINKLRCAYQQFNFSTGFYDIDTFVPVTPNITHLPYPDLKDNTSQEVHEFYVALKGDPVNYNQSCVDSKYSFFKLKCNNTYSWDFDKLYTLGSEIYVPGYNVYTNTATFICRHYTQIIQLVLPKGLSLENIYNNIGFNRFCVTKLLETRDISSITQYTCVYVVSVEGFDSYHSGLKYSYVGVNFDFGTAMYSVKSAPKQFIYTEQCHNYNIYNIRGVGQILNVTGKDNTTLVDGGLAITSGSGLLAFRNNGSLYSVQPCQTVSTQAVIVNGSFVGLFVPASCRLAQQFNLGNHTEYVDGGCLISNKTTIRMRRSTSAVYTGECIGLFVAMGKSCIYSNGTVLNRTLPQSSVQTSVQPLLGVVANVSIPKELTLAVTTEYLQTRYQKVTIDCAKYVCGDSARCRTLLQQYGSFCQSINAILSGVNENEDNGLLQYAEAINTGYTLNFTGYNVSNLGGFDLSLVLPKNLTLLQNQGRSTIEDLLFDKVVTLGVSEVDQNYDKCIASRGGSFTNLADLTCAQFYNGVMVLPGVVDPGLMAVYTGSLIGGMALGGITAAASIPFATQIQARVNYLALTQSVLLDNQNLIANSFNKALKGIQSALDTMSNGFAEVAKGFESVTVALNKVQDVVNTHSDILNKLMAQLSVNFGAVSSSLNEIYLKLDQINADAQVDRLITGRLTALSTYVASLQLAAYKADQSRRLALQEVEECVKSQSMRYGFCGNGSHVLTIPQSAPNGIFFIHYTYQPTVYVTIEAVPGLCVTTPSGKYGECPRLEVASYLDRMVLSLSLPHSYXEPKLLSYSEVVNLTSCEANYYNVSESETPFQPALPNFDDEFNDIFTELNTSKDAIKNISSNFNYTIPILDLQDEICRLNHSINTLYNYSDVIDKINQGLNDTFINLEQLNKITRYIKWPWYVWLAIGFACLIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVYEQYRPKKSV |
AY342356.1 |
Turkey coronavirus strain Gh spike glycoprotein precursor; gene; complete cds |
3618bp |
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Turkey coronavirus |
Coronaviridae |
Turkey coronavirus |
-- |
DVSP15900002 |
AAQ20922.1 |
spike glycoprotein precursor Turkey coronavirus. |
1208 aa |
MLVQLCCLTIILSLVCNVSSIATICNNATVGSGECISCTNIPQYADGKNGGEALDFYSPDVMRPPDGAYIQSGYYEPLFTGCFNQTNQTDSTCKNGLYRGSPGNLTIQGAFLQNYDAIGIMFWWGIEINAGEVTVDPTFNLTWGNFFFNSKNFTGFPKVKSVIFIATGDIFVNGVLMGVYNLNFTQTLTIWLAQCVGTMKVVILRNSNALVQFSAGNVVAFEPCTGDTTINKLRCAYQQFNFSTGFYDIDTFVPVTSNITYLPYPDLKDNTGQQVYDFYVALRGDAVNYNQSCVDSKYPFFKLKCNNTYSWDSDKLCILGSEIYVPGYNVYTNTATFICWHYTQIIQLVLPKGLSLDNIYNNIGFNRFCVTKLLETRDISSITQYTCVYVVSVEGFDSYHNGIKYRYVGVNFDFGTAMYSVKSVPMQFIYTEQCHNYNIYNIRGVGQILNVTGKDNTTLVDGGLAITSGSGLLAFRNNGSLYSVQPCQTVSTQAVIVNGSFVGLFVPASCWLANQFNLGNHTEYVDGGCLISNKTTIRTRRSTSAVYTGVCIGLFAAMGTSCIYSNGTVLNRTLPQPSVQTSVQPLLGVVANVSIPKELTLAVTTEYLQTRYQKVTIDCAKYVCGDFARCRTLLQQYGSFCQSINAILSGVNENEDNGLLQYAEAINTGYTLNFTGYNVSNLGGFDLSLVLPKNFTLLQNQGRSTIEDLLFDKVVTLGVSEVDQNYDKCIASRGGSFTNLADLTCAQFYNGVMVLPGVVDPGLMAVYTGSLIGGMALGGITAAASIPFATQIQARVNYLALTQSVLLDNQNLIANSFNKALKGIQSALDTVSKGFDEVARGFESVTVALNKVQDVVNTHSDILNKLMAQLSVNFGAVSSSLNEIYLKLDQINADAQVDRLITGRLTALSTYVASLQLAAYKADQSRRLALQKVEECVKSQSMRYGFCGNGSHVLTIPQSAPNGIFFIHYTYQPTAYVTVEAVPGLCVTTPSGKYGECPRLEVALYLDRMVLSLSLPHSYXEPKLLSYSEVVNLTSCEANYYNVSESETPFQPALPNFDDEFNDIFTELNTSKDAIKNISSNFNYTIPILNLPDEICRLNHSINTLYNYSDVIDKINQDLNDTFINLEQLNKITRYIKWPWYVWLAIGFACLIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVYEKYRPKKSV |
AY342357.1 |
Turkey coronavirus strain Gl spike glycoprotein precursor; gene; complete cds |
3627bp |
ATGTTGGTGCAGTTGTGCTGCCTGACGATAATCTTGTCACTTGTATGTAATGTGAGTTCTATTGCCACAATTTGTAATAATGCTACTGTAGGTAGTGGTGAGTGTATATCTTGCACAAACATACCACAGTATGCTGATGGTAAAAATGGGGGTGAAGCCCTAGATTTTTATAGTCCAGATGTTATGCGCCCGCCAGATGGTGCGTATATACAATCCGGTTATTATGAACCACTTTTCACAGGTTGTTTTAATCAAACTAATCAAACCGATTCCACCTGTAAAAATGGGCTTTATAGAGGGTCGCCAGGTAATCTTACTATACAAGGTGCCTTTCTTCAAAATTATGATGCTATTGGCATAATGTTTTGGTGGGGCATTGAAATTAATGCGGGTGAAGTAACCGTGGATCCTACTTTTAATTTAACATGGGGCAACTTTTTCTTTAATTCTAAGAATTTCACAGGTTTCCCTAAAGTTAAAAGTGTTATATTCATTGCCACTGGAGATATTTTTGTAAATGGCGTTTTAATGGGTGTTTATAATCTAAATTTTACGCAAACCTTAACAATTTGGTTAGCACAGTGTGTTGGCACAATGAAAGTTGTTATTTTACGTAATAGTAATGCTCTAGTTCAGTTTTCTGCTGGCAACGTAGTTGCTTTTGAACCCTGTACAGGAGACACTACTATTAATAAGTTACGTTGCGCTTATCAGCAATTTAATTTTTCTACAGGATTTTATGACATAGATACTTTTGTACCTGTGACATCTAATATTACATATTTACCTTACCCAGATTTAAAAGATAATACTGGTCAACAGGTATATGATTTTTATGTAGCTCTTAGAGGAGATGCTGTTAATTACAATCAAAGTTGTGTAGACTCTAAGTACCCATTCTTTAAATTAAAGTGTAATAATACTTATTCTTGGGATTCGGATAAGTTGTGTATATTAGGGTCTGAAATATATGTGCCGGGGTATAATGTTTACACTAATACGGCAACATTCATATGCTGGCACTATACCCAAATTATCCAACTTGTTCTTCCCAAAGGTCTTAGTTTGGATAATATTTATAATAATATAGGTTTCAATAGATTTTGTGTAACTAAATTGTTAGAGACTCGTGATATATCATCTATAACCCAATACACTTGTGTTTATGTTGTTAGTGTAGAAGGTTTTGATAGTTATCATAATGGTATTAAATATAGATATGTTGGTGTAAACTTTGATTTTGGTACAGCTATGTATAGTGTGAAAAGTGTACCCATGCAGTTCATCTATACAGAGCAATGTCATAATTATAATATTTACAACATAAGAGGTGTTGGTCAAATATTAAATGTCACTGGTAAAGATAATACTACACTTGTAGACGGTGGTCTAGCAATAACCAGTGGCAGTGGTTTATTGGCCTTTCGTAATAATGGAAGTCTTTATAGTGTACAACCTTGCCAGACAGTTTCAACTCAAGCTGTAATTGTTAATGGGAGTTTTGTAGGCTTGTTTGTTCCTGCATCTTGTTGGTTAGCCAATCAATTTAATCTAGGTAACCACACAGAATATGTAGATGGTGGTTGTCTTATTAGTAATAAGACTACTATTAGAACGCGCAGGTCTACTAGCGCTGTTTATACTGGTGTATGCATAGGTCTATTTGCAGCTATGGGTACATCTTGTATTTATAGTAATGGCACAGTTCTTAATAGAACATTACCACAACCATCTGTTCAAACTAGTGTGCAACCATTACTAGGTGTTGTAGCAAATGTGTCTATTCCAAAAGAATTGACACTTGCTGTAACCACAGAATACTTACAAACTCGTTATCAGAAAGTTACTATTGATTGTGCTAAATATGTCTGTGGCGATTTTGCAAGGTGCCGCACTTTGCTGCAGCAGTATGGTTCTTTTTGCCAGAGTATTAATGCTATATTAAGTGGTGTTAATGAGAATGAAGATAATGGTTTACTGCAATATGCGGAAGCTATTAATACAGGTTACACACTTAATTTTACTGGTTATAATGTGTCTAATTTGGGTGGGTTCGATTTGTCGCTTGTTCTACCCAAAAATTTTACTCTGTTACAAAATCAAGGTAGGTCTACTATTGAAGACTTACTTTTTGATAAAGTTGTTACTCTAGGTGTTAGTGAAGTTGATCAGAATTATGATAAATGTATAGCATCTAGAGGTGGTTCTTTTACTAATCTAGCAGATTTAACTTGTGCTCAGTTTTACAATGGTGTGATGGTGCTCCCTGGTGTTGTTGACCCTGGCCTAATGGCGGTGTACACCGGTTCTTTAATAGGTGGTATGGCGCTTGGAGGCATTACAGCAGCGGCATCCATACCATTTGCTACTCAAATACAAGCACGTGTCAATTATTTAGCGTTGACACAATCTGTGCTTTTAGATAACCAAAATTTGATAGCAAATTCTTTTAATAAAGCCCTTAAAGGTATACAGTCAGCATTAGACACTGTGTCCAAGGGATTTGATGAAGTAGCTAGAGGTTTTGAGAGTGTAACTGTAGCACTTAATAAAGTCCAGGATGTAGTTAATACACATTCCGACATATTAAATAAACTTATGGCTCAGCTTAGTGTTAATTTTGGGGCTGTTTCATCTTCTCTTAATGAGATATACCTAAAATTAGACCAGATTAATGCAGATGCTCAGGTTGATAGGCTAATTACTGGTAGGTTGACTGCATTATCAACTTACGTAGCATCTCTTCAATTAGCAGCTTATAAGGCTGATCAGTCAAGACGCTTGGCTCTACAGAAAGTAGAGGAGTGTGTTAAGTCTCAATCTATGCGATATGGTTTCTGTGGTAATGGTAGCCATGTTCTAACAATACCACAGAGCGCTCCTAATGGAATATTTTTCATTCACTACACGTACCAACCCACTGCTTATGTTACGGTTGAAGCAGTGCCTGGTCTATGTGTAACAACACCCTCTGGAAAGTATGGGGAATGCCCAAGACTGGAAGTGGCATTATATTTAGACAGAATGGTACTTTCTTTGTCACTTCCACACAGTTATANCGAGCCTAAGCTTTTATCATATTCAGAAGTGGTCAATTTAACATCTTGTGAAGCTAATTATTACAATGTTAGTGAAAGTGAAACACCCTTTCAACCAGCATTGCCTAATTTCGATGATGAGTTTAATGACATTTTTACTGAGTTAAATACCTCAAAAGATGCCATTAAAAATATCAGTTCCAATTTTAACTACACAATTCCCATCCTAAATCTTCCAGATGAGATTTGTAGATTGAATCACTCCATTAACACACTATACAATTATAGTGATGTTATTGATAAAATTAACCAGGATCTTAATGACACCTTTATTAATCTTGAACAACTTAATAAAATCACACGTTACATTAAGTGGCCTTGGTATGTTTGGTTAGCAATTGGTTTTGCTTGTTTAATATTCATCTTAATATTGGGATGGGTGTTTTTCATGACCGGTTGCTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGCATTATTCCGCTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCCTCTTACTACACGACTTTTGATAATGATGTGGTGTATGAAAAATATAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA |
Turkey coronavirus |
Coronaviridae |
Turkey coronavirus |
-- |
DVSP08800271 |
AAQ21585.1 |
S protein Infectious bronchitis virus. |
1164 aa |
MLGKSLFLVTILCALCSANLFDPANYVYYYQSAFRPSNGWHLQGGAYAVVNSSNYANNAGSASECTVGVIKDVYNQSAASIAMTAPLQGMAWSKSQFCSAHCDFSEITVFVTHCYSSGSGSCPITGMIARGHIRISAMKNGSLFYNLTVSVSKYPNFKSFQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNKTTDVTSAGVYFKAGGPVNYSIMKEFKVLAYFVNGTAQDVILCDNSPKGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSTLVREKFIVYRESSVNTTLALTNFTFTNVSNAQPNSGGVHTFHLYQTQTAQSGYYNFNLSFLSQFVYKASDYMYGSYHPICAFRPETINSGLWFNSLSVSLTYGPLQGGYKQSVFSGKATCCYAYSYNGPRACKGVYSGELSRDFECGLLVYVTKSDGSRIQTRTEPLVLTQHNYNNITLDKCVAYNIYGRVGQGFITNVTDSVANFSYLADGGLAILDTSGAIDVFVVQGSYGLNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGNIVGILTSRNETGSEQVENQFYVKLTNSSHRRRRSIGQNVTSCPYVSYGRFCIEPDGSLKMIVPEELKQFVAPLLNITESVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYVCGNSLECRKLFQQYGPVCDNILSVVNSVSQKEDMELLSFYSSTKPKGYDTPVLSNVSTGEFNISLLLTPPSSPSGRSFVEDLLFTSVETVGLPTDAEYKKCTAGPLGTLKDLICAREYNGLLVLPPIITADMQTMYTASLVGAMAFGGITSAAAIPFATQIQARINHLGIAQSLLMKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQVQDVVNKQSAILTETMNSLNKNFGAISSVIQDIYAQLDAIQADAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQSEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSNRYGFCGSGRHVLSIPQNAPNGIVFIHFTYTPETFVNVTAIVGFCVNPLNASQYAIVPANGRGIFIQVNGTYYITSRDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVNVNKTVITTFVEDDDFNFDDELSKWWNDTKHGLPDFDDFNYTVPILNISGEIDNIQGVIQGLNDSLINLEELSIIKTYIKWPWYVWLAIGFAIIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLISKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV |
AY338732.1 |
Avian infectious bronchitis virus 1a protein (1a); 1ab polyprotein (1); S protein (S); 3a protein (3a); 3b protein (3b); E protein (3c); M protein (M); 5a protein (5a); 5b protein (5b); and nucleocapsid protein (N) genes; complete cds |
3495bp |
