Accession Number Protein Id Protein Description Protein Length Protein Sequence Nucleotide Id Nucleotide Description Nucleotide Length Nucleotide Sequence Source Class_virus Virus_name Host
DVSP08800318 AAT46019.1 spike glycoprotein S1, partial Infectious bronchitis virus. 100 aa MLGTSLFIVTVLFALCSVALFDNNETVYYYQSAFRPVDGWHLHGGAYAVVNVSLETNYACTASPMHCQGLFLGVKISQLCCNHDCTDLGMTGQLQLFCTA AY604558.1 Infectious bronchitis virus isolate CO8232L spike glycoprotein S1 gene; partial cds 300bp ATGTTGGGGACCTCACTGTTTATAGTGACTGTTTTGTTTGCACTATGTAGTGTCGCTTTGTTTGATAATAATGAAACCGTTTACTACTACCAAAGTGCCTTTAGACCGGTTGATGGATGGCATTTGCATGGTGGTGCTTATGCAGTAGTAAACGTCTCTTTAGAAACTAATTATGCATGCACAGCTTCCCCAATGCACTGCCAGGGGCTATTTCTTGGAGTAAAAATTTCTCAGCTCTGCTGTAACCATGACTGCACTGATTTAGGGATGACGGGTCAACTCCAGCTATTTTGCACGGCT Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus --
DVSP08800319 AAT46020.1 spike glycoprotein S1, partial Infectious bronchitis virus. 100 aa MLGKSLFIVTVLFALCSAALFDNNETVYYYQSAFRPVDGWHLHGGAYAVVNVSLETNNAGTASQCIAGAISWSKNFSASAVAMTAPELGMTWSTQQFCTA AY604559.1 Infectious bronchitis virus isolate CO8234T spike glycoprotein S1 gene; partial cds 300bp ATGTTGGGGAAGTCACTGTTTATAGTGACTGTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCCGCTTTGTTTGATAATAATGAAACCGTTTACTACTACCAAAGTGCCTTTAGACCGGTTGATGGATGGCATTTGCATGGTGGTGCTTATGCAGTAGTAAACGTTTCTTTAGAAACTAATAATGCAGGCACAGCTTCACAATGCATTGCAGGGGCTATTTCTTGGAGTAAAAATTTCTCTGCTTCTGCTGTAGCCATGACTGCACCTGAGTTAGGGATGACGTGGTCAACTCAGCAATTCTGCACGGCT Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus --
DVSP08800320 AAT46021.1 spike glycoprotein S1, partial Infectious bronchitis virus. 100 aa MLGKSLFIVTVLFALCSAALFDNNETVYYYQSAFRPVDGWHLHGGAYAVVNVSLETNNAGTASQCIAGAIFWSKNFSASAVAMTAPELGMTWSTQQFCTA AY604560.1 Infectious bronchitis virus isolate CO8234CT spike glycoprotein S1 gene; partial cds 300bp ATGTTGGGGAAGTCACTGTTTATAGTGACTGTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCCGCTTTGTTTGATAATAATGAAACCGTTTACTACTACCAAAGTGCCTTTAGACCGGTTGATGGATGGCATTTGCATGGTGGTGCTTATGCAGTAGTAAACGTTTCTTTAGAAACTAATAATGCAGGCACAGCTTCACAATGCATTGCAGGGGCTATTTTTTGGAGTAAAAATTTCTCTGCTTCTGCTGTAGCCATGACTGCACCTGAGTTAGGGATGACGTGGTCAACTCAGCAATTCTGCACGGCT Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus --
DVSP08800321 AAT46022.1 spike glycoprotein S1, partial Infectious bronchitis virus. 98 aa MLVTPLLLVTLLFALCSAALYDNSSYVYYYQSAFRPPNGWHLHGGAYAVVNTSIESNNLRECIVGIIGGDRVVNASSIAMTAPQPGMDWSSRQFCTAH AY604561.1 Infectious bronchitis virus isolate CO8033CT spike glycoprotein S1 gene; partial cds 296bp ATGTTGGTAACACCTCTTTTATTAGTGACTCTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCTGCTTTGTATGACAATAGTTCTTACGTTTACTACTACCAAAGTGCCTTTAGACCACCTAATGGTTGGCATTTACACGGGGGTGCTTATGCGGTAGTTAATACTTCTATAGAATCTAATAATTTAAGAGAGTGTATTGTTGGTATTATTGGTGGTGATCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGCAACCAGGTATGGATTGGTCTAGCAGACAGTTTTGTACTGCACACTG Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus --
DVSP04200048 AAT67458.1 spike protein subunit 1, partial Bovine coronavirus. 134 aa PSTWNRRFGFTEQSVFKPQPVGVFTHHDVVYAQHCFKAPTNFCPCKLDGSLCVGNGLGIDAGYKNSGIGTCPAGTNYLTCHSLCTPDPITSKSTGPYKCPQTKYLVGIGEHCSGLAIKSDYCGGNPCTCQPQAF AY646095.1 Bovine coronavirus strain Kakegawa spike protein subunit 1 (S1) gene; partial cds 404bp TCCTTCTACTTGGAATAGGAGATTTGGTTTTACAGAACAATCTGTTTTTAAGCCTCAACCTGTAGGTGTTTTTACTCATCATGATGTTGTTTATGCACAACATTGTTTTAAAGCTCCCACAAATTTCTGTCCGTGTAAATTGGATGGGTCTTTGTGTGTAGGTAATGGTCTTGGTATAGATGCTGGTTATAAAAATAGTGGTATAGGCACTTGTCCTGCAGGTACTAATTATTTAACTTGCCATAGTTTGTGCACTCCCGACCCCATTACATCTAAATCTACAGGGCCTTACAAGTGCCCCCAAACTAAATACTTAGTTGGCATAGGTGAGCACTGTTCGGGTCTTGCTATTAAAAGTGATTATTGTGGAGGTAATCCTTGTACTTGCCAACCACAAGCATTTT Bovine coronavirus Coronaviridae Bovine coronavirus --
DVSP08800322 AAT70074.1 spike protein Infectious bronchitis virus. 57 aa MIQSPTSFLIVLIFLWCKLVLSCFREFIIALQQLIQVLLQIINSNLQPRLTLCHSLD AY641576.1 Avian infectious bronchitis virus isolate Peafowl/GD/KQ6/2003; complete genome 174bp ATGATTCAAAGTCCCACGTCCTTCCTAATAGTATTAATTTTTCTTTGGTGTAAACTTGTACTAAGTTGTTTTAGAGAGTTTATTATAGCGCTCCAACAACTAATACAAGTTTTACTCCAAATTATCAATAGTAACTTACAGCCTAGACTGACCCTTTGTCACAGTCTAGACTAA Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus --
DVSP03300001 AAT70772.1 spike protein Avian infectious bronchitis virus 1165 aa MLGKSLFLVTILCALCSANLFDSANNYVYYYQSAFRPPNGWHLQGGAYAVVNSTNYTNNAGSANECTIGVIKDVYNQSAAAIAMTAPLQGMAWSKSQFCSAHCNFSEITVFVTHCYSSGSGSCPITGMIPQGHIRISAMKNGSLFYNLTVSVSKYPNFKSFQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNTTTDVKSAGVYFKAGGPVNYNIMKEFKVLAYFVNGTVQDVILCDDTPRGLLACQYNNGNFSDGFYPFTNSSLVKEKFIVYRENSVNTTLTLTNYTFYNVTNASPNRGGVQSIPTYQTQTAQSGYYNFNLSFLSSFVYKESNYMYGSYHPACNFRLETINNGLWFNSLSVSLAYGPLQGGCKQSVFSSRATCCYAYSYNGPRACKGVYAGELLQNFECGLLVYVTKSDGSRIQTATVPPVVTQHNYNNITLNTCVDYNIYGRVGRGFITNVTDSSSSYNYLADAGLAVLDTSGAIDIFVVQGEHGLNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNATGSQPLENQFYIKLTKETRRFRRSTSDNVTSCPYVSYGRFCIQPDGSIKQIVPQELENFVAPLLNVTENVLIPSSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYVCGNPLDCRKLFQQYGPVCDNILSIVNSVGQKEDMELLTFYSSTKPAGYNAPVFSNISTGDFNISLLLTPPSSPSGRSFIEDLLFTSVETVGLPTDAEYKKCTAGPLGTLKDLICAREYNGLLVLPPIITADMQTMYTASLVGAMAFGGITAAGAIPFATQIQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQVQDVVNKQSAILTETMNSLNKNFGAISSVIQDIYAQLDAIQADAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQSEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSNRYGFCGSGRHVLSIPQNAPNGIVFIHFTYTPQSFVNVTAIVGFCVQPANASQYAIVPVNGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVNVNKTVITTFVEDDDFDFDDELSKWWNDTEHELPDFDDFNYTVPILNISGEIDRIQGVIQGLNDSLIDLEELSIIKTYIKWPWYVWLAIGFAVIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV AY646283.1 Avian infectious bronchitis virus partridge/GD/S14/2003; complete genome 3498bp ATGTTGGGGAAGTCACTGTTTTTAGTGACCATTTTGTGTGCACTATGTAGTGCAAATTTGTTTGATTCTGCTAATAATTATGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTTAGGCCTCCAAATGGATGGCATTTGCAAGGGGGTGCTTATGCAGTAGTGAATTCTACTAATTATACTAATAATGCAGGTTCTGCAAATGAGTGCACTATTGGTGTTATTAAGGACGTCTATAATCAAAGTGCGGCTGCTATAGCTATGACAGCACCTCTTCAGGGTATGGCTTGGTCTAAGTCACAATTTTGTAGTGCACACTGTAACTTTTCTGAAATTACAGTTTTTGTCACACATTGTTATAGTAGCGGTAGTGGGTCTTGTCCTATAACAGGCATGATTCCACAGGGTCATATTCGCATTTCTGCAATGAAAAATGGCTCTTTATTTTATAATTTAACAGTTAGCGTGTCTAAATACCCTAATTTTAAATCGTTTCAATGTGTTAACAACTTCACATCTGTTTATTTAAATGGTGATCTTGTTTTTACTTCTAACACAACTACTGATGTTAAGTCAGCAGGTGTGTATTTTAAAGCAGGTGGACCTGTAAATTATAATATTATGAAAGAATTTAAGGTTCTGGCTTATTTTGTCAATGGTACTGTGCAAGATGTAATTCTGTGTGATGACACACCGAGAGGCTTGCTTGCATGTCAATATAATAATGGTAATTTTTCAGATGGGTTTTACCCTTTTACTAATTCTAGTTTAGTTAAGGAAAAGTTTATTGTTTATCGTGAGAATAGTGTTAATACTACTCTTACTTTAACTAACTATACTTTTTATAATGTGACTAATGCCTCGCCTAATCGAGGTGGTGTTCAGTCTATTCCAACTTATCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTATCATTTCTGAGTAGTTTTGTGTATAAAGAGTCTAATTACATGTATGGGTCTTACCACCCTGCATGTAATTTTAGATTAGAAACTATTAATAATGGCTTGTGGTTTAATTCATTGTCAGTTTCGCTTGCTTATGGACCACTTCAAGGTGGGTGTAAGCAGTCGGTTTTTAGTAGTAGAGCCACTTGTTGTTATGCTTATTCATATAATGGTCCTCGCGCATGTAAGGGTGTTTACGCAGGCGAGTTACTACAAAATTTTGAATGTGGACTGTTGGTTTATGTTACTAAGAGCGATGGCTCTCGTATACAAACAGCCACCGTTCCACCAGTTGTAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAGTTGGTCGAGGTTTTATTACTAATGTAACTGACTCATCATCTAGTTATAATTATTTAGCAGATGCAGGGTTGGCTGTTTTAGATACATCAGGTGCCATAGACATCTTTGTTGTACAAGGTGAACATGGTCTTAATTATTACAAGGTTAATCCCTGTGAAGATGTAAACCAGCAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACCTCACGTAATGCAACAGGTTCTCAGCCTCTTGAGAATCAATTCTACATTAAACTCACTAAAGAGACACGTCGTTTTAGACGTTCTACTAGTGATAATGTAACAAGTTGCCCTTATGTTAGTTATGGCAGGTTTTGTATACAACCTGATGGTTCTATTAAGCAAATAGTACCGCAAGAATTAGAAAACTTTGTGGCACCTTTGTTAAATGTTACTGAAAATGTGCTCATACCTAGCAGTTTTAATTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACACGTATGGATAAAGTTCAAATTAATTGCCTGCAATATGTTTGTGGTAATCCTTTGGATTGTAGGAAGTTATTTCAACAATATGGTCCTGTCTGTGACAACATATTGTCTATAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTAACTTTCTATTCTTCTACTAAACCAGCTGGTTATAATGCACCTGTTTTCAGTAATATTAGTACTGGTGATTTTAATATTTCTCTTTTATTAACACCACCTAGTAGTCCTAGTGGTCGTTCTTTTATAGAAGATTTATTATTTACAAGTGTTGAAACAGTTGGTTTGCCAACTGATGCTGAATATAAAAAATGCACAGCGGGACCTTTGGGTACTCTTAAAGATCTTATCTGTGCTAGGGAATATAATGGTTTATTAGTGTTGCCTCCAATTATTACGGCGGATATGCAAACAATGTATACCGCTTCTTTAGTTGGTGCCATGGCTTTTGGTGGTATTACAGCAGCAGGTGCTATACCATTTGCAACTCAGATACAAGCTAGAATTAATCATTTGGGTATTACACAGTCTCTGTTATTGAAGAACCAAGAGAAGATTGCTGCTTCCTTTAATAAGGCCATTGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGAAGCACTTCGCTAGCATTACAACAGGTTCAAGACGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACTGAAACTATGAATTCTCTTAATAAGAATTTTGGTGCCATTTCATCAGTAATTCAAGACATTTATGCGCAACTTGATGCAATTCAAGCAGATGCACAAGTTGACCGTCTTATTACTGGTAGACTCTCTTCTCTCTCAGTGCTAGCCTCTGCTAAGCAGTCTGAGTACATTAGAGTTTCCCAACAACGTGAATTAGCCACTCAAAAAATTAATGAGTGTGTTAAATCACAATCTAATAGGTATGGATTTTGTGGTAGTGGAAGACATGTTCTTTCGATACCGCAAAATGCACCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTATACTCCACAGAGTTTTGTTAATGTTACTGCAATAGTGGGTTTTTGTGTACAGCCTGCTAATGCTAGTCAGTATGCAATAGTGCCTGTTAATGGTAGAGGTATTTTTATACAAGTTAATGGTAGTTACTATATCACTGCACGTGATATGTATATGCCTAGAGACATTACTGCAGGAGATATAGTTACTCTTACGTCTTGTCAAGCAAACTATGTTAATGTAAATAAAACCGTCATTACTACATTTGTAGAAGATGACGATTTTGATTTTGATGATGAGTTGTCAAAATGGTGGAATGACACTGAGCATGAGCTACCAGATTTTGACGACTTCAATTACACAGTACCTATACTGAATATTAGCGGTGAAATTGATCGTATTCAAGGTGTTATACAGGGTCTTAATGACTCCCTTATAGACCTTGAAGAACTGTCAATAATCAAAACTTATATTAAATGGCCTTGGTATGTCTGGCTTGCCATAGGTTTTGCAGTTATTATATTCATCCTAATATTGGGATGGGTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGTATCATTCCTCTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTATTACACGACTTTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA Avian infectious bronchitis virus partridge/GD/S14/2003 Coronaviridae Avian infectious bronchitis virus --
DVSP13700075 AAT74874.1 spike protein SARS coronavirus HHS-2004. 1255 aa MAIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFDNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFAVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDTWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKKISNCVADYSVLYNSTFFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLKHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPALNCYWPLNDYGFYTTTGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTAIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSLLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCTQLNRALSGIAAEQDRNTREVFAQVKQMYKTPTLKYFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDVLSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT AY648300.1 SARS coronavirus HHS-2004 spike protein (S) mRNA; 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DVSP11100009 AAT75298.1 spike glycoprotein Porcine epidemic diarrhea virus. 1383 aa MKSLTYFWLLLPVLSTLSLPQDVTRCQSTINFRRFFSKFNVQAPAVVVLGGYLPSMNSSSWYCGTGLETASGVHGIFLSYIDAGQGFEIGISQEPFDPSGYQLYLHKATNGNTNAIARLRICQFPDNKTLGPTVNDVTTGRNCLFNRAIPAYMQDGKNIVVGITWDNDRVTVFADKIYHFYLKNDWSRVATRCYNKRSCAMQYVYTPTYYMLNVTSAGEDGIYYEPCTANCSGYAANIFATDSNGHIPEGFSFNNWFLLSNDSTLLHGKVVSNQPLLVNCLLAIPKIYGLGQFFSFNQTMDGVCNGAAAQRAPEALRFNINDTSVILAEGSIVLHTALGTNLSFVCSNSSDPHLATFAIPLGATQVPYYCFLKVDTYNSTVYKFLAVLPPTVREIVITKYGDVYVNGFGYLHLGLLDAVTINFTGHGTDDDVSGFWTIASTNFVDALIEVQGTAIQRILYCDDPVSQLKCSQVAFDLDDGFYPISSRNLLSHEQPISFVTLPSFNDHSFVNITVSASFGGHSGANLIASDTTINGFSSFCVDTRQFTISLFYNVTNSYGYVSKSQDSNCPFTLQSVNDYLSFSKFCVSTSLLASACTIDLFGYPEFGSGVKFTSLYFQFTEGELITGTPKPLEGVTDVSFMTLDVCTKYTIYGFKGEGIITLTNSSFLAGVYYTSDSGQLLALKNVTSGAVYSVTPCSFSEQAAYVDDDIVGVISSLSSSTFNSTRELPGFFYHSNDGSNCTEPVLVYSNIGVCKSGSIGYVPSQSGQVKIAPTVTGNISIPTNFSMSIRTEYLQLYNTPVSVDCATYVCNGNSRCKQLLTQYTAACKTIESALQLSARLESVEVNSMLTISEEALQLATISSFNGDGYNFTNVLGVSVYDPASGRVVHKRSFIEDLLFNKVVTNGLGTVDEDYKRCSNGRSVADLVCAQYYSGVMVLPGVVDAEKLHMYSASLIGGMALGGFTVAAALPFSYAVQARLNYLALQTDVLQRNQQLLAESFNSAIGNITSAFESVKEAISQTSKGLNTVAHALTKVQEVVNSQGAALTQLTVQLQHNFQAISSSIDDIYSRLDILSADVQVDRLITGRLSALNAFVAQTLTKYTEVQASRKLAQQKVNECVKSQSQRYGFCGGDGEHIFSLVQAAPQGLLFLHTVLVPGDFVDVIAIAGLCVNDEIALTLREPGLVLFTHELQNHTATEYFVSSRRMFEPRKPTVSDFVQIESCVVTYVNLTRDQLPDVIPDYIDVNKTLDEILASLPYRTGPSLPLDVFNATYLNLTGEIADLEQRSESLRNTTEELQSLIYNINNTLVDLEWLNRVETYIKWPWWVWLIIFIVLIFVVSLLVFCCISTGCCGCCGCCCACFSGCCRGPRLQPYEAFEKVHVQ AY653204.1 Porcine epidemic diarrhea virus strain JS-2004-2 spike glycoprotein (S) gene; 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DVSP13700076 AAT76147.1 spike glycoprotein SARS coronavirus TJF. 1255 aa MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFGNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFAVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDTWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKKISNCVADYSVLYNSTFFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPALNCYWPLNDYGFYTTTGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTAIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSLLRNTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCTQLNRALSGIAAEQDRNTREVFAQVKQMYKTPTLKYFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGKCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT AY654624.1 SARS coronavirus TJF; 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DVSP08400027 AAT84362.1 spike surface glycoprotein Human coronavirus OC43. 