Accession Number |
Protein Id |
Protein Description |
Protein Length |
Protein Sequence |
Nucleotide Id |
Nucleotide Description |
Nucleotide Length |
Nucleotide Sequence |
Source |
Class_virus |
Virus_name |
Host |
DVSP08800318 |
AAT46019.1 |
spike glycoprotein S1, partial Infectious bronchitis virus. |
100 aa |
MLGTSLFIVTVLFALCSVALFDNNETVYYYQSAFRPVDGWHLHGGAYAVVNVSLETNYACTASPMHCQGLFLGVKISQLCCNHDCTDLGMTGQLQLFCTA |
AY604558.1 |
Infectious bronchitis virus isolate CO8232L spike glycoprotein S1 gene; partial cds |
300bp |
ATGTTGGGGACCTCACTGTTTATAGTGACTGTTTTGTTTGCACTATGTAGTGTCGCTTTGTTTGATAATAATGAAACCGTTTACTACTACCAAAGTGCCTTTAGACCGGTTGATGGATGGCATTTGCATGGTGGTGCTTATGCAGTAGTAAACGTCTCTTTAGAAACTAATTATGCATGCACAGCTTCCCCAATGCACTGCCAGGGGCTATTTCTTGGAGTAAAAATTTCTCAGCTCTGCTGTAACCATGACTGCACTGATTTAGGGATGACGGGTCAACTCCAGCTATTTTGCACGGCT |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP08800319 |
AAT46020.1 |
spike glycoprotein S1, partial Infectious bronchitis virus. |
100 aa |
MLGKSLFIVTVLFALCSAALFDNNETVYYYQSAFRPVDGWHLHGGAYAVVNVSLETNNAGTASQCIAGAISWSKNFSASAVAMTAPELGMTWSTQQFCTA |
AY604559.1 |
Infectious bronchitis virus isolate CO8234T spike glycoprotein S1 gene; partial cds |
300bp |
ATGTTGGGGAAGTCACTGTTTATAGTGACTGTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCCGCTTTGTTTGATAATAATGAAACCGTTTACTACTACCAAAGTGCCTTTAGACCGGTTGATGGATGGCATTTGCATGGTGGTGCTTATGCAGTAGTAAACGTTTCTTTAGAAACTAATAATGCAGGCACAGCTTCACAATGCATTGCAGGGGCTATTTCTTGGAGTAAAAATTTCTCTGCTTCTGCTGTAGCCATGACTGCACCTGAGTTAGGGATGACGTGGTCAACTCAGCAATTCTGCACGGCT |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP08800320 |
AAT46021.1 |
spike glycoprotein S1, partial Infectious bronchitis virus. |
100 aa |
MLGKSLFIVTVLFALCSAALFDNNETVYYYQSAFRPVDGWHLHGGAYAVVNVSLETNNAGTASQCIAGAIFWSKNFSASAVAMTAPELGMTWSTQQFCTA |
AY604560.1 |
Infectious bronchitis virus isolate CO8234CT spike glycoprotein S1 gene; partial cds |
300bp |
ATGTTGGGGAAGTCACTGTTTATAGTGACTGTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCCGCTTTGTTTGATAATAATGAAACCGTTTACTACTACCAAAGTGCCTTTAGACCGGTTGATGGATGGCATTTGCATGGTGGTGCTTATGCAGTAGTAAACGTTTCTTTAGAAACTAATAATGCAGGCACAGCTTCACAATGCATTGCAGGGGCTATTTTTTGGAGTAAAAATTTCTCTGCTTCTGCTGTAGCCATGACTGCACCTGAGTTAGGGATGACGTGGTCAACTCAGCAATTCTGCACGGCT |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP08800321 |
AAT46022.1 |
spike glycoprotein S1, partial Infectious bronchitis virus. |
98 aa |
MLVTPLLLVTLLFALCSAALYDNSSYVYYYQSAFRPPNGWHLHGGAYAVVNTSIESNNLRECIVGIIGGDRVVNASSIAMTAPQPGMDWSSRQFCTAH |
AY604561.1 |
Infectious bronchitis virus isolate CO8033CT spike glycoprotein S1 gene; partial cds |
296bp |
ATGTTGGTAACACCTCTTTTATTAGTGACTCTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCTGCTTTGTATGACAATAGTTCTTACGTTTACTACTACCAAAGTGCCTTTAGACCACCTAATGGTTGGCATTTACACGGGGGTGCTTATGCGGTAGTTAATACTTCTATAGAATCTAATAATTTAAGAGAGTGTATTGTTGGTATTATTGGTGGTGATCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGCAACCAGGTATGGATTGGTCTAGCAGACAGTTTTGTACTGCACACTG |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP04200048 |
AAT67458.1 |
spike protein subunit 1, partial Bovine coronavirus. |
134 aa |
PSTWNRRFGFTEQSVFKPQPVGVFTHHDVVYAQHCFKAPTNFCPCKLDGSLCVGNGLGIDAGYKNSGIGTCPAGTNYLTCHSLCTPDPITSKSTGPYKCPQTKYLVGIGEHCSGLAIKSDYCGGNPCTCQPQAF |
AY646095.1 |
Bovine coronavirus strain Kakegawa spike protein subunit 1 (S1) gene; partial cds |
404bp |
TCCTTCTACTTGGAATAGGAGATTTGGTTTTACAGAACAATCTGTTTTTAAGCCTCAACCTGTAGGTGTTTTTACTCATCATGATGTTGTTTATGCACAACATTGTTTTAAAGCTCCCACAAATTTCTGTCCGTGTAAATTGGATGGGTCTTTGTGTGTAGGTAATGGTCTTGGTATAGATGCTGGTTATAAAAATAGTGGTATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGCCATAGTTTGTGCACTCCCGACCCCATTACATCTAAATCTACAGGGCCTTACAAGTGCCCCCAAACTAAATACTTAGTTGGCATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCTTGCTATTAAAAGTGATTATTGTGGAGGTAATCCTTGTACTTGCCAACCACAAGCATTTT |
Bovine coronavirus |
Coronaviridae |
Bovine coronavirus |
-- |
DVSP08800322 |
AAT70074.1 |
spike protein Infectious bronchitis virus. |
57 aa |
MIQSPTSFLIVLIFLWCKLVLSCFREFIIALQQLIQVLLQIINSNLQPRLTLCHSLD |
AY641576.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate Peafowl/GD/KQ6/2003; complete genome |
174bp |
ATGATTCAAAGTCCCACGTCCTTCCTAATAGTATTAATTTTTCTTTGGTGTAAACTTGTACTAAGTTGTTTTAGAGAGTTTATTATAGCGCTCCAACAACTAATACAAGTTTTACTCCAAATTATCAATAGTAACTTACAGCCTAGACTGACCCTTTGTCACAGTCTAGACTAA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP03300001 |
AAT70772.1 |
spike protein Avian infectious bronchitis virus |
1165 aa |
MLGKSLFLVTILCALCSANLFDSANNYVYYYQSAFRPPNGWHLQGGAYAVVNSTNYTNNAGSANECTIGVIKDVYNQSAAAIAMTAPLQGMAWSKSQFCSAHCNFSEITVFVTHCYSSGSGSCPITGMIPQGHIRISAMKNGSLFYNLTVSVSKYPNFKSFQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNTTTDVKSAGVYFKAGGPVNYNIMKEFKVLAYFVNGTVQDVILCDDTPRGLLACQYNNGNFSDGFYPFTNSSLVKEKFIVYRENSVNTTLTLTNYTFYNVTNASPNRGGVQSIPTYQTQTAQSGYYNFNLSFLSSFVYKESNYMYGSYHPACNFRLETINNGLWFNSLSVSLAYGPLQGGCKQSVFSSRATCCYAYSYNGPRACKGVYAGELLQNFECGLLVYVTKSDGSRIQTATVPPVVTQHNYNNITLNTCVDYNIYGRVGRGFITNVTDSSSSYNYLADAGLAVLDTSGAIDIFVVQGEHGLNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNATGSQPLENQFYIKLTKETRRFRRSTSDNVTSCPYVSYGRFCIQPDGSIKQIVPQELENFVAPLLNVTENVLIPSSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYVCGNPLDCRKLFQQYGPVCDNILSIVNSVGQKEDMELLTFYSSTKPAGYNAPVFSNISTGDFNISLLLTPPSSPSGRSFIEDLLFTSVETVGLPTDAEYKKCTAGPLGTLKDLICAREYNGLLVLPPIITADMQTMYTASLVGAMAFGGITAAGAIPFATQIQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQVQDVVNKQSAILTETMNSLNKNFGAISSVIQDIYAQLDAIQADAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQSEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSNRYGFCGSGRHVLSIPQNAPNGIVFIHFTYTPQSFVNVTAIVGFCVQPANASQYAIVPVNGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVNVNKTVITTFVEDDDFDFDDELSKWWNDTEHELPDFDDFNYTVPILNISGEIDRIQGVIQGLNDSLIDLEELSIIKTYIKWPWYVWLAIGFAVIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV |
AY646283.1 |
Avian infectious bronchitis virus partridge/GD/S14/2003; complete genome |
3498bp |
ATGTTGGGGAAGTCACTGTTTTTAGTGACCATTTTGTGTGCACTATGTAGTGCAAATTTGTTTGATTCTGCTAATAATTATGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTTAGGCCTCCAAATGGATGGCATTTGCAAGGGGGTGCTTATGCAGTAGTGAATTCTACTAATTATACTAATAATGCAGGTTCTGCAAATGAGTGCACTATTGGTGTTATTAAGGACGTCTATAATCAAAGTGCGGCTGCTATAGCTATGACAGCACCTCTTCAGGGTATGGCTTGGTCTAAGTCACAATTTTGTAGTGCACACTGTAACTTTTCTGAAATTACAGTTTTTGTCACACATTGTTATAGTAGCGGTAGTGGGTCTTGTCCTATAACAGGCATGATTCCACAGGGTCATATTCGCATTTCTGCAATGAAAAATGGCTCTTTATTTTATAATTTAACAGTTAGCGTGTCTAAATACCCTAATTTTAAATCGTTTCAATGTGTTAACAACTTCACATCTGTTTATTTAAATGGTGATCTTGTTTTTACTTCTAACACAACTACTGATGTTAAGTCAGCAGGTGTGTATTTTAAAGCAGGTGGACCTGTAAATTATAATATTATGAAAGAATTTAAGGTTCTGGCTTATTTTGTCAATGGTACTGTGCAAGATGTAATTCTGTGTGATGACACACCGAGAGGCTTGCTTGCATGTCAATATAATAATGGTAATTTTTCAGATGGGTTTTACCCTTTTACTAATTCTAGTTTAGTTAAGGAAAAGTTTATTGTTTATCGTGAGAATAGTGTTAATACTACTCTTACTTTAACTAACTATACTTTTTATAATGTGACTAATGCCTCGCCTAATCGAGGTGGTGTTCAGTCTATTCCAACTTATCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTATCATTTCTGAGTAGTTTTGTGTATAAAGAGTCTAATTACATGTATGGGTCTTACCACCCTGCATGTAATTTTAGATTAGAAACTATTAATAATGGCTTGTGGTTTAATTCATTGTCAGTTTCGCTTGCTTATGGACCACTTCAAGGTGGGTGTAAGCAGTCGGTTTTTAGTAGTAGAGCCACTTGTTGTTATGCTTATTCATATAATGGTCCTCGCGCATGTAAGGGTGTTTACGCAGGCGAGTTACTACAAAATTTTGAATGTGGACTGTTGGTTTATGTTACTAAGAGCGATGGCTCTCGTATACAAACAGCCACCGTTCCACCAGTTGTAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAGTTGGTCGAGGTTTTATTACTAATGTAACTGACTCATCATCTAGTTATAATTATTTAGCAGATGCAGGGTTGGCTGTTTTAGATACATCAGGTGCCATAGACATCTTTGTTGTACAAGGTGAACATGGTCTTAATTATTACAAGGTTAATCCCTGTGAAGATGTAAACCAGCAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACCTCACGTAATGCAACAGGTTCTCAGCCTCTTGAGAATCAATTCTACATTAAACTCACTAAAGAGACACGTCGTTTTAGACGTTCTACTAGTGATAATGTAACAAGTTGCCCTTATGTTAGTTATGGCAGGTTTTGTATACAACCTGATGGTTCTATTAAGCAAATAGTACCGCAAGAATTAGAAAACTTTGTGGCACCTTTGTTAAATGTTACTGAAAATGTGCTCATACCTAGCAGTTTTAATTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACACGTATGGATAAAGTTCAAATTAATTGCCTGCAATATGTTTGTGGTAATCCTTTGGATTGTAGGAAGTTATTTCAACAATATGGTCCTGTCTGTGACAACATATTGTCTATAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTAACTTTCTATTCTTCTACTAAACCAGCTGGTTATAATGCACCTGTTTTCAGTAATATTAGTACTGGTGATTTTAATATTTCTCTTTTATTAACACCACCTAGTAGTCCTAGTGGTCGTTCTTTTATAGAAGATTTATTATTTACAAGTGTTGAAACAGTTGGTTTGCCAACTGATGCTGAATATAAAAAATGCACAGCGGGACCTTTGGGTACTCTTAAAGATCTTATCTGTGCTAGGGAATATAATGGTTTATTAGTGTTGCCTCCAATTATTACGGCGGATATGCAAACAATGTATACCGCTTCTTTAGTTGGTGCCATGGCTTTTGGTGGTATTACAGCAGCAGGTGCTATACCATTTGCAACTCAGATACAAGCTAGAATTAATCATTTGGGTATTACACAGTCTCTGTTATTGAAGAACCAAGAGAAGATTGCTGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGAAGCACTTCGCTAGCATTACAACAGGTTCAAGACGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACTGAAACTATGAATTCTCTTAATAAGAATTTTGGTGCCATTTCATCAGTAATTCAAGACATTTATGCGCAACTTGATGCAATTCAAGCAGATGCACAAGTTGACCGTCTTATTACTGGTAGACTCTCTTCTCTCTCAGTGCTAGCCTCTGCTAAGCAGTCTGAGTACATTAGAGTTTCCCAACAACGTGAATTAGCCACTCAAAAAATTAATGAGTGTGTTAAATCACAATCTAATAGGTATGGATTTTGTGGTAGTGGAAGACATGTTCTTTCGATACCGCAAAATGCACCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTATACTCCACAGAGTTTTGTTAATGTTACTGCAATAGTGGGTTTTTGTGTACAGCCTGCTAATGCTAGTCAGTATGCAATAGTGCCTGTTAATGGTAGAGGTATTTTTATACAAGTTAATGGTAGTTACTATATCACTGCACGTGATATGTATATGCCTAGAGACATTACTGCAGGAGATATAGTTACTCTTACGTCTTGTCAAGCAAACTATGTTAATGTAAATAAAACCGTCATTACTACATTTGTAGAAGATGACGATTTTGATTTTGATGATGAGTTGTCAAAATGGTGGAATGACACTGAGCATGAGCTACCAGATTTTGACGACTTCAATTACACAGTACCTATACTGAATATTAGCGGTGAAATTGATCGTATTCAAGGTGTTATACAGGGTCTTAATGACTCCCTTATAGACCTTGAAGAACTGTCAATAATCAAAACTTATATTAAATGGCCTTGGTATGTCTGGCTTGCCATAGGTTTTGCAGTTATTATATTCATCCTAATATTGGGATGGGTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGTATCATTCCTCTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTATTACACGACTTTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA |
Avian infectious bronchitis virus partridge/GD/S14/2003 |
Coronaviridae |
Avian infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP13700075 |
AAT74874.1 |
spike protein SARS coronavirus HHS-2004. |
1255 aa |
MAIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFDNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFAVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDTWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKKISNCVADYSVLYNSTFFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLKHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPALNCYWPLNDYGFYTTTGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTAIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSLLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCTQLNRALSGIAAEQDRNTREVFAQVKQMYKTPTLKYFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDVLSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
AY648300.1 |
SARS coronavirus HHS-2004 spike protein (S) mRNA; complete cds |
3768bp |
ATGGCTATTTTCTTATTATTTCTTACTCTCACTAGTGGTAGTGACCTTGACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCTATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAGGATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATTAATCATACGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTTGCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAACAAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAACTTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTTTCTAAACCCATGGGTACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCTGATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTTGTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTAGTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGTATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTCACCTGCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTAAAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGATTGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAAGGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCTAATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTCTATGCATGGGAGAGAAAAAAAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAACTCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTTTGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATAGCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATGGGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAATTATAAATATAGGTATCTTAAACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAATGTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCTCTTAATTGTTATTGGCCATTAAATGATTATGGTTTTTACACCACTACTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTTGTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCCACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGTGTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCTGATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGCTCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTTCTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACACCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTTATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATTTGTGCTAGTTACCATACAGTTTCTTTATTACGTAGTACTAGCCAAAAATCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAACACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCTATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCTAATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATTGCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAAACCCCAACTTTGAAATATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTAAAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGATGCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATTTGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATTGCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCTGGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGAGTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCGATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGACGTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTGCTCAATGATGTCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAGGTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAACAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCTGAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGTGGAAAGGGCTACCACCTTATGTCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCCCAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCTCGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTTTCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATTGGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAAGAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCAGGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCTAAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATTAAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTTACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGTGGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTACATTACACATGA |
SARS coronavirus HHS-2004 |
Coronaviridae |
SARS coronavirus |
-- |
DVSP11100009 |
AAT75298.1 |
spike glycoprotein Porcine epidemic diarrhea virus. |
1383 aa |
MKSLTYFWLLLPVLSTLSLPQDVTRCQSTINFRRFFSKFNVQAPAVVVLGGYLPSMNSSSWYCGTGLETASGVHGIFLSYIDAGQGFEIGISQEPFDPSGYQLYLHKATNGNTNAIARLRICQFPDNKTLGPTVNDVTTGRNCLFNRAIPAYMQDGKNIVVGITWDNDRVTVFADKIYHFYLKNDWSRVATRCYNKRSCAMQYVYTPTYYMLNVTSAGEDGIYYEPCTANCSGYAANIFATDSNGHIPEGFSFNNWFLLSNDSTLLHGKVVSNQPLLVNCLLAIPKIYGLGQFFSFNQTMDGVCNGAAAQRAPEALRFNINDTSVILAEGSIVLHTALGTNLSFVCSNSSDPHLATFAIPLGATQVPYYCFLKVDTYNSTVYKFLAVLPPTVREIVITKYGDVYVNGFGYLHLGLLDAVTINFTGHGTDDDVSGFWTIASTNFVDALIEVQGTAIQRILYCDDPVSQLKCSQVAFDLDDGFYPISSRNLLSHEQPISFVTLPSFNDHSFVNITVSASFGGHSGANLIASDTTINGFSSFCVDTRQFTISLFYNVTNSYGYVSKSQDSNCPFTLQSVNDYLSFSKFCVSTSLLASACTIDLFGYPEFGSGVKFTSLYFQFTEGELITGTPKPLEGVTDVSFMTLDVCTKYTIYGFKGEGIITLTNSSFLAGVYYTSDSGQLLALKNVTSGAVYSVTPCSFSEQAAYVDDDIVGVISSLSSSTFNSTRELPGFFYHSNDGSNCTEPVLVYSNIGVCKSGSIGYVPSQSGQVKIAPTVTGNISIPTNFSMSIRTEYLQLYNTPVSVDCATYVCNGNSRCKQLLTQYTAACKTIESALQLSARLESVEVNSMLTISEEALQLATISSFNGDGYNFTNVLGVSVYDPASGRVVHKRSFIEDLLFNKVVTNGLGTVDEDYKRCSNGRSVADLVCAQYYSGVMVLPGVVDAEKLHMYSASLIGGMALGGFTVAAALPFSYAVQARLNYLALQTDVLQRNQQLLAESFNSAIGNITSAFESVKEAISQTSKGLNTVAHALTKVQEVVNSQGAALTQLTVQLQHNFQAISSSIDDIYSRLDILSADVQVDRLITGRLSALNAFVAQTLTKYTEVQASRKLAQQKVNECVKSQSQRYGFCGGDGEHIFSLVQAAPQGLLFLHTVLVPGDFVDVIAIAGLCVNDEIALTLREPGLVLFTHELQNHTATEYFVSSRRMFEPRKPTVSDFVQIESCVVTYVNLTRDQLPDVIPDYIDVNKTLDEILASLPYRTGPSLPLDVFNATYLNLTGEIADLEQRSESLRNTTEELQSLIYNINNTLVDLEWLNRVETYIKWPWWVWLIIFIVLIFVVSLLVFCCISTGCCGCCGCCCACFSGCCRGPRLQPYEAFEKVHVQ |
AY653204.1 |
Porcine epidemic diarrhea virus strain JS-2004-2 spike glycoprotein (S) gene; complete cds |
4152bp |
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) |
Coronaviridae |
Porcine epidemic diarrhea virus |
-- |
DVSP13700076 |
AAT76147.1 |
spike glycoprotein SARS coronavirus TJF. |
1255 aa |
MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFGNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFAVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDTWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKKISNCVADYSVLYNSTFFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPALNCYWPLNDYGFYTTTGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTAIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSLLRNTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCTQLNRALSGIAAEQDRNTREVFAQVKQMYKTPTLKYFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGKCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
AY654624.1 |
SARS coronavirus TJF; complete genome |
3768bp |
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SARS coronavirus TJF |
Coronaviridae |
SARS coronavirus |
-- |
DVSP08400026 |
AAT84354.1 |
spike surface glycoprotein Human coronavirus OC43. |
1353 aa |