ATGTTGGGGAAGTCACTGTTTTTAGTGACCATTTTGTGTGCACTATGTAGTGCAAATTTGTTCGATCCTGCCAATTATGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTTAGGCCTTCAAATGGGTGGCATTTGCAAGGGGGTGCTTATGCAGTAGTGAATTCTTCTAATTATGCTAATAATGCAGGTTCTGCATCTGAGTGCACTGTTGGTGTTATTAAGGATGTCTATAATCAAAGTGCGGCTTCCATAGCTATGACAGCACCTCTTCAGGGTATGGCTTGGTCTAAGTCACAATTTTGTAGTGCACACTGTGACTTTTCTGAAATTACAGTTTTTGTCACACATTGTTATAGTAGTGGATCAGGGTCTTGTCCTATAACAGGCATGATTGCACGTGGTCATATTCGTATTTCTGCAATGAAAAATGGTTCTTTATTTTATAATTTAACAGTTAGCGTATCTAAATACCCTAATTTTAAATCTTTTCAATGTGTTAACAACTTCACATCTGTTTATTTAAATGGTGATCTTGTTTTTACTTCCAACAAAACTACTGATGTTACGTCAGCAGGTGTCTATTTTAAAGCAGGTGGACCTGTAAATTATAGTATTATGAAAGAATTTAAGGTTCTTGCTTACTTTGTTAATGGTACAGCACAAGATGTAATTTTGTGTGATAACTCCCCCAAGGGTTTGCTAGCTTGTCAATATAACACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTACTTTAGTTAGGGAAAAGTTCATTGTCTATCGTGAAAGTAGTGTTAATACTACTTTGGCGTTAACTAATTTCACTTTTACTAATGTAAGTAATGCACAGCCTAATAGTGGCGGTGTTCATACTTTTCATTTATATCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTGTCATTTCTGAGTCAGTTTGTGTATAAGGCAAGTGATTATATGTATGGGTCTTACCACCCTATTTGTGCTTTTAGACCAGAAACCATTAATAGTGGTTTGTGGTTTAATTCCTTGTCAGTTTCTCTTACTTATGGACCCCTACAGGGAGGGTATAAGCAATCTGTTTTTAGTGGTAAGGCAACGTGTTGTTATGCCTACTCTTATAATGGCCCAAGGGCATGTAAAGGTGTTTATTCAGGTGAATTAAGCAGGGATTTTGAATGTGGATTGCTGGTTTATGTTACTAAGAGTGATGGCTCTCGTATACAGACTAGAACGGAGCCCTTAGTATTAACGCAACACAATTATAATAATATTACTTTAGATAAGTGTGTTGCCTATAATATATATGGCAGAGTAGGCCAAGGTTTTATTACTAATGTGACTGATTCTGTTGCTAATTTTAGTTATTTAGCAGATGGTGGGTTAGCTATTTTAGATACGTCGGGTGCCATAGATGTTTTTGTTGTACAGGGCAGCTATGGTCTTAATTATTACAAGGTTAATCCTTGTGAAGATGTTAACCAACAGTTTGTAGTGTCTGGTGGCAATATAGTTGGCATTCTTACTTCTAGAAATGAAACAGGTTCTGAACAGGTTGAGAACCAGTTTTATGTTAAGTTAACCAATAGCTCACATCGTCGCAGGCGTTCTATTGGCCAAAATGTAACAAGTTGTCCTTATGTTAGTTATGGCAGGTTTTGTATTGAACCAGATGGTTCGTTGAAGATGATAGTGCCAGAAGAATTGAAGCAGTTTGTGGCACCTTTACTTAATATTACTGAAAGTGTACTCATACCTAACAGTTTTAATTTGACTGTTACAGATGAGTACATACAAACACGTATGGATAAGGTCCAAATCAATTGCCTTCAATATGTCTGCGGCAATTCTTTGGAGTGTAGAAAATTGTTTCAACAATATGGTCCGGTTTGTGATAATATATTGTCTGTTGTAAATAGTGTTAGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTGAGCTTCTATTCTTCTACTAAACCAAAGGGTTATGATACACCAGTTCTTAGTAATGTAAGCACTGGTGAGTTCAATATTTCTCTTCTCTTGACACCCCCTAGTAGTCCTAGTGGGCGTTCTTTCGTTGAAGATCTTCTGTTTACAAGTGTTGAAACAGTTGGTTTACCGACTGATGCTGAATACAAAAAATGCACAGCGGGACCTTTGGGTACCCTTAAAGATCTTATCTGTGCTAGGGAATATAATGGTTTATTAGTGTTGCCTCCAATCATTACGGCGGATATGCAAACAATGTATACCGCGTCTCTAGTAGGTGCTATGGCTTTTGGTGGTATTACATCAGCTGCAGCTATACCTTTTGCTACTCAGATTCAGGCAAGAATTAATCATCTTGGTATTGCACAGTCTTTGTTAATGAAAAACCAAGAAAAGATTGCTGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGAAGCACTTCGCTAGCATTACAACAGGTTCAAGATGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACGGAAACTATGAATTCTCTTAATAAGAATTTTGGTGCTATTTCATCAGTCATTCAAGACATTTACGCGCAACTTGATGCAATTCAAGCAGATGCACAAGTTGATCGTCTTATAACTGGTAGGCTTTCATCACTCTCAGTGCTAGCTTCAGCTAAGCAATCTGAGTACATTAGAGTTTCCCAACAGCGTGAATTAGCCACTCAAAAAATTAATGAGTGTGTTAAATCACAATCTAATAGATATGGATTTTGTGGTAGTGGAAGACATGTTCTTTCGATACCTCAAAATGCACCTAATGGCATAGTGTTTATTCACTTTACTTATACTCCAGAAACGTTTGTTAATGTGACAGCAATAGTCGGTTTCTGTGTAAACCCACTTAATGCTAGTCAGTATGCCATAGTACCTGCTAACGGAAGGGGCATTTTTATACAAGTTAATGGTACATACTATATCACATCTCGTGATATGTATATGCCAAGAGACATTACTGCAGGAGATATAGTTACGCTTACGTCTTGTCAAGCAAACTATGTTAATGTAAATAAAACCGTCATTACTACATTTGTAGAAGATGACGATTTTAATTTTGATGATGAGTTGTCTAAATGGTGGAATGACACTAAGCACGGGCTACCAGACTTTGACGACTTCAATTACACAGTACCCATACTTAATATTAGCGGTGAAATTGATAACATTCAAGGTGTTATACAGGGTCTTAATGACTCCCTTATAAACCTTGAAGAACTTTCAATAATTAAAACTTATATTAAGTGGCCTTGGTATGTTTGGCTTGCCATAGGCTTTGCTATTATTATTTTTATCCTTATTTTAGGATGGGTGTTTTTCATGACAGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGTATCATTCCTCTAATTAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTATTACACTACTTTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP18900010 |
AAQ55048.1 |
virion spike glycoprotein precursor Zaire ebolavirus. |
676 aa |
MGVTGILQLPRDRFKRTSFFLWVIILFQRTFSIPLGVIHNSTLQVSEVDKLVCRDKLSSTNQLRSVGLNLEGNGVATDVPSATKRWGFRSGVPPKVVNYEAGEWAENCYNLEIKKPDGSECLPAAPDGIRGFPRCRYVHKVSGTGPCAGDFAFHKEGAFFLYDRLASTVIYRGTTFAEGVVAFLILPQAKKDFFSSHPLREPVNATEDPSSGYYSTTIRYQATGFGTNETEYLFEVDNLTYVQLESRFTPQFLLQLNETIYTSGKRSNTTGKLIWKVNPEIDTTIGEWAFWETKKNLTRKIRSEELSFTAVSNRAKNISGQSPARTSSDPGTNTTTEDHKIMASENSSAMVQVHSQGREAAVSHLTTLATISTSPQPPTTKPGPDNSTHNTPVYKLDISEATQVEQHHRRTDNDSTASDTPPATTAAGPPKAENTNTSKGTDLLDPATTTSPQNHSETAGNNNTHHQDTGEESASSGKLGLITNTIAGVAGLITGGRRARREAIVNAQPKCNPNLHYWTTQDEGAAIGLAWIPYFGPAAEGIYTEGLMHNQDGLICGLRQLANETTQALQLFLRATTELRTFSILNRKAIDFLLQRWGGTCHILGPDCCIEPHDWTKNITDKIDQIIHDFVDKTLPDQGDNDNWWTGWRQWIPAGIGVTGVIIAVIALFCICKFVF |