1353 aa MFLILLISLPTAFAVIGDLKCTSDNINDKDTGPPPISTDTVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLFLNGYYPTSGSTYRNMALKGSVLLSRLWFKPPFLSDFINGIFAKVKNTKVIKDRVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPRTINSTQDGDNKLQGLLEVSVCQYNMCEYPQTICHPNLGNHRKELWHLDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGMALSHYYVMPLTCNSKLTLEYWVTPLTSRQYLLAFNQDGIIFNAVDCMSDFMSEIKCKTQSIAPPTGVYELNGYTVQPIADVYRRKPNLPNCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNKRFGFIEDSVFKPRPAGVLTNHDVVYAQHCFKAPKNFCPCKLNGSCVGSGPGKNNGIGTCPAGTNYLTCDNLCTPDPITFTGTYKCPQTKSLVGIGEHCSGLAVKSDYCGGNSCTCRPQAFLGWSADSCLQGDKCNIFANFILHDVNSGLTCSTDLQKANTDIILGVCVNYDLYGILGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYITNRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNSLTRQLQPINYFDSYLGCVVNAYNSTAISVQTCDLTVGSGYCVDYSKNRRSRGAITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMVEFIQTSSPKVTIDCAAFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVLGCLGSECSKASSRSAIEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYKGIKVLPPLLSENQFSGYTLAATSASLFPPWTAAAGVPFYLNVQYRINGLGVTMDVLSQNQKLIANAFNNALYAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISASLQEILSRLDALEAEAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTARVSPGLCIAGDRGIAPKSGYFVNVNNTWMYTGSGYYYPEPITENNVVVMSTCAVNYTKAPYVMLNTSIPNLPDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQVEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLICLAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGYQELVIKTSHDD AY585229.1 Human coronavirus OC43 serotype OC43-Paris; 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DVSP05600001 AAU04646.1 spike glycoprotein Civet SARS CoV 007/2004. 1255 aa MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFDNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFVVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGIKITNFRAILTAFSPAQGTWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKRISNCVADYSVLYNSTSFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSSDGKPCTPPAPNCYWPLRGYGFYTTSGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTLIHAEQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSSLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCRQLNRALSGIAAEQDRNTREVFVQVKQMYKTPTLKDFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFSGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQEEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT AY572034.1 SARS coronavirus civet007; 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DVSP21400023 AAU06356.1 spike glycoprotein Murine hepatitis virus. 1324 aa MLFVFILFLPSCLGYIGDFRCIQLVNSNGANVSAPSISTETVEVSQGLGTYYVLDRVYLNATLLLTGYYPVDGSKFRNLALTGTNSVSLSWFQPPYLSQFNDGIFAKVQNLKTSTPSGATAYFPTIVIGSLFGYTSYTVVIEPYNGVIMASVCQYTICQLPYTDCKPNTNGNKLIGFWHTDVKPPICVLKRNFTLNVNADAFYFHFYQHGGTFYAYYADKPSATTFLFSVYIGDILTQYYVLPFICNPTAGSTFAPRYWVTPLVKRQYLFNFNQKGVITSAVDCASSYTSEIKCKTQSMLPSTGVYELSGYTVQPVGVVYRRVANLPACNIEEWLTARSVPSPLNWERKTFQNCNFNLSSLLRYVQAESLFCNNIDASKVYGRCFGSISVDKFAVPRSRQVDLQLGNSGFLQTANYKIDTAATSCQLHYTLPKNNVTINNHNPSSWNRRYGFNDAGVFGKNQHDVVYAQQCFTVRSSYCPCAQPDIVSPCTTQTKPKSAFVNVGDHCEGLGVLEDNCGNADPHKGCICANNSFIGWSHDTCLVNDRCQIFANILLNGINSGTTCSTDLQLPNTEVVTGICVKYDLYGITGQGVFKEVKADYYNSWQTLLYDVNGNLNGFRDLTTNKTYTIRSCYSGRVSAAFHKDAPEPALLYRNINCSYVFSNNISREENPLNYFDSYLGCVVNADNRTDEALPNCDLRMGAGLCVDYSKSRRAHRSVSTGYRLTTFEPYTPMLVNDSVQSVDGLYEMQIPTNFTIGHHEEFIQTRSPKVTIDCAAFVCGDNTACRQQLVEYGSFCVNVNAILNEVNNLLDNMQLQVASALMQGVTISSRLPDGISGPIDDINFSPLLGCIGSTCAEDGNGPSAIRGRSAIEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGQEVRDLLCVQSFNGIKVLPPVLSESQISGYTTGATAAAMFPPWSAAAGVPFSLSVQYRINGLGVTMNVLSENQKMIASAFNNALGAIQDGFDATNSALGKIQSVVNANAEALNNLLNQLSNRFGAISASLQEILTRLEAVEAKAQIDRLINGRLTALNAYISKQLSDSTLIKVSAAQAIEKVNECVKSQTTRINFCGNGNHILSLVQNAPYGLYFIHFSYVPISFTTANVSPGLCISGDRGLAPKAGYFVQDDGEWKFTGSSYYYPEPITDKNSVIMSSCAVNYTKAPEVFLNTSIPNPPDFKEELDKWFKNQTSIAPDLSLDFEKLNVTLLDLTYEMNRIQDAIKKLNESYINLKEVGTYEMYVKWPWYVWLLIGLAGVAVCVLLFFICCCTGCGSCCFKKCGNCCDEYGGHQDSIVIHNISSHED AY700211.1 Murine hepatitis virus strain A59; complete genome 3975bp