Accession Number Protein Id Protein Description Protein Length Protein Sequence Nucleotide Id Nucleotide Description Nucleotide Length Nucleotide Sequence Source Class_virus Virus_name Host
DVSP08800473 ABF57593.1 spike protein subunit S1, partial Infectious bronchitis virus. 223 aa MLAQPLLLVTLLCALCSAFLYNNDTYVYYYQSAFRPFNGWHLHGGAYAVVNVSQETNNAGSSPSCTAGAIYWSKNFSASSVAMTAPFEGMQWSTSQFCTAHCNFTDIVVFVTHCFKRGSNECPLTGFITQNHIRISAMKQGNTGPSSLFYNLTVPVTKYSKFKSLQCVNNQTSVYLNGDLVFTSNETKDVSGAGVHFKAGGPITYKVMREVKALAYFVNGTAH DQ492312.1 Infectious bronchitis virus isolate IBV/Brazil/2005/USP-11 spike protein subunit S1 gene; partial cds 671bp ATGTTGGCTCAACCTCTTTTACTAGTGACTCTTTTGTGTGCACTATGTAGTGCATTTTTGTACAATAATGATACCTATGTTTATTATTACCAGAGTGCTTTTAGACCATTTAATGGTTGGCATTTACATGGAGGTGCTTATGCAGTAGTTAACGTTTCTCAAGAAACAAATAATGCAGGTTCTTCCCCATCTTGTACAGCTGGCGCTATCTATTGGAGTAAAAATTTTAGTGCGTCTTCAGTAGCTATGACAGCACCTTTTGAGGGTATGCAATGGTCCACTTCACAATTCTGTACAGCCCATTGTAATTTTACTGATATTGTTGTATTTGTTACTCATTGTTTTAAAAGGGGTTCAAATGAATGCCCTTTAACAGGTTTCATTACACAGAACCATATTCGTATTTCTGCTATGAAACAAGGAAATACTGGTCCTAGCAGTTTGTTTTATAATTTAACAGTTCCTGTGACTAAGTATTCTAAGTTTAAGTCGCTTCAATGTGTTAATAATCAAACATCTGTGTACCTAAATGGTGATTTAGTTTTTACTTCTAATGAGACCAAAGATGTTAGTGGCGCAGGTGTTCATTTCAAAGCCGGAGGACCCATAACTTACAAGGTTATGAGAGAAGTTAAAGCTCTAGCTTATTTTGTTAATGGTACCGCACATGA Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus Gallus gallus
DVSP08800474 ABF61465.1 spike protein Infectious bronchitis virus. 1169 aa MLVKSLFIVTLSSALCSANLYDEGNYVYYYQSAFRPSGGWHLHGGAYAVVNVSQETNNAGSSSQCIAGAIHWSKNFSASSVAMTAPSNGMEWSSSQFCTAHCNFSDIVVFVTHCFKKGVDFCPLTGLIPQGYIRIAAMKQGGNGPSDLFYNLTVPVTKYPKFRSLQCVNNQTSVYLNGDLVFTSNETEDVSGSGVYFTAGGPITYKVMRELKALAYFVNGTAHDVILCDDTPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKEKFIVYRENSVNTTLVLHNFTFHNETAAQPNSGDVNSIQTYQTQTAQSGYYNFNFSFLSGFVYKESNFMYGSYHPKCNFRPENINNGLWFNSLSVSLAYGPLQGGCKQSVFHGRATCCYAYSYSGPRLCKGVYSGELTQQFECGLLVYIIKSDGSRIQTATEPPVITQHNYNNITLNKCVEYNIYGRFGQGFITNVTDSATSYNYLAHGGLATLDTSGAIDIFVVQGEYGFNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQAIENQFYIKLTNGSRRSRRSVNGNVTNCPYVSYGKFCIKPDGSISTIVPKELEQFMAPLFNVTENVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYVCGSSFECRKLFQQYGPVCDNILSIVNSVGQKEDMELLYFYSSTKPAGFNTPVLSNVSTGDFNISLMLTPPSSPTGRSFIEDLLFTSVESVGLPTDDTYKKCTAGPLGFLKDLACAREYNGLLVLPPIITAEMQTLYTSSLVASMALGGITAAGAIPFATQIQARINHLGITQSILLKNREKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQIQDVVNKQSAILTETMQSLNKNFGAISSVIQDIYQQLDAIQADAQVDRLITGRLSSLSVLAFAKQSEYLKVSQQRDLATQKINECVKSQSTRYSFCGNGRHVLTIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFVNVTAIVGFCVNPANASQYAIVPANGRGIFIQANGTYYITARDMYMPRSITAGDVVTLTSCQANYVSVNKTVINTFVENDDFDFDDELSKWWNETKHEFPDFDQFNYTIPVLNITYDIDKIEEVIKGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIAFATIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCSKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV DQ490205.1 Infectious bronchitis virus strain Armidale spike protein (S); 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DVSP08800475 ABF61473.1 spike protein Infectious bronchitis virus. 1160 aa MLVKSLFIVTLLFALCSANLYDNGNYVYYYQSAFRPSGGWHLHGGAYAVVNVSQETSNAGSSSQCITGAIHWSKNFSASSVAMTAPSNGMEWSSSQFCTAHCNFSNIVVFVTHCFKSGAGFCPLTGLIPKGYIRIAAMKQGGNGPSDLFYNLTVPVTKYPKFRSLQCVNNQTSVYLNGDLVFTSNETEDVSGSGVYFKAGGPITYKVMREVKALAYFVNGTAHDVILCDDTPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKEKFIVYRENSVNTTLVLHNFTFYNETAAQPNSGGVNSIQTYQTQTAQSGYYNFNFSFLSGFVYKESNFMYGSYHPKCNFRPENINNGLWFNSLSVSLAYGPLQGGCKQSVFHGRATCCYAYSYLGPRLCKGVYSGELTQQFECGLLVYITKSDGSRIHTATEPPVITQHNYNNITLNKCVEYNIYGRFGQGFITNVTDSAASYNYLADGGLATLDTSGAIDIFVVQGEYGLNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQAIENQFYIKLTNGSRRSRRSVNGNVTNCPYVSYGKFCIKPDGSISTIVPKELEQFMAPLLNVTENVLIPNSFNLTATDEYIQTRMDKVQINCLQYVCGNSFECRKLFQQYGPVCDNILSIVNSVGQKEDMELLYFYSSTKPAGFNTPVLSNVSTGDFNISLMLTPPSSPTGRSFIEDLLFTSVESVGLPTDDAYKKCTAGPLGFLKDLACAREYNGLLVLPPIITAEMQTLYTSSLVASMALGGITAAGAIPFATQIQARINHLGITQSILLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQIHDVVNKQSAILTETMQSLNKNFGAISSVIQDIYQQLDAIQADAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQAEYLKVSQQRELATQKINECVKSQSTRYSFCGNGRHVLTIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFVNVTAIVGFCVNPANASQYAIVPANGRGIFIQANDTYYITARDMYMPRSITAGDVVTLTSCQANYVSVNKTVINTFVENDDFDFDDELSKWWNETKHEFPDFDQFNYTIPVLNITYDIDKIEEVIKGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIAFATIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCSKKSSYYTTFDNDVVT DQ490206.1 Infectious bronchitis virus strain N1-62 spike protein (S); 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DVSP08800476 ABF61481.1 spike protein Infectious bronchitis virus. 