| Accession Number |
Protein Id |
Protein Description |
Protein Length |
Protein Sequence |
Nucleotide Id |
Nucleotide Description |
Nucleotide Length |
Nucleotide Sequence |
Source |
Class_virus |
Virus_name |
Host |
| DVSP42500002 |
AAL11030.1 |
outer capsid spike VP4 protein Porcine rotavirus. |
778 aa |
MASLIYRQLLTNSYTTDLSDEIEEIGSSKSQDVTINPGPFAQTGYAPVDWGLGETNDSTTVAPVLDGPYQPITFTPPIEYWALFAPNDKGVVAELTNNADMWLVIILVEPNVPQELRLYTLFGQQVNLTIENTSQTKWKFIDFRKRSQNDTYILENALLSETKLQAAMKYGGKLFTFTGDTPNAAPQEWGYTTNNYSAISIKSLCDFYIVPRLPRETCRNYINQGLPPMQNTRNVVSVALSARDVISQRVSINEDIVVSKASLWKEMQYNRDITIRFKFANQIIKSGGLGYKWSEISFKPANYQYTYTRNGEEITAHTTCSVNGVNNFSYNGGSLPTDFVISRYEVIKENSYVYIDYWDDSQAFRNMVYVRSLAADLNSVTCSGGSYSFALPLGNFPVMSGGAVSLHPSGVTLSTQFTDFVSLNSLRFRFRLAVEEPPFSITRTRVSRLYGLPAVNPNNAKDFYEIAGRFSLISLIPPNDDYQTPIMNSVTVRQDLERQLGELRNEFNALSQQIAMSQLIDLALLPLDMFSMFSGIKGTIDIAKSMATNVMKKFRKSNLANSVSALTESLSDAASSISRRSTIRTIGSSASAWTEVSTAVIDTTTATNSISTQTATITKRLRLKEMAIQTDGMNFDDISAAVLKTKIDKSTQIAPNTLPDIVTEASEKFIPNRAYRVMDNDEVFEAGTDGKFFAYRVETFEEIPFDVQKFADLITDSPVISAIIDFKTLKNLNDNYGITKQQAYNLLRSDPRVLREFINQENPIIRNRIENLIMQCRL |
AY050274.1 |
Porcine rotavirus outer capsid spike VP4 protein mRNA; complete cds |
2337bp |
ATGGCTTCGCTCATTTATAGACAATTGCTTACTAATTCATACACAACTGACTTATCTGATGAAATTGAAGAAATTGGATCATCAAAATCTCAGGACGTTACAATAAATCCAGGACCATTCGCTCAAACAGGATATGCACCAGTAGACTGGGGTCTTGGTGAAACAAATGACTCAACAACAGTTGCACCAGTATTAGATGGACCATACCAACCAATAACTTTTACTCCACCAATAGAATATTGGGCATTATTTGCCCCTAATGACAAAGGCGTAGTAGCTGAACTAACAAATAATGCAGACATGTGGCTAGTTATTATTTTAGTTGAACCAAACGTACCTCAAGAACTAAGATTATATACATTGTTCGGCCAACAGGTTAATTTAACAATTGAAAATACATCGCAAACAAAATGGAAATTCATTGATTTTAGGAAAAGAAGTCAAAATGATACTTACATCCTCGAGAATGCACTTTTATCAGAAACGAAATTGCAAGCTGCAATGAAATACGGAGGAAAGTTATTTACGTTTACTGGGGATACGCCGAATGCAGCTCCACAAGAATGGGGGTACACAACAAACAATTACAGTGCAATCAGCATAAAATCGTTATGCGATTTTTATATAGTACCACGTTTGCCACGAGAGACATGTAGAAATTACATTAATCAGGGACTCCCACCAATGCAAAACACGAGAAATGTAGTATCAGTTGCACTATCAGCTAGAGATGTTATATCACAGAGAGTAAGTATTAACGAAGATATTGTTGTATCAAAAGCTTCTTTATGGAAAGAGATGCAGTATAACAGAGACATTACAATTAGGTTTAAATTTGCTAATCAAATAATTAAGTCTGGAGGATTAGGTTATAAGTGGTCAGAAATATCCTTTAAACCAGCAAATTATCAATATACATACACTAGAAATGGAGAAGAAATTACAGCACATACTACATGTTCAGTCAATGGAGTAAATAATTTTAGCTACAATGGTGGTTCATTACCAACGGATTTCGTCATATCAAGATACGAAGTTATTAAAGAAAATTCATACGTATATATAGACTACTGGGATGACTCACAAGCATTTAGAAATATGGTATATGTGAGATCATTAGCGGCTGATTTGAATTCTGTCACTTGTAGTGGTGGTAGTTATAGTTTCGCGTTACCTTTAGGAAATTTTCCGGTTATGTCAGGAGGTGCTGTGTCACTGCATCCCTCTGGAGTAACATTATCAACACAATTTACAGATTTTGTATCTCTTAATTCGTTAAGGTTTAGATTCAGATTGGCAGTTGAAGAACCTCCATTCTCAATAACACGCACGCGAGTAAGTAGATTATACGGACTGCCAGCCGTAAATCCAAATAATGCTAAGGACTTTTATGAAATAGCAGGAAGATTCTCTTTAATATCATTAATACCGCCAAATGATGATTATCAAACGCCGATAATGAACTCTGTGACTGTTAGACAAGACCTTGAAAGACAACTTGGAGAGTTGCGTAATGAATTTAACGCGTTATCCCAACAAATTGCAATGTCACAATTAATAGATTTAGCATTATTGCCATTAGATATGTTCTCAATGTTTTCAGGAATCAAAGGTACTATAGATATCGCAAAATCTATGGCAACAAACGTAATGAAAAAATTTAGAAAATCAAATCTAGCTAATTCAGTATCAGCATTAACTGAATCATTATCTGACGCAGCATCGTCAATATCTAGAAGATCAACAATTAGAACAATTGGTTCTTCGGCGTCTGCATGGACAGAAGTTTCAACTGCGGTCATAGACACAACTACTGCAACTAATTCGATATCCACACAGACTGCTACAATTACTAAACGATTAAGATTGAAAGAAATGGCAATCCAAACTGATGGTATGAATTTCGATGACATCTCTGCTGCAGTGTTAAAAACGAAAATAGATAAATCAACACAAATCGCTCCAAATACATTACCAGATATTGTTACAGAGGCATCAGAGAAATTTATACCAAACAGAGCGTATAGAGTTATGGATAATGATGAGGTATTTGAGGCTGGGACAGATGGGAAATTTTTTGCATATCGAGTTGAAACATTTGAAGAAATACCTTTCGATGTGCAAAAATTCGCAGATCTAATTACTGACTCACCAGTTATTTCAGCAATAATAGATTTTAAAACACTCAAGAACCTAAATGATAATTATGGAATAACTAAGCAGCAAGCATATAATTTATTGCGATCTGATCCAAGAGTGTTACGTGAATTTATTAATCAAGAAAATCCAATAATACGCAATAGAATTGAGAATCTAATTATGCAATGTAGATTGTAA |
Porcine rotavirus |
rotavirus |
Porcine rotavirus |
-- |
| DVSP08800193 |
AAL14983.1 |
spike, partial Infectious bronchitis virus. |
279 aa |
ANLFGNNSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYEVVNVSKESSNAGTTGCTVGAIYWSKNFSAASVAMTAPQNGMSWSTEQFCTAHCNFTDFVVFVTHCYKSSHGSCPLTGLIPQNHIRISAMKNSSLFYNLTVAVTKYPRFKSLQCVNNMTSVYLNGDLVFTSNETKDVSAAGVHFKAGGPITYKVMREVKALAYFVNGTAQDVILCDGSPTGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKEKFIVYRESSVNTTLELPNFTFSNVSNATPNTGGVQTIQLYQT |
AF420320.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate 722/95 spike gene; partial cds |
838bp |
GCCAATCTGTTTGGTAATAATTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGTGGTGCTTATGAAGTAGTAAATGTTTCTAAGGAATCTAGTAATGCAGGCACGACTGGGTGTACTGTCGGTGCTATTTATTGGAGTAAGAATTTCAGTGCTGCTTCCGTGGCTATGACAGCACCTCAAAATGGTATGTCATGGTCTACTGAGCAATTTTGTACGGCTCACTGCAATTTTACTGATTTTGTAGTATTTGTTACACATTGCTATAAAAGTAGTCATGGTTCATGTCCTTTAACAGGTCTGATTCCACAGAATCATATTCGTATTTCTGCTATGAAAAATAGCAGTTTGTTTTATAACTTAACAGTTGCTGTGACTAAATATCCTAGATTTAAGTCGCTTCAGTGTGTTAATAATATGACATCTGTATACCTAAATGGCGATCTCGTTTTTACTTCTAACGAGACTAAAGATGTTAGTGCTGCAGGTGTTCATTTTAAAGCTGGTGGCCCTATAACTTATAAAGTTATGCGGGAAGTTAAAGCATTGGCTTATTTTGTTAATGGCACCGCACAAGATGTGATTCTTTGTGACGGTTCACCTACAGGTTTATTAGCATGTCAGTATAATACTGGTAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGGAAAAGTTTATTGTTTATCGTGAAAGTAGTGTTAACACTACTTTGGAGTTACCTAATTTCACTTTTTCTAATGTAAGTAATGCTACCCCTAACACAGGGGGTGTCCAGACCATACAATTATATCAAACCA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800194 |
AAL14984.1 |
spike, partial Infectious bronchitis virus. |
278 aa |
AALYDSSSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSSGCTVGIIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQNSIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYSTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNETTDVTSAGVYFKGGGPITYKVMREVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHNFTFHNETGANPNPSGVQNIQTYQT |
AF420321.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate 748/95 spike gene; partial cds |
837bp |
GAGCTGCTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGTTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGGGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGAATTCTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTCTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACTCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGAGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGGTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACAATTTCACTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCTAATCCTAGTGGTGTTCAGAATATTCAAACTTACCAAACAC |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800195 |
AAL14985.1 |
spike, partial Infectious bronchitis virus. |
279 aa |
AALYDSSSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSSGCTVGIIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQHSIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYPTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNATTDVTSAGVYFKAGGPITYKVMREVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHNFTFHNETGANPNPSGVQNIQTYQTQ |
AF420322.1 |
Avian infectious bronchitis virus spike gene; partial cds |
839bp |
GTGCTGCTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGTTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGGGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGCATTCTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTCTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGCGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACAATTTCACTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCAAATCCTAGTGGTGTCCAGAATATTCAAACTTACCAAACACAA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800196 |
AAL14986.1 |
spike, partial Infectious bronchitis virus. |
242 aa |
AALYDSSSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSSECTVGIIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQHSIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYPNFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVHTSNATTDVTSAGVYFKAGGPITYKVMREVRALAYFXNGTAQDVILCDGSLKGLLACQYNTGNFSDGLYPFTNSSLVKQKFIVYR |
AF420323.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate 423/97 spike gene; partial cds |