ATGCTGTTCGTGTTTATTCTATTTTTGCCCTCTTGTTTAGGGTATATTGGTGATTTTAGATGTATCCAGCTTGTGAATTCAAACGGTGCTAATGTTAGTGCTCCAAGCATTAGCACTGAGACCGTTGAAGTTTCACAAGGCCTGGGGACATATTATGTGTTAGATCGAGTTTATTTAAATGCCACATTATTGCTTACTGGTTACTACCCGGTCGATGGTTCTAAGTTTAGAAACCTCGCTCTTACGGGAACTAACTCAGTTAGCTTGTCGTGGTTTCAACCACCCTATTTAAGTCAGTTTAATGATGGCATATTTGCGAAGGTGCAGAACCTTAAGACAAGTACGCCATCAGGTGCAACTGCATATTTTCCTACTATAGTTATAGGTAGTTTGTTTGGCTATACTTCCTATACCGTTGTAATAGAGCCATATAATGGTGTTATAATGGCCTCAGTGTGCCAGTATACCATTTGTCAGTTACCTTACACTGATTGTAAGCCTAACACTAATGGTAATAAATTAATAGGGTTTTGGCACACGGATGTAAAACCCCCAATTTGTGTGTTAAAGCGAAATTTCACGCTTAATGTTAATGCTGATGCATTTTATTTTCATTTTTACCAACATGGTGGTACTTTTTATGCGTACTATGCGGATAAACCCTCCGCTACTACGTTTTTGTTTAGTGTATATATTGGCGATATTTTAACACAGTATTATGTGTTACCTTTCATCTGCAACCCAACAGCTGGTAGCACTTTTGCTCCGCGCTATTGGGTTACACCTTTGGTTAAGCGCCAATATTTGTTTAATTTCAACCAGAAGGGTGTCATTACTAGTGCTGTTGATTGTGCTAGTAGTTATACCAGTGAAATAAAATGTAAGACCCAGAGCATGTTACCTAGCACTGGTGTCTATGAGTTATCCGGTTATACGGTCCAACCAGTTGGAGTTGTATACCGGCGTGTTGCTAACCTCCCAGCTTGTAATATAGAGGAGTGGCTTACTGCTAGGTCAGTCCCCTCCCCTCTCAACTGGGAGCGTAAGACTTTTCAGAATTGTAATTTTAATTTAAGCAGCCTGTTACGTTATGTTCAGGCTGAGAGTTTGTTTTGTAATAATATCGATGCTTCCAAAGTGTATGGCAGGTGCTTTGGTAGTATTTCAGTTGATAAGTTTGCTGTACCCCGAAGTAGGCAAGTTGATTTACAGCTTGGTAACTCTGGATTTCTGCAGACTGCTAATTATAAGATTGATACAGCTGCCACTTCGTGTCAGCTGCATTACACCTTGCCTAAGAATAATGTCACCATAAACAACCATAACCCCTCGTCTTGGAATAGGAGGTATGGCTTTAATGATGCTGGCGTCTTTGGCAAAAACCAACATGACGTTGTTTACGCTCAGCAATGTTTTACTGTAAGATCTAGTTATTGCCCGTGTGCTCAACCGGACATAGTTAGCCCTTGCACTACTCAGACTAAGCCTAAGTCTGCTTTTGTTAATGTGGGTGACCATTGTGAAGGCTTAGGTGTTTTAGAAGATAATTGTGGCAATGCTGATCCACATAAGGGTTGTATCTGTGCCAACAATTCATTTATTGGATGGTCACATGATACCTGCCTTGTTAATGATCGCTGCCAAATTTTTGCTAATATATTGTTAAATGGCATTAATAGTGGTACCACATGTTCCACAGATTTGCAGTTGCCTAATACTGAAGTGGTTACTGGCATTTGTGTCAAATATGACCTCTACGGTATTACTGGACAAGGTGTTTTTAAAGAGGTTAAGGCTGACTATTATAATAGCTGGCAAACCCTTCTGTATGATGTTAATGGTAATTTGAATGGTTTTCGTGATCTTACCACTAACAAGACTTATACGATAAGGAGCTGTTATAGTGGCCGTGTTTCTGCTGCATTTCATAAAGATGCACCCGAACCGGCTCTGCTCTATCGTAATATAAATTGTAGCTATGTTTTTAGCAATAATATTTCCCGTGAGGAGAACCCACTTAATTACTTTGATAGTTATTTGGGTTGTGTTGTTAATGCTGATAACCGCACGGATGAGGCGCTTCCTAATTGTGATCTCCGTATGGGTGCTGGCTTATGCGTTGATTATTCAAAATCACGCAGGGCTCACCGATCAGTTTCTACTGGCTATCGGTTAACTACATTTGAGCCATACACTCCGATGTTAGTTAATGATAGTGTCCAATCCGTTGATGGATTATATGAGATGCAAATACCAACCAATTTTACTATTGGGCACCATGAGGAGTTCATTCAAACTAGATCTCCAAAGGTGACTATAGATTGTGCTGCATTTGTCTGTGGTGATAACACTGCATGCAGGCAGCAGTTGGTTGAGTATGGCTCTTTCTGTGTTAATGTTAATGCCATTCTTAATGAGGTTAATAACCTCTTGGATAATATGCAACTACAAGTTGCTAGTGCATTAATGCAGGGTGTTACTATAAGCTCGAGACTGCCAGACGGCATCTCAGGCCCTATAGATGACATTAATTTTAGTCCTCTACTTGGATGCATAGGTTCAACATGTGCTGAAGACGGCAATGGACCTAGTGCAATCCGAGGGCGTTCTGCTATAGAGGATTTGTTATTTGACAAGGTCAAATTATCTGATGTTGGCTTTGTCGAGGCTTATAATAATTGCACCGGTGGTCAAGAAGTTCGTGACCTCCTTTGTGTACAATCTTTTAATGGCATCAAAGTATTACCTCCTGTGTTGTCAGAGAGTCAGATCTCTGGCTACACAACCGGTGCTACTGCGGCAGCTATGTTCCCACCGTGGTCAGCAGCTGCCGGTGTGCCATTTAGTTTAAGTGTTCAATATAGAATTAATGGTTTAGGTGTCACTATGAATGTGCTTAGTGAGAACCAAAAGATGATTGCTAGTGCTTTTAACAATGCGCTGGGTGCTATCCAGGATGGGTTTGATGCAACCAATTCTGCTTTAGGTAAGATCCAGTCCGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCACTCAATAACTTACTAAATCAACTTTCTAACAGGTTTGGTGCTATTAGTGCTTCTTTACAAGAAATTCTAACTCGGCTTGAGGCTGTAGAAGCAAAAGCCCAGATAGATCGTCTTATTAATGGCAGGTTAACTGCACTTAATGCGTATATATCCAAGCAACTTAGTGATAGTACGCTTATTAAAGTTAGTGCTGCTCAGGCCATAGAAAAGGTCAATGAGTGCGTTAAGAGCCAAACCACGCGTATTAATTTCTGTGGCAATGGTAATCATATATTATCTCTTGTCCAGAATGCGCCTTATGGCTTATATTTTATACACTTCAGCTATGTGCCAATATCCTTTACAACCGCAAATGTGAGTCCTGGACTTTGCATTTCTGGTGATAGAGGATTAGCACCTAAAGCTGGATATTTTGTTCAAGATGATGGAGAATGGAAGTTCACAGGCAGTTCATATTACTACCCTGAACCCATTACAGATAAAAACAGTGTCATTATGAGTAGTTGCGCAGTAAACTACACAAAGGCACCTGAAGTTTTCTTGAACACTTCAATACCTAATCCACCCGACTTTAAGGAGGAGTTAGATAAATGGTTTAAGAATCAGACGTCTATTGCGCCTGATTTATCTCTCGATTTCGAGAAGTTAAATGTTACTTTGCTGGACCTGACGTATGAGATGAACAGGATTCAGGATGCAATTAAGAAGTTAAATGAGAGCTACATCAACCTCAAGGAAGTTGGCACATATGAAATGTATGTGAAATGGCCTTGGTATGTTTGGTTGCTAATTGGATTAGCTGGTGTAGCTGTTTGTGTGTTGTTATTCTTTATATGTTGCTGCACAGGTTGTGGCTCATGTTGTTTTAAGAAGTGTGGAAATTGTTGTGATGAGTATGGAGGACACCAGGACAGTATTGTGATACATAATATTTCCTCTCATGAGGATTGA Murine hepatitis virus hepatitis virus Murine hepatitis virus --