1170 aa MLENLLLLATALLSLCSGNLFDEDNKYVYYYQSGFRPPNGWHLHGGAYAVDRVFNITNNANGAGCTVGSLGQSLNVGASAIAMTAPVGSGMSWSTKSFCTAHCNFSEFTVFVTHCFSSISGACPLTGNIGQGAIRVGVFKNGVSIHNITFNSTEYRSFKSLHCVNNNTAVYLNGNLIYTSNQTLEISGVGLYFSSGEPITCKIMREHKVLAYFENGTAHDIILCDDSPRCILACQYNTGNFSDGLYPFNLEIVVNKTFVVFEQNSITTTLELNNFTIVNQSNAGPNQKESSPGVSNYVYYQQCSAVAGYNNFNFSFLSDFSYVDTDFNKGSYPRNCPFRPESINRNFRFNHFSVKIAYGPRDGGCKQAAFGRSNVCCFMYSYNGPRECMGVYSGQLSHKFECVLLVFVEYTFGSRFFTSETVPVINKNFSNTIVTGECVDYNIYGRYGRGFISDITAHANGSNYLADSGLAILDPSGAIDTFMVKGASGINYYKVSPCQDVNQQYVVSGGKIVGLFTSTNITGSQELEDQYYTKLINGSHTRRRRSINATVSTCPYATYGRFCIKPDGELAEIVPDEIETYSSLLLNVSEYVLIPDSFNLTVTDEYIQINMEKIQINCIQYVCGNSLECKKLFQQYGPVCDNLLSIVNSIAQQDNMEFLHFYSATKPKGFDKPIFNNVSTDGFNLTLVLSQPSSSKKRSFIEDLLFTKVESLGLPGDTAYKNCTAGPLGFVKDLICAQNYNGLLVLPPIITAEMQTMYTASLVASMAFGGITSAGAIPFATQIQARINHLGITQTVLQKNQEQIAASFNKAMAHMQNGFRATSSALQQIQDVINKQGSVLQDAMNSLNKNFGALSSVIQDIYSRLDAIEANVQVDRLITGRLSSLSVLASAKQAEYAKVSQQRELAKQKINECVKSQSTRLGFCGAGRHVLTIPQNAPNGIVLLHFTYTPETYKNVTAVVGFCIKPDNGSEYAIVPVSGRGVFIQENGTYYITARDMYMPGAITGGDVVTLTSCQANYVSLNKTVITTFVENDDFNFHDELSKWWNETKHDLPDFDQFNYTIPVLNITYDIDNIEQVIKGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIAFLTIIFILILVWIFFMTGCCGCCCGCFGLIPLMSKCGKKSSYYTTFDDDVVGVQIKPKKNV DQ490207.1 Infectious bronchitis virus strain N1-88 spike protein (S); 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3a protein (3a); 3b protein (3b); small membrane protein (3c); membrane protein (M); 5a protein (5a); 5b protein (5b); and nucleocapsid (N) genes; complete cds 3504bp ATGTTGGAACGACCGCTTTTATTAGTGACTCTTTTGTGTGCACTATGTAGTGCCAATTTGTTTGATAATCGTTCTTATGTTTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCTAGTTATGGTTGGCATTTACATGGAGGTGCTTATGCAGTAGTAAATGTTACTGAAGAACCAAATAATGCAGGTGGTGCAGAGGAGTGTACAGCCGGAGCTATTTCTTGGAGTAAAAATTTCAGTGCTGCTTCTGTAGCTATGACAGCACCACCTGCCGGTATGCGGTGGTCTACCTCTGCATTTTGCACGGCTCACTGTAATTTTACTGATTTTACAGTGTTTGTTACACATTGTTTTAAACGTGGTGCCTGTCCTTTAACAGGTTTTATTGAAAAAGGTTACATTCGTATTTCTGCTATGAAAAATACCGGTAGTACACCTAGCGATTTGTTTTATAATTTAACAGTTGCTGTGACTAAATATCCCACGTTTAGATCACTTCAATGTGTTAATAATTTTACATCTGTATATCTAAATGGTGATCTCGTTTTTACTTCTAATGAGACTAAAGCTGTTAGTGCTGCAGGTGTTCACTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGTTTATTAGCATGCCAATATAACACTGGTAATTTTTCAGATGGATTATATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGGAAAGGTTTATTGTATATCGTGAGACTAGTATTAATACTACTTTGACGTTAACTAATTTTACTTTTTCAAATGAAAGTAGTGCGCCACCCAATTCTGGTGGTGTAAACACTATTCAATTGTACCAAACTAAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTTTCATTTCTGAGTGGTTTTGAGTATAAGGAGTCTAATTTTATGTATGGGTCTTATCACCCGCAATGTAACTTTAAACCGGAGACTATTAATAATGGCCTCTGGTTTAACTCACTTTCAGTTTCAATTGCTTACGGTCCTATTCAAGGCGGTTGCAAGCAATCTGTTTTTAATGGTAAAGCAACTTGTTGTTATGCTTACTCATATCGTGGTCCCACAGCGTGTAAAGGTGTTTACAGTGGTGAGTTAACTCAGAATTTTGAATGTGGACTGTTAGTTTTTGTCACTAAGAGCGATGGCTCTCGTATACAAACAGCTACCACACCACCAATCATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATAGTTGTGTTGATTATAATATATATGGTAGAACAGGCCAAGGTCTTATTACTAACATAACCGATTCAGCTGCTAGTTATAATTATCTAGCAGACGGAGGTTTGGCTATTTTAGATTCATCTGGTGCCGTACACATCTTCGTTGTACAAGGTGCATATGGTCTTAATTATTATAAGGTTAACCCTTGCGAAGATGTTAACCAGCAGTTTGTAGTGTCTGGTGGTAAATTAGTTGGTATTCTTACTTCACGTAATGAAACAGGTTCTCAGGCTATTGAGAACCAGTTTTATATTAAACTCACCAATGGATCACGTCGTTCTAGGCGTTCTGTTTCTGAAAATGTTACAAATTGCCCTTATGTTAGTTACGGCAAGTTTTGTATAAAACCTGACGGTTCAATTTCTACAATAGTACCAAAAGAACTTGAACAGTTTTTGGCACCTTTACTTAATGTTACTGAAAATGTACTCATACCTAACAGTTTTAACTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACGCGTATGGATAAGGTTCAAATTAATTGCATGCAGTATGTTTGTGGCAATTCTTTGGAGTGTAGAAATTTATTTCAACAATATGGGCCTGTTTGTGACAACATACTGTCTATAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTATATTTCTATTCTTCTACTAAACCAGCTGGCTTTAATACACCAGTTCTTAGTAATGTTAGTACTGGTGATTTTAATATTTCTCTTTTGTTAACACCTCCTAGTAATCCTAGTGGGCGTTCTTTTATTGAAGATCTTTTGTTTACAAGTGTTGAATCTGTTGGACTACCGACAGATGATGCTTATAAAAAGTGCACTGCGGGACCTTTGGGTTTTCTTAAAGACCTTGCTTGCGCTCGTGAATATAATGGTTTGCTTGTCTTGCCACCTATTATTACAGCAGAGATGCAAACTTTGTATACTAGCTCTTTGGTAGCATCTATGGCTCTTGGTGGTATTACTGCAGCTGGTGCTATACCTTTTGCTACACAGCTTCAGGCTAGAATTAATCACTTGGGTATTACCCAGTCTCTTTTGTTAAAAAATCAAGAAAAAATTGCAGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAAAAGTACTTCTCTAGCATTACAACAGATTCAGGATGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACAGAAACTATGCAATCACTTAATAAGAATTTTGGTGCTATTTCCTCTGTGATTCAAGATATTTACCAGCAACTTGACGCCATACAAGCAGATGCTCAAGTGGATCGTCTTATAACTGGTAGATTGTCTTCACTTTCTGTTTTAGCATCTGCTAAGCAGGCGGAGTATCTTAAAGTATCACAACAGCGTGAGTTAGCCACGCAAAAGATTAATGAGTGTGTTAAATCACAGTCTACTAGGTACTCCTTTTGTGGTAATGGAAGACATGTTCTAACCATACCACAAAATGCACCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTATACTCCAGAGAGTTTTGTTAATGTTACAGCAATAGTAGGGTTTTGCGTGAACCCAGCTAATGCTAGTCAATATGCAATAGTACCGGCTAATGGAAGGGGTATTTTTATACAGGTCAACGGCACATACTATATCACAGCACGTGATATGTATATGCCCAGAAGCATTACTGCTGGAGACATAGTTACTTTGACTTCTTGCCAGGCAAACTATGTTAATGTTAATAAAACCGTCATCACTACATTTGTAGATGAAGATGATTTTGATTTTAATGATGAATTGTCAAAATGGTGGAATGAAACTAAGCATGAGTTTCCAGACTTTGACCAGTTTAATTACACCATACCTGTTTTAAATATAACTTATGACATTGACAAGATTGAGGAAGTCATCAAGGGACTTAATGATTCCTTGATAGACCTCGAAACACTTTCAATACTCAAAACGTATATTAAGTGGCCTTGGTATGTATGGCTTGCCATAGCTTTTGCTACTATAATTTTTATCCTTATTTTAGGATGGGTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTCGGTATCCTTCCTTTAGTGGGTAAGTGTAGTAAGAAGTCTTCTTATTACACGACATTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus --
DVSP08800480 ABF61510.1 spike protein Infectious bronchitis virus. 1167 aa MLERPLLLVTLLCALCSANLFDNRSYVYYYQSAFRPSYGWHLHGGAYAVVNVTEEPNNAGGAKECTAGAISWSKNFSAASVAMTAPPAGMRWSTSEFCTAHCNFTDFTVFVTHCFKHDACPLTGFIEKGYIRISAMKNTGSTLSDLFYNLTVAVTKYPTFRSLQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNETKAVSAAGVHFKAGGPITYKVMREVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGLYPFTNSSLVKERFIVYRETSINTTLTLTNFTFSNESSAPPNSGGVNTIQLYQTKTAQSGYYNFNFSFLSGFEYKESNFMYGSYHRQCNFRPETINNGLWFNSLSVSIAYGPIQGGCKQSVFSGKATCCYAYSYRGPTACKGVYSGELTQNFECGLLVFVTKSDGSRIQTATTPPIITQHNYNNITLNSCVDYNIYGRTGQGLITNITDSAASYNYLADGGLAILDSSGAVDIFVVQGAYGLNYYKVNPCEDVHQQFAVSGGKLVGILTSRNETGSQAIENQFYIKLTNGSRRSRRSVSENVTNCPYVSYGKFCIKPDGSISTIVPKELEQFLAPLLNVTENVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCMQYVCGNSLECRNLFQQYGPVCDNILSIVNSVGQKEDMELLYFYSSTKPAGFNTPVLSNVSTGDFNISLLLTPPSNPSGRSFIEDLLFTSVESVGLPTDDAYKKCTAGPLGFLKDLACAREYNGLLVLPPIITAEMQILYTSSLVASMALGGITAAGAIPFATQLQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFKSTSLALQQIHDVYNKQSAILTETMQSLNNRFGAISSGIQDIYQQLDAIQAECQVDRLITGRLSSLSVLASAKQAEYLKVSQQRELATQKINECVKSQSTRYSFCGNGRHVLTIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFVNVTAIVGFCVNPANASQYAIVPANGRGIFIQVNGTYYITARDMYMPRSITAGDIVTLTSCQANYVNVNKTVITTFVDEDDFDFNDELSKWWNETKHEFPDFDQFNYTIPVLNITYDIDKIEEVIKGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIAFATIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGILPLVSKCSKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV DQ490211.1 Infectious bronchitis virus strain Q1-99 spike protein (S); 3a protein (3a); 3b protein (3b); small membrane protein (3c); membrane protein (M); 5a protein (5a); 5b protein (5b); and nucleocapsid (N) genes; complete cds 3504bp ATGTTGGAACGACCGCTTTTATTAGTGACTCTTTTGTGTGCACTATGTAGTGCCAATTTGTTTGATAATCGTTCTTATGTTTACTACTACCAAAGTGCTTTCAGACCTAGTTATGGTTGGCATTTACATGGAGGTGCTTATGCAGTAGTAAATGTTACTGAAGAACCAAATAATGCAGGTGGTGCAAAGGAGTGTACAGCCGGAGCTATTTCTTGGAGTAAAAATTTCAGTGCTGCTTCTGTAGCTATGACAGCACCACCTGCCGGTATGCGGTGGTCTACCTCTGAATTTTGCACGGCTCACTGTAATTTTACTGATTTTACAGTGTTTGTTACACATTGTTTTAAACATGATGCCTGTCCTTTAACAGGTTTTATTGAAAAAGGTTACATTCGTATTTCTGCTATGAAAAATACCGGTAGTACACTTAGCGATTTGTTTTATAATTTAACAGTTGCTGTGACTAAATATCCCACGTTTAGATCACTTCAATGTGTTAATAATTTTACATCTGTATATCTAAATGGTGATCTCGTTTTTACTTCTAATGAGACTAAAGCTGTTAGTGCTGCAGGTGTTCACTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGTTTATTAGCATGCCAATATAATACTGGTAATTTTTCAGATGGATTATATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGGAAAGGTTTATTGTATATCGTGAGACTAGTATTAATACTACTTTGACGTTAACTAATTTTACTTTTTCAAATGAAAGTAGTGCGCCACCCAATTCTGGTGGTGTAAACACTATTCAATTGTACCAAACTAAAACAGCCCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTTTCATTTCTGAGTGGTTTTGAGTATAAGGAGTCTAATTTTATGTATGGGTCTTATCACCGGCAATGTAACTTTAGACCGGAGACTATTAATAATGGCCTCTGGTTTAACTCACTTTCAGTTTCAATTGCTTACGGTCCTATTCAAGGCGGTTGCAAGCAATCTGTTTTTAGTGGTAAAGCAACTTGTTGTTATGCTTACTCATATCGTGGTCCCACAGCGTGTAAAGGTGTTTACAGTGGTGAGTTAACTCAGAATTTTGAATGTGGACTGTTAGTTTTTGTCACTAAGAGCGATGGCTCTCGTATACAAACAGCTACCACACCACCAATCATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATAGTTGTGTTGATTATAATATATATGGTAGAACAGGCCAAGGTCTTATTACTAACATAACCGATTCAGCTGCTAGTTATAATTATCTAGCAGACGGAGGTTTGGCTATTTTAGATTCATCTGGTGCCGTAGACATCTTCGTTGTACAAGGTGCATATGGTCTTAATTATTATAAGGTTAACCCTTGCGAAGATGTTCACCAGCAGTTTGCAGTGTCTGGTGGTAAATTAGTTGGTATTCTTACTTCACGTAATGAAACAGGTTCTCAGGCTATTGAGAACCAGTTTTATATTAAACTCACCAATGGATCACGTCGTTCTAGGCGTTCCGTTTCTGAAAATGTTACAAATTGCCCTTATGTTAGTTACGGCAAGTTTTGTATAAAACCTGACGGTTCAATTTCTACAATAGTACCAAAAGAACTTGAACAGTTTTTGGCACCTTTACTTAATGTTACTGAAAATGTGCTCATACCTAACAGTTTCAACTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACGCGTATGGATAAGGTTCAAATTAATTGCATGCAGTATGTTTGTGGCAATTCTTTGGAGTGTAGAAATTTATTTCAACAATATGGGCCTGTTTGTGACAACATACTGTCTATAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTATATTTCTATTCTTCTACTAAACCAGCTGGCTTTAATACACCAGTTCTTAGTAATGTTAGTACTGGTGATTTTAATATTTCTCTTTTGTTAACACCTCCTAGTAATCCTAGTGGGCGTTCTTTTATTGAAGATCTTTTGTTTACAAGTGTTGAATCTGTTGGACTACCGACAGATGATGCTTATAAAAAGTGCACTGCGGGACCTTTGGGTTTTCTTAAAGACCTTGCTTGCGCTCGTGAATATAATGGTTTGCTTGTCTTGCCACCTATTATTACAGCAGAGATGCAAATTTTGTATACTAGCTCTTTGGTAGCATCTATGGCTCTTGGTGGTATTACTGCAGCTGGTGCTATACCTTTTGCTACACAGCTTCAGGCTAGAATTAATCACTTGGGTATTACCCAGTCTCTTTTGTTAAAAAATCAAGAAAAAATTGCAGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAAAAGTACTTCTCTAGCATTACAACAGATTCATGATGTGTATAATAAGCAGAGTGCTATCCTTACGGAAACTATGCAATCACTTAATAATAGATTTGGTGCTATTTCCTCTGGGATTCAAGATATTTACCAGCAACTGGACGCCATACAAGCAGAATGTCAAGTGGATCGTCTTATAACTGGTAGATTGTCTTCACTTTCTGTTTTAGCATCTGCTAAGCAGGCGGAGTATCTTAAAGTATCACAACAGCGTGAGTTAGCCACGCAAAAGATTAATGAGTGTGTTAAATCACAGTCTACTAGGTACTCCTTTTGTGGTAATGGAAGACATGTTCTAACCATACCACAAAATGCACCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTATACTCCAGAGAGTTTTGTTAATGTTACAGCAATAGTAGGGTTTTGCGTGAACCCAGCTAATGCTAGTCAATATGCAATAGTACCGGCTAATGGAAGGGGTATTTTTATACAGGTCAACGGCACATACTATATCACAGCACGTGATATGTATATGCCCAGAAGCATTACTGCTGGAGACATAGTTACTTTGACTTCTTGCCAGGCAAACTATGTTAATGTTAATAAAACCGTCATCACTACATTTGTAGATGAAGATGATTTTGATTTTAATGATGAATTGTCAAAATGGTGGAATGAAACTAAGCATGAGTTTCCAGACTTTGACCAGTTTAATTACACCATACCTGTTTTAAATATAACTTATGACATTGACAAGATTGAGGAAGTCATCAAGGGACTTAATGATTCCTTGATAGACCTCGAAACACTTTCAATACTCAAAACGTATATTAAGTGGCCTTGGTATGTATGGCTTGCCATAGCTTTTGCTACTATAATTTTTATCCTTATTTTAGGATGGGTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTCGGTATCCTTCCTTTAGTGAGTAAGTGTAGTAAGAAGTCTTCTTATTACACGACATTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus --
DVSP08800481 ABF61518.1 spike protein Infectious bronchitis virus. 1174 aa MLVKLLSIVTVLSSLCSGNLFDENNKYVYYYQSGCRPPNGWHMHGGAYAVDTVFNETNNAVDSTCTAGAIVGSLNFSAAAVAMTAPVGAGMNWSTRQFCTAHCNFSDGSATITVFVTHCFKSGPNTCPLTGNIGQGSIRIGVLKNRVSDLNITVNSTVYTTFRSLHCVNNNTAVYLNGNLVYTSNQTMAINGAGVHFKAGGPITYKTMKEHKVLAYFQNGTAHDIVLCDDSPRGILACQYNTGNFSDGLYPFTNDIVVNKTFVVYEQNSITTTLKLTNFTISNQTDASPNAQESSPGVSQYVYYQHHSAVAGLHNFNFSFLSYFSYVDTDFNKGSYPRTCKFRPENINKNFRFNHLSVKIAYGPREGGCKQAVYGRKDVCCFMYSYNGPIECRGVYSGQLTQKFECVLLVFIEHTSGSRVLTSETIPVTTQNFTNNIVTGECVDYNIYGRYGRGFISDITEQASYNNYLADSGLAILDSSGAIDIFIVRGPNEFKYYKVNPCQDVNQQFVVSGGNVVGLLTSINESGSLQVEDLFFKNLINSTHRRKRSVSVNTVTTCPYVSYGKFCFKPDGEMVEIVPEGIETYSSPLFNLSENVLIPYTFNLTVTDEYIQTTMEKVQINCIQYVCGNSIECKKLFQQYGPVCDNILSIVNSLAQQDNMEFLQFYSATKPKGFDTPILNNVSTDAFNLSLVLRKPSNSRGRSFIEDLLFTKVESLGLPGDTAYQKCTAGPLGFVKDLVCAQHYNGLLVLPPIITAEMQTMYTASLVASMAFGGITSAGAIPFATQIQARINHLGITQTVLQKNQEQIAASFNKAMLHMQDGFRATSSALQQIQDVINKQGSVLQDAMNALNKNFGAVSSVIQDIYSRLDTIEANVQVNRLITGRLSSLSVLASAKQAEYAKVSQQRELAKQKINECVKSQSTRLGFCGAGKHVLTIPQNAPNGIVLLHFTYTPETYKNVTAVVGFCIKPDNGSEYAIVPVSGRGIFIQENDTYYITARDMYMPRAITGGDVVMLTSCQANYVSLNRTVITTFVENDDFNFDDELSKWWNRTKSELPDFDQFNYTIPVLNITYDIDKIEEVINGLNDSLIDLEVLSILKTYIKWPWYVWLAIAFLTIIFILILVWIFFMTGCCGCCCGCFGLIPLMSKCGKKSSYYTTFDDDVVGVQIKPKKNV DQ490212.1 Infectious bronchitis virus strain Q3-88 spike protein (S); 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DVSP08800482 ABF61523.1 spike protein Infectious bronchitis virus. 1167 aa MLERPLLLVTLLCALCSANLFDNRSYVYYYQSAFRPSYGWHLHGGAYTVVNVTEEPNNAGGAEECTAGAISWSKNFSAASVAMTAPPAGMRWSTSEFCTAHCNFTDFTVFVTHCFKRDACPLTGFIEKGYIRISAMKNTGSTPSDLFYNLTVAVTKYPTFRSLQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNETKAVSAAGVHFKAGGPITYKVMREVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGLYPFTNSSLVKERFIVYRETSINTTLTLTNFTFSNESSAPPNSGGVNTIQLYQTKTAQSGYYNFNFSFLSDFEYKESNFMYGSYHPQCNFRPETINNGLWFNSLSVSIAYGPIQGGCKQSVFSGKATCCYAYSYRGPTACKGVYSGELTQNFECGLLVFVTKSDGSRIQTATTPPIITQHNYNNITLNSCVDYNIYGRTGQGLITNITDSAASYNYLADGGLTILDSSGAVDIFVVQGAYGLNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGIPTSRNETGSQAIENQFYIKLTNGSRRSRRSVSENVTNCPYVSYGKFCIKPDGSISTIVPKELEQFLAPLLNVTENVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCMQYVCGNSLECRNLFQQYGPVCDNILSIVNSVGQKEDMELLYFYSSTKPAGFNTPVLSNVSTGDFNISLLLTPPSNPSGRSFIEDLLFTSVESVGLPTDDAYKKCTAGPLGFLKDLACAREYNGLLVLPPIITAEMQILYTSSLVASMALGGITAAGAIPFATQLQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFKSTSLALQQIHDVVNKQSAILTETMQSLNKNFGAISSVIQDIYQQLDAIQADAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQAEYLKVSQQRELATQKINECVKSQSTRYSFCGNGRHVLTIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFVNVTAIVGFCVNPANASQYAIVPANGRGIFIQVNGTYYITARDMYMPRSITAGDIVTLTSCQANYVNVNKTVITTFVDEDDFDFNDELSKWWNETKHEFPDFDQFNYTIPVLNITYDIDKIEEVIKGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIAFATIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGILPLVSKCSKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV DQ490213.1 