730bp |
GTGCTGCTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGTTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGAGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGCATTCTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTCTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTAATTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGAGATCTTGTTCACACCTCTAATGCGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGWTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACTTAAAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCCTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800197 |
AAL14987.1 |
spike, partial Infectious bronchitis virus. |
252 aa |
AALYDSSSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSSECTVGIIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQDSIRVSAVKNGQLFYNLTVSVAKYPTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNATTDVTSAGVYFKAGGPITYKVMREVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTL |
AF420324.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate 422/97 spike gene; partial cds |
760bp |
GTGCTGCTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGTTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGAGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGGATTCTATACGTGTTTCTGCTGTAAAAAATGGCCAGCTTTTCTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGCGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCTATMACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800198 |
AAL14988.1 |
spike, partial Infectious bronchitis virus. |
278 aa |
AALYDSSSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSSGCTVGIIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQHSIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYPTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNATTDVTSAGVYFKAGGPITYKVMREVKALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHNFTFHNETGANPNPSGVQNIQTYQT |
AF420325.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate 50/98 spike gene; partial cds |
838bp |
GTGCTGCTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGTTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGGGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGCATTCTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTCTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGCGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAAAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACAATTTCACTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCAAATCCTAGTGGTGTCCAGAATATTCAAACTTACCAAACACA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800199 |
AAL14989.1 |
spike, partial Infectious bronchitis virus. |
279 aa |
AALYDSSSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSSGCTVGIIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQHSIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYPTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNATTDVTSAGVYFKAGGPITYKVMREVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHNFTFHNETGANPNPSGVQNIQTYQTQ |
AF420326.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate 1120/97 spike gene; partial cds |
840bp |
GAGCTGCTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGTTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGGGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGCATTCTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTCTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGCGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACAATTTCACTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCAAATCCTAGTGGTGTCCAGAATATTCAAACTTACCAAACACAAC |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800200 |
AAL14990.1 |
spike, partial Infectious bronchitis virus. |
279 aa |
AALYDSSSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSSGCTVGIIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQHSIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYPTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNATTDVTSAGVYFKAGGPITYKVMREVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHNFTFHNETGANPNPSGVQNIQTYQTT |
AF420327.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate 1097/97 spike gene; partial cds |
840bp |
GAGCTGCTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGTTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGGGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGCATTCTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTCTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGCGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACAATTTCACTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCAAATCCTAGTGGTGTCCAGAATATTCAAACTTACCAAACAACAC |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800201 |
AAL14991.1 |
spike, partial Infectious bronchitis virus. |
269 aa |
DSSSYVCYYNLAFRPPDGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSSGCTVGIIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQHSIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYPTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNATTDVTSAGVYFKAGGPITYKVMEEVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHNFTFHNETGANPDSFGVHYV |
AF420328.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate 1106/97 spike gene; partial cds |
806bp |
GACAGCAGCTCTTACGTGTGCTATTATAATTTAGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGTTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGGGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGCATTCTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTCTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGCGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGGAAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACAATTTCACTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCTGACTCTTTTGGTGTGCACTATGT |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800202 |
AAL14992.1 |
spike, partial Infectious bronchitis virus. |
278 aa |
AALYDSSSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSSGCTVGIIHGGRVGNASSIAMTAPSPGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQNSIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYSTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNETTDVTSAGVYFKGGGPITYKVMREVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHNFTFHNETGANPNPSGVQNIQTYQT |
AF420329.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate 397/97 spike gene; partial cds |
836bp |
GAGCTGCTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGTTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGGGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGGTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCACCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGAATTCTATACGGGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTCTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACTCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGAGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGGTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACAATTTCACTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCTAATCCTAGTGGTGTTCAGAATATTCAAACTTACCAAACC |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800203 |
AAL14993.1 |
spike, partial Infectious bronchitis virus. |
279 aa |
AALYDSSSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSSGCTVGIIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQHSIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYPTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNATTDVTSAGVYFKAGGPITYKVMREVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHNFTFHNETGANPNPSGVQNIQTYQTQ |
AF420330.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate 1096/97 spike gene; partial cds |
839bp |
GTGCTGCTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGTTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGGGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGCATTCTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTCTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGCGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACAATTTCACTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCAAATCCTAGTGGTGTCCAGAATATTCAAACTTACCAAACACAA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800204 |
AAL23951.1 |
spike glycoprotein S-1 subunit, partial Infectious bronchitis |
189 aa |
VVNETDLTYNTPNCIVGTIAGGVFLNASAISFATKTPISWSSQGVCTAFCNYTNFYIFVTHCGGTGHKSCIVNENRIGVIVLGVKDYSNKWVYNRTIHTTGPYRNFVSWQCLSNFTSVFLNGNLVYSSNYTDDVSFAGVYAKKVNGLKRRIMEEVEVLAYFINGTVQDVIICDDSPKGRLACQYNTGIR |
AF425648.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate CA/603/01 spike glycoprotein S-1 subunit gene; partial cds |
569bp |
GTGGTTAATGAAACTGACCTAACTTATAATACTCCTAATTGCATAGTGGGTACAATAGCGGGTGGTGTTTTTTTAAATGCAAGTGCTATATCATTTGCTACGAAAACACCAATTTCTTGGTCATCCCAAGGTGTTTGTACGGCATTTTGCAATTATACTAACTTTTATATTTTTGTAACTCATTGTGGAGGCACAGGACATAAAAGTTGCATTGTTAATGAAAATAGAATTGGTGTGATTGTTTTAGGTGTTAAAGACTATAGTAATAAGTGGGTTTATAATCGCACTATACATACTACTGGCCCTTATAGGAATTTTGTTTCCTGGCAGTGTCTTAGTAATTTTACTAGTGTGTTTTTAAATGGTAATCTCGTGTATAGTTCTAACTATACGGACGATGTTTCATTTGCTGGTGTGTATGCTAAAAAAGTCAACGGCTTAAAACGTAGAATTATGGAAGAAGTTGAAGTTTTGGCATATTTTATAAATGGTACTGTCCAAGATGTCATTATTTGCGATGACAGCCCTAAAGGTAGATTAGCATGCCAATACAACACCGGAATTCGAGA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP18900008 |
AAL25818.1 |
spike glycoprotein precursor Zaire ebolavirus. |
676 aa |
MGVTGILQLPRDRFKRTSFFLWVIILFQRTFSIPLGVIHNSTLQVSDVDKLVCRDKLSSTNQLRSVGLNLEGNGVATDVPSATKRWGFRSGVPPKVVNYEAGEWAENCYNLEIKKPDGSECLPAAPDGIRGFPRCRYVHKVSGTGPCAGDFAFHKEGAFFLYDRLASTVIYRGTTFAEGVVAFLILPQAKKDFFSSHPLREPVNATEDPSSGYYSTTIKYQATGFGTNETEYLFEVDNLTYVQLESRFTPQFLLQLNETIYTSGKRSNTTGKLIWKVNPEIDTTIGEWAFWETKKNLTRKIRSEELSFTAVSNRAKNISGQSPARTSSDPGTNTTTEDHKIMASENSSAMVQVHSQGREAAVSHLTTPATISTSLQPPTTKPGPDNSTHNTPVYKLDISEATQVEQHHRRTDNASTTSDTPPATTAAGPLKAENTNTSKGTDLLDPATTTSPQNHSETAGNNNTHHQDTGEESTSSGKLGLITNTIAGVAGLITGGRRTRREAIVNAQPKCNPNLHYWTTQDEGAAIGLAWIPYFGPAAEGIYTEGLMHNQDGLICGLRQLANETTQALQLFLRATTELRTFSILNRKAIDFLLQRWGGTCHILGPDCCIEPHDWTKNITDKIDQIIHDFVDKTLPDQGDNDNWWTGWRQWIPAGIGVTGVIIAVIALFCICKFVF |
AY058898.1 |
Zaire Ebola virus spike glycoprotein precursor (GP) mRNA; partial cds |
2031bp |
ATGGGTGTTACAGGAATATTGCAGTTACCTCGTGATCGATTCAAGAGGACATCATTCTTTCTTTGGGTAATTATCCTTTTCCAAAGAACATTTTCCATCCCACTTGGAGTCATCCACAATAGCACATTACAGGTTAGTGATGTCGACAAACTGGTTTGCCGTGACAAACTGTCATCCACGAATCAATTGAGATCAGTTGGACTGAATCTCGAAGGGAATGGAGTGGCAACTGACGTGCCATCTGCAACTAAAAGATGGGGCTTCAGGTCCGGTGTCCCACCAAAAGTGGTCAATTATGAAGCTGGTGAATGGGCTGAAAACTGCTACAATCTTGAAATCAAAAAACCTGACGGGAGTGAGTGTCTACCAGCAGCGCCAGACGGGATTCGGGGCTTCCCCCGGTGCCGGTATGTGCACAAAGTATCAGGAACGGGACCGTGTGCCGGAGACTTTGCCTTCCACAAAGAGGGTGCTTTCTTCCTGTATGATCGACTTGCTTCCACAGTTATCTACCGAGGAACGACTTTCGCTGAAGGTGTCGTGGCATTTCTGATACTGCCCCAAGCTAAGAAGGACTTCTTCAGCTCACACCCTTTGAGAGAGCCGGTCAATGCAACGGAGGACCCGTCTAGTGGCTACTATTCTACCACAATTAAATATCAGGCTACCGGCTTTGGAACCAATGAGACAGAGTATTTGTTCGAGGTTGACAATTTGACCTACGTCCAACTTGAATCAAGATTCACACCACAGTTTCTGCTCCAGCTGAATGAGACAATATATACAAGTGGGAAAAGGAGCAATACCACGGGAAAACTAATTTGGAAGGTCAACCCCGAAATTGATACAACAATCGGGGAGTGGGCCTTCTGGGAAACTAAAAAAAACCTCACTAGAAAAATTCGCAGTGAAGAGTTGTCTTTCACAGCTGTATCAAACAGAGCCAAAAACATCAGTGGTCAGAGTCCGGCGCGAACTTCTTCCGACCCAGGGACCAACACAACAACTGAAGACCACAAAATCATGGCTTCAGAAAATTCCTCTGCAATGGTTCAAGTGCACAGTCAAGGAAGGGAAGCTGCAGTGTCGCATCTGACAACCCCTGCCACAATCTCCACGAGTCTTCAACCCCCCACAACCAAACCAGGTCCGGACAACAGCACCCACAATACACCCGTGTATAAACTTGACATCTCTGAGGCAACTCAAGTTGAACAACATCACCGCAGAACAGACAACGCCAGCACAACCTCCGACACTCCCCCCGCCACGACCGCAGCCGGACCCCTAAAAGCAGAGAACACCAACACGAGCAAGGGCACTGACCTCCTGGACCCCGCCACCACAACAAGTCCCCAAAACCACAGCGAGACCGCTGGCAACAACAACACTCATCACCAAGATACCGGAGAAGAGAGTACCAGCAGCGGGAAGCTAGGCTTAATTACCAATACTATTGCTGGAGTCGCAGGACTGATCACAGGCGGGAGAAGAACTCGAAGAGAAGCAATTGTCAATGCTCAACCCAAATGCAACCCTAATTTACATTACTGGACTACTCAGGATGAAGGTGCTGCAATCGGACTGGCCTGGATACCATATTTCGGGCCAGCAGCCGAGGGAATTTACACAGAGGGGCTGATGCACAATCAAGATGGTTTAATCTGTGGGTTGAGACAGCTGGCCAACGAGACGACTCAAGCTCTTCAACTATTCCTGAGAGCCACAACCGAGCTACGCACCTTTTCAATCCTCAACCGTAAGGCAATTGATTTCTTGCTGCAGCGATGGGGCGGCACATGCCACATTTTGGGACCGGACTGCTGTATCGAACCACATGATTGGACTAAGAACATAACGGACAAAATTGATCAGATTATTCATGATTTTGTTGATAAAACCCTTCCGGACCAGGGGGACAATGACAATTGGTGGACAGGATGGAGACAGTGGATACCGGCAGGTATTGGAGTTACAGGCGTTATAATTGCAGTTATCGCTTTATTCTGTATATGCAAATTTGTCTTTTAG |
Zaire ebolavirus |
ebolavirus |
Zaire ebolavirus |
-- |
| DVSP04200029 |
AAL40400.1 |
spike glycoprotein Bovine coronavirus. |
1363 aa |
MFLILLISLPMAFAVIGDLKCTTVSINDVDTGAPSISTDIVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLLLNGYYPTSGSTYRNMALKGTLLLSRLWFKPPFLSDFINGIFAKVKNTKVIKKGVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPHTTNLDNKLQGLLEISVCQYTMCEYPHTICHPKLGNKRVELWHWDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGTVLSHYYVLPLTCSSAMTLEYWVTPLTSKQYLLAFNQDGVIFNAVDCKSDFMSEIKCKTLSIAPSTGVYELNGYTVQPIADVYRRIPNLPDCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNRRFGFTEQFVFKPQPVGVFTHHDVVYAQHCFKAPKNFCPCKLDGSLCVGNGPGIDAGYKNSGIGTCPAGTNYLTCHNAAQCDCLCTPDPITSKSTGPYKCPQTKYLVGIGEHCSGLAIKSDYCGGNPCTCQPQAFLGWSVDSCLQGDRCNIFANFIFHDVNSGTTCSTDLQKSNTDIILGVCVNYDLYGITGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYLTNRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNTLSRQLQPINYFDSYLGCVVNADNSTSSVVQTCDLTVGSGYCVDYSTKRRSRRAITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMEEFIQTSSPKVTIDCSAFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVLGCLGSACNKVSSRSAIEDLLFSKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYNGIKVLPPLLSVNQISGYTLAATSASLFPPLSAAVGVPFYLNVQYRINGIGVTMDVLSQNQKLIANAFNNALDAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISSSLQEILSRLDALEAQAQIDRLINGRLTALNVYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTAKVSPGLCIAGDRGIAPKSGYFVNVNNTWMFTGSGYYYPEPITGNNVVVMSTCAVNYTKAPDVMLNISTPNLHDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQDEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLIGFAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKICGGCCDDYTGHQELVIKTSHDD |
AF220295.1 |
Bovine coronavirus strain Quebec; complete genome |
4092bp |
ATGTTTTTGATACTTTTAATTTCCTTACCAATGGCTTTTGCTGTTATAGGAGATTTAAAGTGTACTACGGTTTCCATTAATGATGTTGACACCGGTGCTCCCTCTATTAGCACTGATATTGTCGATGTTACTAATGGTTTAGGTACTTATTATGTTTTAGATCGTGTGTATTTAAATACTACGTTGTTGCTTAATGGTTACTACCCTACTTCAGGTTCTACATATCGTAATATGGCACTGAAGGGAACTTTACTATTGAGCAGACTATGGTTTAAACCACCTTTTCTTTCTGATTTTATTAATGGTATTTTTGCTAAGGTCAAAAATACCAAGGTTATTAAAAAGGGTGTAATGTATAGTGAGTTTCCTGCTATAACTATAGGTAGTACTTTTGTAAATACATCCTATAGTGTGGTAGTACAACCACATACTACCAATTTGGATAATAAATTACAAGGTCTCTTAGAGATCTCTGTTTGCCAGTATACTATGTGCGAGTACCCACATACGATTTGTCATCCTAAGCTGGGTAATAAACGCGTAGAACTATGGCATTGGGATACAGGTGTTGTTTCCTGTTTATATAAGCGTAATTTCACATATGATGTGAATGCTGATTACTTGTATTTCCATTTTTATCAAGAAGGTGGTACTTTTTATGCATATTTTACAGACACTGGTGTTGTTACTAAGTTTCTGTTTAATGTTTATTTAGGCACGGTGCTTTCACATTATTATGTCCTGCCTTTGACTTGTTCTAGTGCTATGACTTTAGAATATTGGGTTACACCTCTCACTTCTAAACAATATTTACTAGCTTTCAATCAAGATGGTGTTATTTTTAATGCTGTTGATTGTAAGAGTGATTTTATGAGTGAGATTAAGTGTAAAACACTATCTATAGCACCATCTACTGGTGTTTATGAATTAAACGGTTACACTGTTCAGCCAATTGCAGATGTTTACCGACGTATACCTAATCTTCCCGATTGTAATATAGAGGCTTGGCTTAATGATAAGTCGGTGCCCTCTCCATTAAATTGGGAACGTAAGACCTTTTCAAATTGTAATTTTAATATGAGCAGCCTGATGTCTTTTATTCAGGCAGACTCATTTACTTGTAATAATATTGATGCTGCTAAGATATATGGTATGTGTTTTTCCAGCATAACTATAGATAAGTTTGCTATACCCAATGGTAGGAAGGTTGACCTACAATTGGGCAATTTGGGCTATTTGCAGTCTTTTAACTATAGAATTGATACTACTGCTACAAGTTGTCAGTTGTATTATAATTTACCTGCTGCTAATGTTTCTGTTAGCAGGTTTAATCCTTCTACTTGGAATAGGAGATTTGGTTTTACAGAACAATTTGTTTTTAAGCCTCAACCTGTAGGTGTTTTTACTCATCATGATGTTGTTTATGCACAACATTGTTTTAAAGCTCCCAAAAATTTCTGTCCGTGTAAATTGGATGGGTCTTTGTGTGTAGGTAATGGTCCTGGTATAGATGCTGGTTATAAAAATAGTGGTATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGCCATAATGCTGCCCAATGTGATTGTTTGTGCACTCCCGACCCCATTACATCTAAATCTACAGGGCCTTACAAGTGCCCCCAAACTAAATACTTAGTTGGCATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCTTGCTATTAAAAGTGATTATTGTGGAGGTAATCCTTGTACTTGCCAACCACAAGCATTTTTGGGTTGGTCTGTTGACTCTTGTTTACAAGGGGATAGGTGTAATATTTTTGCTAATTTTATTTTTCATGATGTTAATAGTGGTACTACTTGTTCTACTGATTTACAAAAATCAAACACAGACATAATTCTTGGTGTTTGTGTTAATTATGATCTTTATGGTATTACAGGCCAAGGTATTTTTGTTGAGGTTAATGCGACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTTTTATATGATTCTAATGGTAATCTCTATGGTTTTAGAGACTACTTAACAAACAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGCTATAGCGGTCGTGTTTCAGCGGCCTTTCATGCTAACTCTTCCGAACCAGCATTGCTATTTCGGAATATTAAATGCAATTACGTTTTTAATAATACTCTTTCACGACAGCTGCAACCTATTAACTATTTTGATAGTTATCTTGGTTGTGTTGTCAATGCTGATAATAGTACTTCTAGTGTTGTTCAAACATGTGATCTCACAGTAGGTAGTGGTTACTGTGTGGATTACTCTACAAAAAGACGAAGTCGTAGAGCGATTACCACTGGTTATCGGTTTACTAATTTTGAGCCATTTACTGTTAATTCAGTAAATGATAGTTTAGAACCTGTAGGTGGTTTGTATGAAATTCAAATACCTTCAGAGTTTACTATAGGTAATATGGAGGAGTTTATTCAAACAAGCTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTTCTGCTTTTGTCTGTGGTGATTATGCAGCATGTAAATCACAGTTGGTTGAATATGGTAGCTTCTGTGACAATATTAATGCTATACTCACAGAAGTAAATGAACTACTTGACACTACACAGTTGCAAGTAGCTAATAGTTTAATGAATGGTGTCACTCTTAGCACTAAGCTTAAAGATGGCGTTAATTTCAATGTAGACGACATCAATTTTTCCCCTGTATTAGGTTGTTTAGGAAGCGCTTGTAATAAAGTTTCCAGCAGATCTGCTATAGAGGATTTACTTTTTTCTAAAGTAAAGTTATCTGATGTCGGTTTCGTTGAGGCTTATAATAATTGTACTGGAGGTGCCGAAATTAGGGACCTCATTTGTGTGCAAAGTTATAATGGTATCAAAGTGTTGCCTCCACTGCTCTCAGTAAATCAGATCAGTGGATACACTTTGGCTGCCACCTCTGCTAGTCTGTTTCCTCCTTTGTCAGCAGCAGTAGGTGTACCATTTTATTTAAATGTTCAGTATCGTATTAATGGGATTGGTGTTACCATGGATGTGTTAAGTCAAAATCAAAAGCTTATTGCTAATGCATTTAACAATGCTCTTGATGCTATTCAGGAAGGGTTTGATGCTACCAATTCTGCTTTAGTTAAAATTCAAGCTGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCTCTTAATAACTTATTGCAACAACTCTCTAATAGATTTGGTGCTATAAGTTCTTCTTTACAAGAAATTCTATCTAGACTGGATGCTCTTGAAGCGCAAGCTCAGATAGACAGACTTATTAATGGGCGTCTTACCGCTCTTAATGTTTATGTTTCTCAACAGCTTAGTGATTCTACACTAGTAAAATTTAGTGCAGCACAAGCTATGGAGAAGGTTAATGAATGTGTCAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTTTGTGGTAATGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCATATGGTTTGTATTTTATCCACTTTAGCTATGTCCCTACTAAGTATGTCACTGCGAAGGTTAGTCCCGGTCTGTGCATTGCTGGTGATAGAGGTATAGCCCCTAAGAGTGGTTATTTTGTTAATGTAAATAATACTTGGATGTTCACTGGTAGTGGTTATTACTACCCTGAACCCATAACTGGAAATAATGTTGTTGTTATGAGTACCTGTGCTGTTAACTATACTAAAGCGCCGGATGTAATGCTGAACATTTCAACACCCAACCTCCATGATTTTAAGGAAGAGTTGGATCAATGGTTTAAAAACCAAACATCAGTGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATAAATGTTACATTCTTGGACCTACAAGATGAAATGAATAGGTTACAGGAGGCAATAAAAGTTTTAAATCAGAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACATATGAGTATTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATTGGCTTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGTTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGTTTTAAGATATGTGGTGGTTGTTGTGATGATTATACTGGACACCAGGAGTTAGTAATTAAAACATCACATGACGACTAA |
Bovine coronavirus |
Coronaviridae |
Bovine coronavirus |
-- |
| DVSP08800205 |
AAL56654.1 |
spike glycoprotein S1 subunit, partial Infectious bronchitis |
302 aa |
MLVTPRLLVTLLFALCSASLYDNHSYVYYYQSAFRPPNGWHIHGGAYAVVNTSIEYNNAGGRPRCTLGAIHWSKNFSASSAAMTAPLLGMEWSPNQFWRLHCNFSDLTVFVTHCLKDNACPSIGKIPGGYIGIYAMRARNLYYDLTVSVTKYRKFHSFQCVNNQTSVYLNGDLVFTCNQTTDVTGAGVHFKAGGPITYKVMRQTKALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNNTIVQDKFIVYRETSINTTFNLTNFTFVNDTFASPNSGGVSTIKTYQTQTAQSGY |
AF218850.1 |
Avian infectious bronchitis virus strain JF28 spike glycoprotein S1 subunit gene; partial cds |
908bp |
ATGTTGGTAACACCTCGTTTATTAGTGACTCTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCTTCTTTGTATGACAATCATTCTTATGTGTACTACTATCAAAGTGCTTTTAGGCCACCTAATGGCTGGCACATACACGGTGGTGCCTATGCAGTAGTTAATACTTCTATAGAATATAACAATGCAGGTGGACGACCTAGGTGCACTCTTGGTGCTATTCATTGGAGTAAAAATTTTAGTGCCTCTTCCGCTGCAATGACTGCACCGTTATTGGGTATGGAGTGGTCTCCTAATCAGTTTTGGCGGCTCCACTGTAATTTTAGTGATCTTACAGTGTTTGTTACACATTGTTTAAAAGATAATGCATGTCCTTCAATAGGTAAGATTCCAGGCGGTTATATTGGTATTTATGCTATGAGGGCTAGAAATTTATATTATGATTTAACAGTTTCTGTTACTAAGTATCGTAAATTTCATTCGTTTCAATGCGTTAATAACCAAACATCTGTATATCTGAATGGTGATCTTGTTTTTACCTGTAATCAGACTACAGATGTTACTGGTGCAGGTGTCCATTTTAAAGCTGGTGGACCCATAACTTATAAAGTTATGAGACAAACTAAAGCTTTGGCCTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTCTTTGTGATGGTTCACCTAGAGGTTTGTTAGCATGTCAGTATAATACTGGTAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAATACCATTGTCCAGGATAAGTTTATTGTTTATCGTGAAACTAGTATTAATACCACTTTTAACTTAACTAATTTCACGTTTGTTAATGATACTTTCGCTAGTCCTAATAGTGGTGGTGTCTCTACTATTAAAACTTACCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800206 |
AAL56655.1 |
spike glycoprotein S1 subunit, partial Infectious bronchitis |
537 aa |
MLVTPPLLVTLLFALCSASLYDNHSYVYYYQSAFRPPNGWHIHGGAYAVVNTSIEYNNAGGRPRCTLGAIHWSKNFSASSVAMTAPVIGMEWSANQFCTAHCNFSDLTVFVTHCFKDNACPLIGKIPDGYIVIYPMRARNLYYNLTVSVTNYRKFHSFQCVNNQTSVYLNGDLVFTSNQTTDVTGAGVRFKAGGPITYKVMRQTKALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNNTIVKDKFIVYRETSINTTLNLTNFTFVNETNASPNSGGVSTIKTYQTQTAQSGYYNFNLSFLSSFVYKESNFMYGSYHPKCNFRPENINNGLWFNSLSVSIAYGPLHGGCKQSVFKGRATCCYAYSYKGPNLCKGVYSGELKNNFECGLLVYVTKSDGSRIQTATEPPVITQYNYNNITLDTCVDYNIYGRTGQGFITNVTDSAVSYNYLADAGLAILDTSGAIDIFVVQGRYGPNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQFLENQFYIKITNGTRRSRR |
AF218851.1 |
Avian infectious bronchitis virus strain JF24 spike glycoprotein S1 subunit gene; partial cds |
1611bp |
ATGTTGGTAACACCTCCTTTATTAGTGACTCTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCTTCTTTGTATGACAATCATTCTTATGTGTACTACTATCAAAGTGCTTTTAGGCCACCTAATGGCTGGCACATACACGGTGGTGCCTATGCAGTAGTTAATACTTCTATAGAATATAACAATGCAGGTGGACGACCTAGGTGCACTCTTGGTGCTATTCATTGGAGTAAAAATTTTAGTGCCTCTTCCGTTGCAATGACTGCACCAGTTATTGGTATGGAGTGGTCTGCTAATCAGTTTTGTACGGCTCACTGTAATTTTAGTGATCTTACAGTGTTTGTTACACATTGTTTTAAAGATAATGCATGTCCTCTAATTGGTAAGATTCCAGACGGTTATATTGTAATTTATCCTATGAGGGCTAGAAATTTATATTATAATTTAACAGTTTCTGTTACTAATTATCGTAAATTTCATTCGTTTCAATGCGTTAATAACCAAACATCTGTATATCTGAATGGTGATCTTGTTTTTACTTCTAATCAGACTACAGATGTTACTGGTGCAGGTGTCCGTTTTAAAGCTGGTGGACCCATAACTTATAAAGTTATGAGACAAACTAAAGCTTTGGCCTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTCTTTGTGATGGTTCACCTAGAGGTTTGTTAGCATGTCAGTATAATACTGGTAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAATACCATTGTCAAGGATAAGTTTATTGTTTATCGTGAAACTAGTATTAACACCACTTTAAACTTAACTAATTTCACGTTTGTTAATGAAACTAACGCTAGTCCTAATAGTGGTGGTGTCTCTACTATTAAAACTTACCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATCTTTCCTTTCTGAGTAGTTTTGTTTATAAGGAGTCTAATTTTATGTATGGATCTTATCATCCAAAGTGTAATTTTAGACCAGAAAATATTAATAATGGTTTGTGGTTTAATTCACTTTCAGTTTCAATTGCTTACGGTCCTCTTCACGGTGGCTGCAAGCAATCTGTCTTTAAAGGTAGAGCAACTTGTTGTTATGCTTACTCATATAAAGGTCCTAATTTGTGTAAAGGTGTTTATTCAGGTGAGTTAAAAAATAATTTTGAATGTGGACTGTTAGTTTATGTTACTAAGAGCGATGGCTCTCGTATACAAACTGCCACTGAACCGCCAGTTATAACTCAATATAATTATAATAATATTACTTTAGATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAACTGGCCAAGGTTTTATTACTAATGTAACCGACTCAGCTGTTAGTTATAATTATCTAGCAGACGCAGGTTTGGCTATTTTAGATACTTCTGGTGCCATAGACATCTTCGTTGTACAAGGTCGATATGGCCCTAACTATTATAAGGTTAATCCATGTGAAGATGTGAACCAACAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTCACTTCACGTAATGAGACTGGTTCTCAGTTTCTTGAGAACCAGTTTTATATTAAAATCACTAATGGAACTCGTCGTTCTAGACGT |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP08800207 |
AAL56656.1 |
spike glycoprotein S1 subunit, partial Infectious bronchitis |
543 aa |
MLVTRPLLVTLLCALCSAALYDDSYVYYYQSGFRPYDGWHLHGGAYAGVDVTTELNNAGNADTCTVGTILGSKNFSACFCGMTPPPSGMSWSPSQFCTAHCNFTDFTVFVTHCFKSGPETALLTALIEQGHIRISAMKTGVGSRPELFYNQTVSVDKYPKFKSLQCVNNHTSVYLNGDLVFTSNKTIDVSAAGVHFKAGGPIDYKVMREVKALAYFINGTAQEVILCDRSPRGLLACQYNTANFSDGFYPFTNSSLVKEKFIVYRENSVNTTLVLHNFTFHNETDAKPNTGGVSTIPIYQTQTAQSGYYNFNFSFLSGFSYQESNFMYGSYHPGCNFRPENINNGLWFNSLSVSIAYGPLQGGCKQSVFAGRTTCCYAYSYNGPSLCKGVYTGELKRDFQCGLLVYVTKSDGSLIQTATKPPVITQYNYNNITLNTCVDYNIYGRTGQGSITNVTESAVSYNYLADAGLAILDTSGAVDVFVVQGEYGLNYYKVNPCDDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQLLENQFYIKIINGTRRSRR |
AF218852.1 |
Avian infectious bronchitis virus strain JF39 spike glycoprotein S1 subunit gene; partial cds |
1629bp |
ATGTTGGTAACACGTCCTTTACTAGTGACTCTTTTGTGTGCACTATGTAGTGCTGCTTTGTATGATGATTCTTACGTTTACTACTATCAAAGTGGCTTTAGGCCATATGATGGTTGGCACTTACATGGGGGTGCTTATGCAGGAGTTGATGTTACTACAGAACTTAATAATGCAGGTAACGCGGATACTTGTACTGTTGGTACTATTCTTGGGAGTAAGAATTTTAGTGCTTGTTTCTGTGGCATGACGCCTCCACCAAGTGGTATGTCATGGTCTCCTAGCCAATTTTGCACAGCACACTGTAATTTCACAGATTTTACAGTGTTTGTTACACATTGTTTTAAATCTGGTCCTGAAACTGCCCTTTTAACAGCCCTTATAGAGCAAGGGCATATTCGTATATCTGCTATGAAAACAGGTGTCGGTTCTAGGCCCGAATTGTTTTATAACCAAACAGTTTCTGTGGATAAGTATCCTAAGTTTAAGTCTCTTCAATGTGTTAATAATCACACATCTGTATACCTAAATGGTGATCTTGTTTTTACTTCTAACAAGACAATAGATGTTAGTGCTGCAGGTGTTCATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAGATTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAAAGCCCTGGCTTATTTTATTAATGGTACCGCACAAGAGGTTATTTTGTGTGATCGATCACCTAGAGGTTTGTTAGCATGCCAGTATAACACTGCCAATTTCTCAGATGGTTTTTACCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAAGAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAACACTACTCTTGTATTACACAATTTTACTTTTCATAATGAGACTGATGCCAAGCCTAATACTGGTGGCGTTAGTACAATTCCAATTTACCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAACTTCTCTTTTCTGAGTGGGTTTTCTTATCAGGAGTCTAATTTTATGTATGGGTCTTACCACCCAGGTTGTAATTTTAGACCAGAAAATATTAATAATGGCTTGTGGTTTAATTCACTTTCAGTTTCAATTGCATACGGACCCCTTCAGGGTGGTTGTAAGCAATCTGTCTTTGCAGGTAGAACAACTTGTTGTTATGCTTATTCATATAATGGTCCTAGCTTGTGTAAAGGTGTTTATACAGGTGAGTTAAAAAGGGATTTTCAATGTGGACTGTTAGTTTATGTTACTAAGAGCGATGGCTCTCTTATACAAACAGCCACTAAACCGCCAGTTATAACTCAATACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAACTGGCCAAGGTTCTATTACTAATGTAACCGAATCAGCTGTTAGTTATAATTATCTAGCAGACGCAGGTTTGGCTATTTTAGATACATCTGGTGCCGTAGACGTCTTTGTTGTACAAGGTGAATATGGTCTTAATTATTATAAGGTTAACCCTTGCGACGATGTCAACCAGCAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACTTCACGTAATGAGACCGGTTCCCAGCTTCTTGAGAACCAGTTTTACATTAAAATCATTAATGGAACACGTCGTTCTAGGCGT |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP04200030 |
AAL57308.1 |
spike structural protein Bovine coronavirus. |
1363 aa |
MFLILLISLPTAFAVIGDLKCTTVSINDVDTGVPSISTDTVDVTKGLGTYYVLDRVYLNTTLLLNGYYPTSGSTYRNMALKGTLLLSTLWFKPPFLSDFTNGIFAKVKNTKVIKDGVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPHTTILGNKLQGFLEISVCQYTMCEYPNTICNPNLGNRRVELWHWDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGTVLSHYYVMPLTCNSALTLEYWVTPLTSKQYLLAFNQDGVIFNAVDCKSDFMSEIKCKTLSIAPSTGVYELNGYTVQPIADVYRRIPNLPDCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNRRFGFTEQSVFKPQPAGVFTDHDVVYAQHCFKAPTNFCPCKLDGSLCVGNGPGIDAGYKTSGIGTCPAGTNYLTCHNAAQCDCLCTPDPITSKATGPYKCPQTKYLVGIGEHCSGLAIKSDHCGGNPCTCQPQAFLGWSVDSCLQGDRCNIFANFILHDVNSGTTCSTDLQKSNTDIILGVCVNYDLYGITGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYLTNRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNTLSRQLQPINYFDSYLGCVVNADNSTSSVVQTCDLTVGSGYCVDYSTKRRSRRSITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMEEFIQTSSPKVTIDCSAFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVLGCLGSDCNKVSSRSAIEDLLFSKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYNGIKVLPPLLSENQISGYTLAATSASLFPPWSAAAGVPFYLNVQYRINGIGVTMDVLSQNQKLIANAFNNALGAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAETLNNLLQQLSNRFGAISSSLQEILSRLDALEAQAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTAKVSPGLCIAGGRGIAPKSGYFVNVNNTWMFTGSGYYYPEPITGNNVVVMSTCAVNYTKAPDVMLNISTPNLPDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQDEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLIGFAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGHQELVIKTSHED |
AF391542.1 |
Bovine coronavirus isolate BCoV-LUN; complete genome |
4092bp |
ATGTTTTTGATACTTTTAATTTCCTTACCAACGGCTTTTGCTGTTATAGGAGATTTAAAGTGTACTACAGTTTCCATTAATGATGTTGACACTGGTGTTCCTTCTATTAGCACTGATACTGTCGATGTTACTAAAGGTTTAGGTACTTATTATGTTTTAGATCGTGTGTATTTAAATACTACGTTGTTGCTTAATGGTTATTACCCTACTTCAGGTTCTACATATCGTAATATGGCACTGAAGGGAACTTTACTATTGAGCACACTGTGGTTTAAACCACCTTTTCTTTCTGATTTTACTAATGGTATTTTTGCTAAGGTCAAAAATACCAAGGTTATTAAAGATGGTGTAATGTATAGTGAGTTTCCTGCTATAACTATAGGTAGTACTTTTGTAAATACATCCTATAGTGTGGTAGTACAACCACATACTACCATTTTGGGTAATAAATTACAAGGTTTCTTAGAGATCTCTGTTTGCCAGTATACTATGTGCGAGTACCCAAATACGATTTGTAATCCTAATCTGGGTAATCGACGCGTAGAACTATGGCATTGGGATACAGGTGTTGTTTCCTGTTTATATAAGCGTAATTTCACATATGATGTGAATGCTGATTATTTGTATTTCCATTTTTATCAAGAAGGTGGTACTTTTTATGCATATTTTACAGACACTGGTGTCGTTACTAAGTTTCTGTTTAATGTTTATTTAGGCACGGTGCTCTCACATTATTATGTCATGCCTTTGACTTGTAATAGTGCTCTGACTTTAGAATATTGGGTTACACCCCTCACTTCTAAACAATATCTACTAGCTTTCAATCAAGATGGTGTTATTTTTAATGCTGTTGATTGTAAGAGTGATTTTATGAGTGAGATTAAGTGTAAAACACTATCTATAGCACCATCTACTGGTGTTTATGAATTAAACGGTTACACTGTTCAGCCAATTGCAGATGTTTACCGACGTATACCTAATCTTCCCGATTGCAATATTGAGGCTTGGCTTAATGATAAGTCGGTGCCCTCTCCATTAAATTGGGAACGTAAGACTTTTTCAAATTGTAATTTTAATATGAGCAGCCTGATGTCTTTTATTCAGGCAGACTCATTTACTTGTAATAATATTGATGCTGCTAAGATATATGGTATGTGTTTTTCCAGCATAACTATAGATAAGTTTGCAATACCCAATGGTAGGAAGGTTGACCTACAATTGGGTAATTTGGGTTATTTGCAGTCTTTTAACTATAGAATTGATACTACTGCTACAAGTTGTCAGTTGTATTATAATTTACCTGCTGCTAATGTTTCTGTTAGCAGGTTTAATCCTTCTACTTGGAATAGGAGATTTGGTTTTACAGAACAATCTGTTTTTAAGCCTCAACCTGCAGGTGTTTTTACTGATCATGATGTTGTTTATGCACAACATTGTTTTAAAGCTCCCACAAATTTCTGTCCGTGTAAATTGGATGGGTCTTTGTGTGTAGGTAATGGTCCTGGTATAGATGCTGGTTATAAAACTAGTGGCATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGCCATAATGCTGCCCAATGTGATTGTTTGTGCACTCCAGACCCCATTACATCTAAAGCTACAGGGCCTTACAAGTGCCCCCAAACTAAATATTTAGTTGGCATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCTTGCTATTAAAAGTGATCATTGTGGAGGTAACCCTTGTACTTGCCAACCACAAGCATTTTTGGGGTGGTCTGTTGACTCTTGTTTACAAGGGGATAGGTGTAATATTTTTGCTAATTTCATTTTGCATGATGTTAATAGTGGTACTACTTGTTCTACTGATTTACAAAAATCAAACACAGACATAATTCTTGGTGTTTGTGTTAATTATGATCTTTATGGTATTACTGGCCAAGGTATCTTTGTTGAGGTTAATGCGACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTTTTATATGATTCTAATGGTAATCTCTATGGTTTTAGAGACTACTTAACAAATAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGCTATAGTGGTCGTGTTTCAGCGGCCTTTCATGCTAACTCTTCCGAACCAGCATTGCTATTTCGGAATATTAAATGCAATTACGTTTTTAATAATACTCTTTCACGACAGCTGCAACCTATTAACTATTTTGATAGCTATCTTGGTTGTGTTGTCAATGCTGATAATAGTACTTCTAGTGTTGTTCAAACATGTGATCTCACAGTAGGTAGTGGTTACTGTGTGGATTACTCTACAAAAAGACGAAGTCGTAGATCGATTACCACTGGTTATCGGTTTACTAATTTTGAGCCATTTACTGTTAATTCAGTAAATGATAGCTTAGAACCTGTAGGTGGTTTGTACGAAATTCAAATACCTTCAGAGTTTACTATAGGTAATATGGAGGAGTTTATTCAAACAAGCTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTTCTGCTTTTGTCTGTGGTGATTATGCAGCATGTAAATCACAGTTGGTTGAATATGGTAGCTTCTGTGACAATATTAATGCTATACTCACAGAAGTAAATGAACTACTTGACACTACACAGTTGCAAGTAGCTAATAGTTTAATGAATGGTGTCACTCTTAGCACTAAGCTTAAAGATGGCGTTAATTTCAATGTAGACGACATCAATTTTTCCCCTGTATTAGGTTGTTTAGGAAGCGATTGTAATAAAGTTTCCAGTAGATCTGCTATAGAGGACTTACTTTTTTCTAAAGTAAAGTTATCTGATGTCGGTTTCGTTGAGGCTTATAATAATTGTACTGGAGGTGCCGAAATTAGGGACCTCATTTGTGTGCAAAGTTATAATGGTATCAAGGTGTTGCCTCCACTGCTCTCAGAAAATCAGATCAGTGGATACACTTTGGCTGCCACCTCTGCTAGCCTGTTTCCTCCATGGTCAGCAGCAGCAGGTGTACCATTCTATTTAAATGTTCAGTATCGTATTAATGGTATTGGTGTTACCATGGATGTGCTAAGTCAAAATCAAAAGCTTATTGCTAATGCATTTAACAATGCTCTTGGTGCTATTCAGGAAGGGTTTGATGCTACCAATTCTGCTTTAGTTAAAATTCAAGCTGTTGTTAATGCAAATGCTGAAACTCTTAATAACTTATTGCAACAACTCTCTAATAGATTTGGTGCTATAAGTTCTTCTTTACAAGAAATTCTATCTAGACTGGATGCTCTTGAAGCGCAAGCTCAGATAGACAGACTTATTAATGGGCGTCTTACCGCTCTTAATGCTTATGTTTCTCAACAGCTTAGTGACTCTACACTAGTAAAGTTTAGTGCAGCACAAGCTATGGAGAAGGTTAATGAATGTGTCAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTTTGTGGTAATGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCATATGGTTTGTATTTTATCCACTTTAGCTATGTCCCTACTAAGTATGTCACTGCGAAGGTTAGTCCCGGTCTGTGCATTGCTGGTGGTAGAGGTATAGCCCCTAAGAGTGGTTATTTTGTTAATGTAAATAACACTTGGATGTTCACTGGTAGTGGTTATTACTACCCTGAACCTATAACTGGAAATAATGTTGTTGTTATGAGTACCTGTGCTGTTAATTATACTAAAGCGCCGGATGTAATGCTGAACATTTCAACACCCAACCTCCCTGATTTTAAGGAAGAGTTGGATCAATGGTTTAAAAACCAAACTTCAGTGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATAAATGTTACATTCTTGGACCTACAAGATGAAATGAATAGGTTACAGGAGGCAATAAAAGTTTTAAATCAGAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACATATGAGTATTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATTGGCTTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGTTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGTTTTAAGAAATGTGGTGGTTGTTGTGATGATTATACTGGACACCAGGAGTTAGTAATTAAAACATCACATGAAGATTAA |