MFLILLISLPTAFAVIGDLKCTSDNINDKDTGPPPISTDTVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLFLNGYYPTSGSTYRNMALKGSVLLSRLWFKPPFLSDFINGIFAKVKNTKVIKDRVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPRTINSTQDGDNKLQGLLEVSVCQYNMCEYPQTICHPNLGNHRKELWHLDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGMALSHYYVMPLTCNSKLTLEYWVTPLTSRQYLLAFNQDGIIFNAVDCMSDFMSEIKCKTQSIAPPTGVYELNGYTVQPIADVYRRKPNLPNCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNKRFGFIEDSVFKPRPAGVLTNHDVVYAQHCFKAPKNFCPCKLNGSCVGSGPGKNNGIGTCPAGTNYLTCDNLCTPDPITFTGTYKCPQTKSLVGIGEHCSGLAVKSDYCGGNSCTCRPQAFLGWSADSCLQGDKCNIFANFILHDVNSGLTCSTDLQKANTDIILGVCVNYDLYGILGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYITNRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNSLTRQLQPINYFDSYLGCVVNAYNSTAISVQTCDLTVGSGYCVDYSKNRRSRGAITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMVEFIQTSSPKVTIDCAAFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVLGCLGSECSKASSRSAIEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYKGIKVLPPLLSENQISGYTLAATSASLFPPWTAAAGVPFYLNVQYRINGLGVTMDVLSQNQKLIANAFNNALYAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISASLQEILSRLDALEAEAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTARVSPGLCIAGDRGIAPKSGYFVNVNNTWMYTGSGYYYPEPITENNVVVMSTCAVNYTKAPYVMLNTSIPNLPDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQVEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLICLAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGYQELVIKTSHDD |
AY585228.1 |
Human coronavirus OC43 strain ATCC VR-759; complete genome |
4062bp |
ATGTTTTTGATACTTTTAATTTCCTTACCAACGGCTTTTGCTGTTATAGGAGATTTAAAGTGTACTTCAGATAATATTAATGATAAAGACACCGGTCCTCCTCCTATAAGTACTGATACTGTTGATGTTACTAATGGTTTGGGTACTTATTATGTTTTAGATCGTGTGTATTTAAATACTACGTTGTTTCTTAATGGTTATTACCCTACTTCAGGTTCCACATATCGTAATATGGCACTGAAGGGAAGTGTACTATTGAGCAGACTATGGTTTAAACCACCATTTCTTTCTGATTTTATTAATGGTATTTTTGCTAAGGTCAAAAATACCAAGGTTATTAAAGATCGTGTAATGTATAGTGAGTTCCCTGCTATAACTATAGGTAGTACTTTTGTAAATACATCCTATAGTGTGGTAGTACAACCACGTACAATCAATTCAACACAGGATGGTGATAATAAATTACAAGGTCTTTTAGAGGTCTCTGTTTGCCAGTATAATATGTGCGAGTACCCACAAACGATTTGTCATCCTAACCTGGGTAATCATCGCAAAGAACTATGGCATTTGGATACAGGTGTTGTTTCCTGTTTATATAAGCGTAATTTCACATATGATGTGAATGCTGATTATTTGTATTTTCATTTTTATCAAGAAGGTGGTACTTTTTATGCATATTTTACAGACACTGGTGTTGTTACTAAGTTTTTGTTTAATGTTTATTTAGGCATGGCGCTTTCACACTATTATGTCATGCCTCTGACTTGTAATAGTAAGCTTACTTTAGAATATTGGGTTACACCTCTCACTTCTAGACAATATTTACTCGCTTTCAATCAAGATGGTATTATTTTTAATGCTGTTGATTGTATGAGTGATTTTATGAGTGAGATTAAGTGTAAAACACAATCTATAGCACCACCTACTGGTGTTTATGAATTAAACGGTTACACTGTTCAGCCAATCGCAGATGTTTACCGACGTAAACCTAATCTTCCCAATTGCAATATAGAAGCTTGGCTTAATGATAAGTCGGTGCCCTCTCCATTAAATTGGGAACGTAAGACATTTTCAAATTGTAATTTTAATATGAGCAGCCTGATGTCTTTTATTCAGGCAGACTCATTTACTTGTAATAATATTGATGCTGCTAAGATATATGGTATGTGTTTTTCCAGCATAACTATAGATAAGTTTGCTATACCCAATGGCAGGAAGGTTGACCTACAATTGGGTAATTTGGGCTATTTGCAGTCATTTAACTATAGAATTGATACTACTGCAACAAGTTGTCAGTTGTATTATAATTTACCTGCTGCTAATGTTTCTGTTAGCAGGTTTAATCCTTCTACTTGGAATAAGAGATTTGGTTTTATAGAAGATTCTGTTTTTAAGCCTCGACCTGCAGGTGTTCTTACTAATCATGATGTAGTTTATGCACAACACTGTTTCAAAGCTCCTAAAAATTTCTGTCCGTGTAAATTGAATGGTTCGTGTGTAGGTAGTGGTCCTGGTAAAAATAATGGTATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGTGATAATTTGTGCACTCCTGATCCTATTACATTTACAGGTACTTATAAGTGCCCCCAAACTAAATCTTTAGTTGGCATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCTTGCTGTTAAAAGTGATTATTGTGGAGGCAATTCTTGTACTTGCCGACCACAAGCATTTTTGGGTTGGTCTGCAGACTCTTGTTTACAAGGAGACAAGTGTAATATTTTTGCTAATTTTATTTTGCATGATGTTAATAGTGGTCTTACTTGTTCTACTGATTTACAAAAAGCTAACACAGACATAATTCTTGGTGTTTGTGTTAATTATGACCTCTATGGTATTTTAGGCCAAGGCATTTTTGTTGAGGTTAATGCGACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTTTTATATGATTCTAATGGTAATCTCTACGGTTTTAGAGACTACATAACAAACAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGCTATAGCGGTCGTGTTTCTGCGGCCTTTCACGCTAACTCTTCCGAACCAGCATTGCTATTTCGGAATATTAAATGCAACTACGTTTTTAATAATAGTCTTACACGACAGCTGCAACCCATTAACTATTTTGATAGTTATCTTGGTTGTGTTGTCAATGCTTATAATAGTACTGCTATTTCTGTTCAAACATGTGATCTCACAGTAGGTAGTGGTTACTGTGTGGATTACTCTAAAAACAGACGAAGTCGTGGAGCGATTACCACTGGTTATCGGTTTACTAATTTTGAGCCATTTACTGTTAATTCAGTAAACGATAGTTTAGAACCTGTAGGTGGTTTGTATGAAATTCAAATACCTTCAGAGTTTACTATAGGTAATATGGTGGAGTTTATTCAAACAAGCTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTGCTGCATTTGTCTGTGGTGATTATGCAGCATGTAAATCACAGTTGGTTGAATATGGTAGTTTCTGTGATAACATTAATGCCATACTCACAGAAGTAAATGAACTACTTGACACTACACAGTTGCAAGTAGCTAATAGTTTAATGAATGGTGTTACTCTTAGCACTAAGCTTAAAGATGGCGTTAATTTCAATGTAGACGACATCAATTTTTCCCCTGTATTAGGTTGTCTAGGCAGCGAATGTAGTAAAGCTTCCAGTAGATCTGCTATAGAGGATTTACTTTTTGATAAAGTAAAGTTATCTGATGTCGGTTTTGTTGAGGCTTATAATAATTGTACAGGAGGTGCCGAAATTAGGGACCTCATTTGTGTGCAAAGTTATAAAGGCATCAAAGTGTTGCCTCCACTGCTCTCAGAAAATCAGATCAGTGGATACACTTTGGCTGCCACCTCTGCTAGTCTATTTCCTCCTTGGACAGCAGCAGCAGGTGTACCATTTTATTTAAATGTTCAGTATCGCATTAATGGGCTTGGTGTCACCATGGATGTGCTAAGTCAAAATCAAAAGCTTATTGCTAATGCATTTAACAATGCCCTTTATGCTATTCAGGAAGGGTTCGATGCAACTAATTCTGCTTTAGTTAAAATTCAAGCTGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCTCTTAATAACTTATTGCAACAACTCTCTAATAGATTTGGTGCTATAAGTGCTTCTTTACAAGAAATTCTATCTAGACTTGATGCTCTTGAAGCGGAAGCTCAGATAGATAGACTTATTAATGGTCGTCTTACCGCTCTTAATGCTTATGTTTCTCAACAGCTTAGTGATTCTACACTGGTAAAATTTAGTGCAGCACAAGCTATGGAGAAGGTTAATGAATGTGTCAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTCTGTGGTAATGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCATATGGTTTGTATTTTATCCACTTTAGTTATGTCCCTACTAAGTATGTCACAGCGAGGGTTAGTCCTGGTCTGTGCATTGCTGGTGATAGAGGTATAGCTCCTAAGAGTGGTTATTTTGTTAATGTAAATAATACTTGGATGTACACTGGTAGTGGTTACTACTACCCTGAACCTATAACTGAAAATAATGTTGTTGTTATGAGTACCTGCGCTGTTAATTATACTAAAGCGCCGTATGTAATGCTGAACACTTCAATACCCAACCTTCCTGATTTTAAGGAAGAGTTGGATCAATGGTTTAAAAATCAAACATCAGTGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATAAATGTTACATTCTTGGACCTACAAGTTGAAATGAATAGGTTACAGGAGGCAATAAAAGTCTTAAATCAGAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACATATGAATATTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATCTGCCTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGTTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGTTTTAAGAAATGTGGTGGTTGTTGTGATGATTATACTGGATACCAGGAGTTAGTAATCAAAACTTCACATGACGACTAA |
Human coronavirus OC43 (HCoV-OC43) |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
DVSP08400027 |
AAT84362.1 |
spike surface glycoprotein Human coronavirus OC43. |
1353 aa |
MFLILLISLPTAFAVIGDLKCTSDNINDKDTGPPPISTDTVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLFLNGYYPTSGSTYRNMALKGSVLLSRLWFKPPFLSDFINGIFAKVKNTKVIKDRVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPRTINSTQDGDNKLQGLLEVSVCQYNMCEYPQTICHPNLGNHRKELWHLDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGMALSHYYVMPLTCNSKLTLEYWVTPLTSRQYLLAFNQDGIIFNAVDCMSDFMSEIKCKTQSIAPPTGVYELNGYTVQPIADVYRRKPNLPNCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNKRFGFIEDSVFKPRPAGVLTNHDVVYAQHCFKAPKNFCPCKLNGSCVGSGPGKNNGIGTCPAGTNYLTCDNLCTPDPITFTGTYKCPQTKSLVGIGEHCSGLAVKSDYCGGNSCTCRPQAFLGWSADSCLQGDKCNIFANFILHDVNSGLTCSTDLQKANTDIILGVCVNYDLYGILGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYITNRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNSLTRQLQPINYFDSYLGCVVNAYNSTAISVQTCDLTVGSGYCVDYSKNRRSRGAITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMVEFIQTSSPKVTIDCAAFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVLGCLGSECSKASSRSAIEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYKGIKVLPPLLSENQFSGYTLAATSASLFPPWTAAAGVPFYLNVQYRINGLGVTMDVLSQNQKLIANAFNNALYAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISASLQEILSRLDALEAEAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTARVSPGLCIAGDRGIAPKSGYFVNVNNTWMYTGSGYYYPEPITENNVVVMSTCAVNYTKAPYVMLNTSIPNLPDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQVEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLICLAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGYQELVIKTSHDD |
AY585229.1 |
Human coronavirus OC43 serotype OC43-Paris; complete genome |
4062bp |
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Human coronavirus OC43 (HCoV-OC43) |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
-- |
DVSP08400028 |
AAT98580.1 |
spike glycoprotein Human coronavirus HKU1. |
1356 aa |
MLLIIFILPTTLAVIGDFNCTNFAINDLNTTVPRISEYVVDVSYGLGTYYILDRVYLNTTILFTGYFPKSGANFRDLSLKGTTYLSTLWYQKPFLSDFNNGIFSRVKNTKLYVNKTLYSEFSTIVIGSVFINNSYTIVVQPHNGVLEITACQYTMCEYPHTICKSKGSSRNESWHFDKSEPLCLFKKNFTYNVSTDWLYFHFYQERGTFYAYYADSGMPTTFLFSLYLGTLLSHYYVLPLTCNAISSNTDNETLQYWVTPLSKRQYLLKFDNRGVITNAVDCSSSFFSEIQCKTKSLLPNTGVYDLSGFTVKPVATVHRRIPDLPDCDIDKWLNNFNVPSPLNWERKIFSNCNFNLSTLLRLVHTDSFSCNNFDESKIYGSCFKSIVLDKFAIPNSRRSDLQLGSSGFLQSSNYKIDTTSSSCQLYYSLPAINVTINNYNPSSWNRRYGFNNFNLSSHSVVYSRYCFSVNNTFCPCAKPSFASSCKSHKPPSASCPIGTNYRSCESTTVLDHTDWCRCSCLPDPITAYDPRSCSQKKSLVGVGEHCAGFGVDEEKCGVLDGSYNVSCLCSTDAFLGWSYDTCVSNNRCNIFSNFILNGINSGTTCSNDLLQPNTEVFTDVCVDYDLYGITGQGIFKEVSAVYYNSWQNLLYDSNGNIIGFKDFVTNKTYNIFPCYAGRVSAAFHQNASSLALLYRNLKCSYVLNNISLTTQPYFDSYLGCVFNADNLTDYSVSSCALRMGSGFCVDYNSPSSSSSRRKRRSISASYRFVTFEPFNVSFVNDSIESVGGLYEIKIPTNFTIVGQEEFIQTNSPKVTIDCSLFVCSNYAACHDLLSEYGTFCDNINSILDEVNGLLDTTQLHVADTLMQGVTLSSNLNTNLHFDVDNINFKSLVGCLGPHCGSSSRSFFEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGSEIRDLLCVQSFNGIKVLPPILSESQISGYTTAATVAAMFPPWSAAAGIPFSLNVQYRINGLGVTMDVLNKNQKLIATAFNNALLSIQNGFSATNSALAKIQSVVNSNAQALNSLLQQLFNKFGAISSSLQEILSRLDALEAQVQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDISLVKFGAALAMEKVNECVKSQSPRINFCGNGNHILSLVQNAPYGLLFMHFSYKPISFKTVLVSPGLCISGDVGIAPKQGYFIKHNDHWMFTGSSYYYPEPISDKNVVFMNTCSVNFTKAPLVYLNHSVPKLSDFESELSHWFKNQTSIAPNLTLNLHTINATFLDLYYEMNLIQESIKSLNNSYINLKDIGTYEMYVKWPWYVWLLISFSFIIFLVLLFFICCCTGCGSACFSKCHNCCDEYGGHHDFVIKTSHDD |