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DVSP08800324 AAU14248.1 S protein Infectious bronchitis virus. 1165 aa MLGKSLFLVTILCALCSANLFDSANNYVYYYQNAFRPPNGWHLQGGAYAVVNSTNYTNNAGSVNECTIGVIKDVYNYSAAAIAMTAPLQGMAWSKSQFCSAHCNFSEITVFVTHCYSSGSGSCPITGMIPQGHIRISAMKNGSLFYNLTVSVSKYPNFKSFQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNATTGVKSAGVYFKAGGPVNYNIMKEFKVLAYFVNGTVQDVILCDDTPRGLLACQYNNGNFSDGFYPFTNSSLVKEKFIVYRENSVNTTLTLTNYTFYNVANASPNRGGVQSIPTYQTQTAQSGYYNFNLSFLSSFVYKESNYMYGSYHPACNFRLETINNGLWFNSLSVSLAYGPFQGGCKQSVFSSRATCCYAYSYNGPRACKGVYAGELLQNFECGLLVYVTKSDGSRIQTATVPPVVTQHNYNNITLNTCVDYNIYGRVGRGFITNVTDSSSSYNYLADAGLAILDTSGAIDIFVVQGEHGLNYYKVNPCEDVNHQFVVSGGKLVGILTSRNATGSQPLENQFYIKLTKETRRFRRSTSDNVTSCPYVTYGRFCIQPDGSIKQIVPQELENFVAPLLNVTENVLIPSSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYVCGNSLDCRKLFQQYGPVCDNILSIVNSVGQKEDMELLTFYSSTKPAGYNAPVFSNISTGDFNISLLLTPPSSPSGRSFIEDLLFTSVETVGLPTDAEYKKCTAGPLGTLKDLICAREYNGLLVLPPIITADMQTMYTASLVGAMAFGGITAAGAIPFATQIQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQVQDVVNKQSAILTETMNSLNKNFGAISSVIQDIYAQLDAIQADAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQSEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSNRYGFCGSGRHVLSIPQNAPNGIVFIHFTYTPQSFVNVTAIVGFCVQPANASQYAIVPVNGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVNVNKTVITTFVEDDDFDFDDELSKWWNDTKHELPDFDDFNYTVPILNISGEIDRIQGVIQGLNDSLIDLEELSIIKTYIKWPWYVWLAIGFAVIIFILILGWVFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV AY702975.1 Avian infectious bronchitis virus isolate LDT3 S protein (S); 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DVSP08800325 AAV28722.1 S protein Infectious bronchitis virus. 1162 aa MLVTPLLLVTLLCALCSAVLYDSSSYVYYYQSAFRPPDGWHLHGGAYAVANISSESNNAGSSSGCTVGIIHGGRVVNASSIAMTAPSSGMAWSSSQFCTAYCNFSDTTVFVTHCYKHGGCPITGMLQQHSIRVSAMKNGQLFYNLTVSVAKYPTFKSFQCVNNLTSVYLNGDLVYTSNETTDVTSAGVYFKAGGPITYKVMREVRALAYFVNGTAQDVILCDGSPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKQKFIVYRENSVNTTFTLHNFTFHNETGANPNPSGVQNIQTYQTQTAQSGYYNFNFSFLSSFVYKESNFMYGSYYPSCNFRLETINNGLWFNSLSVSIAYGPLQGGCKQSVFSGRATCCYAYSYGGPLLCKGVYSGELDHNFECGLLVYVTKSGGSRIQTATEPPVITQHNYNNITLNTCVDYNIYGRTGQGFITNVTDSAVSYNYLADAGLAILDTSGSIDIFVVQSEYGLNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNETGSQLLENQFYIKITNGTRRFRRSITESVENCPYVSYGKFCIKPDGSIATIVPKQLEQFVAPLLNVTENVLIPNSFNLTVTDEYIQTRMDKVQINCLQYICGNSLECRNLFQQYGPVCDNILSVVNSVGQKEDMELLNFYSSTKPAGFNTPVLSNVSTGEFNISLFLTTPSSPRRRSFIEDLLFTSVESVGLPTDDAYKNCTAGPLGFLKDLVCAREYNGLLVLPPIITAEMQTLYTSSLVASMAFGGITAAGAIPFATQLQARINHLGITQSLLLKNQEKIAASFNKAIGHMQEGFRSTSLALQQIQDVVNKQSAILTETMASLNKNFGAISSVIQEIYQQLDAIQANAQVDRLITGRLSSLSVLASAKQAEYIRVSQQRELATQKINECVKSQSIRYSFCGNGRHVLTIPQNAPNGIVFIHFTYTPESFINVTAIVGFCVSPANASQYAIVPANGRGIFIQVNGSYYITARDMYMPRDITAGDIVTLTSCQANYVSVNKTVITTFVDNDDFDFDDELSKWWNDTKHELPDFDKFNYTVPILDIDSEIDRIQGVIQGLNDSLIDLETLSILKTYIKWPWYVWLAIAFATIIFILILGWLFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMSKCGKKSSYYTTFDNDVVTEQYRPKKSV AY761141.1 Avian infectious bronchitis virus strain HK S protein (S); 3a protein (3a); 3b protein (3b); envelope protein (E); membrane protein (M); 5a protein (5a); 5b protein (5b); and nucleocapsid protein (N) genes; complete cds 3489bp ATGTTGGTAACACCTCTTTTACTAGTGACTCTTTTGTGTGCACTATGTAGTGCTGTTTTGTATGACAGTAGTTCTTACGTGTACTACTACCAAAGTGCCTTCAGACCACCTGATGGTTGGCATTTACATGGGGGTGCGTATGCGGTTGCTAATATTTCTAGTGAATCTAATAATGCAGGCTCTTCATCTGGGTGTACTGTTGGTATTATTCATGGTGGTCGTGTTGTTAATGCTTCTTCTATAGCTATGACGGCACCGTCATCAGGTATGGCTTGGTCTAGCAGTCAGTTTTGTACTGCATACTGTAACTTTTCAGATACTACAGTGTTTGTTACACATTGTTATAAACATGGTGGGTGTCCTATAACTGGCATGCTTCAACAGCATTCTATACGTGTTTCTGCTATGAAAAATGGCCAGCTTTTTTATAATTTAACAGTTAGTGTAGCTAAGTACCCTACTTTTAAATCATTTCAGTGTGTTAATAATTTAACATCCGTATATTTAAATGGTGATCTTGTTTACACCTCTAATGAGACCACAGATGTTACATCTGCAGGTGTTTATTTTAAAGCTGGTGGACCTATAACTTATAAAGTTATGAGAGAAGTTAGAGCCCTGGCTTATTTTGTTAATGGTACTGCACAAGATGTTATTTTGTGTGATGGGTCACCTAGAGGCTTGTTAGCATGCCAGTATAATACTGGCAATTTTTCAGATGGCTTTTATCCTTTTACTAATAGTAGTTTAGTTAAGCAGAAGTTTATTGTCTATCGTGAAAATAGTGTTAATACTACTTTTACGTTACACAATTTCACTTTTCATAATGAGACTGGCGCCAACCCAAATCCTAGTGGTGTCCAGAATATTCAAACTTACCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTTTCCTTTCTGAGTAGTTTTGTTTATAAGGAGTCTAATTTTATGTATGGATCTTATTACCCAAGTTGTAATTTTAGACTAGAAACTATTAATAATGGTTTGTGGTTTAATTCACTTTCAGTTTCAATTGCTTACGGTCCTCTTCAAGGTGGTTGCAAGCAATCTGTCTTTAGTGGTAGAGCAACCTGTTGTTATGCTTACTCATATGGAGGTCCTTTGCTGTGTAAAGGTGTTTATTCAGGTGAGTTAGATCATAATTTTGAATGTGGACTGTTAGTTTATGTTACTAAGAGCGGTGGCTCTCGTATACAAACAGCCACTGAACCGCCAGTTATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAACTGGCCAAGGTTTTATTACTAATGTAACCGACTCAGCTGTTAGTTATAATTATCTAGCAGACGCAGGTTTGGCTATTTTAGATACATCTGGTTCCATAGACATCTTTGTCGTACAAAGTGAATATGGTCTTAATTATTATAAGGTTAACCCTTGCGAAGATGTCAACCAGCAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACTTCACGTAATGAGACTGGTTCCCAGCTTCTTGAGAATCAGTTTTACATCAAAATCACTAATGGAACACGTCGTTTTAGACGTTCTATTACTGAAAGTGTTGAAAATTGCCCTTATGTTAGTTATGGTAAGTTTTGTATAAAACCTGATGGCTCAATTGCCACAATAGTACCAAAACAATTGGAACAGTTTGTGGCACCTTTACTTAATGTTACTGAAAATGTGCTCATACCTAACAGTTTTAATTTAACTGTTACAGATGAGTACATACAAACGCGTATGGATAAGGTCCAAATTAATTGCCTGCAGTATATTTGTGGCAATTCTCTGGAGTGCAGAAATTTGTTCCAACAATATGGTCCTGTTTGCGACAACATATTGTCTGTAGTAAATAGTGTTGGTCAAAAAGAAGATATGGAACTTTTGAATTTCTATTCTTCTACTAAGCCGGCTGGTTTTAATACACCAGTTCTTAGTAATGTTAGCACTGGTGAGTTTAATATTTCTCTTTTTTTAACAACGCCTAGTAGTCCTAGAAGGCGTTCTTTTATTGAAGACCTTCTATTTACAAGTGTTGAATCTGTTGGATTACCAACAGATGACGCATACAAAAATTGCACTGCAGGTCCTTTAGGCTTTCTTAAGGACCTTGTATGTGCTCGTGAATATAATGGTTTGCTTGTGTTGCCTCCTATTATAACAGCAGAAATGCAAACTTTGTATACTAGTTCTCTAGTAGCTTCTATGGCTTTTGGTGGTATTACTGCAGCTGGTGCTATACCTTTTGCCACACAACTGCAGGCTAGAATTAATCACTTGGGTATTACCCAGTCACTTCTTTTGAAGAATCAAGAAAAAATTGCTGCTTCCTTTAATAAGGCCATCGGTCATATGCAGGAAGGTTTTAGAAGTACATCTTTAGCATTACAACAAATTCAAGATGTTGTTAATAAGCAGAGTGCTATTCTTACTGAGACTATGGCATCACTTAATAAAAATTTTGGTGCCATTTCTTCTGTGATTCAAGAAATCTACCAGCAACTTGACGCCATACAAGCAAATGCTCAAGTGGATCGTCTTATAACTGGTAGATTGTCATCACTTTCTGTTTTAGCATCTGCTAAGCAGGCGGAGTATATTAGAGTGTCACAACAGCGTGAGTTAGCTACTCAGAAGATTAATGAGTGTGTCAAGTCACAGTCCATTAGGTACTCCTTTTGTGGTAATGGACGACATGTTTTAACCATACCACAAAATGCCCCTAATGGTATAGTGTTTATACACTTTACTTATACACCAGAGAGCTTTATTAATGTTACTGCAATAGTGGGTTTTTGTGTAAGTCCTGCTAATGCTAGTCAGTATGCAATAGTGCCCGCTAATGGTAGGGGTATTTTTATACAAGTTAATGGTAGTTACTACATCACTGCACGAGATATGTATATGCCAAGAGATATTACTGCAGGAGATATAGTTACGCTTACTTCTTGTCAAGCAAATTATGTAAGTGTAAATAAGACCGTCATTACTACATTTGTAGACAATGATGATTTTGATTTTGATGATGAATTGTCAAAATGGTGGAATGATACTAAGCATGAGCTACCAGACTTTGACAAATTCAATTACACAGTACCTATACTTGACATTGATAGTGAAATTGATCGTATTCAAGGCGTTATACAGGGTCTTAACGACTCTCTAATAGACCTTGAAACACTATCAATACTCAAAACTTATATTAAGTGGCCTTGGTATGTGTGGTTAGCCATAGCTTTTGCCACTATTATCTTCATCTTAATACTAGGATGGTTGTTTTTCATGACTGGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGGATGCTTTGGCATTATTCCTTTAATGAGTAAGTGTGGTAAGAAATCTTCTTATTACACGACTTTTGATAATGATGTGGTAACTGAACAATACAGACCTAAAAAGTCTGTTTAA Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus --
DVSP08800326 AAV33433.1 spike protein S1, partial Infectious bronchitis virus. 588 aa MLGKSLLIATVLFALCSATLYTHDYVYYYQSAYRLPNGWHLQGGAYAVVNSTNKTNNAGAASECSVGVPFNYTNGNDVGYNNSASSVAMTAPLPGMSWSKTQFCTAHCNFSDFTVFVTHCFANSCPLTGRTEENHIRISAMRNGSLFYNLTVSVSKYPKFKSLQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNKTTDVIGAGVYFKAGGPITYKIMKEFKVLAYFVNGTVQDVILCDDTPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKKKFIVYRESSVNTTLILTNYTFYNVTNAPPNQGGVQSILTYQTQTAQSGYYNFNLSFLSSFVYKQSDYMYGSYHPACNFRLETINNGLWFNSLSVSLAYGPLQGGCKQSVFSSRATCCYAYSYNGPRACKGVYAGELRQNFECGLLVYVTKSDGSRIQTATEPPVITQHNYNNITLNTCVDYNIYGRVGRGFITNVTDLSSSYNYLADGGLAILDTSGAIDIFVVQGEHGFNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNATGSQPLENQFYIKLTKETRRFRRSTSENVTSCHYVSYGRFCIQPDGSIKQIVPQELQNFVAPLLNVTEN AY764368.1 Infectious bronchitis virus strain CQ/01/2004 spike protein S1 gene; partial cds 1764bp ATGTTGGGGAAGTCACTGTTAATAGCGACTGTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCCACTCTTTATACTCACGATTATGTTTACTACTACCAAAGTGCCTATAGACTACCAAATGGATGGCATTTGCAAGGGGGTGCTTATGCAGTAGTGAATTCTACTAATAAAACTAACAATGCAGGCGCCGCTAGCGAGTGTTCTGTAGGTGTTCCTTTTAATTATACTAACGGGAATGACGTTGGTTATAATAATAGTGCTTCTTCCGTAGCCATGACAGCACCGCTTCCTGGTATGTCTTGGTCTAAAACACAATTTTGTACTGCCCATTGTAACTTTTCGGATTTTACAGTGTTTGTTACACATTGTTTTGCAAATTCTTGTCCTTTAACAGGTAGGACAGAGGAAAACCATATCCGTATTTCTGCTATGAGAAATGGTTCTCTATTTTATAATTTAACAGTTAGTGTATCCAAATACCCTAAATTTAAATCGCTTCAATGTGTTAACAATTTCACTTCTGTTTATTTAAATGGTGACCTTGTTTTTACTTCTAACAAAACCACCGATGTTATAGGTGCTGGTGTGTATTTTAAAGCAGGTGGGCCTATAACCTACAAAATTATGAAAGAATTTAAGGTTTTGGCTTATTTTGTCAATGGTACTGTGCAAGATGTAATTCTGTGTGATGACACACCGAGAGGCTTGCTTGCATGTCAATATAATACTGGTAATTTTTCAGATGGGTTTTACCCTTTTACTAATTCTAGTTTAGTTAAGAAAAAGTTTATTGTTTATCGTGAGAGTAGTGTTAATACTACTCTTATTTTAACTAATTATACTTTTTATAATGTGACTAATGCCCCGCCTAATCAAGGTGGTGTTCAGTCTATTTTAACTTATCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTATCATTTCTGAGTAGTTTTGTGTATAAACAATCTGATTACATGTATGGGTCTTATCACCCTGCATGTAATTTTAGATTAGAAACTATTAATAATGGCTTGTGGTTTAATTCACTGTCAGTTTCTCTTGCTTATGGACCACTTCAAGGTGGGTGTAAGCAGTCGGTTTTTAGTAGTAGAGCCACTTGTTGTTATGCTTATTCATATAATGGTCCTCGCGCTTGTAAGGGTGTTTATGCAGGCGAGTTACGACAAAATTTTGAATGTGGACTGTTGGTTTATGTTACTAAGAGCGATGGCTCTCGTATACAAACAGCCACCGAGCCACCAGTCATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAGTTGGTCGAGGTTTCATTACTAATGTAACTGACTTATCATCTAGTTATAATTATTTAGCAGATGGAGGGTTGGCTATTTTAGATACATCAGGTGCCATAGACATCTTTGTTGTACAAGGTGAACATGGTTTTAATTATTACAAGGTTAATCCCTGTGAAGATGTAAACCAGCAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACCTCACGTAATGCAACAGGTTCTCAGCCCCTTGAGAATCAATTCTACATTAAACTCACTAAAGAGACACGTCGTTTTAGACGTTCTACTAGTGAAAATGTAACAAGTTGTCATTATGTAAGTTATGGCAGGTTTTGTATACAACCTGATGGTTCTATTAAGCAAATAGTACCGCAAGAATTACAAAATTTTGTGGCACCTTTGTTAAATGTTACTGAAAAT Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus --
DVSP08800327 AAV34696.1 spike protein S1, partial Infectious bronchitis virus. 588 aa MLGKSLLIATVLFALCSATLYTHDYVYYYQSAYRLPNGWHLQGGAYAVVNSTNKTNNAGAASECSVGVPFNYTNGNDVGYNNSASSVAMTAPLPGMSWSKTQFCTAHCNFSDFTVFVTHCFANSCPLTGRTEENHIRISAMRNGSLFYNLTVSVSKYPKFKSLQCVNNFTSVYLNGDLVFTSNKTTDVIGAGVYFKAGGPITYKIMKEFKVLAYFVNGTVQDVILCDDTPRGLLACQYNTGNFSDGFYPFTNSSLVKKKFIVYRESSVNTTLILTNYTFYNVTNAPPNQGGVQSILTYQTQTAQSGYYNFNLSFLSSFVYKQSDYMYGSYHPACNFRLETINNGLWFNSLSVSLAYGPLQGGCKQSVFSSRATCCYAYSYNGPRACKGVYAGELRQNFECGLLVYVTKSDGSRIQTATEPPVITQHNYNNITLNTCVDYNIYGRVGRGFITNVTDLSSSYNYLADGGLAILDTSGAIDIFVVQGEHGFNYYKVNPCEDVNQQFVVSGGKLVGILTSRNATGSQPLENQFYIKLTKETRRFRRSTSENVTSCHYVSYGRFCIQPDGSIKQIVPQELQNFVAPLLNVTEN AY769993.1 Avian infectious bronchitis virus strain CQ/01/2004 spike protein S1 gene; partial cds 1764bp ATGTTGGGGAAGTCACTGTTAATAGCGACTGTTTTGTTTGCACTATGTAGTGCCACTCTTTATACTCACGATTATGTTTACTACTACCAAAGTGCCTATAGACTACCAAATGGATGGCATTTGCAAGGGGGTGCTTATGCAGTAGTGAATTCTACTAATAAAACTAACAATGCAGGCGCCGCTAGCGAGTGTTCTGTAGGTGTTCCTTTTAATTATACTAACGGGAATGACGTTGGTTATAATAATAGTGCTTCTTCCGTAGCCATGACAGCACCGCTTCCTGGTATGTCTTGGTCTAAAACACAATTTTGTACTGCCCATTGTAACTTTTCGGATTTTACAGTGTTTGTTACACATTGTTTTGCAAATTCTTGTCCTTTAACAGGTAGGACAGAGGAAAACCATATCCGTATTTCTGCTATGAGAAATGGTTCTCTATTTTATAATTTAACAGTTAGTGTATCCAAATACCCTAAATTTAAATCGCTTCAATGTGTTAACAATTTCACTTCTGTTTATTTAAATGGTGACCTTGTTTTTACTTCTAACAAAACCACCGATGTTATAGGTGCTGGTGTGTATTTTAAAGCAGGTGGGCCTATAACCTACAAAATTATGAAAGAATTTAAGGTTTTGGCTTATTTTGTCAATGGTACTGTGCAAGATGTAATTCTGTGTGATGACACACCGAGAGGCTTGCTTGCATGTCAATATAATACTGGTAATTTTTCAGATGGGTTTTACCCTTTTACTAATTCTAGTTTAGTTAAGAAAAAGTTTATTGTTTATCGTGAGAGTAGTGTTAATACTACTCTTATTTTAACTAATTATACTTTTTATAATGTGACTAATGCCCCGCCTAATCAAGGTGGTGTTCAGTCTATTTTAACTTATCAAACACAAACAGCTCAGAGTGGTTATTATAATTTTAATTTATCATTTCTGAGTAGTTTTGTGTATAAACAATCTGATTACATGTATGGGTCTTATCACCCTGCATGTAATTTTAGATTAGAAACTATTAATAATGGCTTGTGGTTTAATTCACTGTCAGTTTCTCTTGCTTATGGACCACTTCAAGGTGGGTGTAAGCAGTCGGTTTTTAGTAGTAGAGCCACTTGTTGTTATGCTTATTCATATAATGGTCCTCGCGCTTGTAAGGGTGTTTATGCAGGCGAGTTACGACAAAATTTTGAATGTGGACTGTTGGTTTATGTTACTAAGAGCGATGGCTCTCGTATACAAACAGCCACCGAGCCACCAGTCATAACTCAACACAATTATAATAATATTACTTTAAATACTTGTGTTGATTATAATATATATGGCAGAGTTGGTCGAGGTTTCATTACTAATGTAACTGACTTATCATCTAGTTATAATTATTTAGCAGATGGAGGGTTGGCTATTTTAGATACATCAGGTGCCATAGACATCTTTGTTGTACAAGGTGAACATGGTTTTAATTATTACAAGGTTAATCCCTGTGAAGATGTAAACCAGCAGTTTGTAGTTTCTGGTGGTAAATTAGTAGGTATTCTTACCTCACGTAATGCAACAGGTTCTCAGCCCCTTGAGAATCAATTCTACATTAAACTCACTAAAGAGACACGTCGTTTTAGACGTTCTACTAGTGAAAATGTAACAAGTTGTCATTATGTAAGTTATGGCAGGTTTTGTATACAACCTGATGGTTCTATTAAGCAAATAGTACCGCAAGAATTACAAAATTTTGTGGCACCTTTGTTAAATGTTACTGAAAAT Infectious bronchitis virus Coronaviridae Infectious bronchitis virus --
DVSP13700085 AAV49719.1 spike glycoprotein SARS coronavirus PC4-115. 1255 aa MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFDNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFVVSKPMGTRTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDTWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKRISNCVADYSVLYNSTSFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPAPNCYWPLNGYGFYTTSGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTLIHAEQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSSLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCRQLNRALSGIAAEQDRNTREVFVQVKQMYKTPTLKDFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQEEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT AY627044.1 SARS coronavirus PC4-115 spike glycoprotein gene; 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