Bovine coronavirus |
Coronaviridae |
Bovine coronavirus |
-- |
| DVSP08800208 |
AAL69418.1 |
spike glycoprotein S-1 subunit, partial Infectious bronchitis |
152 aa |
AGECTAGAIVWSKNFSAASVAMTAPQSGMSWSVQQFCTAHCNFTNFVVFVTHCFKNGPNTCPLTGRIDQGYIRIAAMKNTGTGPRDLFYNSTVPVTKYPSFKSLQCVNNQTSVYLNGDLVFTSNETVDVSGAGVHFKAGGPITYKVMREVKA |
AF469167.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate CA/96/01 spike glycoprotein S-1 subunit gene; partial cds |
456bp |
GCAGGCGAGTGCACTGCTGGTGCAATTGTGTGGAGTAAGAATTTTAGTGCAGCTTCTGTAGCCATGACTGCACCACAGTCTGGTATGTCATGGTCTGTTCAACAATTTTGTACGGCTCACTGTAATTTTACTAATTTTGTAGTGTTTGTTACACATTGTTTTAAAAACGGACCTAATACGTGTCCTTTAACAGGCCGTATTGACCAGGGTTATATTCGTATTGCCGCTATGAAAAATACTGGTACTGGCCCTAGAGACCTATTTTATAACTCTACAGTTCCTGTGACTAAGTATCCTTCATTTAAATCACTTCAGTGTGTTAATAATCAAACATCTGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTTTACTTCTAATGAGACTGTAGATGTCTCAGGTGCAGGTGTTCATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAAAGCC |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
| DVSP11200001 |
AAL80031.1 |
spike glycoprotein Porcine hemagglutinating encephalomyelitis |
1349 aa |
MFFILLISLPSAFAVIGDLKCTTSLINDVDTGVPSISSEVVDVTNGLGTFYVLDRVYLNTTLLLNGYYPISGATFRNMALKGTRLLSTLWFKPPFLSPFNDGIFAKVKNSRFSKDGVIYSEFPAITIGSTFVNTSYSIVVEPHTSLINGNLQGLLQISVCQYTMCEYPHTICHPNLGNQRIELWHYDTDVVSCLYRRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGFVTKFLFKLYLGTVLSHYYVMPLTCNSALSLEYWVTPLTTRQFLLAFDQDGVLYHAVDCASDFMSEIMCKTSSITPPTGVYELNGYTVQPVATVYRRIPDLPNCDIEAWLNSKTVSSPLNWERKIFSNCNFNMGRLMSFIQADSFGCNNIDASRLYGMCFGSITIDKFAIPNSRKVDLQVGKSGYLQSFNYKIDTAVSSCQLYYSLPAANVSVTHYNPSSWNRRYGFNNQSFGSRGLHDAVYSQQCFNTPNTYCPCRTSQCIGGAGTGTCPVGTTVRKCFAAVTKATKCTCWCQPDPSTYKGVNAWTCPQSKVSIQPGQHCPGLGLVEDDCSGNPCTCKPQAFIGWSSETCLQNGRCNIFANFILNDVNSGTTCSTDLQQGNTIITTDVCVNYDLYGITGQGILIEVNATYYNSWQNLLYDSSGNLYGFRDYLSNRTFLIRSCYSGRVSAVFHANSSEPALMFRNLKCSHVFNNTILRQIQLVNYFDSYLGCVVNAYNNTASAVSTCDLTVGSGYCVDYVTALRSRRSFTTGYRFTNFEPFAANLVNDSIEPVGGLYEIQIPSEFTIGNLEEFIQTRSPKVTIDCATFVCGDYAACRQQLAEYGSFCENINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKIKDGINFNVDDINFSPVLGCLGSECNRASTRSAIEDLLFDKVKLSDVGFVQAYNNCTGGAEIRDLICVQSYNGIKVLPPLLSENQISGYTLAATAASLFPPWTAAAGVPFYLNVQYRINGLGVTMDVLSQNQKLIASAFNNALDAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISASLQEILSRLDALEAKAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAIEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTAKVSPGLCIAGDIGISPKSGYFINVNNSWMFTGSSYYYPEPITQNNVVVMSTCAVNYTKAPDLMLNTSTPNLPDFKEELYQWFKNQSSVAPDLSLDYINVTFLDLQDEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLIGLAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGHQEFVIKTSHDD |
AY078417.1 |
Porcine hemagglutinating encephalomyelitis virus hemagglutinin-esterase protein; spike glycoprotein; 4.9 kDa non-structural protein; 12.7 kDa non-structural protein; small envelope-associated protein; matrix glycoprotein; nucleocapsid protein; and N2 protein genes; complete cds |
4050bp |
ATGTTTTTTATACTTTTAATCTCCCTGCCTTCTGCTTTTGCAGTTATAGGGGATTTAAAGTGTACTACTTCATTAATTAATGACGTTGACACTGGTGTGCCATCTATTAGCTCTGAAGTTGTTGATGTCACTAATGGTTTGGGGACTTTCTATGTTTTAGATCGTGTCTATTTAAATACCACATTGTTGCTCAATGGTTATTACCCAATTTCAGGTGCTACATTTCGTAATATGGCTCTGAAAGGAACTCGATTATTGAGCACCTTGTGGTTTAAGCCGCCTTTTTTATCACCTTTTAATGATGGTATTTTTGCCAAGGTTAAAAACAGCAGATTTTCTAAAGATGGTGTTATTTATAGTGAGTTTCCTGCTATTACTATAGGTAGTACTTTTGTAAATACTTCCTATAGCATAGTAGTAGAGCCTCATACCTCACTTATTAATGGTAATTTACAAGGTTTGTTGCAAATTTCTGTTTGTCAATACACTATGTGTGAATACCCACATACTATTTGTCATCCTAATTTGGGTAATCAACGCATAGAATTATGGCATTATGACACAGATGTTGTTTCTTGTTTATACAGGCGTAATTTCACATATGATGTGAATGCTGATTATTTATATTTTCACTTTTATCAGGAAGGTGGCACTTTTTATGCATACTTTACAGATACTGGTTTTGTGACCAAGTTTCTGTTTAAGTTGTATTTAGGCACTGTGCTGTCACATTATTATGTTATGCCATTGACTTGTAATAGCGCTTTATCTTTAGAATACTGGGTTACACCTCTCACTACTAGACAATTTCTTCTAGCCTTTGACCAGGATGGTGTTTTATACCATGCTGTTGATTGTGCTAGTGATTTTATGAGTGAGATTATGTGTAAAACTTCTTCAATTACACCACCTACTGGTGTTTATGAACTAAACGGTTACACAGTTCAACCTGTTGCCACTGTATATCGTAGAATACCTGATTTACCCAATTGCGATATCGAAGCTTGGCTTAATTCTAAGACCGTTTCTTCGCCTCTTAATTGGGAACGTAAAATTTTTTCTAATTGTAATTTTAACATGGGCAGGCTGATGTCTTTTATTCAGGCTGACTCTTTTGGTTGTAACAATATTGATGCTTCTCGCTTATATGGTATGTGTTTTGGTAGCATTACTATTGATAAGTTTGCTATACCCAATAGTAGAAAGGTTGATCTGCAAGTGGGTAAATCTGGTTATTTACAATCTTTTAATTATAAGATTGACACTGCTGTTAGCAGTTGTCAACTCTATTATAGTTTGCCTGCAGCAAACGTATCTGTCACTCATTATAATCCTTCATCTTGGAATAGAAGGTATGGGTTTAATAATCAGAGTTTTGGTTCCAGAGGCCTTCATGATGCTGTTTATTCACAGCAATGTTTTAATACACCTAACACATATTGTCCTTGTAGAACAAGTCAATGCATAGGTGGTGCAGGCACAGGAACTTGTCCTGTAGGCACCACTGTGCGCAAGTGTTTTGCTGCAGTTACAAAAGCTACTAAGTGTACTTGCTGGTGTCAACCAGATCCTTCCACATATAAAGGTGTAAACGCCTGGACTTGTCCGCAATCTAAAGTTTCTATACAACCAGGTCAGCATTGCCCTGGTTTGGGTCTTGTGGAGGATGATTGCTCTGGCAACCCTTGCACTTGTAAACCACAGGCTTTCATAGGCTGGAGTTCAGAAACTTGTTTGCAAAATGGTAGGTGTAATATTTTTGCTAATTTTATTCTGAATGATGTTAATAGCGGTACAACCTGTTCTACTGATTTACAACAGGGTAATACTATTATTACTACTGATGTTTGTGTTAATTATGACCTATATGGCATTACAGGCCAGGGCATACTTATAGAAGTTAATGCCACTTATTATAATAGTTGGCAGAATCTTCTTTATGATTCTAGTGGTAATCTCTATGGCTTTAGAGATTATTTATCAAATAGAACTTTTCTTATTCGTAGCTGCTATAGTGGAAGAGTTTCAGCAGTTTTTCATGCTAACTCATCTGAACCAGCTTTGATGTTTCGTAATCTTAAATGCAGCCACGTTTTTAATAATACCATTTTAAGACAAATACAGCTTGTTAACTATTTTGATAGTTACCTTGGTTGTGTTGTTAATGCTTATAATAATACAGCTAGTGCTGTAAGTACTTGTGATTTAACCGTTGGTAGCGGCTATTGTGTTGATTATGTTACAGCACTTAGATCACGTAGATCTTTTACTACAGGTTATCGCTTTACTAATTTTGAACCATTTGCCGCTAATTTGGTAAATGATAGTATAGAACCTGTTGGTGGTTTGTATGAAATACAGATACCTTCAGAGTTTACCATTGGTAATTTAGAAGAGTTCATTCAAACGAGATCCCCTAAGGTTACTATAGACTGTGCTACATTTGTTTGTGGTGACTATGCAGCATGTAGACAACAGTTAGCTGAGTATGGTAGTTTTTGTGAGAACATTAATGCTATACTCACAGAAGTAAATGAACTACTTGACACTACACAGTTGCAAGTAGCTAATAGTTTAATGAATGGAGTCACCCTTAGTACCAAGATTAAGGATGGCATTAATTTCAATGTTGACGATATCAACTTCTCCCCTGTATTAGGTTGTTTAGGAAGCGAATGTAATAGAGCTTCCACTAGATCTGCTATAGAGGATTTACTTTTTGATAAAGTAAAATTGTCTGATGTCGGCTTTGTACAGGCCTATAATAACTGCACTGGAGGTGCCGAAATTAGGGATCTCATTTGTGTGCAAAGTTATAATGGTATCAAAGTGTTGCCTCCATTGTTATCTGAAAATCAGATCAGTGGCTACACTTTGGCAGCCACCGCTGCTAGCTTATTCCCTCCTTGGACAGCTGCAGCAGGTGTACCATTTTATTTAAATGTTCAGTATCGTATAAATGGGCTTGGCGTCACTATGGATGTGCTAAGTCAAAACCAAAAGCTTATTGCTAGTGCATTTAACAATGCTCTTGATGCTATCCAGGAAGGGTTCGACGCAACCAATTCTGCTTTAGTTAAAATTCAGGCTGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCACTTAATAACTTATTGCAGCAACTCTCTAACAGATTTGGTGCCATAAGTGCCTCTTTACAAGAAATTTTATCCAGGCTCGATGCTCTTGAAGCTAAAGCTCAGATAGACAGACTTATCAATGGGCGTCTCACCGCTCTTAATGCTTATGTTTCTCAGCAGCTTAGTGATTCTACACTAGTAAAATTTAGTGCAGCACAAGCTATTGAGAAAGTTAATGAATGTGTTAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTCTGTGGTAATGGTAATCATATTATATCATTAGTACAGAATGCTCCATATGGTTTGTATTTTATCCATTTTAGCTATGTCCCCACCAAGTATGTTACAGCAAAGGTTAGTCCTGGTTTGTGCATTGCTGGCGATATAGGAATATCGCCTAAGAGTGGTTATTTTATTAATGTAAATAATTCTTGGATGTTCACTGGTAGTAGCTATTACTACCCTGAACCTATAACCCAAAATAATGTTGTTGTGATGAGTACCTGTGCTGTTAATTATACTAAAGCACCGGATCTAATGCTGAACACATCGACACCCAACCTTCCTGACTTCAAGGAAGAATTGTATCAATGGTTTAAAAACCAATCTTCAGTGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATTAATGTTACGTTCTTGGACCTACAAGATGAAATGAATAGGTTACAAGAGGCTATAAAAGTTTTAAATCAGAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACATATGAGTATTATGTGAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATTGGCCTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGCTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGTTTTAAGAAATGTGGCGGTTGTTGTGATGATTATACTGGACACCAGGAGTTTGTAATCAAAACTTCACATGACGATTAA |
Porcine hemagglutinating encephalomyelitis virus |
Coronaviridae |
Porcine hemagglutinating encephalomyelitis |