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Human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1) |
Coronaviridae |
Human coronavirus |
Homo sapiens |
DVSP05600001 |
AAU04646.1 |
spike glycoprotein Civet SARS CoV 007/2004. |
1255 aa |
MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFDNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFVVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGIKITNFRAILTAFSPAQGTWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKRISNCVADYSVLYNSTSFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSSDGKPCTPPAPNCYWPLRGYGFYTTSGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTLIHAEQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSSLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCRQLNRALSGIAAEQDRNTREVFVQVKQMYKTPTLKDFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFSGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQEEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
AY572034.1 |
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Civet SARS CoV 007/2004 |
Coronaviridae |
Civet SARS CoV |
civet |
DVSP13700077 |
AAU04649.1 |
spike glycoprotein SARS coronavirus civet010. |
1255 aa |
MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFDNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFVVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGIKITNFRAILTAFSPAQGTWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKRISNCVADYSVLYNSTSFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSSDGKPCTPPAPNCYWPLRGYGFYTTSGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTLIHAEQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSSLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCRQLNRALSGIAAEQDRNTREVFVQVKQMYKTPTLKDFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQEEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
AY572035.1 |
SARS coronavirus civet010; complete genome |
3768bp |
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AY572037.1 |
SARS coronavirus civet019 spike glycoprotein gene; complete cds |
3768bp |
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SARS coronavirus civet020; complete genome |
3768bp |
ATGTTTATTTTCTTATTATTTCTTACTCTCACTAGTGGTAGTGACCTTGACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCTATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAGGATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATTAATCATACGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTTGCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAACAAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAACTTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGTTGTTTCTAAACCCATGGGTACACGGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCTGATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTTGTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTAGTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGTATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTCACCTGCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTAAAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGATTGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAAGGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCTAATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTCTATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAACTCAACATCTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTTTGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATAGCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATGGGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAATTATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAATGTGCCTTTCTCTCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCTCCTAATTGTTATTGGCCATTAAGAGGTTATGGTTTTTACACCACTAGTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTTGTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCCACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGTGTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCTGATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGCTCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTTCTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACATTAATTCATGCAGAACAACTCACACCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTTATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATTTGTGCTAGTTACCATACAGTTTCTTCATTACGTAGTACTAGCCAAAAATCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAACACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCTATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCTAATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCAGACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATTGCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGTTCAAGTCAAACAAATGTACAAAACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTAAAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGATGCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATTTGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATTGCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCTGGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGAGTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCGATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGACGTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAGGTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAACAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCTGAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAGGGCTACCACCTTATGTCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCCCAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCTCGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTTTCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATTGGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAAGAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCAGGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAGAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCTAAAAATTTAAATGAATCACTCATCGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATTAAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTTACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGTGGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTACATTACACATAA |
SARS coronavirus civet020 |
Coronaviridae |
SARS coronavirus |
civet |
DVSP21400023 |
AAU06356.1 |
spike glycoprotein Murine hepatitis virus. |
1324 aa |
MLFVFILFLPSCLGYIGDFRCIQLVNSNGANVSAPSISTETVEVSQGLGTYYVLDRVYLNATLLLTGYYPVDGSKFRNLALTGTNSVSLSWFQPPYLSQFNDGIFAKVQNLKTSTPSGATAYFPTIVIGSLFGYTSYTVVIEPYNGVIMASVCQYTICQLPYTDCKPNTNGNKLIGFWHTDVKPPICVLKRNFTLNVNADAFYFHFYQHGGTFYAYYADKPSATTFLFSVYIGDILTQYYVLPFICNPTAGSTFAPRYWVTPLVKRQYLFNFNQKGVITSAVDCASSYTSEIKCKTQSMLPSTGVYELSGYTVQPVGVVYRRVANLPACNIEEWLTARSVPSPLNWERKTFQNCNFNLSSLLRYVQAESLFCNNIDASKVYGRCFGSISVDKFAVPRSRQVDLQLGNSGFLQTANYKIDTAATSCQLHYTLPKNNVTINNHNPSSWNRRYGFNDAGVFGKNQHDVVYAQQCFTVRSSYCPCAQPDIVSPCTTQTKPKSAFVNVGDHCEGLGVLEDNCGNADPHKGCICANNSFIGWSHDTCLVNDRCQIFANILLNGINSGTTCSTDLQLPNTEVVTGICVKYDLYGITGQGVFKEVKADYYNSWQTLLYDVNGNLNGFRDLTTNKTYTIRSCYSGRVSAAFHKDAPEPALLYRNINCSYVFSNNISREENPLNYFDSYLGCVVNADNRTDEALPNCDLRMGAGLCVDYSKSRRAHRSVSTGYRLTTFEPYTPMLVNDSVQSVDGLYEMQIPTNFTIGHHEEFIQTRSPKVTIDCAAFVCGDNTACRQQLVEYGSFCVNVNAILNEVNNLLDNMQLQVASALMQGVTISSRLPDGISGPIDDINFSPLLGCIGSTCAEDGNGPSAIRGRSAIEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGQEVRDLLCVQSFNGIKVLPPVLSESQISGYTTGATAAAMFPPWSAAAGVPFSLSVQYRINGLGVTMNVLSENQKMIASAFNNALGAIQDGFDATNSALGKIQSVVNANAEALNNLLNQLSNRFGAISASLQEILTRLEAVEAKAQIDRLINGRLTALNAYISKQLSDSTLIKVSAAQAIEKVNECVKSQTTRINFCGNGNHILSLVQNAPYGLYFIHFSYVPISFTTANVSPGLCISGDRGLAPKAGYFVQDDGEWKFTGSSYYYPEPITDKNSVIMSSCAVNYTKAPEVFLNTSIPNPPDFKEELDKWFKNQTSIAPDLSLDFEKLNVTLLDLTYEMNRIQDAIKKLNESYINLKEVGTYEMYVKWPWYVWLLIGLAGVAVCVLLFFICCCTGCGSCCFKKCGNCCDEYGGHQDSIVIHNISSHED |
AY700211.1 |
Murine hepatitis virus strain A59; complete genome |
3975bp |