AY354458.1 |
Zaire ebolavirus strain Zaire 1995; complete genome |
2031bp |
ATGGGTGTTACAGGAATATTGCAGTTACCTCGTGATCGATTCAAGAGGACATCATTCTTTCTTTGGGTAATTATCCTTTTCCAAAGAACATTTTCCATCCCACTTGGAGTCATCCACAATAGCACATTACAGGTTAGTGAGGTCGACAAACTGGTTTGCCGTGACAAACTGTCATCCACAAATCAATTGAGATCAGTTGGACTGAATCTCGAAGGGAATGGAGTGGCAACTGACGTGCCATCTGCAACTAAAAGATGGGGCTTCAGGTCCGGTGTCCCACCAAAGGTGGTCAATTATGAAGCTGGTGAATGGGCTGAAAACTGCTACAATCTTGAAATCAAAAAACCTGACGGGAGTGAGTGTCTACCAGCAGCGCCAGACGGGATTCGGGGCTTCCCCCGGTGCCGGTATGTGCACAAAGTATCAGGAACGGGACCGTGTGCCGGAGACTTTGCCTTCCACAAAGAGGGTGCTTTCTTCCTGTATGACCGACTTGCTTCCACAGTTATCTACCGAGGAACGACTTTCGCTGAAGGTGTCGTTGCATTTCTGATACTGCCCCAAGCTAAGAAGGACTTCTTCAGCTCACACCCCTTGAGAGAGCCGGTCAATGCAACGGAGGACCCGTCTAGTGGCTACTATTCTACCACAATTAGATATCAAGCTACCGGTTTTGGAACCAATGAGACAGAGTATTTGTTCGAGGTTGACAATTTGACCTACGTCCAACTTGAATCAAGATTCACACCACAGTTTCTGCTCCAGCTGAATGAGACAATATATACAAGTGGGAAAAGGAGCAATACCACGGGAAAACTAATTTGGAAGGTCAACCCCGAAATTGATACAACAATCGGGGAGTGGGCCTTCTGGGAAACTAAAAAAAACCTCACTAGAAAAATTCGCAGTGAAGAGTTGTCTTTCACAGCTGTATCAAACAGAGCCAAAAACATCAGTGGTCAGAGTCCGGCGCGAACTTCTTCCGACCCAGGGACCAACACAACAACTGAAGACCACAAAATCATGGCTTCAGAAAATTCCTCTGCAATGGTTCAAGTGCACAGTCAAGGAAGGGAAGCTGCAGTGTCGCATCTGACAACCCTTGCCACAATCTCCACGAGTCCTCAACCCCCCACAACCAAACCAGGTCCGGACAACAGCACCCACAATACACCCGTGTATAAACTTGACATCTCTGAGGCAACTCAAGTTGAACAACATCACCGCAGAACAGACAACGACAGCACAGCCTCCGACACTCCCCCCGCCACGACCGCAGCCGGACCCCCAAAAGCAGAGAACACCAACACGAGCAAGGGTACCGACCTCCTGGACCCCGCCACCACAACAAGTCCCCAAAACCACAGCGAGACCGCTGGCAACAACAACACTCATCACCAAGATACCGGAGAAGAGAGTGCCAGCAGCGGGAAGCTAGGCTTAATTACCAATACTATTGCTGGAGTCGCAGGACTGATCACAGGCGGGAGGAGAGCTCGAAGAGAAGCAATTGTCAATGCTCAACCCAAATGCAACCCTAATTTACATTACTGGACTACTCAGGATGAAGGTGCTGCAATCGGACTGGCCTGGATACCATATTTCGGGCCAGCAGCCGAGGGAATTTACACAGAGGGGCTGATGCACAATCAAGATGGTTTAATCTGTGGGTTGAGACAGCTGGCCAACGAGACGACTCAAGCTCTTCAACTGTTCCTGAGAGCCACAACCGAGCTACGCACCTTTTCAATCCTCAACCGTAAGGCAATTGATTTCTTGCTGCAGCGATGGGGCGGCACATGCCACATTTTGGGACCGGACTGCTGTATCGAACCACATGATTGGACCAAGAACATAACAGACAAAATTGATCAGATTATTCATGATTTTGTTGATAAAACCCTTCCGGACCAGGGGGACAATGACAATTGGTGGACAGGATGGAGACAATGGATACCGGCAGGTATTGGAGTTACAGGCGTTATAATTGCAGTTATCGCTTTATTCTGTATATGCAAATTTGTCTTTTAG |
Zaire ebolavirus |
ebolavirus |
Zaire ebolavirus |
-- |
DVSP04200033 |
AAQ62562.1 |
spike protein S1, partial Bovine coronavirus. |
143 aa |
PSTWNRRFGFTEQSVFKPQPVGVFTHHDVVYAQHCFKAPTNFCPCKLDGSLCVGNGLGIDAGYKNSGIGTCPAGTNYLTCHSLCTPDPITSKSTGPYKCPQTKYLVGIGEHCSGLAIKSDYCGGNPCTCQPQAFLGWSVDSYL |
AY353075.1 |
Bovine coronavirus isolate WDBR-01 spike protein S1 mRNA; partial cds |
430bp |
TCCTTCTACTTGGAATAGGAGATTTGGTTTTACAGAACAATCTGTTTTTAAGCCTCAACCTGTAGGTGTTTTTACTCATCATGATGTTGTTTATGCACAACATTGTTTTAAAGCTCCCACAAATTTCTGTCCGTGTAAATTGGATGGGTCTTTGTGTGTAGGTAATGGTCTTGGTATAGATGCTGGTTATAAAAATAGTGGTATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGCCATAGTTTGTGCACTCCCGACCCCATTACATCTAAATCTACAGGGCCTTACAAGTGCCCCCAAACTAAATACTTAGTTGGCATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCTTGCTATTAAAAGTGATTATTGTGGAGGTAATCCTTGTACTTGCCAACCACAAGCATTTTTGGGTTGGTCGGTTGACTCTTATTTA |
Bovine coronavirus (BcoV) |
Coronaviridae |
Bovine coronavirus |
-- |
DVSP06900001 |
AAQ67205.1 |
spike protein Equine coronavirus NC99. |
1363 aa |
MVLLLLFFLPGAFAVVGDVKCTTTGVNNFNSGAPVISTETVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLLLNGYYPTSGANYRNLALKASGLLSTLWYKPPFLSEFNDGVFAKVKNTKVTKNGIVYSEFPTMAIGTTFVNTSYTVVVQPRTTVVNSKLQGLLEITICQYSMCEYPNTVCNSGIGSPRKELWHYEKAVASCLYRRNFTYDVNSDWLYFHFYQQGGTFYAYYTDSGFITTFLFNIYLGTSLSHYYVMPLSCSGKLDLQYWVTPLTNRQFLLVFNQDGIIYNAVDCASDYMSEIKCNTQNVKPSTGVYDLTGYTVQPIADVYRRIPNLPDCNMEDWLSAPTVASPLNWERRTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFSCSNIDAAKLYGMCFGSVTIDKFAIPNSRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYSLGADNVTVTRSNPSAWNRRYGFNDTMFKPQPAGFFTNHDVVYSKQCFKVPNTYCPCKNNGATCVGNGISAGVSGTTTGSGTCPVGTSYRTCFNPIQCACTCDPEPINAILTSGPRACPQVKSLVGLGEHCSGLGIHEDFCGGSPCSCPANAFMAWSADSCLQDGRCNIFSNLILNGVNSGATCSTDLQRSNTEIVVGVCVKYDLYGITGQGIFIEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYLTNRTFMIRSCYSGRVSAAYHSDASEPALLYRNLKCNYVFNNTIAREGNPINYFDSYLGCIVNADNSTSSVVDTCVLTMGSGYCVDYSTARRQRRSPSTGYRLTNFEPFNVRLVNDSVEPVGGLYEIQIPSEFTIGNFEEFIQTNSPKVTIDCAAFVRGDYAACREQLVEYGSFCDNINAILTEVNDLLDTTQFQVANSLMNGVTLSSRLKTGINFNVDDINFSSVLGCVGSDCNTVSSRSAIEDLLFNKVRLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLLCVQTFNGIKVLPPVLSENQISGYTLAATSASLFPPWTAAAGIPFYLNVQYRINGLGVTMDVLSQNQKMIANAFNNALGAIQNGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISSSLQEILSRLDALEAQAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDTTLVKFSASQAIEKVNECVKSQSLRVNFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFNYVPTKYVTAKVSPGLCIAGDKGIAPKSGYFVNVNNIWMFTGSGYYYPEPITENNVVVMSTCAVNYTKAPDVMLNISIPNLPDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLNLQDEMNRLQESIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLIGLAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGHQELVIKTSHDD |
AY316300.1 |
Equine coronavirus NC99 hemagglutinin-esterase protein (HE); spike protein (S); 5.3 kDa nonstructural protein; 12.7 kDa protein; small envelope protein (E); and triple spanning membrane protein (M) genes; complete cds |
4092bp |
ATGGTTTTATTACTTTTATTTTTCCTACCTGGTGCTTTTGCTGTTGTAGGAGATGTAAAATGTACTACTACAGGTGTTAACAATTTTAATTCTGGTGCACCTGTTATAAGTACTGAGACTGTTGATGTTACTAACGGTCTTGGCACTTATTATGTGCTTGATCGTGTTTATTTAAATACCACATTGTTGCTCAATGGCTATTATCCCACCTCTGGTGCCAATTATCGCAATTTGGCACTTAAAGCTTCTGGATTATTGAGCACCTTATGGTATAAGCCACCCTTTTTGTCCGAGTTTAATGATGGTGTTTTTGCTAAGGTCAAGAATACCAAAGTAACTAAAAATGGCATTGTCTATAGTGAGTTCCCCACAATGGCTATTGGTACTACATTTGTTAATACCTCTTATACTGTTGTTGTGCAACCTAGGACTACCGTTGTTAATTCTAAATTACAAGGTCTTTTGGAGATTACTATTTGTCAATATTCTATGTGCGAATACCCTAACACTGTTTGCAACAGTGGTATTGGGTCACCACGCAAAGAGTTGTGGCATTATGAGAAGGCTGTGGCCTCCTGTTTATATCGGCGTAATTTTACGTACGATGTTAATTCTGATTGGCTTTATTTTCATTTTTACCAACAGGGTGGTACTTTTTATGCTTATTATACAGATAGTGGTTTTATTACCACTTTCTTGTTTAATATTTACCTTGGTACAAGTTTATCGCATTACTATGTGATGCCTTTATCTTGTAGTGGTAAGTTAGACCTGCAATATTGGGTTACACCACTCACTAATAGACAGTTTTTGTTGGTATTTAATCAGGATGGCATTATTTATAATGCAGTTGATTGTGCCAGTGATTACATGAGTGAGATTAAGTGTAATACCCAAAATGTGAAACCTAGTACAGGTGTTTATGATTTAACTGGTTACACTGTTCAACCTATAGCTGATGTGTACCGGCGTATTCCTAATTTACCAGATTGTAATATGGAGGATTGGCTTAGTGCTCCTACTGTTGCATCTCCTCTTAATTGGGAGCGTAGGACGTTCTCTAATTGTAATTTTAATATGAGCAGCCTGATGAGTTTTATTCAGGCTGACTCGTTTTCTTGTTCCAATATTGATGCTGCTAAATTGTATGGTATGTGTTTTGGCAGTGTTACTATTGATAAATTTGCTATACCTAATAGCAGGAAGGTTGACTTGCAATTAGGTAATTTGGGTTATTTACAGTCCTTTAATTATAGAATAGATACCACAGCTACTAGCTGTCAATTATATTATAGTTTGGGTGCTGATAATGTTACTGTTACCCGATCTAATCCTTCTGCCTGGAATAGGCGGTATGGTTTTAATGATACAATGTTTAAGCCTCAGCCTGCAGGTTTTTTTACTAACCATGATGTGGTTTATTCAAAACAGTGCTTTAAGGTTCCTAACACATATTGCCCTTGTAAGAACAATGGTGCAACCTGTGTAGGCAATGGTATTTCTGCTGGAGTCAGTGGTACTACCACTGGCTCTGGCACTTGTCCTGTAGGTACATCTTATCGCACTTGTTTTAATCCTATACAATGTGCATGCACTTGTGATCCTGAGCCTATTAATGCAATTTTAACCTCTGGCCCTCGTGCTTGTCCTCAAGTCAAGTCTCTTGTTGGTCTTGGAGAGCATTGCTCAGGTTTAGGCATACATGAAGATTTTTGCGGAGGCTCACCTTGTTCTTGTCCAGCCAATGCCTTTATGGCTTGGTCTGCAGATTCTTGTTTACAAGATGGACGCTGCAATATTTTTTCCAATTTAATTTTAAATGGTGTTAATAGTGGTGCTACTTGTTCTACTGATTTACAACGGTCCAATACTGAGATCGTTGTTGGTGTTTGTGTTAAATATGACTTGTACGGTATTACAGGTCAAGGCATTTTTATTGAGGTTAATGCCACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTCCTTTATGACTCTAATGGTAATCTCTATGGTTTTAGGGATTACCTTACTAATAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGTTATAGTGGTAGAGTTTCAGCCGCTTACCACTCTGATGCATCTGAGCCAGCTCTTTTGTATCGTAATTTAAAATGCAACTACGTTTTTAATAATACTATTGCTAGAGAGGGCAACCCTATTAACTATTTTGATAGTTATTTAGGTTGCATTGTTAATGCTGATAATAGCACTTCTAGTGTAGTGGATACTTGCGTTTTAACCATGGGAAGTGGTTATTGTGTTGATTATTCCACTGCACGTCGTCAGCGTAGGTCACCTTCTACTGGATACCGTCTCACCAATTTTGAGCCATTCAATGTTAGATTGGTGAATGATAGTGTAGAACCTGTTGGTGGTTTGTATGAAATTCAGATCCCTTCCGAGTTTACTATAGGTAATTTTGAGGAGTTCATTCAAACTAACTCCCCTAAGGTTACTATTGATTGTGCGGCATTTGTTCGTGGTGACTATGCTGCTTGTAGAGAACAGTTGGTTGAGTATGGCAGTTTTTGTGATAACATCAATGCTATACTCACAGAAGTAAATGACCTACTTGATACTACCCAGTTTCAGGTAGCTAATAGTTTAATGAATGGTGTCACTCTAAGCTCTAGGCTTAAGACTGGCATAAATTTTAATGTAGATGATATTAATTTTTCTTCTGTTTTGGGTTGTGTAGGCAGTGATTGTAATACTGTCTCAAGTAGATCCGCTATAGAGGACTTACTTTTCAATAAAGTAAGGTTGTCTGATGTTGGCTTTGTAGAGGCTTATAATAATTGTACAGGAGGTGCCGAAATTAGGGATCTCCTTTGTGTACAAACTTTTAATGGAATTAAAGTTTTACCACCTGTTTTGTCTGAAAATCAGATTAGTGGTTATACTTTGGCTGCAACGTCTGCTAGTCTCTTTCCACCATGGACTGCGGCTGCAGGTATTCCTTTTTATTTAAATGTTCAGTATCGTATAAATGGACTCGGTGTAACTATGGATGTACTGAGCCAAAACCAGAAAATGATTGCTAATGCATTTAACAATGCCCTTGGTGCTATTCAGAATGGGTTTGATGCTACCAATTCTGCTTTAGTCAAGATTCAGGCTGTTGTTAATGCTAATGCAGAAGCATTAAATAACTTATTACAGCAACTTTCTAATAGATTTGGTGCCATAAGTTCGTCTTTGCAAGAAATTCTATCTCGTCTTGATGCTCTTGAAGCGCAAGCTCAGATAGACCGGTTGATTAATGGCAGATTAACTGCATTAAATGCTTATGTTTCGCAGCAGCTTAGTGACACTACTCTTGTTAAGTTTAGTGCTTCACAGGCGATTGAGAAAGTTAATGAATGTGTTAAGAGTCAATCCCTTAGAGTTAATTTCTGTGGTAATGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCATATGGTTTGTATTTTATCCACTTTAATTATGTTCCTACTAAGTATGTTACAGCGAAGGTTAGTCCCGGTTTGTGCATTGCTGGTGATAAAGGTATAGCTCCTAAGAGCGGCTATTTTGTTAATGTAAATAATATTTGGATGTTTACTGGTAGTGGTTATTACTACCCTGAACCTATAACTGAAAATAATGTTGTTGTTATGAGTACCTGCGCTGTTAATTATACTAAAGCACCGGATGTAATGTTGAACATTTCTATACCCAACCTTCCTGACTTTAAGGAAGAGTTGGATCAATGGTTTAAAAATCAAACTTCAGTGGCACCAGATTTGTCACTCGATTATATAAATGTTACATTCTTGAACCTACAAGATGAAATGAATAGGTTACAGGAGTCAATAAAAGTTTTAAATCAGAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACATATGAATATTACGTAAAGTGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATCGGCCTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTTTTTATTTGCTGCTGTACAGGATGTGGGACTAGCTGTTTTAAGAAATGTGGTGGTTGTTGTGATGATTATACTGGACATCAAGAGCTAGTTATTAAAACCTCACATGACGATTAA |
Equine coronavirus NC99 |
Coronaviridae |
Equine coronavirus |
-- |
DVSP08400007 |
AAQ89995.1 |
spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
567 aa |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
DVSP08400009 |
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spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
567 aa |
MFVLLVAYALLHIAGCQTTNGLNTSYSVCNGCVGYSENVFAVESGGYIPSDFAFNNWFLLTNTSSVVDGVVRSFQPLLLNCLWSVSGLRFTTGFVYFNGTGRGDCKGFSSDVLSDVIRYNLNFEENLRRGTILFKTSYGVVVFYCTNNTLVSGDAHIPFGTVLGNFYCFVNTTIGNETTSAFVGALPKTVREFVISRTGHFYINGYRYFTLGNVEAVNFNVTTAETTDFFTVALASYADVLVNVSQTSIANIIYCNSVINRLRCDQLSFDVPDGFYSTSPIQSVELPVSIVSLPVYHKHTFIVLYVDFKPQSGGGKCFNCYPAGVNITLANFNETKGPLCVDTSHFTTKYVAVYANVGRWSASINTGNCPFSFGKVNNFVKFGSVCFSLKDIPGGCAMPIVANWAYSKYYTIGSLYVSWSDGDGITGVPQPVEGVSSFMNVTLDKCTKYNIYDVSGVGVIRVSNDTFLNGITYTSTSGNLLGFKDVTKGTIYSITPCNPPDQLVVYQQAVVGAMLSENFTSYGFSNVVELPKFFYASNGTYNCTDAVLTYSSFGVCADGSIIAVQPR |
AY386381.1 |
Human coronavirus 229E isolate 40NSD2 spike glycoprotein gene; partial cds |
1702bp |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
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spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
567 aa |
MFVLLVAYALLHIAGCQTTNGLNTSYSVCNGCVGYSENVFAVESGGYIPSDFAFNNWFLLTNTSSVVDGVVRSFQPLLLNCLWSVSGLRFTTGFVYFNGTGRGDCKGFSSDVLSDVIRYNLNFEENLRRGTILFKTSYGVVVFYCTNNTLVSGDAHIPFGTVLGNFYCFVNTTIGNETTSAFVGALPKTVREFVISRTGHFYINGYRYFTLGNVEAVNFNVTTAETTDFFTVALASYADVLVNVSQTSIANIIYCNSVINRLRCDQLSFDVPDGFYSTSPIQSVELPVSIVSLPVYHKHTFIVLYVDFKPQSGGGKCFNCYPAGVNITLANFNETKGPLCVDTSHFTTKYVAVYANVGRWSASINTGNCPFSFGKVNNFVKFGSVCFSLKDIPGGCAMPIVANWAYSKYYTIGSLYVSWSDGDGITGVPQPVEGVSSFMNVTLDKCTKYNIYDVSGVGVIRVSNDTFLNGITYTSTSGNLLGFKDVTKGTIYSITPCNPPDQLVVYQQAVVGAMLSENFTSYGFSNVVELPKFFYASNGTYNCTDAVLTYSSFGVCADGSIIAVQPR |
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Human coronavirus 229E isolate 18D2NS spike glycoprotein gene; partial cds |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
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spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
567 aa |
MFVLLVAYALLHIAGCQTTNGLNTSYSVCNGCVGYSENVFAVESGGYIPSDFAFNNWFLLTNTSSVVDGVVRSFQPLLLNCLWSVSGLRFTTGFVYFNGTGRGDCKGFSSDVLSDVIRYNLNFEENLRRGTILFKTSYGVVVFYCTNNTLVSGDAHIPFGTVLGNFYCFVNTTIGNETTSAFVGALPKTVREFVISRTGHFYINGYRYFTLGNVEAVNFNVTTAETTDFCTVALASYADVLVNVSQTSIANIIYCNSVINRLRCDQLSFDVPDGFYSTSPIQSVELPVSIVSLPVYHKHTFIVLYVDFKPQSGGGKCFNCYPAGVNITLANFNETKGPLCVDTSHFTTKYVAVYANVGRWSASINTGNCPFSFGKVNNFVKFGSVCFSLKDIPGGCAMPIVANWAYSKYYTIGSLYVSWSDGDGITGVPQPVEGVSSFMNVTLDKCTKYNIYDVSGVGVIRVSNDTFLNGITYTSTSGNLLGFKDVTKGTIYSITPCNPPDQLVVYQQAVVGAMLSENFTSYGFSNVVELPKFFYASNGTYNCTDAVLTYSSFGVCADGSIIAVQPR |
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Human coronavirus 229E isolate 1048 spike glycoprotein gene; partial cds |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
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spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