-- |
| DVSP15800004 |
AAL89739.1 |
spike glycoprotein, partial Transmissible gastroenteritis virus. |
789 aa |
MKKLFVVLVVMPLIYGDNFPCSKLTNRTIGNHWNLIETFLLNYSSRLPPNSDVVLGDYFPTVQPWFNCIRNDSNDLYVTLENLKALYWDYATENITWNHRQRLHVVVNGYPYSITVTTTRDFNSAEGAIICICKGSPPTTTTESSLTCNWGSECRLNHKFPICPSNSEANCGNMLYGLQWFADEVVAYLHGASYRISFENQWSGTVTLGDMRATTLEVAGTLVDLWWFNPVYDVSYYRVNNKNGTTVVSNCTDQCASYVANVFTTQPGGFIPSDFSFNNWFLLTNSSTLVSGKLVTKQPLLVNCLWPVLSFEEAASTFCFEGAGFDQCNGAVLNNTVDVIRFNLNFTTNVQSGKGATVFSLNTTGGVTLEISCYNDTVSDSSFFSYGEIPFGVTDGPRYCYILYNGTALKYIGILPPSVKEIAISKWGHFYINGHNFFSTLPIDCISFNLTTGDSDLFWTIAYTSYTQSLLQVENTAITKVTYCNSYVNNIKCSQLTANLNNGFYPVSSSEVGLVNKSVVLLPSFYTHTIVNITIGLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNKTDVYCIRSDQFSVYVHSTCKSALWDNIFKRNCTDVLHATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCLSLSHVGANCKFDVAAGTRSNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGRTGVGIIRRTNRTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVSDGVIYSVTPCDVSAQAAVIDGTIVGAITSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNDRTRGT |
AF481360.1 |
Transmissible gastroenteritis virus strain KT2 spike glycoprotein (S) gene; partial cds |
2366bp |
ATGAAAAAACTATTTGTGGTTTTGGTTGTAATGCCATTGATTTATGGAGACAATTTTCCTTGTTCTAAATTGACTAATAGAACTATAGGTAACCATTGGAATCTCATTGAAACCTTCCTTCTAAATTATAGTAGTAGGTTACCACCTAATTCAGATGTGGTGTTAGGTGATTATTTTCCTACTGTACAACCTTGGTTTAATTGCATTCGCAATGATAGTAATGACCTTTATGTTACACTGGAAAATCTTAAAGCATTGTATTGGGATTATGCTACAGAAAATATCACTTGGAATCACAGACAACGGTTACACGTAGTCGTTAATGGATACCCATATTCCATCACAGTTACAACAACCCGCGATTTTAATTCTGCTGAAGGTGCTATTATATGCATTTGTAAGGGCTCACCACCTACTACCACCACAGAATCTAGTTTGACTTGCAATTGGGGTAGTGAGTGCAGGTTAAACCATAAGTTCCCTATATGTCCTTCTAATTCAGAGGCAAATTGTGGTAATATGCTGTATGGCCTACAATGGTTTGCAGATGAGGTTGTTGCTTATTTACATGGTGCTAGTTACCGTATTAGTTTTGAAAATCAATGGTCTGGCACTGTCACACTTGGTGATATGCGTGCGACAACATTAGAAGTCGCTGGCACGCTTGTAGACCTTTGGTGGTTTAATCCTGTTTATGATGTTAGTTATTATAGAGTTAATAATAAAAATGGTACTACCGTAGTTTCCAATTGCACTGATCAATGTGCTAGTTATGTGGCTAATGTTTTTACTACACAGCCAGGAGGTTTCATACCATCAGATTTTAGTTTTAATAATTGGTTCCTTCTAACTAATAGCTCCACGTTGGTTAGTGGTAAATTAGTTACCAAACAGCCGTTATTAGTTAATTGCTTATGGCCAGTCCTTAGCTTTGAAGAAGCAGCTTCTACATTTTGTTTTGAGGGTGCTGGCTTTGATCAATGTAATGGTGCTGTTTTAAATAACACTGTAGACGTCATTAGGTTCAACCTTAATTTTACTACAAATGTACAATCAGGTAAGGGTGCCACAGTGTTTTCATTGAACACAACGGGTGGTGTCACTCTTGAAATCTCATGTTATAATGATACAGTGAGTGACTCGAGCTTTTTCAGTTACGGTGAAATTCCGTTCGGCGTAACTGATGGACCACGGTACTGTTACATACTCTACAATGGCACAGCTCTNAAGTATATAGGAATATTACCACCTAGTGTCAAGGAGATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCATTTTTATATTAATGGTCACAATTTCTTTAGCACACTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAATTTGACCACTGGTGATAGTGACCTTTTCTGGACAATAGCTTACACATCGTACACTCAATCATTATTACAAGTTGAAAACACAGCTATTACAAAGGTGACGTATTGTAATAGTTACGTTAATAACATTAAATGCTCTCAACTTACTGCTAATTTGAATAATGGATTTTATCCTGTTTCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCTAGCTTTTACACACATACCATTGTTAACATAACTATTGGTCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCCTCAACATTAAGTAACATCACACTACCAATGCAGGATAACAAAACCGATGTGTACTGTATTCGTTCTGACCAATTTTCAGTTTATGTTCATTCTACTTGCAAAAGTGCTTTATGGGACAATATTTTTAAGCGAAACTGCACGGACGTTTTACATGCCACAGCTGTTATAAAAACTGGTACTTGTCCTTTCTCATTTGATAAATTGAACAATTACTTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTGTCGTTGAGCCATGTTGGTGCTAATTGTAAGTTTGATGTAGCTGCCGGTACAAGAAGCAATGAGCAGGTTGTTAGAAGTTTGTATGTAATATATGAAGAAGGAGACAACATAGTGGGTGTACCGTCTGATAATAGTGGTTTGCACGATTTGTCAGTGCTACACCTAGATTCCTGCACAGATTACAATATATATGGTAGAACTGGTGTTGGTATTATTAGACGTACTAACAGGACGCTACTTAGTGGCTTATATTACACATCACTATCAGGTGATTTGTTAGGTTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTCATCTACTCTGTAACGCCATGTGATGTAAGCGCACAAGCAGCTGTTATTGATGGTACCATAGTTGGGGCTATCACTTCCATTAACAGTGAACTGTTAGGTCTAACACATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTACTACTCTATATATAATTACACAAATGATAGGACTCGTGGTAC |
Transmissible gastroenteritis virus |
Coronaviridae |
Transmissible gastroenteritis virus |
-- |
| DVSP15800005 |
AAL89740.1 |
spike glycoprotein, partial Transmissible gastroenteritis virus. |
790 aa |
MKKLFVVLVVMPLIYGDNFPCSKLTNRTIGNHWNLIETFLLNYSSRLPPNSDVVLGDYFPTVQPWFNCIRNDSNDLYVTLENLKALYWDYATENITWNHRQRLHVVVNGYPYSITVTTTRDFNSAEGAIICICKGSPPITTTESSLTCNWGSECRLNHKFPICPSNSEANCGNMLYGLQWFADEVVAYLHGASYRISFENQWSGTVTLGDMRATTLEVAGTLVDLWWFNPVYDVSYYRVNNKNGTTVVSNCTDQCASYVANVFTTQPGGFIPSDFSFNNWFLLTNSSTLVSGKLVTKQPLLVNCLWPVPSFEEAASTFCFEGAGFDQCNGAVLNNTVDVIRFNLNFTTNVQSGKGATVFSLNTTGGVTLEISCYNDTVSDSSFFSYGEIPFGVTDGPRYCHILYNGTALKYIGILPPSVKEIAISKWGHFYINGHNFFSSLPIDCISFNLTTGDSDVFWTIAYTSYTEALVQVENTAITKVTYCNSYVNNIKCSQLTANLNNGFYPVSSSEVGLVNKSVVLLPSFYTHTIVNITIGLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNKTDVYCIRSDQFSVYVHSTCKSALWDNIFKRNCTDVLHATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCLSLSPVGANCKFDVAARTRSNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGRTGVGIIRRTNRTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVSDGVIYSVTPCDVSAQRAVIDGTIVGAITSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNDRTRGTA |
AF481361.1 |
Transmissible gastroenteritis virus strain KT3 spike glycoprotein (S) gene; partial cds |
2369bp |
ATGAAAAAACTATTTGTGGTTTTGGTTGTAATGCCATTGATTTATGGAGACAATTTTCCTTGTTCTAAATTGACTAATAGAACTATAGGTAACCATTGGAATCTCATTGAAACCTTCCTTCTAAATTATAGTAGTAGGTTACCACCTAATTCAGATGTGGTGTTAGGTGATTATTTTCCTACTGTACAACCTTGGTTTAATTGCATTCGCAATGATAGTAATGACCTTTATGTTACACTGGAAAATCTTAAAGCATTGTATTGGGATTATGCTACAGAAAATATCACTTGGAATCACAGACAACGGTTACACGTAGTCGTTAATGGATACCCATATTCCATCACAGTTACAACAACCCGCGATTTTAATTCTGCTGAAGGTGCTATTATATGCATTTGTAAGGGCTCACCACCTATTACCACCACAGAATCTAGTTTGACTTGCAATTGGGGTAGTGAGTGCAGGTTAAACCATAAGTTCCCTATATGTCCTTCTAATTCAGAGGCAAATTGTGGTAATATGCTGTATGGCCTACAATGGTTTGCAGATGAGGTTGTTGCTTATTTACATGGTGCTAGTTACCGTATTAGTTTTGAAAATCAATGGTCTGGCACTGTCACACTTGGTGATATGCGTGCGACAACATTAGAAGTCGCTGGCACGCTTGTAGACCTTTGGTGGTTTAATCCTGTTTATGATGTTAGTTATTATAGAGTTAATAATAAAAATGGTACTACCGTAGTTTCCAATTGCACTGATCAATGTGCTAGTTATGTGGCTAATGTTTTTACTACACAGCCAGGAGGTTTCATACCATCAGATTTTAGTTTTAATAATTGGTTCCTTCTAACTAATAGCTCCACGTTGGTTAGTGGTAAATTAGTTACCAAACAGCCGTTATTAGTTAATTGCTTATGGCCAGTCCCTAGCTTTGAAGAAGCAGCTTCTACATTTTGTTTTGAGGGTGCTGGCTTTGATCAATGTAATGGTGCTGTTTTAAATAACACTGTAGACGTCATTAGGTTCAACCTTAATTTTACTACAAATGTACAATCAGGTAAGGGTGCCACAGTGTTTTCATTGAACACAACGGGTGGTGTCACTCTTGAAATCTCATGTTATAATGATACAGTGAGTGACTCGAGCTTTTTCAGTTACGGTGAAATTCCGTTCGGCGTAACTGATGGACCACGGTACTGTCACATACTCTACAATGGCACAGCTCTTAAGTATATAGGAATATTACCACCTAGTGTCAAGGAGATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCATTTTTATATTAATGGTCACAATTTCTTTAGCTCACTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAATTTGACCACTGGTGATAGTGACGTTTTCTGGACAATAGCTTACACATCGTACACTGAAGCATTAGTACAAGTTGAAAACACGGCTATTACAAAGGTGACGTATTGTAATAGTTACGTTAATAACATTAAATGCTCTCAACTTACTGCTAATTTGAATAATGGATTTTATCCTGTTTCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCTAGCTTTTACACACATACCATTGTTAACATAACTATTGGTCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCCTCAACATTAAGTAACATCACACTACCAATGCAGGATAACAAAACCGATGTGTACTGTATTCGTTCTGACCAATTTTCAGTTTATGTTCATTCTACTTGCAAAAGTGCTTTATGGGACAATATTTTTAAGCGAAACTGCACGGACGTTTTACATGCCACAGCTGTTATAAAAACTGGTACTTGTCCTTTCTCATTTGATAAATTGAACAATTACTTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTGTCGTTGAGTCCTGTTGGTGCTAATTGTAAGTTTGATGTAGCTGCCCGTACAAGAAGCAATGAGCAGGTTGTTAGAAGTTTGTATGTAATATATGAAGAAGGAGACAACATAGTGGGTGTACCGTCTGATAATAGTGGTTTGCACGATTTGTCAGTGCTACACCTAGATTCCTGCACAGATTACAATATATATGGTAGAACTGGTGTTGGTATTATTAGACGTACTAACAGGACGCTACTTAGTGGCTTATATTACACATCACTATCAGGTGATTTGTTAGGTTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTCATCTACTCTGTAACGCCATGTGATGTAAGCGCACAACGAGCTGTTATTGATGGTACCATAGTTGGGGCTATCACTTCCATTAACAGTGAACTGTTAGGTCTAACACATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTACTACTCTATATATAATTACACAAATGATAGGACTCGTGGCACTGC |
Transmissible gastroenteritis virus |
Coronaviridae |
Transmissible gastroenteritis virus |
-- |
| DVSP15800006 |
AAL89741.1 |