ATGCTGTTCGTGTTTATTCTATTTTTGCCCTCTTGTTTAGGGTATATTGGTGATTTTAGATGTATCCAGCTTGTGAATTCAAACGGTGCTAATGTTAGTGCTCCAAGCATTAGCACTGAGACCGTTGAAGTTTCACAAGGCCTGGGGACATATTATGTGTTAGATCGAGTTTATTTAAATGCCACATTATTGCTTACTGGTTACTACCCGGTCGATGGTTCTAAGTTTAGAAACCTCGCTCTTACGGGAACTAACTCAGTTAGCTTGTCGTGGTTTCAACCACCCTATTTAAGTCAGTTTAATGATGGCATATTTGCGAAGGTGCAGAACCTTAAGACAAGTACGCCATCAGGTGCAACTGCATATTTTCCTACTATAGTTATAGGTAGTTTGTTTGGCTATACTTCCTATACCGTTGTAATAGAGCCATATAATGGTGTTATAATGGCCTCAGTGTGCCAGTATACCATTTGTCAGTTACCTTACACTGATTGTAAGCCTAACACTAATGGTAATAAATTAATAGGGTTTTGGCACACGGATGTAAAACCCCCAATTTGTGTGTTAAAGCGAAATTTCACGCTTAATGTTAATGCTGATGCATTTTATTTTCATTTTTACCAACATGGTGGTACTTTTTATGCGTACTATGCGGATAAACCCTCCGCTACTACGTTTTTGTTTAGTGTATATATTGGCGATATTTTAACACAGTATTATGTGTTACCTTTCATCTGCAACCCAACAGCTGGTAGCACTTTTGCTCCGCGCTATTGGGTTACACCTTTGGTTAAGCGCCAATATTTGTTTAATTTCAACCAGAAGGGTGTCATTACTAGTGCTGTTGATTGTGCTAGTAGTTATACCAGTGAAATAAAATGTAAGACCCAGAGCATGTTACCTAGCACTGGTGTCTATGAGTTATCCGGTTATACGGTCCAACCAGTTGGAGTTGTATACCGGCGTGTTGCTAACCTCCCAGCTTGTAATATAGAGGAGTGGCTTACTGCTAGGTCAGTCCCCTCCCCTCTCAACTGGGAGCGTAAGACTTTTCAGAATTGTAATTTTAATTTAAGCAGCCTGTTACGTTATGTTCAGGCTGAGAGTTTGTTTTGTAATAATATCGATGCTTCCAAAGTGTATGGCAGGTGCTTTGGTAGTATTTCAGTTGATAAGTTTGCTGTACCCCGAAGTAGGCAAGTTGATTTACAGCTTGGTAACTCTGGATTTCTGCAGACTGCTAATTATAAGATTGATACAGCTGCCACTTCGTGTCAGCTGCATTACACCTTGCCTAAGAATAATGTCACCATAAACAACCATAACCCCTCGTCTTGGAATAGGAGGTATGGCTTTAATGATGCTGGCGTCTTTGGCAAAAACCAACATGACGTTGTTTACGCTCAGCAATGTTTTACTGTAAGATCTAGTTATTGCCCGTGTGCTCAACCGGACATAGTTAGCCCTTGCACTACTCAGACTAAGCCTAAGTCTGCTTTTGTTAATGTGGGTGACCATTGTGAAGGCTTAGGTGTTTTAGAAGATAATTGTGGCAATGCTGATCCACATAAGGGTTGTATCTGTGCCAACAATTCATTTATTGGATGGTCACATGATACCTGCCTTGTTAATGATCGCTGCCAAATTTTTGCTAATATATTGTTAAATGGCATTAATAGTGGTACCACATGTTCCACAGATTTGCAGTTGCCTAATACTGAAGTGGTTACTGGCATTTGTGTCAAATATGACCTCTACGGTATTACTGGACAAGGTGTTTTTAAAGAGGTTAAGGCTGACTATTATAATAGCTGGCAAACCCTTCTGTATGATGTTAATGGTAATTTGAATGGTTTTCGTGATCTTACCACTAACAAGACTTATACGATAAGGAGCTGTTATAGTGGCCGTGTTTCTGCTGCATTTCATAAAGATGCACCCGAACCGGCTCTGCTCTATCGTAATATAAATTGTAGCTATGTTTTTAGCAATAATATTTCCCGTGAGGAGAACCCACTTAATTACTTTGATAGTTATTTGGGTTGTGTTGTTAATGCTGATAACCGCACGGATGAGGCGCTTCCTAATTGTGATCTCCGTATGGGTGCTGGCTTATGCGTTGATTATTCAAAATCACGCAGGGCTCACCGATCAGTTTCTACTGGCTATCGGTTAACTACATTTGAGCCATACACTCCGATGTTAGTTAATGATAGTGTCCAATCCGTTGATGGATTATATGAGATGCAAATACCAACCAATTTTACTATTGGGCACCATGAGGAGTTCATTCAAACTAGATCTCCAAAGGTGACTATAGATTGTGCTGCATTTGTCTGTGGTGATAACACTGCATGCAGGCAGCAGTTGGTTGAGTATGGCTCTTTCTGTGTTAATGTTAATGCCATTCTTAATGAGGTTAATAACCTCTTGGATAATATGCAACTACAAGTTGCTAGTGCATTAATGCAGGGTGTTACTATAAGCTCGAGACTGCCAGACGGCATCTCAGGCCCTATAGATGACATTAATTTTAGTCCTCTACTTGGATGCATAGGTTCAACATGTGCTGAAGACGGCAATGGACCTAGTGCAATCCGAGGGCGTTCTGCTATAGAGGATTTGTTATTTGACAAGGTCAAATTATCTGATGTTGGCTTTGTCGAGGCTTATAATAATTGCACCGGTGGTCAAGAAGTTCGTGACCTCCTTTGTGTACAATCTTTTAATGGCATCAAAGTATTACCTCCTGTGTTGTCAGAGAGTCAGATCTCTGGCTACACAACCGGTGCTACTGCGGCAGCTATGTTCCCACCGTGGTCAGCAGCTGCCGGTGTGCCATTTAGTTTAAGTGTTCAATATAGAATTAATGGTTTAGGTGTCACTATGAATGTGCTTAGTGAGAACCAAAAGATGATTGCTAGTGCTTTTAACAATGCGCTGGGTGCTATCCAGGATGGGTTTGATGCAACCAATTCTGCTTTAGGTAAGATCCAGTCCGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCACTCAATAACTTACTAAATCAACTTTCTAACAGGTTTGGTGCTATTAGTGCTTCTTTACAAGAAATTCTAACTCGGCTTGAGGCTGTAGAAGCAAAAGCCCAGATAGATCGTCTTATTAATGGCAGGTTAACTGCACTTAATGCGTATATATCCAAGCAACTTAGTGATAGTACGCTTATTAAAGTTAGTGCTGCTCAGGCCATAGAAAAGGTCAATGAGTGCGTTAAGAGCCAAACCACGCGTATTAATTTCTGTGGCAATGGTAATCATATATTATCTCTTGTCCAGAATGCGCCTTATGGCTTATATTTTATACACTTCAGCTATGTGCCAATATCCTTTACAACCGCAAATGTGAGTCCTGGACTTTGCATTTCTGGTGATAGAGGATTAGCACCTAAAGCTGGATATTTTGTTCAAGATGATGGAGAATGGAAGTTCACAGGCAGTTCATATTACTACCCTGAACCCATTACAGATAAAAACAGTGTCATTATGAGTAGTTGCGCAGTAAACTACACAAAGGCACCTGAAGTTTTCTTGAACACTTCAATACCTAATCCACCCGACTTTAAGGAGGAGTTAGATAAATGGTTTAAGAATCAGACGTCTATTGCGCCTGATTTATCTCTCGATTTCGAGAAGTTAAATGTTACTTTGCTGGACCTGACGTATGAGATGAACAGGATTCAGGATGCAATTAAGAAGTTAAATGAGAGCTACATCAACCTCAAGGAAGTTGGCACATATGAAATGTATGTGAAATGGCCTTGGTATGTTTGGTTGCTAATTGGATTAGCTGGTGTAGCTGTTTGTGTGTTGTTATTCTTTATATGTTGCTGCACAGGTTGTGGCTCATGTTGTTTTAAGAAGTGTGGAAATTGTTGTGATGAGTATGGAGGACACCAGGACAGTATTGTGATACATAATATTTCCTCTCATGAGGATTGA |
Murine hepatitis virus |
hepatitis virus |
Murine hepatitis virus |
-- |
DVSP08800323 |
AAU09490.1 |
spike protein Infectious bronchitis virus. |
1162 aa |
MLVTSLLLVTLLCALCSAVLYDSSSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYAVVNISSESNNAGSSSGCTVGIIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHVGCPITGMLQQHSIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYPTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNETTDVTSAGVYFKAGGPITYKVMREVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHNFTFHNETGANPNPSGVQNIQTYQTQTAQSGYYNFNFSFLSSFVYKESNFMYGSYHPSCNFRLETINNGLWFNSLSVSIAYGPLQGGCKQSVFSGRATCCYAYSYGGPLLCKGVYSGELDHNFECGLLVYVTKSGGSRIQTATEPPVITRHNYNNITLNTCVDYNIYGRTGQGFITNVTDSAVSYNYLADAGLAILDTSGSIDIFVVQSEYGLNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQLLENQFYIKITNGTRRFRRSITESVENCPYVSYGKFCIKPDGSIATIVPKQLEQFVAPLLNVTENVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYICGNSLECRNLFQQYGPVCDNILSVVNSVGQKEDMELLNFYSSTKPAGFNTPVLSNVSTGEFNISLFLTTPSSPRRRSFIEDLLFTSVESVGLPTDDAYKNCTAGPLGFLKDLVCAREYNGLLVLPPIITAEMQTLYTSSLVASMAFGGITAAGAIPFATQLQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQIQDVVNKQSAILTETMASLNKNFGAISSVIQEIYQQLDAIQANAQVDRLITGRLSSLSVLASAKHAEYDRGLQQRELATQKINECVKSQSIRYSFCGNGRHVLTIPQNAPNGIVFIHFSYTPDSFVNVTAMVGFCVKPANASQYAIVPANGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRAITAGDIVTLTSCQVNYVSVNKTVITTFVDNDDFDFNDELSKWWNDTKHELPDFDKFNYTVPILDIDSEIDRIQGVIQGLNDSLIDLEKLSILKTYIKWPWYVWLAIAFATIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIMPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV |
AY702085.1 |
Avian infectious bronchitis virus strain LKQ3 spike protein; 3a protein; 3b protein; 3c protein; membrane protein; 5a protein; 5b protein; and nucleocapsid protein genes; complete cds |
3489bp |
ATGTTGGTAACATCTCTTTTACTAGTGACTCTTTTGTGTGCACTATGTAGTGCTGTTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGTTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGGGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGTTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGCATTCTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTTTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGAGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACAATTTCACTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCAAATCCTAGTGGTGTCCAGAATATTCAAACTTACCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTTTCCTTTCTGAGTAGTTTTGTTTATAAGGAGTCTAATTTTATGTATGGATCTTATCACCCAAGTTGTAATTTTAGACTAGAAACTATTAATAATGGTTTGTGGTTTAATTCACTTTCAGTTTCAATTGCTTACGGTCCTCTTCAAGGTGGTTGCAAGCAATCTGTCTTTAGTGGTAGAGCAACCTGTTGTTATGCTTACTCATATGGAGGTCCTTTGCTGTGTAAAGGTGTTTATTCAGGTGAGTTAGATCATAATTTTGAATGTGGACTGTTAGTTTATGTTACTAAGAGCGGTGGCTCTCGTATACAAACAGCCACTGAACCGCCAGTTATAACTCGACACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAACTGGCCAAGGTTTTATTACTAATGTAACCGACTCAGCTGTTAGTTATAATTATCTAGCAGACGCAGGTTTGGCTATTTTAGATACATCTGGTTCCATAGACATCTTTGTCGTACAAAGTGAATATGGTCTTAATTATTATAAGGTTAACCCTTGCGAAGATGTCAACCAGCAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACTTCACGTAATGAGACTGGTTCCCAGCTTCTTGAGAATCAGTTTTACATCAAAATCACTAATGGAACACGTCGTTTTAGACGTTCTATTACTGAAAGTGTTGAAAATTGCCCTTATGTTAGTTATGGTAAGTTTTGTATAAAACCTGATGGCTCAATTGCCACAATAGTACCAAAACAATTGGAACAGTTTGTGGCACCTTTACTTAATGTTACTGAAAATGTGCTCATACCTAACAGTTTTAATTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACGCGTATGGATAAGGTCCAAATTAATTGCCTGCAGTATATTTGTGGCAATTCTCTGGAGTGCAGAAATTTGTTTCAACAATATGGTCCTGTTTGCGACAACATATTGTCTGTAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTGAATTTCTATTCTTCTACTAAGCCGGCTGGTTTTAATACACCAGTTCTTAGTAATGTTAGCACTGGTGAGTTTAATATTTCTCTTTTTTTAACAACGCCTAGTAGTCCTAGAAGGCGTTCTTTTATTGAAGACCTTCTATTTACAAGTGTTGAATCTGTTGGATTACCAACAGATGACGCATACAAAAATTGCACTGCAGGTCCTTTAGGCTTTCTTAAGGACCTTGTATGTGCTCGTGAATATAATGGTTTGCTTGTGTTGCCTCCTATTATAACAGCAGAAATGCAAACTTTGTATACTAGTTCTCTAGTAGCTTCTATGGCTTTTGGTGGTATTACTGCAGCTGGTGCTATACCTTTTGCCACACAACTGCAGGCTAGAATTAATCACTTGGGTATTACCCAGTCACTTCTTTTGAAGAATCAAGAAAAAATTGCTGCTTCCTTTAATAAGGCCATCGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGAAGTACATCTTTAGCATTACAACAAATTCAAGATGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACTGAGACTATGGCATCACTTAATAAAAATTTTGGTGCCATTTCTTCTGTGATTCAAGAAATCTACCAGCAACTTGACGCCATACAAGCAAATGCTCAAGTGGATCGTCTTATAACTGGTAGATTGTCATCACTTTCTGTTTTAGCATCTGCTAAGCACGCGGAGTACGATCGAGGGTTACAACAGCGTGAGTTAGCTACTCAGAAGATTAATGAGTGTGTTAAGTCACAGTCCATTAGGTACTCCTTTTGTGGTAATGGACGACATGTTTTAACCATACCGCAAAATGCACCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTTCTTACACTCCAGATAGTTTTGTTAATGTTACTGCAATGGTGGGTTTTTGTGTAAAGCCAGCTAATGCTAGTCAGTATGCAATAGTACCCGCTAATGGTAGGGGTATTTTTATACAAGTTAATGGTAGTTACTACATCACTGCACGAGATATGTATATGCCAAGAGCTATTACTGCAGGAGATATAGTTACGCTTACTTCTTGTCAAGTAAATTATGTAAGTGTAAATAAGACCGTCATTACTACATTCGTAGACAATGATGATTTTGATTTTAATGACGAATTGTCAAAATGGTGGAATGATACTAAGCATGAGCTACCAGACTTTGACAAATTCAATTACACAGTACCTATACTTGACATTGATAGTGAAATTGATCGTATTCAAGGCGTTATACAGGGTCTTAATGACTCTCTAATAGACCTTGAAAAACTTTCAATACTCAAAACTTATATTAAGTGGCCTTGGTATGTGTGGTTAGCCATAGCTTTTGCCACTATTATCTTCATCTTAATATTAGGATGGGTTTTCTTCATGACTGGGTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGCATTATGCCTCTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTATTACACGACTTTTGATAACGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