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MFVLLVAYALLHIAGCQTTNGLNTSYSVCNGCVGYSENVFAVESGGYIPSDFAFNNWFLLTNTSSVVDGVVRSFQPLLLNCLWSVSGLRFTTGFVYFNGTGRGDCKGFSSDVLSDVIRYNLNFEENLRRGTILFKTSYGVVVFYCTNNTLVSGDAHIPFGTVLGNFYCFVNTTIGNETTSAFVGALPKTVREFVISRTGHFYINGYRYFTLGNVEAVNFNVTTAETTDFCTVALASYADVLVNVSQTSIANIIYCNSVINRLRCDQLSFDVPDGFYSTSPIQSVELPVSIVSLPVYHKHTFIVLYVDFKPQSGGGKCFNCYPAGVNITLANFNETKGPLCVDTSHFTTKYVAVYANVGRWSASINTGNCPFSFGKVNNFVKFGSVCFSLKDIPGGCAMPIVANWAYSKYYTIGSLYVSWSDGDGITGVPQPVEGVSSFMNVTLDKCTKYNIYDVSGVGVIRVSNDTFLNGITYTSTSGNLLGFKDVTKGTIYSITPCNPPDQLVVYQQAVVGAMLSENFTSYGFSNVVELPKFFYASNGTYNCTDAVLTYSSFGVCADGSIIAVQPR |
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Human coronavirus 229E isolate 1623 spike glycoprotein gene; partial cds |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
DVSP08400013 |
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spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
567 aa |
MFVLLVAYALLHIAGCQTTNGLNTSYSVCNGCVGYSENVFAVESGGYIPSDFAFNNWFLLTNTSSVVDGVVRSFQPLLLNCLWSVSGLRFTTGFVYFNGTGRGDCKGFSSDVLSDVIRYNLNFEENLRRGTILFKTSYGVVVFYCTNNTLVSGDAHIPFGTVLGNFYCFVNTTIGNETTSAFVGALPKTVREFVISRTGHFYINGYRYFTLGNVEAVNFNVTTAETTDFCTVALASYADVLVNVSQTSIANIIYCNSVINRLRCDQLSFDVPDGFYSTSPIQSVELPVSIVSLPVYHKHTFIVLYVDFKPQSGGGKCFNCYPAGVNITLANFNETKGPLCVDTSHFTTKYVAVYANVGRWSASINTGNCPFSFGKVNNFVKFGSVCFSLKDIPGGCAMPIVANWAYSKYYTIGSLYVSWSDGDGITGVPQPVEGVSSFMNVTLDKCTKYNIYDVSGVGVIRVSNDTFLNGITYTSTSGNLLGFKDVTKGTIYSITPCNPPDQLVVYQQAVVGAMLSENFTSYGFSNVVELPKFFYASNGTYNCTDAVLTYSSFGVCADGSIIAVQPR |
AY386385.1 |
Human coronavirus 229E isolate 1027 spike glycoprotein gene; partial cds |
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ATGTTTGTTTTGCTTGTTGCATATGCCTTGTTGCATATTGCTGGTTGTCAAACTACAAATGGGCTGAACACTAGTTACTCTGTTTGCAACGGCTGTGTTGGTTATTCAGAAAATGTATTTGCTGTTGAGAGTGGTGGTTATATACCCTCCGACTTTGCATTCAATAATTGGTTCCTTCTAACTAATACCTCATCTGTTGTAGATGGTGTTGTGAGGAGTTTTCAGCCTTTGTTGCTTAATTGCTTATGGTCTGTTTCTGGCTTGCGGTTTACTACTGGTTTTGTCTATTTTAATGGTACTGGGAGAGGTGATTGTAAAGGTTTTTCCTCAGATGTTTTGTCTGATGTCATACGTTACAACCTCAATTTTGAAGAAAACCTTAGACGTGGAACCATTTTGTTTAAAACATCTTATGGTGTTGTTGTGTTTTATTGTACCAACAACACTTTAGTTTCAGGTGATGCTCACATACCATTTGGTACAGTTTTGGGCAATTTTTATTGCTTTGTAAATACTACTATTGGCAATGAAACTACGTCTGCTTTTGTGGGTGCACTACCTAAGACAGTTCGTGAGTTTGTTATTTCACGCACAGGACATTTTTATATTAATGGCTATCGCTATTTCACTTTAGGTAATGTAGAAGCCGTTAATTTCAATGTCACTACTGCAGAAACCACTGATTTTTGTACTGTTGCGTTAGCTTCTTATGCTGACGTTTTGGTTAATGTGTCACAAACCTCTATTGCTAATATAATTTATTGCAACTCTGTTATTAACAGACTGAGATGTGACCAGTTGTCCTTTGATGTACCAGATGGTTTTTATTCTACAAGCCCTATTCAATCCGTTGAGCTACCTGTGTCTATTGTGTCGCTACCTGTTTATCATAAACATACGTTTATTGTGTTGTACGTTGACTTCAAACCTCAGAGTGGCGGTGGCAAGTGCTTTAACTGTTATCCTGCTGGTGTTAATATTACACTGGCCAATTTTAATGAAACTAAAGGGCCTTTGTGTGTTGACACATCACACTTCACTACCAAATACGTTGCTGTTTATGCCAATGTTGGTAGGTGGAGTGCTAGTATTAACACGGGAAATTGCCCTTTTTCTTTTGGCAAAGTTAATAACTTTGTTAAATTTGGCAGTGTATGTTTTTCGCTAAAGGATATACCCGGTGGTTGCGCAATGCCTATAGTGGCTAATTGGGCTTATAGTAAGTACTATACTATAGGCTCATTGTATGTTTCTTGGAGTGATGGTGATGGAATTACTGGCGTCCCACAACCTGTTGAGGGTGTTAGTTCCTTTATGAATGTTACATTGGACAAATGTACTAAATATAATATTTATGATGTATCTGGTGTGGGTGTTATTCGCGTTAGCAATGACACCTTTCTTAATGGAATTACGTACACATCAACTTCAGGTAACCTTCTGGGTTTTAAAGATGTTACTAAGGGCACCATCTACTCTATCACTCCTTGTAACCCACCAGATCAGCTTGTTGTTTATCAGCAAGCTGTTGTTGGTGCTATGTTGTCTGAAAATTTTACTAGTTACGGCTTTTCTAATGTTGTAGAACTGCCGAAATTTTTCTATGCGTCCAATGGCACTTATAATTGCACAGACGCTGTTTTAACTTATTCTAGTTTTGGCGTTTGTGCAGATGGTTCTATAATTGCTGTTCAACCACGTA |
Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
DVSP08400014 |
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spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
567 aa |
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AY386386.1 |
Human coronavirus 229E isolate 13-4 spike glycoprotein gene; partial cds |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
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-- |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
DVSP08400016 |
AAQ90004.1 |
spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
567 aa |
MFVLLVAYALLHIAGCQTTNGLNTSYSVCNGCVGYSENVFAVESGGYIPSDFAFNNWFLLTNTSSVVDGVVRSFQPLLLNCLWSVSGLRFTTGFVYFNGTGRGDCKGFSSDVLSDVIRYNLNFEENLRRGTILFKTSYGVVVFYCTNNTLVSGDAHIPFGTVLGNFYCFVNTTIGNETTSAFVGALPKTVREFVISRTGHFYINGYRYFTLGNVEAVNFNVTTAETTDFFTVALASYADVLVNVSQTSIANIIYCNSVINRLRCDQLSFDVPDGFYSTSPIQSVELPVSIVSLPVYHKHTFIVLYVDFKPQSGGGKCFNCYPAGVNITLANFNETKGPLCVDTSHFTTKYVAVYANVGRWSTSINTGNCPFSFGKVNNFVKFGSVCFSLKDIPGGCAMPIVANWAYSKYYTIGSLYVSWSDGDGITGVPQPVEGVSSFMNVTLDKCTKYNIYDVSGVGVIRVSNDTFLNGITYTSTSGNLLGFKDVTKGTIYSITPCNPPDQLVVYQQAVVGAMLSENFTSYGFSNVVELPKFFYASNGTYNCTDAVLTYSSFGVCADGSIIAVQPR |