spike glycoprotein, partial Transmissible gastroenteritis virus. |
790 aa |
MKKLFVVLVVMPLIYGDNFPCSKLTNRTIGNHWNRIETFLLNYSSRLPPNSDVVLGDYFPTVQPWFNCIRNDSNDLYVTLENLKALYWDYATENSTWNHRQRLHVVVNGYPYSITVTTTRDFNSAEGAIICICKGSPPTTTTESSLTCNWGSECRLNHKFPICPSNSEANCGNMLYGLQWFADEVVAYLHGASYRISFENQWSGTVTLGDMRATTLEVAGTLVDLWWFNPVYDASYYRVNNXNGTTVVSNCTDQCASYVANVFTTQPGGFIPSDFSFNNWFLLTNSSTLVSGKLVTKQPLLVNCLWPVPSFEEAASTFCFEGTGFDQCNGAVLNNTVDVIRFNLNFTTNVQSGKGATVFSLNTTGGVTLEISCYNDTVSDSSFFSYGEIPFGVTDGPRYCHILYNGTALKYIGILPPSVKEIAISKWGHFYINGHNFFSTLPIDCISFNLTTGDSDVFWTIAYTSYTEALVQVENTAITKVTYCNSYVNNIKCSQLTANLNNGFYPVSSSEVGLVNKSVVLLPSFYTHTIVNITIGLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNKTDVYCIRSDQFSVYVHSTCKSALWDNIFKRNCTDVLHATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCLSLSPVGANCKFDVAARTRSNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGRTGVGIIRRTNRTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVSDGVIYSVTPCDVSAQAAVIDGTIVGAITSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNDRTRGTA |
AF481362.1 |
Transmissible gastroenteritis virus strain KT4 spike glycoprotein (S) gene; partial cds |
2369bp |
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Transmissible gastroenteritis virus |
Coronaviridae |
Transmissible gastroenteritis virus |
-- |
| DVSP15800007 |
AAL89742.1 |
spike glycoprotein, partial Transmissible gastroenteritis virus. |
789 aa |
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AF481363.1 |
Transmissible gastroenteritis virus strain KT5 spike glycoprotein (S) gene; partial cds |
2366bp |
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Transmissible gastroenteritis virus |
Coronaviridae |
Transmissible gastroenteritis virus |
-- |
| DVSP15800008 |
AAL89743.1 |
spike glycoprotein, partial Transmissible gastroenteritis virus. |
789 aa |
MKKLFVVLVVMPLIYGDNFPCSKLTNRTIGNHWNLIETFLLNYSSRLPPNSDVVLGDYFPTVQPWFNCIRNDSNDLYVTLENLKALYWDYATENITWNHRQRLHVVVNGYPYSITVTTTRDFNSAEGAIICICKGSPPTTTTESSLTCNWGSECRLNHKFPICPSNSEANCGNMLYGLQWFADEVVAYLHGASYRISFENQWSGTVTLGDMRATTLEVAGTRVDLWWFNPVYDVSYYRVNNKNGTTVVSNCTDQCASYVANVFTTQPGGFIPSDFSFNNWFLLTNSSTLVSGKLVTKQPLLVNCLWPVPSFEEAASTFCFEGAGFDQCNGAVLNNTVDVIRFNLNFTTNVQSGKGATVFSLNTTGGVTLEISCYNDIVSDSSFFSYGEIPFGVTDGPRYCYILYNGTALKYIGILPPSVKEIAISKWGHFYINGHNFFSTLPIDCMSFNLTTGDSDVFWTIAYTSYTEALVQVENTAITKVTYCNSYVNNIKCSQLTANLNNGFYPVSSSEVGLVNKSVVLLPSFYTHTIVNITIGLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNKTDVYCIRSDQFSVYVHSTCKSALWDNIFKRNCTDVLHATAVIKTGTCPFSFDKLNNYLTFNKFCLSLSPVGANCKFDVAARTRSNEQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGRTGVGIIRRTNRTLLSGLHYTSLSGDLLGFKNVSDGVIYSVTPCDVSAQAAVIDGTIVGAITSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNDRTRGT |
AF481364.1 |
Transmissible gastroenteritis virus strain KT6 spike glycoprotein (S) gene; partial cds |
2366bp |
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Transmissible gastroenteritis virus |
Coronaviridae |
Transmissible gastroenteritis virus |
-- |
| DVSP15800009 |
AAL89744.1 |
spike glycoprotein, partial Transmissible gastroenteritis virus. |
789 aa |
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AF481365.1 |
Transmissible gastroenteritis virus strain 133 spike glycoprotein (S) gene; partial cds |
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Transmissible gastroenteritis virus |
Coronaviridae |
Transmissible gastroenteritis virus |
-- |
| DVSP15800010 |
AAL89745.1 |
spike glycoprotein, partial Transmissible gastroenteritis virus. |
789 aa |
MKKLFVVLVVMPLIYGDNFPCSKLTNRTIGNHWNLIETFLLNYSSRLPPNSDVVLGDYFPTVQPWFNCIRNDSNDLYVTLENLKALYWDYATENITWNHRQRFHVVVNGYPYSITVTTTRDFNSAEGAIICICKGSPPTTTTESSLTSNWGSECRLNHKFPICPSNSEANCGNMLYGLQWFADEVVAYLHGASYRISFENQWSGTVTLGDMRATTLEVAGTLVDLWWFNPVYDFSYYRVNNKNGTTVVSNCTDQCASYVANVFTTQPGGYIPSDFSFNNWFLLTNSSTLVSGKLVTKQPLLVNCLWPVPSFEEAASTFCFEGAGFDQCNGAVLNNTVDVIRFNLNFTTNVQSGKGATVFSLNTTGGVTLDISCYKDTVSDSSFFSYGEIPFGVTDGPRYCHILYNGTALKYIGILPPSVKEIAISKWGHFYINGHNFFSTLPIDCISFNLTTGDSDVFWTIAYTSYTEALVQVENTAITKVTYCNSYVNNIKCSQLTANLNNGFYPVSSSEVGLVNKSVVLLPSFYTHTIVNITIGLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNKTDVYCIRSDQFSVYVHSTCKSALWDNIFKRNCTDVLHATAVIKTGTCPFSFDKLTNYLTFNKFCLSLSPVGANCKFDVAARTRSNVQVVRSLYVIYEEGDNIVGVPSDNSGLHDLSVLHLDSCTDYNIYGRTGVGIIRRTNRTLLSGLYYTSLSGDLLGFKNVSDGVIYSVTPCDVSAQAAVIDGTIVGAITSINSELLGLTHWTTTPNFYYYSIYNYTNDRTRGT |
AF481366.1 |
Transmissible gastroenteritis virus strain HKT2 spike glycoprotein (S) gene; partial cds |
2366bp |
ATGAAAAAACTATTTGTGGTTTTGGTTGTAATGCCATTGATTTATGGAGACAATTTTCCTTGTTCTAAATTGACTAATAGAACTATAGGTAACCATTGGAATCTCATTGAAACCTTCCTTCTAAATTATAGTAGTAGGTTACCACCTAATTCAGATGTGGTGTTAGGTGATTATTTTCCTACTGTACAACCTTGGTTTAATTGCATTCGCAATGATAGTAATGACCTTTATGTTACACTGGAAAATCTTAAAGCATTGTATTGGGATTATGCTACAGAAAATATCACTTGGAATCACAGACAACGGTTTCACGTAGTCGTTAATGGATACCCATATTCCATCACAGTTACAACAACCCGCGATTTTAATTCTGCTGAAGGTGCTATTATATGCATTTGTAAGGGCTCACCACCTACTACCACCACAGAATCTAGTTTGACTTCCAATTGGGGTAGTGAGTGCAGGTTAAACCATAAGTTCCCTATATGTCCTTCTAATTCAGAGGCAAATTGTGGTAATATGCTGTATGGCCTACAATGGTTTGCAGATGAGGTTGTTGCTTATTTACATGGTGCTAGTTACCGTATTAGTTTTGAAAATCAATGGTCTGGCACTGTCACACTTGGTGATATGCGTGCGACAACATTAGAGGTCGCTGGCACGCTTGTAGACCTTTGGTGGTTTAATCCTGTTTATGATTTTAGTTATTATAGAGTTAATAATAAAAATGGTACTACCGTAGTTTCCAATTGCACTGATCAATGTGCTAGTTATGTGGCTAATGTTTTTACTACACAGCCAGGAGGTTACATACCATCAGATTTTAGTTTTAATAATTGGTTCCTTCTAACTAATAGCTCCACGTTGGTTAGTGGTAAATTAGTTACCAAACAGCCGTTATTAGTTAATTGCTTATGGCCAGTCCCTAGCTTTGAAGAAGCAGCTTCTACATTTTGTTTTGAGGGTGCTGGCTTTGATCAATGTAATGGTGCTGTTTTAAATAACACTGTAGACGTCATTAGGTTCAACCTTAATTTTACTACAAATGTACAATCAGGTAAGGGTGCCACAGTGTTTTCATTGAACACAACGGGTGGTGTCACTCTTGACATCTCATGTTATAAGGATACAGTGAGTGACTCGAGCTTTTTCAGTTACGGTGAAATTCCGTTCGGCGTAACTGATGGTCCACGGTACTGTCACATACTCTACAATGGCACAGCTCTTAAGTATATAGGAATATTACCACCTAGTGTCAAGGAGATTGCTATTAGTAAGTGGGGCCATTTTTATATTAATGGTCACAATTTCTTTAGCACACTTCCTATTGATTGTATATCTTTTAATTTGACCACTGGTGATAGTGACGTTTTCTGGACAATAGCTTACACATCGTACACTGAAGCATTAGTACAAGTTGAAAACACAGCTATTACAAAGGTGACGTATTGTAATAGTTACGTTAATAACATTAAATGCTCTCAACTTACTGCTAATTTGAATAATGGATTTTATCCTGTTTCTTCAAGTGAAGTTGGTCTTGTCAATAAGAGTGTTGTGTTACTACCTAGCTTTTACACACATACCATTGTTAACATAACTATTGGTCTTGGTATGAAGCGTAGTGGTTATGGTCAACCCATAGCCTCGACATTAAGTAACATCACACTACCAATGCAGGATAACAAAACCGATGTGTACTGTATTCGTTCTGACCAATTTTCAGTTTATGTTCATTCTACTTGCAAAAGTGCTTTATGGGACAATATTTTTAAGCGAAACTGCACGGACGTTTTACATGCCACAGCTGTTATAAAAACTGGTACTTGTCCTTTCTCATTTGATAAATTGACCAATTACTTAACTTTTAACAAGTTCTGTTTGTCGTTGAGTCCTGTTGGTGCTAATTGTAAGTTTGATGTAGCTGCCCGTACAAGAAGCAATGTGCAGGTTGTTAGAAGTTTGTATGTAATATATGAAGAAGGAGACAACATAGTGGGTGTACCGTCTGATAATAGTGGTTTGCACGATTTGTCAGTGCTACACCTAGATTCCTGCACAGATTACAATATATATGGTAGAACTGGTGTTGGTATTATTAGACGTACTAACAGGACGCTACTTAGTGGCTTATATTACACATCACTATCAGGTGATTTGTTAGGTTTTAAAAATGTTAGTGATGGTGTCATCTACTCTGTAACGCCATGTGATGTAAGCGCACAAGCAGCTGTTATTGATGGTACCATAGTTGGGGCTATCACTTCCATTAACAGTGAACTGTTAGGTCTAACACATTGGACAACAACACCTAATTTTTATTACTACTCTATATATAATTACACAAATGATAGGACTCGTGGCAC |
Transmissible gastroenteritis virus |
Coronaviridae |
Transmissible gastroenteritis virus |
-- |
| DVSP15800011 |
AAL89746.1 |
spike glycoprotein, partial Transmissible gastroenteritis virus. |
9 aa |
EPIEKVHVH |
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Transmissible gastroenteritis virus strain HKT2 spike glycoprotein (S) gene; partial cds; and ORF3-1-like protein gene; partial sequence |
31bp |
CGAACCTATTGAAAAAGTGCACGTCCATTAA |
Transmissible gastroenteritis virus |
Coronaviridae |
Transmissible gastroenteritis virus |
-- |
| DVSP15800013 |
AAL89748.1 |
spike glycoprotein, partial Transmissible gastroenteritis virus. |
9 aa |
EPIEKVHVH |
AF481368.1 |
Transmissible gastroenteritis virus strain KT2 spike glycoprotein (S) gene; partial cds; ORF3 gene; complete cds; and ORF3-1 gene; partial cds |
31bp |
CGAACCTATTGAAAAAGTGCACGTCCATTAA |
Transmissible gastroenteritis virus |
Coronaviridae |
Transmissible gastroenteritis virus |
-- |