Infectious bronchitis virus strain S spike protein (S); 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3a protein (3a); 3b protein (3b); small membrane protein (3c); membrane protein (M); 5a protein (5a); 5b protein (5b); and nucleocapsid (N) genes; complete cds 3504bp ATGTTGGAACGACCGCTTTTATTAGTGACTCTTTTGTGTGCACTATGTAGTGCCAATTTGTTTGATAATCGTTCTTATGTTTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCTAGTTATGGTTGGCATTTACATGGAGGTGCTTATGCAGTAGTAAATGTTACTGAAGAACCAAATAATGCAGGTGGTGCAGAGGAGTGTACAGCCGGAGCTATTTCTTGGAGTAAAAATTTCAGTGCTGCTTCTGTAGCTATGACAGCACCACCTGCCGGTATGCGGTGGTCTACCTCTGAATTTTGCACGGCTCACTGTAATTTTACTGATTTTACAGTGTTTGTTACACATTGTTTTAAACGTGATGCCTGTCCTTTAACAGGTTTTATTGAAAAAGGTTACATTCGTATTTCTGCTATAAAAAATACCGGTAGTACACCTAGCGATTTGTTTTATAATTTAACAGTTGCTGTGACTAAATATCCCACGTTTAGATCACTTCAATGTGTTAATAATTTTACATCTGTATATCTAAATGGTGATCTCGTTTTTACTTCTAATGAGACTAAAGCTGTTAGTGCTGCAGGTGTTCACTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGTTTATTAGCATGCCAATATAACACTGGTAATTTTTCAGATGGATTATATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGGAAAGGTTTATTGTATATCGTGAGACTAGTATTAATACTACTTTGACGTTAACTAATTTTACTTTTTCAAATGAAAGTAGTGCGCCACCCAATTCTGGTGGTGTAAACACTATTCAATTGTACCAAACTAAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTTTCATTTCTGAGTGGTTTTGAGTATAAGGAGTCTAATTTTATGTATGGATCTTATCACCCGCAATGTAACTTTATACCGGAGACTATTAATAAAGGCCTCTGGTTTAACTCACTTTCAGTTTCAATTGCTTACGGTCCTATTCAAGACGGTTGCAAGCAATCTGTTTTTAGTGGTAAAGCAACTTGTTGTTATGCTTACTCATATCGTGGTCCCACAGCGTGTAAAGGTGTTTACAGTGGTGAGTTAACTCAGAATTTTGAATGTGGACTGTTAGTTTTTGTCACTAAGAGCGATGGCTCTCGTATACAAACAGCTACCACACCACCAATCATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATAGTTGTGTTGATTATAATATATATGGTAGAACAGGCCAAGGTCTTATTACTAACATAACCGATTCAGCTGCTAGTTATAATTATCTAGCAGACGGAGGTTTGGCTATTTTAGATTCATCTGGTGCCGTAGACATCTTCGTTGTACAAGGTGCATATGGTCTTAATTATTATAAGGTTAACCCTTGCGAAGATGTTAACCAGCAGTTTGTAGTGTCTGGTGGTAAATTAGTTGGTATTCTTACTTCACGTAATGAAACAGGTTCTCAGGCTATTGAGAACCAGTTTTATATTAAACTCACCAATGGATCACGTCGTTCTAGGCGTTCTGTTTCTGAAAATGTTACAAATTGCCCTTATGTTAGTTACGGCAAGTTTTGTATAAAACCTGACGGTTCAATTTCTACAATAGTACCAAAAGAACTTGAACAGTTTTTGGCACCTTTACTTAATGTTACTGAAAATGTGCTCATACCTAACAGTTTTAACTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACGCGTATGGATAAGGTTCAAATTAATTGCATGCAGTATGTTTGTGGCAATTCTTTGGAGTGTAGAAATTTATTTCAACAATATGGGCCTGTTTGTGACAACATACTGTCTATAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTATATTTCTATTCTTCTACTAAACCAGCTGGCTTTAATACACCAGTTCTTAGTAATGTTAGTACTGGTGATTTTAATATTTCTCTTTTGTTAACACCTCCTAGTAATCCTAGTGGGCGTTCTTTTATTGAAGATCTTTTGTTTACAAGTGTTGAATCTGTTGGACTACCGACAGATGATGCTTATAAAAAGTGCACTGCGGGACCTTTGGGTTTTCTTAAAGACCTTGCTTGCGCTCGTGAATATAATGGTTTGCTTGTCTTGCCACCTATTATTACAGCAGAGATGCAAACTTTGTATACTAGCTCTTTGGTAGCATCTATGGCTCTTGGTGGTATTACTGCAGCTGGTGCTATACCTTTTGCTACACAGCTTCAGGCTAGAATTAATCACTTGGGTATTACCCAGTCTCTTTTGTTAAAAAATCAAGAAAAAATTGCAGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAAAAGTACTTCTCTAGCATTACAACAGATTCAGGATGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACAGAAACTATGCAATCACTTAATAAGAATTTTGGTGCTATTTCCTCTGTGATTCAAGATATTTACCAGCAACTTGACGCCATACAAGCAGATGCTCAAGTGGATCGTCTTATAACTGGTAGATTGTCTTCACTTTCTGTTTTAGCATCTGCTAAGCAGGCGGAGTATCTTAAAGTATCACAACAGCGTGAGTTAGCCACGCAAAAGATTAATGAGTGTGTTAAATCACAGTCTACTAGGTACTCCTTTTGTGGTAATGGAAGACATGTTCTAACCATACCACAAAATGCACCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTATACTCCAGAGAGTTTTGTTAATGTTACAGCAATAGTAGGGTTTTGCGTGAACCCAGCTAATGCTAGTCAATATGCAATAGTACCGGCTAATGGAAGGGGTATTTTTATACAGGTCAACGGCACATACTATATCACAGCACGTGATATGTATATGCCCAGAAGCATTACTGCTGGAGACATAGTTACTTTGACTTCTTGCCAGGCAAACTATGTTAATGTTAATAAAACCGTCATCACTACATTTGTAGATGAAGATGATTTTGATTTAAATGATGAATTGTCAAAATGGTGGAATGAAACTAAGCATGAGTTTCCAGACTTTGACCAGTTTAATTACACCATACCTGTTTTAAATATAACTTATGACATTGACAAGATTGAGGAAGTCATCAAGGGACTTAATGATTCCTTGATAGACCTCGAAACACTTTCAATACTCAAAACGTATATTAAGTGGCCTTGGTATGTATGGCTTGCCATAGCTTTTGCTACTATAATTTTTATCCTTATTTTAGGATGGGTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTCGGTATCCTTCCTTTAGTGAGTAAGTGTAGTAAGAAGTCTTCTTATTACACGACATTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus --
DVSP14400036 ABF65836.1 S protein Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus. 1255 aa MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFGNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFAVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDIWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKKISNCVADYSVLYNSTFFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNHNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPALNCYWPLNDYGFYTTTGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTAIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSLLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCTQLNRALSGIAAEQDRNTREVFAQVKQMYKTPTLKYFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT DQ497008.1 SARS coronavirus strain MA-15; 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DVSP13700122 ABF68959.1 spike glycoprotein SARS coronavirus CS24. 1255 aa MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFDNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFAVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDIWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKKISNCVADYSVLYNSTFFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPAPNCYWPLNDYGFYTTSGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCAFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTAIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSLLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCTQLNRALSGIAAEQDRNTREVFAQVKQMYKTPTLKYFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCVTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT DQ514532.1 SARS coronavirus CS24 spike glycoprotein gene; 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DVSP00500001 ABG02427.2 putative spike protein Nam Dinh virus. 899 aa MINSKCPLLFQTTTTSMPNQAHRNRPGPPIILKPETQWHQNHNANASSSSKLHRSPLNNHPKDNQNLNATNLMLQHLPSLRSRKQLQQAPTTPKPAVNFTKSEKNSMLETTWDGGKMKRLDQQSSSSLNLKWHPELTKSTIAINLRILTISSILSVLAYLFKTQPLSAMQFTTTKNSLLKKKMSTFVNYLMPSMQSSCVHVKHLTLVPFLLLLLMLPNANCSTRIDLSTHHIVSYNKPLIVVDDFLKTTLKYNFGTDLYNSAINYKTSFEQLLNNFKTPYQPLVDAFRVLFSYLGIEPVAHPFKDYFNADSPCPLQTTTTTGDVTTIGEHFQEILDDGNLELEPLASYWLRHTEDIFVYTRSQLWAFICPSEFAQASIFLPNYTEAIYNVSTAFCKTVYYDTPTNAFNAEICNKVNFITPAKAQKRSKRWDSSYVCGWPLVSSAAKVLGGECTTNIDIGTLKSSLNAIQNFSYANTELIHDLQSQLSVVNARTNLHYNQLQQLVTAINDHQAKYVNDINNLINHIKNTTNTMENRINVNSIIMSYTNSLFRVYQNIVDYRFAYIETLSSIQQHYHFPSEHLHAFNVPLQAKLREHGFSIPIIDSNIPYSYGKVRYLNVTGINFYDLEFDIYIPVIKLIHEKDSKYYHSTLSALPIGINTTLVTYNTYQGNAICTDTYCLESPINGFCREGESYWYCGQHYIRTLHKITSLYTKPTKFTXSAMFIPPHTMYFVHNTTYSLNYGSSLQALAGSILMLTCNSTVQIPGYNFNSNDFVSCTDMNVNNVFIHPSLRVNDANFYIPPTRVDLLEKLYKRDIIPILNHIQKANDITIDTTADEELKQQYETLKSDFNAKYDALNIENRRIHALINSMHSIQSEPSYILYMVIAVIVFIVLKFLRII DQ458789.2 Nam Dinh virus isolate 02VN178; complete genome 2700bp ATGATTAACTCAAAATGCCCGCTACTATTTCAAACAACAACAACGTCAATGCCCAACCAGGCACATCGAAACAGACCCGGCCCACCAATAATTCTAAAACCGGAAACGCAATGGCACCAAAACCACAACGCCAACGCAAGCAGCAGCAGCAAGCTTCATCGCAGTCCCCTAAACAACCACCCAAAGGACAACCAAAACCTAAACGCAACCAACCTAATGCTGCAGCATCTGCCCAGCCTAAGGTCAAGAAAGCAATTGCAACAGGCCCCAACTACACCGAAACCAGCGGTAAACTTTACAAAATCGGAAAAGAATTCGATGCTAGAAACCACATGGGATGGAGGAAAAATGAAAAGACTGGATCAACAGTCCAGTTCCTCTTTAAACCTAAAATGGCATCCCGAATTGACCAAGTCTACTATCGCAATCAATTTGAGGATCCTGACCATTTCATCCATACTTTCGGTGTTGGCGTATTTGTTCAAGACTCAACCCTTGAGCGCAATGCAATTTACAACCACCAAAAACTCACTACTGAAGAAAAAGATGAGTACGTTCGTAAACTATCTGATGCCTTCAATGCAATCCTCCTGCGTACACGTCAAGCATTTGACTCTGGTTCCCTTCCTGCTCTTACTGTTGATGCTGCCTAATGCTAACTGCTCTACCCGTATAGATTTGAGCACACACCACATAGTTTCATATAACAAGCCACTTATAGTGGTAGATGATTTTCTGAAGACAACTTTAAAATATAATTTTGGCACTGATTTGTATAATAGTGCTATAAATTATAAAACCTCTTTCGAGCAACTTCTGAATAACTTTAAAACACCTTACCAACCACTTGTTGACGCCTTCCGCGTTTTATTTAGTTATTTAGGTATAGAACCCGTAGCCCATCCATTCAAGGATTACTTCAATGCTGATTCCCCTTGCCCCTTGCAAACTACAACAACCACTGGCGATGTAACCACTATAGGTGAACATTTCCAAGAAATCTTGGATGATGGTAATTTAGAATTGGAACCACTAGCTAGTTATTGGCTTAGACATACAGAAGATATTTTTGTATACACACGATCACAACTATGGGCCTTTATATGTCCTTCTGAATTTGCACAAGCTAGTATATTTTTACCCAATTATACTGAAGCCATTTATAATGTATCAACCGCTTTTTGTAAAACTGTCTATTATGACACCCCTACAAATGCCTTCAATGCTGAAATTTGTAATAAAGTTAATTTCATCACACCAGCCAAAGCACAAAAACGCAGCAAACGTTGGGATTCTTCCTACGTTTGTGGCTGGCCACTTGTATCTAGCGCCGCTAAAGTGCTGGGAGGTGAATGTACAACTAACATCGACATTGGTACTTTAAAATCAAGTCTAAATGCTATTCAAAATTTCTCTTATGCAAATACAGAATTAATCCACGACTTACAATCACAGCTTAGTGTTGTAAATGCTCGCACAAATCTTCACTATAATCAACTTCAACAACTCGTCACAGCTATAAATGATCATCAAGCTAAATATGTGAATGACATAAACAACTTAATTAACCATATTAAGAATACAACTAACACTATGGAAAATCGCATTAATGTTAACTCCATTATTATGTCTTATACTAATTCACTCTTTCGTGTATATCAAAATATAGTTGATTATCGCTTCGCGTATATAGAAACACTTAGTTCCATACAGCAACACTATCATTTTCCCTCTGAACATCTACATGCTTTTAATGTCCCTCTTCAGGCTAAACTTCGAGAGCATGGGTTTTCAATACCTATTATAGATTCAAATATCCCTTACTCTTATGGTAAAGTTAGATATCTAAATGTAACTGGCATAAATTTTTATGACCTTGAATTTGATATCTACATCCCTGTAATAAAACTCATTCATGAAAAAGATAGTAAATACTACCATTCAACGCTTTCAGCGCTCCCCATTGGAATTAATACTACACTAGTAACTTACAATACTTATCAGGGTAATGCTATATGCACAGATACGTATTGTCTTGAGTCACCTATTAACGGATTTTGCCGCGAAGGTGAGAGTTATTGGTATTGTGGCCAACATTATATTAGAACACTTCATAAAATAACCTCTTTGTATACCAAACCCACAAAATTCACTRAAAGTGCCATGTTTATACCACCACATACTATGTACTTTGTACATAATACCACTTATTCATTAAACTATGGATCCTCACTTCAAGCACTAGCTGGTTCTATACTGATGCTAACTTGCAACTCTACAGTCCAGATCCCTGGGTACAACTTCAACTCCAACGATTTTGTTTCGTGCACAGATATGAATGTTAATAATGTTTTTATACATCCCTCCCTACGTGTCAATGACGCAAACTTCTATATACCGCCCACTCGAGTAGATCTACTTGAAAAACTTTATAAACGCGATATAATCCCTATACTAAATCATATACAAAAAGCTAATGACATAACTATAGACACCACGGCTGACGAAGAATTAAAACAACAATATGAAACACTTAAAAGCGATTTCAATGCTAAATACGACGCATTGAATATAGAAAATAGACGAATACACGCACTAATTAATAGTATGCATTCCATACAATCGGAACCCTCATATATTCTATACATGGTTATCGCAGTAATCGTTTTTATAGTCCTCAAATTTCTTAGAATCATATAA Nam Dinh virus alphamesonivirus Nam Dinh virus mosquito