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Human coronavirus 229E isolate 29NSD4 spike glycoprotein gene; partial cds |
1702bp |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
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spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
567 aa |
MFVLLVAYALLHIAGCQTTNGLNTSYSVCNGCVGYSENVFAVESGGYIPSDFAFNNWFLLTNTSSVVDSVVRSFQPLLLNCLWYVSGLRFTNGFVYFNGTGRGDCKGFSSDVLSDVIRYNLNFEENLRRGTILFKTSYGVVVFYCTNNTLVSGDAHIPFGTVLGNFYCFVNTTIGNETTSAFVGALPKTVREFVISRTGHFYINGYRYFTLGNVEAVNFNVTTAETTDFFTVALASYADVLVNVSQTSIANIIYCNSVINRLRCDQLSFDVPDGFYSTSPIQSVELPVSIVSLPVYHKHTFIVLYVDFKPQSGGGKCFNCYPAGVNITLANFNETKGPLCVDTSHFTTKYVAVYANVGRWSASINTGNCPFSFGKVNNFVKFGSVCFSLKDIPGGCAMPIVANWAYSKYYTIGSLYVSWSDGDGITGVPQPVEGVSSFMNVTLDKCTKYNIYDVSGVGVIRVSNDTFLNGITYTSTSGNLLGFKDVTKGTIYSITPCNPPDQLVVYQQAVVGAMLSENFTSYGFSNVVELPKFFYASNGTYNCTDAVLTYSSFGVCADGSIIAVQPR |
AY386389.1 |
Human coronavirus 229E isolate 1610 spike glycoprotein gene; partial cds |
1700bp |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
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spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
559 aa |
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Human coronavirus 229E isolate 862 spike glycoprotein gene; partial cds |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
DVSP08400019 |
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spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
559 aa |
TNGLNTSYSVCNGCVGYSENVFAVESGGYIPSDFAFNNWFLLTNTSSVVDGVVRSFQPLLLNCLWSVSGLRFTTGFVYFNGTGRGDCKGFSSDVLSDVIRYNINFEENLRRGTILFKTSYGVVVFYCTNNTLVSGDAHIPFGTVLGNFYCFVNTTIGNETTSAFVGALPKTVREFVISRTGHFYINGYRYFTLGNVEAVNFNVTNAETTDFFTVALASYADVLVNVSQTSIANIIYCNSVINRLRCDQLSFDVPDGFYSTSPIQSVELPVSIVSLPVYHKHTFIVLYVDFKPQSGGGKCFNCAPAVVNITLANFNETKGPLCVDTSHFTTKYVAANVGRWSASINTGNCPFSFGKVNNFVKFGSVCFSLKDIPGGCAMPIVANLAYSNSYTIGSLYVSWSDGDGITGVPQPVEGVSSFMNVTLNKCTKYNIYDVSGVGVIRVSNDTFLNGITYTSTSGNLLGFKDVTNGTIYSITPCNPPDQLVVYQQAVVGAMLSENFTSYGFSNVVELPKFFYASNGTYNCTDAVLTYSSFGVCADGSIIAVQPRNVSYDSVSAIVT |
AY386391.1 |
Human coronavirus 229E isolate 879 spike glycoprotein gene; partial cds |
1678bp |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
DVSP08400020 |
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spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
578 aa |
TNGMNTSHSVCNGCVGHSENVFAVESGGYIPSDFAFNNWFLLTNTSSVVDGVVRSFQPLLLNCLWSVSGSLFTTGFVYFNGTGRGDCKGFYSNASSDVIRYNINFEENLRRGTILFKTSYGAVVFYCTNNTLVSGDAHIPSGTVLGNFYCFVNTTIGNETTSAFVGALPKTVREFVISRTGHFYINGYRYFSLGNVEAVNFNVTNAETTVCTVALASYADVLVNVSQTAIANIIYCNSVINRLRCDQLSFDVPDGFYSTSPIQSVELPVSIVALPVYHKHTFIVLYVNFELRRGPGRCYNCRPAVVNITLANFNETKGPLCVDTSHFTTQFVGVKFDRWSASINTGNCPFSFGKVNNFVKFGSVCFSLKDIPGGCAMPIMANLANLNSHNIGSLYVSWSDGDVITGVPKPVEGVSSFMNVTLNKCTKYNIYDVSGVGVIRVSNDTFLNGITYTSTSGNLLGFKDVTNGTIYSITPCNPPDQLVVYQQAVVGAMLSENFTSYGFSNVVEMPKFFYASNGTYNCTDAVLTYSSFGVCADGSIIAVQPRNVSYDSVSAIVTANLSIPSNWTTSVQVEYLQI |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
DVSP08400021 |
AAQ90009.1 |
spike glycoprotein, partial Human coronavirus 229E. |
559 aa |
TNGLNTSYSVCNGCVGYSENVFAVESGGYIPSDFAFNNWFLLTNTSSVVDGVVRSFQPLLLNCLWSVSGLRFTTGFVYFNGTGRGDCKGFSSDVLSDVIRYNINFEENLRRGTILFKTSYGVVVFYCTNNTLVSGDAHIPFGTVLGNFYCFVNTTIGNETTSAFVGALPKTVREFVISRTGHFYINGYRYFTLGNVEAVNFNVTNAETTDFFTVALASYADVLVNVSQTSIANIIYCNSVINRLRCDQLSFDVPDGFYSTSPIQSVELPVSIVSLPVYHKHTFIVLYVDFKPQSGGGKCFNCAPAVVNITLANFNETKGPLCVDTSHFTTKYVAANVGRWSASINTGNCPFSFGKVNNFVKFGSVCFSLKDIPGGCAMPIVANLAYSNSYTIGSLYVSWSDGDGITGVPQPVEGVSSFMNVTLNKCTKYNIYDVSGVGVIRVSNDTFLNGITYTSTSGNLLGFKDVTNGTIYSITPCNPPDQLVVYQQAVVGAMLSENFTSYGFSNVVELPKFFYASNGTYNCTDAVLTYSSFGVCADGSIIAVQPRNVSYDSVSAIVT |
AY386393.1 |
Human coronavirus 229E isolate 865 spike glycoprotein gene; partial cds |
1678bp |
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Human coronavirus 229E |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
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