peafowl |
DVSP08800324 |
AAU14248.1 |
S protein Infectious bronchitis virus. |
1165 aa |
MLGKSLFLVTILCALCSANLFDSANNYVYYYQNAFRPPNGWHLQGGAYAVVNSTNYTNNAGSVNECTIGVIKDVYNYSAAAIAMTAPLQGMAWSKSQFCSAHCNFSEITVFVTHCYSSGSGSCPITGMIPQGHIRISAMKNGSLFYNLTVSVSKYPNFKSFQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNATTGVKSAGVYFKAGGPVNYNIMKEFKVLAYFVNGTVQDVILCDDTPRGLLACQYNNGNFSDGFYPFTNSSLVKEKFIVYRENSVNTTLTLTNYTFYNVANASPNRGGVQSIPTYQTQTAQSGYYNFNLSFLSSFVYKESNYMYGSYHPACNFRLETINNGLWFNSLSVSLAYGPFQGGCKQSVFSSRATCCYAYSYNGPRACKGVYAGELLQNFECGLLVYVTKSDGSRIQTATVPPVVTQHNYNNITLNTCVDYNIYGRVGRGFITNVTDSSSSYNYLADAGLAILDTSGAIDIFVVQGEHGLNYYKVNPCEDVNHQFVVSGGKLVGILTSRNATGSQPLENQFYIKLTKETRRFRRSTSDNVTSCPYVTYGRFCIQPDGSIKQIVPQELENFVAPLLNVTENVLIPSSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYVCGNSLDCRKLFQQYGPVCDNILSIVNSVGQKEDMELLTFYSSTKPAGYNAPVFSNISTGDFNISLLLTPPSSPSGRSFIEDLLFTSVETVGLPTDAEYKKCTAGPLGTLKDLICAREYNGLLVLPPIITADMQTMYTASLVGAMAFGGITAAGAIPFATQIQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQVQDVVNKQSAILTETMNSLNKNFGAISSVIQDIYAQLDAIQADAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQSEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSNRYGFCGSGRHVLSIPQNAPNGIVFIHFTYTPQSFVNVTAIVGFCVQPANASQYAIVPVNGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVNVNKTVITTFVEDDDFDFDDELSKWWNDTKHELPDFDDFNYTVPILNISGEIDRIQGVIQGLNDSLIDLEELSIIKTYIKWPWYVWLAIGFAVIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV |
AY702975.1 |
Avian infectious bronchitis virus isolate LDT3 S protein (S); 3a protein (3a); 3b protein (3b); envelope protein (E); M protein (M); 5a protein (5a); 5b protein (5b); and nucleocapsid protein (N) genes; complete cds |
3498bp |
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Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP13700081 |
AAU81608.1 |
S protein SARS Coronavirus CDC#200301157. |
1255 aa |
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AY714217.1 |
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SARS Coronavirus CDC#200301157 |
Coronaviridae |
SARS coronavirus |
-- |
DVSP13700082 |
AAU93318.1 |
spike glycoprotein SARS coronavirus PC4-127. |
1255 aa |
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SARS coronavirus PC4-127 spike glycoprotein gene; complete cds |
3768bp |
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SARS coronavirus PC4-127 |
Coronaviridae |
SARS coronavirus |
-- |
DVSP13700083 |
AAU93319.1 |
spike glycoprotein SARS coronavirus PC4-205. |
1255 aa |
MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFDNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQTVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFVVSKPMGTRTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDTWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKRISNCVADYSVLYNSTSFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPAPNCYWPLRGYGFYTTSGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTLIHAEQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSSLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCRQLNRALSGIAAEQDRNTREVFVQVKQMYKTPTLKDFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQEEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
AY613952.1 |
SARS coronavirus PC4-205 spike glycoprotein gene; complete cds |
3768bp |
ATGTTTATTTTCTTATTATTTCTTACTCTCACTAGTGGTAGTGACCTTGACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCTATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAGGATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATTAATCATACGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTTGCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAACAAGTCACAGACGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAACTTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGTTGTTTCTAAACCCATGGGTACACGGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCTGATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTTGTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTAGTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGTATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTCACCTGCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTAAAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGATTGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAAGGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCTAATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTCTATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAACTCAACATCTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTTTGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATAGCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATGGGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAATTATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAATGTGCCTTTCTCTCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCTCCTAATTGTTATTGGCCATTAAGAGGTTATGGTTTTTACACCACTAGTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTTGTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCCACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGTGTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCTGATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGCTCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTTCTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACATTAATTCATGCAGAACAACTCACACCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTTATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATTTGTGCTAGTTACCATACAGTTTCTTCATTACGTAGTACTAGCCAAAAATCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAACACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCTATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCTAATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCAGACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATTGCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGTTCAAGTCAAACAAATGTACAAAACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTAAAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGATGCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATTTGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATTGCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCTGGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGAGTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCGATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGACGTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAGGTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAACAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCTGAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAGGGCTACCACCTTATGTCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCCCAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCTCGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTTTCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATTGGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAAGAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCAGGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAGAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCTAAAAATTTAAATGAATCACTCATCGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATTAAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTTACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGTGGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTACATTACACATAA |
SARS coronavirus PC4-205 |
Coronaviridae |
SARS coronavirus |
-- |
DVSP13700084 |
AAU93320.1 |
spike glycoprotein SARS coronavirus GZ0403. |
1255 aa |
MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFDNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFVVSKPMGTRTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDTWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKRISNCVADYSVLYNSTSFSTLKCYGVSATKLNDLCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSKILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTLIHAEQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYERDIPIGAGICASYHTVSLLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCRQLNRALSGIAAEQDRNTREVFVQVKQMYKTPTLKDFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHFMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQEEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
AY613953.1 |
SARS coronavirus GZ0403 spike glycoprotein gene; complete cds |
3768bp |