DVSP03500001 ABG11962.1 spike Bat coronavirus (BtCoV/A434/2005). 1319 aa MCSLTSIGSLVNSQSVDMGTTGSGNCIESQVAPDFFETARNIWPLPIDTSKAEGVIYPNGKSYSNISLTYTGLYPKANDLGKQYIFSDGHSSPGTLSRLFVSNYSRQVEMFDSGFIVRIGAASNKTGTTVISQSTNRPIKKIYPAFMLGHSVGNYTPTNITGRYLNHTLVILPDGCGTLVHAFYCILQPRTQAYCAGASTFTSVTVWDTPASDCANSQSYNQLANLNAFKLYFDLINCTFRYNYTITEDENAEWFGITQDTQGVHLYSSRKENVFRNNMFHFATLPVYQKILYYTVIPRSIRSPFNDRKAWAAFYIYKLHPLTYLLNFDVEGYITKAVDCGYDDFAQLQCSYENFDVETGVYSVSSFEASPRGEFIEQSVTKECDFSPMLTGTPPPIYDFKRLVFTNCNYNLTKLLSLFQVSEFSCHQVSPSSLATGCYSSLTVDYFAYSTDMSSYLQPGSAGEIVQFNYKQDFSNPTCRVLATVPQNLTTITKPSNYAYLTECYKTTAHGKNYLYNAPGGYTPCLSLASRGFSTKYQSHSDGELTTTGYIYPVNGNLQMAFIISVQYGTDTNSVCPMQVLRNDTSIEDKLDVCVEYSLHGITGRGVFHNCTSVGLRNQRFVYDTFDNLVGYHSDNGNYYCVRPCVSVPVSVIYDKSSNSHATLFGSVACSHVTTMMSQFSRMTKSSLLARTTPRPLQTTVGCAMGFINSSLVVDECRLPLGQSLCAIPPTISTRLRRATSGVSDVFQIATLNFTSPLTLAPINSTGFVVAVPTNFTFGVTQEFIETTIQKITVDCKQYVCNGFKKCEDLLKEYGQFCSKINQALHGANLRQDESIANLFSSIKTQNTQPLQAGLNGDFNLTLLQVPHVTTGQGKYRSAIEDLLFNKVTIADPGYMQGYDECMQQGPQSARDLICAQYVAGYKVLPPLYDPYMEAAYTSSLLGSIAGASWTAGLSSFAAIPFAQSIFYRLNGVGITQQVLSENQKIIANKFNQALGAMQTGFSTTNLAFNKVQDAVNANAMALSKLAAELSNTFGAISSSISDILARLDTVEQEAQIDRLINGRLTSLNAFVAQQLVRTEAAARSAQLAQDKVNECVKSQSKRNGFCGTGTHIVSFAINAPNGLYFFHVGYQPTSHLNATAAYGLCNSETPPKCIAPIDGYFVLNQTISTARSSEDQQWYYTGSSFFHPEPITEANSKYVSMDVKFENLTNRLPPPLLSNSTDLDFKEELEEFFKNVSSQGPNFQEISKINTTLLNLNQELLVLSEVVKQLNESYIDLKELGNYTFYQKWPWYIWLGFIAGLVALALCVLHSMLYWLWY DQ648790.1 Bat coronavirus (BtCoV/A434/2005) spike (S) gene; 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DVSP03500002 ABG11963.1 spike Bat coronavirus A515/2005. 1371 aa MKYTLLFCVVFATVSCGLAANERCGKTVNLTRLFSKFDIQPPSQVVLAGLLPNQTAQWKCTTANNKRDEGVGAKGVFLSYVSSGRGFTIGVSQDVFDPNTYQLYLHRDANGNPNAFAYLXICKWPHQKWLQATFDMNTSGRYCLVNRKIPAAFVDNANMVVGITWDQDRVTFYTDKVYHFYVPNNRWSRVVSWCSAADSCAMQYINSTIYYNLNVTAQGPGGITYSVCTKHCTGLADNVFSTDQGGHIPPIFPYNNWFLLTNTSTLVQGVTRVFQPFLVNCLVALPKLQGLTTTLSFDSPLNVPGFSCNGANGSSSAEAFRFNVNDTKLFVGAGAVTLTTVDGVNVSIVCSNNATQPTRSNNLQENLPYYCFTNTSSGTNHTVKFLSVFPPIIREFVITKYGNVYVNGYIYLRTRPLTAVHLNASSHSQDVAGFWTIAATNFTDVLVEVNNTGIQRLLYCDTPENSVKCSQLSFELEDGFYSMTADNVYAVTKPHTFVTLPTFNDHGFVNVTVGGTFDTSYPPKFTANGTFVNNDTVVCVTSNQFTLTHDFKVAYSNDMRKGIFEYSSTCPFNRESINNYLTFGRICFSTTPADGACELKYYVWNTVGAISHLAGTLYVQHTRGDTITGTPKPLQGLNDISELHLDTCTTYTIYGFRGDGVIRLTNQTFLSGVYYTSESGQLLAFKNVTTGQIYSVTPCQLVQQVAFVEDRIVGVISSANNTGFFNSTRTFPGFYYHSNDTTNCTSPRLVYSNIGVCTSGAIGLLSPKXAQPQIQPMFQGNISIPTNFTMSVRTEYVQLFNKPVSVDCAMYVCNGNERCNQLLSQYTSACKNIESALQLSARLESMEVNSMLTVSDEALKLATISQFPGGGYNFTNILPANPGARSVIEDILFDKVVTSGLGTVDEDYKRCSNGLSIADLACAQHYNGIMVLPGVADWEKVHMYSASLVGGMTLGGITSAAALPFSYAVQARLNYVALQTDVLQRNQQMLANSFNSAISNITLAFESVNNAIYQTSAGLNTVAEALSKVQDVVNGQGNALSQLTVQLQNNFQAISNSIGDIYSRLDQITADAQVDRLITGRLAALNAFVAQSLTKYAEVQASRTLAKQKVNECVKSQSPRYGFCGDEGEHIFSLTQAAPQGLMFLHTVLVPNGFINVTAVTGLCVDETIAMTLRQSGFVLFVQSGSYLVSPRKMFEPRRPEVADFVQVKTCTISYVNITNNQLPDIIPDYVDVNKTIDEILANLPNNTVPDLPLDVFNQTFLNLTGEIADLEARSESLKNTSEELRQLIQNINNTLVDLQWLNRVETYIKWPWYVWLAIVIALILVVSLLVFCCISTGCCGCCGCCGSCFSGCCRGTKLQHYEPIEKVHVQ DQ648791.1 Bat coronavirus (BtCoV/A515/2005) spike (S) gene; 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DVSP08800491 ABG36779.1 spike protein Infectious bronchitis virus. 1163 aa MLVKSLFLVTLLFALSSATLYDNDTYVYYYQSAFRPPNGWHLHGGANAVVNVTTQLNNAGNASVCIGGSIQGGYVFNASSVAMTAPNNGMTWSTAQFCTAHCNFSDVTVFVTHCFNSTRGACPTGFVPRNHIRISAMKNGSLFYNSTISVSKYPRFMSFQSVNNLTSVYLNGDLVYTSNETTDVTSAGVYFKAGGPITYKIMREVKALAYFINGTAQDVILCDDTPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQRFVVYRENSVNTTLTLTNYTFYNETNASPNSGGVHTISTYQTQTAQSGYYNFNLSFLSSFVYRESNFMYGSYHPACNFRLETINNGLWFNSLSVSLAYGPLQGGCKQSVFTGRATCCYAYSYNGRRQCKGVYSGELQQNFECGLLVYLTKSDGSRIQTATEPPVITQHNYNNITLNTCVEYNIYGRVGQGFITNVTDSAASYNYLADAGLAILDTSGAIDIFVVQGEYGFNYYKVNPCEDVNKQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQPLENQFYIKLTNGSRRFRRSISSNVTSCPYVSYGRYCIEPDGSLKQIVPQELQHFVAPLLNVTEYVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYVCGNSIECRKLFQQYGPVCDNILSVVNSVGQKEDMELLHFYSSTKPKGFDTPVLSNVSTGGFNISLLLTPPSSPRRRSFIEDLLFTSVETVGLPTDAEYKKCTAGPLGTLKDLICAREYNGLLVLPPIITADMQTMYTASLVGAMAFGGITSAAAIPFATQIQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQVQDVVNKQSAILMETMNSLNKNFGAISSVIQDIYAQLDAIQADAQVDRLITGRLSSLSVLASVKQSEYLRVSQQRELATQKINECVKSQSTRYGFCGSGRHVLSIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFVNVTAIVGFCVNPPNASQYAIVPVNGRGVFIQVNGTYYITSRDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVSVNKTVITTFVDNDDFDFEDELSKWWNDTKHELPDFDEFNYTVPVLNISSEIDRIQGVIQGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIAFAIIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPIMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV DQ646404.1 Infectious bronchitis virus isolate TW2296/95 spike protein (S); 3a protein (3a); 3b protein (3b); E protein (E); M protein (M); 5a protein (5a); 5b protein (5b); and nucleocapsid protein (N) genes; complete cds 3492bp ATGTTGGTGAAGTCACTGTTTTTAGTGACTCTTTTGTTTGCACTATCTAGTGCTACTTTGTATGACAATGATACTTATGTTTATTACTATCAGAGCGCTTTTAGACCGCCAAATGGTTGGCATTTACATGGTGGTGCTAATGCAGTAGTCAATGTTACTACTCAACTTAACAATGCAGGCAATGCGTCTGTCTGTATTGGTGGTAGTATTCAAGGCGGCTATGTATTTAATGCTTCTTCTGTAGCTATGACCGCTCCGAATAATGGTATGACTTGGTCTACAGCACAATTTTGTACTGCACACTGCAATTTTTCGGACGTTACAGTGTTTGTTACACATTGTTTTAATTCAACTCGAGGCGCTTGTCCTACGGGCTTTGTTCCAAGGAATCATATACGTATTTCTGCTATGAAAAATGGTTCTCTGTTTTATAATTCAACAATTAGTGTATCTAAATACCCTAGATTTATGTCATTTCAGAGTGTTAATAATTTAACATCTGTCTATTTGAATGGTGACCTTGTTTACACTTCTAATGAGACCACAGACGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCCGGTGGACCTATAACTTATAAAATTATGAGAGAAGTTAAAGCCTTGGCTTATTTTATTAACGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGACACACCTAGAGGTTTGCTAGCATGTCAATATAATACTGGCAATTTCTCAGATGGTTTCTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAAAGGTTTGTTGTTTATCGTGAGAATAGTGTTAATACTACTCTTACTTTAACCAACTACACTTTTTATAATGAGACTAATGCCTCACCTAATTCAGGTGGTGTCCATACTATCTCAACTTATCAAACACAAACTGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTATCATTTCTGAGTAGTTTTGTGTATAGAGAGTCTAATTTCATGTATGGGTCTTACCACCCAGCATGTAATTTTAGACTAGAAACTATTAATAATGGCTTGTGGTTTAACTCACTATCAGTCTCATTAGCTTATGGCCCTCTTCAAGGTGGGTGTAAGCAATCAGTTTTTACAGGTAGAGCTACTTGTTGTTATGCGTACTCCTACAATGGACGTCGCCAGTGTAAAGGAGTTTACAGTGGTGAGTTACAACAAAATTTTGAATGTGGGCTGTTGGTTTATCTTACTAAGAGTGATGGCTCTCGTATACAAACAGCCACAGAACCACCGGTTATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGAGTACAATATATATGGTAGAGTTGGCCAAGGCTTTATAACTAATGTAACCGACTCAGCAGCTAGCTATAATTATTTAGCAGATGCTGGATTGGCAATTTTAGATACTTCAGGTGCCATAGACATTTTCGTTGTACAAGGTGAATATGGTTTCAATTATTATAAGGTTAACCCTTGTGAAGATGTTAATAAGCAGTTTGTAGTGTCAGGAGGCAAGTTAGTAGGCATTCTGACTTCTCGTAATGAAACTGGTTCTCAGCCTCTTGAAAATCAGTTTTATATTAAGTTAACTAATGGAAGTCGTCGTTTTAGACGTTCTATTAGTAGTAATGTTACTAGTTGTCCATATGTTAGTTATGGCAGGTATTGCATTGAACCTGATGGTTCACTTAAACAAATAGTACCACAAGAATTACAACATTTCGTGGCACCTTTACTTAATGTTACAGAATATGTGCTCATACCTAACAGCTTTAATTTGACTGTTACAGATGAGTACATACAAACTCGTATGGATAAAGTTCAAATTAACTGCCTTCAATATGTTTGTGGAAATTCTATTGAATGCAGAAAATTGTTTCAGCAATATGGCCCTGTCTGTGACAACATATTGTCTGTAGTAAATAGTGTTGGTCAGAAAGAAGACATGGAACTTTTACACTTCTATTCTTCTACTAAACCAAAAGGTTTTGATACACCAGTTCTGAGTAATGTTAGTACTGGTGGTTTTAATATTTCACTTTTGTTAACACCACCTAGTAGTCCTAGAAGGCGTTCTTTTATAGAAGATTTGTTATTTACAAGTGTTGAAACAGTTGGGTTGCCAACTGATGCTGAATATAAAAAATGCACAGCGGGACCTTTGGGTACTCTTAAAGATCTTATCTGTGCTAGGGAATATAATGGTTTACTAGTGTTGCCTCCAATTATTACTGCGGATATGCAAACAATGTATACTGCTTCTTTAGTAGGAGCTATGGCTTTTGGTGGTATTACATCAGCTGCAGCTATACCTTTTGCTACACAGATTCAGGCAAGAATTAATCATCTTGGTATTACACAGTCTTTGTTACTGAAAAACCAAGAAAAGATTGCTGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGAAGCACTTCGCTAGCATTACAACAGGTTCAAGATGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTATGGAAACTATGAATTCTCTTAATAAGAATTTTGGTGCCATTTCCTCAGTCATTCAAGACATTTATGCGCAACTTGATGCAATTCAAGCAGATGCTCAAGTTGATCGTCTTATCACTGGTAGACTATCGTCTCTTTCAGTGCTAGCCTCTGTTAAGCAGTCTGAATACCTTAGAGTATCACAACAGCGTGAGTTGGCTACTCAAAAAATTAATGAGTGTGTCAAATCACAATCTACTAGGTATGGATTTTGTGGTAGTGGAAGACATGTTCTTTCGATACCACAAAATGCACCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACATATACTCCAGAGAGTTTTGTTAATGTCACAGCAATAGTTGGCTTTTGTGTAAACCCACCTAATGCTAGTCAGTATGCAATAGTACCTGTTAATGGTAGGGGTGTTTTTATACAAGTTAATGGCACATACTATATTACGTCACGTGACATGTATATGCCAAGAGATATTACAGCAGGAGATATAGTTACCTTGACTTCTTGTCAAGCAAACTATGTTAGTGTTAACAAAACCGTCATTACTACATTTGTGGATAACGATGATTTTGATTTTGAGGATGAATTGTCAAAATGGTGGAATGATACTAAGCATGAGCTACCAGACTTTGACGAATTCAACTACACAGTACCTGTACTTAATATTAGTAGTGAGATTGATCGTATTCAAGGTGTTATACAGGGTCTCAATGACTCTTTGATAGACCTCGAAACACTCTCAATTCTCAAAACTTACATTAAGTGGCCTTGGTATGTGTGGCTTGCCATAGCTTTTGCCATCATTATCTTCATCCTAATATTAGGTTGGGTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGCATTATTCCAATAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAGTCTTCTTACTACACGACTTTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus --
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