ATGTTTATTTTCTTATTATTTCTTACTCTCACTAGTGGTAGTGACCTTGACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCTATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAGGATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATTAATCATACGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTTGCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAACAAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAACTTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGTTGTTTCTAAACCCATGGGTACACGGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCTGATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGGGAGTTTGTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTAGTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGTATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTCACCTGCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTAAAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGATTGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAAGGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCTAATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTCTATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAACTCAACATCTTTTTCAACCCTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTTGTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCCACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGTGTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCTGATTTCACTGATTCCGTTCGGGATCCTAAAACATCTAAAATATTAGACATTTCACCTTGCTCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTTCTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACATTAATTCATGCAGAACAACTCACACCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTTATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGCGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATTTGTGCTAGTTACCATACAGTTTCCTTATTACGTAGTACTAGCCAAAAATCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCATACTCTAATAACACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCTATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCTAATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCAGACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATTGCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGTTCAAGTCAAACAAATGTACAAAACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTAAAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGATGCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATTTGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATTGCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCTGGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGAGTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCGATTAGTCAGATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGACGTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAGGTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAACAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCTGAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAGGGCTACCACTTTATGTCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCCCAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCTCGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTTTCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATTGGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAAGAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCAGGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAGAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCTAAAAATTTAAATGAATCACTCATCGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATTAAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTTACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGTGGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTACATTACACATAA |
SARS coronavirus GZ0403 |
Coronaviridae |
SARS coronavirus |
-- |
DVSP08800325 |
AAV28722.1 |
S protein Infectious bronchitis virus. |
1162 aa |
MLVTPLLLVTLLCALCSAVLYDSSSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYAVANISSESNNAGSSSGCTVGIIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQHSIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYPTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNETTDVTSAGVYFKAGGPITYKVMREVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHNFTFHNETGANPNPSGVQNIQTYQTQTAQSGYYNFNFSFLSSFVYKESNFMYGSYYPSCNFRLETINNGLWFNSLSVSIAYGPLQGGCKQSVFSGRATCCYAYSYGGPLLCKGVYSGELDHNFECGLLVYVTKSGGSRIQTATEPPVITQHNYNNITLNTCVDYNIYGRTGQGFITNVTDSAVSYNYLADAGLAILDTSGSIDIFVVQSEYGLNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQLLENQFYIKITNGTRRFRRSITESVENCPYVSYGKFCIKPDGSIATIVPKQLEQFVAPLLNVTENVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYICGNSLECRNLFQQYGPVCDNILSVVNSVGQKEDMELLNFYSSTKPAGFNTPVLSNVSTGEFNISLFLTTPSSPRRRSFIEDLLFTSVESVGLPTDDAYKNCTAGPLGFLKDLVCAREYNGLLVLPPIITAEMQTLYTSSLVASMAFGGITAAGAIPFATQLQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQIQDVVNKQSAILTETMASLNKNFGAISSVIQEIYQQLDAIQANAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQAEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSIRYSFCGNGRHVLTIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFINVTAIVGFCVSPANASQYAIVPANGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVSVNKTVITTFVDNDDFDFDDELSKWWNDTKHELPDFDKFNYTVPILDIDSEIDRIQGVIQGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIAFATIIFILILGWLFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV |
AY761141.1 |
Avian infectious bronchitis virus strain HK S protein (S); 3a protein (3a); 3b protein (3b); envelope protein (E); membrane protein (M); 5a protein (5a); 5b protein (5b); and nucleocapsid protein (N) genes; complete cds |
3489bp |
ATGTTGGTAACACCTCTTTTACTAGTGACTCTTTTGTGTGCACTATGTAGTGCTGTTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGCTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGGGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGCATTCTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTTTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGAGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACAATTTCACTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCAAATCCTAGTGGTGTCCAGAATATTCAAACTTACCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTTTCCTTTCTGAGTAGTTTTGTTTATAAGGAGTCTAATTTTATGTATGGATCTTATTACCCAAGTTGTAATTTTAGACTAGAAACTATTAATAATGGTTTGTGGTTTAATTCACTTTCAGTTTCAATTGCTTACGGTCCTCTTCAAGGTGGTTGCAAGCAATCTGTCTTTAGTGGTAGAGCAACCTGTTGTTATGCTTACTCATATGGAGGTCCTTTGCTGTGTAAAGGTGTTTATTCAGGTGAGTTAGATCATAATTTTGAATGTGGACTGTTAGTTTATGTTACTAAGAGCGGTGGCTCTCGTATACAAACAGCCACTGAACCGCCAGTTATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAACTGGCCAAGGTTTTATTACTAATGTAACCGACTCAGCTGTTAGTTATAATTATCTAGCAGACGCAGGTTTGGCTATTTTAGATACATCTGGTTCCATAGACATCTTTGTCGTACAAAGTGAATATGGTCTTAATTATTATAAGGTTAACCCTTGCGAAGATGTCAACCAGCAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACTTCACGTAATGAGACTGGTTCCCAGCTTCTTGAGAATCAGTTTTACATCAAAATCACTAATGGAACACGTCGTTTTAGACGTTCTATTACTGAAAGTGTTGAAAATTGCCCTTATGTTAGTTATGGTAAGTTTTGTATAAAACCTGATGGCTCAATTGCCACAATAGTACCAAAACAATTGGAACAGTTTGTGGCACCTTTACTTAATGTTACTGAAAATGTGCTCATACCTAACAGTTTTAATTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACGCGTATGGATAAGGTCCAAATTAATTGCCTGCAGTATATTTGTGGCAATTCTCTGGAGTGCAGAAATTTGTTCCAACAATATGGTCCTGTTTGCGACAACATATTGTCTGTAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTGAATTTCTATTCTTCTACTAAGCCGGCTGGTTTTAATACACCAGTTCTTAGTAATGTTAGCACTGGTGAGTTTAATATTTCTCTTTTTTTAACAACGCCTAGTAGTCCTAGAAGGCGTTCTTTTATTGAAGACCTTCTATTTACAAGTGTTGAATCTGTTGGATTACCAACAGATGACGCATACAAAAATTGCACTGCAGGTCCTTTAGGCTTTCTTAAGGACCTTGTATGTGCTCGTGAATATAATGGTTTGCTTGTGTTGCCTCCTATTATAACAGCAGAAATGCAAACTTTGTATACTAGTTCTCTAGTAGCTTCTATGGCTTTTGGTGGTATTACTGCAGCTGGTGCTATACCTTTTGCCACACAACTGCAGGCTAGAATTAATCACTTGGGTATTACCCAGTCACTTCTTTTGAAGAATCAAGAAAAAATTGCTGCTTCCTTTAATAAGGCCATCGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGAAGTACATCTTTAGCATTACAACAAATTCAAGATGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACTGAGACTATGGCATCACTTAATAAAAATTTTGGTGCCATTTCTTCTGTGATTCAAGAAATCTACCAGCAACTTGACGCCATACAAGCAAATGCTCAAGTGGATCGTCTTATAACTGGTAGATTGTCATCACTTTCTGTTTTAGCATCTGCTAAGCAGGCGGAGTATATTAGAGTGTCACAACAGCGTGAGTTAGCTACTCAGAAGATTAATGAGTGTGTCAAGTCACAGTCCATTAGGTACTCCTTTTGTGGTAATGGACGACATGTTTTAACCATACCACAAAATGCCCCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTATACACCAGAGAGCTTTATTAATGTTACTGCAATAGTGGGTTTTTGTGTAAGTCCTGCTAATGCTAGTCAGTATGCAATAGTGCCCGCTAATGGTAGGGGTATTTTTATACAAGTTAATGGTAGTTACTACATCACTGCACGAGATATGTATATGCCAAGAGATATTACTGCAGGAGATATAGTTACGCTTACTTCTTGTCAAGCAAATTATGTAAGTGTAAATAAGACCGTCATTACTACATTTGTAGACAATGATGATTTTGATTTTGATGATGAATTGTCAAAATGGTGGAATGATACTAAGCATGAGCTACCAGACTTTGACAAATTCAATTACACAGTACCTATACTTGACATTGATAGTGAAATTGATCGTATTCAAGGCGTTATACAGGGTCTTAACGACTCTCTAATAGACCTTGAAACACTATCAATACTCAAAACTTATATTAAGTGGCCTTGGTATGTGTGGTTAGCCATAGCTTTTGCCACTATTATCTTCATCTTAATACTAGGATGGTTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGCATTATTCCTTTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTATTACACGACTTTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP08800326 |
AAV33433.1 |
spike protein S1, partial Infectious bronchitis virus. |
588 aa |
MLGKSLLIATVLFALCSATLYTHDYVYYYQSAYRLPNGWHLQGGAYAVVNSTNKTNNAGAASECSVGVPFNYTNGNDVGYNNSASSVAMTAPLPGMSWSKTQFCTAHCNFSDFTVFVTHCFANSCPLTGRTEENHIRISAMRNGSLFYNLTVSVSKYPKFKSLQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNKTTDVIGAGVYFKAGGPITYKIMKEFKVLAYFVNGTVQDVILCDDTPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKKKFIVYRESSVNTTLILTNYTFYNVTNAPPNQGGVQSILTYQTQTAQSGYYNFNLSFLSSFVYKQSDYMYGSYHPACNFRLETINNGLWFNSLSVSLAYGPLQGGCKQSVFSSRATCCYAYSYNGPRACKGVYAGELRQNFECGLLVYVTKSDGSRIQTATEPPVITQHNYNNITLNTCVDYNIYGRVGRGFITNVTDLSSSYNYLADGGLAILDTSGAIDIFVVQGEHGFNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNATGSQPLENQFYIKLTKETRRFRRSTSENVTSCHYVSYGRFCIQPDGSIKQIVPQELQNFVAPLLNVTEN |
AY764368.1 |
Infectious bronchitis virus strain CQ/01/2004 spike protein S1 gene; partial cds |
1764bp |
ATGTTGGGGAAGTCACTGTTAATAGCGACTGTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCCACTCTTTATACTCACGATTATGTTTACTACTACCAAAGTGCCTATAGACTACCAAATGGATGGCATTTGCAAGGGGGTGCTTATGCAGTAGTGAATTCTACTAATAAAACTAACAATGCAGGCGCCGCTAGCGAGTGTTCTGTAGGTGTTCCTTTTAATTATACTAACGGGAATGACGTTGGTTATAATAATAGTGCTTCTTCCGTAGCCATGACAGCACCGCTTCCTGGTATGTCTTGGTCTAAAACACAATTTTGTACTGCCCATTGTAACTTTTCGGATTTTACAGTGTTTGTTACACATTGTTTTGCAAATTCTTGTCCTTTAACAGGTAGGACAGAGGAAAACCATATCCGTATTTCTGCTATGAGAAATGGTTCTCTATTTTATAATTTAACAGTTAGTGTATCCAAATACCCTAAATTTAAATCGCTTCAATGTGTTAACAATTTCACTTCTGTTTATTTAAATGGTGACCTTGTTTTTACTTCTAACAAAACCACCGATGTTATAGGTGCTGGTGTGTATTTTAAAGCAGGTGGGCCTATAACCTACAAAATTATGAAAGAATTTAAGGTTTTGGCTTATTTTGTCAATGGTACTGTGCAAGATGTAATTCTGTGTGATGACACACCGAGAGGCTTGCTTGCATGTCAATATAATACTGGTAATTTTTCAGATGGGTTTTACCCTTTTACTAATTCTAGTTTAGTTAAGAAAAAGTTTATTGTTTATCGTGAGAGTAGTGTTAATACTACTCTTATTTTAACTAATTATACTTTTTATAATGTGACTAATGCCCCGCCTAATCAAGGTGGTGTTCAGTCTATTTTAACTTATCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTATCATTTCTGAGTAGTTTTGTGTATAAACAATCTGATTACATGTATGGGTCTTATCACCCTGCATGTAATTTTAGATTAGAAACTATTAATAATGGCTTGTGGTTTAATTCACTGTCAGTTTCTCTTGCTTATGGACCACTTCAAGGTGGGTGTAAGCAGTCGGTTTTTAGTAGTAGAGCCACTTGTTGTTATGCTTATTCATATAATGGTCCTCGCGCTTGTAAGGGTGTTTATGCAGGCGAGTTACGACAAAATTTTGAATGTGGACTGTTGGTTTATGTTACTAAGAGCGATGGCTCTCGTATACAAACAGCCACCGAGCCACCAGTCATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAGTTGGTCGAGGTTTCATTACTAATGTAACTGACTTATCATCTAGTTATAATTATTTAGCAGATGGAGGGTTGGCTATTTTAGATACATCAGGTGCCATAGACATCTTTGTTGTACAAGGTGAACATGGTTTTAATTATTACAAGGTTAATCCCTGTGAAGATGTAAACCAGCAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACCTCACGTAATGCAACAGGTTCTCAGCCCCTTGAGAATCAATTCTACATTAAACTCACTAAAGAGACACGTCGTTTTAGACGTTCTACTAGTGAAAATGTAACAAGTTGTCATTATGTAAGTTATGGCAGGTTTTGTATACAACCTGATGGTTCTATTAAGCAAATAGTACCGCAAGAATTACAAAATTTTGTGGCACCTTTGTTAAATGTTACTGAAAAT |
Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP08800327 |
AAV34696.1 |
spike protein S1, partial Infectious bronchitis virus. |
588 aa |
MLGKSLLIATVLFALCSATLYTHDYVYYYQSAYRLPNGWHLQGGAYAVVNSTNKTNNAGAASECSVGVPFNYTNGNDVGYNNSASSVAMTAPLPGMSWSKTQFCTAHCNFSDFTVFVTHCFANSCPLTGRTEENHIRISAMRNGSLFYNLTVSVSKYPKFKSLQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNKTTDVIGAGVYFKAGGPITYKIMKEFKVLAYFVNGTVQDVILCDDTPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKKKFIVYRESSVNTTLILTNYTFYNVTNAPPNQGGVQSILTYQTQTAQSGYYNFNLSFLSSFVYKQSDYMYGSYHPACNFRLETINNGLWFNSLSVSLAYGPLQGGCKQSVFSSRATCCYAYSYNGPRACKGVYAGELRQNFECGLLVYVTKSDGSRIQTATEPPVITQHNYNNITLNTCVDYNIYGRVGRGFITNVTDLSSSYNYLADGGLAILDTSGAIDIFVVQGEHGFNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNATGSQPLENQFYIKLTKETRRFRRSTSENVTSCHYVSYGRFCIQPDGSIKQIVPQELQNFVAPLLNVTEN |
AY769993.1 |
Avian infectious bronchitis virus strain CQ/01/2004 spike protein S1 gene; partial cds |
1764bp |
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Infectious bronchitis virus |
Coronaviridae |
Infectious bronchitis virus |
-- |
DVSP13700085 |
AAV49719.1 |
spike glycoprotein SARS coronavirus PC4-115. |
1255 aa |
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AY627044.1 |
SARS coronavirus PC4-115 spike glycoprotein gene; complete cds |
3768bp |
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SARS coronavirus PC4-115 |
Coronaviridae |
SARS coronavirus |
-- |
DVSP13700086 |
AAV49720.1 |
spike glycoprotein SARS coronavirus PC4-137. |
1255 aa |
MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFDNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFVVSKPMGTRTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDTWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKRISNCVADYSVLYNSTSFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPAPNCYWPLKGYGFYTTSGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTLIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSSLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCRQLNRALSGIAAEQDRNTREVFAQVKQMYKTPTLKDFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQEEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT |
AY627045.1 |
SARS coronavirus PC4-137 spike glycoprotein gene; complete cds |
3768bp |
ATGTTTATTTTCTTATTATTTCTTACTCTCACTAGTGGTAGTGACCTTGACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCTATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAGGATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATTAATCATACGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTTGCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAACAAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAACTTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGTTGTTTCTAAACCCATGGGTACACGGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCTGATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTTGTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTAGTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGTATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTCACCTGCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTAAAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGATTGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAAGGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCTAATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTCTATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAACTCAACATCTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTTTGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATAGCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATGGGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAATTATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAATGTGCCTTTCTCTCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCTCCTAATTGTTATTGGCCATTAAAAGGTTATGGTTTTTACACCACTAGTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTTGTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCCACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGTGTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCTGATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGCTCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTTCTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACATTAATTCATGCAGATCAACTCACACCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTTATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATTTGTGCTAGTTACCATACAGTTTCTTCATTACGTAGTACTAGCCAAAAATCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAACACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCTATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCTAATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCAGACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATTGCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAAACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTAAAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGATGCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATTTGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATTGCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCTGGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGAGTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCGATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGACGTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCTCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAGGTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAACAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCTGAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAGGGCTACCACCTTATGTCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCCCAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCTCGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTTTCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATTGGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAAGAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCAGGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAGAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCTAAAAATTTAAATGAATCACTCATCGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATTAAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTTACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGTGGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTACATTACACATAA |
SARS coronavirus PC4-137 |
Coronaviridae |
SARS coronavirus |
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